Mikroba merupakan mahluk hidup yang dapat tumbuh pada lingkungan yang sesuai untuk
pertumbuhannya. Dengan demikian adanya mikroba dapat menyebabkan banyak bahaya karena
kemampuannya dalam menginfeksi tanaman, hewan serta manusia yang berakibat dapat timbul
penyakit ringan atau bahkan menyebabkan kematian. Mikroba juga dapat menyebabkan
kerusakan pada bahan pangan dan produk olahannya ataupun kerusakan lainnya, misalnya
kerusakan kayu, kulit, tekstil dan sebagainya. Bahan pangan atau produk olahan pangan dapat
tercemar oleh mikroba sehingga menimbulkan perubahan-perubahan kimiawi di dalamnya,
akibatnya bahan pangan atau produk olahan pangan menjadi tidak layak dimakan karena telah
rusak atau bahkan mungkin beracun. Namun demikian, terdapat cukup banyak mikroba yang
berperan positif pada pangan yaitu peran mikrob pada proses fermentasi pangan. Oleh karena itu
perlu diketahui pola pertumbuhan mikroba sehingga dapat dilakukan pengendalian terhadap
pertumbuhan mikroba patogen dan mikroba penyebab kerusakan pangan ataupun mikroba yang
berperan pada fermentasi pangan.
A. FASE-FASE PERTUMBUHAN MIKROBA
Dalam mencermati fase-fase pertumbuhan mikroba, maka perlu diketahui beberapa istilah
penting.
Pertumbuhan : berkaitan dengan suatu mikroba, pertumbuhan diartikan sebagai suatu
peningkatan massa atau jumlah sel total (misalnya di dalam suatu biakan) dan bukan dalam hal
ukuran atau kerumitan organisme masing-masing.
Laju Pertumbuhan : pertambahan jumlah sel per satuan waktu.
Generasi : interval untuk pembentukan dua sel yang berasal dari satu sel.
Waktu Generasi : selang waktu yang diperlukan bagi sebuah sel untuk membelah diri. Setiap
mikroba mempunyai waktu generasi yang berbeda.
Pertumbuhan eksponensial : pertambahan jumlah sel secara sangat cepat dengan konstanta
tertentu dalam statu periode waktu, sehingga pertambahan jumlah sel tersebut berdasarkan deret
ukur.
Populasi mikroba dalam kurun waktu tertentu jumlahnya sangat banyak hingga dalam hitungan
juta atau miliar sel. Namun demikian, dengan mengukur pertumbuhan mikroba dalam selang
waktu tertentu pada beberapa titik waktu pengukuran maka dapat diketahui pola pertumbuhan
mikrobanya. Pertumbuhan mikroba meliputi beberapa fase yaitu :
1) fase lag atau fase adaptasi
2) fase log atau fase pertumbuhan eksponensial
3) fase statis, dan
4) fase kematian.
Data pertumbuhan mikroba selanjutnya diplotkan dalam skala aritmatik (dalam satuan log atau
dalam grafik semilog).
Sedangkan yang dimaksud dengan pertumbuhan dalam keadaan kesetimbangan yaitu jika
pertumbuhan mikroba tersebut terjadi secara teratur pada kondisi konstan, sehingga jumlah
pertambahan komponen kimia (hasil metabolisme) juga konstan.
Fase Lag
Jika suatu populasi mikroba diinokulasikan ke dalam medium, maka umumnya tidak segera
terjadi pertumbuhan mikroba, tetapi diperlukan beberapa waktu bagi mikroba untuk beradaptasi
dalam medium tersebut. Fase lag tidak terlihat jika suatu kultur yang dalam pertumbuhan
eksponensial diinokulasikan pada medium yang sama dan dalam kondisi
yang sama. Pengamatan fase lag dapat dilakukan jika populasi mikroba tersebut dipindahkan dari
medium yang kaya nutrisi ke dalam medium yang minim/miskin nutrisi.
Fase Log
Merupakan pertumbuhan mikroba secara teratur dalam interval waktu tertentu, artinya populasi
mikroba bertambah secara teratur menjadi dua kali lipat pada interval waktu tertentu (waktu
generasi) selama inkubasi. Tidak semua spesies mikroba mempunyai waktu generasi yang sama,
ada yang mempunyai waktu generasi beberapa belas menit, sedangkan spesies lainnya selama
beberapa jam. Sebagai contoh, di dalam médium kultur maka waktu generasi Escherichia coli
adalah 15 hingga 20 menit, Salmonella typhi 20 hingga 30 menit sedangkan Mycobacterium
tuberculosis selama 12 hingga 24 jam. Laju pertumbuhan tersebut dipengaruhi oleh kondisi
lingkungan (suhu dan komposisi medium pertumbuhannya) sera karakteristik mikrobanya.
Bakteri tumbuh lebih cepat dibandingkan mikroba eukaryotik lainnya.
Fase Statis
Pertumbuhan mikroba relatif statis pada fase ini, artinya populasi sel-sel hidup relatif constan
atau pertambahan sel yang hidup sebanding dengan pertambahan sel yang mati.
