NEOANTIGEN DALAM IMUNOTERAPI KANKER

Relevansi klinis selT dalam pengendalian beragam kanker manusia sudah tidak diragukan
lagi saat ini. Namun, genigen yang memungkinkan sistem imun sel-sel kanker yang
berbeda dari sel-sel non-kanker menjadi tidak jelas. Inovasi teknologi baru-baru ini telah
membuat kemungkinan untuk menghilangkan oksigen yang spesifik-responsif terhadap
oksigen yang spesifik sebagai akibat dari pemetaan khusus atau tidak, dan menyarankan
bahwa pengakuan terhadap neoantigen seperti itu merupakan faktor utama dalam
aktivitas imunoterapi klinis. Pengamatan ini menunjukkan bahwa neoantigen load dapat
membentuk suatu terapi kanker dan imunoterapi. pendekatan yang secara selektif
meningkatkan reaktivitas Tcell terhadap kelas antigen ini.

Imunoterapi yang meningkatkan kemampuan sel T endogen untuk

menghancurkan sel kanker telah menunjukkan kemanjuran terapeutik dalam
berbagai keganasan manusia. Baru-baru ini, bukti bahwa kompartemen sel T
endogen dapat membantu mengendalikan pertumbuhan tumor yaitu praklinis pada
model tumor tikus dan untuk melanoma manusia. Secara khusus, tikus yang tidak
memiliki sistem kekebalan utuh terbukti lebih rentan terhadap kanker yang
diinduksi karsinogen dan kanker spontan dibandingkan dengan yang
imunokompeten. Efek dari Tcell cytokine interleukin-2 pada sebagian kecil pasien
melanoma memberikan bukti klinis awal tentang potensi imunoterapi pada
penyakit ini. Pada tahun 2010, dilakukan revitalisasi uji klinis yang menunjukkan
bahwa pengobatan dengan ipilimumab, sebuah antibodi yang menargetkan protein
pos pemeriksaan sel T CTLA-4, meningkatkan kelangsungan hidup keseluruhan
pasien dengan metastasis melanoma. Dilakukan juga tes secara langsung dari
potensi tumoricidal kompartemen sel T endogen, yang menunjukkan bahwa infus
limfosit infiltrasi tumor yang diperluas secara autologous ex vivo dapat
menginduksi respon klinis objektif dalam melanoma metastasis, dimana sebagian
dari ini aktivitas klinis ini disebabkan oleh sel T sitotoksik. Penelitian terbaru
menunjukkan bahwa imunoterapi berbasis sel T juga efektif dalam berbagai
keganasan manusia lainnya. Secara khusus, percobaan fase awal antibodi yang
mengganggu molekul pos pemeriksaan sel T PD-1 telah menunjukkan aktivitas
klinis dalam jenis tumor yang beragam seperti melanoma, kanker paru-paru,
kanker kandung kemih, kanker perut, kanker sel ginjal, kanker kepala dan leher,
dan limfoma Hodgkin. Berdasarkan hubungan antara infiltrasi sel T CD8 +
preterapi dan respons terhadap blokade PD-1 pada melanoma, aktivitas sel T
sitotoksik juga memainkan peran sentral dalam bentuk imunoterapi kanker ini.

Kesimpulan tersirat dari data klinis ini adalah bahwa dalam sebagian besar
pasien, kompartemen sel T endogen mampu mengenali epitop peptida yang
ditampilkan pada kompleks histokompatibilitas utama (MHC) pada permukaan sel
ganas. Atas dasar teoretis, epitop penolakan kanker tersebut dapat diturunkan dari
dua kelas antigen. Kelas antigen penolakan kanker yang potensial terbentuk oleh
protein nonmutated yang toleransi sel T tidak lengkap — misalnya, karena pola
ekspresi jaringannya yang terbatas. Kelas kedua antigen penolakan kanker
potensial dibentuk oleh peptida yang sepenuhnya tidak ada pada genom manusia
normal, yang disebut neoantigen. Untuk kelompok besar tumor manusia tanpa
virusiologi, neo-epitop semacam itu semata-mata diciptakan oleh perubahan DNA
spesifik-tumor yang menghasilkan pembentukan sekuens protein baru. Untuk
tumor terkait virus, seperti kanker serviks dan subset kanker kepala dan leher,
epitop yang berasal dari bingkai pembacaan virus terbuka juga berkontribusi
terhadap kumpulan neoantigen.

Dibandingkan dengan self-antigen nonmutated, neoantigens telah

dipostulasikan memiliki relevansi khusus untuk kontrol tumor, karena kualitas
kumpulan sel T yang tersedia untuk antigen ini tidak dipengaruhi oleh toleransi
sel T sentral. Meskipun sejumlah studi heroik memberikan bukti awal untuk
imunogenisitas neoantigen yang diturunkan mutasi, teknologi untuk menganalisis
reaktifitas sel T secara sistematis terhadap antigen ini hanya tersedia baru-baru ini.
Di sini, kami meninjau pemahaman kami yang muncul tentang peran neoantigen
spesifik pasien dalam imunoterapi kanker saat ini dan implikasi dari data ini untuk
pengembangan imunoterapi generasi berikutnya.

