Biomarker didefinisikan sebagai indikator yang dapat diukur dari keadaan biologis tertentu, khususnya yang menunjukkan informasi

tentang risiko, kemunculan atau progresifitas dari suatu penyakit. Biomarker ini dapat digunakan di klinik untuk mendiagnosis (diagnostik), memprediksi perkembangan penyakit (prognosis), memantau aktivitas penyakit, menilai respon terapi (screening) atau panduan terapi molekuler. Biomarker untuk penyakit sendi bisa datang dalam berbagai bentuk: secara klinis, histologis atau pencitraan, molekul spesifik, atau pola molekul tertentu. Biomarker molekular termasuk genomik, proteomik biomarker dan transkriptomik. Karena munculnya spektrometri massa dan komputasi pencitraan dengan perangkat lunak, kita sekarang memiliki kemampuan untuk membandingkan protein konten dalam penyakit dan kelompok sampel kontrol, dengan harapan menghasilkan biomarker potensial. Cairan sendi mengandung sejumlah besar protein, yang berasal dari membran sinovial, rawan sendi dan serum. Komposisi protein dalam cairan sendi mungkin dapat menunjukkan kondisi patofisiologis yang mengganggu jaringan sinovial dan rawan sendi artikular.

Konsentrasi total protein di SF normal 19-28 mg / mL - sepertiga dari yang ditemukan dalam plasma. Ukuran protein plasma menentukan sifat filtrasi mereka melalui membran sinovial dan mereka masuk ke SF: berat molekul plasma protein yang besar seperti fibrinogen ada dengan konsentrasi rendah di SF yang normal, sebaliknya, albumin dan transferin ada dalam jumlah relatif tinggi. Albumin merupakan protein utama dalam SF (12 mg / mL), diikuti dengan 1, , 1, dan 2 globulin (masing-masing pada konsentrasi 1-3 mg / mL).

Sampai saat ini, pendekatan proteomik yang berbeda telah digunakan untuk karakterisasi proteome SF manusia. Beberapa kelompok telah menggabungkan 2D-PAGE dengan MALDI-TOF-MS dan LC-ESI-MS51,104-108. Teknologi baru seperti SID-SRM telah muncul selama beberapa tahun terakhir, sehingga memungkinkan untuk mendiskripsikannya dengan angka. Ini menjanjikan kualifikasi / verifikasi dan validasi pada porsi yang lebih besar dari calon biomarker yang telah muncul dari banyak percobaan yang dilakukan dalam beberapa tahun terakhir. Pada bagian ini, kami merangkum upaya penemuan biomarker di SF untuk RA, OA dan JIA menggunakan metode proteomika.

Rheumatoid arthritis ditandai oleh peradangan sinovial dan hiperplasia, produksi autoantibodi (arthritis faktor dan anti-citrullinated peptida (PKC) antibodi [ACPA]), destruksi tulang rawan dan tulang, serta fitur sistemik termasuk kelainan kardiovaskular, paru, dan muskuloskeletal. Kelainan pada RA dapat berkisar dari ringan dan self-limited sampai parah dan progresif; Oleh karena itu, pengobatan RA yang efektif telah terhalang oleh heterogenitas penyakit. Diagnosis dini dibuat saat erosi tulang rawan dan tulang sudah dimulai, waktu di

mana jendela perawatan yang optimal mungkin sudah terlewati, sehingga biomarker diagnostik untuk RA dibutuhkan untuk pasien dengan arthritis yang sulit dibedakan. Kemajuan paling signifikan dalam diagnosis RA dalam dekade terakhir adalah pengembangan tes untuk deteksi autoantibodi terhadap cyclic citrullinated peptide, yang tidak seperti biomarker RA tradisional, arthritisfaktor, sangat spesifik untuk RA. Namun, sensitivitas diagnostik ACPA dalam kohort sinovitis dini adalah antara 40% dan 71% sebagian karena sekitar 30% pasien RA tidak membentuk antibodi ini. Dengan demikian, pencarian biomarker yang memberikan sensitivitas yang lebih besar dan spesifisitas dalam diagnosis awal RA masih berlangsung. Analisis diferensial dari pola protein 2-DE dari SF pada pasien OA dan pasien RA telah memungkinkan identifikasi penanda khusus yang berkaitan dengan RA daripada OA seperti S100A9 dan SAA51. Analisis SF dari pasien RA dengan 2-DE dan MALDI mengidentifikasi protein myeloid (S100A9, S100A8) di RA SF bila dibandingkan dengan OA SF, sementara perbandingan serupa jaringan sinovial dengan 2-DE juga mengungkapkan peningkatan kadar MRP8 (S100A8) di RA samples. Selanjutnya, penelitian dengan menggunakan proteomik kuantitatif, ditemukan ada korelasi antara keparahan erosi sendi di RA dan tingkat protein S100 A8, A9 dan A12 di SF. Penelitian ini mengadopsi pendekatan kromatografi cair dua dimensi (LC-MS/MS) untuk menghasilkan profil protein dari SF pada RA yang erosif dan nonerosif. Tiga puluh protein dipilih karena upregulationnya dalam RA erosif, termasuk C reactive protein (CRP), dan diukur dalam sera pasien menggunakan MRMs. Sekali lagi, hanya protein S100 yang meningkat signifikan dalam RA erosif dibandingkan nonerosif RA. Sebuah penelitian dengan pendekatan yang berbeda, di mana protein yang berasal dari neutrofil yang dirangsang oleh sitokin dianalisis dengan MALDI-TOF untuk mengidentifikasi gen pengatur sitokin. Protein NGAL, kandidat yang paling menjanjikan, kemudian diukur dalam SF OA dan RA pasien, di mana ternyata ditemukan secara signifikan diregulasi di SF RA. Pendekatan kromatografi berbasis cairan digunakan untuk mempelajari SF dan serum dari RA dan OA pasien dan hasilnya mengungkapkan tingginya jumlah yang diduga RA biomarker. Berbagai prognostik RA biomarker diidentifikasi di SF, dan kemudian divalidasi dalam serum. Proteomik penemuan biomarker di OA OA arthropati yang paling sering, terkait dengan penuaan dan ditandai dengan degradasi progresif tulang rawan artikular. Ini mempengaruhi lebih dari 10% dari populasidan merupakan penyebab utama inkapasitasi kerja permanen, serta salah satu alasan paling umum untuk mengunjungi dokter perawatan primer. Tujuan utama untuk penelitian OA dalam pengembangan strategi diagnostik dini, adalah karena OA secara klinis asimptimatik dalam tahap awal dan pada saat diagnosis, kerusakan sudah ada. Metode diagnostik OA bergantung pada deskripsi rasa sakit dan kekakuan pada sendi yang terkena, dan radiografi digunakan sebagai teknik referensi dalam mendefinisikan tingkatan kerusakan sendi.

