RNA RANTAI perpanjangan dan PENAMBAHAN 5 METIL guanosin CAPS

Setelah polimerase RNA eukariotik telah dibebaskan dari kompleks inisiasi selanjutnya dapat mengkatalis RNA
rantai perpanjangan dengan mekanisme yang sama seperti polimerase RNA dari prokariota. Dan RNA
polimerase bakteri, archaea, dan eukariota memiliki substruktur yang berbeda, fitur utama mereka dan
mekanisme aksi yang cukup mirip.

Struktur kristal dari RNA polimerase II (resolusi 0,28 nm) dari S. cerevisiae ditunjukkan pada sebuah diagram
skematik yang memperlihatkan fitur struktural polimerase RNA dan interaksi dengan DNA dan RNA transkrip .
Awal dari proses perpanjangan, 5 ujung eukariotik pre-mRNA dimodifikasi dengan penambahan 7-methyl
guanosin (7-MG) . 7-MG ini ditambahkan ketika rantai RNA tumbuh hanya sekitar 30 nukleotida panjang. 7-
MG berisi tidak biasa 5-5 trifosfat linkage dan dua atau lebih kelompok metil. 5caps ini ditambahkan co-
transcriptionally oleh jalur biosintesis.

Seperti yang telah diketahui bahwa gen eukariotik yang hadir dalam kromatin diatur dalam nukleosom.
Bagaimana RNA polimerase transkripsi DNA dikemas dalam nukleosom? Apakah nukleosom harus dibongkar
sebelum DNA di dalamnya dapat ditranskripsi? Anehnya, RNA polimerase II mampu bergerak nukleosom masa
lalu dengan bantuan protein kompleks yang disebut FAKTA (memfasilitasi transkripsi kromatin), yang
menghilangkan histone dimer H2A / H2B dari nukleosom meninggalkan histone “hexasomes.” Setelah
polimerase II bergerak melewati nukleosom, FAKTA dan protein aksesori lainnya dapat bantuan redeposit yang
dimer histone, memulihkan struktur nukleosom dan juga didalam kromatin yang berisi gen aktif menjadi
ditranskripsi memiliki struktur kurang kompak dari kromatin yang berisi gen tidak aktif. Kromatin di mana gen
aktif dikemas cenderung mengandung histon dengan banyak kelompok asetil, sedangkan kromatin dengan gen
tidak aktif mengandung histon dengan kelompok asetil lebih sedikit.

PENGHENTIAN DENGAN RANTAI belahan, dan PENAMBAHAN 3 POLY (A) EKOR

Dari 3 ujung transkrip RNA disintesis oleh RNA polimerase II yang diproduksi oleh pembelahan
endonucleolytic dari transkrip primer bukan oleh penghentian transkripsi. Peristiwa terminasi transkripsi yang
sebenarnya sering terjadi di beberapa situs yang terletak 1000-2000 nukleotida hilir dari situs yang akan
menjadi 3 akhir transkrip matang. Artinya, hasil transkripsi di luar situs yang akan menjadi 3 terminal, dan
segmen distal dihapus oleh pembelahan endonucleolytic. Pembelahan acara yang menghasilkan 3 akhir
transkrip biasanya terjadi pada situs 11-30 nukleotida hilir dari sinyal polyadenylation dilestarikan, konsensus
AAUAAA, dan hulu dari urutan GU kaya terletak dekat ujung dari transkrip. Setelah pembelahan, enzim poli
(A) polimerase menambahkan poli (A) ekor, traktat residu monofosfat adenosin sekitar 200 nukleotida panjang,
dengan 3 ujung transkrip. Penambahan poli (A) ekor ke mRNA eukariotik disebut polyadenylation. Untuk
menguji sinyal polyadenylation dari HBB (-globin) gen manusia, dapat memecahkan Pembentukan 3-Terminus
dari RNA Polymerase II Transkrip. Pembentukan poli (A) ekor pada transkrip membutuhkan komponen
spesifisitas yang mengakui dan mengikat untuk urutan AAUAAA, faktor stimulasi yang mengikat ke urutan GU
kaya, endonuklease, dan poli (A) polimerase. Protein ini membentuk kompleks multimerik yang melakukan
kedua belahan dada dan polyadenylation dalam reaksi ketat ditambah. Penambahan poli (A) ekor ke mRNA
eukariotik disebut polyadenylation.

Untuk menguji sinyal polyadenylation dari HBB (-globin) gen manusia, dapat memecahkan Pembentukan 3-
Terminus dari RNA Polymerase II Transkrip. Pembentukan poli (A) ekor pada transkrip membutuhkan
komponen spesifisitas yang mengakui dan mengikat untuk urutan AAUAAA, faktor stimulasi yang mengikat ke
urutan GU kaya, endonuklease, dan poli (A) polimerase. Protein ini membentuk kompleks multimerik yang
melakukan kedua belahan dada dan polyadenylation dalam reaksi ketat ditambah. Penambahan poli (A) ekor ke
mRNA eukariotik disebut polyadenylation. Untuk dapat menguji sinyal polyadenylation dari HBB (-globin) gen
manusia, bisa dilihat dari cara memecahkan Pembentukan 3-Terminus dari RNA Polymerase II Transkrip.
Pembentukan poli (A) ekor pada transkrip membutuhkan komponen spesifisitas yang mengakui dan mengikat
untuk urutan AAUAAA, faktor stimulasi yang mengikat ke urutan GU kaya, endonuklease, dan poli (A)
polimerase. Protein ini membentuk kompleks multimerik yang melakukan kedua belahan dada dan
polyadenylation dalam reaksi ketat ditambah. Pembentukan poli (A) ekor pada transkrip membutuhkan
komponen spesifisitas yang mengakui dan mengikat untuk urutan AAUAAA, faktor stimulasi yang mengikat ke
urutan GU kaya, endonuklease, dan poli (A) polimerase. Protein ini membentuk kompleks multimerik yang
melakukan kedua belahan dada dan polyadenylation dalam reaksi ketat ditambah. Pembentukan poli (A) ekor
pada transkrip membutuhkan komponen spesifisitas yang mengakui dan mengikat untuk urutan AAUAAA,
faktor stimulasi yang mengikat ke urutan GU kaya, endonuklease, dan poli (A) polimerase. Protein ini
membentuk kompleks multimerik yang melakukan kedua belahan dada dan polyadenylation dalam reaksi ketat
ditambah.

