MURNIATI TIHO

Metabolisme Nukleotida Yanti Meilen Mewo

Bagian Biokimia
Purin dan Pirimidin Fakultas Kedokteran
Unsrat
 Purin dan Pirimidin

Nukleosida

Nukleotida
Pokok Sintesis Nukleotida Purin
bahasan
Katabolisme Purin

Sintesis Nukleotida Pirimidin

Katabolisme Pirimidin
PURIN DAN
PIRIMIDIN
Senyawa heterosiklik yang
mengandung nitrogen dengan
cincin mengandung karbon dan
unsur-unsur lain (atom hetero)
NUKLEOSIDA

 Turunan purin dan pirimidin

• Penambahan gula ribosa atau
deoksi ribosa pada basa nitrogen
(basa purin dan pirimidin)
• melalui ikatan ß-N-glikosida
• dengan atom N-1 primidin atau
N-9 purin
• Jika Ribosa  Ribonukleosida
• Jika 2-Deoksiribosa
Deoksiribonukleosida
 NUKLEOSIDA
Ribonukleosida A, G, C, U : Deoksiribonukleosida A,
G, C, T :

Adenosin, Deoksiadenosin,
Guanosin, Deoksiguanosin,
Sitidin, Deoksisitidin,
Deoksitimidin (Timidin)
Uridin
NUKLEOTIDA

• Penambahan satu atau lebih gugus fosfat pada Nukleosida (Fosforilasi

Nukleosida)

• Terdiri atas :- Basa Nitrogen,

- Monosakarida Pentosa
- Satu, dua atau tiga gugus Fosfat

• Basa Nitrogen berasal dari : Purin dan Pirimidin

• Peran Nukleotida
1. Sintesis DNA dan RNA
2. Pembawa zat antara pada sintesis KH,
Protein, Lemak : UDP-Glukosa, CDP-Kolin
3. Komponen struktural Koenzim : FAD,
NADH,NADP
4. Second Messenger : cAMP, cGMP
5. Sebagai arus energi dalam sel: ATP
6. Senyawa pengatur berbagai jalur
metabolisme zat antara
courtesy of shanehopkins biochemistry flashcard
• 5 Basa Heterosiklik penyusun asam nukleat
Purin : Adenin (A) & Guanin (G)
Pirimidin : Sitosin (C), Timin (T) dan Urasil (U)
• Semua Asam Nukleat mengandung : Adenin,
Guanin dan Sitosin
• DNA : Adenin, Guanin, Sitosin & Timin (ada
satu gugus metil)
RNA : Adenin, Guanin, Sitosin & Urasil
• Penambahan Gugus Fosfat
Gugus fosfat pertama pada 5’-OH Pentosa
dengan ikatan ester  Nukleosida 5’fosfat
(5’Nukleotida)

• Jika I gugus fosfat pada 5’-karbon pentosa

Nukleosida Monofosfat (NMP) : AMP(Adenilat),
TMP (Asam Timidilat), UMP (Asam Uridilat)
- 2 gugus fosfat  Nukleosida Difosfat : ADP
- 3 gugus Fosfat  Nukleosida Trifosfat : ATP
• Nukleotida alamiah
- Derivat adenosin : ADP dan ATP
- Derivat Guanosin : GDP dan GTP
- Derivat Urasil : UDP-Glu dan UDP-Gal

• Derivat Sintetik
5-Fluoro urasil analog Timin
5-yodo urasil

5-Fluoro deoksiuridin analog Timidin

5-Yodo deoksiuridin
 Metabolisme Nukleotida Purin dan
Pirimidin

• Pencernaan
- Asam Nukleat dalam makanan berbentuk
Nukleoprotein
- Enzim Nuklease pankreas (Ribonuklease dan
Deoksiribonuklease)
As. Nukleat  Oligonukleotida
- Enzim Usus oleh Fosfodiesterase pankreas
Oligonukleotida  3’- dan5’-mononukleotida
- Di dalam sel mukosa usus halus oleh Nukleotidase
Mononukleotida  Nukleosida
- Oleh Nukleosidase ( Nukleosida fosforilase)
Nukleosida  Basa bebas +
(deoksi) ribosa 1-fosfat
- Basa purin dari makanan  asam urat dalam sel
mukosa usus halus  darah  diekskresi ke
dalam urin
- Sisa purin dari makanan akan dimetabolisme oleh
flora usus
• Nukleosida dapat langsung diserap atau dipecah
menjadi basa purin atau basa pirimidin bebas
oleh fosforilase usus

