Tugas Resume Mata Kuliah Genetika 1

Kelas / Off : H 2014

Kelompok 11
Nama Kelompok :
Isfatun Chasanah (140342603465)
Yanis Kurnia Basitoh (140342604027)

TRANSLASI

Translasi terjadi selama proses penterjemahan informasi genetik, mengikuti perintah

dari kode genetik kedalam urutan dari asam amino dalam produk gen polipeptida yang telah
selesei, dan membutuhkan banyak makromolekul. Hal ini termasuk : (1) Lebih dari 50
polipeptida dan dari 3 sampai 5 molekul RNA hadir di setiap ribosom (2) Setidaknya 20 asam
amino mengaktifkan enzimyme. (3) Dari 40 sampai 60 molekul tRNA yang berbeda (4) Dan
setidaknya 9 protein larut terlibat dalam polipeptida rantai initation, elongasi, dan terminasi.
Karena banyak makromolekul ini khususnya komponen ribosom yang hadir dalam jumlah
besar di setiap sel, sistem penerjem ahan membuat sebagian besar dari mesin metabolisme
setiap sel.
Proses penerjemahan terjadi pada ribosom, struktur makromolekul kompleks yang
terletak di sitoplasma. Terjemahan melibatkan tiga jenis RNA, yang semuanya ditranskripsi
dari DNA template. Selain mRNA 3-5 molekul RNA yang hadir sebagai bagian dari struktur
masing-masing ribosom dan molekul RNA kecil 40-60 berfungsi sebagai adapter mediasi
penggabungan asam amino yang tepat dalam menanggapi kodon spesifik di mRNA. Ribosom
dapat dianggap sebagai meja kerja. Lengkap dengan mesin dan peralatan yang diperlukan
untuk membuat polipeptida. Mereka tidak spesifik dalam arti bahwa mereka dapat
mensintesis setiap polipeptida spesified oleh molekul mRNA tertentu. Mengingat gambaran
dangkal ini sintesis protein.
Penelitian awal menggunakan pulse-labeling dan autoradiografi menunjukkan protein
disintesis sebagian besar di sitoplasma dalam jumlah kecil, tetapi kompleks, struktur
makromolekul disebut ribosom. Di prokariotik, ribosom didistribusakan keluar sel; di
eukariotik mereka terletak di sitoplasma, seringkali pada jaringan membran intraseluler
disebut RE.
Kira-kira ribosom adalah setengah protein dan setengah RNA. Mereka tersusun dalam
subunit besar dan kecil, yang memisah ketika translasi dari molekul mRNA selesai; mereka
bergabung kembali inisiasi dari translasi. Ukuran ribosom adalah yang paling sering
diekspresikan dalam jangka waktu dari laju mereka dari sedimentasi selama sentrifugasi,
dalam unit disebut S atau unit Svedberg. Ribosom E.coli seperti pada kebanyakan
prokariotik, mempunyai berat molekul 2.7 x 106 dan ukuran dari 70S. Ribososm dari
eukariotik lebih besar namun, ukurannya berbeda dari spesies. Ribosom hadir di organel sel
eukariotik lebih kecil.
Di E.coli ribosom subunit kecil terdiri dari 16S molekul RNA + 21 polipeptida
berbeda dan subunit besar terdiri dari dua molekul RNA + 31 polipeptida. Dalam ribosom
eukariotik subunit kecil terdiri dari 18S molekul RNA dan subunit besar terdiri 5S, 5,8S, dan
28S molekul RNA. Ribosom Drosophila, tetapi tidak di beberapa eukariotik diuji juga
muncul beberapa molekul kecil RNA 2S. Dalam organel, ukuran rRNA sesuai 5S, 13S, 21S.
Dalam kasus E. coli, M. Nomura dan kolega telah selesai memisahkan 30S sub unit ribosom
ke dalam makromolekul induvidu dan menyusun kembali sub unit fungsional 30S dari
komponen komponen. Hal ini telah disetujui untuk mempelajari fungsi dari setiap induvidu
RNA dan molekul protein.
Molekul RNA ribosom ditranskipsi dari DNA template seperti molekul mRNA. Di
eukariotik namun sintesis rRNA terjadi dalam nucleolus dan dikatalis oleh polimerase RNA
