REPLIKASI, TRANSKRIPSI DAN TRANSLASI (SINTESIS PROTEIN)

Pengertian DNA

DNA, Deoxyribose Nucleic Acid adalah asam nukleotida, biasanya dalam bentuk heliks
ganda yang mengandung instruksi genetik yang menentukan perkembangan biologis dari
seluruh bentuk kehidupan sel. DNA berbentuk polimer panjang nukleotida, mengkode barisan
residu asam amino dalam protein dengan menggunakan kode genetik, sebuah kode nukleotida
triplet.

DNA seringkali dirujuk sebagai molekul hereditas karena ia bertanggung jawab untuk
penurunan sifat genetika dari kebanyakan ciri yang diwariskan. Pada manusia, ciri-ciri ini
misalnya dari warna rambut hingga kerentanan terhadap penyakit. Selama pembelahan sel,
DNA direplikasi dan dapat diteruskan ke keturunan selama reproduksi.

DNA bukanlah suatu molekul tunggal, nampaknya ia adalah sepasang molekul yang
digandeng oleh ikatan hidrogen: DNA tersusun sebagai untai komplementer dengan ikatan
hidrogen di antara mereka. Masing-masing untai DNA adalah rantai kimia ?batu bata
penyusun, yakni nukleotida, yang terdiri dari empat tipe: Adenine (A), Cytosine (C), Guanine
(G) dan Thymine (T). DNA mengandung informasi genetika yang diwariskan oleh keturunan
dari suatu organisme; informasi ini ditentukan oleh barisan pasangan basa. Sebuah untai
DNA mengandung gen, sebagai ?cetak biru? organisme. DNA membuat genom organisme.

Struktur DNA

DNA adalah polimer, lebih tepatnya, suatu himpunan dua polimer yang terbelit. Tiap-tiap
monomer yang menyusun polimer ini adalah nukleotida yang terdiri dari tiga elemen: fosfat,
gula dan basa. Gula dan fosfat dari seluruh nukleotida seluruhnya sama, tetapi nukleotida
dapat dibedakan dengan meninjau komponen basanya menjadi empat tipe, termasuk dua
kategori, purin: Adenine (A) dan Guanine (G) yang memiliki dua siklus organik dan
pirimidin: Cytosine (C) dan Thymine (T), yang memiliki satu siklus organik. Satu
pengamatan penting yang menuntun Watson dan Crick ke penemuan terkenal dari struktur
heliks ganda DNA adalah, basa cenderung berpasangan melalui ikatan hidrogen, dan
pasangan yang terbentuk oleh purin dan pirimidin memiliki ukuran yang hampir sama,
sehingga pasangan-pasangan demikian membentuk struktur dua rantai nukleotida berikatan
hidrogen yang sangat teratur. Untuk memahami mengapa dua rantai nukleotida terkait
membentuk heliks ganda, maka harus ditinjau interaksi antara grup penyusun nukleotida.
 Gambar Struktur DNA
(Sumber : http://biosman1sbw.wordpress.com/2010/08/30/struktur-dna/)

Terdapat dua kelas interaksi dasar yang menstabilkan struktur heliks ganda :

Ikatan hidrogen antara basa-basa komplementer;

Interaksi tumpukan (stacking interaction) dari plateu pasangan basa. Barisan pasangan
basa dalam DNA mengkode informasi untuk mensintesa protein, adalah polimer yang
terdiri dari 20 asam amino berbeda. Dalam kaitan dengan gen, DNA mengandung
daerah tak terkode yang peranannya belum sepenuhnya dipahami. Selama replikasi
DNA, yang terjadi selama pembelahan sel, misalnya, molekul dikopi dengan cara
membukanya seperti ritsleting. Transkripsi DNA adalah pembacaan gen tunggal untuk
mensintesa protein.

Model DNA

DNA adalah entitas yang sangat dinamis dan srtukturnya tidak beku. Pernapasan (breathing),
DNA terkandung dalam pembukaan temporer pasangan-pasangan basa [2]. Dalam pemodelan
gerak fungsional DNA, dianalogikan dengan gerak mekanis. Terdapat banyak variasi model
yang mendeskripsikan gerak DNA: kontinyu dan diskrit, spiral dan tak spiral, gerak tiruan
dari setiap atau hampir setiap atom, model homogen dan model-model yang memasukkan
keberadaan barisan basa.
 Gambar Model DNA
(Sumber : http://www.nimble2.com/dna.gif).