Identifikasi neoantigen yang dipandu exome: Pertimbangan proses

Sebagian besar dari mutasi pada tumor manusia tidak dibagi antara pasien
pada frekuensi yang bermakna dan karena itu dapat dianggap spesifik untuk
pasien. Karena ini, teknologi untuk menginterogasi reaktivitas sel T terhadap
neoantigen yang diturunkan mutasi putatif perlu didasarkan pada genom tumor
individu. . Dengan pengembangan teknologi pengurutan dalam, menjadi layak
untuk mengidentifikasi mutasi yang ada dalam bagian protein-encoding dari
genom (exome) dari tumor individu dengan relatif mudah dan dengan demikian
memprediksi potensi neoantigen (9). Dua studi dalam model tikus memberikan
bukti langsung pertama bahwa pendekatan berbasis cance rexome dapat
digunakan untuk mengidentifikasi neoantigen yang dapat dikenali oleh Cell
(10,11). Singkatnya, untuk semua mutasi yang menghasilkan pembentukan urutan
protein baru, peptida pengikat MHC potensial diprediksi, dan sekumpulan
neoantigen potensial yang dihasilkan digunakan untuk menanyakan reaktivitas sel
T. Studi-studi berikutnya telah menunjukkan bahwa analisis berbasis kanker
exome juga dapat dieksploitasi dalam pengaturan klinis, untuk membedah
reaktivitas sel T pada pasien yang dirawat dengan terapi sel limfosit infiltrasi
(TIL) tumornya atau blokade check point (12, 13) . Lebih jauh, setelah penelitian
awal ini, identifikasi neoantigen berdasarkan data eksome kanker telah
didokumentasikan dalam berbagai sistem model eksperimental dan keganasan
manusia.

Pipa teknologi yang digunakan untuk mengidentifikasi neoantigen dalam

studi yang berbeda ini bervariasi secara substansial, dan optimasi lebih lanjut
mungkin dilakukan (Gbr. 1). Menerima keterbatasan menyelidiki profil mutasi
tumor dalam biopsi tunggal (23), analisis genetik tumor itu sendiri dapat dianggap
sebagai proses yang kuat. Secara khusus, berdasarkan analisis neoantigen yang
sebelumnya diidentifikasi dengan cara lain, tingkat negatif palsu dari sekuensing
kanker exome rendah - yaitu, sebagian besar neoantigen terjadi dalam urutan
eksonik yang cakupannya cukup (24). Pada saat yang sama, tampak jelas dari
upaya penyaringan yang tidak bias — di mana seluruh kumpulan mutasi yang
diidentifikasi digunakan untuk menanyakan reaktivitas sel T — bahwa sebagian
besar mutasi dalam gen yang diekspresikan tidak mengarah pada pembentukan
neoantigen yang dikenali oleh autologousTcells (16,17). Karena itu, pipa yang
kuat yang dapat digunakan untuk menyaring data exome kanker sangat penting,
khususnya untuk tumor dengan beban mutasi tinggi.
 Bagaimana penyaringan seperti itu dapat dilakukan? Dengan serangkaian
mutasi dalam gen yang diekspresikan sebagai titik awal, dua persyaratan
tambahan dapat dirumuskan. Pertama, protein bermutasi perlu diproses dan
kemudian disajikan sebagai peptida mutan oleh molekul MHC. Kedua, sel T harus
ada yang dapat mengenali kompleks MHC peptida ini. Dalam dua studi praklinis
baru-baru ini, presentasi dari beberapa neoantigen yang diprediksi oleh molekul
MHC secara eksperimental ditunjukkan oleh spektrometri massa (15, 20), dan
pendekatan ini dapat membentuk strategi yang berharga untuk lebih
mengoptimalkan algoritma presentasi MHC. Pada saat yang sama, sensitivitas
spektrometri massa saat ini masih terbatas, sehingga kemungkinan menghasilkan
sebagian kecil negatif palsu. Untuk alasan ini, tetapi juga karena masalah logistik,
implementasi pendekatan ini dalam pengaturan aclinical tidak mungkin terjadi
segera. Kurangnya bukti langsung untuk presentasi MHC, seperti yang dapat
disediakan oleh spektrometri massa, presentasi neoantigen oleh molekul MHC
kelas I dapat diprediksi menggunakan algoritma yang telah ditetapkan
sebelumnya yang menganalisis aspek-aspek seperti kemungkinan pemrosesan
proteasomal, transportasi ke retikulum endoplasma, dan afinitas untuk allele MHC
kelas I yang relevan. Selain itu, level ekspresi gen (atau mungkin lebih disukai
level translasi protein) berpotensi juga dapat digunakan untuk meningkatkan
prediksi tingkat kelangkaan (25).

