Trakripsi Overview Prokariot

Transkripsi adalah langkah pertama ekspresi gen. Selama proses ini, urutan DNA
suatu gen disalin ke dalam RNA.Sebelum transkripsi dapat terjadi, heliks ganda DNA harus
terlepas di dekat gen yang ditranskripsi. Wilayah DNA terbuka disebut gelembung
transkripsi. Dalam transkripsi, bagian DNA terbuka. Satu untai, untai templat, berfungsi
sebagai templat untuk sintesis transkrip RNA komplementer. Untai yang lain, untai
pengkodean, identik dengan transkrip RNA secara berurutan, kecuali bahwa ia memiliki basis
urasil (U) sebagai pengganti basis timin (T). Dalam transkripsi, bagian DNA terbuka. Satu
untai, untai templat, berfungsi sebagai templat untuk sintesis transkrip RNA komplementer.
Untai yang lain, untai pengkodean, identik dengan transkrip RNA secara berurutan, kecuali
bahwa ia memiliki basis urasil (U) sebagai pengganti basis timin (T). Transkripsi
menggunakan salah satu dari dua untai DNA yang terbuka sebagai templat; untai ini disebut
untai cetakan. Produk RNA merupakan pelengkap untai cetakan dan hampir identik dengan
untai DNA lainnya, disebut untai nempemplate (atau coding). Namun, ada satu perbedaan
penting: dalam RNA yang baru dibuat, semua nukleotida T diganti dengan nukleotida U.

RNA polimerase
RNA polimerase adalah enzim yang mentranskripsi DNA menjadi RNA. Menggunakan
cetakan DNA, RNA polimerase membangun molekul RNA baru melalui pasangan basa.
Misalnya, jika ada G dalam templat DNA, RNA polimerase akan menambahkan C ke untai
RNA yang baru tumbuh. RNA polimerase mensintesis untai RNA sebagai pelengkap untai
DNA templat. Ini mensintesis untai RNA di arah 5 'ke 3', sambil membaca cetakan untai
DNA dalam arah 3 'ke 5'. Untai cetakan DNA dan untai RNA bersifat antiparalel. RNA
polimerase mensintesis untai RNA sebagai pelengkap untai DNA templat. Ini mensintesis
untai RNA di arah 5 'ke 3', sambil membaca cetakan untai DNA dalam arah 3 'ke 5'. Untai
cetakan DNA dan untai RNA bersifat antiparalel. RNA polimerase adalah enzim besar
dengan banyak subunit, bahkan pada organisme sederhana seperti bakteri. Selain itu, manusia
dan eukariota lainnya memiliki tiga jenis RNA polimerase yang berbeda: I, II, dan III.
Masing-masing mengkhususkan diri dalam menyalin kelas gen tertentu.

Inisiasi transkripsi
Untuk mulai menyalin gen, RNA polimerase berikatan dengan DNA gen di daerah yang
disebut promotor. Pada dasarnya, promotor memberi tahu polimerase tempat untuk "duduk"
pada DNA dan mulai menyalin. Wilayah promotor hadir sebelum (dan sedikit tumpang tindih
dengan) wilayah yang ditranskripsi yang ditentukan oleh transkripnya. Ini berisi situs
pengenalan untuk RNA polimerase atau protein penolongnya untuk diikat. DNA terbuka di
daerah promotor sehingga RNA polimerase dapat memulai transkripsi. Wilayah promotor
hadir sebelum (dan sedikit tumpang tindih dengan) wilayah yang ditranskripsi yang
ditentukan oleh transkripnya. Ini berisi situs pengenalan untuk RNA polimerase atau protein
penolongnya untuk diikat. DNA terbuka di daerah promotor sehingga RNA polimerase dapat
memulai transkripsi.

Elongation
Setelah RNA polimerase berada pada posisi di promotor, langkah transkripsi selanjutnya —
perpanjangan — dapat dimulai. Pada dasarnya, perpanjangan adalah tahap ketika untai RNA
menjadi lebih panjang, berkat penambahan nukleotida baru.
Selama perpanjangan, RNA polimerase "berjalan" di sepanjang satu untai DNA, yang dikenal
sebagai untai cetakan, dalam arah 3 'ke 5'. Untuk setiap nukleotida dalam template, RNA
polimerase menambahkan nukleotida RNA yang cocok (komplementer) ke ujung 3 'dari untai
RNA.
Reaksi polimerisasi di mana nukleotida RNA nukleotida ditambahkan ke untai RNA yang
ada. Nukleotida triphosphate RNA memiliki serangkaian tiga gugus fosfat yang melekat
padanya. Kelompok phoosphate yang paling dalam bereaksi dengan hidroksil 3 'pada
nukleotida di ujung untai yang ada, membentuk ikatan fosfodiester yang menempelkan
nukleotida baru ke ujung rantai. Pirofosfat (molekul yang terdiri dari dua kelompok fosfat)
hilang dalam proses ini, dan kemudian dibelah menjadi dua fosfat anorganik individu. Secara
umum, reaksi ini akan terjadi hanya ketika nukleotida yang masuk adalah pelengkap
nukleotida yang terpapar berikutnya dalam untai DNA yang berfungsi sebagai templat untuk
sintesis RNA.

Transcription Terminated
RNA polimerase akan terus menyalin hingga mendapat sinyal untuk berhenti. Proses
mengakhiri transkripsi disebut penghentian, dan itu terjadi setelah polimerase menyalin
urutan DNA yang dikenal sebagai terminator, contohnya ditemukan pada bakteri: Rho-
dependent dan Rho-independent. Dalam terminasi yang bergantung pada Rho, RNA
mengandung situs pengikatan untuk protein yang disebut faktor Rho. Faktor Rho mengikat
urutan ini dan mulai "memanjat" transkrip menuju RNA polimerase. Pengakhiran yang
bergantung pada Rho. Terminator adalah wilayah DNA yang mencakup urutan kode untuk
situs pengikatan Rho di mRNA, serta titik berhenti transkripsi yang sebenarnya (yang
merupakan urutan yang menyebabkan RNA polimerase berhenti sehingga Rho dapat
mengejar ketinggalannya. ). Rho mengikat ke situs pengikatan Rho dalam mRNA dan
memanjat transkrip RNA, dalam arah 5 'ke 3', menuju gelembung transkripsi di mana
polimerase berada. Ketika menangkap hingga polimerase, itu akan menyebabkan transkrip
dilepaskan, mengakhiri transkripsi.