MAKALAH MIKROBIOLOGI

Mineral tanah mempengaruhi pertumbuhan bakteri spesifik takson

DOSEN PENGAMPU
Firman Fajar Perdhana,S.Si.,M biotech

OLEH:
KELOPOK 6
1. Linda Panesa Aulia J1A021074
2. Miftahul Fath Rahmatullah J1A021078
3. Rizqi Alif Mulia J1A021090
4. Santiana J1A021093
5. Zafiirah Quratul Aini J1A021102

PROGRAM STUDI ILMU DAN TEKNLOGI PANGAN

FAKULTAS ILMU TEKNOLOGI PANGAN DAN AGROINDUSTRI
UNIVERSITAS MATARAM
2022
 KATA PENGANTAR

Puji dan syukur kami panjatkan kehadiran Tuhan Yang Maha Esa atas berkat dan karunia-Nya
sehingga kami dapat menyelesaikan makalah ini dengan baik. Adapun judul dari makalah ini yaitu “Peran
Mikroba Dalam Dekomposisi Karbon Organik Dan Pemeliharaan Ekosistem Tanah”.
Kami sangat berharap makalah ini dapat berguna dalam rangka menambah wawasan serta
pengetahuan kita. Kami juga menyadari sepenuhnya bahwa makalah ini masih jauh dari sempurna
terdapat kekurangan-kekurangan dan masih jauh dari apa yang diharapkan. Untuk itu, kami berharap
kritik, saran, dan usulan demi perbaikan makalah ini di masa yang akan datang, mengingat tidak ada
sesuatu yang sempurna tanpa kritik dan saran yang membangun.
Semoga makalah ini dapat dipahami bagi siapapun yang membacanya, sekiranya makalah yang
telah disusun ini dapat berguna bagi kami sendiri maupun orang yang membacanya. Sebelumnya kami
mohon maaf apabila terdapat kesalahan kata-kata yang kurang berkenan dan kami memohon kritik dan
saran yang membangun demi perbaikan di masa depan.

Mataram, 14 November 2022

Kelompok 6
 DAFTAR ISI
KATA PENGANTAR..............................................................Error! Bookmark not defined.
DAFTAR ISI............................................................................Error! Bookmark not defined.
BAB I.......................................................................................Error! Bookmark not defined.
PENDAHULUAN....................................................................Error! Bookmark not defined.
1.1 Latar Belakang...............................................................Error! Bookmark not defined.
1.2 Material dan Metode......................................................Error! Bookmark not defined.
1.3 Tujuan.............................................................................Error! Bookmark not defined.
BAB II......................................................................................Error! Bookmark not defined.
PEMBAHASAN......................................................................Error! Bookmark not defined.
BAB III…………………………………………………………………………………………7
KESIMPULAN…………………………………………………………………………………7
 BAB 1
PENDAHULUAN