Meskipun sebagian besar studi identifikasi neoantigen telah berhasil

menggunakan kriteria untuk prediksi epitop yang mirip dengan yang sebelumnya
ditetapkan untuk identifikasi epitop yang diturunkan dari patogen [misalnya, (12,
13)], Srivastava dan rekannya berpendapat bahwa neoantigen dalam model tumor
tikus yang dapat ditransplantasikan. menampilkan sifat yang sangat berbeda dari
antigen virus dan umumnya memiliki afinitas yang sangat rendah untuk MHC
kelas I (14). Meskipun tidak memiliki penjelasan yang memuaskan untuk
merekonsiliasi temuan ini, kami mencatat bahwa sebagian besar neoantigen
manusia yang telah diidentifikasi dalam layar yang tidak bias menampilkan
afinitas pengikatan MHC yang diprediksi tinggi (24, 26). Demikian juga, antigen
histokompatibilitas minor, kelas antigen yang secara konseptual mirip dengan
neoantigen, diidentifikasi dengan benar oleh algoritma pengikatan MHC klasik
(27). Selain itu, mutasi yang diidentifikasi dalam studi praklinis baru-baru ini
sebagai pembentuk antigen mutan spesifik-tumor yang dapat mendorong
penolakan tumor terapeutik ketika digunakan dalam vaksin tumor (15) tidak
diprediksi signifikan dengan menggunakan pendekatan Srivastava. Langkah filter
potensial lain yang telah disarankan adalah memeriksa apakah mutasi diharapkan
untuk meningkatkan pengikatan MHC, daripada semata-mata mengubah
permukaan Tcell reseptor (TCR) - yang terpapar peptida mutan. Namun, dengan
contoh-contoh dari kedua kategori dalam model mouse dan data manusia, nilai
tambah dari filter semacam itu mungkin relatif sederhana (11, 15, 20, 26). Untuk
MHC kelas I membatasi neoantigen, kemungkinan perolehan terbesar dalam
algoritma prediksi dapat dibuat sehubungan dengan identifikasi subset peptida
pengikat MHC yang berhasil dikenali oleh repertoar TCR. Sehubungan dengan
ini, sifat residu peptida terikat MHC terpapar TCR pusat telah terbukti dikaitkan
dengan imunogenisitas peptida (28). Dengan cara yang sama, perubahan pada
situs-situs ini berpotensi diambil oleh sistem kekebalan tubuh lebih lama (20).
Namun, upaya eksperimental lebih lanjut diperlukan untuk mengevaluasi sejauh
mana algoritma yang memprediksi imunogenisitas dapat memfasilitasi identifikasi
MHC kelas I neoantigen terbatas. Untuk neoantigen MHC kelas II yang dibatasi,
penting untuk memperoleh pemahaman yang lebih baik tidak hanya tentang
imunogenisitas peptida tetapi juga faktor-faktor dasar yang menentukan efisiensi
presentasi epitop.

Ukuran Dan Sifat Repertoar Neoantigen

Analisis skala besar dari reaktivitas sel T neoantigen spesifik kini telah
dilakukan untuk jumlah yang signifikan dari pasien, kebanyakan dalam melanoma
(12, 13, 16, 17). Dengan peringatan bias seleksi potensial terhadap pasien dengan
manfaat klinis setelah intervensi imunoterapi, analisis ini memberikan perkiraan
pertama dari frekuensi yang sistem kekebalan mengenali neoantigen yang
terbentuk sebagai konsekuensi dari mutasi. Kesimpulan pertama dan paling
penting yang dapat diambil dari analisis ini adalah bahwa sistem kekebalan
berbasis Tcell bereaksi terhadap MHC kelas I-terbatas (12, 13, 17) dan MHC
kelas II-neoantigen terbatas (16) dalam jumlah besar sebagian kecil dari pasien
melanoma. Kesimpulan kedua yang dapat diambil dari analisis ini adalah bahwa
hanya sebagian kecil dari mutasi nonsynonim dalam gen yang diekspresikan
dalam tumor ini mengarah pada pembentukan neoantigen yang reaktivitas sel T
CD4 + atau CD8 + dapat dideteksi dalam limfosit yang menginfiltrasi tumor.

