DNA, RNA

dan Sintesis
Protein
Mengapa kambing selalu melahirkan kambing ?
Mengapa bebek selalu melahirkan bebek ?
Dapatkah monyet melahirkan kucing atau rusa?
Hal ini terjadi karena ada sesuatu Zat yang mengatur, ada
suatu pola atau pesan yang tetap yang tersimpan terus
menerus dan turun temurun. Sehingga orang tua / induk akan
melahirkan generasi yang sama.

Zat tersebut terdapat di seluruh sel didalam tubuh mahluk

hidup, baik itu hewan, manusia, tumbuhan ataupun bakteri.
Zat tersebut adalah Nukleotida atau Asam Nukleat yang ada
dalam RNA (Ribo Nucleic Acid ) dan DNA (Deoksiribo Nucleic
Acid ). Salah satu fungsi Asam Nukleat adalah sebagai agen
penyimpan informasi genetik yang dipertahankan turun
temurun

Sifat yang spesifik atau menonjol dari orang tua/ induk yang
diturunkan kepada anaknya. Contoh : Rambut kriting atau
lurus; mata bulat atau sipit dsb , sifat sifat tersebut dinamakan
factor keturunan.
Dengan perkembangan ilmu, factor keturunan dipelajari
dalam ilmu genetika yang tiada lain berasal dari kata gen
yaitu suatu unit pembawa factor keturunan yang terdapat
pada kromosom dalam inti setiap sel hidup. Gen kini
diketahui adalah DNA.

Asam Nukleat nerupakan biomolekul / polimer yang

mengandung unsur-unsur C, H, O, N dan P, tapi
bukan karbohidrat, bukan protein dan bukan lipida.
Asam Nukleat sering disebut Nuclein
Asam nukleat terdiri dari 3 komponen

1. Basa Nitrogen heterosiklik (Basa N) :

BASA PURIN , terdiri dari ; ADENIN (A) dan GUANIN (G)
BASA PIRIMIDIN, terdiri dari ; URASIL (U), CITOSIN (C) dan TIMIN (T),

2. Karbohidrat Pentosa
β - D-ribose (RNA)
β – D- Deoksiribose (DNA)

3. Asam Fosfat (H3 PO4)

Ketiga komponen tersebut membentuk struktur polimer/biomolekul

Asam Nukleat
 pirimidin

pirin
 DNA (DEOKSIRIBONUCLEI ACID)

Karbohidrat
Pentosa
RNA (RIBONUCLEI ACID)

STRUKTUR DASAR : DNA DAN RNA  RANTAI YANG TERDIRI

ATAS ULANGAN ASAM PHOSPAT, RESIDU
GULA YANG TERIKAT PADA BASA
NITROGEN.

DNA  RESIDU GULA – DEOKSIRIBOSA

RNA  RESIDU GULA – RIBOSA
BASA NITROGEN YANG MEMBENTUK ASAM NUKLEAT :

PURIN  ADENIN (A), GUANIN (G)

PIRIMIDIN  SITOSIN (C), TIMIN (T).

DNA  ADENIN, GUANIN, SITOSIN DAN TIMIN

RNA  ADENIN, GUANIN, SITOSIN DAN URASIL

LAKTAM (BENTUK KETO)  dalam pH cairan tubuh

URASIL

LAKTIM (BENTUK ENOL)

SENYAWA GABUNGAN ANTARA ASAM NUKLEAT DENGAN
PROTEIN  NUKLEOPROTEIN

MOLEKUL ASAM NUKLEAT  POLIMER SEPERTI PROTEIN,

TAPI MONOMERNYA NUKLEOTIDA.
 NUKLEOPROTEIN

PROTEIN ASAM NUKLEAT

NUKLEOTIDA

NUKLEOSIDA ASAM PHOSPAT

BASA PURIN/BASA PENTOSA

PIRIMIDIN
NUKLEOPROTEIN DIHIDROLISIS SEMPURNA AKAN MENGHASILKAN PROTEIN,
ASAM PHOSPAT, BASA PURIN/PIRIMIDIN, PENTOSA

NUKLEOSIDA  BASA PURIN ATAU PIRIMIDIN DENGAN RIBOSA/DEOKSIRIBOSA

IKATAN GLIKOSIDIK MOLEKUL AIR DIHASILKAN DARI ATOM
HIDROGEN PADA N-9 (BASA PURIN) DENGAN GUGUS OH PADA
ATOM C1 DARI PENTOSA