• Basa purin atau basa pirimidin dapat dioksidasi

- Guanosin  Guanin  Xantin As. Urat
- Adenosin  Inosin  Hipoxantin  Xantin
As. Urat
 Sintesis Nukleotida Purin
• Nukleotida purin dapat disintesis melalui dua cara :
1. Sintesis de novo (Sintesis dari zat antara amfibolik)
2. Reaksi penyelamatan (purine salvage pathway)
- Fosforibosilasi basa purin bebas
- Fosforilasi nukleosida purin

• Sumber atom karbon dan nitrogen cincin purin :

- Aspartat
- Glisin
- Glutamin
- CO2
- N10-formiltetrahidrofolat
Sumber atom karbon dan nitrogen cincin purin
 Sintesis de novo
• Membutuhkan 11 reaksi dan 6 molekul Adenosin
Trifosfat (ATP) untuk setiap sintesis purin.
• Melibatkan glisin, α-D-ribosa 5-fosfat, glutamin,
aspartat, CO2 dan N10-formiltetrahidrofolat sebagai
prekursor
• Berlangsung terutama di Hati/Hepar
• Purin disintesis dalam bentuk ribonukleotida
pertama yaitu inosin monofosfat (IMP) dan dari IMP
diturunkan adenosin monofosfat (AMP) dan
guanosin monofosfat (GMP)
• 1. Sintesis 5-fosforibosil-1-pirofosfat (PRPP)
Ribosa 5-fosfat + ATP  PRPP

Perpindahan pirofosfat dari ATP ke karbon 1

ribosa 5- fosfat

Enzim : PRPP Sintetase

Terkait kromosom-X
diaktifkan : Pi
dihambat : nukleotida purin
Gula PRPP : Ribosa
• 2. Sintesis 5- fosforibosilamin
PRPP + Glutamin  5-fosforibosilamin

Glutamin sebagai donor Nitrogen

Enzim : Glutamin fosforibosil pirofosfat

amidotransferase
Dihambat : 5-nukleotida AMP dan GMP
(guanilat)

Laju reaksi diatur oleh konsentrasi PRPP

3. Sintesis senyawa Glisinamida
Ribosil-5-Fosfat
5-Fosforibosilamina + Glisin 
Glisinamida Ribosil-5-Fosfat

Enzim : Fosforibosilglisinamida
sintetase

Reaksi : Kondensasi
4.Sintesis Senyawa
Formilglisinamida Ribosil-5-Fosfat

Glisinamida Ribosil-5-Fosfat + N5,N10 –Methenil-

H4 Folat Formilglisinamida Ribosil-5-Fosfat

Enzim :Glisinamida Ribosil-5-Fosfat

Formiltransferase
5. Sintesis senyawa
Formilglisinamidin Ribosil-5-Fosfat

Enzim : Formilglisinamida Ribosil-5-

fosfat Sintetase

Reaksi : Amidasi C4
Formilglisinamida Ribosil-5-Fosfat

Glutamin sebagai donor Amida

Reaksi membutuhkan ATP

• 6. Pembentukan senyawa Aminoimidazol
Ribosil-5-Fosfat
Reaksi : Penutupan cincin imidazol dan
dehidrasi (Pelepasan H2O)
Enzim : Aminoimidazol Ribosil-5-fosfat
Sintetase
Membutuhkan ATP
• 7.Pembentukan senyawa Aminoimidazol
Karboksilat Ribosil-5-Fosfat
Reaksi : Karboksilasi (Penambahan CO2)
Enzim : Aminoimidazol Ribosil-5-fosfat
Karboksilase
• 8. Sintesis senyawa Aminoimidazol Suksinil
Karboksamida Ribosil-5-Fosfat

