Diagnostik Laboratorium

pada COVID 19
July Kumalawati

Departemen Patologi Klinik

Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia
RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo
RS Premier Bintaro

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

Pokok bahasan
• Struktur virion SARS CoV 2
• Genom SARS Co V 2
• Cara penularan
• Gambaran klinis
• Pola deteksi RNA virus pada COVID 19
• Pola serokonversi pada COVID 19
• Jenis-jenis pemeriksaan laboratorium untuk COVID 19
• Alur pemeriksaan antigen dan antibodi pada COVID 19
(usulan PDSPatKLIn)
• Pemeriksaan laboratorium lain
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
Penyebab

• SARS CoV 2 (Severe Acute Respiratory Syndrome

Coronavirus 2)
• Berbentuk sferis
• Genom: satu ss-RNA
• 4 protein structural utama:
• S (spike)
• M (membrane)
• E (envelope)
• N (nucleocapsid)

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

Struktur virion SARS CoV 2

https://asm.org/Articles/2020/January/2019-Novel-
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
Coronavirus-2019-nCoV-Update-Uncoating
Genome SARS CoV 2

ZijieShen, YanXiao, LuKang, WentaiMa, Leisheng Shi, LiZhang, ZhuoZhou, JingYang

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
et al. Genomic diversity of SARS-CoV-2 in Coronavirus Disease 2019 patients
Penularan
• Melalui droplet dan
kontak

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

Gambaran klinis
• Masa inkubasi: 2-14 hari (median: 4-5 hari)

• Gambaran klinis:
• Ringan: batuk, pilek, demam ≥ 38°C, lelah,
• Berat: Ringan + sesak nafas, hipoksia, foto toraks:
pneumonia, CT toraks: ground glass appearance
• Kritis: gagal nafas, syok (renjatan), disfungsi multiorgan

• Tanpa gejala

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

Pola deteksi RNA virus pada
pasien COVID 19

Lirong Zou, Feng Ruan, Mingxing Huang, Lijun Liang, Huitao Huang, Zhongsi Hong, et al. SARS-CoV-2 viral load in
July Kumalawati
upper respiratory specimens of infectedWebinar
patients.PERSI 26 JMaret
N Engl Med; 2020
2020, 382;12. DOI: 10.1056/NEJMc2001737
Pola deteksi RNA virus pada
pasien COVID 19

Lirong Zou, Feng Ruan, Mingxing Huang, Lijun Liang, Huitao Huang, Zhongsi Hong, et al. SARS-CoV-2 viral load in
July Kumalawati
upper respiratory specimens of infectedWebinar
patients.PERSI 26 JMaret
N Engl Med; 2020
2020, 382;12. DOI: 10.1056/NEJMc2001737
Pola deteksi RNA virus dan
serokonversi pada pasien COVID 19

Roman Wölfel, Victor M. Corman, Wolfgang Guggemos, Michael Seilmaier, Sabine Zange, Marcel A. Müller, et al.
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
Virological assessment of hospitalized cases of coronavirus disease 2019. (pre-print)
 Pola berbagai petanda (marker)
infeksi SARS CoV 2

Antibodi SARS CoV 2

Antigen ???? IgG

Antibodi SARS CoV 2

IgM

8-12 hari
4-5 hari
RNA virus

Infeksi Gejala
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
Berbagai jenis pemeriksaan laboratorium
untuk mendeteksi SARS CoV 2
• Deteksi asam nukleat (NAT): PCR
• Mendeteksi gen SARS CoV 2
• N
• E
• S
• RdRP
• ORF

• Bahan pemeriksaan:
• Swab nasofaring &/ orofaring

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

Berbagai jenis pemeriksaan laboratorium
untuk mendeteksi SARS CoV 2
• Deteksi antigen:
• Jenis antigen yg dideteksi ????
• Bahan pemeriksaan:
• Swab nasofaring &/ orofaring

• Deteksi antibodi:
• Jenis antigen yang dipakai????
• Bahan pemeriksaan:
• Darah / serum

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

 Masa deteksi berbagai petanda
(marker) infeksi SARS CoV 2
Antibodi
NAT
Antibodi SARS CoV 2
Antigen ???? IgG

Antibodi SARS CoV 2

IgM

8-12 hari
4-5 hari
RNA virus

Infeksi Gejala
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
Usulan alur pemeriksaan untuk deteksi antigen
dan antibodi SARS CoV 2 dari PDSPatKLIn

Versi
tanggal 21
Maret 2020,
July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020
jam 22.00
 Parameter laboratorium lain pada
penderita COVID 19

W. July
Guan, Z. Ni, Yu Hu, W. Liang, C. Ou, J. He, et al.Webinar
Kumalawati Clinical PERSI
Characteristics
26 Maretof Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J
2020
Med; March 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2002032
 Parameter laboratorium lain pada
penderita COVID 19

W. July
Guan, Z. Ni, Yu Hu, W. Liang, C. Ou, J. He, et al.Webinar
Kumalawati Clinical PERSI
Characteristics
26 Maretof Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J
2020
Med; March 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2002032
Pesan penutup
• COVID 19 adalah penyakit baru, masih banyak penelitian
dibutuhkan, termasuk untuk menentukan parameter
laboratorium yang dibutuhkan untuk menegakkan diagnosis
atau mengetahui status seseorang sebagai pembawa virus atau
bukan

• Reagensia yang dikembangkan juga masih dalam tahap awal,

juga memerlukan banyak penelitian untuk menentukan gen
yang akan dideteksi, bilamana melakukan pemeriksaan antigen
atau antibodi, serta epitope yang dipakai.

• Apapun jenis pemeriksaan yang dipakai dalam menentukan

diagnosis, diperlukan data gambaran klinis selengkapnya

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020

July Kumalawati Webinar PERSI 26 Maret 2020