Nama : Munawaroh fauziah

Kelas : 3 B
Nim : 41035003211081
Agroteknologi
TUGAS FISIOLOGI TUMBUHAN
(RuBisCO)

1. Pengertian RuBisCO
Ribulosa bifosfat karboksilase/oksigenase ( RuBisCO ) adalah enzim kunci dalam
fotosintesis yang mengkatalisis fiksasi korbondioksida. RuBisCO adalah singkatan dari
Ribulosa 1,5-bifosfat karboksilase-oksigenase terdapat protein yang paling melimpah di
biosfer. Ini mengkatalisis langkah pertama fiksasi karbon dalam siklus Calvin selama
fotosintesis. Ini adalah jalur umum fiksasi karbon di semua tanaman, yaitu tanaman C3, C4 dan
CAM.

Hal ini bertanggung jawab untuk fiksasi karbon selama fotosintesis. RuBisCO ada di mana-
mana untuk organisme fotosintesis dan dianggap sebagai protein paling melimpah di bumi.
Dari sudut pandang nutrisi, subunit besar Rubisco memiliki komposisi asam amino esensial
yang sangat ideal antara protein nabati. Oleh karena itu, tanaman Rubisco diharapkan dapat
menjadi sumber protein pangan yang besar di masa depan.

2. Fungsi RuBisCO
- Fungsi utama RuBisCO adalah dalam fotosintesis dan fotorespirasi.
- Ini mengkatalisis langkah pertama fiksasi karbon di jalur C3 atau siklus Calvin, yaitu
karboksilasi RuBP. Ini menghasilkan pembentukan 2 molekul 3-PGA.
- RuBisCO juga memiliki afinitas terhadap oksigen sehingga ia mengikat sejumlah O2
dalam proses yang dikenal sebagai fotorespirasi. Ini mengarah pada konversi RuBP
menjadi satu molekul masing-masing fosfogliserat dan fosfoglikolat.
- Karena afinitas RuBisCO jauh lebih tinggi untuk CO2 daripada O2 , fotosintesis lebih
disukai daripada fotorespirasi.

3. Struktur dan Karakteristik RuBisCO

- RuBisCO hadir dalam alga, protista fotosintesis, tanaman dan bakteri autotrofik
tertentu, seperti cyanobacteria, proteobacteria, dan sebagainya.
- RuBisCO adalah protein paling melimpah yang ditemukan di biosfer. Ini menyumbang
sekitar 50% dan 30% dari total protein daun larut dalam tanaman C3 dan C4.
- Pada tanaman C3, RuBisCO terdapat dalam sel mesofil sedangkan, pada tanaman C4,
RuBisCO terdapat dalam sel seludang berkas.
- Ini adalah protein kompleks besar yang terdiri dari rantai besar dan kecil. Berat molekul
adalah sekitar 540.000 Da.
 - Umumnya terdapat 8 rantai besar yang membentuk 4 dimer dan 8 rantai kecil. Situs
aktif untuk substrat hadir dalam rantai besar. Beberapa bakteri dan dinoflagellata hanya
mengandung subunit besar.
- Rantai besar dikodekan oleh DNA kloroplas dan rantai kecil dikodekan oleh DNA inti.
Rantai kecil diimpor ke stroma kloroplas dari sitoplasma dan Mg 2+ diperlukan untuk
aktivitas enzim.
- RuBisCO tidak aktif dalam gelap dan diaktifkan dalam terang. RuBisCO diaktifkan
dengan mengikat ion CO2 dan Mg2+ ke residu lisin di dekat situs aktif, yang membawa
perubahan konformasi dan stabilitas pada bentuk aktif enzim.

4. Tahap-Tahap RuBisCO dalam Fotosintesis

Bentuk lengkap RuBisCO adalah Ribulosa bifosfat Karboksilase-Oksigenase. RuBisCO
sangat penting untuk fiksasi karbon di pabrik C3, C4 dan CAM. Ini hadir dalam sel mesofil dan
selubung bundel. Ini mengkatalisis reaksi fiksasi karbon dalam siklus Calvin, yaitu karboksilasi
RuBP.

- RuBisCO mengkatalisis langkah pertama fiksasi karbon dalam siklus Calvin. Siklus
Calvin terjadi di semua tumbuhan, yaitu C3, C4 dan CAM.
- Langkah pertama dari siklus Calvin adalah karboksilasi. Di sini, CO2 difiksasi menjadi
zat antara organik yang stabil. RuBP adalah senyawa 5-C. Ini dikarboksilasidengan
memanfaatkan CO2 dan kemudian pemutusan ikatan C-C menghasilkan pembentukan
2 molekul 3-PGA. Reaksi yang dikatalisis oleh RuBisCO adalah sebagai berikut:
RuBP (5C) + CO2 + H2O → 2 3-PGA (3C)
- Reaksi melibatkan enolisasi RuBP diikuti oleh karboksilasi, yang mengarah pada
pembentukan perantara 3-keto-2′-carboxyarabinitol-1,5-bifosfat. Hal ini diikuti oleh
hidrasi, dan kemudian pemutusan berikutnya dari ikatan antara dua karbon untuk
menimbulkan 2 molekul 3-fosfogliserat (3-PGA). 3-PGA yang terbentuk digunakan
dalam pembentukan glukosa dan karbohidrat lain pada langkah selanjutnya.
- Pada tanaman C3, proses ini terjadi di sel mesofil. Di jalur C4, siklus Calvin terjadi di
sel selubung bundel. Sel selubung bundel kaya akan RuBisCO. Ini merupakan adaptasi
untuk mengurangi fotorespirasi pada tanaman C4.
- RuBisCO hadir di pabrik C4. Hal ini hadir dalam sel-sel selubung bundel di mana ia
mengambil bagian dalam siklus Calvin. Pada tanaman C3, RuBisCO aktif dalam sel
mesofil sedangkan pada tanaman C4 terdapat dalam sel seludang berkas.
5. Fotorespirasi
- RuBisCO juga memiliki afinitas terhadap oksigen dan mengoksidasi RuBP dengan
adanya oksigen. Fotorespirasi menggunakan ATP, karenanya, menyebabkan
pemborosan beberapa energi yang dihasilkan dalam fotosintesis.

