Judul jurnal yang saya ambil yaitu ‘Biofilm Formation and Antimicrobial Susceptibility of

Staphylococcus epidermidis Strains from a Hospital Environment’

Alasan yang mendasari saya memilih jurnal tersebut dikarenakan pembahasan yang menarik
terkait dengan pembentukan biofilm dari mikroba pada lingkungan rumah sakit, dimana hal ini
menjadi pengetahuan baru terkait bagaimana menyikapi penyakit yang bisa disebabkan oleh
mikrobia yang terbentuk di lingkungan rumah sakit. Sebagaimana diketahui penyakit infeksi
nosocomial adalah penyakit yang diakibatkan oleh penggunaan berbagai jenis perangkat medis
dengan permukaan yang terkontaminasi dengan bakteri pathogen.
Tujuan peneliti melakukan penelitian ini adalah untuk mengevaluasi prevalensi
pembentukan biofilm stafilokokus koagulase-negatif (CoNS) di lingkungan rumah sakit
sebagai faktor risiko infeksi nosokomial. Sebagaimana diketahui Penyakit infeksi nosokomial
diidentifikasi dalam sekitar tiga juta orang di Uni Eropa setiap tahun dan sekitar 50.000 dari
mereka fatal. Infeksi ini juga dapat mempengaruhi tenaga medis, pengunjung pasien dan staf
pendukung rumah sakit. Sekitar 60% -70% infeksi nosokomial berhubungan dengan
penggunaan berbagai jenis perangkat medis dengan permukaan yang terkontaminasi dengan
bakteri patogen dan terlebih lagi, the tangan yang terkontaminasi dari tenaga medis juga
dianggap sebagai salah satu jalur nosocomial penyebaran infeksi. Telah ditunjukkan bahwa
penggunaan disinfektan yang tepat dapat mengurangi secara signifikan konten
mikroorganisme dan dengan demikian mengurangi risiko infeksi nosokomial terkait rumah
sakit lebih banyak dari 40% . Karena berkurangnya kerentanan mikroorganisme pembentuk
biofilm terhadap antibiotik dan beberapa desinfektan teknik disinfeksi kulit yang umum
digunakan tampaknya tidak efisien.
Karena itu untuk mengurangi risiko infeksi yang terkait dengan mikroorganisme ini, penting
untuk dilakukan memperkenalkan prosedur desinfeksi yang lebih ketat untuk menghilangkan
strain biofilm dari umum lingkungan rumah sakit. Banyak mikroorganisme di lingkungan
alami diorganisasikan dalam struktur biofilm [8]. Biofilm dapat didefinisikan sebagai
komunitas bakteri multiseluler, diimobilisasi oleh polimer ekstraseluler matriks yang
diproduksi oleh bakteri, yang dapat melekat pada berbagai permukaan biotik dan abiotic.
Struktur biofilm tiga dimensi ini dibuat dalam 85% oleh matriks ekstraseluler yang
terdiri dari polisakarida, protein, enzim, DNA, glikolipid bakteri, air, dan dalam 15% oleh
agregat sel mikroorganisme [8]. Pengembangan biofilm tergantung pada banyak fisik, kimia
dan faktor biologis. Dalam stafilokokus, molekul utama yang bertanggung jawab untuk
adhesi antar sel adalah polisakarida interselular adhesin (PIA), juga dikenal sebagai poly-N-
acetylglucosamine (PNAG). Ini adalah polimer sebagian terdeasilasi dari β-1,6-N-
acetylglucosamine, yang dengan polimer lain seperti karena asam teichoic dan protein dapat
membentuk bagian utama dari matriks ekstraseluler. Baru-baru ini, PIA homolog
diidentifikasi dalam banyak patogen dengan kemampuan pembentukan biofilm, yang
menunjukkan bahwa pembentukan matriks tiga dimensi memainkan peran penting dalam
virulensi bakteri dalam biofilm infeksi [12-14].
Biosintesis PIA dilakukan oleh protein yang disandikan oleh operon gen ica :
N-acetylglucosamine transferase ( icaA dan icaD ), PIA deacylase ( icaB ), eksportir PIA (
icaC ) dan gen pengatur ( icaR ) [15,16]. Ekspresi lokus Ica diatur oleh berbagai faktor
lingkungan dan protein pengatur internal. Biosintesis dan deasetilasi PIA diakui sangat
penting faktor virulensi pada infeksi terkait Staphylococcus epidermidis

