JOURNAL READING

Neurological Diseases With Autism Spectrum Disorder: Role of

ASD Risk Genes
Pembimbing:
dr. Agus Yudawijaya, Sp. S

Disusun oleh:
Ni Ketut Maharani
2065050121

Kepaniteraan Klinik Kesehatan Kulit dan Kelamin

Periode 19 Oktober – 31 Oktober 2020
Fakultas Kedokteran Universitas Kristen Indonesia
Jakarta
 ABSTRAK
Gangguan spektrum autisme (ASD) sering menjadi komorbiditas dengan gangguan
neurologis lain seperti disabilitas intelektual (ID) atau keterlambatan perkembangan global
(GDD) dan epilepsi.

Dalam penelitian ini, kami merekrut kohort dari 158 gangguan neurologis proband dengan
163 varian dari 48 gen risiko ASD. Dari jumlah tersebut, 50 orang (31,6%) didiagnosis
dengan ASD.

Dalam subset pasien ASD, kami mengidentifikasi beberapa kandidat gen yang
jarang dilaporkan termasuk DOLK, USH2A, dan HUWE1

Kami menemukan bahwa ID / GDD sering menjadi komorbid dengan ASD sedangkan
epilepsi lebih sering terjadi pada kelompok non-ASD.

Analisis statistik dari semua faktor risiko yang mungkin berimplikasi bahwa varian gen
sinaptik, terutama gen saluran ion nonvoltage- Gated dan gen transkripsi dan kromosom
yang terkait dengan ASD
PENDAHULUAN
 PENDAHULUAN

 Gangguan spektrum autisme (ASD), gangguan perkembangan saraf

yang umum, ditandai dengan defisiensi dalam komunikasi dan interaksi
sosial serta perilaku berulang yang terbatas.

 ASD memiliki 1007 gen risiko sesuai dengan basis data Gen SFARI,
basis data gen yang berkembang yang terlibat di dalamnya kerentanan
autisme. Beberapa gen penyebab telah diidentifikasi untuk ASD,
termasuk MECP2 dan CHD8. Banyak gen terkait ASD lainnya seperti
CDKL5, SCN1A juga terkait dengan epilepsi, ID, atau sindrom
neurologis lainnya.
 Faktor risiko untuk ASD :
 Termasuk usia orang tua yang lanjut
 Ibu merokok
 Faktor yang berhubungan dengan kehamilan seperti obesitas dan
diabetes
 Paparan logam berat, polutan udara, atau racun lainnya setelah
melahirkan.
 Mutasi genetik pada gen risiko ASD telah terdeteksi pada anak-anak
dengan berbagai gangguan sistem saraf, termasuk epilepsi dan ID.
 Namun, hanya sebagian dari pasien ini yang datang dengan ciri-ciri
autistik, bahkan ketika mutasi terjadi pada gen ASD sindromik seperti
TSC1.
BAHAN DAN METODE
 PASIEN
 Kami merekrut 158 pasien dengan gangguan sistem saraf dari departemen
pediatrik Rumah Sakit Xiangya di Central South University dari 2014 hingga
2018.
 Gen risiko ASD diidentifikasi menurut database Gen SFARI.
 Kami kemudian mengadopsi " genotype-first approach" untuk memastikan
diagnosis akhir pasien.
 Persetujuan etis untuk penelitian ini diperoleh dari Komite Etik Rumah Sakit
Xiangya sesuai dengan deklarasi Helsinki, dan persetujuan tertulis diperoleh
dari subjek dan orang tua atau wali pasien.
 Tindak lanjut dilakukan dari tanggal diagnosis genetik hingga tanggal diagnosis
ASD atau hingga 1 Juni 2018.
Pasien dievaluasi untuk ASD sesuai dengan kriteria DSM-V oleh dua
dokter neurologis anak yang berpengalaman:
1. Defisit persisten dalam komunikasi sosial dan interaksi sosial
2. Pola perilaku, minat, atau aktivitas yang dibatasi dan berulang
3. Gejala yang muncul pada periode perkembangan awal
4. Gejala yang menyebabkan gangguan yang signifikan secara klinis di
bidang fungsi sosial, pekerjaan, atau kritis lainnya
5. Gangguan tidak dijelaskan dengan lebih baik oleh ID atau GDD.