Model batang elastis dicirikan oleh tiga tipe gerak internal: gerak longitudinal, gerak rotasi
atau berpilin, dan gerak transversal. Model DNA tingkat kedua memasukkan perhitungan
bahwa molekul DNA terdiri dari dua rantai polinukleotida, dapat dimodelkan dengan dua
batang elastis yang berinteraksi lemah di antara mereka serta tergulung ke dalam spiral
ganda. Analogi diskrit dari model demikian mewakili dua rantai dari cakram yang terkait oleh
pegas longitudinal dan transversal serta kekakuan pegas longitudinal yang jauh lebih kuat
ketimbang pegas transversal.

Model DNA tingkat ketiga memperhitungkan tiap-tiap rantai terdiri dari tiga subunit: gula,
fosfat dan basa. Model DNA tingkat keempat diwakili oleh model kisi DNA dan
mendeskripsikan gerak atom yang menyusun sel kisi. Solusi tipe model DNA tingkat
keempat ini dapat diselesaikan dengan aproksimasi (harmonik) linier. Model DNA tingkat
kelima mensimulasi struktur dan gerak DNA dengan akurasi maksimum dalam model
dinamika molekuler.

Untuk mendeskripsikan gerak internal DNA, digunakan model aproksimasi berbeda. Model
yang paling sederhana dari DNA, katakanlah, model batang elastis dan versi diskritnya.
Untuk mendeskripsikan dinamika internal dari batang elastis, cukup dengan menuliskan tiga
pasang persamaan diferensial: satu persamaan untuk gerak longitudinal, satu persamaan
untuk gerak puntiran (torsional) dan satu persamaan untuk gerak transversal. Untuk
mendeskripsikan versi diskrit diperlukan 3N persamaan.

Model yang lebih kompleks, dengan meninjau molekul DNA yang terdiri dari dua rantai
polinukleotida. Model pertama terdiri dari dua batang elastis yang secara lemah berinteraksi
dan melilit satu sama lain untuk menghasilkan heliks ganda. Model kedua adalah versi
diskritnya. Untuk mendeskripsikan model yang terdiri dari dua batang elastis yang
berinteraksi lemah (dengan mengabaikan helisitas struktur DNA), diperlukan enam
persamaan diferensial tergandeng: dua persamaan untuk gerak longitudinal, dua persamaan
untuk gerak torsional dan dua persamaan untuk gerak transversal dalam kedua batang.
Deskripsi model untuk versi diskritnya terdiri dari 6N persamaan tergandeng
Model berikutnya dengan memasukkan dalam perhitungan bahwa masing-masing rantai
polinukleotida terdiri dari tiga tipe grup atom (basa, gula dan fosfat). Dalam model-model
DNA tersebut di atas, grup berbeda ditunjukkan dengan bentuk geometri yang berbeda, dan
untuk penyederhanaan helisitas struktur DNA diabaikan.

Pembentukan keadaan terbuka DNA dihubungkan dengan deviasi sudut basa dari keadaan
kesetimbangan. Proses ini dideskripsikan dengan menggunakan formalisme Hamiltonian.

Dalam skema penguraian DNA, dua rantai gula-fosfat digambarkan oleh dua garis panjang,
sementara basa ditandai dengan banyak garis pendek. Kusutan (kink) berhubungan dengan
daerah lokal dengan pasangan basa yang terbuka. Solusi tipe kink mendeskripsikan deformasi
lokal (pembukaan pasangan-pasangan basa) bergerak sepanjang molekul DNA.

Sintesis Protein

Replikasi

Replikasi : proses perbanyakan bahan genetik (genom : DNA dan RNA)

Proses yg mengawali pertumbuhan sel

Replikasi akan diikuti oleh pembentukan sel-sel anakan yg membawa duplikat bhn
genetik hasil replikasi.

Komposisi bahan genetik sel anakan sangat identik dengan komposisi genetik sel
induk. Fungsi replikasi ini merupakan fungsi genotipik.

