Nama Anggota Kelompok :

1. Hilmi Maula Abdillah (1152000008)

2. Muhammad Audy Caesar (1152000041)
3. Ihza Inzaghi (1152000087)
4. Reonaldi Saputro (1152000090)

Pensejajaran sekuen CGAGTAGTG terhadap sekuen CTAGTAG dengan ketentuan:

❖ match : +1
❖ mismatch : -1
❖ gap penalty x : -2
❖ gap penalty y : -2

C T A G T A G
0 -2 -4 -6 -8 -10 -12 -14
C -2 1 -1 -3 -5 -7 -9 -11
G -4 -1 0 -2 -2 -4 -6 -8
A -6 -3 -2 1 -1 -3 -3 -5
G -8 -5 -4 -1 2 0 -2 -2
T -10 -7 -4 -3 0 3 1 -1
A -12 -9 -6 -3 -2 1 4 2
G -14 -11 -8 -5 -2 -1 2 5
T -16 -13 -10 -7 -4 -1 0 3
G -18 -15 -12 -9 -6 3 2 1
Tracing Back dan penulisannya

C T A G T A G
0 -2 -4 -6 -8 -10 -12 -14
C -2 1 -1 -3 -5 -7 -9 -11
G -4 -1 0 -2 -2 -4 -6 -8
A -6 -3 -2 1 -1 -3 -3 -5
G -8 -5 -4 -1 2 0 -2 -2
T -10 -7 -4 -3 0 3 1 -1
A -12 -9 -6 -3 -2 1 4 2
G -14 -11 -8 -5 -2 -1 2 5
T -16 -13 -10 -7 -4 -1 0 3
G -18 -15 -12 -9 -6 3 2 1

Terhadap penjajaran diatas maka hasil sebagai berikut :

1. Pada M(9,7) dengan nilai 1, basa nucleotide sama (match) yaitu G dan G, maka
langsung ke kiri atas.
2. Pada M(8,6) dengan nilai 0, basa nucleotide berbeda (mismatch) yaitu T dan A,
maka dipilih nilai terbesar yaitu 2. Nilai terbesarnya berada di atas, maka terjadi
insertion.
3. Pada M(7,6) dengan nilai 2, basa nucleotide berbeda (mismatch) yaitu G dan A,
maka dipilih nilai terbesar yaitu 4. Nilai terbesarnya berada di atas, maka terjadi
insertion.
4. Pada M(6,6) dengan nilai 4, basa nucleotide sama (match) yaitu A dan A, maka
langsung ke kiri atas.
5. Pada M(5,5) dengan nilai 3, basa nucleotide sama (match) yaitu T dan T, maka
langsung ke kiri atas.
6. Pada M(7,6) dengan nilai 2, basa nucleotide berbeda (mismatch) yaitu G dan A,
maka dipilih nilai terbesar yaitu 4. Nilai terbesarnya berada di atas, maka terjadi
insertion.
7. Pada M(3,3) dengan nilai 1, basa nucleotide sama (match) yaitu A dan A, maka
langsung ke kiri atas.
 8. Pada M(2,2) dengan nilai 0, basa nucleotide berbeda (mismatch) yaitu G dan T,
maka dipilih nilai terbesar yaitu 1. Nilai terbesarnya berada di kiri atas, maka
terjadi mutation.
9. Pada M(1,1) dengan nilai 1, basa nucleotide sama (match) yaitu C dan C, maka
langsung ke kiri atas.

Hasil dari penjajaran sebagai berikut :

C T A G T A G
C G A G T A G
G T

insert
mutation