khusus yang ada dalam nucleolus. Selain itu transkripsi dari rRNA memproduksi precursor
rRNA yang lebih besar daripada molekul RNA di ribosom. Precursor rRNA ini mengalami
proses post-transkripsional memproduksi molekul rRNA termasuk dalam translasi. Di E. coli
transkripsi gen rRNA adalah precursor 30S yang mengalami pembelahan oleh
endoribonuklease memproduksi 5S, 16S, 23S, rRNA + 4S transfer molekul RNA.
Di prokariotik 2S, 5.8S, 18S, dan 28S rRNA dipotong dari precursor 40-45S,
sedangkan 5S rRNA diproduksi oleh proses post-transkripsional dari transkripsi gen yang
terpisah. Tambahannya pembelahan post-transkripsional dari precursor rRNA metilasi post-
transkripsional dari banyak nukleotida terjadi dalam rRNA kira kira metilasi melindungi
rRNA dari ribonuklease intraseluler yang termasuk degradasi mRNA; namun, fungsi ini
belum jelas.
Beberapa salinan dari gen untuk rRNA hadir di genome semua organisme dipelajari
saat ini. Hal ini tidak mengejutkan mengingat jumlah besar ribosom hadir di setiap sel. Di E.
coli, diperkirakan ada 5-10 salinan rRNA gen, dengan setidaknya satu salinan setiap tiga
lokasi yang berbeda di kromosom. Di eukariotik, gen rRNA hadir dalam ratusan hingga
ribuan salinan. 5.8S, 18S, dan 28S rRNA dari eukariot hadir bersama duplikasinya nulear
organizer daerah kromosom. Beberapa eukariot seperti jagung, ada sepasang penyelenggara
nuclear. Pada Drosophila dan katak pencakar afrika selatan dipelajari secara luas, xenopus
laevis, kromosom sex menjaga penyelenggara nuclear. Manusia disisi lain memiliki lima
pasang penyelenggara nuclear berada di lengan pendek dari kromosom 13, 14, 15, 21, dan 22.
Penelitian mengindikasikan ada sekitar 500 salinan dari 5.8S, 18S, dan 28S rRNA setiap
penyelenggara nuclear di xenopus laevis. Pada tingkat yang sama kelebihan telah
diperkirakan terjadi di beberapa hewan lain. Tumbuhan menunjukan variasi yang lebih baik
dir RNA redundasi dengan beberapa ribu salinan hadir di beberapa genome. Variasi
intraspesies dalam jumlah dari kelebihan rRNA juga telah didokumentasikan di beberapa
spesies.
Gen rRNA 5s di eukariotik tidak terletak di wilayah nukleolar. Sebaliknya mereka
biasanya didistribusikan dari beberapa kromosom. Namun mereka sebagian besar berlebihan
seperti gen rRNA. 5.8S, 18S, dan 28S rRNA. Meskipun ribosom menyediakan tempat kerja
dan banyak mesin mebutuhkan sintesis protein, spesifikasi dari masing-masing polipeptida
ditulis dalam molekul mRNA, translasi dari kode pesan mRNA ke sekuen asam amino dalam
polipeptida membutuhkan satu tambahan molekul tRNA. Pertimbangan kimiawi
menyarankan bahwa interaksi langsung antara asam amino dan sekuens nukleotida atau
kodon dalam mRNA tidak sama.
Tahun 1958 Crick mengusulkan beberapa dari molekul adapter bertindak sebagai
kodon pengenal asam amino selama sintesis protein. Molekul adapter dengan segera di
indentifaksi dan ditemukan menjadi molekul RNA kecil. Molekul ini pertama disebut soluble
RNA molekul atau sRNA dan berikutnya molekul tRNA terdiri dari sekuens dasar triplet
yang disebut antikodon. Yang melengkapi dan dikenali sekuens kodon dalam mRNA selama
translasi. Ada 1-4 tRNA yang diketahui untuk masing masing asam amino terbentuk dalam
proses dua-langkah, baik langkah yang dikatalisasi oleh tertentu "mengaktifkan enzim" atau
amynoacyl-tRNA sintetase. Ada setidaknya satu amynoacyl-tRNA sybthesis melibatkan
aktivasi asam amino menggunakan energi dari adenosine triphosphate (ATP):
asam amino + ATP