Fase Kematian
Jika mikroba telah melewati fase statis, akhirnya terjadi penurunan populasi sel-sel hidup yang
berarti mikroba memasuki fase kematian.
Perlu dicermati bahwa fase lag, fase log, fase statis maupun fase kematian tidak dapat diterapkan
untuk tiap sel individu tetapi hanya untuk populasi sel mikroba. Waktu generasi mikroba
(misalnya bakteri) dapat
ditentukan dengan pengamatan langsung secara mikroskopis. Namun metode yang lebih praktis
dan umum adalah dengan cara menginokulasi suatu medium dengan bakteri dalam jumlah yang
diketahui, membiarkan bakteri tersebut tumbuh pada kondisi optimum kemudian menentukan
populasinya pada interval waktu tertentu secara berkala. Dengan demikian data yang diperlukan
untuk menghitung waktu generasi bakteri adalah (a) jumlah bakteri pada awalnya di dalam
inokulum, (b) jumlah bakteri pada setiap titik pengamatan pada akhir waktu tertentu, dan (c)
interval waktu.
Jika misalnya satu spesies bakteri mempunyai waktu generasi 30 menit. Jika pada awalnya
terdapat satu sel bakteri, maka 30 menit kemudian terdapat 2 sel bakteri, setelah 1 jam terdapat 4
sel, setelah 2 jam terdapat 16 sel, dan secara teoritis setelah 10 jam akan terdapat 1.048.576 sel
bakteri. Jika populasi awalnya sebanyak 100 sel, maka secara teoritis terdapat 100x1048576 sel,
artinya sebanyak 104.857.600 sel atau sebanyak 108 sel. Dapat dibayangkan jika populasi
awalnya sebanyak lebih dari 10.000 sel. Perla diketahui bahwa pada susu segar/susu mentah
terdapat 105 sel/ml.
B. KINETIKA PERTUMBUHAN
Pertumbuhan mikroba (pada fase eksponensial atau fase log), mengikuti formula :
dX/dt = kX
ln X = ln Xo + k(t)
dimana :
X = jumlah sel pada waktu t
Xo= jumlah sel pada waktu 0
k = konstanta laju pertumbuhan
t = waktu yang diperlukan
Maka antilogaritma : X = Xo ekt
Jika populasi meningkat dua kalinya, maka
X/Xo = 2
X = Xo ekt
X/Xo = ekt
2 = ek(t-gen) t-gen = waktu generasi
k = ln 2/t-gen
k = 0,693/tgen ; Jika 1/tgen = μ
maka : k = 0,693 μ atau μ = k/0,693
Ln X - ln Xo = kt
log X - log Xo = kt/2,303
karena k = 0,693 μ; maka
log X - log Xo = 0,693 μt/2,303
log X - log Xo = 0,301 μt
μ= (log Xt - log Xo)/0,301 t ;
dimana μ = laju pertumbuhan
Sebagai contoh :
Jika pada awalnya terdapat bakteri sebanyak 103 sel/ml, setelah 5 jam inkubasi ternyata terdapat
bakteri sebanyak 107 sel/ml. Tentukan laju pertumbuhan bakteri dan waktu generasinya.
μ = (log Xt - log Xo)/0.301 t
μ= (log 107 - log 103)/0.301 t
Laju pertumbuhan :
μ = 4/(0.301x5) = 2.6578 generasi/jam
Karena μ = 1/g; maka g = 1/μ
Waktu generasi :
g = 1/2.6578 = 0.37625 jam/generasi
C. PENGUKURAN LAJU PERTUMBUHAN
Telah diketahui bahwa istilah pertumbuhan mikroba mengacu pada perubahan dalam populasi
total dan bukannya perubahan dalam suatu individu organisme saja. Selain itu pada kondisi
pertumbuhan seimbang ada suatu pertambahan semua komponen seluler secara teratur. Oleh
sebab itu pertumbuhan dapat ditentukan tidak hanya dengan cara mengukur jumlah sel tetapi
juga dengan mengukur jumlah berbagai komponen selular (DNA, RNA, protein) serta produk-
produk metabolisme tertentu.
Terdapat beberapa teknik laboratorium untuk mengukur pertumbuhan mikroba dengan bantuan
peralatan sederhana misalnya sebuah gelas obyek dengan olesan yang diwarnai serta telah
diketahui volumenya (dikenal sebagai hitungan mikroskopis), cawan Petri berisi media/agar
padat (dikenal sebagai hitungan cawan), secara gravimetri untuk penentuan massa sel hingga
peralatan elektronik modern yang mengukur fotoluminesens senyawa-senyawa yang dihasilkan
oleh beberapa spesies mikroba. Pertumbuhan mikroba tentunya dipengaruhi oleh faktor intrinsik
maupun faktor ekstrinsik.
