Biomarker Saliva: MenujuMasa Depan

Utilitas Klinis dan Diagnostik

Janice M. Yoshizawa, Christopher A. Schafer, Jason J. Schafer, James J. Farrell, Bruce J.
Paster dan David TW Wong
klinik Mikrobiol. Wahyu 2013, 26(4):781. DOI:
10.1128/CMR.00021-13.
o

Informasi dan layanan terbarudapat ditemukan di:

http://cmr.asm.org/content/26/4/781
c

Ini termasuk:
REFERENSI a Artikel ini mengutip 114 artikel, 27 di antaranya dapat diakses secara gratis
di: http://cmr.asm.org/content/26/4/781#ref-list-1

TANDA KONTEN Terima: Umpan RSS, eTOC, peringatan email gratis (ketika artikel baru
mengutip artikel ini), lebih banyak»

Informasi tentang pesanan cetak ulang komersial:

http://journals.asm.org/site/misc/reprints.xhtml Untuk berlangganan Jurnal
ASM lain, kunjungi: http://journals.asm.org/site/subscriptions/

Biomarker Saliva: Menuju Utilitas Klinis dan Diagnostik

Masa Depan
 Janice M. Yoshizawa,seorang Christopher A. Schafer,seorang Jason J. Schafer,b James J. Farrell,c Bruce J. Paster,d,e David
TW Wonga UCLA School of Dentistry and Center of Oral/Head & Neck Oncology Research, Los Angeles, California, USA a; Departemen
Praktik Farmasi, Jefferson School of Pharmacy, Universitas Thomas Jefferson, Philadelphia, Pennsylvania, AS b; Pusat Penyakit Pankreas dan
Onkologi Endoskopi Yale, Fakultas Kedokteran Universitas Yale, New Haven, Connecticut, AS c; Institut Forsyth, Cambridge, Massachusetts,
ASd; Department of Oral Biology Medicine, Infection and Immunity, Harvard School of Dental Medicine, Boston, Massachusetts, USA e
o

RINGKASAN .................................................. ................................................................... ................................................................... ...

781 d

PENDAHULUAN .................................................. ................................................................... ..................................................781

Sifat-sifat Saliva dan Kelenjar Saliva .............................................. ................................................................... ...............782
e

Air liur versus Darah ................................................... ................................................................... ...................................... 782

r

o ludah DIAGNOSTIK ....... ................................................................... ................................................................... ........................784 m

Pengumpulan
Sampel ........................ ................................................................... ................................................................... ...............784
Biomarker dan Realitas Klinis ............................... ................................................................... ..........................................784
t

PENYAKIT LISAN DAN

SALIVA ................................................................... ................................................................... .........................784
/
:

Biomarker Mikroba .............. ................................................................... ................................................................... ...............784

Mikrobioma Oral ............... ................................................................... ................................................................... ...............785
Diagnostik mikroba berbasis kultur awal .............................. ................................................................... ..................................785
Diagnostik mikroba
molekuler............ ................................................................... ................................................................... ...785 S

PENYAKIT SISTEM DAN SALIVA ......................................... ................................................................... ...................................785 m

Penyakit
.
Menular ............... ................................................................... ................................................................... .....................785
o

r
Penyakit Sistemik Lainnya .................................................. ................................................................... ..................................786
g

BIOMARKER LAIN DI SALIVA ......... ................................................................... ................................................................... ...............

787
/

Transkriptomik ................................................................... ................................................................... ........................................78

o
7
n

Proteomik ....... ................................................................... ................................................................... ....................................787

....... 787 a

......................787 y

UCAPAN TERIMA
KASIH....... ................................................................... ................................................................... ...........................788

REFERENSI ................................................................... ................................................................... ..................................................