Lalu, kami membagi menjadi dua kelompok: pasien dengan kelompok

ASD (ASD Group) dan pasien tanpa kelompok ASD (non-ASD Group).
CAPTURE STRATEGY, SEQUENCING, DAN VALIDASI

Semua pasien menjalani tes peripheral blood genetic

Empat puluh empat pasien menjalani whole-exome sequencing (WES),

67 pasien menjalani pengujian panel gen termasuk panel untuk epilepsi,
tuberous sclerosis complex, dan neurofromatosis, dan 47 pasien
menjalani pengujian panel gen WES klinis

Varian kandidat disaring sesuai dengan pedoman American

College of Medical Genetics (ACMG) untuk interpretasi varian
sekuens dan dikonfirmasi oleh sekuensing Sanger.
 PENGELOMPOKAN FUNGSIONAL GENETIK
Penelitian ini hanya memasukkan gen risiko ASD yang dikonfirmasi oleh database
Gen SFARI, dikelompokkan menjadi tiga kategori:
1. Gen Sinaptik: gen yang terlibat dalam fungsi sinaptik seperti transmisi, daur
ulang vesikel, dan plastisitas sinaptik.
2. Gen Transkripsi dan kromatin: regulator kromatin dan faktor transkripsi yang
penting untuk proses perkembangan, termasuk pemodel ulang kromatin yang
bergantung pada ATP.
3. Gen dengan fungsi lain termasuk gen yang berhubungan dengan metabolisme.

Gen sinaptik dibagi lagi menjadi dua kelompok: gen yang mengkode saluran ion
dengan voltage-gated dan gen yang mengkode saluran ion dengan non voltage-
gated.
 STATISTIK

 Perbedaan yang signifikan dalam diagnosis awal antara kelompok ASD dan non-
ASD dievaluasi menggunakan tes eksak Fisher.

 Ambang batas untuk signifikansi adalah p < 0,05. Untuk mengontrol beberapa
perbandingan, kami menggunakan pendekatan Benjamini-Yekutieli, yang
memungkinkan struktur data dependen, menetapkan false discovery rate (FDR)
(FDR) 0,05.
HASIL
 ANALISIS SEGREGASI

 Di antara 131 kasus ini, 93 kasus mutasi de novo . Enam kasus terdeteksi
dengan mutasi heterozigot yang diwarisi dari orang tua mereka yang sehat.
Khususnya, proband M0332 memiliki file de novo mutasi dan mutasi
heterozigot yang diwarisi dari ibunya yang sehat.

 Sebelas proband memiliki mutasi heterozigot yang juga terdeteksi pada

orang tua mereka.

 Selain itu, 12 anak laki-laki memiliki varian hemizigous dari gen resesif
terkait-X yang diturunkan dari ibu mereka.
 Tujuh pasien terbagi menjadi heterozigot SCN1A (M0343, M0344, P0274,
M0352, M0353, M0355) atau SCN8A ( M0358) mutasi dengan orang tua
mereka yang masing-masing sehat, yang dapat dijelaskan sebagai
incomplete penetrance.

 Selain itu, pasien M0046 yang memiliki mutasi gen STXBP1 yang diwarisi
dari ibu yang sehat akibat mosaicism seperti yang dilaporkan dalam
penelitian sebelumnya.
 FENOTIPE PASIEN
Berkenaan dengan penyakit komorbid ID / GDD lebih umum
pada kelompok ASD dibandingkan pada kelompok non-ASD
(50,0% vs. 5,7%, p = 9.37 × 10 - 11). Sebaliknya, epilepsi dan
ensefalopati epilepsi lebih sedikit ditemukan pada kelompok
ASD dibandingkan pada kelompok non-ASD (34,0% vs 74,5%,
p = 2.76 × 10 - 4) ( Tabel 1).
GENOTIPE PASIEN

Kami mendeteksi 163 varian dalam 48 gen risiko ASD. Hanya satu gen yang bermutasi
yang diidentifikasi sebagai gen patogenik atau kemungkinan patogenik atau uncertain
significant gene pada setiap subjek.

