PATOGEN DAN INFEKSI

Oleh kelompok 4:
Sisi Yulianti (2020422015)
Sindy Gemaeka Putri (2020422005)

Jurusan Biologi
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Program Pascasarjana
2020/2021
 Patogen, mikroorganisme dan
mikrobiota

• Patogen adalah agen biologis atau disebut juga dengan

mikroorganisme parasit yang mampu menghasilkan berbagai jenis
penyakit yang dapat menyerang inangnya yaitu manusia, hewan, dan
tumbuhan melalui simbiosis parasitisme, mutualisme, atau
komensalisme.
• Mikroorganisme atau mikroba adalah organisme yang berukuran
sangat kecil sehingga untuk mengamatinya diperlukan alat
bantuan. Mikroorganisme disebut juga organisme mikroskopik,
seperti virus, bakteri, fungi dan lainnya.
• Kumpulan mikroorganisme yang berada di dalam atau pada suatu
organisme disebut mikrobiota. Banyak dari mikroba ini memiliki
efek menguntungkan pada kesehatan organisme, membantu
perkembangan dan fisiologi normal.
HUBUNGAN SIMBIOSIS MIKROBA-HOST

• Simbiosis = hidup bersama

• Hidup di atau dalam organisme inang atau
disebut dengan Host. Inang manusia adalah
lingkungan yang kaya nutrisi, hangat, dan
lembab, sehingga membuat sel patogen
nyaman dengan lingkungan tersebut.
• Manusia  hubungan simbiosis dengan
mikroorganisme yang tidak terhitung
jumlahnya (100 triliun bakteri, jamur dan
virus yang sangat banyak)
• Tipe simbiosis:
Mutualisme
Komensalisme
Parasitisme
 Simbiosis Organisme 1 Organisme 2 Contoh

Bakteri dalam kolon manusia.

Bakteri mendapat lingkungan
Mutualisme Untung Untung hangat, lembab, banyak
makanan, Manusia mendapat
vitamin yang dilepas bakteri
ketika mati

Tidak untung
Komensalisme Untung dan tidak Staphylococcus di kulit manusia
merusak

Bakteri tuberkulosis di paru

Parasitisme Untung Merusak manusia. Parasit yang
menyebabkan penyakit
(PATOGEN).
 Cara Patogen Berinteraksi dengan Inangnya

• Patogen primer menyebabkan infeksi epidemik akut yang mengancam jiwa dan menyebar
cepat dari satu inang yang sakit atau sekarat ke yang lain, contoh bakteri Vibrio cholerae ,
Patogen yang menyebabkan kolera.
Primer

• Menyebabkan penyakit hanya jika sistem kekebalan kita melemah atau jika mereka
Patogen memperoleh akses ke bagian tubuh yang biasanya steril
Oportunistik

• Memasuki inang (biasanya dengan memecahkan penghalang

epitel)
• Menemukan ceruk yang cocok secara nutrisi dalam tubuh inang
• Menghindari, menumbangkan, atau mengelak dari respons imun
bawaan dan adaptif inang
• Mereplikasi, menggunakan sumber daya hosT
• Keluar dari satu host dan menyebar ke yang lain
Patogen Dapat Berkontribusi pada Kanker, Penyakit
Kardiovaskular, dan Penyakit Kronis Lainnya

• Beberapa kanker pada manusia juga diketahui

berasal dari virus. Human papillomavirus,
misalnya, yang menyebabkan kutil kelamin,
bertanggung jawab atas lebih dari 90% kanker
serviks.
• Kerusakan jaringan kronis yang disebabkan
oleh infeksi dapat meningkatkan
kemungkinan terjadinya kanker. Peradangan
yang disebabkan oleh bakteri H. pylori yang
tinggal di perut bisa menjadi penyumbang
utama kanker perut, serta tukak lambung.
• penyakit kardiovaskular sering kali diakibatkan
oleh aterosklerosis, penumpukan timbunan
lemak di dinding pembuluh darah yang dapat
menghalangi aliran darah dan menyebabkan
serangan jantung dan stroke.
A. Struktur selubung protein, atau
kapsid, virus polio. Virus ini
pernah menjadi penyebab umum
kelumpuhan, tetapi penyakit
(poliomielitis) telah sangat
berkurang dengan vaksinasi yang
meluas

