GENETIK
HALAMAN SAMPUL
Disusun oleh:
ASRIL MAHADI
NIM : L011191086
Setiap orang mewarisi dua salinan segmen DNA apa pun, satu dari masing-
masing orangtua, dan karenanya dapat membawa 0, 1, atau 2 salinan alel minor pada
SNP tertentu (Fisher, 1941; J. J. Lee & Chow, 2013). Hubungan genotipe-fenotip
yang sebenarnya tentu tidak akan linier secara tepat, tetapi kemiringan garis lurus
yang paling pas adalah sama dengan rata-rata tertimbang dari perubahan fenotipik
berikut dari kemungkinan penggantian gen (Rietveld, Esko , et al., 2014).
Misalnya, SNP yang ditunjuk "rs9320913" terletak di kromosom 6 dan
memiliki dua alel: C (cytosine) dan A (adenine). Itu diidentifikasi dalam studi
asosiasi genome-wide (GWAS) terbaru dari pencapaian pendidikan (Rietveld et al.,
2013). GWAS adalah analisis bebas hipotesis dari kekuatan prediksi masing-masing
sekitar 1 juta (atau lebih) SNP individu yang tersebar di seluruh genom. Tujuan dari
suatu GWAS adalah untuk menemukan SNP mana yang dikaitkan dengan suatu sifat
yang menarik (mis. Pencapaian pendidikan, kecerdasan, extraversion, atau
schizophrenia).
Studi DNA dari lebih dari 36.000 kasus yang didiagnosis dan 113.000 kontrol
sejauh ini telah mengidentifikasi 108 SNP yang terkait dengan skizofrenia pada
ambang batas bukti yang ketat, namun 108 SNP ini secara bersama-sama hanya
menyumbang 3,4% dari varian sifat (diukur pada suatu skala tanggung jawab, dengan
pertanggungjawaban menjadi sifat yang tidak diukur tetapi disimpulkan yang
terdistribusi normal dan harus melebihi ambang batas agar sifat yang diukur - di sini,
diagnosis skizofrenia - terjadi; Ripke et al., 2014).
sebuah teknik baru telah dikembangkan yang menggunakan data GWAS dari
individu yang tidak berhubungan secara nominal untuk memperkirakan suatu tolok
ukur yang bahkan lebih relevan: fraksi total varian dalam suatu sifat yang dapat
diterapkan pada efek rata-rata dari SNPs (JJ Lee & Chow, 2014; SH Lee, Wray,
Goddard, & Visscher, 2011; Speed, Hemani, Johnson, & Balding, 2012; Yang et al.,
2010). Teknik ini disebut genomic-relatedness-matrix limited maximum likelihood
(GREML) .
Pada dasarnya, GREML menentukan apakah kemiripan genetik yang muncul
secara acak antara pasangan individu yang tidak berhubungan memprediksikan
kesamaan fenotipik antara individu-individu tersebut; hubungan yang lebih kuat
antara kesamaan genetik dan fenotipik menyiratkan pengaruh yang lebih besar dari
SNP yang diukur pada sifat yang diinginkan. Yang penting, besarnya pengaruh ini
dapat diperkirakan secara akurat bahkan jika ukuran sampel terlalu kecil untuk
mengidentifikasi semua (atau apa pun) varian terkait pada tingkat kepercayaan yang
tinggi.
Hukum Keempat menyatakan bahwa ini juga berlaku untuk fenotip perilaku.
Karena jumlah varian umum adalah terbatas (walaupun besar), Hukum Keempat
menyarankan pada gilirannya bahwa arsitektur genetik dari fenotip manusia juga
pleiotropik (masing-masing varian mempengaruhi banyak sifat yang berbeda).
1. Ada jenis lain dari varian genetik selain SNP, termasuk penyisipan,
penghapusan, dan pengulangan panjang variabel dari satu atau lebih pasangan
basa atau urutan pendek, tetapi SNP adalah jenis varian yang paling banyak
tersedia dan siap diuji.
2. Dalam ulasan baru-baru ini tentang penelitian genetik tentang kecerdasan,
Plomin dan Deary (2015) merumuskan generalisasi yang serupa: “Hukum
ketiga telah muncul dari penelitian genetika molekuler yang berupaya
mengidentifikasi gen spesifik yang bertanggung jawab atas heritabilitas yang
tersebar luas, terutama genome-wide asosiasi (GWA) studi beberapa tahun
terakhir: Warisan sifat disebabkan oleh banyak gen efek kecil ”(hal. 98-99).
Perhatikan bahwa paralelnya adalah antara "hukum ketiga" Plomin dan Deary
dan apa yang kami sebut "Hukum Genetik Perilaku Keempat."
3. Teknik ini juga kadang-kadang disebut analisis sifat kompleks-genom, atau
GCTA (mis., J. J. Lee & Chow, 2014).
4. Selain itu, ketika hasil studi GWAS dan kandidat-gen dibandingkan secara
langsung, hit GWAS biasanya lebih mungkin untuk ditiru (seperti dalam,
misalnya, studi SNP yang dilaporkan terkait dengan glioma: Walsh et al., 2013)
5. Bukti juga menunjukkan bahwa efek dominasi (bukan efek aditif, yang diukur
oleh GWAS) tidak memperhitungkan banyak heritabilitas (Zhu et al., 2015).
6. Penjelasan ini pertama kali diajukan oleh Lande (1983) untuk menjelaskan,
misalnya, mengapa resistensi pestisida bersifat poligenik pada beberapa
populasi serangga dan tergantung pada varian efek besar pada populasi lain
yang telah terganggu oleh manusia.