BASA RIBONUKLEOSIDA DEOKSIRIBONUKLEOSIDA

ADENIN ADENOSIN 21-DEOKSIADENOSIN
GUANIN GUANOSIN 21-DEOKSIGUANOSIN
URASIL URIDIN 21-DEOKSIURIDIN
SITOSIN SITIDIN 21-DEOKSISITIDIN
TIMIN TIMIDIN 21-DEOKSITIMIDIN
NUKLEOTIDA

DALAM ALAM NUKLEOSIDA TERUTAMA DALAM BENTUK ESTER

PHOSPAT  NUKLEOTIDA

PADA RIBOSA ADA 3 TEMPAT PHOSPAT DAPAT MEMBENTUK ESTER

YAITU C-21, C-31, DAN C-51

PADA 21-DEOKSIRIBOSA  HANYA 2 TEMPAT UNTUK MEMBENTUK

ESTER PHOSPAT PADA POSISI 31 DAN 51

PALING DOMINAN  GUGUS PHOSPAT PADA POSISI 51 (PALING

BANYAK PADA JARINGAN BIOLOGIS)

NUKLEOTIDA YANG SANGAT PENTING :

ADENOSIN 51-MONOFOSFAT (51-ADENILAT)  AMP,
DERIVATNYA ADENOSIN 51-DIFOSFAT (ADP) DAN
ADENOSIN 51-TRIFOSFAT (ATP)
FUNGSI : PENYIMPANAN DAN PEMANFAATAN ENERGI METABOLISME SEL
(KEMAMPUAN MENERIMA DAN MEMBERI GUGUS FOSFAT)
(DEFOSFORILASI ATP  ADP  AMP)
NUKLEOTIDA  SEBAGAI PEMBAWA BAHAN PEMBENTUK DASAR MOLEKUL
UDP (URIDIN DIFOSFAT BERTUGAS SEBAGAI PEMBAWA
RESIDU GULA UNTUK SINTESIS POLISAKARIDA.

CONTOH :

GLU.URIDIN DIFOSFAT  DONOR RESIDU GLUKOSA UNTUK

PEMBENTUKAN GLIKOGEN
KOLIN SITIDIN DIFOSFAT  SENYAWA DONOR KOLIN UNTUK
BIOSINTESIS FOSFOGLISERIDA YANG
MENGANDUNG KOLIN.

RIBONUKLEOSIDA DEOKSIRIBONUKLEOSIDA
BASA MONO-P DI-P TRI-P MONO-P DI-P TRI-P

ADENIN AMP ADP ATP dAMP dADP dATP

GUANIN GMP GDP GTP dGMP dGDP dGTP
SITOSIN CMP CDP CTP dCMP dCDP dCTP
URASIL UMP UDP UTP dUMP dUDP d UTP

Keterangan: (dAMP)  d deoksiadenosin –monofosfat

 ASAM NUKLEAT

1. DNA :

 TERDIRI ATAS 2 ATAU LEBIH RANTAI POLINUKLEOTIDA YANG

TERSUSUN DALAM STRUKTUR HELIX  ALASAN UTAMA PARA AHLI 
PENGGANDAAN YANG SANGAT TEPAT SESUAI INFORMASI GENETIK

 MOLEKUL DNA BERASAL DARI BERMACAM-MACAM SEL YANG

TERDIRI ATAS 4 UNIT MONONUKLEOTIDA  dAMP, dTMP, DAN dCMP
DAN BEBERAPA DERIVAT BERMETILASI DARI BASA-BASA TERSEBUT

 BOBOT MOLEKUL TINGGI  SUKAR DIISOLASI

2. RNA :

 m RNA
 r RNA (Setiap bentuk RNA memiliki bentuk mol berlainan)
 t RNA

RANTAI TUNGGAL POLIBONUK LEOTIDA  TEK PERLU MEMILIKI PASANGAN

m RNA  MENGANDUNG 4 BASA  A, G, C, DAN U

 DISINTESIS DI NUKLEUS
 m RNA MENGATUR SUSUNAN AA

t RNA  MEMBAWA 1`MOLEKUL AA MASUK KE DALAM RIBOSOM

r RNA  65% DARI BERAT RIBOSOM
FUNGSI  BELUM JELAS, YANG PALING UTAMA SEBAGAI
POLIMER STRUKTURAL YANG MEMEGANG PARTIKEL PROTEIN
 ENDONUKLEASE

