Fel21 GATTCCGGCGTGCTATAATGCAGTCGAGCGATGGATTAAGAGCTTGCTC

TTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCA
TAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTT
TGAACCGCATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGG
ATGGACCCGCGTCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGG
CAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTG
AGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGC
AATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCTT
TCGGGTCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCTAGTTGAATA
AGCTGGCACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTG
CCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTG
GGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCAC
GGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAA
GAGGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATATGGA
GGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGG
CGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG
CCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCT
GAAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCT
GAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG
GTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCT
GACAACCCTAGAGATAGGGCTTCTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTG
GTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
CAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTC
TAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGGGGGGGATGAACGTC
AAATCATCATGGCCCCTTATGACCTGGGGCTAACCACCGTGGTTACAAT
GGAACGGTACAAAAAACTTGCAAGACCCCCGAGGTGGAAGCTAAACCTC
ATAAAAACCGTTTCTAAGTTCGGAATGGGAAGGCTGCAACTTCGCCCTA
CTTGAAAGCTGGGAATCCCTTTGGTAA
Nama : Dandi Asmawi

Nim :1804111123

Jurusan : Ilmu Kelautan/B

Mata Kuliah : Aplikasi Mikrobiologi Laut

• Pilih satu pasta dalam lampiran 1.

• Cari nama jenis bakterinya pada web
• Cari kepustakaaan apa fungsi bakteri tersebut
• Buat filogenetiknya. Seperti hal paper

Hasil penelusuran sekuen 16S rDNA isolat bakteri dengan sistem BLAST
A. Isolat, species, ID, Query Coverage dan Homology
Isola Species ID Query Homology
t Coverage
a Bacillus careus MG737476 100% 100%
b Bacillus careus MG751107 99% 97.82%
c Bacillus KY750685 99% 97.52%
d Bacillus careus MG696052 99% 97.59%
e Bacillus careus MH552993 99% 97.31%

B. Pohon filogenetik masing – masing isolat

C. Fungsi

Bacillus careus
 Kelompok Bacillus cereus saat ini terdiri dari tujuh jenis Bacillus , yaitu B.
anthracis, B. cereus, B. mycoides, B. pseudomycoides, B. thuringiensis, B.
weihenstephanensis , dan anggota kelompok yang paling baru dikenal, B.
cytotoxicus , yang merupakan toleransi termotoleran. Ada dua jenis penyakit
bawaan makanan B. cereus . Jenis pertama, yang disebabkan oleh racun emetik,
menyebabkan muntah, sedangkan jenis kedua, yang disebabkan oleh enterotoksin,
menyebabkan diare. Enterotoksin B. cereus yang paling baru ditemukan,
sitotoksin K (CytK), mirip dengan toksin β dari Clostridium perfringens (dan
racun terkait lainnya) dan merupakan agen penyebab dalam wabah parahPenyakit
bawaan makanan B. cereus di Prancis pada tahun 1998. Kedua jenis penyakit
bawaan makanan B. cereus disebabkan oleh jenis racun yang sangat berbeda
termasuk toksin emetik dan enterotoksin. Ekspresi toksin B. cereus Hb1, Nhe, dan
CytK diatur oleh sistem penginderaan kuorum PlcR. Spora B. cereus merupakan
faktor penting yang berkontribusi pada penyakit bawaan makanan. The B. cereus
spora lebih hidrofobik dari spora dari yang lain Bacillus spp., Yang
memungkinkan untuk mematuhi beberapa jenis permukaan. B. cereuspenyakit
bawaan makanan kemungkinan besar jarang dilaporkan karena gejalanya yang
relatif ringan dengan durasi yang singkat. Namun, minat konsumen yang
meningkat untuk produk makanan yang dimasak dan didinginkan dengan umur
simpan yang diperpanjang mungkin cocok untuk kelangsungan hidup dan
pertumbuhan B. cereus . Makanan semacam itu dapat meningkatkan keunggulan
B. cereus sebagai patogen bawaan makanan.
 Kitinase merupakan enzim yang menghidrolisis polimer kitin menjadi
oligomer kitin atau monomer Nasetilglukosamin. Penelitian ini bertujuan
melakukan isolasi dan karakterisasi kitinase untuk memperoleh informasi aktivitas
optimum kitinase asal B. cereus 11 UJ. Isolasi enzim kasar kitinase dan purifikasi
parsial dilakukan dengan pengendapan amonium sulfat jenuh 70% dan dialisis
menggunakan membran selofan, selanjutnya dikarakterisasi untuk memperoleh
aktivitas optimum pada berbagai kondisi pH, suhu, waktu inkubasi, ion logam
serta penentuan nilai Km dan Vmaks. Hasil penelitian menunjukkan pemurnian
kitinase dengan amonium sulfat 70% dan dialisis menunjukkan tingkat kemurnian
masing-masing 2.40 kali dan 5.23 kali dibandingkan dengan ekstrak kasar enzim.
Hasil karakterisasi menunjukkan bahwa kitinase asal B. cereus isolat 11 UJ
mempunyai pH optimum 8, suhu optimum 37oC, dan waktu inkubasi optimum
selama 120 menit. Kation Mn2+, Fe2+, dan Cu2+ dengan konsentrasi 10 mM
diketahui dapat berfungsi sebagai inhibitor. Kitinase mempunyai nilai Km sebesar
29.71 μg/mL dan Vmaks sebesar 1.035 x 10-1 μg/mL detik.

Untuk memperkirakan set gen minimal yang diperlukan untuk

mempertahankan kehidupan bakteri dalam kondisi bergizi, kami melakukan
inaktivasi sistematis Bacillus subtilis.gen. Di antara ≈4.100 gen organisme, hanya
192 yang terbukti sangat diperlukan oleh penelitian ini atau sebelumnya. 79 gen
lainnya diperkirakan menjadi penting. Sebagian besar gen esensial dikategorikan
dalam domain metabolisme sel yang relatif sedikit, dengan sekitar setengahnya
terlibat dalam pemrosesan informasi, seperlima terlibat dalam sintesis selubung
sel dan penentuan bentuk dan pembelahan sel, dan sepersepuluh terkait dengan
sel. energetika. Hanya 4% dari gen esensial yang menyandikan fungsi yang tidak
diketahui. Gen paling penting hadir di berbagai Bakteri, dan hampir 70% juga
dapat ditemukan di Archaea dan Eucarya. Namun, gen penting yang terkait
dengan selubung, bentuk, pembelahan, dan respirasi sel cenderung hilang dari
bakteri dengan genom kecil. Tanpa diduga, sebagian besar gen yang terlibat
dalam jalur Embden – Meyerhof – Parnas sangat penting.