Poli (A) ekor mRNA eukariotik meningkatkan stabilitas dan memainkan peran penting dalam transportasi dari
inti ke sitoplasma. Berbeda dengan RNA polimerase II, baik RNA polimerase I dan III merespon sinyal
penghentian diskrit. RNA polimerase I berakhir transkripsi dalam menanggapi urutan 18-nukleotida panjang
yang diakui oleh protein terminator terkait. RNA polimerase III merespon untuk sinyal terminasi yang mirip
dengan terminator rho-independen dalam E. coli.

RNA EDITING: mengubah informasi ISI mRNA MOLEKUL

Menurut dogma sentral biologi molekuler, informasi genetik mengalir dari DNA ke RNA ke protein selama
ekspresi gen. Biasanya, informasi genetik tidak diubah dalam perantara mRNA. Namun, penemuan RNA
editing telah menunjukkan bahwa pengecualian terjadi. proses mengedit RNA mengubah isi informasi dari
transkrip gen dalam dua cara: (1) dengan mengubah struktur dasar individu dan (2) dengan menyisipkan atau
menghapus residu monofosfat uridin. Jenis pertama dari RNA editing, yang menghasilkan substitusi satu dasar
untuk dasar lain, jarang terjadi. Jenis pengeditan ditemukan dalam studi tentang apolipoprotein-B (apo-B) gen
dan mRNA pada kelinci dan manusia. Apolipoprotein adalah protein darah yang jenis transportasi tertentu
molekul lemak dalam sistem peredaran darah. Dalam hati, apo-B mRNA mengkode protein 4563 asam amino
besar panjang. Dalam usus, apo-B mRNA mengarahkan sintesis protein hanya 2153 asam amino panjang. Di
sini, residu C di pra-mRNA diubah menjadi U, menghasilkan kodon UAA terjemahan-terminasi internal, yang
hasil dalam dipotong apolipoprotein.

UAA adalah salah satu dari tiga kodon yang mengakhiri rantai polipeptida selama terjemahan. Jika UAA kodon
diproduksi di wilayah coding dari mRNA, itu prematur akan mengakhiri polipeptida selama terjemahan,
menghasilkan produk gen yang tidak lengkap. C → U konversi dikatalisis oleh protein RNA mengikat urutan
spesifik dengan aktivitas yang menghilangkan amino kelompok dari residu sitosin. Contoh serupa RNA editing
telah didokumentasikan untuk mRNA menentukan protein (glutamat reseptor) hadir dalam sel-sel otak tikus.
Lebih luas mRNA mengedit dari jenis C → U terjadi di mitokondria tanaman, di mana sebagian besar transkrip
gen yang diedit untuk beberapa derajat. Mitokondria memiliki sendiri genom DNA dan sintesis protein 2S
mesin dan dalam beberapa transkrip hadir dalam mitokondria tanaman.
Kedua, jenis yang lebih kompleks RNA editing terjadi dalam mitokondria trypanosomes (kelompok protozoa
flagellated yang menyebabkan penyakit tidur pada manusia). Dalam hal ini, residu monofosfat uridin
dimasukkan ke dalam (kadang-kadang dihapus dari) transkrip gen, menyebabkan perubahan besar dalam
polipeptida ditentukan oleh molekul mRNA. Proses editing RNA ini dimediasi oleh RNA panduan ditranskripsi
dari gen mitokondria yang berbeda. RNA panduan mengandung urutan yang sebagian melengkapi pra-mRNA
yang akan diedit. Memasangkan antara RNA panduan dan hasil pra-mRNA kesenjangan dengan A residu
berpasangan dalam RNA panduan. RNA panduan berfungsi sebagai template untuk mengedit, sebagai U
dimasukkan dalam kesenjangan dalam molekul premRNA sebaliknya A dalam RNA panduan.

Trypanosomes primitif eukariota bersel tunggal yang menyimpang dari eukariota lainnya di awal evolusi.
Beberapa evolusionis berspekulasi bahwa RNA editing umum di sel kuno, di mana banyak reaksi yang diduga
dikatalisasi oleh molekul RNA bukan protein. Pandangan lain adalah bahwa RNA editing adalah mekanisme
primitif untuk mengubah pola ekspresi gen. Untuk alasan apapun, RNA editing memainkan peran utama dalam
ekspresi gen dalam mitokondria trypanosomes dan tanaman.