B. Bakteri Vibrio cholerae, agen

penyebab epidemi, penyakit diare
kolera

D. Parasit protozoa Trypanosoma

brucei (ungu) dalam lapisan
eritrosit (sel darah merah; merah D. Gumpalan nematoda Ascaris ini dikeluarkan
muda). Parasit ini menyebabkan dari usus seorang anak laki-laki berusia dua
penyakit tidur Afrika, penyakit tahun yang terhalang
yang berpotensi fatal pada sistem
saraf pusat
Patogen Bisa berupa Virus, Bakteri, atau Eukariota

Virus adalah agen infeksi berukuran kecil yang

Virus bereproduksi di dalam sel inang yang hidup. Ketika
terinfeksi, sel inang dipaksa untuk menghasilkan
ribuan salinan identik virus asli dengan cepat. Virus
sendiri tidak memiliki sel; pembentukan virus-virus
baru berlangsung dalam sel inang yang terinfeksi.

Bakteri kelompok organisme yang tidak memiliki membran

inti sel. Bakteri merupakan organisme mikroskopik.
Bakteri terdiri atas 2 yaitu bakteri patogen yang
merupakan penyakit bagi inangnya dan bakteri non
patogen yang dapat digunakan dalam kehidupan
sehari-hari.

Eukariota memiliki organel bermembran, terutama inti, yang

berisi materi genetik, dan terbungkus oleh selubung
nukleus
Bentuk Bakteri Dan Struktur Permukaan Sel

Bakteri diklasifikasikan Menjadi Gram

Positif dan Gram Negatif

A. Bakteri gram positif memiliki membran

tunggal dan dinding sel tebal yang terbuat
dari peptidoglikan bersilangan dan dapat
mempertahankan pewarna violet yang
digunakan dalam prosedur pewarnaan
Gram, contohnya
Streptococcus dan Staphylococcus.
B. Bakteri gram negatif memiliki dinding sel
peptidoglikan yang lebih tipis dan gagal
mempertahankan pewarna di dalam
prosedur pewarnaan Gram. Contohnya
Escherichia coli ( E. coli ) dan Salmonella.
 Pelengkap permukaan sel pada
bakteri berupa alat berenang yang
menggunakan rotasi heliks
flagella. Bakteri yang
diilustrasikan hanya memiliki satu
flagellum di satu kutub namun,
banyak yang memiliki banyak
flagela. Pili lurus (juga disebut
fimbriae) digunakan untuk
menempel pada berbagai
permukaan inang, serta
memfasilitasi pertukaran genetik
antar bakteri.
• Bakteri menunjukkan keanekaragaman molekuler, metabolisme, dan ekologi
yang luar biasa. Pada tingkat molekuler, bakteri jauh lebih beragam daripada
eukariota, dan mereka dapat menempati relung ekologis yang memiliki suhu
ekstrim, konsentrasi garam, dan batasan nutrisi.
• menyebabkan penyakit jika mereka bertemu dengan inang yang rentan; ini
disebut patogen fakultatif. Yang lain hanya dapat bereplikasi di dalam tubuh
inangnya dan oleh karena itu disebut patogen obligat.
• Contohnya, Shigella flexneri, misalnya yang menyebabkan epidemic disentri
(diare berdarah), hanya akan menginfeksi manusia dan primata lainnya.
 Bakteri Patogen Membawa Gen Virulensi Khusus

Gen yang berkontribusi pada kemampuan suatu organisme yang menyebabkan penyakit
disebut gen virulensi , dan protein yang dikodekannya adalah disebut faktor virulensi . Gen
virulensi tersebut sering berkumpul bersama di kromosom bakteri, kelompok besar
disebut pulau patogenisitas.

Perbedaan genetik antara E. coli non patogenik dan dua patogen yang ditularkan
melalui makanan. Shigella flexneri, yang menyebabkan disentri, dan Salmonella
enterica, penyebab umum keracunan makanan. E. coli nonpatogenik memiliki
kromosom melingkar tunggal. Kromosom S. flexneri berbeda dari E. coli di beberapa
lokasi, sebagian besar gen yang diperlukan untuk patogenesis (gen virulensi) dibawa
ke dalam plasmid virulensi ekstrakromosom. Kromosom S. enterica membawa dua
sisipan besar (pulau patogenisitas) yang tidak ditemukan dalam kromosom E. coli,
sisipan ini masing-masing mengandung banyak gen virulensi
 Bakteri patogen diperkirakan muncul saat kelompok gen virulensi ditransfer bersama
menjadi bakteri avirulen sebelumnya dengan proses yang disebut transfer gen
horizontal (untuk membedakannya dari transfer gen vertikal dari induk untuk keturunan).

