RESUM JURNAL

Jurnal: Prospects Of Sars-Cov-2 Vaccines And Their Landscape

1. Pendahuluan
Agen penyebab penyakit coronavirus 2019 (COVID-19), Sindrom Pernafasan Akut
Parah Corona Virus-2 (SARS CoV-2), bergulat di seluruh dunia dengan tingkat penularannya
yang tinggi dan etiologi yang belum pernah terjadi sebelumnya. Penyakit ini sangat
mempengaruhi kesehatan manusia dan kekayaan pada abad ke-21 daripada penyakit lain atau
bencana alam. Kematian yang disebabkan oleh penyakit ini telah dilaporkan terkait dengan
usia dan orang dengan penyakit penyerta, di mana hasil penyakit yang parah terjadi dengan
tingkat kematian yang lebih tinggi (Arumugam et al., 2020; Michelozzi et al., 2020).
Vaksin terbukti menjadi taruhan yang aman dalam mengatasi epidemi, meskipun tidak
100 persen aman dan efektif. Sejak, yang pertama mencatat penggunaan imunisasi pada
manusia untuk mencegah cacar oleh Edward Jenner 1796, pengembangan dan cakupan
vaksin telah terlihat kemajuan bertahap (Riedel, 2005). Dengan kemajuan teknologi, bidang
produksi vaksin telah diuntungkan dan platform produksi terbaru seperti vaksin DNA dan
RNA, vaksin vektor virus non-replikasi, vaksin protein rekombinan, dan vaksin berbasis
kultur sel menjadi tersedia (Wallis et al. , 2019).
Studi sekuensing genom SARS –CoV-2 tidak hanya menghasilkan pemahaman tentang
variabilitas genom, evolusi, tetapi juga membuka jalan bagi vaksin berdasarkan asam nukleat,
platform produksi vaksin genetika terbalik. Banyak laboratorium di seluruh dunia bekerja
tanpa lelah dalam membuat vaksin yang efektif dalam mengendalikan pandemi COVID-19.
Sebagian besar kandidat vaksin didasarkan pada protein selubung “Spike” (Zhu et al., 2020;
Lauxmann et al., 2020; Tai et al., 2020).
Gambar Struktur virion SARS-CoV-2, protein Spike dalam bentuk trimerik dan sub unitnya
dengan furincleavage ; konfirmasi berdiri dan peletakan daerah RBD protein lonjakan (Fitur
struktural umum virion SARS-CoV-2 yang merinci protein menyelubungi dan bahan nuklir.
Subunit rinci protein Spike (S1/S2) dengan pembelahan furin. Bentuk trimerik protein Spike,
konfirmasi berdiri dan peletakan wilayah RBD protein Spike juga ditampilkan

2. Pertimbangan utama dalam pengembangan vaksin SARS-CoV-2

Untuk kandidat vaksin SARS-CoV-2 yang berhasil, harus aman pada semua individu
termasuk individu COVID-19 yang paling rentan seperti orang tua, orang dengan penyakit
penyerta, individu dengan gangguan sistem kekebalan, dan anak-anak. Perhatian khusus
harus diberikan pada segmen masyarakat ini, karena penuaan kekebalan, orang tua kurang
merespon terhadap vaksinasi, sehingga hal ini dapat diatasi dengan formulasi spesifik yang
mencakup lebih banyak antigen atau adjuvant (DiazGranados et al., 2013; Calina et al. Al.,
2020). Selanjutnya, vaksin yang dikembangkan tidak boleh tunduk pada variabilitas geografis
dan temporal, dan juga menstandarisasi antigen dengan adjuvant dan rute pemberian tanpa
reaktogenisitas yang jelas.

3. Platform produksi vaksin untuk SARS-CoV-2

Menurut Organisasi Kesehatan Dunia (WHO), saat ini (6 November 2020), 47 kandidat
vaksin COVID-19 dalam fase klinis 1/2/3, sedangkan 155 vaksin dalam fase praklinis. Yang
terdepan termasuk vaksin berbasis RNA/DNA, yang memanfaatkan leverage urutan asam
nukleat dan dibuat dengan cepat.

