Efektivitas Vaksin Covid-19 Terhadap Varian B.1.617.

2
(Delta)
Jamie Lopez Bernal, FFPH, Ph.D., Nick Andrews, Ph.D., Charlotte Gower, D.Phil., Eileen Gallagher,
Ph.D., Ruth Simmons, Ph.D.,
Simon Thelwall, Ph.D., Julia Stowe, Ph.D., Elise Tessier, M.Si.,
Natalie Groves, M.Sc., Gavin Dabrera, MB, BS, FFPH, Richard Myers, Ph.D., Colin NJ Campbell,
MPH, FFPH, Gayatri Amirthalingam, MFPH,
Matt Edmunds, M.Sc., Maria Zambon, Ph.D., FRCPath.,
Kevin E. Brown, MRCP, FRCPath., Susan Hopkins, FRCP, FFPH,
Meera Chand, MRCP, FRCPath., dan Mary Ramsay, MB, BS, FFPH

ABSTRAK
LATAR BELAKANG
Varian B.1.617.2 (delta) dari yang parah sindrom pernafasan akut coronavirus 2 (SARS-
CoV-2), virus yang menyebabkan penyakit coronavirus 2019 (Covid-19), memiliki
berkontribusi pada lonjakan kasus di India dan sekarang telah terdeteksi di seluruh
dunia, termasuk peningkatan kasus yang mencolok di Inggris. Efektivitas vaksin
BNT162b2 dan ChAdOx1 nCoV-19 terhadap varian ini belum jelas.
METODE
Kami menggunakan desain kasus-kontrol uji-negatif untuk memperkirakan efektivitas
vaksinasi terhadap penyakit simtomatik yang disebabkan oleh varian delta atau strain
dominan (B.1.1.7, atau varian alfa) selama periode varian delta mulai beredar. Varian
diidentifikasi dengan menggunakan sekuensing dan berdasarkan status gen spike (S). Data
pada semua kasus sekuensing gejala Covid-19 di Inggris digunakan untuk memperkirakan
proporsi kasus dengan salah satu varian ac-sesuai dengan status vaksinasi pasien.
HASIL
Efektivitas setelah satu dosis vaksin (BNT162b2 atau ChAdOx1 nCoV-19) terutama lebih
rendah di antara orang-orang dengan varian delta (30,7%; interval kepercayaan 95% [CI],
25,2 hingga 35,7) dibandingkan dengan mereka yang memiliki varian alfa (48,7%;
95% CI, 45,5 sampai 51.7); hasilnya serupa untuk kedua vaksin. Dengan vaksin
BNT162b2,efektivitas dua dosis adalah 93,7% (95% CI, 91,6 hingga 95,3) di antara
orang-orangdengan varian alfa dan 88,0% (95% CI, 85,3 hingga 90,1) di antara
mereka yang memiliki varian delta. Dengan vaksin ChAdOx1 nCoV-19, efektivitas
dua dosis adalah 74,5% (95% CI, 68,4 hingga 79,4) di antara orang-orang dengan
varian alfa dan 67,0% (95% CI, 61,3 hingga 71,8) di antara mereka yang memiliki
varian delta.
KESIMPULAN
Hanya perbedaan kecil dalam efektivitas vaksin yang dicatat dengan varian delta
dibandingkan dengan varian alfa setelah menerima dua dosis vaksin. Perbedaan mutlak
dalam efektivitas vaksin lebih terlihat setelah penerimaan vaksin pertamadosis.
IniTemuan ini akan mendukung upaya untuk memaksimalkan penyerapan vaksin
dengan dua dosis di antara populasi yang rentan.