Apa arti pengamatan ini untuk potensi pembentukan repertoar neoantigen

pada keganasan manusia lainnya? Sebagian besar melanoma manusia memiliki
beban mutasi di atas 10 mutasi somatik permegabase (Mb) pengkodean DNA, dan
ini tampaknya cukup untuk menyebabkan pembentukan sering neoantigen yang
dapat dilihat oleh sel T. Berdasarkan data ini, pembentukan neoantigen yang
berpotensi dapat dikenali oleh sel T autologus diharapkan juga umum untuk tumor
lain dengan beban mutasi di atas 10 mutasi somatik per Mb (sesuai dengan sekitar
150 mutasi yang tidak identik dalam gen yang diekspresikan) (Gbr. 2 ). Kelompok
ini mengandung fraksi yang cukup besar dari jenis kanker dengan prevalensi
tinggi seperti kanker paru-paru dan kanker kolorektal. Jika pembentukan
neoantigen sering terjadi pada tumor dengan beban mutasi di atas 10 mutasi
somatik per Mb, banyak tumor dengan beban mutasi 1 hingga 10 per Mb mungkin
masih diharapkan membawa neoantigen yang dapat dikenali oleh Tcell. Namun,
karena berdasarkan pada fakta bahwa bahkan untuk melanoma dengan beban
mutasi sekitar 10 mutasi per Mb, reaktivitas sel T tidak selalu diamati (16), tipe
tumor dengan beban mutasi di bawah 1 mutasi per Mb tampaknya lebih kecil
kemungkinannya untuk mengekspresikan neoantigen. yang dapat dikenali oleh sel
T autologous.

Meskipun analisis ini memberikan sketsa pertama yang berguna dari

relevansi yang diharapkan dari neoantigen pada berbagai jenis tumor, tiga faktor
penting harus dipertimbangkan. Pertama, dengan mengandalkan keberadaan
reaktivitas sel T yang sudah ada sebagai pembacaan, studi manusia yang
dilakukan hingga saat ini hanya akan mendeteksi neoantigen yang imunogenik
selama pertumbuhan tumor in vivo (baik secara spontan atau didorong oleh
terapi). Dapat dibayangkan bahwa tidak semua neoantigen yang diekspresikan
tumor menginduksi respon sel T autologus - misalnya, karena mereka tidak
disajikan secara efisien. Selain itu, setidaknya dalam model praklinis, ada bukti
untuk immunodominance antigen tumor, di mana sistem kekebalan tubuh menjadi
sangat terpaku pada antigen tertentu sehingga mengabaikan antigen lain yang
keduanya ada dan terdeteksi dalam tumor (29). Jika hanya sebagian kecil dari
neoantigen yang ada biasanya akan memperoleh reaktivitas sel T, analisis yang
dilakukan sampai saat ini dapat meremehkan repertoar neoantigen yang
sebenarnya. Sebagai pertimbangan kedua, penting untuk menyadari bahwa
pembentukan neoantigen adalah proses probabilistik di mana setiap mutasi
tambahan meningkatkan peluang terciptanya suatu neoantigen yang relevan.
Dengan demikian, dalam "lotere neoantigen," akan ada kasus di mana meskipun
beban mutasi tinggi, reaktivitas sel T spesifik-neoantigen kurang atau, sebaliknya,
di mana tumor dengan hanya beberapa mutasi akan mengekspresikan kelas MHC
I -Atau neoantigen kelas II-terbatas. Ketiga, meskipun kami di sini membuat
prediksi berkenaan dengan frekuensi neoantigen yang berpotensi dikenali oleh
repertoar TCR, harus diingat bahwa kehadiran neoantigen tidak sama dengan
induksi reaktivitas sel T. Tumor manusia bervariasi secara substansial dalam
komposisi lingkungan mikro mereka, dan ini cenderung mempengaruhi
kemampuan kumpulan sel T untuk menanggapi antigen yang bermutasi. Terkait
dengan ini, dari sudut pandang konseptual, manipulasi terapeutik reaktivitas sel T
akan tampak sangat menarik untuk jenis tumor yang mengekspresikan sejumlah
besar antigen tetapi di mana lingkungan mikro tumor menghambat aktivasi Sel
yang mengenali mereka.

Apa ciri-ciri neoantigen yang diturunkan dari mutasi pada kanker manusia,
baik yang berkenaan dengan gen-gen dari mana mereka diturunkan maupun
frekuensi mereka muncul dalam populasi pasien? Dalam dunia yang ideal,
neoantigen akan diturunkan dari onkogen esensial dan terjadi pada kelompok
pasien besar, untuk mengurangi kemungkinan melarikan diri dan memfasilitasi
intervensi klinis yang meningkatkan reaktivitas sel T terhadap mereka. Jelas,
respon sel T kadang-kadang terjadi terhadap MHC kelas I-terbatas (30) dan MHC
kelas II-neoantigen terbatas pada onkogen tervalidasi yang dibagi antara
subkelompok pasien (31). Pada saat yang sama, jelas bahwa, setidaknya dalam
melanoma, sebagian besar respons sel T spesifik-neoantigen diarahkan pada
protein bermutasi yang pada dasarnya unik untuk tumor itu dan yang tidak
mungkin memainkan peran kunci dalam transformasi seluler (Gbr. .3, atas dan
bawah) (16). Implikasi langsung dari bias ini dalam reaktivitas sel T spesifik-
neoantigen terhadap mutasi penumpang khusus-pasien adalah bahwa penargetan
neoantigen yang pasti kemungkinan akan membutuhkan pengembangan
imunoterapi yang dipersonalisasi.

