REPLIKASI DNA

REPLIKASI
Adalah proses perbanyakan bahan genetik.
Tujuan replikasi:
- pertumbuhan sel

Ada 3 hipotesis tentang replikasi DNA

1. Replikasi secara Konservatif
Molekul DNA untai ganda induk tetap bergabung,
sedangkan kedua untai DNA anakan terdiri atas molekul hasil
sintesis baru.
2. Replikasi secara Semi Konservatif
Setiap molekul untai ganda DNA anakan terdiri atas satu
untai tunggal DNA induk dan satu untai tunggal DNA hasil sintesis
baru.
3. Replikasi secara Dispersif
Molekul DNA induk mengalami fragmentasi sehingga DNA
anakan terdiri atas campuran molekul lama (berasal dari DNA
induk) dan molekul hasil sintesis baru.

Pada tahun 1958 Matthew Meselson dan

Franklin Stahl berhasil menunjukkan secara
empiris bahwa replikasi DNA berlangsung
dengan mekanisme secara semikonservatif.

Tahap-tahap replikasi DNA

1. Inisiasi sintesis DNA

Proses replikasi DNA diawali dengan pemutusan ikatan antara

untai DNA yang satu dengan untaian komplementernya (secara
enzimatis, dikenal sbg replisome)
Original of Replication (Ori) merupakan titik khusus untuk
dimulainya replikasi

 Replikasi DNA sirkuler (prokariota):

dimulai pada 1 titik khusus dalam lingkar DNA
yang mengarahkan terbentuknya replication
bubble
Replikasi DNA linier (eukariota) :
dimulai pada titik spesifik di beberapa tempat
(multiple sites) disepanjang DNA template
melalui pembentukan replication bubble

2. Elongasi/Pemanjangan Untaian DNA

- DNA helicase unwinds the parental DNA by at
replication fork
- SSBP binds to ssDNA
- DNA gyrase is used to make sure double
strandes areas outside of the replication do
not supercoil
- Primase makes RNA primers (short sequence
of RNA)
- clamp and clamp loader help hold DNA
polymerase in place to DNA

Replication Point
DNA polymerase III catalyze the addition of new
nucelotides to the growing daughter.
new DNA always synthesized in 5- 3 directions
Replication of both strand occurs at the same time:
- continuous
synthesis occurs on the 3-5 oriented parent strand
:"leading strand
- discontinuous
synthesis occurs on the 5-3 oriented parent strand
:"lagging strand"
completed in segments called Okazaki Fragment

Ligasi Fragmen Okazaki

DNA polymerase III then adds short sequences of

nucleotides to the primer filling the gap
DNA polymerase I replace RNA primers with DNA
nucleotide
DNA ligase is used to ensure bonding between the
fragments and replace nucleotides

3. Terminasi Replikasi
Replikasi berakhir saat DNA
Polimerase mengenali daerah basa
nitrogen tertentu.
- Prokariot : sequens Ter
- Eukariot : telomer

 Total genom manusia : 3 milyar pasang basa (base pairs)

Kesalahan hanya terjadi sekitar satu dalam setiap 10100 milyard DNA.
Proses replikasi DNA secara sempurna pada sel-sel
manusia berlangsung beberapa jam.
Untuk mereplikasi DNA yang sebesar ini dalam waktu
yang hanya beberapa jam, memerlukan tidak hanya satu
replication fork, membentuk beberapa replication
bubble dan menghasilkan beberapa segmen untai DNA
yang pada akhirnya disambung-sambung membentuk
DNA double heliks baru.

Perbaikan DNA
Terdapat dua jalur perbaikan:
base excision, memperbaiki basa yang tertukar dengan
cara membuangnya oleh kerja DNA glycosylase yang
diikuti dengan membuang gula fosfat yang terbentuk.
nucleotide excision, nukleotida disekitar daerah yang
rusak dibuang sebagai oligonucleotida.
Kekosongan yang terjadi dari dua proses tersebut
kemudian diisi oleh kerja secara berurutan dari DNA
polymerase dan DNA ligase.

Komponen Penting dalam Replikasi

1. DNA template
yaitu molekul DNA atau RNA yang akan direplikasi
2. Molekul deoksi ribonukleotida
yaitu dATP, dTTP, dCTP, dGTP
3. DNA helicase
yaitu enzim yang membuka untai ganda DNA induk
4. SSBP (single strand binding protein)
yaitu molekul protein yang menstabilkan untaian DNA
yang sudah terbuka.
5. DNA Gyrase
yaitu enzim yang memastikan area luar DNA yang
sedang direplikasi tidak mengalami supercoil

6. Primase
yaitu enzim yang mengkatalisis sintesis primer untuk
memulai replikasi DNA.
7. clamp and clamp loader
mengikat DNA Polimerase III dalam proses replikasi
8. DNA Polimerase III
Yaitu enzim utama yang mengkatalisis proses
polimerisasi nukleotida menjadi untaian DNA
9. DNA Polimerase I
yaitu enzim yang menggantikan RNA primer dengan
DNA nukleotida
10. DNA ligase
yaitu enzim yang berfungsi untuk menyambung
fragmen-fragmen DNA.

THANK YOU