Mekanisme Bakteri patogen

berevolusi melalui transfer gen
horizontal

• transformasi alami, di mana DNA

telanjang diambil oleh bakteri yang
kompeten
• transduksi, di mana virus bakteri
(bakteriofag) mentransfer DNA dari
satu bakteri ke bakteri lain
• konjugasi, di mana DNA plasmid,
dan bahkan DNA kromosom,
ditransfer dari donor ke bakteri
penerima
Gen Virulensi Bakteri Menyandikan Protein Efektor dan Sistem Sekresi untuk
Mengirimkan Protein Efektor ke Sel Inang

• Bakteri patogen yang hidup di luar sel inang, yang disebut

bakteri patogen ekstraseluler
• Gen virulensi sering kali menyandikan protein beracun
yang disekresikan (racun) yang berinteraksi dengan
struktural sel inang atau memberi sinyal protein untuk
memperoleh respons yang menguntungkan bagi patogen.
• Racun bakteri seringkali terdiri dari dua komponen protein.
subunit A dengan aktivitas enzimatik, dan subunit B yang
mengikat reseptor spesifik pada permukaan sel inang dan
mengarahkan lalu lintas subunit A ke sitosol melalui
berbagai rute
Masuknya Toksin Bakteri Sel Inang

Racun bakteri sering kali terdiri dari subunit

protein A dan B.
• Subunit B (pengikat) dari toksin berinteraksi
dengan reseptor toksin sel inang,
memungkinkan endositosis dan perdagangan
intraseluler subunit B serta subunit A yang
terkait dan aktif secara enzimatis.
• Dalam kasus Bacillus anthracis, subunit B
mengubah konformasi di lingkungan pH rendah
dari endosom untuk membentuk pori melalui
dua subunit A yang berbeda, faktor letal dan
faktor edema, diangkut melintasi membran
endosom dalam konformasi yang tidak terlipat.
• Dalam kasus racun Vibrio cholerae dan toksin
Bordetella pertussis, subunit B dan A diangkut
ke aparatus Golgi dan kemudian ke retikulum
endoplasma (ER), di mana subunit A kemudian
ditranslokasi ke dalam sitosol dalam konformasi
yang tidak terlipat melalui saluran
proteintranslokasi
Bakteri Mengeluarkan Dua Racun Dengan Subunit B Identik Tetapi Subunit A
Berbeda
• Subunit A disebut faktor mematikan
dan faktor edema.
• Subunit A toksin edema adalah siklase
adenil yang mengkatalisis produksi AMP
siklik, menyebabkan ketidakseimbangan
ion yang dapat menyebabkan akumulasi
cairan ekstraseluler (edema) di kulit
atau paru-paru.
• Subunit A toksin mematikan adalah
protease yang membelah beberapa
anggota aktif dari famili protein kinase
kinase (MAP kinase kinase) yang
diaktifkan oleh mitogen, mengganggu
pensinyalan intraseluler dan
menyebabkan disfungsi sel kekebalan
dan kematian sel.
• Selain racun, bakteri menggunakan
sistem sekresi khusus untuk
mengeluarkan banyak protein faktor
penentu lain yang berinteraksi dengan
sel inang.
• Contohnya Bakteri gram negatif memiliki
sistem sekresi umum dan beberapa
kelas sistem sekresi aksesori (tipe I-VI).
• Sistem sekresi tipe III menyuntikkan ke
dalam protein eflektor sitoplasma sel
inang yang dapat memunculkan
berbagai respons sel inang yang
memungkinkan bakteri menyerang atau
bertahan hidup
Sistem Sekresi Tipe III Yang Dapat Mengirimkan Protein Efektor Ke Dalam
Sitosol Sel Inang

A. Mikrograf elektron dari sistem sekresi

tipe III yang dimurnikan, masing-
masing terdiri dari lebih dari dua lusin
protein.
B. Cincin bawah yang besar tertanam di
membran dalam bakteri, dan cincin
atas yang lebih kecil tertanam di
membran luar bakteri. Selama infeksi,
penambatan ujung jarum berlubang
pada membran plasma sel inang
menghasilkan sekresi protein
translocator bakteri (hijau), yang
membentuk pori di membran inang,
di mana protein efektor bakteri
kemudian disekresikan ke sel inang.
Parasit Jamur dan Protozoa Memiliki Siklus Hidup Kompleks Yang Melibatkan
Berbagai Bentuk