Faktor-faktor intrinsik yang mempengaruhi pertumbuhan mikroba antara lain :
1. Nutrien
2. pH
3. aktivitas air (water activity)
4. komponen antimikroba
Faktor-faktor ekstrinsik yang mempengaruhi pertumbuhan mikroba antara lain :
1. Suhu
2. Potensial redox
BAB I
PENDAHULUAN
Pertumbuhan mikroba dapat dibedakan antara pertumbuhan masing-masing individu sel dan
pertumbuhan kelompok sel atau pertumbuhan populasi. Pertumbuhan tersebut dapat diukur
secara langsung maupun tidak langsung. Pengukuran langsung akan diperoleh jumlah
keseluruhan mikrobia, baik yang hidup maupun yang mati, sedangkan pengukuran tidak
langsung hanya menghitung mikrobia yang hidup. Pengukuran langsung dilakukan secara
mikroskopis yaitu dengan menghitung jumlah bakteri dalam satuan isi yang sangat kecil. Alat
yang digunakan adalah Petroff-Hauser Chamber atau Haemocytometer. Pengukuran tidak
langsung dapat dilakukan dengan metode plate count, MPN maupun dengan pengukuran
turbiditas dengan menggunakan spektrofotometer.
Kinetika pertumbuhan populasi mikroba dapat dilihat berdasarkan sistem biakannya yaitu pada
biakan sistem tertutup (batch culture) dan biakan sistem terbuka (continous culture). Pada biakan
sistem tertutup, pengamatan pertumbuhan populasi mikrobia dalam waktu yang cukup lama
memberikan gambaran melalui kurva pertumbuhan, terdapat fase-fase pertumbuhan.
Pertumbuhan sel bakteri biasanya mengikuti suatu pola pertumbuhan tertentu berupa kurva
pertumbuhan sigmoid. Fase pertumbuhan dimulai pada fase log, fase eksponensial, fase
stasioner, dan fase kematian.
Sistem biakan terbuka digunakan untuk mempertahankan sel pada fase pertumbuhan
eksponensial. Sistem biakan terbuka mempunyai ciri berupa ukuran populasi dan kecepatan
pertumbuhan dapat diatur pada nilai konstan menggunakan khemostat. Khemostat digunakan
dengan mengatur kecepatan aliran medium dan kadar substrat (nutrien pembatas). Nutrien
pembatas dapat menggunakan sumber C (karbon), sumber N atau faktor tumbuh.
1.2. Tujuan
Penulisan yang membahas tentang tema kinetika pertumbuhan mikrobia bertujuan untuk:
BAB II
ISI
Penumbuhan mikroba dalam sistem batch culture merupakan sistem kultur tertutup
(menggunakan tabung reaksi atau flask) tanpa adanya penambahan medium baru ke dalam
kultur. Mikrobia dalam sistem tertutup mengalami 4 fase pertumbuhan, secara berurutan meliputi
fase lag, fase eksponensial, fase stasioner dan fase kematian. Pertumbuhan mikrobia dalam
sistem tertutup menyebabkan fase eksponensial mikrobia sangat terbatas (Brock, 2012). Tipe
pertumbuhan mikrobia dalam batch culture dapat dilihat pada Gambar 1.
Gambar 1. Kurva Pertumbuhan Populasi Mikroba dalam Batch Culture.
Pada Gambar 1 menggambarkan jumlah berat kering sel mikroba (dalam bentuk log) yang
ditumbuhkan dalam periode inkubasi (waktu) tertentu. Mikroba akan mengalami fase
pertumbuhan populasi berdasarkan laju peningkatan jumlah individu mikroba selama waktu
tertentu (Scragg, 1988).
a. Fase Lag
Fase lag merupakan waktu yang dibutuhkan mikrobia untuk tumbuh beradaptasi di dalam
medium baru. Adaptasi mikrobia dilakukan untuk mensintesis enzim-enzim yang dibutuhkan
untuk pertumbuhan lebih lanjut. Pada fase lag terjadi pertambahan massa dan volume sel
mikrobia. Panjang atau pendeknya interval fase lag tergantung pada jenis inokulum mikrobia,
medium yang sedikit nutrisi dan kondisi pertumbuhan mikrobia saat diinokulasikan.
1. Inokulum hidup yang digunakan berasal dari kultur medium lama (saat mikrobia dalam
fase stasioner) dipindahkan ke dalam komposisi medium baru yang sama. Keadaan
mikrobia kembali ke fase lag karena mikrobia sudah tidak memiliki metabolit penting
untuk menunjang kehidupannya. Oleh karena itu, mikrobia membutuhkan rentang waktu
untuk melakukan biosintesis kembali. Mikrobia yang diinokulasikan mengalami
kerusakan sel (tidak mati) akibat perubahan suhu, radiasi atau bahan kimia toxic. Fase lag
dibutuhkan mikrobia untuk memperbaiki kerusakan sel nya.
2. Populasi mikrobia yang diinokulasikan berasal dari medium kaya nutrisi dipindahkan ke
dalam medium yang sedikit nutrisinya. Mikrobia membutuhkan waktu untuk
menghasilkan enzim baru yang digunakan untuk mensintesis metabolit essensial.
