MK BAKTERIOLOGI

Postur Pertahanan Nirmiliter - Universitas Pertahanan

 LEARNING MATERIALS
Meeting number TOPICS
The ecological function of bacteria and their use in the
environment
Pendahuluan

13 Bacteria as Decomposer
Bacteria as Biocleaner
Bacteria as Nitrogen Fixators
Bacteria for Bioremediation
Bacteria for water quality testing and water purification
Expected Cadet Abilities
Cadets are able to explain the ecological function of bacteria and their use
in the environment.
Assignment :
 Bacteria as Decomposer

Bacteria play an important role in decomposition of organic

materials, especially in the early stages of decomposition
when moisture levels are high. In the later stages of
decomposition, fungi tend to dominate.

Bacillus subtilis and Pseudomonas fluorescens are

examples of decomposer bacteria.
Scavenger
Decomposer
 Scavenger Vs Decomposer
Scavenger Decomposer

Definition Animal that feed on dead animals, Organism that breaks doen
plants and carrion and breaks down into small pieces of organic matter
smlaller pieces into molecular level
Importance Facilitates food for decomposers Facilitates nutrients for plant
and animals
Kingdom Animalia Fungi, Monera and Animalia
Function Break down th elarge dead materials Break down particles into the
into smaller particles molecular level
Involtvement in Initiates decomposition Completes decomposition
Decomposition
Examples Birds, Crabs, Insect, Opossums, etc Earthworm, Fungi, Insect, Bact
 Bacteria as Decomposer
PENGERTIAN
Dekomposer atau pengurai merupakan organisme yang memakan
organisme mati dan produk-produk limbah dari organisme lain.
Dekomposer membantu siklus nutrisi kembali ke ekosistem lainnya.
Terdapat beberapa organisme yang berperan sebagai dekomposer pada
pola rantai makanan di dalam ekosistem tertentu. Bisa dibilang peran
dekomposer sangat penting dalam keseimbangan ekosistem alam.
Pengurai atau dekomposer akan selalu ada di tiap jenis-jenis ekosistem
yang ada, baik di padang rumput, di hutan, di gurun, di kutub, hingga di
lautan sekalipun
 DEFINISI DEKOMPOSER
Pengertian dekomposer secara umum adalah makhluk hidup
atau organisme yang memperoleh energi dengan cara
menguraikan sisa-sisa makhluk hidup lain yang telah mati.
 PERAN DEKOMPOSER
Penting dalam keberlangsungan ekosistem di darat dan di laut.
Organisme yang sudah mati selanjutnya akan langsung diuraikan
oleh dekomposer untuk kemudian dikembalikan ke tanah menjadi
unsur hara atau zat anorganik yang penting untuk pertumbuhan.
Penguraian organisme oleh dekomposer akan menghasilkan gas
karbondioksida yang sangat bermanfaat dalam proses fotositesis
tumbuhan. Dekomposer juga membuat tanah memiliki banyak
tambahan senyawa organik. Zat-zat seperti karbon, air dan nitrogen
dikembalikan ke ekosistem melalui aktivitas pengurai.
 Decomposer Fuction
1. Pereaksi Kimia di dalam Tanah.
Mengurai materi organik di dalam tanah menjadi nitrat.
Senyawa nitrat inilah yang diperlukan oleh tumbuhan.
2. Mengurai Polutan di dalam Tanah.
Dekomposer juga memiliki peran sebagai agen biologis
untuk mengurai polutan dalam tanah menjadi bahan yang
sitatnya tidak berbahaya.
Penguraian ini bisa berlangsung dengan sangat cepat
apabila paktivitas organisme dekomposer di dalam tanah
juga tinggi..
 Fungsi Dekomposer
3. Mencegah Berkembangnya Penyakit di dalam Tanah
Tanah bisa dikatakan dalam keadaan normal apabila di
dalamnya terdapat aktivitas organisme serta senyawa
organik dalam kapasitas yang tinggi. Saat itulah saat dimana
organisme di dalam tanah berhasil melawan patogen atau
penyakit yang masuk ke bagian dalam tanah.