ENZIM HIDROLIS ASAM

NUKLEAT

EKSONUKLEASE

ENZIM EKSONUKLEASE  BEKERJA PADA UJUNG POLINUKLEOTIDA

ENZIM ENDONUKLEASE  BEKERJA MEMUTUS SECARA ACAK
JEMBATAN POSPODIESTER DARI RANTAI
POLIPEPTIDA
ENZIM a DAN b  ENZIM EKSONUKLEASE
ENZIM DEOKSIRIBONUKLEASE 1  DARI PANKREAS SAPI
ENZIM DEOKSIRIBONUKLEASE 2  DIISOLASI DARI LIMPA TIKUS DAN
BEBERAPA BAKTERI
HIDROLISIS ASAM NUKLEAT DENGAN ASAM ATAU BASA

1. HIDROLISIS DNA DENGAN ASAM pH DENGAN ASAM 3,6 

MENYEBABKAN PUTUSNYA IKATAN  - GLIKOSIDA ANTARA PURIN
DENGAN DEOKSIRIBOSA, SEDANGKAN IKATAN ANTARA PIRIMIDIN DAN
DEOKSIRIBOSA DAN IKATAN ANTAR UNIT-UNIT MONOLEOTIDA  TIDAK
BERUBAH.

DNA YANG TERTUNDA (TIDAK ADA PURIN)  ASAM APURINAT

CARA-CARA LAIN  ASAM APIRINIDA
DNA TIDAK BISA DIHIDROLISA DENGAN BASA

2. HIDROLISIS RNA  DENGAN BASA  PUTUS IKATAN GUGUS

HIDROKSIL-21 RIBOSA
HIDROLISIS RNA DENGAN NaOH  TERBENTUK CAMPURAN
NUKLEOSIDA FOSFAT 21 DAN 31 DAN SEDIKIT NUKLEOSIDA 21 DAN 31 –
MONOFOSFAT SIKLIK
 PERANAN ASAM NULKEAT DALAM SINTESIS PROTEIN

DNA  MATERI GENETIK YANG BERPERAN DALAM INFORMASI

PEMBENTUKAN PROTEIN

PROSES PEMBENTUKAN PROTEIN ( 3 TAHAP) :

transkripsi translasi
REPLIKASI DNA RNA PROTEIN

m RNA
t RNA
r RNA
REPLIKASI : SATU SETIAP UNTAI GANDA DNA INDUK DICOPY
SECARA PERSIS SESUAI DENGAN PASANGAN
NUKLEOTIDANYA

TRANSKRIPSI : INFORMASI YANG TERDAPAT DI DALAM DNA DISATUKAN

DENGAN PASANGAN BASA MEMBENTUK URUTAN
RIBONUKLEOTIDA YANG SESUAI MENJADI SEBUAH
RANTAI RNA

TRANSLASI : INFORMASI DARI DNA KE m RNA  DITERJEMAHKAN

SEBAGAI PERINTAH UNTUK MEMBUAT POLIMERASI ASAM-
ASAM AMINO YANG TELAH DIPROGRAM  SUSUNAN
PROTEIN TERTENTU
REKAYASA GENETIKA :

PADA ABAD XX ILMU GENETIKA MENGALAMI PERKEMBANGAN PESAT .

PENELITIAN BANYAK DILAKUKAN KHUSUSNYA TENTANG FAKTOR
KETURUNAN
EKSPERIMEN BANYAK DILAKUKAN MENGGUNAKAN E. COLI
PRINSIP REKAYASA GENETIKA : BIOSINTESIS PROTEIN ATAU
POLIPEPTIDA DITENTUKAN OLEH DNA YANG TERDAPAT DALAM
SEL.BILA STRUKTUR DNA DIUBAH MAKA STRUKTUR PROTEIN/
POLIPEPTIDA YANG TERBENTUK AKAN BERUBAH.
HASIL REKAYASA GENETIKA DALAM BIDANG KEDOKTERAN HORMON
INSULIN, HORMON METABOLISME

BIDANG PETERNAKAN HORMON PERTUMBUHAN  REKOMBINAN

INSULIN, REKOMBINAN HORMON PERTUMBUHAN .
 Ribosom merupakan struktur yg berperan sebagai
pabrik sintesis protein. Selama penterjemahan
ribosom menempel dan bergeser sepanjang molekul
mRNA dari ujung 5‘ – 3‘