• Aminoimidazol karboksilat ribosil-5-fosfat +

Aspartat  Aminoimidazol Suksinil
Karboksinamida Ribosil-5-Fosfat

Reaksi : Kondensasi
Enzim : Aminoimidazol Suksinil karboksinamida
ribosil-5-fosfat sintetase
• 9. Pembentukan senyawa Aminoimidazol
karboksamida ribosil-5-fosfat

Reaksi : Pembebasan gugus suksinil (sebagai

Fumarat) dari senyawa Aminoimidazol Suksinil
Karboksamida Ribosil-5-Fosfat

Enzim : Adenilosuksinase
• 10. Sintesis senyawa Formimidoimidazol
karboksamida ribosil-5-fosfat
Reaksi : Pemindahan gugus formil senyawa N10-
formil-tetrahidrofolat ke senyawa
Aminoimidazol karboksamida ribosil-5-fosfat
Enzim : Formil Transferase
• 11. Sintesis senyawa Inosin Monofosfat (IMP)
Reaksi : Penutupan cincin senyawa
Formimidoimidazol karboksamida
ribosil-5-fosfat
Enzim : IMP Siklohidrolase
• Konversi IMP menjadi AMP dan GMP
12. Sintesis senyawa Adenilosuksinat
Reaksi : Penambahan aspartat pada IMP
Enzim : Adenilosuksinat Sintetase

13. Sintesis senyawa Adenosin 5’Monofosfat (AMP)

Reaksi : Pelepasan Fumarat
Enzim : Adenilosuksinase
14. Sintesis senyawa Xantosin Monofosfat (XMP)
Reaksi : Oksidasi IMP
Enzim : IMP Dehidrogenase
Membutuhkan NAD+ dan air

• 15. Sintesis senyawa Guanosin Monofosfat (GMP)

Reaksi : Transamidasi gugus 2-okso pada XMP
oleh nitrogen amida senyawa glutamin
Enzim : Transamidinase
Pengaturan sintesis Purin
Jalur Penyelamatan Purin (Purine Salvage Pathway)
• Mengubah kembali purin yg berasal dari as.
Nukleat sel normal atau dari makanan yg tidak
dapat didegradasi menjadi nukleosida trifosfat dan
digunakan tubuh.
• Dua enzim yang terlibat :
- Adenin Fosforibosil transferase (APRT)
- Hipoxantin Guanin Fosforibosil Transferase
(HGPRT)
• Adenin Fosforibosil transferase (APRT)
Memfosforibosilasi Adenin dengan PRPP
membentuk AMP
• Hipoxantin Guanin Fosforibosil Transferase (HGPRT)
Memfosforibosilasi : Hipoxantin  IMP
Guanin  GMP
• Purin Nukleosida Fosforilase
mengkatalisis reaksi fosforilasi
nukleosida
Guanosin  Guanin +
Ribosa 1-fosfat
Inosin  Hipoxantin +
Ribosa 1- fosfat
 Katabolisme Purin
• Hasil akhir katabolisme purin : Asam Urat
• 1. Reaksi pelepasan gugus amino
- AMP  IMP oleh AMP Deaminase
- Adenosin  Inosin (hipoxantinribosa) oleh
Adenosin deaminase

• 2. Oleh enzim 5’nukleotidase

- IMP  Inosin
- GMP  Guanosin
• 3. Inosin  Hipoxantin
Guanosin  Guanin
Oleh Purin Nukleosida Fosforilase
• 4. Guanin  Xantin oleh Guanase (deaminasi)
Hipoxantin  Xantin oleh Xantin oksidase
• 5. Xantin  Asam Urat oleh Xantin Oksidase