1
788
,

PENULIS BIOS................................................. ................................................................... ..................................................791

RINGKASAN
Mengejar metodologi diagnostik yang tepat waktu, hemat biaya, akurat, dan non-invasif adalah upaya
mendesak di antara para klinisi dan ilmuwan. Mendeteksi patologi pada tahap awal dapat secara signifikan
mempengaruhi ketidaknyamanan pasien, prognosis, intervensi apeutik, tingkat kelangsungan hidup, dan
kekambuhan. Diagnosis dan pemantauan seringkali memerlukan prosedur invasif yang menyakitkan seperti
biopsi dan pengambilan darah berulang, menambah tekanan yang tidak semestinya pada pengalaman
yang sudah tidak menyenangkan. Penemuan biomarker mikroba, imunologi, dan molekuler berbasis air liur
menawarkan peluang unik untuk melewati langkah-langkah ini dengan memanfaatkan cairan oral untuk
mengevaluasi kondisi individu yang sehat dan yang sakit. Di sini kita membahas air liur dan signifikansinya
sebagai sumber indikator untuk gangguan lokal, sistemik, dan infeksi. Kami menyoroti inovasi kontemporer
dan mengeksplorasi penemuan terbaru yang menganggap air liur sebagai mediator kondisi fisiologis tubuh.
Selain itu, kami memeriksa keadaan diagnostik saliva saat ini dan teknologi terkait, aspirasi masa depan,
dan potensi sebagai rute yang disukai untuk deteksi, pemantauan, dan prognosis penyakit.

PENDAHULUAN

Rongga mulut adalah lingkungan yang rumit yang terdiri dari berbagai struktur dan jenis jaringan yang bekerja
bersama-sama. Sementara setiap struktur melakukan fungsi yang unik, semuanya dijajah oleh bakteri dan
direndam dalam cairan saliva. Terutama dianggap sebagai komponen penting dari proses pencernaan, air liur
berfungsi untuk memulai
pemecahan lipid dan pati melalui enzim endogen. Bagaimanapernah, dalam beberapa tahun terakhir, apa yang
kita telah datang untuk memahami tentang sekresi saliva dan rongga mulut telah berubah secara dramatis. r

Penelitian telah menunjukkan bahwa air liur sebenarnya mengandung berbagaianalit molekuler dan mikroba (1,
2, 3, 4). Selain itu, publikasi menegaskan bahwa konstituen saliva ini sebenarnya dapat menjadiefektif
indikatordari gangguan lokal dan sistemik (5). Pengungkapan initelah membentuk dasar bidang diagnostik
salivadan karenanya memicu penyelidikan yang memuncak padaidentifikasi biomarker berbasis saliva untuk
gangguan mulai dari kanker hingga penyakit menular (6, 7). U

Meskipun indikator proteomik dan transkriptomik memiliki menghasilkan hasil yang paling menjanjikan sampai
saat ini (8, 9, 10, 11), informasi yang diperoleh dari mikroba oral dan faktor imunologi tetap menjadisalah satu
aspek yang lebih menarik dalam mengejarsaliva
biomarker. Meskipun mekanisme penyakit ini dalam indikator muncul dalam air liur belum dijelaskan
sepenuhnya,ini temuanmenyindir bahwa cairan mulut dapat mewakilisignifikan sumber yangdari biomarker
diskriminatif untuk lokal, sistemik, dan gangguan menular.

Alamat korespondensi ke David TW Wong, dtww@ucla.edu.

JMY dan CAS berkontribusi sama untuk artikel ini.
Hak Cipta © 2013, American Society for Microbiology. Seluruh hak cipta.
doi:10.1128/CMR.00021-13

Oktober 2013 Volume 26 Nomor 4 Ulasan Mikrobiologi Klinik hlm. 781–791 cmr.asm.org 781
Yoshizawa dkk.

Gambar 1 Lokasi kelenjar ludah (parotis, submandibular, dan sublingual). Gambar menunjukkan pandangan lateral kepala yang
menunjukkan posisi kelenjar ludah utama (kelenjar parotis, submandibular, dan sublingual) dan saraf yang diisi dengan
persarafannya (saraf trigeminal dan wajah). Setiap kelenjar berpasangan. Kelenjar parotis terletak tepat di depan setiap telinga dan
merupakan yang terbesar dari tiga kelenjar ludah utama. Kelenjar submandibular berada di bawah rahang bawah tepat di posterior
dan di bawah kelenjar sublingual, yang terletak di bawah lidah. (Dicetak ulang dari referensi 119 dengan izin dari Mayo Foundation for
Medical Education and Research.)