Gambar (a) Platform produksi vaksin berbeda yang digunakan untuk Vaksin SARS-CoV-2
(Platform produksi vaksin berbeda yang digunakan dalam persiapan vaksin SARS-CoV-2)
dan (B) status mereka saat ini (Bagan Pai yang menunjukkan status vaksin saat ini dalam uji
klinis)
Jenis-jenis vaksin:

a. Vaksin RNA
Potensi asam ribonukleat messenger (mRNA's) sebagai vaksin profilaksis telah
dieksplorasi dan beberapa di antaranya diuji kesesuaiannya pada berbagai penyakit
menular termasuk penyakit pernapasan. Banyak perusahaan Biotek menggunakan
vaksin COVID-19 berbasis platform mRNA, seperti Moderna, AS; BioNTech,
Jerman; Terjemahkan Bio dengan Sanofi AS dan, Fosum Pharma, Shanghai, China.
b. Vaksin DNA
Dalam platform produksi vaksin ini, molekul DNA hasil rekayasa genetika
digunakan sebagai kandidat vaksin. DNA ini saat masuk ke dalam tubuh,
mengkodekan antigen yang digunakan untuk membangun respons imun humoral dan
seluler.
c. Vaksin vektor virus yang tidak bereplikasi
Platform produksi vaksin sangat ditingkatkan di masa lalu dan memiliki vektor virus
yang efisien seperti sistem vektor Adenoviral dan sistem Ankara Viral dll.
d. Vaksin Subunit Protein
Vaksin subunit protein diproduksi dengan memurnikan protein patogen atau dengan
menggunakan teknologi DNA rekombinan (Vetter et al., 2018). Untuk SARS-CoV-
2, lebih dari 40 vaksin berbasis subunit protein saat ini dalam fase klinis/praklinis
(Funk et al., 2020), dan sebagian besar didasarkan pada protein Spike‖ (Shi et al.,
2020b
e. Seluruh virus dinonaktifkan atau dibunuh
Dalam platform vaksin ini, seluruh virus dinonaktifkan melalui perlakuan panas atau
kimia dan merupakan salah satu bentuk produksi vaksin tradisional.
f. Vaksin vaksin hidup yang dilemahkan (LAV)
Platform atenuasi langsung dieksplorasi untuk vaksin SARS-CoV-2 dengan
mengadopsi mekanisme genetika terbalik melalui penghapusan faktor virulensi
utama (penghapusan protein E atau inaktivasi efek eksonuklease NSP14).
g. Vaksin berbasis partikel mirip virus (VLP)
Vaksin yang dikembangkan oleh teknologi ini dapat meniru virus asli (dibentuk oleh
perakitan sendiri protein kapsid virus); tidak dapat bereplikasi karena tidak memiliki
materi genetik. Vaksin yang dikembangkan pada teknologi ini untuk COVID-19,
 meniru konformasi virion SARS-CoV-2, dapat menghasilkan respons imun yang
kuat tanpa memerlukan adjuvant.

4. Rute Administrasi
Disini akan dijelaskan jenis platform produksi vaksin yang digunakan untuk
mengembangkan vaksin SARS-CoV-2, serta rute pemberian yang berperan dalam SARS
CoV2, jika kita mempertimbangkan patofisiologinya. Data dari vaksin virus Corona (SARS
& MERS) sebelumnya yang diberikan melalui rute hidung memberikan hasil yang
menjanjikan, mendukung rute pemberian ini (Marasini & Kaminskas, 2019). Bharat Biotech,
India dan Flu-Gen, USA telah mengembangkan vaksin yang disebut CoroFlu sebagai bagian
dari kerjasama internasional para ahli virologi, yang diberikan melalui rute intranasal,
memasuki uji klinis fase 2. Ini dikembangkan dengan memasukkan urutan gen lonjakan
SARS-CoV-2 ke dalam M2SR (yang merupakan versi virus influenza yang membatasi diri),
dapat menginduksi respon imun terhadap influenza dan CoV karena juga mengekspresikan
protein hemagglutinin virus influenza (Pharmatutor).

Gambar Skema representasi vaksin berbasis vektor DNA/RNA/Peptida/Adenoviral dan

pembangkitan respon imun melalui rute pemberian intramuskular/intranasal
Gambar Signifikansi Vaksinasi dalam mengendalikan Pandemi di antara populasi manusia
(A) Jumlah individu yang rentan, menular dan pulih untuk model yang tidak divaksinasi. (B)
Jumlah individu yang rentan, menular dan pulih untuk model yang divaksinasi. (C) Jumlah
model rentan untuk tidak divaksinasi dan divaksinasi. (D) Jumlah menular untuk model yang
tidak divaksinasi dan divaksinasi.