Kesalahan dlm replikasi bhn genetik dpt mengakibatkan perubahan pd sifat sel-sel
anakan

Perbedaan struktural molekul bahan genetik (DNA) menyebabkan perbedaan

mekanisme replikasi pada prokariot dan eukariot

Replikasi pd prokariot dimulai dari satu situs awal replikasi (ORI) dan berlangsung ke
dua arah menuju daerah terminasi Replikasi pd eukariot dimulai dari banyak ORI,
bergerak ke dua arah
 Gambar Replikasi DNA
(Sumber : http://www.forumsains.com/biologi/bagaimana-dna-mengatur-sifat/)

Ada 3 hipotesis mengenai replikasi DNA yaitu semikonservatif, konservatif dan dispersif

1. Hipotesis semikonservatif : setiap molekul untai ganda DNA anakan terdiri atas satu
untai-tunggal DNA induk dan satu untai tunggal DNA hasil sintesis baru.

2. Konservatif : DNA untai ganda induk tetap bergabung sedangkan kedua untaian DNA
anakan terdiri atas molekul hasil sintesis baru.

3. Dispersif : molekul DNA induk mengalami fragmentasi sehingga DNA anakan terdiri
atas campuran molekul lama (induk) dan molekul hasil sintesis baru

(Sumber : http://dc383.4shared.com/doc/xpuHcay6/preview.html)
Diantara ketiga cara replikasi DNA yang diusulkan tersebut, hanya cara semikonservatif yang
dapat dibuktikan kebenarannya melalui percobaan yang dikenal dengan nama sentrifugasi
seimbang dalam tingkat kerapatan atau equilibrium density-gradient centrifugation.

Model replikasi semikonservatif memberikan gambaran bahwa untaian DNA induk berperan
sbg cetakan (template) bagi pembentukan untaian DNA baru . Dengan demikian, salah satu
bagian yg sangat penting dlm proses replikasi DNA adalah denaturasi awal untaian DNA yg
mrpk proses enzimatis. Denaturasi awal terjadi pd bagian DNA yg disebut ORI. Untaian
DNA membuka membentuk struktur yg disebut garpu replikasi (replication fork).

Garpu replikasi akan bergerak sehingga molekul DNA induk membuka secara
bertahap . Masing-masing untaian DNA yang sudah terpisah, berfungsi sebagai cetakan untuk
penempelan nukleotida-nukleotida yg akan menyusun molekul DNA baru. Sekuens basa
nitrogen DNA baru sesuai dengan sekuens basa cetakan DNA komplementernya.

Replikasi DNA berlangsung dlm tahapan : 1) denaturasi (pemisahan) untaian DNA induk; 2).
pengawalan (inisiasi) sintesis DNA; 3). Pemanjangan untaian DNA; 4). Ligasi fragmen
DNA; 5) pengakhiran (terminasi) sintesis DNA.

Sintesis untaian DNA yg baru akan dimulai segera setelah ke dua untaian DNA induk terpisah
membentuk garpu replikasi.

Pemisahan dilakukan oleh enzim DNA helikase.

Kedua untaian DNA induk menjadi cetakan dlm orientasi 5-P ke arah 3-OH

Jadi, ada dua untaian DNA cetakan yg orientasinya berlawanan

Garpu replikasi akan membuka secara bertahap

Sintesis untaian DNA baru yang searah dg pembukaan garpu replikasi akan dpt
dilakukan dilakukan tanpa terputus (kontinyu) : untaian DNA awal (leading strand)

Sebaliknya, tahap demi tahap (diskontinyu) : untaian DNA lambat (lagging strand)

Mekanisme replikasi DNA berlangsung secara semidiskontinyu karena ada perbedaan

mekanisme dlm proses sintesis kedua untaian DNA

Fragmen-fragmen DNA hasil replikasi diskontinyu (fragmen Okazaki) akan

disambung (ligasi) dengan enzim DNA ligase

Polimerisasi DNA hanya dpt dimulai jika tersedia molekul primer : molekul yg digunakan
untuk mengawali proses polimerisasi untai DNA

Primer : molekul DNA, RNA atau protein spesifik

Pada transkripsi : tidak diperlukan primer.

 Dlm replikasi DNA in vivo, primer berupa molekul RNA berukuran 10-12 nukleotida

In vitro, misal pada Polymerase Chain Reaction (PCR) : diperlukan DNA sebagai
molekul primer

Fungsi primer : menyediakan ujung 3-OH yg akan digunakan untuk menempelkan

molekul DNA pertama dlm proses polimerisasi

Sintesis RNA primer dilakukan oleh kompleks protein yg disebut primosom

(primase+bbrp protein lain)

Diperlukan lebih dari 1 primer untuk proses sintesis pada untaian DNA lambat
(lagging strand)

Pd. prokariot, polimerisasi dikatalisis DNA polimerase III

Dissosiasi enzim ini dari DNA cetakan terjadi saat bertemu dengan ujung 5-P RNA
primer yg menempel pd bagian lain

RNA primer pd fragmen Okazaki, didegradasi oleh aktivitas eksonuklease yg ada pd enzim
DNA polimerase I.