1.1. Latar Belakang

Aktivitas mikroba tanah bertanggung jawab atas salah satu fluks terbesar dalam siklus karbon terestrial
(C). Namun, aktivitas ini berasal dari koleksi organisme yang hidup berdampingan yang sangat beragam
dari semua cabang pohon kehidupan, dengan satu gram tanah sering mengandung lebih dari satu miliar
organisme dan ribuan spesies. Kumpulan mineral tanah yang berbeda telah ditemukan untuk mendukung
pengembangan komunitas mikroba tertentu melalui karakteristik permukaannya seperti muatan dan luas
permukaan, kandungan nutrisi, dan tahap pelapukan. Mineral tanah juga dapat mempengaruhi komunitas
mikroba dengan mempengaruhi ukuran pori,ukuran partikel, pembentukan agregat , dan tingkat
pemrosesan mikroba SOC. Kumpulan mineral tanah sangat mempengaruhi dinamika SOC, terutama
mineral orde jarak pendek (SRO). Memahami bagaimana mineral dan mikroorganisme mempengaruhi
ketersediaan spektrum luas senyawa organik dalam tanah dapat membantu memprediksi aktivitas taksa
bakteri dan stabilisasi OM tanah. Untuk mengevaluasi bagaimana kumpulan mineral tanah mempengaruhi
pertumbuhan, kami menghitung pertumbuhan takson spesifik bakteri di tanah dari tiga bahan induk yang
berbeda dari tipe ekosistem hutan campuran konifer barat Amerika Utara yang sama. Kami juga
mengevaluasi bagaimana penambahan dan bentuk kimia karbon memodulasi efek mineral tanah pada
pertumbuhan, dan peran identitas taksonomi dalam memprediksi pertumbuhan bakteri di tanah dengan
kumpulan mineral yang berbeda.
1.2. Metode
Lokasi
Tiga tanah dikumpulkan dari cakrawala A (0-11 cm) pada bulan Juni 2012 dari situs di
pegunungan California Sierra Nevada dengan vegetasi konifer campuran yang serupa, suhu
tahunan rata-rata, kemiringan, dan kandungan tanah liat seperti yang dijelaskan sebelumnya.
Inkubasi
Pada awal inkubasi, 200 L air ditambahkan ke semua perlakuan: 97 atom%18O-air
untuk perawatan berlabel dan air deionisasi kelimpahan alami ke perawatan paralel yang tidak
berlabel. Perlakuan termasuk tiga tanah (andesit, basal, dan granit), tiga perlakuan penambahan
C (hanya air, eksudat akar, dan serasah pinus tanah), dan dua isotop perawatan (H 218O pada
kelimpahan alami dan pada 97 atom %) dengan empat ulangan untuk setiap perlakuan,
Sentrifugasi dan fraksinasi kepadatan
DNA dipisahkan dengan sentrifugasi densitas dengan menambahkan 800-1000 ng DNA
ke dalam larutan yang mengandung 2,55 mL jenuh (1,9 g mL1) cesium klorida, 450 L gradien
buffer dan ~200 L buffer TE dalam 3,3 mL tabung ultrasentrifugasi OptiSeal (Beckman
Coulter).
1.3. Tujuan
Tujuan dari jurnal penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh mineral tanah terhadap
pertumbuhan bakteri spesifik takson.
 PEMBAHASAN
Hasil dari penelitian jurnal ini mencakup beberapa point penting yaitu :
 Respirasi tanah
Tanah andesit dan basal, dua tanah yang kaya akan mineral SRO, meskipun kandungan
SOC totalnya lebih tinggi, memiliki laju respirasi yang lebih rendah setelah satu minggu
inkubasi dibandingkan dengan tanah granit (Tabel1). Di bawah kondisi air saja,
komunitas tanah granit bernafas sekitar empat kali lebih banyak CO2–C sebagai tanah
andesit dan basal (Tabel 1). Substrat C segar meningkatkan total CO2–C direspirasi dari
semua tanah, dengan penambahan eksudat menghasilkan CO . yang lebih besar2–C
bernafas daripada penambahan serasah.
 Komposisi komunitas bakteri
Dari ketiga jenis tanah, andesit memiliki kekayaan bakteri terbesar dengan 2319 ASV
hadir di ketiga perlakuan penambahan C, basal memiliki 1596 ASV, dan tanah granit
memiliki 1206 ASV (Gbr. 2).1sebuah). Dari 3476 ASV, 484 (13,9% dari semua ASV
yang terdeteksi) hadir di semua tanah dan perlakuan penambahan C. Tanah andesit
memiliki kelimpahan salinan gen 16S rRNA terukur tertinggi dengan 2,526 salinan.
Filum bakteri yang paling melimpah di seluruh tanah adalah Actinobacteria dan
Proteobacteria, bersama-sama terdiri dari 59% andesit, 54% basal, dan 72% komunitas
granit dalam perlakuan kontrol (Gbr. S1b). Acidobacteria juga berlimpah di seluruh
tanah, dengan kelimpahan yang lebih rendah dari Bacteroidota, Gemmatimonadota,
Chloroflexi, Firmicutes, Myxococcota, Planctomycetota, dan Verrucomicrobia.
 Pertumbuhan Bakteri
Pengayaan relatif rata-rata adalah 0,1 EAF18O lebih besar di seluruh perawatan di tanah
granit dibandingkan dengan andesit dan basal, yang tidak berbeda satu sama
lain.Substrat Sebagian besar tidak mempengaruhi pertumbuhan relative rata-rata di
seluruh taksa semua, bersama dan taksa unik,kecuali untuk interaksi antara penurunan
tanah basaldi EAF 18 O dibawah penambahan eksudat dibandingkan dengan kondisi air
saja. Dari analisis kemungkinan maksimum terbatas dan estimasi komponen varians,
taksonomi menyumbang 37,7% dari variasi yang dijelaskan dalam EAF18Nilai O, tanah
menyumbang 53,5%, dan jenis substrat menyumbang 8,8% (Gbr. S2). Dari taksonomi,
filum menyumbang 6,3% dari total variasi yang dijelaskan, dan tingkat taksonomi yang
lebih rendah (keluarga hingga ASV) menjelaskan sisanya (31,4%).
 KESIMPULAN
Dari 484 ASV bakteri yang ada di semua tanah, sebagian besar pertumbuhan relatif ASV tidak
terpengaruh atau ditekan dengan adanya mineral SRO. . Di bawah penambahan air saja, hanya tiga ASV
(kurang dari 1% ASV), yang semuanya milik Actinobacteria (secara umum Atopobium,
Rothia,danActinomyces) dirangsang dengan meningkatkan konten SRO, dan 35,3% ASV ditekan oleh
Kehadiran SRO dalam hal pertumbuhan relatif (kemiringan konten SRO menurut EAF18O signifikan
negatif, = 0,05). Penambahan C segar sedikit meningkatkan jumlah responden positif terhadap SRO,
dengan lima ASV di bawah penambahan eksudat dan sembilan ASV di bawah penambahan serasah yang
memiliki pertumbuhan relatif meningkat secara signifikan di bawah konsentrasi mineral SRO yang lebih
besar. Lebih banyak ASV masih memiliki pertumbuhan yang ditekan dengan SRO di bawah penambahan
C baru, dengan 29, 7% ASV di bawah penambahan eksudat menunjukkan pertumbuhan yang ditekan
dengan konsentrasi mineral SRO yang lebih besar dan 35, 5% ASV di bawah penambahan serasah .Taksa
yang menekan pertumbuhan dengan meningkatnya kandungan mineral SRO terdiri dari 26–48% salinan
16S dalam setiap komunitas tanah, sedangkan taksa yang dirangsang dengan meningkatnya kandungan
SRO terdiri kurang dari 0,5% dari setiap komunitas tanah di bawah penambahan substrat yang berbeda.