Scribd Logo
Unggah

Selamat datang di Scribd!

  • 9 MARKA MOLEKULER - Scoring

    Diunggah oleh

    Salma Wafiana
    33 tayangan9 halaman
    Dokumen tersebut membahas analisis keragaman genetik pada beberapa spesies tanaman, yaitu nangka, manggis, dan anggrek, menggunakan marka molekular ISSR. Beberapa hasil yang diuraikan adalah pola pita DNA yang dihasilkan dari PCR menggunakan primer ISSR pada berbagai aksesi, serta perbandingan pola pita antara genotipe mutan dan non-mutan untuk mengetahui adanya variasi genetik.

    Deskripsi Asli:

    Judul Asli

    9 MARKA MOLEKULER - scoring

    Hak Cipta

    © © All Rights Reserved

    Format Tersedia

    PPTX, PDF, TXT atau baca online dari Scribd

    Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

    Apakah konten ini tidak pantas?

    Laporkan Dokumen Ini
    Dokumen tersebut membahas analisis keragaman genetik pada beberapa spesies tanaman, yaitu nangka, manggis, dan anggrek, menggunakan marka molekular ISSR. Beberapa hasil yang diuraikan adalah pola pita DNA yang dihasilkan dari PCR menggunakan primer ISSR pada berbagai aksesi, serta perbandingan pola pita antara genotipe mutan dan non-mutan untuk mengetahui adanya variasi genetik.

    Hak Cipta:

    © All Rights Reserved
    Unduh sebagai PPTX, PDF, TXT atau baca online dari Scribd
    Tandai sebagai konten tidak pantas
    33 tayangan9 halaman

    9 MARKA MOLEKULER - Scoring

    Diunggah oleh

    Salma Wafiana
    Dokumen tersebut membahas analisis keragaman genetik pada beberapa spesies tanaman, yaitu nangka, manggis, dan anggrek, menggunakan marka molekular ISSR. Beberapa hasil yang diuraikan adalah pola pita DNA yang dihasilkan dari PCR menggunakan primer ISSR pada berbagai aksesi, serta perbandingan pola pita antara genotipe mutan dan non-mutan untuk mengetahui adanya variasi genetik.

    Hak Cipta:

    © All Rights Reserved
    Unduh sebagai PPTX, PDF, TXT atau baca online dari Scribd
    Tandai sebagai konten tidak pantas
    dari 9

    MARKA MOLEKULAR

    MARKA MOLEKULAR
    Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)
    AUKSIN
    SEL

    Area amplifikasi menurut Zietkiewicz et al. (1994)


    MARKA MORFOLOGI
    Keanekaragaman Genus Artocarpus, Famili Moraceae

    No Aksesi
    AUKSIN

    A Kunir1
    B Kapuk1
    C Bola2
    SEL

    A B C D Telanjang
    E Kandel Cipaku
    F Marang

    D E G
    Sumber : Sulassih, Sobir. E. Santosa., M.R. Tirtawinata. 2013. Variability of Jack Fruit (Artocarpus heterophyllus Lam.) based on
    morphological and ISSR Molecular markers. International Seminar on Tropical Horticulture 28-29 November 2016. Bogor.
    MARKA MOLEKULAR
    ISSR Markers of Jackfruit

    Marang A
    Kapuk2
    Bola3
    Bola2
    Kapuk1
    Sempur2
    MerahPutih
    AUKSIN

    Mas
    KandelCipaku B
    Kandel
    Telanjang
    PondokRumput2
    Sempur1
    Salak
    SEL

    Kunir2
    Kunir1
    Babakanmadang4
    Darmaga
    Barata
    Babakanmadang2
    Babakanmadang5
    Babakanmadang1
    PondokRumput1
    Cimanggu
    Babakanmadang3
    Cikabayan
    Bantarkambing
    C
    Tanahbaru
    Sindangsari2
    Leuwisadeng
    Sindangsari1
    Leuwisadeng1

    Group A is outgroup, group B and C


    0.15 0.10 0.05 0.00
    mixing small fruit and long shape.
    Dissimilarity coefficient
    • Pola pita polimorfik pada 32 aksesi nangka menggunakan primer ISSR PKBT 6 (AG)8TT suhu annealing temperatur 53 0C

    Kb KU1 KU2 KA SA KP1 KP2 BO2 BO3 MA TJ KAC MP SE1 SE2 PD2 MR

    1000 bp
    750 bp
    500 bp

    250 bp

    16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32

    PKBT6_250 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

    PKBT6_300 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1

    PKBT6_400 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1

    PKBT6_500 0 1 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0

    PKBT6_600

    PKBT6_750

    PKBT6_900

    PKBT6_1000
    MARKA MOLEKULAR
    Pola pita monomorfik pada 32 aksesi manggis menggunakan primer ISSR
    PKBT 6 yaitu (AG)8TT pada suhu annealing temperatur 53 0C
    SEL

    1000 bp
    750 bp
    500 bp

    250 bp
    TUGAS
    1. Analisis scoring DNA Anggrek hasil mutasi dengan sinar gamma. Proses PCR
    menggunakan primer ISSR PKBT2.
    2. Bandingkan genotipe tanpa mutasi (M0) dengan genotipe mutan (M1-M12)
    3. Apakah terdapat keragaman genetik pada genotipe anggrek?

    Kb M0 M1 M2 M3 M4 M6 M7 M8 M9 M10 M11 M12 M5 kb

    2000 bp
    1500 bp
    1000 bp
    750 bp
    500 bp

    250 bp
    MARKA MOLEKULAR
    1. Analisis scoring DNA Anggrek hasil mutasi dengan sinar gamma. Proses PCR
    menggunakan primer ISSR PKBT9.
    2. Bandingkan genotipe tanpa mutasi (M0) dengan genotipe mutan (M1-M12)
    3. Apakah terdapat keragaman genetik pada genotipe anggrek?

    Kb M0 M1 M2 M3 M4 M6 M7 M8 M9 M10 M11 M12 M5 kb


    SEL

    1000 bp
    750 bp
    500 bp

    250 bp
    TUGAS
    Analisis scoring DNA Manggis Sumatera Utara (2-3) dan varietas pembanding yaitu varietas Wanayasa.
    Hasil PCR dengan menggunakan primer ISSR (PKBT6, PKBT7) dan RAPD (SBH13, SBH19)
    1. Bandingkan aksesi manggis Sumatera Utara (2-4) dengan varietas pembanding (1= varietas
    Wanayasa)
    2. Apakah terdapat keragaman genetik pada aksesi manggis Sumatera Utara?
    3. Apakah aksesi Sumatera Utara dapat dijadikan sebagai varietas baru? Sebutkan calon kadidat
    varietas baru/calon Pohon Induk Tunggal (PIT).

    PKBT6 PKBT7 SBH13 SBH 19


    SEL

    kb 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4

    1000 bp
    750 bp
    500 bp

    250 bp

    Anda mungkin juga menyukai