(Sumber : http://biologigonz.blogspot.com/2009/11/sintesa-protein-2.html)

Bagian RNA yg terdegradasi, diisi oleh molekul DNA, meskipun antar fragmen masih
ada celah (takik = nick)

Celah terbentuk karena belum ada ikatan fosfodiester antara ujung 3-OH pd
nukleotida terakhir yg disintesis oleh DNA polimerase I dengan ujung 5-P fragmen
DNA yg ada didekatnya

Takik ini akan disambung oleh DNA ligase dengan menggunakan NAD atau ATP
sebagai sumber energi

Pada untai DNA awal (leading strand) : hanya diperlukan satu molekul primer pd titik
awal replikasi

Untaian DNA baru disintesis dengan aktivitas DNA polimerase III secara kontinyu.
 Replikasi dapat berlangsung ke dua arah yg berlawanan : replikasi dua arah
(bidirectional replication)

Replikasi 2 arah terjadi pada prokariot maupun eukariot

Replikasi pada plasmid colE1 : satu arah

Proses pemisahan untaian DNA dilakukan oleh enzim DNA helikase

Selain helikase, enzim lain yg berperan dlm pemisahan untaian DNA adalah enzim
DNA girase.

DNA girase adalah salah satu enzim topoisomerase : suatu enzim yg dpt mengubah
topologi molekul DNA yakni dengan memutus ikatan hidrogen

Protein SSb menjaga agar bagian DNA yg sudah terpisah tidak berikatan lagi
sehingga dpt digunakan sebagai cetakan

Protein ini mempunyai sifat kooperatif, artinya pengikatan satu molekul protein pd
untai tunggal DNA akan meningkatkan kekuatan ikat (affinity) molekul yg lain
beberapa ribu kali.

Transkripsi

Transkripsi : proses penyalinan kode-kode genetik yang ada pada urutan DNA menjadi
molekul RNA. Merupakan proses yan mengawali ekspresi sifat-sifat genetik yang nantinya
muncul sebagai fenotip. RNA: selalu single stranded . Pada proses transkripsi hanya 1 untai
DNA yang disalin DNA RNA. Sintesis RNA : 5 3.

Gambar Transkripsi DNA

(Sumber : http://oblktirupifabiounsoed.wordpress.com/2009/03/29/gambaran-umum-materi-olimpiade-
biologi/c7177btrans cription/)
Inisiasi Transkripsi

Pembentukan kompleks promoter tertutup. Pembentukan kompleks promoter terbuka.

Penggabungan beberapa nukleotida awal (sekitar 10 nukeotida). Perubahan konformasi RNA
polimerase karena subunit/faktor dilepaskan dari kompleks holoenzim.

Mekanisme transkripsi pada eukariot pada dasarnya menyerupai mekanisme pada

prokariot

Proses transkripsi diawali (diinisiasi) oleh proses penempelan faktor-faktor transkripsi

dan kompleks enzim RNA polimerase pd daerah promoter

Berbeda dg prokariot, RNA polimerase eukariot tidak menempel secara langsung

pada DNA di daerah promoter, melainkan melalui perantaraan protein-protein lain, yg
disebut faktor transkripsi (transcription factor = TF) .

TF dibedakan 2, yaitu : 1) TF umum dan 2) TF yg khusus untuk suatu gen n TF umum

dlm mengarahkan RNA polimerase II ke promoter adalah TFIIA, TFIIB, TFIID,
TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ

Produk Transkripsi

mRNA (messenger RNA) : salinan kode genetik pada DNA yang pada proses translasi akan
diterjemahkan menjadi urutan asam amino yang menyusun suatu polipeptida atau protein
tertentu. tRNA (transfer RNA) : berperanan membawa asam amino spesifik yang akan
digabung pada proses translasi (sintesis protein). rRNA (ribosomal RNA) : digunakan untuk
menyusun ribosom sebagai tempat sintesis protein .