KELOMPOK PRESENTASI MUTASI GEN

ASD SCN1A ( 56, 35,4%), CDKL5 ( 16,10,1%),

MECP2 ( 7, 4,4%), PCDH19 ( 4, 2,5%),
ATP1A3 ( 4, 2,5%), NF1 ( 4, 2,5%), SCN8A ( 4, 2,5%), TSC2 (4, 2,5%), SCN2A ( 3,
1,9%), TSC1 ( 3, 1,9%), SMARCA2 ( 3, 1,9%), dan STXBP1 (3, 1,9%).

Non-ASD CDKL5 ( 8, 16%), MECP2 ( 7, 14%), SMARCA2 ( 3, 6%), SYNGAP1 (2, 4%),
SLC6A1 ( 2, 4%), dan UBE3A ( 2, 4%).

Perlu dicatat bahwa varian USH2A, HUWE1, dan DOLK terdeteksi pada pasien dengan ASD, yang
jarang dilaporkan.
Klasifikasi fungsional gen dan jumlah gen dalam setiap kelompok.
 PERBEDAAN UNUSUAL SEX PADA
PENYAKIT NEUROLOGIS ASD GROUP

ID / GDD adalah komorbiditas umum dalam kelompok ASD kami (29/50 pasien), dan
penelitian sebelumnya telah menunjukkan bahwa tingkat kecerdasan secara signifikan
memengaruhi rasio jenis kelamin autisme, dengan rasio pria-wanita 1,7: 1 pada pasien
dengan ID sedang hingga berat.

Yang tidak kalah penting, semua subjek yang terdaftar dalam penelitian ini memiliki mutasi
genetik, yang mungkin juga berkontribusi pada rasio jenis kelamin yang tidak biasa karena
wanita dengan autisme memiliki tingkat varian genetik yang lebih tinggi daripada pria
autisme.
 MUTASI GEN RISIKO ASD PADA PASIEN
GANGGUAN NEUROLOGIS PEDIATRIK

Penelitian sebelumnya melaporkan bahwa 70% pasien autisme memiliki ID,

sementara prevalensi autisme dengan epilepsi komorbid diperkirakan
mencapai 8-30%. De Rubies dan koleganya juga menemukan bahwa
anak-anak dengan ID lebih mungkin mengembangkan ASD dibandingkan
dengan epilepsi.

Kesimpulan serupa dapat diperoleh dalam penelitian kami, dan kami

menemukan bahwa ID / GDD lebih relevan dengan ASD daripada epilepsi.
Karena ukuran sampel penelitian terbatas, kami tidak dapat memperoleh
kesimpulan yang lebih berguna tentang hubungan antara penyakit neurologis
lain dan ASD
 GEN YANG BERKONTRIBUSI PADA KEMUNGKINAN MEKANISME
MONOGENIK UMUM DALAM ASD

 Hasilnya menggambarkan bahwa gen risiko ASD dengan fungsi transkripsi dan
kromosom sering dikaitkan dengan fitur autistik. Kami selanjutnya menyimpulkan
bahwa pasien ASD lebih cenderung memiliki varian pada gen yang berhubungan
dengan saluran non-ion daripada pada gen yang berhubungan dengan saluran ion.

 Khususnya, 35,4% pasien dalam kelompok kami mengalaminya mutasi SCN1A,

yang sebelumnya dikaitkan dengan spektrum gangguan kejang. Lebih lanjut, 56
pasien ini didiagnosis dengan sindrom Dravet.