Organisme yang masuk dalam kategori dekomposer ini akan

secara alami memanfaatkan prinsip pengendalian secara
biologis. Dengan begitu, segala organisme lain yang
mengganggu pun bisa dikendalikan.
 Fungsi Dekomposer
4. Memberikan Pengaruh pada Tekstur Tanah
Berdasarkan teksturnya sendiri, tanah bisa dikategorikan
menjadi beberapa jenis. Ada tanah yang bertekstur halus,
ada yang bertekstur sedang dan bertekstur kasar.

Tekstur ini juga dipengaruhi oleh jumlah dekomposer dalam

tanah tersebut.
 Fungsi Dekomposer
5. Mempengaruhi Kesuburan Tanah
Selain memberikan tekstur, organisme dekomposer juga berperan dalam
menentukan tingkat kesuburannya.
Tanah tersusun atas partikel yang terikat satu sama lain. Partikel
terbentuk dari bahan organik yang dihasilkan oleh organisme dekomposer
dalam tanah.
Organisme dalam tanah juga membuat pori-pori yang membuat tanah
menjadi gembur sehingga proses aerasi tanah bisa berlangsung. Dengan
dua faktor tersebut yang akan memungkinkan berbagai jenis tanaman
bisa tumbuh subur.
 JENIS JENIS DEKOMPOSER
1. Mikroba. Mikroba/mikroorganisme adalah organisme yang berukuran sangat
kecil. Karena ukurannya yang sangat kecil. Organisme yang termasuk dalam
kelompok mikroba ini antara lain adalah bakteri dan jamur. Keduanya memiliki
sifat yang unik yang berfungsi sebagai penyeimbang dalam ekosistem lingkungan.

2. Mirkofauna. Mikrofauna ini adalah hewan yang memiliki ukuran sangat

kecil sehingga untuk mengamatinya dibutuhkan alat bantu berupa mikroskop.
Organisme yang termasuk dalam kategori mikrofauna ini adalah protozoa.

3. Meiofauna. Meiofauna. Organisme yang termasuk dalam kelompok ini adalah

kumbang.
 JENIS JENIS DEKOMPOSER
4. Makrofauna. Jenis dekomposer terakhir adalah makrofauna. Seperti
namanya, dekomposer yang tergolong dalam makrofauna adalah organisme yang
berukuran cukup besar sehingga tidak dibutuhkan alat bantu seperi mikroskop
untuk mengamatinya. Contoh dari makrofauna ini misalnya cacing tanah.
 Hubungan Ekosistem dan Dekomposer
1. Dekomposer di Ekosistem Hutan
Di wilayah daratan, ekosistem hutan ini adalah ekosistem yang paling umum dan
sering dijumpai. Pada ekosistem hutan ini, terdapat berbagai jenis dekomposer,
seperti misalnya cacing tanah, keong, siput hingga jamur dan bakteri. Organisme
mati yang diuraikan oleh dekomposer ini kemudian akan menjadi sumber nutrisi bagi
tanah yang juga akan meningkatkan kesuburan hutan.

2. Dekomposer di Ekosistem Kutub

Kutub yang memiliki suhu yang sangat rendah memang tidak memungkinkan untuk
organisme dekomposer hidup. Namun, ada satu jenis dekomposer yang mampu
hidup di ekosistem kutub ini, yaitu bakteri. Hal ini karena bakteri sendiri memiliki sifat
mampu bertahan pada kondisi dan suhu apapun.
 Hubungan Ekosistem dan Dekomposer
3. Dekomposer di Ekosistem Gurun
Sama seperti ekosistem kutub, ekosistem gurun yang juga memiliki kondisi suhu
ekstrem juga membuat beberapa jenis dekomposer sulit untuk hidup di lingkungan
ini. Namun ada beberapa jenis dekomposer yang tetap bertahan hidup di ekosistem
gurun, yaitu kumbang, cacing tanah, bakteri dan kaki seribu.