INDIA TELAH MENGALAMI LONJAKAN KASUS PENYAKIT CORONAVIRUS 2019 (COVID-

19) SEJAK AKHIR MARET 2021, MENCAPAI LEBIH DARI 400.000 KASUS DAN 4000 KEMATIAN
DILAPORKAN SETIAP HARI PADA AWAL MEI 2021.1 PENINGKATAN INI MENGAKIBATKAN
LAYANAN RUMAH SAKIT MENJADI KEWALAHAN DAN KELANGKAAN PASOKAN OKSIGEN. 2
MESKIPUN HANYA SEBAGIAN KECIL SAMPEL YANG TELAH DIURUTKAN, GARIS KETURUNAN
B.1.617 DARI SINDROM PERNAFASAN AKUT PARAH CORONAVIRUS 2 (SARS-COV-2) TELAH
MENDOMINASI. VARIAN B.1.617.2 (DELTA) PERTAMA KALI TERDETEKSI DI INDIA PADA
DESEMBER 2020 DAN MENJADI VARIAN YANG PALING SERING DILAPORKAN DI NEGARA
TERSEBUT MULAI PERTENGAHAN APRIL 2021.1 PADA 19 MEI 2021, VARIAN TERSEBUT TELAH
TERDETEKSI DI 43 NEGARA DI ENAM BENUA DI GISAID (AWALNYA SINGKATAN DARI
INISIATIF GLOBAL BERBAGI DATA FLU BURUNG TETAPI BARU-BARU INI SEBUAH SITUS UNTUK
MENYUSUN DATA URUTAN VIRUS, dari India dan dengan transmisi komunitas.4 Di Inggris,
vaksinasi adalah ini umumnya diprioritaskan untuk orang dewasa yang lebih tua, pengasuh, dan
pekerja perawatan kesehatan dan sosial, dengan peluncuran untuk orang-orang dalam kelompok
risiko klinis dan kelompok usia yang lebih muda.5 Pada tahap awal peluncuran, keputusan
kebijakan, berdasarkan saran dari Komite Bersama untuk Vaksinasi dan Imunisasi, dibuat
untuk menggunakan interval pemberian yang diperpanjang hingga 12 minggu untuk
memaksimalkan jumlah orang rentan yang menerima dosis pertama selama gelombang kedua
pandemi dalam konteks kendala pasokan dan pengiriman vaksin.6
Vaksin telah ditemukan sangat manjur dalam mencegah penyakit simtomatik, seperti yang
ditunjukkan oleh uji klinis7-9 dan bukti dunia nyata.10-14 Varian B.1.1.7 (alpha), pertama kali
diidentifikasi pada Inggris Raya, adalah garis keturunan yang dominan terlihat antara Januari
dan Mei 2021. Tingkat perlindungan terhadap varian alfa yang diberikan melalui vaksinasi
serupa dengan yang diamati dalam uji klinis, dengan perlindungan tambahan terhadap
penyakit parah.10,11,15-17 Data laboratorium menunjukkan bahwa B .1.351 (beta) varian
telah mengurangi netralisasi, menurut analisis sampel serum yang diperoleh dari orang yang
divaksinasi.18,19 Data pengamatan dari Qatar menunjukkan sedikit mengurangi efektivitas
terhadap gejala- penyakit atik yang disebabkan oleh varian ini tetapi tingkat efektivitasnya tinggi
terhadap penyakit parah, kritis, atau fatal pada orang yang divaksinasi dengan vaksin BNT162b2
(Pfizer–BioNTech).17 Selanjutnya, uji coba vaksin NVX-CoV2373 (Novavax) menunjukkan
kemanjuran 51,0% terhadap varian beta.20 Akhirnya, tingkat netralisasi yang tinggi telah terlihat
dengan varian P.1 (gamma) dalam sampel serum yang diperoleh dari orang yang divaksinasi
dengan vaksin BNT162b2, dan satu penelitian menunjukkan hanya sedikit pengurangan
efektivitas vaksin terhadap kasus-kasus positif dengan satu dosis vaksin messenger
RNA.19,21, 22
Varian delta ditandai dengan mutasi protein lonjakan T19R, 157-158, L452R, T478K, D614G,
P681R, dan D950N.1 Beberapa dari mutasi ini dapat mempengaruhi respon imun yang
diarahkan pada daerah antigenik kunci dari protein pengikat reseptor (452 dan 478) dan
penghapusan bagian dari domain terminal-N.23 P681R berada pada situs pembelahan S1–
S2, dan tampaknya galur dengan mutasi di situs itu mungkin telah meningkatkan replikasi,
yang mengarah ke viral load yang lebih tinggi dan peningkatan transmisi.24 Data tentang
efektivitas vaksin Covid-19 terhadap hasil klinis dengan ini varian telah terbatas. Dalam
penelitian ini, kami bertujuan untuk memperkirakan efektivitas dua vaksin Covid-19,
BNT162b2 dan ChAdOx1 nCoV-19 (AstraZeneca), terhadap penyakit simtomatik yang
disebabkan oleh varian delta.
METODE
Desain Studi
Kami menggunakan dua pendekatan untuk memperkirakan efek vaksinasi pada varian delta.
Pertama, kami menggunakan desain kasus-kontrol uji-negatif untuk memperkirakan efektivitas
vaksin terhadap penyakit simtomatik yang disebabkan oleh varian delta, dibandingkan dengan
varian alfa, selama periode varian delta telah beredar. Pendekatan initelah dijelaskan secara rinci
di tempat lain.10 Singkatnya, kami membandingkan status vaksinasi pada orang dengan
gejala Covid-19 dengan status vaksinasi pada orang yang melaporkan gejala tetapi memiliki
tes negatif. Pendekatan ini membantu mengendalikan bias yang terkait dengan perilaku
mencari kesehatan, akses ke pengujian, dan penetapan kasus. Untuk analisis sekunder, proporsi
orang dengan kasus yang disebabkan oleh varian delta relatif terhadap virus sirkulasi utama
(varian alfa) diperkirakan berdasarkan vaksinasistatus. Asumsi yang mendasarinya adalah
bahwa jika vaksin memiliki beberapa kemanjuran dan sama efektifnya terhadap setiap varian,
proporsi kasus yang serupa dengan varian mana pun akan diharapkan pada orang yang tidak
divaksinasi dan pada orang yang divaksinasi. Sebaliknya, jika vaksin kurang efektif terhadap
varian delta dibandingkan varian alfa, maka varian delta diharapkan membuat proporsi kasus
yang lebih tinggi yang terjadi lebih dari 3 minggu setelah vaksinasi daripada di antara orang
yang tidak divaksinasi. Rincian analisis ini dijelaskan dalam Bagian S1 dalam Lampiran
Tambahan, tersedia dengan teks lengkap artikel ini di NEJM.org. Penulis menjamin
keakuratan dan kelengkapan data dan kesetiaan uji coba terhadap protokol.

