Metode untuk Menargetkan Asam

Amino Tidak Alami

Azida, Sydnon, Alkuna, dan Alkena.

• Kemajuan d a l a m p e n g g a bu n g a n a s a m a m i no ya n g
t i da k a l a m i k e d a l a m p r o t e i n t e l a h m e n d o r o ng
p e n g e m b a n g a n m e t od o l og i b a r u u n t u k m o d i f i k a s i n y a ,
• D e n g a n de m i k i a n , p e n g g a bu ng a n y a n g t i d a k a l a m i
memberikan titik kimia istimewa dari mana strategi
y a n g d i m e d i a s i l o ga m , b i a s a n y a d i k e m b a n gk a n
s e be l u m ny a , d a p a t b e k e r j a s e c a r a e f i s i e n d e ng a n
menetapkan kembali k o n di s i reaksi untuk
t r a n s f o r m a s i t e r s e bu t m e n g g u n a k a n s i s t e m k a t a l i t i k
b e r a i r, r i n g a n , d a n da p a t d i t o l e r a n s i a t m os f e r.
Metode Yang Digunakan Untuk
Modifikasi Transisi Yang
Dimediasi Logam Dari Azida,
Sydnon, Alkuna, Dan Alkena.

Skema 1 : Modifikasi Transisi

yang Dimediasi Logam dari
Sydnon dan Azida: (a c) Cu (I) -
dan Ru (II) -Dikatalis Azida
Alkuna dan Siklon, masing-
masing
Terdapat sikloadisi azida alkuna yang dikatalisis Cu (I)
(CuAAC) atau "reaksi klik", yang mewakili salah satu
metode biokonjugasi penting untuk modifikasi protein.
Jumlah katalitik Cu (I) cukup untuk mempromosikan
sikloadisi kemoselektif [3 + 2] ringan dalam media
berair yang menghasilkan cincin triazol tersubstitusi 1,4
isosterik yang stabil secara hidrolitik dan amida.
 Metode ini telah digunakan untuk mengakses dan
mempelajari berbagai PTM penting termasuk
kasusPTM ganda ortogonal,atau dalam protokol
imobilisasi spesifik lokasi.
Skema 2 : Modifikasi Alkuna yang Diperantarai Logam
Transisi: (a, b) Cu (I) - dan Ru (II) -Dikatalis Azida Alkuna
Sikload, Masing-masing, (c) Sonogashira Bebas Tembaga
Cross-Coupling pada Homopropargylglycine (Hpg) dan (d)
Versi Tanpa Ligan pada Sistem Berbasis Pyrrolysine (Pyl), (e)
Modifikasi Hpg dengan Palladacycles
probe pada protein globular yang difungsikan Hpg SsβG (β-
galactosidase) dan juga pada partikel bakteriofag mirip virus
multivalen dan rakitan Qβ (dengan 180 unit F-glikosil
tergabung) dicapai di bawah kondisi CuAAC.
Pendekatan ini memungkinkan desain glikoprotein homogen
probe untuk dinamika struktural (misalnya, 19F NMR) dan
pencitraan (Misalnya, 18F-positron emission tomography (PET))
tujuan.
Namun, dan terlepas dari kesuksesan besar protokol ini dan
kemajuan yang dicapai dalam pengembangan ligan dan
kompleks (misalnya, N-heterosiklik karben katalis Cu) itu
menstabilkan dan mempertahankan spesies katalitik Cu (I) aktif.
Skema 3 :
Modifikasi Alkena yang
Dimediasi Logam Transisi:
Metatesis Silang Olefin
dengan (a) S-Allylcysteine ​
dan (b) Se-
Allylselenocysteine, dan (c)
Pd yang dikatalisis oleh
Reaksi Heck Oksidatif
Skema 4 :
Pd-Mediated Protein Cross-Coupling di Aryl Halides: (a)
Mizoroki Heck, (b) Sonogashira dan (c) Versi Tanpa Ligan
Bebas Tembaga, (d) Suzuki Bebas Fosfin Miyaura dengan Ligan
ADHP atau NHC, dan (e) Suzuki Tanpa Ligan Miyaura Cross-
Couplings
pendekatan ini telah berhasil digunakan untuk
pelabelan protein dalam sel bakteri (E. coli) dan di
permukaan sel mamalia.
Keberhasilan transformasi ini dalam sel hidup
tergantung pada penggunaan ligan 2-amino-4,6-
dihidroksipirimidin (ADHP) yang larut dalam air .
Baru-baru ini,peningkatan kopling silang Sonogashira
bebas tembaga pada sistem berbasis pirolisin (Pyl)
telah dilaporkan.
para penulis mengidentifikasi Pd (NO3) 2 sebagai
katalis spesifik nontoksik (dengan potensi kerusakan
membran yang berkurang) yang bekerja secara ilmiah
pada suhu kamar (25 ° C) dalam sel E. coli dan Shigella
hidup.
 Aril Halida dan Boronat.

Selain dari kopling silang Sonogashira yang

dikatalisis paladium bebas tembaga yang disebutkan
di atas pada protein yang dilengkapi dengan
pegangan alkuna , transformasi lain menggunakan
logam yang sama telah muncul sebagai alat yang
ampuh untuk modifikasi protein pada kelompok
yang berbeda. Sama halnya dengan metatesis silang,
kopling silang yang dikatalisis paladium dari aril
halida atau boronat dengan mitra organologam.
Skema 5 :

Pd-Mediated Protein Cross-

Coupling di Aryl Boronates:
(a) Suzuki Miyaura
Keuntungan dari metode ini adalah :
toleransi gugus fungsi yang tinggi
toksisitas yang berkurang
bioortogonalitas kimia
penggunaan ligan yang stabil terhadap udara dan
kelembaban, menghindari atmosfir inert atau
pelarut tanpa gas, dan terakhir
stabilitas produk dan ireversibilitas transformasi,
yang membuat transformasi ini menjadi protokol
yang dapat diterima dan menarik untuk
menghasilkan konjugat protein yang stabil
 Peran Kunci Untuk Transformasi Yang Dimediasi Logam
Dalam Kimia Protein Dan Menyoroti Tantangan Yang Terkait
Dengan Mengadaptasi Kimia Ke Sistem Biologis.

(i) memperbesar kebanyakan transformasi yang dimediasi logam

untuk modifikasi protein dengan mengembangkan sistem katalitik
yang mampu bekerja secara efisien dalam sistem berair yang tidak
berbahaya, pada suhu dan pH fisiologis, dan dengan adanya oksigen;
(ii) berkembang menuju sistem katalitik "nyata" karena hampir
semua strategi yang dimediasi logam yang dilaporkan hingga saat ini
memerlukan kelebihan logam untuk mencapai konversi sedang
hingga baik (meningkatkan angka pergantian katalis);
(iii) pindah ke kopling antarspesies karena sebagian besar protokol
yang dimediasi logam saat ini terbatas pada sistem prokariotik;
 (iv) merancang dan mengembangkan reagen dan katalis permeabel
sel untuk melakukan reaksi intraseluler karena sebagian besar
metode saat ini terbatas pada lisat sel atau pelabelan permukaan
Terimakasih