Berikut tabel Keuntungan dan Keterbatasan platform vaksin berbeda yang digunakan
untuk produksi vaksin SARS-CoV-2

S.
Vaccine
No Keuntungan Keterbatasan Referensi
Platform
.
Kemajuan transfeksi
vaksin berbasis RNA
sekitar sepuluh kali lipat
lebih rendah daripada
vektor virus, toksisitas
Mudah dibuat langsung dari
karena aktivitas inflamasi
urutan genetik hewan yang Conforti
intrinsik, Waktu paruh m
RNA diinginkan membuat dkk., 2020;
1 RNA yang pendek,
vaksin produksi sangat fleksibel, Wang dkk.,
translasi protein yang
tidak ada resiko integritas 2020
lebih rendah dan karena
DNA inang
vaksin ini rapuh sehingga
untuk transportasi dan
penyimpanannya
memerlukan proses rantai
dingin yang tidak terputus.
 Biokompatibilitas yang
baik, umur simpan yang Hobernik&
lama dan stabilitas, karena Kemungkinan integrasi Bros, 2018;
manufaktur benar-benar DNA dalam genom inang, Koirala et al.,
DNA bebas sel sehingga memerlukan beberapa 2020;
2
vaksin mengabaikan kebutuhan rezim prime-boost dan Manam et al.,
akan BSL2 dan membuat generasi yang lebih rendah 2000; Al-
proses produksi skala besar dari imunogenisitas, Kassmy et
menjadi mudah, hemat al., 2020
biaya, dan cepat
platform vektor virus
memiliki catatan keamanan
yang luas, ini stabil secara
genetik dan fisik, tidak ada
risiko integrasi, vektor virus
yang tidak bereplikasi
digunakan untuk terapi gen
selama bertahun-tahun,
kemanjuran transfeksi
tinggi karena vektor virus Dosis tinggi vaksin
meniru proses alami berbasis vetor virus non-
infeksi , vektor virus replikasi diperlukan,
terutama berbasis Selama kemungkinan
adenovirus telah ditentukan produksi rekombinasi, Markusic et
memiliki beberapa serotipe Paparan sebelumnya al., 2017;
dan ini sangat imunogenik terhadap virus Wang et al.,
Virus
sehingga menghasilkan menyebabkan penyakit 2020; Ertl,
3 vektor
kinerja tinggi sebagai yang sudah ada 2016;
vaksin
kendaraan pengiriman sebelumnya kekebalan Afrough et
vaksin, Keuntungan dari terhadap vektor sebagai al., 2019;
Modified vaccinia virus akibatnya mengarah pada Guroff, 2007
Ankara (MVA) sebagai produksi antibodi
vektor virus: tidak penetralisir yang
memerlukan rantai dingin mengurangi kemanjuran
yang mapan, pembuatannya vaksin
murah, dan dapat
menampung sisipan gen
yang besar dan telah terlihat
menimbulkan respons
imunologis yang kuat.
Vaksin berbasis replikasi
platform vektor virus aman
sebagai vaksin oral maupun
untuk pemberian intranasal,
Mudah diproduksi,
imunogenisitas yang
menggabungkan banyak Afrough et
Protein buruk, untuk memilih
epitop patogen dalam satu al., 2019;
4 Subunit respons imun memerlukan
kandidat vaksin, aman dan Wang dkk.,
Vaksin pemberian beberapa dosis
didistribusikan tanpa 2020
dengan adjuvant
masalah rantai dingin