Sumber data
Status Vaksinasi
Data semua orang di Inggris yang telah divaksinasi dengan vaksin Covid-19 tersedia dalam
daftar vaksinasi nasional (National Immunization Management System). Data mengenai
vaksinasi yang telah terjadi sampai dengan 16 Mei 2021, termasuk tanggal penerimaan setiap
dosis vaksin dan jenis vaksin, diekstraksi pada 17 Mei 2021. Status vaksinasi dikategorikan
sebagai penerimaan satu dosis vaksin. vaksin di antara orang-orang yang memiliki onset
gejala yang terjadi 21 hari atau lebih setelah menerima dosis pertama hingga hari sebelum
dosis kedua diterima, sebagai penerimaan dosis kedua di antara orang-orang yang memiliki
onset gejala yang terjadi 14 hari atau lebih setelah menerima vaksin. dosis kedua,
Pengujian SARS-CoV-2
Pengujian polymerase-chain-reaction (PCR) untuk SARS- CoV-2 di Inggris dilakukan
olehlaboratorium rumah sakit dan kesehatan masyarakat, serta melalui pengujian komunitas
dengan menggunakan pengujian drive-through atau di rumah, yang tersedia bagi siapa saja
dengan gejala yang konsisten dengan Covid-19 (suhu tinggi, batuk terus menerus baru, atau
kehilangan atau perubahan indera penciuman atau rasa). Data pada semua tes PCR positif
antara 26 Oktober 2020, dan 16 Mei 2021, diekstraksi. Data pada semua tes komunitas yang
tercatat negatif di antara orang-orang yang melaporkan gejala juga diekstraksi untuk analisis
kasus-kontrol tes-negatif. Anak-anak di bawah usia 16 tahun pada 21 Maret 2021,
dikeluarkan. Data dibatasi untuk orang-orang yang telah melaporkan gejala, dan hanya
orang-orang yang telah menjalani pengujian dalam 10 hari setelah timbulnya gejala
dimasukkan, untuk memperhitungkan penurunan sensitivitas pengujian PCR di luar periode
ini.25

Identifikasi Varian
Sekuensing seluruh genom digunakan untuk mengidentifikasi varian delta dan alfa. Proporsi
darisemua sampel positif yang diurutkan meningkat dari sekitar 10% pada Februari 2021
menjadi sekitar 60% pada Mei 2021.4 Pengurutan dilakukan di jaringan laboratorium,
termasuk Wellcome Sanger Institute, di mana sebagian besar sampel telah diuji, dan sekuens
seluruh genom ditetapkan ke definisi varian Public Health England berdasarkan mutasi.26
Status target gen lonjakan pada PCR digunakan sebagai pendekatan kedua untuk
mengidentifikasi setiap varian. Laboratorium menggunakan uji TaqPath (Thermo Fisher
Scientific) untuk menguji tiga target gen: spike (S), nucleocapsid (N), dan open reading
frame 1ab (ORF1ab). Pada Desember 2020, varian alfa tercatat terkait dengan pengujian
negatif pada target S, sehingga status target-negatif S kemudian digunakan sebagai proksi
untuk identifikasi varian. Varian alfa menyumbang antara 98% dan 100% dari hasil S target-
negatif di Inggris. Di antara sampel sekuens yang diuji positif untuk target S, varian delta
berada di 72,2% sampel pada April 2021 dan pada 93,0% pada Mei (per 12 Mei 2021).4
Untuk analisis kasus-kontrol uji-negatif, hanya sampel yang telah diuji di laboratorium
dengan menggunakan uji TaqPath yang disertakan.