Metode yan digunakan

Sebanyak 122 strain stafilokokus koagulase-negatif diisolasi dari lingkungan rumah sakit
termasuk dalam penelitian yang disajikan. Sampel dikumpulkan dari udara dan permukaan di
rumah sakit.
Metode sedimentasi digunakan untuk pengumpulan sampel udara, di mana cawan Petri
mengandungmedia pertumbuhan nutrisi terpapar ke lingkungan selama satu jam.
Pelat kontak Deteksi dan Penghitungan Organisme Replikasi Standar (RODAC) (BTL, Łódź,
Polandia) mengandung agen penetralisir yang menonaktifkan disinfektan residual apa pun
yang digunakan
pengumpulan bakteri dari permukaan. Agar cembung meniskus memungkinkan aplikasi
langsung ke yang diuji permukaan misalnya dinding, lantai, peralatan medis, peralatan untuk
kontrol kebersihan.
Metode mikrobiologis rutin dengan sistem identifikasi MICRONAUT semi-otomatis
(Merlin-Virotech, Bornheim-Hersel, Jerman) digunakan untuk identifikasi spesies bakteri.
Sampel disimpan untuk analisis masa depan dalam medium TBE dengan 20% gliserol, pada
-86 ° C
2.1. Analisis Produksi Biofilm oleh Congo Red Agar (CRA).
Karakterisasi fenotipik produksi biofilm dilakukan oleh kultur isolat CoNS
di piring CRA seperti yang dijelaskan sebelumnya oleh Freeman et al. [26]. Kaldu infus otak-
jantung yang spesifik (BHI) medium yang dilengkapi dengan sukrosa 5% dan Congo Red
disiapkan. Medium itu terdiri dari BHI (37 g / L), sukrosa (50 g / L), No. 1 agar (10 g / L) dan
Congo Red stain (0,8 g / L).
Pelat diinokulasi dan diinkubasi dalam lingkungan aerobik selama 24 jam pada 37 °
C. Dalam kondisi seperti itu, produsen biofilm membentuk koloni berkerak hitam pada CRA,
sedangkan non-produsen membentuk koloni merah. SEBUAH penggelapan koloni dengan
tidak adanya morfologi kolonial kristal kering menunjukkan suatu hasil antara
2.2.Microtiter Plate Assay (TCP)
Untuk mengevaluasi pembentukan biofilm, kami melakukan uji pelat mikrotiter
termodifikasi yang dijelaskan oleh Christensen et al. Bakteri ditangguhkan di Muller-Hinton
Broth (MHB-BTL, Łodź, Poland) di
Kepadatan setara dengan 0,5 McFarland standar dan 100 μL dari setiap suspensi bakteri
diinokulasi ke piring mikrokultur jaringan 96-well. Pelat diinkubasi pada suhu 37 ° C selama
24 jam suasana normal. Untuk menghilangkan bakteri planktonik mengambang bebas,
medium dipindahkan dan sumur dicuci 3 kali dengan buffer salin fosfat (PBS, pH = 7,2).
Kemudian 150 μL dari 1% kristal violet (Sigma) ditambahkan ke setiap sumur dan diinkubasi
selama 30 menit pada suhu kamar. Pewarna telah dihapus, dengan 4 × mencuci dengan air
deionisasi steril. Sampel diinkubasi dengan 200 μL dari 95% isopropanol dalam 1 M HCl
selama 5 menit. Akhirnya, 100 μL isopropanol berwarna dari masing-masing sumur
dipindahkan ke piring mikrotiter segar. Densitas optis (OD) suspensi diukur pada gelombang
panjangnya 490 nm dengan pembaca microplate Multitec SX.
Kontrol negatif terdiri dari semua reagen tetapi tanpa inokulum bakteri. Berdasarkan
Christensen et al. [27], sampel dengan OD> 0,11 harus dianggap positif. Pengujian
dilakukan dalam rangkap tiga. Berarti nilai A 490 ± SD dihitung. Dalam penelitian ini, strain
bakteri dianggap tidak patuh ketika OD sama atau lebih rendah dari 0,11; lemah patuh ketika