• Asam Urat : - produk akhir degradasi purin

- diekskresi lewat urin
Katabolisme Purin
 Sintesis Pirimidin
• Membutuhkan PRPP, CO2, Glutamin dan
Aspartat
• 1. Sintesis senyawa karbamoil fosfat
Glutamin + CO2  Karbamoil fosfat
Enzim : Karbamoil fosfat sintetase (CPS II)
Diaktifkan : PRPP
Dihambat : UTP
• 2. Sintesis senyawa karbamoilaspartat
Aspartat + Karbamoil fosfat  Karbamoilaspartat
Enzim : aspartat transkarbamoilase
Reaksi : Kondensasi

• 3. Sintesis senyawa Dihidroorotat

Enzim : Dihidroorotase
Reaksi : Penutupan cincin pirimidin dan
pelepasan H2O
• 4. Sintesis senyawa Orotat (asam orotat)
Enzim : Dihidroorotat Dehidrogenase
Koenzim : NAD
Reaksi : Oksidasi

• 5. Sintesis senyawa Orotidin 5’-Monofosfat

(OMP/orotidilat)
Enzim : Orotat Fosforibosil transferase
Reaksi : Penambahan gugus ribosa fosfat
Pelepasan gugus pirofosfat
Sebagai donor ribosa fosfat : PRPP
• 6. Sintesis senyawa Uridin Monofosfat
(UMP)/Uridilat
Enzim : Orotidilat Dekarboksilase
Reaksi : Pelepasan gugus karboksil (dekarboksilasi)
( Orotidilat dekarboksilase dan orotat
fosforibosil transferase disebut : UMP Sintase)

• 7 & 8. Sintesis senyawa UDP & UTP

Enzim : UMP Kinase & Nukleotida difosfokinase
Reaksi : fosforilasi UMP
• 9. Sintesis senyawa Sitidin trifosfat (CTP)
Enzim : CTP Sintetase
Reaksi : Aminasi UTP dengan
Glutamin donor gugus amino
Memerlukan : ATP
Menghasilkan : Nitrogen
• 9. - Sebagian CTP  CDP (substrat utk
ribonukleotida reduktase)
Reaksi : defosforilasi
- dCDP  dCTP ( Untuk sintesis DNA)
Reaksi : fosforilasi
- dCDP dCMP
Reaksi : defosforilasi
- dCMP dUMP
Reaksi : deaminasi
• 10. Sintesis senyawa deoksitimitidin monofosfat
(dTMP)
Enzim : Timidilat Sintase
Reaksi : Metilasi
Sebagai donor gugus metil : N5,N10-Metilen
tetrahidrofolat
 Jalur Penyelamatan Pirimidin
• Mengubah ribonukleosida pirimidin : uridin & sitidin
deoksiribonukleosida pirimidin : timidin & deoksisitidin
 nukleotida
UMP, CMP, TMP dan dCMP
Enzim : Nukleosida kinase

• Asam Orotat  Orotidin monofosfat (OMP)

Enzim : Orotat fosforibosiltransferase
 Katabolisme Pirimidin
• Katabolisme pirimidin menghasilkan senyawa
yang mudah larut air seperti : CO2, NH3, β-
alanin,dan β-aminoisobutirat
• Terjadi di hati
• Nukleotida pirimidin (defosforilasi)
Nukleosida pirimidin (pemutusan)
 Ribosa-1-fosfat & basa pirimidin bebas
(Sitosin, urasil & timin)
• Sitosin  Urasil  CO2, NH4+ & β-alanin
deaminasi
Timin  CO2, NH4+ & β-aminoisobutirat
• Produk katabolisme diekskresi lewat urin atau
diubah menjadi CO2, H2O & NH4+ (membentuk
urea)
Katabolisme Pirimidin
 REFERENSI
• Ferrier, DR. Lippincott’s Ilustrated Reviews
Biokimia Edisi ke-6 Jilid Dua. Binarupa Aksara
Publisher. 2014. hal. 79-98.
• Rodwell VW. Metabolisme Nukleotida Purin
dan Pirimidin. Biokimia Harper Edisi 27.
Murray RK, Granner DK, Rodwell VW editor.
Jakarta: Penerbit Buku Kedokteran EGC. 2009.
hal 311-320