Keterkaitan Data
Tiga sumber data yang dijelaskan di atas adalah terkait dengan penggunaan nomor Layanan
Kesehatan Nasional (pengidentifikasi unik untuk setiap orang yang menerima perawatan
medis di Inggris). Sumber data ini juga dihubungkan dengan data tanggal lahir pasien, nama
belakang, nama depan nama, kode pos, dan pengenal spesimen dan tanggal sampel.

kovariat
Beberapa kovariat yang mungkin terkait dengan kemungkinan ditawarkan atau diterimanya
vaksin dan risiko terpapar Covid-19 atau khususnya salah satu varian yang dianalisis juga
diambil dari Sistem Manajemen Imunisasi Nasional dan data pengujian. Data ini termasuk
usia (dalam kelompok usia 10 tahun), jenis kelamin, indeks deprivasi ganda (indikasi
nasional tingkat deprivasi yang didasarkan pada wilayah geografis kecil tempat tinggal,27
dinilai dalam kuintil), ras atau kelompok etnis, rumah perawatan status tempat tinggal,
riwayat perjalanan ke luar negeri (yaitu, di luar Inggris atau Irlandia), wilayah geografis,
periode (minggu kalender), status pekerja perawatan kesehatan dan sosial, dan status berada
dalam kelompok yang sangat rentan secara klinis.28 Selain itu, untuk analisis kasus-kontrol
uji-negatif, riwayat infeksi SARS-CoV-2 sebelum dimulainya program vaksinasi
dimasukkan. Orang dianggap telah bepergian jika, pada saat meminta tes, mereka
melaporkan telah bepergian ke luar Inggris dan Irlandia dalam 14 hari sebelumnya atau jika
mereka telah diuji di hotel karantina atau saat karantina di rumah. Kode pos digunakan untuk
menentukan indeks deprivasi berganda, dan nomor referensi properti unik digunakan untuk
mengidentifikasi panti jompo.29

Analisis statistik
Untuk kasus-kontrol uji-negatif analisis, regresi logistik digunakan untuk memperkirakan
kemungkinan memiliki kasus Covid-19 yang bergejala dan dikonfirmasi PCR di antara orang
yang divaksinasi dibandingkan dengan orang yang tidak divaksinasi (kontrol). Kasus
diidentifikasi memiliki varian delta melalui pengurutan atau jika mereka adalah target S-
positif pada uji TaqPath PCR. Kasus diidentifikasi memiliki varian alfa melalui pengurutan
atau jika mereka adalah target S-negatif pada uji TaqPath PCR.
Jika seseorang telah dites positif beberapa kali dalam periode 90 hari (yang mungkin
mewakili satu episode penyakit), hanya tes positif pertama yang disertakan. Maksimal tiga
hasil tes negatif yang dipilih secara acak dimasukkan untuk setiap orang. Tes negatif di mana
sampel telah diperoleh dalam waktu 3 minggu sebelum hasil positif atau setelah hasil positif
bisa jadi negatif palsu; oleh karena itu, ini dikecualikan. Tes yang telah diberikan dalam waktu 7
hari setelah hasil negatif sebelumnya juga dikeluarkan. Orang yang sebelumnya dites positif
sebelum periode analisis juga dikeluarkan untuk memperkirakan efektivitas vaksin pada orang
yang sepenuhnya rentan. Semua kovariat dimasukkan dalam model seperti yang telah dilakukan
dengan analisis kasus-kontrol tes-negatif sebelumnya, dengan minggu kalender dimasukkan
sebagai faktortor dan tanpa interaksi dengan wilayah.
Berkenaan dengan status target S-positif atau-negatif, hanya orang yang telah dites positif pada
dua target gen PCR lainnya yang dimasukkan. Penetapan varian delta berdasarkan status target
S dibatasi pada minggu yang dimulai 12 April 2021, dan seterusnya untuk mencapai
spesifisitas tinggi dari pengujian target-positif S untuk varian delta.4
Efektivitas vaksin untuk dosis pertama diperkirakan di antara orang-orang dengan tanggal
timbulnya gejala yaitu 21 hari atau lebih setelah menerima dosis pertama vaksin, dan efek
vaksin untuk dosis kedua diperkirakan di antara orang-orang dengan tanggal timbulnya
gejala yang 14 hari atau lebih setelah penerimaan. dari dosis kedua. Perbandingan dibuat
dengan orang-orang yang tidak divaksinasi dan dengan orang-orang yang memiliki onset
gejala dalam periode 4 sampai 13 hari setelah vaksinasi untuk membantu menjelaskan
perbedaan risiko infeksi yang mendasari. Jangka waktu dari hari pemberian vaksin (hari 0)
sampai hari ke 3 tidak termasuk karena reaktogenisitas terhadap vaksin dapat menyebabkan
peningkatan pengujian yang membiaskan hasil, seperti yang dijelaskan sebelumnya.10
HASIL
Keterkaitan Data
Di antara semua sampel yang diurutkan yang terkait dengan kumpulan data pengujian SARS-
CoV-2, 92,9% dikaitkan dengan data tentang status vaksinasi. Selama masa studi, ada 38.592
tes berurutan terkait. Dalam analisis yang dibatasi untuk hanya memasukkan orang berusia
minimal 16 tahun yang memiliki gejala Covid-19 yang disebabkan oleh varian alfa atau delta
dan yang telah divaksinasi dengan ChAdOx1 nCoV-19 atau BNT162b2 sesuai dengan jadwal
yang sesuai, 19.109 kasus berurutan dimasukkan (Gbr. S1 dalam Lampiran Tambahan).
Varian alfa terdeteksi pada 14.837 sampel, dan varian delta pada 4272 sampel.
Karakteristik Deskriptif
Karakteristik orang dengan Covid-19 dalam populasi penelitian menurut varian ditunjukkan pada
Tabel 1. Perbedaan utama dengan varian delta termasuk proporsi yang lebih tinggi dari orang
dengan riwayat perjalanan ke luar negeri; proporsi yang lebih tinggi-tion orang dengan kasus
dalam beberapa minggu terakhir (kalender minggu 18 sampai 20); proporsi yang lebih tinggi
dari orang dengan kasus di wilayah barat laut, London, dan timur Inggris; dan proporsi yang
lebih tinggi dari orang-orang dalam kelompok etnis “India atau British Indian,” “Pakistan
atau British Pakistan,” atau “latar belakang Asia lainnya”. Sedikit perbedaan dalam distribusi
usia atau indeks deprivasi ganda terlihat. Beberapa kasus varian baik terlihat pada orang yang
lebih tua dari 70 tahun, dan hanya sembilan kasus (semua yang dengan varian alpha) terjadi
di antara penghuni panti jompo.
Di antara sampel sekuensing yang asliakhirnya diuji dengan menggunakan uji TaqPath,
korelasi tinggi terlihat antara status target S dan dua varian yang sedang diselidiki, dengan
95,3% dari kasus target-positif S diidentifikasi memiliki varian delta dan 99,6% dari kasus
target-negatif S diidentifikasi memiliki varian alfa (Tabel S1 dan S2). Distribusi interval
antara penerimaan dosis vaksin ditunjukkan pada Gambar S2.