 50% kasus kami dengan CDKL5 varian memiliki ASD. Hal ini dapat dijelaskan
dengan fakta bahwa CDKL5 mutasi yang terkait dengan gangguan perkembangan
saraf yang memiliki fenotipe mirip Rett.
 VARIASI FENOTIPE KLINIS PASIEN
DENGAN GEN RISIKO ASD

 Dari 163 varian dalam 48 gen risiko ASD yang terdeteksi dalam kohort
ini, hanya 54 varian dalam 29 gen yang dikaitkan dengan ciri autistik.

 Jenis mutasi gen pada kedua kelompok serupa, tetapi persentase mutasi
nonsense lebih tinggi pada kelompok ASD dibandingkan pada kelompok
non-ASD, khususnya untuk gen sinaptik (21,4% vs 13,0%).
 Dengan keterbatasan penelitian kami, kami tidak dapat menarik
kesimpulan yang lebih akurat, tetapi kecenderungan tersebut
dapat tercermin dari hasil kami.
 Dalam penelitian kami, tidak ada hubungan antara faktor
lingkungan potensial termasuk usia orang tua, operasi caesar,
komplikasi kelahiran, trauma, iskemia, hipoksia.
 PROSPEK UNTUK GEN RISIKO ASD
PADA PASIEN DENGAN
GANGGUAN NEUROLOGIS

 Peningkatan jumlah gen penyebab penyakit neurologis lainnya

diidentifikasi sebagai gen kandidat untuk ASD. Namun, masih
belum jelas apakah dan kapan pasien dengan gen ini hadir dengan
karakteristik autistik dan bagaimana mereka harus dirawat.

 Penemuan ini menunjukkan bahwa hampir 1/3 orang dengan

gangguan sistem saraf dan mutasi pada gen risiko ASD juga
mengembangkan komorbid ASD, terutama pada pasien dengan ID.
Hasil lebih lanjut menunjukkan bahwa fungsi gen dan jenis mutasi
juga dapat digunakan untuk memprediksi ASD.
 Referensi
 
 Amiet, C., Gourfinkel-An, I., Bouzamondo, A., Tordjman, S., Baulac, M., Lechat, P., et al. (2008). Epilepsy in autism is associated with
intellectual disability and gender: evidence from a meta-analysis. Biol. Psychiatry 64, 577–582. doi: 10.1016/j.biopsych.2008.04.030!
 Arafat, A., Jing, P., Ma, Y., Pu, M., Nan, G., Fang, H., et al. (2017). Unexplained early infantile epileptic encephalopathy in Han
Chinese children: nextgeneration sequencing and phenotype enriching. Sci. Rep. 7:46227. doi: 10.1038/ srep46227
 Auerbach, B. D., Osterweil, E. K., and Bear, M. F. (2011). Mutations causing syndromic autism define an axis of synaptic
pathophysiology. Nature 480, 63–68. doi: 10.1038/nature10658
 Bölte, S., Duketis, E., Poustka, F., and Holtmann, M. (2011). Sex differences in cognitive domains and their clinical correlates in
higher-functioning autism spectrum disorders. Autism 15, 497–511. doi: 10.1177/1362361310 391116
 Bozzi, Y., Provenzano, G., and Casarosa, S. (2018). Neurobiological bases of autism-epilepsy comorbidity: a focus on
excitation/inhibition imbalance. Eur. J. Neurosci. 47, 534–548. doi: 10.1111/ijlh.13595
 Chiurazzi, P., and Pirozzi, F. (2016). Advances in understanding-genetic basis of intellectual disability. F1000Res. 5:599. doi:
10.12688/f1000research.7134.1 Curran, E. A., O’Neill, S. M., Cryan, J. F., Kenny, L. C., Dinan, T. G., Khashan,
 A. S., et al. (2015). Research review: birth by caesarean section and development of autism spectrum disorder and attention-
deficit/hyperactivity disorder: a systematic review and meta-analysis. J. Child. Psychol. Psychiatry. 56, 500–508. doi:
10.1111/jcpp.12351
 De Rubeis, S., He, X., Goldberg, A. P., Poultney, C. S., Samocha, K., Cicek, A. E., et al. (2014). Synaptic, transcriptional and
chromatin genes disrupted in autism.
 Nature 515, 209–215. doi: 10.1038/nature13772 Fehr, S., Leonard, H., Ho, G., Williams, S., De Klerk, N., Forbes, D., et al. (2015).
There is variability in the attainment of developmental milestones in the CDKL5 disorder. J. Neurodev. Disord. 7, 1–13. doi:
10.1186/1866- 1955-7-2
 