Strategi produksi vaksin ini
Whole
telah digunakan selama
virus
bertahun-tahun karena
5 inactivate
formulasi platform
d or
vaksinasi yang sukses itu
killed
sederhana
Vaksin berdasarkan
platform ini (LAV)
Live
ditemukan menggunakan
attenuated
perlindungan silang yang
6 vaccines
luas, ini secara imunologis
(LAV)
sangat efisien dan dapat
vaccines
ditingkatkan untuk produksi
massal.
Menghasilkan tanpa ajuvan
apapun dan juga dapat
Virus-like memicu respons yang
particle diperantarai sel T dan
7 (VLP) produksinya membutuhkan
based waktu yang sangat singkat
Vaccines ~3-12 minggu tanpa
ancaman pembalikan
virulensi
durasi respons vaksinasi
yang terbatas dan pendek,
risiko bahaya terhadap
lingkungan dan orang
yang terlibat dalam
pembuatan vaksin karena
pembuatannya melibatkan
Fransiskus,
kultur agen infeksius
2017
dalam jumlah besar dan
media kultur mungkin
mengandung protein yang
tidak diinginkan yang
dapat menyebabkan alergi
dan juga mempengaruhi
imunogenisitasnya
Shin dkk.,
Selama distribusi rantai 2020;
dingin harus Amanat &
dipertahankan dan Krammer,
memerlukan pengujian 2020;
keamanan yang ekstensif Fransiskus,
karena ada risiko bahwa ia 2017; Begum
dapat kembali ke virulensi dkk., 2020;
penuh. Frederiksen
dkk., 2020
Urakami
Memerlukan transfer dkk., 2017;
rantai dingin, kurang stabil Wallis dkk.,
2019

5. Tantangan Pengembangan Vaksin SARS-CoV-2

 Saat ini, banyak kandidat vaksin untuk SARS-CoV-2 sedang dalam uji klinis dan
beberapa di antaranya hampir menyelesaikan uji klinis fase III. Namun, beberapa
tantangan masih perlu diatasi, tantangan yang paling dihadapi oleh para ahli vaksin
adalah pengamatan terhadap penurunan respon antibodi pada pasien SARS-CoV-2,
dan juga pelepasan virus hidung yang dapat dicegah dengan meningkatkan kekebalan
mukosa tetapi seperti yang kita ketahui bahwa kekebalan mukosa umumnya berumur
pendek sehingga memerlukan beberapa vaksinasi penguat (Begum et al., 2020; Wu et
al. (2007)
  Tantangan lain dalam infeksi SARS-CoV-2 adalah bahwa sebagian besar individu
yang terkena berusia di atas 50 tahun, status kekebalan individu ini mungkin pada
awal penuaan kekebalan. ( Sambhara & McElhaney, 2009).
 Meskipun 47 kandidat vaksin sedang dalam tahap evaluasi klinis, masih ada 156
vaksin yang saat ini dievaluasi dalam tahap praklinis
 Yang perlu dipertimbangkan adalah apakah vaksin-vaksin terhadap virus corona versi
saat ini, juga akan mampu melindungi dari virus corona versi baru, yang
kemungkinan akan muncul di masa depan atau tidak?
 Efektivitas vaksin menjadi tantangan besar lainnya karena tidak ada vaksin yang
100% efektif.
 Setelah keberhasilan pengembangan vaksin terhadap SARS-CoV-2, keraguan
terhadap vaksin juga akan menjadi tantangan lain.

6. Model Matematika Dasar Menjelaskan Pentingnya Vaksinasi pada SARS-CoV2

Matematikawan yang Antusias menghasilkan model Matematika untuk melacak

penyebaran virus dan untuk memobilisasi kecepatan diagnostik inovatif dan sedang
mengerjakan beberapa vaksin untuk melindungi dari COVID-19. Model berikut berguna
untuk dinamika epidemi untuk memperkirakan jumlah orang yang terinfeksi. Jika   adalah
jumlah orang yang rentan,   adalah jumlah orang yang terinfeksi,   adalah jumlah orang yang
dipindahkan,   adalah jumlah orang yang divaksinasi, dan t' adalah waktu terjadinya wabah,
laju perubahan ketiga jenis persamaan tersebut dapat dimodelkan dengan menggunakan
hukum pertumbuhan/peluruhan alami sebagai berikut. Dalam persamaan yang dimodelkan β
dan α dianggap sebagai tingkat terinfeksi dan imunisasi populasi.
Dari Persamaan (1) sampai (3) diketahui bahwa

Dimana N adalah konstan dan dapat dianggap sebagai jumlah orang yang rentan sebelum
wabah epidemi. Berikut ini dapat dianggap sebagai kondisi awal untuk himpunan persamaan
(1 -3).

Dari persamaan (1-2)

Jumlah orang yang terinfeksi ini   maksimum ketika jumlah orang yang rentan,   adalah sama
dengan . Dengan mempertimbangkan data statistik dari daerah tertentu dengan menggunakan
persamaan (7) kita dapat memperkirakan jumlah orang yang terinfeksi dan dapat melakukan
tindakan yang diperlukan.