ESTIMASI EFEKTIVITAS VAKSIN

Hasil analisis kasus-kontrol uji-negatif ditunjukkan pada Tabel 2 dan Gambar 1. Dalam analisis
“vaksin apa pun”, di mana data dari orang-orang yang menerima salah satu vaksin
dikumpulkan, efektivitasnya terutama lebih rendah setelah dosis vaksin pertama di antara
orang-orang dengan varian delta ( 30,7%; interval kepercayaan 95% [CI], 25,2 hingga 35,7)
dibandingkan di antara mereka yang memiliki varian alfa (48,7%; 95% CI, 45,5 hingga 51,7).
Hasil untuk dosis pertama serupa untuk kedua vaksin, dengan perbedaan mutlak dalam
efektivitas vaksin terhadap varian delta dibandingkan dengan varian alfa sebesar 11,9 poin
persentase dengan vaksin BNT162b2 dan 18,7 poin persentase dengan vaksin ChAdOx1
nCoV-19.
Perbedaan efektivitas vaksin jauh lebih kecil di antara orang-orang yang telah menerima dosis
vaksin kedua. Dalam "vaksin apa saja" analisis, efektivitas vaksin adalah 87,5% (95% CI, 85,1
hingga 89,5) dengan varian alfa dan 79,6% (95% CI, 76,7 hingga 82,1) dengan varian delta.
semut. Dengan vaksin BNT162b2, perbedaan kecilefektivitas antara varian terlihat setelah dosis
kedua: 93,7% (95% CI, 91,6 hingga
95,3) dengan varian alpha dan 88,0% (95% CI,
85,3 hingga 90,1) dengan varian delta. yang efektif-ness dengan dua dosis vaksin ChAdOx1
nCoV-19 lebih rendah dibandingkan dengan vaksin BNT162b2; namun, dengan vaksin
ChAdOx1 nCoV-19, perbedaan efektivitas antara varian alfa dan delta kecil (74,5% [95%
CI, 68,4 hingga 79,4] dan 67,0% [95% CI, 61,3 hingga 71,8], masing-masing ).
Tabel S3, di mana periode setelah dosis pertama dikelompokkan menurut periode 21
hingga 55 hari dan periode 56 hari atau lebih, menunjukkan kemungkinan indikasi penurunan
kemanjuran terhadap varian alfa dengan vaksin BNT162b2 dan terhadap delta varian dengan
vaksin ChAdOx1 nCoV-19. Bagian S1 dan Tabel S4 sampai S6 menunjukkan hasil analisis
sekunder.
DISKUSI
Kami menemukan bahwa perbedaan mutlak dalam efektivitas vaksin terhadap penyakit
simtomatik dengan satu dosis vaksin dengan varian delta dibandingkan dengan varian alfa
adalah sekitar 12 sampai 19 poin persentase. Namun, perbedaan efektivitas vaksin setelah
dua dosis kecil. Ini adalah kasus untuk vaksin BNT162b2 dan ChAdOx1 nCoV-19. Dalam
analisis kasus-kontrol uji-negatif, perkiraan efektivitas vaksin terhadap penyakit simtomatik
dengan varian delta adalah sekitar 36% dengan dosis tunggal vaksin BNT162b2 dan sekitar
30% dengan dosis tunggal vaksin ChAdOx1 nCoV-19 ; efektivitasnya sekitar 88% dengan
dua dosis vaksin BNT162b2 dan sekitar 67% dengan dua dosis vaksin ChAdOx1 nCoV-19.
Efek yang jelas dicatat dengan keduanya vaksin, dengan tingkat efektivitas yang tinggi
setelah dua dosis. Efektivitas vaksin terhadap kedua varian lebih kecil setelah menerima dua
dosis vaksin ChAdOx1 nCoV-19 dibandingkan setelah menerima dua dosis vaksin
BNT162b2, sebuah temuan yang konsisten dengan temuan uji klinis yang dilaporkan.7,8
Perbedaan antara kedua vaksin dibahas lebih lanjut dalam Bagian S2. Jumlah kasus dan
periode tindak lanjut saat ini tidak cukup untuk memperkirakan efektivitas vaksin terhadap
penyakit parah, termasuk rawat inap dan kematian.