sintesis aminoasil tRNA

asam amino ~ AMP + P ~ P

Asam amino ~ AMP menengah biasanya tidak dilepaskan dari enzim sebelum menjalani
langkah kedua dalam amynoacyl-tRNA sintesis, yaitu reaksi dengan tRNA yang sesuai:

asam amino ~ AMP + tRNA

sintesis aminoasil tRNA

 asam amino ~ tRNA + AMP

Aminoasill ~ tRNA (asam amino ~ tRNA) adalah prekursor langsung sintesis

polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing tRNA diaktifkan mengakui benar kodon
mRNA dan penyajian asam amino dalam konfigurasi sterik (struktur tiga dimensi) yang
memfasilitasi pembentukan ikatan peptida.
tRNA ditranskripsi dari gen kromosom. Seperti dalam kasus rRNA, tRNA yang
dituangkan dalam bentuk molekul yang lebih besar prekursor yang mengalami pengolahan
posttranscriptioanal (pembelahan, pemangkasan, metilasi, dll). Molekul-molekul tRNA
matang mengandung beberapa nukleosida tidak hadir dalam mRNA atau dalam tRNA
transcripts.These gen nukleosida biasa primer, seperti inosin, pseudouridine, dihydrouridine,
1-methylguanosine dan beberapa orang lain, yang diproduksi oleh posttranscriptionall,
modifikasi enzim-katalis dari empat nukleosida dimasukkan ke dalam RNA selama
transkripsi.
Karena ukurannya yang kecil (70-80 nukleotida panjang), tRNA lebih setuju untuk
analisis struktural dari yang lain, molekul besar RNA involyed dalam sintesis protein. Urutan
nukleotida lengkap dan mengusulkan "daun semanggi" struktur alanin tRNA ragi diterbitkan
oleh RWHolley dan rekan pada tahun 1965; Holley berbagi Penghargaan Nobel 1968 dalam
fisiologi dan obat-obatan untuk pekerjaan ini. Karena mereka, banyak tRNA telah diurutkan,
dan tRNA ragi alanin bahkan telah disintesis in vitro dari mononucleotides oleh HGKhorana
(1968 pemenang Hadiah Nobel lain, dalam hal Khorana itu, untuk bekerja pada sifat kode
genetik) dan rekan kerja. Struktur tiga dimensi dari tRNA fenilalanin ragi telah ditentukan
oleh studi difraksi sinar-X. Para anticodons dari alanin dan fenilalanin tRNA ragi terjadi
dalam loop (wilayah nonhidrogen-berikat) dekat pusat molekul. Bahkan, anticodons semua
tRNA sequencing sampai saat ini (lebih dari 70 dari semua organisme) telah ditemukan dalam
comparably terletak loop antikodon.
Setiap ribosom memiliki dua situs pengikatan tRNA. A atau amynoacyl mengikat
masuk aminoasil-tRNA, tRNA membawa asam amino yang berikutnya yang akan
ditambahkan ke rantai polipeptida yang sedang tumbuh . P atau peptidil situs mengikat tRNA
mejadi polipeptida. Kekhususan untuk aminoasil - tRNA mengikat dalam situs ini disediakan
oleh kodon mRNA yang membentuk bagian dari situs A dan P mengikat. Sebagai bergerak
ribosom sepanjang mRNA ( atau sebagai mRNA shuttled di ribosom ), kekhususan untuk
aminoasil - tRNA mengikat dalam perubahan situs A dan P sebagai kodon mRNA yang
berbeda pindah ke situs pengikat. Ribosom mengikat situs sendiri (minus mRNA) dengan
demikian mampu mengikat setiap aminoasil-tRNA.
Molekul tRNA mengandung banyak kekhususan meskipun ukurannya yang kecil.
Tidak hanya harus mereka (1) memiliki urutan antikodon yang benar, sehingga dapat
merespon kodon yang tepat, tetapi mereka juga harus (2) diakui oleh sintetase tRNA
aminoacyl- benar, sehingga mereka diaktifkan dengan asam amino yang tepat, dan (3)
mengikat ke situs A dan P di ribosom. Sintesis protein dimulai oleh tRNA inisiator khusus,
ditunjuk tRNAMet. Ini berarti bahwa semua polipeptida dimulai dengan metionin selama
sintesis. Amino-terminal metionin selanjutnya dibelah dari banyak polipeptida. Dengan
demikian, protein fungsional tidak perlu memiliki metionin amino-terminal.
Dalam organel prokariota dan eukariota, metionin pada inisiator tRNAMet memiliki
gugus amino diblokir dengan kelompok formil. Dalam sistem sitoplasma eukariotik, inisiator
tRNAkhusus juga ada, tapi gugus amino tidak formylated. Sebuah metionin yang berbeda
tRNA, tRNAMet yang merespon kodon metionin internal ada di kedua sistem prokariotik dan