4. Dekomposer di Ekosistem Air

Pada lingkungan atau ekosistem air juga terdapat beberapa jenis dekomposer
meskipun jumlahnya memang tidak sebanyak dekomposer di ekosistem daratan.
Jenis dekomposer yang hidup di ekosistem air kebanyakan adalah jenis bakteri.
Selain itu, ada pula hewan yang disebut sebagai hewan pemulung, yaitu kerang,
beberapa jenis ikan, cacing, kepiting dan lobster.
Hubungan Ekosistem dan Dekomposer
 Bacteriology

Bacteria as
Biocleaner
Microbial Cleaning for Removal
of Surface Contamination
 Bacteriology
Bacteria

Bacteria Bacteria
Reproduce Secrete A typical
enzyme microbial
cleaning life
cycle diagram.
Bacteria Enzymes
Excrete CO₂ Attack
Contaminant
And H₂O
 Bacteriology

Examples of bioremediation parts washers. (a) Graymills

Biomatics™ Parts Washer, (b) Bio-Circle, and (c) ChemFree
SmartWasher.
Bacteriology

Cleaning of
parts in a wash
basin.
 Bacteriology

Parts cleaner sink (a) prior to cleaning, and (b) after cleaning.
 Bacteriology

Photos of a truck fueling bay before (a) and after (b) microbial
cleaning.
 Bacteriology

A cleaning tank (a) after drainage but before cleaning, and (b) after microbial
treatment.
Bacteriology

Inverted image of a
cellulose acetate replica
of bacteria in a vegetable
marinade. The scale bar
is 5 µm.
Bacteriology

Effect of biocleaning
with Pseudomonas
stutzeri bacterial
strain on the Stories
of the Holy Fathers
fresco before (a) and
after (b) treatment.
 Bacteriology

Fiksator
nitrogen
 FIKSATOR NITROGEN
Bakteri nitrogen (bakteri pengikat nitrogen) adalah kelompok bakteri yang mampu
mengikat nitrogen (terutaman N2) bebas di udara dan mereduksinya menjadi senyawa
amonia (NH4) dan ion nitrat (NO3-) oleh bantuan enzim nitrogenase.

Ada dua golongan besar bakteri pengikat nitrogen:

a. Kelompok Cyanobacteria
Kelompok Cyanobacteria bersimbiosis dengan banyak tumbuhan dari kelompok
tumbuhan paku atau tumbuhan berbiji terbuka, seperti Anabaena.

b. Kelompok Proteobacteria.
Kelompok Proteobacteria biasanya bersimbiosis dengan tanaman polong-
polongan untuk membentuk suatu simbiosis mutualisme dalam nodul atau bintil
akar untuk mengikat nitrogen bebas di udara yang pada umumnya tidak dapat
digunakan secara langsung oleh kebanyakan organisme.
 FIKSATOR NITROGEN
Kelompok bakteri Proteobacteria ini dikenal dengan istilah rhizobia, termasuk di
dalamnya genus bakteri Rhizobium, Bradyrhizobium, Mesorhizobium, Photorhizobium,
dan Sinorhizobium.[3] Contoh bakteri nitrogen yang hidup bersimbiosis dengan tanaman
polong-polongan yaitu Rhizobium leguminosarum, yang hidup di akar membentuk nodul
atau bintil-bintil akar.