Pengaruh Ekstrinsik Pada Lanskap Antigenik Tumor

Repertoar neoantigen yang diekspresikan dalam kanker yang tampak

secara klinis mungkin telah secara substansial dipengaruhi oleh interaksi tumor
yang berkembang dengan sistem kekebalan yang terjadi bahkan sebelum menjadi
jelas secara klinis. Ini adalah proses "immunoediting kanker" yang telah
didokumentasikan dengan baik dalam model kanker praklinis. (1,32,33). Dalam
bentuknya yang paling kompleks, immunoediting kanker dapat terjadi dalam tiga
fase: eliminasi, di mana sistem imun bawaan dan adaptif bekerja bersama untuk
mengenali tumor yang berkembang dan menghancurkannya sebelum menjadi
jelas secara klinis; kesetimbangan, di mana sel okultum residu residual yang tidak
dihancurkan dalam fase eliminasi diadakan dalam keadaan dormansi tumor
sebagai konsekuensi dari aktivitas sistem imun adaptif dan menjalani
"penyuntingan", dan melarikan diri, di mana sel-sel tumor yang diedit tidak lagi
dikenali atau dikendalikan oleh proses imun , mulai tumbuh secara progresif,
menginduksi lingkungan mikro tumor yang imunosupresif, dan kemudian muncul
sebagai kanker yang tampak secara klinis. Penelitian terbaru menunjukkan bahwa
sel T memainkan peran utama dalam membentuk imunogenisitas kanker yang
sedang berkembang — yaitu, “menyunting” imunogenisitas tumor — dan
mengerahkan efek melalui mekanisme dua kali lipat. Pertama, sel-sel T dapat
membentuk ntigenitas / imunogenisitas tumor melalui proses seleksi immuno
dengan menghancurkan sel-sel tumor yang mengekspresikan mutan-mutan
spesifik tumor yang kuat, meninggalkan sel-sel tumor yang bisa mengekspresikan
antigen yang lebih lemah (beberapa di antaranya mungkin masih merupakan
antigen tumor mutan) atau tidak mampu mengekspresikan antigen (misalnya,
mereka yang telah mengembangkan mutasi dalam pemrosesan atau presentasi
antigen) (11). Kedua, serangan sel T kronis pada tumor telah terbukti
membungkam ekspresi antigen spesifik tumor tertentu melalui mekanisme
epigenetik dalam model praklinis (34). Yang mengejutkan, sebuah penelitian
baru-baru ini, berdasarkan analisis ribuan sampel tumor padat Cancer Genome
Atlas, menunjukkan bahwa, khususnya pada kanker kolorektal, peptida bermutasi
yang diperkirakan berikatan dengan molekul MHC autologous kelas I lebih jarang
daripada yang diharapkan secara kebetulan, sebuah pengamatan yang konsisten
dengan seleksi berbasis kekebalan (35). Dengan ekstensi, kombinasi kekuatan sel-
ekstrinsik seperti immunoediting kanker dan sifat stokastik epitop yang timbul
dari mutasi spesifik-tumor dapat membantu mendorong lanskap mutasi yang
heterogen — dan dengan kesimpulan, antigenik — yang telah dicatat pada tumor
tertentu (23) . Dengan demikian, heterogenitas antigenik dari tumor mungkin
menjelaskan beberapa perbedaan dalam respons yang ditunjukkan oleh masing-
masing pasien terhadap terapi blokade pos pemeriksaan. Individu yang
mengembangkan respons yang tahan lama untuk memeriksa blokade titik
mungkin mereka yang tumornya mempertahankan antigenisitas yang cukup untuk
membuatnya sensitif terhadap fungsi kekebalan yang meningkat yang menyertai
imunoterapi kanker, meskipun tidak dikendalikan oleh respons imun antitumor
yang terjadi secara alami.