 Ho, L., and Crabtree, G. R. (2010). Chromatin remodelling during development. Nature 463, 474–484. doi:
10.1038/nature08911Guo, H., Peng, Y., Hu, Z., Li, Y., Xun, G., Ou, J., et al. (2017). Genome-wide copy number variation analysis
in a Chinese autism spectrum disorder cohort. Sci. Rep. 10:44155. doi: 10.1038/srep44155
 Han, S., Tai, C., Westenbroek, R. E., Yu, F. H., Cheah, C. S., Potter, G. B., et al. (2012). Autistic behavior in Scn1aC/􀀀 mice and
rescue by enhanced GABAergic transmission. Nature 489, 385–390. doi: 10.1038/nature11356
 Hattier, M. A., Matson, J. L., Tureck, K., and Horovitz, M. (2011). The effects of gender and age on repetitive and/or restricted
behaviors and interests in adults with autism spectrum disorders and intellectual disability. Res. Dev. Disabil. 32, 2346–2351. doi:
10.1016/j.ridd.2011.07.028
 Helander, A., Stödberg, T., Jaeken, J., Matthijs, G., Eriksson, M., and Eggertsen, G. (2013). Dolichol kinase deficiency (DOLK-
CDG) with a purely neurological presentation caused by a novel mutation. Mol. Genet. Metab. 110, 342–344. doi:
10.1016/j.ymgme.2013.07.002
 Ho, L., and Crabtree, G. R. (2010). Chromatin remodelling during development. Nature 463, 474–484. doi: 10.1038/nature08911
 Guo, H., Peng, Y., Hu, Z., Li, Y., Xun, G., Ou, J., et al. (2017). Genome-wide copy number variation analysis in a Chinese autism
spectrum disorder cohort. Sci. Rep. 10:44155. doi: 10.1038/srep44155
 Han, S., Tai, C., Westenbroek, R. E., Yu, F. H., Cheah, C. S., Potter, G. B., et al. (2012). Autistic behavior in Scn1aC/􀀀 mice and
rescue by enhanced GABAergic transmission. Nature 489, 385–390. doi: 10.1038/nature11356
 Hattier, M. A., Matson, J. L., Tureck, K., and Horovitz, M. (2011). The effects of gender and age on repetitive and/or restricted
behaviors and interests in adults with autism spectrum disorders and intellectual disability. Res. Dev. Disabil. 32, 2346–2351. doi:
10.1016/j.ridd.2011.07.028 Helander, A., Stödberg, T., Jaeken, J., Matthijs, G., Eriksson, M., and Eggertsen, G. (2013). Dolichol
kinase deficiency (DOLK-CDG) with a purely neurological presentation caused by a novel mutation. Mol. Genet. Metab. 110, 342–
344. doi: 10.1016/j.ymgme.2013.07.002
 Ho, L., and Crabtree, G. R. (2010). Chromatin remodelling during development. Nature 463, 474–484. doi: 10.1038/nature08911
Jenuwein, T., and Allis, C. D. (2001). Translating the histone code. Science 293, 1074–1080. doi: 10.1126/science.1063127 Lai,
M. C., Lombardo, M. V., and Baron-Cohen, S. (2014). Autism. Lancet 383, 896–910. doi: 10.1016/S0140-6736(13)61539-1
Lampi, K. M., Hinkka-Yli-Salomäki, S., Lehti, V., Helenius, H., Gissler, M., Brown, A. S., et al. (2013). Parental age and risk of
autism spectrum disorders in a Finnish national birth cohort. J. Autism Dev. Disord. 43, 2526–2535. doi: 10.1007/s10803-013-
1801-3
TERIMA KASIH