3. Populasi mikrobia tidak akan mengalami fase lag jika inokulum yang digunakan berasal
dari populasi mikrobia yang mengalami pertumbuhan fase eksponensial dan
ditumbuhakan pada kondisi medium yang sama (Brock, 2012).
b. Fase Eksponensial
Pada fase eksponensial, populasi mikrobia mengalami pembelahan paling tinggi dan konstan
dalam waktu generasi yang pendek. Waktu generasi mikrobia merupakan waktu yang dibutuhkan
sel mikrobia untuk membelah menjadi 2 sel. Setiap sel mikrobia akan membelah 2x lipat
sehingga peningkatan jumlah populasi selalu 2n, n adalah jumlah generasi. Pertambahan jumlah
sel dalam populasi disebut sebagai pertumbuhan mikrobia.
Pada fase eksponensial, awalnya sel mikrobia membelah secara pelan kemudian penambahannya
semakin meningkat cepat. Secara matematis memiliki rumus:
Nt = N02n (1)
Berikut contoh pertambahan populasi mikrobia yang dapat di lihat pada Gambar 2.
menggunakan rumus tersebut maka dapat di cari nilai n. Waktu generasi (g) pada pertumbuhan
ekponensial diperoleh dari:
g = t/n (3)
Rerata pertumbuhan dalam batch culture dapat dinyatakan dalam bentuk konstanta kecepatan
pertumbuhan rerata (k).
k = n/t
k = log Nt – log N0
——————-
0.301(t)
k = 1/g (4)
g = 1/k (5)
(waktu generasi berbanding terbalik dengan kecepatan pertumbuhan rerata) (Prescott, 1999).
Rata-rata kecepatan pertumbuhan pada fase eksponensial sangat dipengaruhi oleh kondisi
lingkungan (seperti nutrisi, kondisi inkubasi), seperti halnya karakteristik genetik suatu mikrobia.
Pada umumnya, prokariot lebih cepat tumbuh daripada eukariot dan eukariot yang berukuran
kecil lebih cepat tumbuh daripada yang ukurannya lebih besar. Hal ini karena sel yang berukuran
kecil memiliki kapasitas penyerapan nutrisi dan pembuangan sisa metabolisme lebih besar
daripada sel yang berukuran besar. Kondisi tersebut mempercepat proses metabolisme yang akan
mempengaruhi kecepatan pertumbuhan mikrobia. Pertumbuhan yang lebih cepat pada prokariot
(bakteri) menyebabkan waktu generasinya lebih pendek dibandingkan eukariot (Brock, 2012).
Biomassa sel mikrobia dapat dihitung melalui konstanta kecepatan pertumbuhan spesifik (µ),
berikut:
dX / dt = µX (1)
dt : perubahan waktu
Xt / t = µX0
µ (t) = Xt / X0
µ = (ln Xt – ln X0) / t
µ(t) = ln Xt – ln X0
Xt / X0 = e µt
2 = e µt
ln 2 = ln e µt
0,693 = µt (t=g)
0,693 = µg (5)
0,693 = µ (1/k)
µ = 0,693 k (6)
μ dan k, keduanya menggambarkan proses pertumbuhan yang sama dari peningkatan populasi
secara eksponensial. Perbedaannya μ merupakan konstanta kecepatan pertumbuhan yang
digunakan untuk memperkirakan kecepatan pertumbuhan populasi dari masing-masing aktivitas
sel individual dan dapat digunakan untuk mengetahui dinamika pertumbuhan secara teoritis,
sedang k adalah nilai rata-rata populasi pada periode waktu terbatas, yang menggambarkan
asumsi rata-rata pertumbuhan populasi.
c. Fase Stasioner
Mikrobia mengalami pertumbuhan yang terbatas dan konstan selama fase stasioner. Pada fase
stasioner, pembelahan sel yang terjadi sangat lambat. Jumlah pembelahan sel dengan sel yang
mati seimbang, sehingga jumlah sel relatif konstan (pertumbuhan 0). Pertambahan jumlah sel
yang sebanding dengan kematian sel disebut dengan fenomena pertumbuhan kriptik.
Pada fase ini, sel mikroba tetap aktif melakukan metabolisme energi dan proses biosintesis
lainnya. Metabolit sekunder banyak dihasilkan mikrobia pada fase ini. Fase stasioner terjadi
karena beberapa alasan yaitu:
4. Fase Kematian
Fase kematian terjadi jika terjadi perubahan lingkungan menjadi tidak menguntungkan, seperti
berkurangnya nutrisi essensial dalam medium dan meningkatnya akumulasi zat toksik dalam
medium. Grafik fase kematian seperti grafik fase eksponensial yaitu logaritmik (kematian sel
tiap jam adalah konstan). Sel mikrobia yang mati akan mengalami lisis (Prescott, 1999).
D = F/V
Keterangan:
F : Laju aliran
V : Volume
D : Laju dilusi
Dengan menggunakan continuous culture, sel mikroba atau produk metabolitnya dapat dipanen
secara kontinyu. Continuous culture cocok untuk diterapkan pada sistem produksi metabolit sel
mikroba yang tidak berpengaruh pada pertumbuhan selnya itu sendiri. Untuk industri
bioteknologi berkapasitas besar, continuous culture menghasilkan efisiensi produksi yang lebih
tinggi dibandingkan dengan batch culture asalkan produk yang dihasilkan tidak berpengaruh
negatif terhadap mikroba penghasilnya.