Strategi baru untuk penemuan dan validasi biomarker OA telah muncul termasuk genomik, proteomik dan metabolomik metodologi. Banyak studi proteomik dilakukan pada SF telah berfokus pada RA dan penggunaan sampel OA SF sebagai kontrol. Dua pendekatan proteomik yang berbeda telah dikembangkan untuk mendapatkan wawasan OA SF proteome. Dalam sebuah studi yang dilakukan oleh Gobezie et al., Peneliti menggunakan SDS-PAGE dan LC-MS/MS untuk memetakan SF proteome sehat, OA awal dan akhir pasien OA cohorts. Dari kelompok mereka mengidentifikasi 135 protein SF, 18 di antaranya adalah diubah dalam OA. Kelompok lain mengamati SF peptida endogen menggunakan ultrafiltrasi dan LCMS/MS analysis dan mencatat enam protein yang bisa digunakan sebagai penanda potensial untuk OA: COL2, PRG4, SAA, TUB, VIME dan MGP. Akhirnya, penggunaan SELDI-MS menyebabkan identifikasi beberapa calon biomarker antara RA dan OA, salah satunya adalah MRP-8 (S100A8). Baru-baru ini, Mateos et al. Melaporkan identifikasi 136 SF protein. Dalam kumpulan data, SF protein dari RA dan OA diidentifikasi dan diukur relatif terhadap satu sama lain untuk mengidentifikasi secara diferensial protein antara dua group. Terbukti, alat proteomik telah memiliki pengaruh besar pada penemuan biomarker, karena mereka telah membantu dalam identifikasi sejumlah molekul yang mungkin berhubungan dengan arthritis. Beberapanya, termasuk COMP, COL2 atau MMPs, sebelumnya terdeteksi dalam penelitian lain, sedangkan yang lain telah baru ditandai hanya dalam analisis proteomik dan perlu mengalami kualifikasi lebih lanjut. Proteomik penemuan biomarker di JIA Juvenile idiopathic arthritis (JIA) adalah sekelompok heterogen penyakit inflamasi dengan distribusi jenis kelamin yang berbeda-beda, genetik predisposisi, manifestasi klinis, perjalanan penyakit dan prognosis. Saat ini, tidak ada prognostik yang berguna secara klinis penanda untuk memprediksi hasil penyakit pada pasien ini. Terdapat tiga subtipe utama JIA: oligoarticular, subtipe yang paling sering, polyarticular, subtipe lebih kronis, dan sistemik, subtipe parah juga dikaitkan dengan berbagai manifestasi extraarticular. Sekitar 25% dari anak-anak mengalami penyakit oligoarticular lama, yang jauh lebih resisten terhadap terapi dan sulit untuk diterapi. Biomarker prognostik, oleh karena itu, penting untuk menentukan risiko peradangan menyebar ke sendi yang normal dan membantu untuk memulai terapi yang tepat. Strategi proteomik, seperti yang dibahas sebelumnya, dapat digunakan untuk mengidentifikasi dan mengukur protein yang terkait dengan bagian penyakit tertentu. Menggunakan 2-DE, MALDI-TOF dan Q-TOF untuk identifikasi protein, Rosenkranz et al. mengidentifikasi subset proteome sinovial, yang bisa membedakan antara bentuk JIA oligoarticular, polyarticular dan sistemik. Dalam hal ini, haptoglobin muncul sebagai kandidat yang sangat kuat. Ling et al. juga mengidentifikasi panel tujuh protein plasma menggunakan 2-DE DIGE, yang dapat membedakan pasien yang berisiko terkena penyakit dengan keandalan yang lebih besar daripada CRP. Dengan menggunakan metodologi yang sama, Gibson et al. melakukan karakterisasi proteomika pada SF pasien oligoarticular, oligoarticular diperpanjang dan pasien polyarticular. Mereka mengidentifikasi kelompok tertentu protein yang membedakan antara subtipe JIA - lebih khusus, isoform dari vitamin D-

binding protein (VDBP) hadir secara signifikan pada jumlah yang lebih rendah tingkat di SF dari oligoarticular diperpanjang dibandingkan dengan subkelompok lainnya.