Faktor transkripsi

Diperlukan untuk sintesis semua mRNA

Mengenali urutan promoter basal spesifik

Menentukan situs inisiasi transkripsi

Menginstruksikan RNA polimerase II ke tempat tersebut

Bersama-sama dengan RNA polimerase dan promoter basal membentuk Kompleks

inisiasi Transkripsi

Pada prokariot, proses transkripsi dan translasi berlangsung hampir secara serentak,
artinya sebelum transkripsi selesai dilakukan, translasi sudah dpt dimulai

Pada eukariot, transkripsi berlangsung di dlm nukleus , sedangkan translasi

berlangsung di dlm sitoplasma (ribosom)
 Dengan demikian, ada jeda waktu antara transkripsi dengan translasi, yg disebut
sebagai fase pasca-transkripsi

Pd fase ini, terjadi proses : 1). Pemotongan dan penyambungan RNA (RNA-splicing);
2). Poliadenilasi (penambahan gugus poli-A pada ujung 3mRNA); 3). Penambahan
tudung (cap) pada ujung 5 mRNA dan 4). Penyuntingan mRNA

Translasi

Translasi adalah proses penerjemahan kode genetik oleh tRNA ke dalam urutan asam amino.
Translasi menjadi tiga tahap (sama seperti pada transkripsi) yaitu inisiasi, elongasi, dan
terminasi. Semua tahapan ini memerlukan faktor-faktor protein yang membantu mRNA,
tRNA, dan ribosom selama proses translasi. Inisiasi dan elongasi rantai polipeptida juga
membutuhkan sejumlah energi. Energi ini disediakan oleh GTP (guanosin triphosphat), suatu
molekul yang mirip dengan ATP.

Gambar Langkah-langkahTranslasi
(Sumber : http://biology.unm.edu/ccouncil/Biology_124/Summaries/T&T.html)

Inisiasi

Tahap inisiasi terjadi karena adanya tiga komponen yaitu mRNA, sebuah tRNA yang memuat
asam amino pertama dari polipeptida, dan dua sub unit ribosom.

mRNA yang keluar dari nukleus menuju sitoplasma didatangi oleh ribosom, kemudian
mRNA masuk ke dalam celah ribosom. Ketika mRNA masuk ke ribosom, ribosom
membaca kodon yang masuk. Pembacaan dilakukan untuk setiap 3 urutan basa hingga
selesai seluruhnya. Sebagai catatan ribosom yang datang untuk mebaca kodon biasanya tidak
hanya satu, melainkan beberapa ribosom yang dikenal sebagai polisom membentuk rangkaian
mirip tusuk satu, di mana tusuknya adalah mRNA dan daging adalah ribosomnya.
Dengan demikian, proses pembacaan kodon dapat berlangsung secara berurutan. Ketika
kodon I terbaca ribosom (misal kodonnya AUG), tRNA yang membawa antikodon UAC dan
asam amino metionin datang. tRNA masuk ke celah ribosom.

Ribosom di sini berfungsi untuk memudahkan perlekatan yang spesifik antara antikodon
tRNA dengan kodon mRNA selama sintesis protein. Sub unit ribosom dibangun oleh protein-
protein dan molekul-molekul RNA ribosomal.

Elongasi

Pada tahap elongasi dari translasi, asam amino-asam amino ditambahkan satu per satu pada
asam amino pertama (metionin). Ribosom terus bergeser agar mRNA lebih masuk, guna
membaca kodon II. Misalnya kodon II UCA, yang segera diterjemahkan oleh tRNA berarti
kodon AGU sambil membawa asam amino serine. Di dalam ribosom, metionin yang pertama
kali masuk dirangkaikan dengan serine membentuk dipeptida.

Ribosom terus bergeser, membaca kodon III. Misalkan kodon III GAG, segera diterjemahkan
oleh antikodon CUC sambil membawa asam amino glisin. tRNA tersebut masuk ke ribosom.
Asam amino glisin dirangkaikan dengan dipeptida yang telah terbentuk sehingga membentuk
tripeptida. Demikian seterusnya proses pembacaan kode genetika itu berlangsung di dalam
ribobom, yang diterjemahkan ke dalam bentuk asam amino guna dirangkai menjadi
polipeptida.