- Ketika RuBisCO berikatan dengan O2, RuBP akan mengubah RuBP menjadi satu
molekul fosfogliserat (3C) dan fosfoglikolat (2 Karbon). Ini adalah proses limbah, tidak
menghasilkan ATP atau gula.

6. Kendala atau Masalah Pada RuBisCO

Menurut Bar-Even mengungkapkan “RuBisCO adalah jawaban yang bagus untuk semua
kreasionis yang berpikir bahwa Tuhan menciptakan segala sesuatu dengan cara yang sempurna
dan ini berkembang ketika kadar oksigen di atmosfer jauh lebih rendah dari hariini. Ini
mewakili kecelakaan yang membeku. ” Masalah dengan RuBisCO adalah ia cenderung
mengacaukan karbon dioksida dengan oksigen, yang mengarah ke reaksi samping yang sangat
merusak, pembersihan yang membutuhkan banyak energi. Selain itu, belum ada tekanan
evolusioner yang cukup untuk mengatasi kekurangan RuBisCO. “Tanaman tidak perlu
memperbaiki banyak karbon dioksida. Mereka tumbuh sangat lambat, sehingga tingkat fiksasi
yang lambat sudah cukup,” jelas Shota Atsumi dari University of California, Davis.

RuBisCO adalah jawaban yang bagus untuk semua kreasionis yang berpikir bahwa Tuhan
menciptakan segala sesuatu dengan cara yang sempurna. Sejauh ini, para peneliti kurang
berhasil dalam mencoba meningkatkan RuBisCO. “Itu adalah sifat dari enzim. Jika Anda
mencoba membuatnya lebih spesifik, itu menjadi lebih lambat. Jika Anda mencoba
membuatnya lebih cepat, itu kehilangan spesifisitas, ”jelas Erb mengingatkan pada cara orang
kehilangan akurasi ketika mereka bekerja di bawah tekanan waktu. Tetapi ada cara lain untuk
mengatasi masalah tersebut sama seperti ada cara untuk menangani masalah karyawan yang
bekerja lambat. Salah satu strategi mungkin untuk meningkatkan lingkungan kerja untuk
membantu karyawan bekerja dengan potensi penuhnya. Kemungkinan lain adalah untuk
merestrukturisasi alur kerja sehingga kesalahan rekan kerja yang tidak kompeten dikoreksi oleh
orang lain. Last but not least, mungkin bijaksana untuk mengganti pekerja yang tidak efisien
dengan seseorang yang lebih kompeten.

7. Memperbaiki kesalahan RuBisCO

Pada pabrik C3, di mana karbon dioksida dari udara secara langsung difiksasi dalam siklus
Calvin, RuBisCO secara keliru bekerja pada oksigen daripada karbon dioksida sekitar satu dari
tiga hingga lima kali. Reaksi ini menghasilkan produk samping beracun yang disebut
fosfoglikolat, yang perlu dimasukkan kembali ke dalam siklus Calvin melalui jalur yang
disebut fotorespirasi. “Fotorespirasi sangat tidak efisien karena menghabiskan banyak energi.
Tetapi aspek yang paling bermasalah adalah ia melepaskan karbon dioksida, sehingga secara
langsung melawan seluruh tujuan siklus Calvin,” jelas Bar-Even. Ini seperti mengambilempat
langkah maju dan satu langkah mundur.
 Oleh karena itu, Bar-Even dan rekan-rekannya bertujuan untuk melengkapi pabrik dengan
sarana untuk memperbaiki kesalahan RuBisCO dengan lebih murah. “Tujuan kami adalah
untuk memanfaatkan kekuatan rekayasa enzim dan menciptakan jalur baru untuk mendaur
ulang fosfoglikolat ke dalam siklus Calvin sambil melewati pelepasan karbon dioksida. Ini
akan secara dramatis meningkatkan efisiensi fotosintesis,” jelas Bar-Even. Mereka merancang
kemungkinan rute bypass di atas kertas dan kemudian mencari enzim yang sesuai; jika reaksi
spesifik tidak dapat dilakukan oleh enzim yang terjadi secara alami, mereka akan merekayasa
yang sudah ada untuk tugas 2 .

Tantangan besar berikutnya adalah merakit jalur ini menjadi sel hidup pertama menjadi E.
coli sebagai bukti prinsip, tetapi akhirnya menjadi cyanobacteria dan tanaman. Ini tidak akan
menjadi usaha yang mudah. “Hanya mengambil selusin enzim dan mengekspresikannyadalam
sel baru mungkin tidak akan berhasil,” kata Bar-Even. Sebaliknya, ia berencana untuk
melakukannya langkah demi langkah, menciptakan sejumlah strain yang mengekspresikan
sub-jalur yang berbeda. “Kami membuat galur penghapusan gen khusus yang mengekspresikan
segmen tertentu dari jalur kami, sehingga aktivitas modul secara langsung digabungkan dengan
pertumbuhan galur ini,” jelas Bar-Even. “Ini memungkinkan kami untuk langsung memilih
aktivitas modul.” Strain ini kemudian dapat digunakan untuk mengoptimalkan segmen jalur
tertentu ini melalui seleksi alam sebelum modul yang berbeda digabungkan menjadi satu.