Gambar 3. Teknik continuous culture.
Continuous culture memiliki beberapa kelebihan sebagai berikut:
1. Produktivitas lebih tinggi, disebabkan lebih sedikit waktu persiapan bioreaktor persatuan
produk yang dihasilkan, laju pertumbuhan & konsentrasi sel dapat dikontrol, pemasokan
oksigen dan pembuangan panas dapat diatur, dengan demikian hanya butuh pabrik lebih
kecil (pengurangan biaya modal untuk fasilitas baru).
2. Dapat dijalankan pada waktu yang lama.
3. Cocok untuk proses yang kontaminasinya rendah dan produk yang berasosiasi dengan
pertumbuhan.
4. Pemantauan dan pengendalian proses lebih sederhana.
5. Tidak ada akumulasi produk yang menghambat.
Kekurangannnya antara lain: aliran umpan yang lama, resiko kontaminasi besar (operasi harus
hati-hati & desain peralatan lebih baik), peralatan untuk operasi dan pengendalian proses harus
biasa tetap bekerja baik untuk waktu yang lama, memerlukan mikroba dengan kestabilan genetik
tinggi, karena akan digunakan pada waktu yang lama (Irianto, 2007).
Pemberian nutrient secara kontinyu dan untuk mempertahankan keadaan steady state dalam
teknik kultivasi ini dapat dilakukan dengan dua macam cara, yaitu: khemostat dan turbidostat.
a. Khemostat
Dengan sistem ini, sel seolah-olah dibuat dalam keadaan setengah kelaparan, dengan nutrien
pembatas. Kadar nutrien yang rendah menyebabkan kecepatan pertumbuhan berbanding lurus
dengan kadar nutrien atau substrat tersebut.
Sifat-sifat kemostat dan pertumbuhan steady-state dapat ditunjukkan dengan sejumlah rumus
yang berhubungan dengan jumlah sel dan konsentrasi nutrien pembatas terhadap laju alir suplai
medium sebagai faktor yang beroperasi secara independen. Hal ini dilakukan dengan menjaga
keseimbangan materi dan pembatasan substrat dalam bioreaktor (Scragg, 1988).
Keterangan :
dimana F/V diistalahkan sebagai laju dilusi, D, yang merupakan jumlah volume kultur yang
melewati reaktor setiap jam, sehingga persamaannya dapat ditulis ulang sebagai berikut:
Monod adalah orang pertama yang mengkaji pengaruh konsentrasi substrat tehadap laju
pertumbuhan. Beliau menemukan bahwa ketika medium segar, yang mengandung glukosa
sebagai sumber karbon sekaligus sebagai sumber energi dan dengan semua nutrien yang
terkandung di dalamnya, diinokulasikan, siklus pertumbuhan kembali berjalan.
Hubungan antara laju pertumbuhan spesifik (μ) dan konsentrasi substrat (S) dapat digambarkan
dengan kurva (Gambar 4) yang mirip demgam yang penggambaran kinetika enzim model
Michaelis-Menten. Monod mengajukan suatu aturan yang dikenal sebagai rumus Monod, untuk
menggambarkan kurva tersebut.
μmax : kecepatan pertumbuhan pada keadaan nutrien berlebihan
Perpotongan antara 1/µ dengan 1/S menghasilkan garis lurus dengan slope Ks/µm, menangkap
titik absis dari -1/Ks dan ordinat µm (Gambar 5).
Biomassa (Yx/s)dan hasil produk (Yp/s) merupakan parameter yang penting selama keduanya
menunjukkan efesiensi penggunaan substrat dalam biomassa dan produk. Keduanya ditetapkan
sebagai berat biomassa dan berat produk yang dibentuk per unit dari substrat yang digunakan.
dan
dimana:
Yx : berat biomassa sel
Yp : berat produk
Teknik kultivasi dengan sistem turbidostat dilakukan dengan menambahkan nutrient secara
kontinyu sehingga kerapatan sel selalu dalam keadaan tetap. Dalam teknik turbidostat, aliran
medium diatur berdasarkan atas kerapatan optik kultur mikrobia. Pertumbuhan konsentrasi sel
dipertahankan konstan dengan cara memonitor kekeruhan kultur.
Sistem ini didasarkan pada kerapatan bakteri tertentu atau kekeruhan tertentu yang dipertahankan
konstan. Ada perbedaan mendasar antara biak statik klasik dengan biak sinambung dalam
kemostat biak static arus dilihat sebagai sistem tertutup (boleh disamakan dengan organisme sial,
tahap stationer dan tahap kematian. Kalau pada biak sinambung merupakan sistem terbuka yang
mengupayakan keseimbangan aliran untuk organisme selalu terdapat kondisi lingkungan yang
sama.
Dalam pertumbuhan sinkron akan terjadi sinkronisasi pembelahan sel. Hal ini dimaksudkan agar
proses metabolisme siklus pembelahan bakteri dapat dipelajari diperlukan suspensi sel yang
mengalami pembelahan sel dalam waktu sama yaitu sinkron. Sinkronisasi populasi sel dapat
dicapai dengan berbagai tindakan buatan antara lain dengan merubah suhu rangsangan cahaya,
pembatasan nutrien atau menyaring untuk memperoleh sel-sel yang sama ukurannya.