Kodon mRNA pada ribosom membentuk ikatan hidrogen dengan antikodon molekul tRNA
yang baru masuk yang membawa asam amino yang tepat. Molekul mRNA yang telah
melepaskan asam amino akan kembali ke sitoplasma untuk mengulangi kembali
pengangkutan asam amino. Molekul rRNA dari sub unit ribosom besar berfungsi sebagai
enzim, yaitu mengkatalisis pembentukan ikatan peptida yang menggabungkan polipeptida
yang memanjang ke asam amino yang baru tiba.

Terminasi

Tahap akhir translasi adalah terminasi. Elongasi berlanjut hingga kodon stop mencapai
ribosom. Triplet basa kodon stop adalah UAA, UAG, dan UGA. Kodon stop tidak mengkode
suatu asam amino melainkan bertindak sinyal untuk menghentikan translasi. Polipeptida yang
dibentuk kemudian diproses menjadi protein.

Referensi

Wikipedia Encyclopedia, http://en.wikipedia.org/wiki/Dna, 2006.

Michel Peyrard, Nonlinear Dynamics and Statistical Physics of DNA, 2004

Riznichenko Galina Yur?evna, Mathematical Models in Biophysics,

http://www.biophysics.org/education/galina.pdf, May 22, 2006.
 Ludmila V. Yakushevich, Is DNA a Nonlinear Dynamical System where Solitary
Conformational Waves are Possible?, J. Biosci., Vol.26, No.3, September 2001, 305-
313, Indian Academy of Sciences.

Korespondensi dengan Ika Nurlaila, tidak dipublikasikan.

Substansi Genetika, http://desybio.wordpress.com/tag/2-translasi/.

Translasi Genetik, Wikipedia

Encyclopedia, http://id.wikipedia.org/wiki/Translasi_(genetik)