• Jamur patogen dan parasit protozoa adalah eukariota, seperti juga inangnya
• Ciri kedua dari infeksi jamur dan parasit yang membuat mereka sulit diobati adalah
kecenderungan patogen untuk berpindah di antara beberapa bentuk yang berbeda
selama siklus hidup mereka.
• Jamur menunjukkan dimorfisme yaitu kemampuan untuk tumbuh dalam bentuk ragi
atau jamur. Transisi ragi-ke-jamur atau jamur-ke-ragi sering dikaitkan dengan infeksi.
Contohnya Histoplasma capsulatum , misalnya, tumbuh sebagai jamur pada suhu
rendah di tanah, tetapi berubah menjadi bentuk ragi ketika dihirup ke paru-paru, di
mana itu dapat menyebabkan histoplasmosis penyakit.
• Parasit protozoa adalah eukariota bersel tunggal dengan siklus hidup
yang lebih rumit daripada jamur, dan seringkali membutuhkan lebih dari
satu inang.
• Misalnya Malaria adalah penyakit protozoa yang paling merusak,
menginfeksi lebih dari 200 juta orang setiap tahun dan membunuh lebih
dari 500.000. Penyakit ini disebabkan oleh empat spesies Plasmodium
yang ditularkan ke manusia melalui gigitan nyamuk Anopheles betina.
• Plasmodium falciparum menyebabkan bentuk paling serius dari malaria
dan merupakan parasit penyebab malaria yang paling banyak dipelajari.
• Beberapa dari bentuk ini sangat terspesialisasi untuk menyerang dan
mereplikasi di jaringan tertentu seperti lapisan usus serangga, hati
manusia, dan sel darah merah manusia.
 Siklus Seksual Plasmodium falciparum Membutuhkan Perjalanan Antara Inang
Manusia Dan Inang Serangga

Beberapa dari bentuk ini sangat khusus untuk menyerang dan berkembang biak di jaringan
tertentu, misalnya lapisan usus serangga, hati manusia, dan sel darah merah
manusia. Bahkan dalam satu jenis sel inang, sel darah merah, Parasit Plasmodium mengalami
rangkaian peristiwa perkembangan yang kompleks, tercermin dalam perubahan morfologi
yang mencolok.
Semua Aspek Propagasi Virus Tergantung pada Sistem Sel Inang

• Bakteri, jamur, dan patogen

protozoa menggunakan diri mereka
sendiri untuk replikasi DNA, transkripsi,
dan terjemahan, dan, untuk sebagian
besar, mereka menyediakan sumber
energi metaboliknya sendiri.
• Virus, mereka paling sering mencari
tumpangan, hanya membawa sedikit
informasi di dalam bentuk asam nukleat
• replikasi virus melibatkan
masuk ke dalam sel inang
pembongkaran partikel virus menular
replikasi genom virus
transkripsi gen virus dan sintesis
protein virus
perakitan komponen virus ini menjadi
partikel virus keturunan
pelepasan virion keturunan
Contoh virus morfologi. Seperti yang ditunjukkan, baik DNA dan virus RNA sangat
bervariasi dalam ukuran dan bentuk
• Genom virus dikemas dalam mantel protein, yang disebut kapsid,
yang pada beberapa virus lebih jauh ditutup oleh membran bilayer
lipid, atau selubung
• Kapsid terbuat dari satu atau beberapa protein, disusun dalam
susunan teratur yang umumnya menghasilkan struktur dengan simetri
heliks, yang menghasilkan struktur silinder (misalnya, flu, campak, dan
bunyavirus), atau simetri ikosahedral (misalnya, virus polio dan virus
herpes.
• Ketika kapsid dikemas dengan genom virus, strukturnya disebut
nukleokapsid. Nukleokapsid dari virus yang tidak memiliki amplop
biasanya meninggalkan sel yang terinfeksi dengan melisasinya.
• Virus dalam amplop dapat menyebabkan infeksi terus-menerus yang
dapat berlangsung selama bertahun-tahun, seringkali tanpa efek
merusak yang nyata pada host.
A. Mikrograf elektron dari sel
hewan dari mana enam
salinan virus yang diselimuti
(Semliki virus hutan ) sedang
bertunas.
B. Skema perakitan amplop dan
pemula proses. Lapisan
ganda lipid yang mengelilingi
kapsid virus diturunkan
langsung dari membran
plasma dari sel inang. Di
Sebaliknya, protein dalam
lapisan ganda lipid ini
(berwarna hijau) dikodekan
oleh virus genom.