Sinkronisasi pertumbuhan ini juga dimaksudkan untuk menyediakan stater dengan usia yang
sama (Budiyanto, 2005).
Ada beberapa cara perhitungan secara langsung, antara lain adalah dengan membuat preparat
dari suatu bahan (preparat sederhana diwarnai atau tidak diwarnai) dan penggunaan ruang hitung
(counting chamber). Enumerasi mikroba dapat dilakukan secara langsung yaitu dengan
menghitung jumlahnya tanpa ditumbuhkan terlebih dahulu dalam suatu medium, dalam teknik
ini semua sel mikroba baik yang hidup maupun yang mati akan terhitung. Untuk melakukan
renumerasi mikroba dalam suatu bahan seringkali diperlukan pengenceran bertingkat.
Pada metode ini tidak dibedakan sel yang hidup dan sel mati. Penghitungan dilakukan secara
langsung pada setiap bidang pandang mikroskop. Sampel berupa cairan disebar (kira-kira 0,01
mL) pada microscope slide. Setelah dilakukan pewarnaan kemudian dilakukan penghitungan
pada setiap bidang pandang mikroskop.
Penghitungan secara langsung dapat dilakukan secara mikroskopis yaitu dengan menghitung
jumlah bakteri dalam satuan isi yang sangat kecil. Alat yang digunakan adalah Petroff-Hauser
Chamber atau Haemocytometer. Jumlah cairan yang terdapat antara coverglass dan alat ini
mempunyai volume tertentu sehingga satuan isi yang terdapat dalam satu bujur sangkar juga
tertentu. Dengan membuat preparat dari Suatu bahan (preparat sederhana diwarnai atau tidak
diwarnai) dan penggunaan ruang hitung (counting chamber).
Ruang hitung terdiri dari 9 kotak besar dengan luas 1 mm². Satu kotak besar di tengah, dibagi
menjadi 25 kotak sedang dengan panjang 0,2 mm. Satu kotak sedang dibagi lagi menjadi 16
kotak kecil. Dengan demikian satu kotak besar tersebut berisi 400 kotak kecil. Tebal dari ruang
hitung ini adalah 0,1 mm. Sel nakteri yang tersuspensi akan memenuhi volume ruang hitung
tersebut sehingga jumlah bakteri per satuan volume dapat diketahui.
Perhitungan cara tidak langsung hanya untuk mengetahui jumlah mikroorganisme pada suatu
bahan yang masih hidup saja (viable count). Metode perhitungan secara tidak langsung yang
didasarkan pada anggapan bahwa setiap sel yang dapat hidup akan berkembang menjadi satu
koloni yang merupakan suatu indeks bagi jumlah organisme yang dapat hidup yang terdapat
pada sampel. Cara ini adalah cara yang paling umum digunakan untuk menentukan jumlah
mikroba yang masih hidup, berdasarkan jumlah koloni yang tumbuh. Teknik ini diawali dengan
pengenceran sampel secara seri, dengan kelipatan 1 : 10. Masing-masing suspensi pengenceran
ditanam dengan metode tuang (pour plate) atau sebar (spread plate). Bakteri akan bereproduksi
pada medium agar dan membentuk koloni setelah 18-24 jam inkubasi. Untuk menghitung jumlah
koloni dalam cawan petri dapat digunakan alat ’colony counter’ yang biasanya dilengkapi
dengan pencatat elektronik.
Metode sebar (spread plate) merupakan metode penghitungan mikrobia pada medium padat.
Dalam metode spread plate ini, volume kultur yang disebar tidak lebih dari 0,1 ml pada agar
plate dan diratakan menggunakan alat yang disebut glass spreader. Kemudian plate diinkubasi
sampai terlihat koloni sehingga jumlah koloni mikrobia dapat dihitung. Walaupun mikrobia
tertanam dalam agar plate, namun hasilnya sama dengan metode pour plate.
Gambar 10. Keuntungan menggunakan metode spread plate daripada metode pour plate adalah
kultur tidak pernah terpapar suhu 450 oC (suhu melelehnya agar).
b). Pour plate method
Metode pour plate adalah metode agar cair yang digunakan untuk inokulasi dalam petri dish.
Volume kultur yang biasa digunakan 0,1-1,0 ml. Kultur mikrobia dimasukkan ke dalam petri
dish menggunakan pipet steril, kemudian medium agar yang telah dilelehkan (± 45 oC
dituangkan ke dalam petri dish yang telah berisi kultur mikrobia. Selanjutnya dilakukan
pemutaran petri dish agar kultur mikrobia dan medium agar bercampur dengan rata. Koloni
mikrobia akan tumbuh dan tertanam di dalam medium, baik di permukaan atas maupun di
bawah. Sehingga metode pour plate ini cocok untuk menumbuhkan mikrobia anaerob.