Tabel 1. (Lanjutan.)

Varian Alfa (N Varian Delta Total

Ciri = 14,837) (N = 4272) (N = 19.109)
5 1,828 (12,3) 524 (12.3) 2,352 (12,3)
Data hilang 33 (0.2) 11 (0.3) 44 (0.2)
Kelompok yang sangat rentan secara klinis — tidak. (%)¶
Tidak 14,582 (98,3) 4211 (98,6) 18.793 (98.3)
ya 255 (1.7) 61 (1.4) 316 (1.7)
Penghuni rumah perawatan — tidak. (%)
Tidak 14.828 (99,9) 4272 (100) 19.100 (100)
ya 9 (0,1) 0 9 (<0,1)
Pekerja perawatan kesehatan atau sosial — tidak. (%)
Tidak 14.621 (98,5) 4181 (97,9) 18.802 (98,4)
ya 216 (1.5) 91 (2.1) 307 (1.6)
Ras atau kelompok etnis — tidak. (%)‖
Bangladesh atau British Bangladesh 230 (1.6) 98 (2.3) 328 (1.7)
Cina 54 (0.4) 18 (0.4) 72 (0.4)
India atau India Inggris 458 (3.1) 705 (16,5) 1.163 (6.1)
Pakistan atau British Pakistan 1.024 (6.9) 510 (11,9) 1.534 (8.0)
Latar belakang Asia lainnya 278 (1.9) 188 (4.4) 466 (2.4)
Afrika Hitam atau Karibia 277 (1.9) 113 (2.6) 390 (2.0)
putih 9.662 (65.1) 1801 (42.2) 11.463 (60,0)
Campuran 234 (1.6) 71 (1.7) 305 (1.6)
Kelompok etnis lainnya 442 (3.0) 139 (3.3) 581 (3.0)
Data hilang 2.178 (14,7) 629 (14,7) 2.807 (14,7)
Wilayah — tidak. (%)
Midlands Timur 1,822 (12,3) 380 (8.9) 2.202 (11,5)
Inggris Timur 1.178 (7.9) 510 (11,9) 1.688 (8.8)
London 1.062 (7.2) 536 (12.5) 1.598 (8.4)
Timur laut 977 (6.6) 69 (1.6) 1046 (5.5)
Barat laut 2,664 (18,0) 2138 (50,0) 4.802 (25.1)
Tenggara 847 (5.7) 198 (4.6) 1045 (5.5)
Barat daya 198 (1.3) 63 (1,5) 261 (1.4)
West Midlands 1.538 (10,4) 241 (5.6) 1.779 (9.3)
Yorkshire dan Humber 4,550 (30,7) 135 (3.2) 4.685 (24,5)
Data hilang 1 (<0,1) 2 (<0,1) 3 (<0,1)

• * B.1.1.7 adalah varian alfa, dan B.1.617.2 varian delta, dari sindrom pernafasan akut
parah coronavirus 2, virus yang menyebabkan penyakit coronavirus 2019 (Covid-19).
Persentase mungkin tidak berjumlah 100 karena pembulatan.
 • † Seseorang dianggap telah melakukan perjalanan jika, pada saat meminta tes,
mereka melaporkan telah bepergian ke luar Inggris Raya dan Irlandia dalam 14 hari
sebelumnya atau jika mereka telah diuji di hotel karantina atau saat karantina di
rumah.
• ‡ Nomor minggu adalah minggu kalender pada tahun 2021.
• § Indeks deprivasi berganda adalah indikator nasional tingkat deprivasi berdasarkan
wilayah geografis kecil tempat tinggal; indeks berkisar dari 1 (kecil) hingga 5
(besar).
• ¶ Status berada dalam kelompok yang sangat rentan secara klinis didefinisikan
menurut NHS Digital.
• ‖ Ras atau kelompok etnis ditentukan dari data dalam daftar Sistem Manajemen
Imunisasi Nasional.