OD lebih tinggi dari 0,11 atau sama atau lebih rendah dari 0,17 dan sangat patuh ketika OD
lebih tinggi dari 0,17.
2.3. Deteksi Strain icaADBC Gen S. epidermidis
Bakteri DNA diisolasi menggunakan Genomic DNA Mini Kit (BLIRT SA, Gdańsk,
Polandia). Secara singkat, semua isolat yang disimpan pada suhu -86 ° C dicairkan dan
diperluas secara in vitro pada pelat agar darah dan diperiksa kemurnian strain sebelum isolasi
DNA. Pada langkah selanjutnya 3-4 koloni bakteri ditangguhkan 100 μL TRIS buffer dengan
10 μL lysostaphine (1 mg / mL; BLIRT SA, Gdańsk, Polandia) dan diinkubasi pada 37 ° C
selama 30 menit. Campuran diperlakukan dengan proteinase K dan LT Buffer pada 37 ° C
untuk semalam dari diinkubasi pada 75 ° C selama 5 menit. Sampel DNA dimurnikan sesuai
dengan protokol dengan penggunaannya dari etanol dan buffer cuci yang disediakan dalam
kit, dan akhirnya diencerkan hingga 200 μL dengan buffer TRIS. Dimurnikan Sampel DNA
disimpan pada suhu -20 ° C untuk analisis di masa depan
2.4. Pengujian Kerentanan Antimikroba
Kerentanan antimikroba terhadap cefoxitin (FOX), erythromycin (E), clindamycin (DA),
tetrasiklin (T), kloramfenikol (C), siprofloksasin (CIP), gentamisin (CN), rifampisin (RIF),
linezolid (LIN) dan trimethoprim / sulphamethoxazole (SXT) diuji dengan metode disk-difusi
dan ditafsirkan menurut pedoman EUCAST [30]. Cak antibiotik komersial (EMAPOL,
Gdańsk, Polandia) dan media agar Mueller-Hinton (BTL, Łódź, Polandia) digunakan dalam
tes in
HASIL
Sampel mikrobiologis dari lingkungan rumah sakit dikumpulkan antara November 2011 dan
Mei 2012. Sampel dikumpulkan dari permukaan udara dan datar dari kedua ruang operasi
(50 sampel) dan bangsal rumah sakit bedah umum (20 sampel), seperti yang dijelaskan dalam
bagian Eksperimental. Di
Sampel-sampel ruang operasi bedah dikumpulkan dari: lantai, kunci steril, koridor, ruang
pembersihan,
ruang persiapan, ruang bahan steril, ruang perawatan pasca operasi. Dalam sampel bangsal
bedah umum
dikumpulkan dari: fasilitas pasien, operasi hari operasi, mandi, kantor pembibitan. Dari
masing-masing
sampel daerah tersebut dikumpulkan dua kali sehari, di pagi dan sore hari. Dalam
ruang operasi bedah 83 (35,8%) dari total 236 strain yang diisolasi adalah CoNS sementara
pada umumnya
bangsal pembedahan yang persentasenya lebih rendah — 39 (22,5%) CoNS strain dari total
173 strain
terpencil. Distribusi spesies dari 122 strain CoNS yang dianalisis diisolasi dari lingkungan
rumah sakit
adalah sebagai berikut: S. epidermidis — 32 strain, S. haemolyticus —31 strain, S. capitis
subsp. kapitis -
21 strain, S. hominis —11 strain, S. cohnii subsp. cohnii —9 strain, S. saprophyticus —5
strain,
S. warneri dan S. kloosii —4 strain, S. cohnii subsp. urealyticum —2 strain dan S.
lugdunensis ,
S. hyicus, dan S. chromogenes —1 masing-masing strain. Strain CoNS yang terisolasi
menunjukkan berbagai hal
kerentanan terhadap kemoterapi teruji
Apa itu yogurt

Susunan yogurt

Inoculum yang digunakan untuk yogurt

Lactobscillus Bulgaricus dan streptococcus dalam hal

Beberapa jenis bakteri yng digunakan dalam

Peran bakteri pada yogurt

Susu

Prosedur kerja poin bagan (skripsi), masukkan untuk smua klompok

Pembahasan

Jelaskan untuk tiap kelompoknya

Dijelskan semua yang dibuat dari klpok 1-4