Butir ribosom terdapat bebas pd sitosol Prokaryota,

sdg pada Eukaryota terdapat bebas di sitosol,
matriks mitokondria, stroma kloroplas atau
menempel pada permukaan sitosol RE. Ribosom
Prokaryota lbh kecil (2.520.000 dalton) dp Eukaryota
(4.220.000 dalton).
Pengamatan terhadap ribosom yg diisolasi dan diwarnai dg
teknik pewarnaan negatif, menunjukkan bhw ribosom terdiri dari
2 bagian yg tidak sama besar. Analisis berdasarkan laju
pengendapan, didapatkan koefisien sedimentasi dg satuan
Swedberg (S)
Koefisien sedimentasi beberapa makromolekul
Ribosom bila berada pada larutan dg kadar Mg++ rendah
(0,2 mM) akan terdisosiasi mjd 2 sub unit yg berbeda
Analisis kimia dari subunit besar ribosom Prokaryota mgd
2 buah molekul rRNA (23S dan 5S) disamping itu tdp 31-34
jenis protein; sub unit kecil hanya mgd sebuah rRNA (16S)
dan 12 jenis protein
Sub unit besar ribosom
Eukaryota mgd 3 buah rRNA
(28S, 5,8S dan 5S) serta 45-
49 jenis protein; sub unit
kecil hanya mgd sebuah
rRNA (18S) dan 33 jenis
protein Komposisi antara ribosom
prokaryota dengan eukaryota
 Komponen ribosom Prokaryota Eukaryota
Ribosoma
Koefisien sedimentasi 70S 80S
BM 280.000 dalton 4.500.000 dalton
Jumlah subunit 2 buah 2 buah
Subunit besar
Koefisien sedimentasi 50S 60S
BM 1.800.000 dalton 3.000.000 dalton
Molekul rRNA
Jumlah 2 3
Ukuran 23S dg 3.000 nukleotida 28S dg 5.000 nukleotida
5S dg 120 nukleotida 5,8S dg 160 nukleotida
Jumlah protein 31-34 45-49
Subunit kecil
Koefisien sedimentasi 30S 40S
BM 1.000.000 dalton 1.500.000 dalton
Molekul rRNA
Jumlah 1 1
Ukuran 16S dg 21 nukleotida 18S dg 2.000 nukleotida
Jumlah protein 21 33
Ribosom terdiri atas molekul protein dan rRNA, yg mensintesis protein
dengan jalan memasangkan antara kodon rRNA dengan antikodon yg
ada di tRNA
Dalam proses sintesis protein, subunit kecil mengikat mRNA dan tRNA,
sedangkan subunit yg besar berperan dalam proses pembentukan ikatan
polipeptida
Lebih dari setengah berat ribosom td rRNA yg memegang peranan utama
dlm kegiatan ribosoma sbg katalisator.
Ribosom memiliki 3 tempat pengikat molekul-molekul RNA:
1 untuk mengikat mRNA dan 2 buah
untuk tRNA (td tempat P: tempat
mengikat molekul tRNA yg
berikatan dg pangkal rantai
polipeptida yg sdng tumbuh dan
tempat A sbg tempat pengikat tRNA
yg masuk, dimuati asam amino)
3 Langkah pemanjangan rantai polipeptida pd ribosom
(1) t-RNA aminoasil terikat di tempat A,
membentuk pasangan basa dg 3
nukleotida yg terpapar di tempat A
(2) Pengikatan gugus karboksil bebas
dari rantai polipeptida tRNA di
tempat P dg asam amino yg terikat
pada tRNA di tempat A dgn
menggunakan katalisator
transferase peptidil yg berasal
dari subunit besar
(3) Perpindahan tRNA peptidil baru
dari tempat A ke tempat P
bersamaan dg bergesernya
ribosom pada mRNA. Akibatnya
tRNA yg semula berada di tempat P
tergeser dari ribosom dan kembali Pergeseran ribosom pd
ke sitosol. proses sintesis protein
1. Tiga diantara 64 kodon pd sebuah
molekul mRNA merupakan kodon
penghenti.
2. Protein sitoplasmik yg disebut protein
pembebas segera terikat pada kodon
penghenti yg mencapai tempat A.
Pengikatan ini mengubah kegiatan
transferase peptidil, dari mengikatkan
asam amino ke tRNA peptidil menjadi
mengikat air.
3. Reaksi ini melepaskan gugus karboksil
rantai polipeptida yg sedang tumbuh
dari ikatannya dg molekul tRNA
4. Rantai polipeptida segera dilepas ke
sitosol, ribosom meninggalkan mRNA Proses berhentinya sintesis
dan segera terurai menjadi subunit protein
besar dan kecil
 Kodon-kodon yg terdapat pd mRNA, dapat
diterjemahkan oleh beberapa buah
ribosoma dg tRNAnya. Penterjemahan ini
berlangsung dg beruntun shg terbentuk
poliribosom

Sintesis protein: proses penerjemahan kodon-kodon mRNA menjadi

polipeptida. Proses ini melibatkan berbagai komponen sel, yang
berperan penting dalam proses ini adalah sandi genetik (kode genetik)
dan dikuatkan oleh molekul tRNA yang berperan sebagai adaptor.

