Program yang Harus Dipelajari:

 SSH (Secure Shell Conection)

o Untuk mengontrol perangkat jarak jauh (server)
 Linux (Cygwin)
o Proses data
o Koneksi ke server
 Server
 LAMMPS
o SANDIA. GOV
o Contoh: Lennard Jones
 VMD
o biomolekul
 OVITO
o Material
 BASH
o Shell

Langkah-langkah
1. Struktur molekul
 CIF : Crystal Information File
 Merubah atom Cif ke file lammps dengan atomsk menggunakan perintah: atomsk input.cif
lammps
o Methacrylat acid
o Salmeterol
o Methanol
PDB/Cif/xyz
2. Packmol
3. Ensemble NVT; NPT

Potensial Lennard Jones

Untuk masuk ke server:

SSH shendi@guriang.unpad.ac.id
Password : qbte6n4EP
mkdir/scratch/shendi
ls
cd /scratch/shendi