Peran Neoantigen Dalam Imunoterapi Kanker

Secara teori, dua faktor harus menentukan kepentingan relatif neoantigen

dan self-antigen nonmutated dalam efek imunoterapi kanker seperti blokade check
point dan terapi TIL: pertama, frekuensi respon sel T terhadap dua kelas antigen
terjadi; kedua, potensi relatif dari respon sel T yang spesifik untuk dua kelas
antigen. Penelitian terbaru dalam model tikus menggunakan kanker yang
diinduksi karsinogen yang dapat ditransplantasikan telah menunjukkan bahwa
blokade pos pemeriksaan mengubah kualitas respon sel T intratumoral spesifik-
neoantigen (sebagaimana tercermin oleh perubahan umum dan khusus pengobatan
dalam ekspresi gen dalam CD8 + TIL yang diisolasi dari tumor). mencit yang
diobati dengan antibodi terhadap CTLA-4 dan / atau PD-1) dan besarnya respon
sel T ini (terlihat dengan CTLA-4 atau kombinasi CTLA-4 / PD-1blockade tetapi
tidak dengan blokade PD-1 saja) (15 ). Karena neoantigen yang diidentifikasi
dalam model ini berfungsi sebagai antigen penolakan kanker, data ini memberikan
bukti kuat bahwa blokade pos pemeriksaan bertindak setidaknya sebagian melalui
reaktivitas sel T spesifik-neoantigen dalam pengaturan ini. Namun, dalam kasus
melanoma manusia, di mana tumor auto chthonous mungkin bersentuhan dengan
sistem kekebalan tubuh selama bertahun-tahun, situasinya lebih rumit. Seperti
dibahas di atas, reaktivitas sel T terhadap neoantigen umum terjadi pada
melanoma. Lebih jauh lagi, sebuah laporan kasus telah menunjukkan bahwa
reaktivitas seperti itu dapat dibiayai dengan pengobatan anti-CTLA-4 (13).
Namun, reaktivitas sel T terhadap antigen bersama yang tidak dipetakan juga
diamati pada sebagian besar pasien melanoma, dan perluasan sel T ini respon
telah didokumentasikan setelah terapi TIL dan pengobatan anti-CTLA-4 (36,37).
Jadi, meskipun data murine menunjukkan bahwa reaktivitas sel T
neoantigenspesifik dapat menjadi penting untuk efek blokade pos pemeriksaan,
data manusia saat ini hanya konsisten dengan kemungkinan ini.

Apa data lain yang tersedia sehubungan dengan masalah ini? Jika
pengakuan neoantigen adalah komponen penting dari imunoterapi kanker, orang
akan mengharapkan tipe tumor dengan jumlah mutasi yang tinggi akan ditandai
dengan respon sel T yang kuat dan menjadi sangat sensitif terhadap imunoterapi.
Selain itu, juga dalam jenis tumor yang diberikan, tingkat respons harus
berkorelasi dengan beban mutasi. Bukti untuk peran neoantigen dalam mendorong
kekuatan respon sel T intratumoral disediakan oleh pengamatan bahwa
keberadaan sel T CD8 + dalam lesi kanker, sebagaimana dibacakan menggunakan
data pengurutan RNA, lebih tinggi pada tumor dengan beban mutasi tinggi ( 38).
Selain itu, analisis ekstensif oleh Hacohen dan rekannya telah menunjukkan
bahwa tingkat transkrip yang terkait dengan aktivitas sitolitik sel pembunuh alami
dan sel T berkorelasi dengan beban mutasi dalam serangkaian besar tumor
manusia (35). Sehubungan dengan efek imunoterapi pada tumor dengan beban
mutasi yang berbeda, pada pasien kanker paru non-sel kecil yang diobati dengan
anti-PD-1, beban mutasional menunjukkan korelasi yang kuat dengan respon
klinis (22). Demikian juga, pada pasien melanoma yang diobati dengan
ipilimumab, antibodi terhadap CTLA-4, manfaat jangka panjang juga terkait
dengan beban mutasi yang lebih tinggi, meskipun efeknya tampak kurang
mendalam pada pengaturan ini (39). Pengamatan yang mencolok dalam penelitian
terakhir adalah bahwa neoantigen pengikat MHC yang diprediksi pada pasien
dengan manfaat klinis jangka panjang diperkaya untuk serangkaian besar motif
tetrapeptida yang tidak ditemukan pada tumor pasien tanpa atau tanpa manfaat
klinis minimal. Interpretasi yang menarik dari data ini adalah bahwa respons sel T
spesifik-neoantigen lebih disukai diarahkan pada sekumpulan urutan mutan,
sesuatu yang dapat memfasilitasi identifikasi bioinformatik dari neoantigen untuk
penargetan terapeutik. penelitian tidak menunjukkan bias mendalam terhadap
tanda tangan tetrapeptida ini yang akan diprediksi jika peran mereka penting
dalam respons sel T spesifik tumor (40), dan kemungkinan motif tetrapeptida
yang diidentifikasi memainkan peran yang berbeda.