Berbagai molekul tRNA dibedakan satu terhadap lainnya dari susunan

nukleotidanya. Ditinjau dari segi fungsional, setiap tRNA dibedakan oleh
kekhasannya untuk mengikat salah satu asam amino yang terlibat dalam
proses sintesis protein. Contoh : tRNAtir, khusus untuk tirosin, tRNAgli
khusus untuk glisin, dan seterusnya. Terdapat lebih dari sebuah molekul
tRNA untuk sebuah asam amino.
 Setelah asam amino terikat pada bagian aseptor tRNA, molekul
tRNA yg telah memuat asam amino ini, harus menyempurnakan
ikatan antara mRNA dan polipeptida dng jalan mengikatkan ke
penyandi yg tepat. Untuk mengenali penyandi (kodon) ini
merupakan tugas lengan antikodon tepatnya trinukleotida yg
disebut antikodon. Trinukleotida ini merupakan komplemen dari
kodon, oleh karena itu dapat mengikatnya dng pasangan basa.
Proses sintesis protein dibagi menjadi tiga tahap yaitu : pemrakarsaan
(initiation), pemanjangan (elongation) dan penghentian
(termination). Ketiga tahapan ini berlangsung bersinambungan.

Awal proses pemrakarsaan: menempeInya ribosoma subunit kecil ke

molekul mRNA. Ribosoma bila tak terlibat dlm proses sintesis protein, dlm
sitosol selalu terdisosiasi mjd subunit besar & subunit kecil. Menempelnya
ribosoma subunit kecil pada mRNA pd tempat khusus sebelum kodon
pemrakarsa dari gen disalin. Tempat khusus ini disebut tempat pengikat
ribosoma, yg mempunyai urutan misal: 5' - AGGAGIGNU - Y, disebut urutan
Shine-Dalgarno.
Setelah terikat pada tempatnya, ribosoma bergeser ke
arah 3' sampai bertemu dengan kodon AUG. Kodon ini
menjadi kodon pemrakarsa pada proses penerjemahan.

Penerjemahan dimulai bila tRNA yang telah memuat asam

amino berpasangan dengan kodon pemrakarsa yg
terletak di subunit kecil ribosoma. Asam amino yg
terdapat pada tRNA pemrakarsa ini adalah metionin,
karena metionin merupakan asam amino yang disandi
oleh AUG.
Pemanjangan rantai polipeptida

Setelah kompleks pemrakarsa terbentuk,

ribosoma subunit besar menempel pd
subunit kecil. Proses penempelan
memerlukan hidrolisis molekul GTP
terkait pada kompleks pemrakarsaan,
menghasilkan dua tempat berbeda serta
terpisah. (1) tempat peptidil atau tempat P
saat ini ditempati oleh tRNA` yang tetap
berpasangan basa dng kodon
pemrakarsa. (2)Tempat aminoasil atau
tempat A terletak kodon kedua, yg pada
saat ini kosong. Pemanjangan mulai
apabila tRNA yg mengikat asam amino yg
tepat, masuk ke tampat A dan
berpasangan basa dengan kodon kedua.
Kegiatan ini memerlukan faktor
pemanjang (elongation factor) RF-Tu dan
EF-Ts. GTP diperlukan sebagai penghasil
tenaga.
Penerjemahan akan berhenti apabila
kodon penghenti (UAA, UAG, atau UGA)
masuk ke tempat A. Tidak ada molekul
tRNA satupun yang memiliki antikodon
yang dapat berpasangan basa dengan
kodon-kodon penghenti. Sebagai ganti
molekul tRNA, masuklah faktor
pembebas (release factors) RF ke tempat
A. Faktor ini bersarna dng molekul GTP,
melepaskan rantai polipeptida yang telah
usai dibentuk dari tRNA yang terakhir.
Ribosoma terpisah menjadi subunit kecil
dan besar serta kembali ke sitosol untuk
kemudian memulai lagi penerjemahan
baru.