Tabel 2. Efektivitas Vaksin terhadap Varian Alpha atau S Target–Status Negatif dan Varian Delta atau S Target–Status Positif, Menurut Dosis
dan Jenis Vaksin.*

Uji-
Negatif Varian Alfa atau Varian Delta atau
Vaksinasi Status Status S Target–Negatif Status S Target–Status Positif
Disesuaikan Vaksin Disesuaikan Vaksin
Kasus:KontrolEfektivitasKasus:Kontrol Efektivitas
Kontrol kasus Perbandingan (95% CI) Kasus Perbandingan (95% CI)
tidak tidak Tidak.%
Tidak 96.371 7313 0,076 Referensi 4043 0,042 Referensi
divaksinasi
Vaksin apa saja
Dosis 1 51.470 2226 0,043 48,7 (45,5–51,7) 1493 0,029 30.7 (25.2–35.7)
Dosis 2 23.993 143 0,006 87,5 (85,1–89,5) 340 0,014 79,6 (76,7–82,1)
Vaksin BNT162b2
Dosis 1 8.641 450 0,052 47,5 (41,6–52,8) 137 0,016 35,6 (22,7–46,4)
Dosis 2 15.749 49 0,003 93,7 (91,6–95,3) 122 0,008 88.0 (85,3–90,1)
ChAdOx1 nCoV-19
vaksin
Dosis 1 42,829 1776 0,041 48,7 (45,2–51,9) 1356 0,032 30.0 (24,3–35,3)
Dosis 2 8.244 94 0,011 74.5 (68.4–79.4) 218 0,026 67.0 (61,3–71,8)

* Analisis efektivitas vaksin yang disesuaikan disesuaikan dengan periode (minggu

kalender), riwayat perjalanan, ras atau kelompok etnis, jenis kelamin, usia, indeks
kekurangan ganda, kelompok yang sangat rentan secara klinis, wilayah, riwayat tes positif,
pekerja perawatan kesehatan atau sosial , dan rumah perawatan resi- dence. CI menunjukkan
interval kepercayaan.
Gambar 1. Efektivitas Vaksin Terhadap Varian Alpha dan Delta, Menurut Dosis dan
Jenis Vaksin.
Ditampilkan adalah efektivitas satu dosis dan dua dosis vaksin BNT162b2 dan ChAdOx1
nCoV-19, atau salah satu vaksin (“apa saja”), terhadap penyakit bergejala dengan B.1.1.7
(alpha) atau B.1.617.2 (delta ) varian dari akut yang parah sindrom pernapasan coronavirus 2.
I bar menunjukkan interval kepercayaan 95%.