eukariotik, baik tRNA metionin memiliki antikodon yang sama dan keduanya menanggapi
kodon yang sama (AUG) untuk metionin.
Pada prokariota, gugus amino formylated pada tRNAMet methionyl- mencegah
pembentukan ikatan peptida antara gugus amino dan gugus karboksil dari asam amino pada
akhir rantai polipeptida yang sedang tumbuh. Pada eukariota, bagaimanapun, gugus amino
dari dari methionyl- tRNAMet tidak diblokir. Apakah mencegah tRNAMet methionyl- (untuk
inisiator) dari menanggapi kodon AUG internal dan methionyl tRNAMet dari rsponding
untuk inisiator coodns AUG di mRNA eukariotik ?. Ternyata, hanya methionyl- tRNAMet
akan bereaksi dengan faktor inisiasi protein, IF-1, IF-2, dan IF-3, dan hanya methionyl-
tRNAMet akan berinteraksi dengan faktor elongasi protein, Ts-upaya-upaya dan Ts. Dalam
hal apapun, hanya methionyl-tRNAMet merespon AUG inisiasi kodon dan hanya methionyl-
tRNA Met juga menanggapi inisiator kodon alternatif, GUG (a coodn valin ketika hadir pada
posisi internal), yang dikenal untuk hadir dalam mRNA alam tertentu.
Pada prokariota, inisiasi rantai polipeptida terjadi dengan pembentukan kompleks
antara mRNA, menthionyl tRNAff Met, dan 30S ribosom subunit. pembentukan kompleks
inisiasi ini memerlukan aktivitas faktor inisiasi tiga protein, yang ditunjuk IF-1, IF-2, IF-3,
ditambah guanosin trifosfat (GTP). Ini dapat difasilitasi oleh interaksi dasar pasangan antara
urutan basa dekat ujung 3 'dari 16S rRNA dan urutan basa dalam "urutan pemimpin" dari
mRNA.
 Inisiasi kompleks maka menggabungkan dengan 50S ribosom subunit, dan methionyl
yang l tRNAff Met, menjadi terikat ke tempat peptidil. Hal ini memerlukan hidrolisis satu
molekul GTP. Keselarasan dari inisiasi AUG kodon dengan antikodon tRNAff Met,
perbaikan kodon hadir di lokasi A, sehingga membentuk kekhususan untuk aminoasil-tRNA
mengikat di lokasi A, pengikatan alanyl-tRNAala di situs A membutuhkan hidrolisis dari satu
molekul GTP dan faktor elongasi protein ditunjuk EF-Ts dan EF-Tu. Pembentukan ikatan
peptida antara gugus karboksil dari f-metionin terikat pada tRNAff Met, di tempat P dan
gugus amino dari molekul alanin terikat tRNAala di situs A kemudian dikatalisis oleh peptidil
transferase, suatu enzim yang terikat pada subunit ribosom 50S . Reaksi ini meninggalkan-f
bertemu-ala dipeptida melekat tRNAala terikat ke situs A ribosom.
Langkah selanjutnya dalam terjemahan, yang disebut translokasi melibatkan (1)
gerakan-f bertemu- tRNA ala dari situs A ke situs P dan (2) pergerakan molekul mRNA tepat
tiga nukleotida, relatif terhadap posisi ribosom , sehingga kodon sebelumnya dalam register
dengan situs A bergerak ke dalam register dengan situs P.
tRNA aminoacyl- berikutnya ditentukan oleh kodon mRNA di situs A kemudian
mengikat di lokasi A, dan pembentukan ikatan peptida dan translokasi langkah yang
berulang. Urutan hanya dijelaskan diulang untuk setiap kodon mRNA sampai kodon
terminasi rantai tercapai. Kelompok formil pada metionin amino-terminal biasanya dihapus
oleh deformylase sebelum sintesis polipeptida selesai. Ketika salah satu dari kodon terminasi
rantai tiga polipeptida (UAG, UAA, atau UGA) datang ke dalam register dengan situs A,
polipeptida baru lahir, tRNA terletak P, dan mRNA dilepaskan, dan subunit ribosom
berdisosiasi. Pemutusan membutuhkan aktivitas salah satu dari dua faktor rilis protein, RF1
ditunjuk DAN RF2, subunit ribosom dipisahkan kemudian bebas untuk memulai terjemahan
molekul mRNA lain.
Dari pada setiap molekul mRNA diterjemahkan oleh ribosom tunggal, kebanyakan
mRNA secara simultan diterjemahkan oleh beberapa ribosom, berjarak sekitar 90 nukleotida
terpisah di sepanjang molekul mRNA. Ukuran kompleks ini terjemahan, yang disebut
polyribosomes atau polysomes, sangat bervariasi tetapi berkorelasi dengan ukuran
polipeptida yang disintesis. Rantai hemoglobin, misalnya, disintesis pada polyribosome.

