Kelimpahan populasi kelompok mikroba fungsional di seluruh skala ekosistem.

PCR kuantitatif
digunakan untuk mengukur kelimpahan gen yang terkait dengan degradasi selulosa (gen fungcbhIR dan
GH74), degradasi pati (GH31), degradasi xilan (atau arabinan) (GH51), nitrifikasi (amoA-a dan amoA-b),
N fiksasi (nifH), dan denitrifikasi (gen narG, nirK, nirS, nosZ, dan norB), mineralisasi P organik (gen
phoD, phoC, dan BPP), dan disolusi P anorganik (pqqC) (Tabel 1). Termasuk dari semua situs, ada
hubungan positif antara populasi mikroba bersepeda C, N, dan P (R2 0,42 sampai 0,57; P 0,001 [lihat
Gambar. S1 dalam bahan tambahan]), dan hubungan yang signifikan diamati di antara sebagian besar
komponen populasi ini (Gambar S2).

MAT dan MAP dan stoikiometri tanah C: N: P (termasuk kandungan C, N, dan P total tanah dan
rasionya) mempengaruhi kelimpahan gen siklus C, N, dan P (Gbr. 2A sampai C). Stoikiometri C: N: P
tanah (35% hingga 49%; P 0,001) memiliki dampak yang lebih besar pada kelimpahan dibandingkan
MAT dan MAP (7% hingga 10%; P 0,01) berdasarkan analisis partisi varian. Variasi yang dijelaskan
bersama oleh variabel-variabel ini adalah 16% dan 8% dari total variasi dalam kelompok bersepeda P dan
C, masing-masing (Gbr. 2A sampai C; P 0,01).

Analisis peta panas jaringan relasional membedah hubungan antara MAT dan MAP dan stoikiometri
tanah C: N: P terhadap kelimpahan gen siklus C, N, dan P (Gambar 2D). Kandungan N total tanah, dan
rasio C / P dan N / P tanah, menunjukkan hubungan positif dengan mayoritas kelimpahan gen fungsional
(Gbr. 2D; semua P 0,05). Kandungan C total tanah berhubungan positif dengan kelimpahan kelompok
bersepeda N (termasuk gen amoA-b, nifH, narG, nirS, dan nosZ; semua P 0,05). Kandungan P total tanah
berkorelasi negatif dengan kelimpahan aktivator P (gen phoD dan pqqC; semua P 0,05). Rasio C / N
tanah menunjukkan hubungan negatif tidak hanya dengan kelimpahan aktivator P (gen phoD, phoC, dan
pqqC) tetapi juga dengan denitrifier (nirK) dan pengurai selulolitik (fungcbhIR dan gen GH74) (Gbr. 2D;
semua P 0,05). MAT atau MAP ditemukan memiliki hubungan yang signifikan hanya dengan kelimpahan
gen nirK, phoC, pqqC, dan fungcbhIR. Kelimpahan bakteri dan jamur menunjukkan hubungan positif
dengan mayoritas kelimpahan gen fungsional, sedangkan rasio bakteri terhadap kelimpahan jamur
berhubungan dengan kelimpahan gen dalam kelompok siklus C (gen fungcbhIR, GH31, GH51, dan
GH74) (Gambar 2D. ; semua P 0,05).

Resistensi populasi kelompok mikroba fungsional terhadap simulasi perubahan global. Di antara
biomarker kelompok siklus C, N, dan P, gen phoD menunjukkan resistensi terendah terhadap siklus
pengeringan-pembasahan, gen nosZ dan GH51 menunjukkan resistensi terendah terhadap pemanasan, dan
gen GH51 dan GH74 paling tidak tahan terhadap pengendapan N. (Gambar S3). Gen siklus nitrogen,
termasuk amoA-b, nirS, narG, dan norB, menunjukkan nilai resistensi genetik tertinggi terhadap
pengendapan N, dan gen amoA-a dan nosZ masing-masing menunjukkan ketahanan tertinggi terhadap
siklus pemanasan dan pengeringan-pembasahan (Gbr. 3; semua P 0,05). Resistensi genetik gen siklus P
(phoD dan phoC) menggambarkan tidak adanya perbedaan antara pemanasan dan pengendapan N,
sedangkan ketahanan terhadap dua stresor lebih tinggi dibandingkan dengan siklus pengeringan-
pembasahan dan ketahanan gen BPP terhadap pemanasan dan pengeringan- Siklus pembasahan lebih
tinggi dari pada pengendapan N (Gbr. 3; semua P 0,05). Gen siklus karbon, termasuk GH31, GH51, dan
GH74, menunjukkan ketahanan genetik yang lebih rendah terhadap pengendapan N daripada siklus
pengeringan-pembasahan dan pemanasan (Gbr. 3; semua P 0,05). Termasuk dari semua situs, ada
hubungan positif antara populasi mikroba bersepeda C, N, dan P di bawah tiga pemicu stres (R2 0,33
hingga 0,62; P 0,001 [Gambar S4]).

Jalur regulasi dari beberapa pendorong pada resistensi populasi fungsional. Rata-rata curah hujan
tahunan menunjukkan tingkat kepentingan prediktor rata-rata tertinggi (MPI; 21%) dalam penjelasan
ketahanan genetik siklus N terhadap siklus pengeringan-pembasahan (model hutan acak [Gbr. 4]). Suhu
tahunan rata-rata menunjukkan MPI tertinggi (23%) dalam penjelasan ketahanan genetik siklus N
terhadap pemanasan. Rasio C / P tanah menunjukkan MPI tertinggi (15%) dalam penjelasan ketahanan
genetik siklus N terhadap pengendapan N, diikuti oleh MAT dan MAP (Gbr. 4). Kandungan C dan N
total tanah dan rasionya dipilih dengan analisis hutan secara acak sebagai prediktor utama ketahanan
genetik siklus P terhadap ketiga penyebab stres. Rasio C / P tanah (10%) dan MAT (10%) menunjukkan
MPI tertinggi dalam penjelasan ketahanan genetik siklus C terhadap siklus pengeringan-pembasahan, dan
paralel total tanah C (18%) dan MAT (15%) menunjukkan MPI tertinggi dalam penjelasan ketahanan
genetik siklus C terhadap pemanasan dan deposisi N, masing-masing (Gbr. 4). Penilaian melalui
pemodelan persamaan struktural selanjutnya memberikan bukti matematis untuk efek regulasi MAT dan
MAP dan stoikiometri tanah C: N: P pada ketahanan genetik dari kelompok mikroba siklus N, P, dan C
(Gbr. 5). Baik MAT dan MAP dapat secara langsung mempengaruhi stoikiometri C: N: P tanah, yang
menghasilkan regulasi akhir ketahanan genetik (Gbr. 5). Misalnya, MAP secara langsung mempengaruhi
kandungan N total tanah dan efek regulasi ini memediasi siklus N ketahanan genetik terhadap perubahan
iklim dan pengendapan N. Kandungan C, N, dan P tanah serta rasionya berpengaruh langsung lebih kuat
terhadap ketahanan genetik kelompok mikroba. Penggerak ini menunjukkan koefisien efek yang
bervariasi dan arah di antara tiga pemicu stres (Gbr. 5). Sebagai contoh, kandungan C dan N total tanah
secara konsisten menunjukkan pengaruh positif terhadap ketahanan genetik kelompok siklus N,
sedangkan rasio C / P tanah secara konsisten berpengaruh positif terhadap ketahanan genetik kelompok
mikroba siklus C, N, dan P.