Satu studi dari India yang melaporkan data netralisasi dalam kategori varian B.1.617 yang lebih
luas menunjukkan bahwa sampel serum pemulihan dari orang dengan Covid-19 dan dari penerima
vaksin BBV152 (Covaxin) mampu menetralisir varian dalam garis keturunan B.1.617.30 As
dibandingkan dengan temuan terbaru dari Qatar tentang efektivitas vaksin BNT162b2
terhadap varian alfa dan beta,17 temuan kami menunjukkan bahwa efektivitas terhadap
varian delta setelah kursus vaksinasi penuh terletak di antara keduanya. Perbandingan dengan
perkiraan efektivitas vaksin yang dilaporkan sebelumnya terhadap varian alfa dibahas di
Bagian S2.
Skala besar pengujian dan seluruh genom pengurutan di Inggris, serta pencatatan status
vaksinasi dalam daftar vaksinasi nasional, memungkinkan kami untuk menganalisis
efektivitas vaksin dalam beberapa minggu dari varian delta yang pertama kali muncul di
Inggris. Kami menggunakan dua pendekatan analitik berbeda yang memberikan hasil yang
hampir sama, dan temuan dengan analisis kontrol kami (menggunakan varian alfa) konsisten
dengan yang telah dilaporkan sebelumnya.7,8,10,17 Temuan juga serupa dengan kasus-kasus
yang terjadi selama 2 minggu pertama setelah menerima dosis vaksin pertama (Tabel S4),
yang membantu menyingkirkan faktor pembaur yang tidak terukur terkait dengan
kemungkinan divaksinasi dan kemungkinan terpapar varian .
Studi kami memilikibeberapa keterbatasan. Temuan ini bersifat observasional dan harus
ditafsirkan dengan hati-hati. Sensitivitas atau spesifisitas pengujian PCR yang rendah dapat
mengakibatkan kasus dan kontrol salah diklasifikasikan, yang akan melemahkan perkiraan
efektivitas vaksin. Sensitivitas atau spesifisitas yang rendah dari pengujian PCR juga dapat
mempengaruhi satu varian lebih dari yang lain, meskipun ini mungkin diharapkan
mempengaruhi varian alfa lebih dari varian delta, mengingat bahwa, dengan varian yang
muncul, lebih banyak kasus dapat dideteksi lebih awal pada infeksi. , yang dapat
mengakibatkan viral load yang lebih tinggi dan peningkatan sensitivitas dan spesifisitas.
Meskipun kami mengontrol ras atau kelompok etnis, wilayah, dan indeks deprivasi ganda,
perbedaan cakupan vaksin di antara kelompok populasi yang mungkin memiliki lebih
banyak atau lebih sedikit paparan varian delta mungkin telah mempengaruhi analisis
sekunder tetapi seharusnya tidak mempengaruhi desain kasus-kontrol tes-negatif. Mungkin
juga ada perbedaan di antara masyarakat orang yang menerima setiap vaksin — misalnya, pada
kelompok usia yang lebih muda, petugas kesehatan lebih mungkin menerima vaksin BNT162b2,
sedangkan orang dalam kelompok risiko klinis lebih mungkin menerima vaksin ChAdOx1
nCoV-19. Selanjutnya, analisis juga mengandalkan asumsi bahwa setiap pembaur residual dalam
desain kasus-kontrol uji-negatif akan mempengaruhi dua perkiraan efektivitas vaksin secara
setara atau setidaknya tidak akan bias. NS rasio odds yang disesuaikan untuk perbandingan
efektivitas vaksin untuk vaksin yang diberikan terhadap dua varian; yaitu, keakuratan urutan
tidak akan tergantung pada varian dan kecenderungan di antara orang-orang yang bergejala
untuk diuji tidak akan berbeda menurut varian. Secara keseluruhan, kami menemukan
tingkat efektivitas vaksin yang tinggi terhadap penyakit simtomatik dengan varian delta
setelah menerima dua dosis. Perkiraan ini hanya sedikit lebih rendah dari perkiraan
efektivitas vaksin terhadap varian alfa. Temuan kami tentang penurunan efektivitas setelah
dosis pertama akan mendukung upaya untuk memaksimalkan penyerapan vaksin dengan dua
dosis di antara kelompok rentan dalam konteks sirkulasi vaksin.
varian delta.
Surveilans pengujian dan vaksinasi penyakit coronavirus 2019 (Covid-19) dilakukan
berdasarkan Peraturan 3 Peraturan Layanan Kesehatan (Pengendalian Informasi Pasien) 2002
untuk mengumpulkan informasi rahasia pasien (www.legislation.gov
.uk/uksi/2002/1438/peraturan/3/dibuat) uneh bagiann 3(aku) (Sebuah) THai (c), 3(i)(d) (i)
dan (ii), dan 3. Protokol penelitian adalah subjek ke tinjauan internal oleh Public Health
England Research Ethics and Governance Group dan ternyata sepenuhnya sesuai dengan
semua persyaratan peraturan. Mengingat bahwa tidak ada masalah peraturan yang
diidentifikasi dan bahwa tinjauan etika bukanlah persyaratan untuk jenis pekerjaan ini,
diputuskan bahwa tinjauan etika penuh tidak diperlukan.
Didukung oleh Public Health England (PHE). Covid-19 Genomics UK Consortium (COG-
UK) didukung oleh pendanaan dari Medical Research Council bagian dari UK Research and
Innovation, National Institute of Health Research, dan Genome Research, yang beroperasi
sebagai Wellcome Sanger Institute.
Formulir pengungkapan yang disediakan oleh penulis tersedia dengan teks lengkap artikel ini
di NEJM.org.
Kami berterima kasih kepada anggota Tim Data Science PHE Covid-19, Tim PHE
Outbreak Surveillance, NHS England, NHS Digital, dan NHS Test and Trace atas peran
mereka dalam mengembangkan dan mengelola pengujian untuk coronavirus pernapasan akut
parah 2 (SARS-CoV -2), sistem identifikasi dan vaksinasi varian, dan kumpulan data, serta
pemberi vaksin NHS yang melaporkan dan staf laboratorium NHS, laboratorium PHE, dan
laboratorium mercusuar; staf Wellcome Sanger Institute dan laboratorium lain yang terlibat
dalam pengurutan seluruh genom sampel yang diperoleh dari pasien Covid-19; anggota
Komite Bersama untuk Vaksinasi dan Imunisasi dan Kelompok Teknis Varian Inggris untuk
saran dan umpan balik dalam mengembangkan penelitian ini; dan Dr. Neil Ferguson untuk
saran analisisnya.