Canada Says COVID Maybe

Here 'Since 2013,' Mask

Fallacies & "Strike Teams"
Enforcing New Lockdown

Disusun : Wahyu Ramadhan (1102015246)

Pembimbing : dr. Ferryal Basbeth, Sp.F

KEPANITERAAN KLINIK BAGIAN FORENSIK

FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS YARSI
00.00 s/d 00.40
June 27, 2020 07:06:53 IST
Berdasarkan artikel yang diterbitkan oleh ‘Firstpost.”
• Para ilmuwan di University of Calgary di Kanada mengatakan bahwa novel
coronavirus (SARS-CoV-2) mungkin telah beredar di antara manusia
setidaknya sejak 2013, meskipun bukan varian yang sama yang
bertanggung jawab atas pandemi COVID-19 saat ini.
• Evolusi : Dalam kasus virus corona, telah ditemukan bahwa virus hidup di
dalam kelelawar tanpa menimbulkan banyak kerusakan karena sistem
kekebalan kelelawar telah berevolusi untuk menjaga virus tetap terkendali.
Namun tidak demikian halnya dengan manusia. Akibatnya, kita rentan
jatuh sakit.
Sebuah kisah evolusi
• Untuk penelitian ini, para peneliti di University of Calgary melihat sekitar
479 urutan genom dari novel coronavirus yang dikumpulkan antara 30
Desember 2019, dan 20 Maret 2020, untuk memahami filogeni - yang
berarti perkembangan evolusioner virus dan hubungannya dengan virus
lain. virus yang terkait erat.
• Dari semua genom, para peneliti menemukan sekitar 16 varian virus dan
sekitar 11 mutasi missense (di mana perubahan nukleotida tunggal
membuat DNA / RNA menjadi kode untuk protein yang berbeda) di lebih
dari 5 persen infeksi, masing-masing membuat pohon filogenetik mereka
sendiri.
• Salah satu temuan awal mereka adalah
kemiripan dengan virus corona kelelawar
dan trenggiling. Genom SARS-CoV-2 telah
ditemukan memiliki setidaknya 96%
kesamaan dengan virus corona kelelawar -
RaTG13 - dan sekitar 90% dengan
coronavirus trenggiling (Pangolin-CoV).
• Sehingga kemungkinan virus COVID-19
saat ini adalah kombinasi dari kedua virus
ini yang dibuat karena koinfeksi pada
inang.
Mempelajari asal usul COVID-19
• Para peneliti mencoba membuat urutan
leluhur dari domain pengikat reseptor dari
lonjakan protein SARS-CoV-2. Domain
pengikat reseptor adalah bagian dari lonjakan
protein yang benar-benar mengidentifikasi
dan mengikat dengan reseptor ACE-2.
• Mereka menciptakan urutan leluhur yang
sama untuk semua virus SARS-COV-2 dan
menandainya N1 dan nenek moyangnya yang
sama dengan virus hewan terdekat - berlabel
N0 (N-Zero).
Inilah yang ditemukan
• Urutan N1 sama dengan urutan referensi dari virus SARS-CoV-2,
sedangkan urutan N0 unik, menunjukkan asal virus yang unik.
• Dua urutan RNA / DNA hanya berbeda pada empat posisi.
• Urutan leluhur memunculkan berbagai keturunan dan RaTG13 adalah
salah satu kerabat terdekat virus SARS-COV-2. Sejak RaTG13
ditemukan sekitar tahun 2013, nenek moyang asli virus penyebab
COVID-19 pasti ada pada saat itu juga.
• Menariknya, varian virus sebelumnya terikat jauh lebih kuat ke hACE2
daripada yang baru-baru ini.
 ABSTRAK
• Berevolusi dari zoonosis
• Kerabat evolusioner terdekatnya adalah Coronavirus
kelelawar (RaTG13)
• Kami menggunakan analisis filogenetik terperinci,
rekonstruksi urutan leluhur, dan simulasi dinamika
molekuler untuk memeriksa evolusi fungsional Spike-
RBD, yang mengejutkan kami bahwa ia kemungkinan
memiliki afinitas tinggi untuk target sel manusia
setidaknya sejak 2013.