STRUKTUR DNA

DNA (Deoksirybose Nucleid Acid) merupakan komponen penyusun kehidupan. Zat inilah
yang membuat lebah adalah seekor lebah dan kanguru adalah kanguru. DNA adalah apa yang
membuat tiap-tiap individual (apapun jenis dan spesiesnya) unik.
Bentuk DNA
Pada tahun 1953, berdasarkan hasil penelitian dari Rosalind Franklin, James Watson dan
Francis Crick,DNA diketahui berbentuk double helix yang terdiri dari 2 pita yang berpilin
menjadi satu yang masing-masing memiliki warna biru dan kuning.
Penyusun utama DNA adalah gula ribose yang kehilangan satu atom oksigen (deoksiribose)
Tiap pita atau rantai double helix terbuat dari unit-unit berulang yang disebut nukleutida. Satu
nukleutida terdiri dari 3 gugus fungsi yaitu:
Satu gula ribose
Triphosphate
Satu basa nitrogen
Ketika nukleotida bergabung menjadi DNA maka nukleotida-nukleotida tersebut
dihubungkan oleh ikatan phosphodiester.
Basa nitrogen pada DNA
Pada struktur DNA, gula ribose dan gugus phosphate yang tarikat adalah sama, yang berbeda
hanyalah pada basa nitrogen, jadi sebetulnya perbedaan disebabkan oleh fariasi susunan dari
basa-basa nitrogen yang terdapat pada rantai DNA. Ada 4 macam basa nitrogen yaitu
Adenine, Cytosine, guanine dan thymin.
Ketika basa-basa nitrogen tersebut terikat dengan nukleotida maka penamaanpun
berubah.interaksi ikatan hidrgen antara masing-masing basa nitrogen menyebabkan bentuk
dari 2 rantai DNA menjadi sedemikian rupa, bentuk ini disebut double helix.
STRUKTUR RNA
RNA merupakan rantai tunggal polinukleutida. Setiap ribonukleutida terdiri dari 3 yaitu:
1. 5 karbon
2. Bas nitrogen yang terdiri dari golongan purin (yang sama dengan DNA) dan golongan
pirimidin yang berbeda yaitu sitosin ( C ) dan urasil ( U )
3. Gugus fosfat
Purin dan pirimidin yang berkaitan dengan ribosa membentuk satu molekul yang dinamakan
nukleusida atau ribonukleusida, yang merupakan frekurso dasar untuk sintesis DNA.
Ribonukleusida yang berkaitan dangan gugus fosfat membentuk suatu nukleutida atau
ribonukleutida.RNA merupakan hasil transkripsi dari suatu fragmen DNA, sehingga RNA
merupakan polimer yang jauh lebih pendek dibandingkan DNA.
Perbedaan DNA dan RNA
Beberapa prbedaan antara DNA dan RNA sebagai berikut:
a. Komponen: gula pada DNA yaitu deoksiribosa, sedangkan pada RNA yaitu ribose
b. Pirimidin : DNA adalah timin dan sitosin, sedangkan pada RNA yaitu urasil dan sitosin
c. Bentuk : DNA berbentuk rantai panjang, ganda, dan berpilin (double heliks). Sedangkan
pada RNA berbentuk rantai pendek, tunggal, dan tidak berpilin
d. Letak : DNA terletak didalam nukleus, kloroplas, mitokondria. Sedangkn RNA terletak
didalam nucleus, sitoplasma, kloroplas, mitokondria
e. Kadar : DNA tetap, sedangkan RNA tidak tetap.
Terdapat 3 jenis RNA yang dibentuk oleh DNA yaitu:
messenger RNA (mRNA): berfungsi membawa kode genetik ke sitoplasma untuk mengatur
sintesa protein.
transfer RNA (tRNA): untuk transfor asam amino menuju ribosom untuk digunakan
menyusun molekul protein.
ribosomal RNA (rRNA): untuk membentuk ribosom bersama dengan 75 protein lainnya.
KROMOSOM
Kromosom merupakan struktur makro molekul besar yang memuat DNA yang membawa
informasi genetik dalam sel.
Kromosom pertama kali diamati oleh Karl Wilhelm Von Nageli pada tahun 1942 dan cirri-ciri
dijelaskan dengan detail oleh Walther Flemming pada tahun 1882 , pada tahun 1910 Thomas
Hunt Morgan membuktikan bahwa kromosom merupakan pembawa gen.
Kromosom adalah benang-benang dalam nucleus yang terlihat pada saat pembelahan sel
yang terdiri dari nukleo protein dan jumlah tertentu pada setiap organism. Kromosom terdiri
dari 2 bagian yaitu:
1. Sentromer (kepala kromosom) yang berfungsi sebagai tempat bergantungnya gelendong
ketika sel membelah dalam sentromer. Didalam sentromer tidak ada gen.
2. Lengan (badan kromosom) yang terdiri dari:
Selaput tipis yang merupakan lapisan tipis yang menyelimuti lengan
Matriks merupakan cairan bening yang mengisi seluruh lengan.
Kromonema merupakan benang-benang terpilin yang bila pilinnya sangat rapat membemtuk
manik yang disebut kromomer.
Berdasarkan letak sentromernya kromosom dapat dibagi menjadi 4 bagian yaitu:
1. Metasentrik yaitu kromosom yang mempunyai 2 lengan yang sama panjang.
2. Submetasentrik yaitu kromosom yang mempunyai 2 lengan tetapi yang satu agak lebih
pendek.
3. Akrosentrik yaitu kromosom yang mempunyai 2 lengan tetapi yang satu pendek.
4. Telosentrik yaitu kromosom yang mempunyai satu lengan atau 2 lengan tetapi yang satu
sangat pendek.

SINTESIS PROTEIN
Ada banyak tahapan antar ekspresi genotip ke fenotip. Gen-gen itdak dapat langsung begitu
saja menghasilkan fenotip-fenotip tertentu. Fenotip suatu individu ditentukan oleh aktifitas
enzim (protein fungsional). Enzim yang berbeda akan menimbulkan fenotip yang berbeda
pula. Perbedaan suatu enzim dengan enzim yang lain di tentukan oleh jumlah, jenis dan
susunan asam amino penyusun protein enzim. Pembentukan asam amino ditentukan oleh gen
atau DNA
Ekspresi gen merupakan proses dimana informasi yang dikode didalam gen terjemahkan
menjadi urutan asam amino selama sintesis protein. Pogmasentral mengenai ekspresi gen,
yaitu DNA yang membawa informasi genetic Yang ditranskripsi oleh RNA, dan RNA
diterjemahkan menjadi polipeptida. Ekspresi gen merupakan sintesis protein yang terdiri dari
2 tahap yaitu:
Tahap pertama urutan rantai nukleutida tempale (cetakan) dari suatu DNA untai ganda
disalin untuk menghasilkan satu rantai molekul RNA. Proses ini disebut transkripsi dan
berlangsung di inti sel.
Tahap kedua merupakan sintsis philopeptida dengan urutan spesifik berdasarkan rantai
DNA yang di buat pada tahapn pertama, proses ini disebut traslasi.