MPN adalah suatu metode enumerasi mikroorganisme yang menggunakan data dari hasil
pertumbuhan mikroorganisme pada medium cair spesifik dalam seri tabung yang ditanam dari
sampel padat atau cair yang ditanam berdasarkan jumlah sampel atau diencerkan menurut tingkat
seri tabungnya sehingga dihasilkan kisaran jumlah mikroorganisme yang diuji dalam nilai
MPN/satuan volume atau massa sampel.
Prinsip utama metode ini adalah mengencerkan sampel sampai tingkat tertentu sehingga
didapatkan konsentrasi mikroorganisme yang pas/sesuai dan jika ditanam dalam tabung
menghasilkaan frekuensi pertumbuhan tabung positif “kadang-kadang tetapi tidak selalu”.
Semakin besar jumlah sampel yang dimasukkan (semakin rendah pengenceran yang dilakukan)
maka semakin “sering” tabung positif yang muncul. Semakin kecil jumlah sampel yang
dimasukkan (semakin tinggi pengenceran yang dilakukan) maka semakin “jarang” tabung positif
yang muncul. Jumlah sampel/pengenceran yang baik adalah yang menghasilkan tabung positif
“kadang-kadang tetapi tidak selalu”. Semua tabung positif yang dihasilkan sangat tergantung
dengan probabilitas sel yang terambil oleh pipet saat memasukkannya ke dalam media. Oleh
karena itu homogenisasi sangat mempengaruhi metode ini. Frekuensi positif (ya) atau negatif
(tidak) ini menggambarkan konsentrasi mikroorganisme pada sampel sebelum diencerkan.
Pertumbuhan dan aktivitas mikrobia dipengaruhi oleh beberapa faktor lingkungan. Faktor-faktor
tersebut dapat menjadi pembatas bagi kebutuhan hidup mikrobia. Jika mikrobia berada di
lingkungan yang sesuai, maka pertumbuhannya juga optimum. Beberapa golongan mikrobia
sangat sensitif terhadap perubahan lingkungan, sedangkan yang lain resisten terhadap perubahan
tersebut. Faktor-faktor yang mempengaruhi aktivitas mikrobia antara lain sebagai berikut:
a. Suhu
Pertumbuhan mikrobia memerlukan kisaran suhu tertentu. Kisaran suhu pertumbuhan dibagi
menjadi suhu minimum, suhu optimum, dan suhu maksimum. Suhu minimum adalah suhu
terendah tetapi mikrobia masih dapat hidup. Suhu optimum adalah suhu paling baik untuk
pertumbuhan mikrobia. Suhu maksimum adalah suhu tertinggi untuk kehidupan mikrobia.
Kelompok ini mempunyai suhu minimum 40 oC optimum pada suhu 55-60 oC dan suhu
maksimum untuk pertumbuhannya 75 oC Untuk mikrobia yang tidak tumbuh dibawah suhu
30 oC dan mempunyai suhu pertumbuhan optimum pada 60 oC dikelompokkan kedalam
mikrobia termofil obligat. Untuk mikrobia termofil yang dapat tumbuh dibawah suhu 30 oC
dimasukkan kelompok mikrobia termofil fakultatif. Bakteri yang hidup di dalam tanah dan air,
umumnya bersifat mesofil, tetapi ada juga yang dapat hidup diatas 50 oC (termotoleran). Contoh
bakteri termotoleran adalah Methylococcus capsulatus. Contoh bakteri termofil adalah Bacillus,
Clostridium, Sulfolobus, dan bakteri pereduksi sulfat/sulfur. Bakteri yang hidup di laut (fototrof)
dan bakteri besi (Gallionella) termasuk bakteri psikrofil.
Gambar 12. Suhu pertumbuhan berbagai jenis mikroba.
Apabila mikroba dihadapkan pada suhu tinggi diatas suhu maksimum, akan memberikan
beberapa macam reaksi.
1. Titik kematian thermal, adalah suhu yang dapat memetikan spesies mikrobia dalam
waktu 10 menit pada kondisi tertentu.
2. Waktu kematian thermal, adalah waktu yang diperlukan untuk membunuh suatu spesies
mikrobia pada suatu suhu yang tetap. Faktor-faktor yang mempengaruhi titik kematian
thermal ialah waktu, suhu, kelembaban, spora, umur mikrobia, pH dan komposisi
medium.
2. Suhu rendah
Apabila mikrobia dihadapkan pada suhu rendah dapat menyebabkan gangguan metabolisme.
Skibat-akibatnya adalah :
1. Cold shock, adalah penurunan suhu yang tiba-tiba menyebabkan kematian bakteri,
terutama pada bakteri muda atau pada fase logaritmik,
2. Pembekuan (freezing), adalah rusaknya sel dengan adanya kristal es di dalam air
intraseluler,
3. Lyofilisasi, adalah proses pendinginan dibawah titik beku dalam keadaan vakum secara
bertingkat. Proses ini dapat digunakan untuk mengawetkan mikrobia karena air
protoplasma langsung diuapkan tanpa melalui fase cair (sublimasi).