Akan bermanfaat untuk memperluas analisis penentu genom kepekaan sel

tumor terhadap terapi immuno kanker pada keganasan lainnya. Namun, karena
sifat probabilistik dari generasi neoantigen, beban mutasi akan dengan sendirinya
selalu tetap menjadi biomarker yang tidak sempurna, bahkan dalam situasi di
mana reaktivitas neoantigen adalah satu-satunya reaktivitas sel T khusus tumor
yang relevan dengan kontrol tumor. Selain itu, pembentukan antigen spesifik
tumor hanya satu dari sejumlah kondisi penting untuk keberhasilan serangan
kekebalan pada sel kanker, sebuah konsep yang dijelaskan dengan baik oleh siklus
kekebalan kanker yang diperkenalkan oleh Chenand Mellman (41). Sebagai
contoh, aktivasi genetik pada sub unit mikroglobulin b2 dari molekul MHC kelas
I adalah peristiwa yang relatif sering terjadi pada beberapa jenis tumor (42).
Selain itu, analisis terbaru dari perubahan genetik yang hadir pada tumor dengan
aktivitas kekebalan yang tinggi memberikan bukti untuk serangkaian mekanisme
pelarian lainnya (35). Dalam kasus-kasus seperti itu, di mana siklus kekebalan-
kanker terganggu di tempat lain, jumlah neoantigen yang dihasilkan kemungkinan
masih banyak yang tidak relevan. Karena saling ketergantungan dari fase-fase
berbeda dari siklus kekebalan-kanker ini, penggunaan gabungan dari sistem
pengujian yang melaporkan fase-fase yang berbeda ini tampaknya diperlukan.
 Data yang paling langsung tentang relevansi sel T spesifik-neoantigen
dalam kontrol tumor manusia berasal dari sejumlah kecil studi klinis yang
melibatkan infus populasi sel T yang ditentukan atau infus TCR-
transducedTellell. Yang menggembirakan, laporan kasus baru-baru ini
menunjukkan regresi karsinoma kolangio metastatik dengan infus produk sel T
CD4 + yang sangat diperkaya untuk reaktivitas terhadap MHC kelas II-neoantigen
terbatas (18). Dikombinasikan dengan pengamatan bahwa, paling tidak dalam
melanoma, pengenalan CD4 + Tcell terhadap neoantigen adalah kejadian yang
sering terjadi (16), data ini menggarisbawahi relevansi klinis potensial dari
neoantigen yang dibatasi MHC kelas II. Perbandingan efek klinis terapi TIL
dengan sel T yang dimodifikasi dengan TCR yang mengenali antigen bersama
yang berbeda juga dapat dianggap informatif. Infus sel T yang dimodifikasi
denganTCRdirekadimenujuuntukmenegaskan 100 danMART-I antigen
diferensiasi melanosit, kelas antigen self-antigen yang menonjol dalam melanoma,
menunjukkan efek klinis yang relatif sederhana yang disertai dengan toksisitas on-
target substansial terhadap melanosit yang sehat (43). Karena toksisitas ini relatif
jarang dalam terapi TIL, data ini sangat menunjukkan bahwa reaktivitas sel T
terhadap antigen diferensiasi melanosit bukan merupakan pendorong utama
aktivitas antitumor dari terapi ini. Pada saat yang sama, ada data yang
menunjukkan bahwa produk sel T yang ditujukan terhadap NY-eso-1, salah satu
antigen diri non-mutan dari keluarga antigen kanker / germline yang menunjukkan
ekspresi yang sangat terbatas pada jaringan sehat, dapat menampilkan aktivitas
antitumor yang substansial ( 44, 45). Dengan demikian, meskipun data yang
tersedia mendukung gagasan bahwa pengenalan sel T neoantigen berkontribusi
secara substansial terhadap efek terapi imuno yang saat ini digunakan, itu tidak
akan dibenarkan untuk mengabaikan kontribusi potensial tanggapan sel T
terhadap subset antigen nonmutant. Perbandingan langsung dari aktivitas
antitumor sel T neoantigen-spesifik dan self-antigen spesifik yang diperoleh dari
masing-masing pasien akan berguna untuk mengatasi masalah ini lebih lanjut.
 Gambar 4. Strategi untuk menargetkan repertoar neoantigen khusus pasien. (A)
Imunoterapi diberikan dalam kombinasi dengan intervensi seperti radioterapi yang
meningkatkan paparan neoantigen autologus. (B) Potensi neoantigen diidentifikasi
seperti pada Gambar. 1 langkah 1 hingga 3, vaksin khusus pasien diproduksi, dan
vaksin ini diberikan bersama dengan antibodi adjuvant dan pos pemeriksaan
pemblokiran Tcell. (C) Potensi neoantigen diidentifikasi seperti pada Gambar. 1
langkah 1 hingga 3, Tsel yang khusus untuk neoantigen ini diinduksi atau
diperluas secara in vitro, dan produk Tcell yang dihasilkan diberikan bersama
dengan antibodi pemblokiran pos pemeriksaan Tcell.