Rhizobium banyak digunakan sebagai pupuk hijau pada beberapa tanaman,

seperti Crotalaria, Tephrosia, dan Indigofera. Akar tanaman polong-polongan tersebut
menyediakan karbohidrat dan senyawa lain bagi bakteri melalui kemampuannya mengikat
nitrogen bagi akar. Jika bakteri dipisahkan dari inangnya (akar), daya tangkap dan efisiensi
penyerapan nitrogen oleh tanaman akan berkurang cukup signifikan. Bintil-bintil akar
melepaskan senyawa nitrogen organik ke dalam tanah tempat tanaman polong hidup.
Dengan demikian terjadi penambahan nitrogen yang dapat menambah kesuburan tanah.
 Mekanisme pbtk bintil akar
Bakteri Rhizobium berkumpul di sekitar rambut – rambut akar secara alami
maupun pada media buatan dengan pemberian inokulan atau preparat
hidup bakteri Rhizobium (Sutedjo et al., 1991).
Sehubungan dengan berkumpulnya bakteri tersebut, akar akan
mengekskresikan atau mengeluarkan senyawa triptofan yang
menyebabkan bakteri berkembang pada ujung akar rambut. Kemudian
Triptofan diubah oleh Rhizobium menjadi IAA (Indole Acetic Acid) yang
menyebabkan akar membengkok Karena adanya interaksi antara akar
dengan Rhizobium.
Kemudian bakteri merombak dinding sel akar tanaman sehingga terjadi
kontak antara keduanya.
 Mekanisme pbtk bintil akar
Benang infeksi terbentuk, yang merupakan perkembangan dari membran
plasma yang memanjang dari sel terinfeksi. Setelah itu Rhizobium
berkembang di dalam benang infeksi yang menjalar menembus sel-sel
korteks sampai parenkim.
Di dalam sel kortek, Rhizobium dilepas di dalam sitoplasma untuk membentuk
bakteroid dan menghasilkan stimulan yang merangsang sel korteks untuk
membelah.
Pembelahan tersebut menyebabkan proliferasijaringan, membentuk struktur
bintil akar yang menonjol sampai keluar akar tanaman, yang mengandung
bakteri Rhizobium (Armiadi, 2009)
 Mekanisme pbtk bintil akar
Bintil akar tidak selalu tumbuh di pangkal akar, ada juga yang tumbuh di
ujung-ujung akar. Tidak selalu bintil akar dihuni oleh bakteri Rhizobium
yang tepat dan efektif.
Ciri bintil akar yang efektif adalah bila dibelah melintang akan
memperlihatkan warna merah muda hingga kecoklatan di bagian
tengahnya. Pigmen merah leghemeglobin ini yang paling berperan dalam
memfiksasi N.
Pigmen itu dijumpai dalam bintil akar antara bakteroid dan selubung
membran yang mengelilinginya. Jumlah leghemoglobin di dalam bintil akar
memiliki hubungan langsung dengan jumlah nitrogen yang difiksasi
(Novriani, 2011).
Mekanisme pbtk bintil akar
 Faktor2 yg mempengaruhi pbtk bintil akar

1. Sumber makanan (Bahan Organik dan perakaran)

Untuk bertahan sebelum menginfeksi tanaman.
2. Mikroorganisme lain (sbg kompetitor di rizosfir)
Terutama yang antagonis, karena dapat menghalangi infeksi
3. Lingkungan
yang mempengaruhi kegiatan fotosintesis untuk menyediakan kebutuhan energi
bakteri (cahaya, luas daun, CO2, pembentukan biji/ fase generatif)
4. pH
keperluan nilai pH dikehendaki netral – agak basa,
5. Suhu
yang disukai 20-28 °C, masing-masing jenis isolat berbeda tanggapnya terhadap suhu
 Faktor2 yg mempengaruhi pbtk bintil akar

6. Ketersediaan air dan hara untuk fotosintesis

karena fotosintesis yang dihasilkan tanaman dimanfaatkan oleh bakteri
7. Senyawa racun
Yang berasal dari herbisida, fungisida di tanah tidak disukai bakteri
bintil, dapat berpengaruh terhadap keberadaan bakteri, salinitas
8. Ketersediaan nutrisi
Seperti N yang bisa menghambat bintil; P untuk supali energi; Mo untuk
kerja nitrogenase, Fe dan Co utk laghemoglobin dan transfer elektron
9. Kesesuian genetik antara bakteri dgn tan (utk keperluan infeksi)
Mekanisme pbtk bintil akar
Mekanisme pbtk bintil akar
Mekanisme pbtk bintil akar
 MATERI PEMBELAJARAN

BIOREMEDIATI
ON
 BIOREMEDIATION
• Remediasi: Proses perbaikan.
• Proses perbaikan lingkungan.
• Pendekatan-pendekatan yang dilakukan untuk menghilangkan pencemar dari
lingkungan
• Menggunakan organisme (bakteri, fungi, tanaman atau enzimnya) untuk
memperbaiki atau mengembalikan keadaan lingkungan yang tercemar
• Saat bioremediasi terjadi, enzim-enzim yang diproduksi oleh mikroorganisme
memodifikasi polutan beracun dengan mengubah struktur kimia polutan tersebut,
sebuah peristiwa yang disebut biotransformasi.
• Pada banyak kasus, biotransformasi berujung pada biodegradasi, dimana polutan
beracun terdegradasi, strukturnya menjadi tidak kompleks, dan akhirnya menjadi
metabolit yang tidak berbahaya dan tidak beracun
BIOREMEDIATION
 BIOREMEDIATION
1 3

2
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
BIOREMEDIATION
Bacteriology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Environmental Microbiology
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles
Biogeochemical Cycles