Setiap mikrobia memerlukan kandungan air bebas tertentu untuk hidupnya, biasanya diukur
dengan parameter aw (water activity) atau kelembaban relatif. Mikrobia umumnya dapat tumbuh
pada aw 0,998-0,6. bakteri umumnya memerlukan aw 0,90-0,999. Mikrobia yang osmotoleran
dapat hidup pada aw terendah (0,6) misalnya khamir Saccharomyces rouxii. Aspergillus glaucus
dan jamur benang lain dapat tumbuh pada aw 0,8. Bakteri umumnya memerlukan aw atau
kelembaban tinggi lebih dari 0,98, tetapi bakteri halofil hanya memerlukan aw 0,75. Mikrobia
yang tahan kekeringan adalah yang dapat membentuk spora, konidia atau dapat membentuk
kista.
c. Tekanan Osmosis
Tekanan osmosis sangat erat hubungannya dengan kandungan air. Apabila mikrobia diletakkan
pada larutan hipertonis, maka selnya akan mengalami plasmolisis, yaitu terkelupasnya membran
sitoplasma dari dinding sel akibat mengkerutnya sitoplasma. Apabila diletakkan pada larutan
hipotonis, maka sel mikrobia akan mengalami plasmoptisa, yaitu pecahnya sel karena cairan
masuk ke dalam sel, sel membengkak dan akhirnya pecah. Berdasarkan tekanan osmosis yang
diperlukan mikrobia dapat dikelompokkan menjadi:
1. Mikrobia Osmofil : tumbuh pada kadar gula tinggi, contoh beberapa jenis khamir,
mampu tumbuh pada larutan gula dengan konsentrasi lebih dari 65 % wt/wt (aw = 0,94).
2. Mikrobia Halodurik : tahan (tidak mati) tetapi tidak dapat tumbuh pada kadar garam
tinggi (30 %).
3. Mikrobia Halofil : dapat tumbuh pada kadar garam yang tinggi, contoh: bakteri yang
termasuk Archaebacterium, misalnya Halobacterium.
d. Buffer
Buffer merupakan campuran garam monobasik dan dibasik, contoh adalah buffer fosfat
anorganik dapat mempertahankan pH diatas 7,2. Cara kerja buffer adalah garam dibasik akan
mengabsorbsi ion H+ dan garam monobasik akan bereaksi dengan ion OH-.
Untuk menumbuhkan mikrobia pada media, memerlukan pH yang konstan, terutama pada
mikrobia yang dapat menghasilkan asam oleh karena itu buffer diperlukan untuk
mempertahankan pH pada kisaran tertentu yang diperlukan untuk pertumbuhan mikroba.
e. Ion-ion lain
Logam berat seperti Hg, Ag, Cu, Au, dan Pb pada kadar rendah dapat bersifat meracuni (toksis)
karena mempunyai daya oligodinamik, yaitu daya bunuh logam berat pada kadar rendah. Ion-ion
lain seperti ion sulfat, tartrat, klorida, nitrat, dan benzoat dapat mengurangi pertumbuhan
mikrobia tertentu dan sering digunakan dalam pengawetan makanan, senyawa lain misalnya
asam benzoat, asam asetat, dan asam sorbat.
f. Listrik
Bila aliran listrik diberikan pada medium tumbuh mikroba akan menyebabkan:
g. Radiasi
h. Tegangan Muka
i. Tekanan Hidrostatik
1. Umumnya tekanan 1 – 400 atm tidak mempengaruhi atau hanya sedikit mempengaruhi
metabolisme dan pertumbuhan mikroba, tekanan hidrostatik yang lebih tinggi akan
menghambat atau menghentikan pertumbuhan, karena dapat menghambat sintesis RNA,
DNA, dan protein, serta mengganggu fungsi transport membran sel maupun mengurangi
aktivitas berbagai macam enzim.
2. Tekanan diatas 100.000 pound/inchi2 menyebabkan denaturasi protein, tetapi ada
mikrobia yang tahan hidup pada tekanan tinggi (mikrobia barotoleran), dan yang tumbuh
optimal pada tekanan tinggi sampai 16.000 pound/inchi2 (mikroba barofilik), umumnya
mikroba laut adalah barofilik atau barotoleran, contoh: bakteri Spirillum.
j. Getaran
Getaran mekanik dapat merusak dinding sel dan membran sel mikroba, dipakai untuk
memperoleh ekstrak sel mikroba dengan cara menggerus sel-sel dengan menggunakan abrasif
atau dengan cara pembekuan kemudian dicairkan berulang kali atau dengan getaran suara 100-
10.000 kali/detik juga dapat digunakan untuk memecah sel mikroba.
Daftar Pustaka :
Adams, M.R. 2000. Food Microbiology. University of Surrey. Guildford. New York
Buckle,K.A., J.A. Davey, M.J. Eyles, A.D. Hocking, K.G. Newton, and E.J. Stuttard. 1989.
Foodborne Microorganisms of Public Health Significance. 4ed.. AIFST (NSW
Branch).Australia.
Madigan, M. T., Martinko, J. M., Stahl, D. A., and Clark, D. P., 2013, Brock Biology of
Microorganisms Thirteenth Edition,