Petanyaan :

1. Bagaimana protein yang terbentuk pertama kali pada prokariot dan

eukariot setelah proses translasi?
 Jawab :
Protein yang terbentuk pertama kali pada prokariot maupun
eukariot selalu diawali dengan metionin. Pada beberapa kasus,
asam amino metionin ini selanjutnya disingkirkan. Misalnya, asam
amino methionine pertama yang diangkut RNAt ke ribosom pada
E.Coli (prokariot) sesuai kode genetic AUG adalah formylmethionin
atau disingkat fMet dan bukan methionine
2. Mengapa tiap kodon bukan mengandung dua nukleotida tetapi mengandung tiga
nukleotida?
Jawab :
Karena ada 20 jenis asam amino yang berbeda sehingga
paling sedikit ada 20 kodon yang berbeda yang harus dibentuk
menggunakan empat simbol (basa) yang tersedia di dalam pesan
(mRNA). Dua basa per kodon akan menghasilkan hanya 42 atau 16
kodon yang mungkin. Tentu saja kodon itu tidak mencukupi.
Sementara itu, tiga basa per kodon akan menghasilkan 43 atau 64
kodon yang mungkin. Jumlah ini tentu saja mencukupi, bahkan
berlebih. Adanya kelebihan ini memungkinkan beberapa kodon yang
berbeda mengkode atau menentukan asam amino yang sama,
misalnya kodon GUU, GUC, GUA, dan GUG sama-sama mengkode
atau menentukan asam amino valin.
3. Jelaskan perbedaan dari ribosom E. coli dan ribosom eukariotik?
Jawab :
- Ribosom E.coli seperti pada kebanyakan prokariotik, mempunyai
berat molekul 2.7 x 106 dan ukuran dari 70S. Di E.coli ribosom
subunit kecil terdiri dari 16S molekul RNA + 21 polipeptida berbeda
dan subunit besar terdiri dari dua molekul RNA + 31 polipeptida.
- Ribososm dari eukariotik lebih besar namun, ukurannya berbeda
dari spesies. Ribosom hadir di organel sel eukariotik lebih kecil.
Dalam ribosom eukariotik subunit kecil terdiri dari 18S molekul RNA
dan subunit besar terdiri 5S, 5,8S, dan 28S molekul RNA
4. Di dalam sel, terdapat ribosom bebas dan ribosom terikat dengan jumlah unit yang
relative. Apakah ribosom bebas dapat menjadi ribosom terikat atau sebaliknya?
Jawab :
Bisa, ribosom terikat dan bebas dapat bertukar. Hal ini
tergantung dengan kebutuhan metabolism dari sel itu sendiri. Jika
sel membutuhkan banyak enzim untuk mengkatalis metabolism
yang ada pada sitoplasma maka ribosom terikat kan melepaskan
diri dari RE dan menjadi ribosom bebas. Dan apabila organel lain
(dalam sel/luar sel) sedang membutuhkan banyak protein maka
jumlah ribosom terikat akan meningkat sehingga sintesis protein
juga akan meningkat.