Penggunaan Terapeutik Khusus Pasien Repertoar Neoantigen

Berdasarkan fakta bahwa, setidaknya pada tumor dengan beban mutasi
tinggi, jumlah kerusakan DNA cukup untuk sistem kekebalan untuk melihat satu
atau beberapa epitop sebagai asing, menjadi menarik untuk merangsang
tanggapan sel T spesifik neoantigen pada pasien kanker. Stimulasi semacam itu
jelas hanya bernilai jika kekuatan respon sel T spesifik-neoantigen merupakan
faktor pembatas dalam pengendalian tumor. Data manusia tentang masalah
penting ini masih kurang. Namun, pada model tikus, vaksinasi dengan neoantigen
didefinisikan telah terbukti menghasilkan peningkatan kontrol tumor (10, 14, 15,
20), memberikan alasan yang cukup untuk pengembangan klinis terapi terarah
neoantigen. Karena sebagian besar kemungkinan neoantigen spesifik untuk
individu yang sedang dirawat (Gbr. 3), pendekatan terapeutik seperti itu akan
dalam kebanyakan kasus memerlukan imunoterapi yang dipersonalisasi yang
mengeksploitasi repertoar antigen dalam sel tumor itu sendiri atau informasi
tentang repertoar itu, sebagaimana diperoleh dengan pengurutan tumor (Gbr. 4).
Sebagai pendekatan pertama, kombinasi antibodi pemblokiran pos pemeriksaan
dengan intervensi terapeutik - seperti radioterapi tumor, virus oncolytic, atau
vaksin sel tumor autologous - yang dapat meningkatkan paparan neoantigen pada
sistem kekebalan berbasis sel T mungkin sinergis (Gambar 4A). ). Kelemahannya,
dibandingkan dengan vaksin yang didefinisikan secara tomolekul tertentu,
neoantigen yang dilepaskan oleh strategi tersebut akan terdilusi oleh
jumlah peptida nonmutant yang juga ada. Selain itu, kontrol atas sinyal jenuh
yang diterima oleh sel penyaji antigen relatif terbatas. Namun demikian, karena
relatif mudahnya pengembangan klinis dari beberapa terapi kombinasi ini,
pengujian ekstensif dari terapi tersebut diperlukan.
Untuk memungkinkan penargetan yang lebih jelas dari repertoar
neoantigen pada tumor manusia, dua pendekatan alternatif harus dipertimbangkan,
pada keduanya. kasus mengandalkan set neoantigen potensial sebagaimana
diidentifikasi dengan mengurutkan bahan tumor (Gbr. 4, B dan C). Pertama,
vaksin sintetis dapat diproduksi yang mengandung atau menyandikan serangkaian
neoantigen yang diprediksi. Meskipun masih jauh berbeda dari model farmasi
klasik, pengembangan klinis dari vaksin yang dipersonalisasi tersebut masih ada
mencapai (46-48). Data model mouse mendukung terjemahan klinis dari
pendekatan ini, dan dua pertanyaan yang paling mendesak tampaknya (i) apakah
kemampuan kami untuk memprediksi neoantigen yang paling relevan sudah
cukup maju dan (ii) bagaimana vaksin seperti itu dapat diberikan. Kedua,
informasi yang diperoleh dari sekuensing tumor dapat digunakan untuk membuat
produk sel T neoantigenspesifik secara in vitro. Ini mungkin melibatkan perluasan
populasi sel T spesifik-neoantigen yang sudah dapat dideteksi dalam jaringan
tumor atau dalam darah atau induksi de novo sel-sel tersebut.
Terlepas dari strategi yang digunakan untuk meningkatkan reaktivitas
sel T spesifik-neoantigen, kemungkinan akan terbukti penting untuk menargetkan
beberapa neoantigen secara bersamaan untuk mencegah tumor melarikan diri
dengan mengedit epitop bermutasi yang bersangkutan (1). Selain itu, mungkin
bijaksana untuk menghindari penargetan mutasi pada produk gen yang dilihat oleh
sistem kekebalan pada penyakit autoimun untuk menghindari induksi atau
eksaserbasi penyakit autoimun terkait kanker (49).
Komentar Penutup
Berdasarkan data yang diperoleh selama beberapa tahun terakhir, masuk akal
bahwa reaktivitas sel T spesifik-neoantigen membentuk "bahan aktif" utama dari
imunoterapi kanker yang berhasil. Dengan kata lain, kerusakan genetik yang pada
satu sisi mengarah pada perkembangan onkogenik juga dapat ditargetkan oleh
sistem kekebalan tubuh untuk mengendalikan keganasan. Berdasarkan temuan ini,
penting untuk merekayasa intervensi terapeutik yang dengannya reaktivitas sel T
spesifik-neoantigen ditingkatkan secara selektif. Karena ekspresi antigen yang
dibatasi oleh tumor yang ditargetkan, imunoterapi kanker yang dipersonalisasi ini
menjanjikan spesifisitas dan keamanan yang tinggi. Dapat dibayangkan,
meningkatkan reaktivitas sel T spesifik-neoantigen yang dapat dicapai dengan
imunoterapi yang dipersonalisasi lebih lanjut akan meningkatkan spektrum
keganasan manusia yang merespons imunoterapi kanker.