Spike glycoprotein Receptor Binding Domain (RBD) (yang memediasi masuknya
virus ke dalam sel inang), Pengikatan Spike-RBD ke human angiotensin converting
enzyme 2 (hACE2) memediasi masuknya seluler SARS-CoV-2.
SARS-CoV-2 terdeteksi di Barcelona pada air limbah jauh sebelum kasus pertama
COVID-19 dideklarasikan, menunjukkan bahwa infeksi telah ada pada populasi
sebelum kasus impor pertama dilaporkan. Surveilans sentinel SARS-CoV-2 di air
limbah akan memungkinkan penerapan tindakan segera jika terjadi gelombang
COVID-19 di masa depan.
Metode
• Untuk menjelaskan evolusi COVID-19 di Barcelona, sampel limbah mentah
komposit 24 jam dari dua pabrik pengolahan air limbah besar (WWTP1 dan
WWTP2) dianalisis mingguan untuk mengetahui keberadaan SARS-CoV-2 mulai 13
April, di puncak epidemi, hingga 25 Mei. Selain itu, untuk IPAL2, sampel arsip
beku dari 2018 (Januari-Maret), 2019 (Januari, Maret, September-Desember) dan
2020 (Januari-Maret) juga diuji.
• Delapan ratus mililiter sampel air limbah dipekatkan melalui presipitasi dengan
20% polietilen-glikol 6000 dan disuspensi kembali dalam 3 mL PBS, pH 7,4 (9).
Ekstraksi asam nukleat dilakukan dari 1mL konsentrat dan dielusi dalam 50 μL
menggunakan sistem ekstraksi NucliSENS® miniMAG® (bioMérieux).
• Five one-step RT-qPCR assays (RNA UltraSense™ One-Step Quantitative RT-PCR
System, Invitrogen, Life Technologies)
Hasil
• Pada IPAL1, jumlah salinan genom SARS-CoV-2 secara bertahap menurun dari 13
April hingga 18 Mei. Penurunan ini diamati menggunakan target IP2 dan IP4.
• Pada IPAL2, Tanpa diduga, analisis sampel arsip mengungkapkan peningkatan
kejadian genom SARS-CoV-2 dalam sampel dari 15 Januari hingga 4 Maret 2020 .
Sebagai catatan, SARS-CoV-2 terdeteksi di limbah 41 hari (15 Januari) sebelum
deklarasi kasus COVID-19 pertama (25 Februari), dengan jelas membuktikan
validitas pengawasan air limbah untuk mengantisipasi kasus di populasi.
• Epidemiologi berbasis air limbah merupakan alat peringatan dini peredaran virus
dalam populasi, termasuk penurun simptomatik dan asimtomatik. Dapat juga
menyerukan untuk pengawasan penjaga SARS-CoV-2 dalam air limbah untuk
memungkinkan tindakan mitigasi yang cepat jika terjadi gelombang pandemi
infeksi di masa depan.
Laporan langsung dari CDC bulan mei 2020 mengatakan :
Masker bedah yang dirancang untuk dipakai oleh petugas medis untuk melindungi
kontaminasi luka pasien yang tidak disengaja, dan untuk melindungi pemakainya dari percikan
cairan tubuh. Namun, bukti tentang keefektifannya masih terbatas dalam mencegah penularan
virus influenza baik saat dipakai oleh orang yang terinfeksi untuk pengendalian sumber atau
saat dipakai oleh orang yang tidak terinfeksi untuk mengurangi paparan. Tinjauan sistematis
kami tidak menemukan efek signifikan dari masker wajah pada penularan influenza yang
dikonfirmasi di laboratorium.
 Tidak ada penurunan yang
signifikan dalam penularan
influenza dengan penggunaan
masker wajah (RR 0,78, 95%
CI 0,51–1,20; I2 = 30%, p =
0,25)
Cloth face coverings Tidak akan melindungi pemakainya dari agen infeksi yang dapat
ditularkan melalui udara karena ukuran yang longgar dan tidak adanya
Surgical masks segel atau penyaringan yang tidak memadai
• Secara keseluruhan ada kekurangan bukti substansial untuk mendukung klaim
bahwa masker wajah melindungi pasien atau ahli bedah dari kontaminasi
infeksius.
THANK YOU