Miniriset bioinformatika

ANALISIS IN SILICO SENYAWA

HIBISCETIN DARI TANAMAN
ROSELLA (HIBISCUS SABDARIFFA)
DAN
POTENSINYASEBAGAIANTIKANKER
oleh kelompok 6: Nur Fadhilatus Shofiyah
(19620028)
Zidni Istiqfarin (19620061)
R a b i a h Tu l H a d a w i y a h
Miniriset bioinformatika
Page 02 of 12

PENDAHUL
UAN
• Obat kemoterapi atau antikanker biasanya merusak sel dan menimbulkan toksisitas
karena ikut menghambat pertumbuhan sel normal.
• Oleh karena itu, Alternatif yang digunakan dalam terapi kanker yaitu dengan
memanfaatkan bahan-bahan alam yang mempunyai prospek sebagai penghambat
kanker.
• Salah satu senyawa yang berpotensi sebagai antikanker yaitu hibiscetin yang
merupakan senyawa aktif dari bunga rosella (Hibiscus sabdariffa).
• pengunaan rosella di bidang kesehatan belum begitu popular. Namun akhir-akhir ini,
minuman berbahan rosella mulai banyak dikenal sebagai minuman kesehatan.
• Overekspresi protein EGFR sering diasosiasikan dengan perkembangan stadium kanker
dan metastasis dari sejumlah kanker
• Selama beberapa tahun terakhir, EGFR banyak menjadi protein target dalam • Hibiscus • flower petals
perkembangan obat
Sabdariffa
 METODE
Miniriset bioinformatika
langkah kerja
• Diunduh sampel ligan menggunakan software Pubchem compound
• Diunduh reseptor menggunakan software PDB
• Dianalisis ligan terkait sifatnya sebagai senyawa obat
• Dilakukan preparasi protein reseptor menggunakan software Pymol
• Dilakukan preparasi kontrol menggunakan software Pymol
• Dilakukan penambatan molekuler (Molecular Docking) dengan menggunakan
software PyRx
• Divisualisasi hasil docking dengan menggunakan software Pymol
• Ditentukan jenis reaksi dengan menggunakan discovery studio
• Dianalisis data yang diperoleh

Page 03 of 12
 hasil dan
pembahasan
 Page 05 of 12
Miniriset bioinformatika

PASS
PREDIC
TION
 Page 06 of 12
Miniriset bioinformatika

UJI
FARMA
KO
KINETI
K
Miniriset bioinformatika Preparasi Prot ein Page 07 of 12

dan kontrol
 Miniriset MOLECULAR DOCKING Page 08 of 12

bioinformatika
DAN
JENIS INTERAKSI

Posisi binding site ligan (kuning) dan kontrol

(merah) pada target protein EGFR
koordinat X: -38.785; Y:-7.8570; Z: -2.9109

Visualisasi antara kontrol LN2380 (merah) dan Hibiscetin (kuning)

menggunakan pymol
 Page 09 of 12
Miniriset bioinformatika

NILAI
AFINI
TAS
 Page 10 of 12
Miniriset bioinformatika

Visualisasi
struktur jenis
ikatan ligan-
eseptor (EGFR)
secara 2D
 Page 11 of 12
miniriset bioinformatika

KESIMPULAN DAN
SARAN
Berdasarkan proses molekular docking yang telah dilakukan, maka disimpulkan
bahwa senyawa hibiscetin dari bunga rosella kemungkinan bisa menghambat
aktivitas EGFR seperti halnya kontrol karena memiliki nilai afinitas yang rendah,
bahkan lebih rendah dibandingkan kontrol. Oleh karena itu, perlu dilakukan uji
lanjutan lain seperti uji toksisitas dan uji lainnya serta dapat dilanjutkan uji secara in
vitro di laboratorium untuk mendapatkan hasil sebagai antikanker.
thank
Any Question?

you !!