Apa yang dulunya dianggap hanya cairan pencernaan sekarang dianggap sebagai cairan biologis yang
mampu mengkomunikasikan status kesehatan seseorang saat ini. Upaya berkelanjutan di bidang ini dapat
mengarah pada penetapan uji yang dapat diterima secara klinis untuk mendeteksi dan memantau keadaan
penyakit yang berbeda di seluruh tubuh. Di sini kami meninjau pemanfaatan air liur dalam diagnosis
molekuler dan potensinya di masa depan sebagai cara evaluasi pasien yang disukai.

Sifat Saliva dan Kelenjar Saliva

Air liur manusia adalah cairan biofluida yang jernih, sedikit asam (pH 6,0 hingga 7,0) yang terdiri dari air
(99%), protein (0,3%), dan zat anorganik (0,2%) (12, 13, 14). Rata-rata, air liur individu dapat berkisar dari
0,3 hingga 0,7 ml air liur per menit (15), menghasilkan kisaran 1 hingga 1,5 liter setiap hari. Air liur
multifungsi, melayani tidak hanya untuk memfasilitasi pencernaan, menelan, pengecapan, dan pelumasan
jaringan tetapi juga sebagai penghalang pelindung terhadap patogen.
Air liur dihasilkan di dalam kelenjar ludah oleh sel-sel asinus, dikumpulkan dalam saluran kecil, dan
kemudian dilepaskan ke dalam rongga mulut (16). Ada tiga kelenjar penghasil saliva mayor dan minor yang
terletak di dalam dan sekitar mulut dan tenggorokan (Gbr. 1). Setiap kelenjar dipersarafi secara otonom,
tunduk pada stimulasi para simpatis dan simpatis, dan dianggap sebagai fungsi eksokrin. Tiga kelenjar
utama, kelenjar parotis, sub mandibula, dan sublingual, menyumbang 90% dari total air liur, sedangkan
kelenjar minor, kelenjar labial, bukal, lingual, dan palatal, mensuplai sisanya.
Setiap kelenjar ludah sangat permeabel dan diselimuti oleh kapiler (Gbr. 2), fitur yang memungkinkan
pertukaran bebas molekul berbasis darah ke dalam sel asinus penghasil air liur yang berdekatan (17). Para
peneliti mendalilkan bahwa molekul yang diturunkan dari darah yang memasuki jaringan saliva melalui rute
transelular (misalnya, transpor pasif dan aktif) atau paraseluler (misalnya, ultrafiltrasi ekstraseluler) (18, 19,
20) berpotensi mempengaruhi konstituen molekul cairan mulut. Hal ini menunjukkan bahwa biomarker
sirkulasi penyakit yang diserap oleh kelenjar ludah mungkin dapat mengubah komposisi biokimia dari
sekresi saliva. Akibatnya, cairan mulut mungkin mengandung informasi molekuler yang mampu
mengkomunikasikan keadaan kesehatan individu saat ini.

Meskipun masih banyak yang harus dibuktikan, mekanisme hipotesis inimencoba menjelaskan etiologi
biomarker berbasis air liur. Jika mekanisme ini benar, mungkin dapat dibenarkan untuk menganggaporal
sebagai cairan"cermin dari tubuh" atau "jendela status kesehatan." Memanfaatkan air liur sebagai barometer
fisiologis bisa menjadi langkah selanjutnya dalam diagnostik molekuler. Namun, upaya yang signifikan harus
dilakukan dan pencapaian penting dicapai untuk menetapkan kemanjurannya dibandingkan darah sebagai
media diagnostik pilihan untuk deteksi penyakit. .
hal

Air liur versus Darah

.Seperti air liur, darah adalah cairan tubuh kompleks yang diketahui mengandung a berbagai komponen
molekuler, termasuk enzim,
hormon, antibodi, dan faktor pertumbuhan (21, 22). Sementara sel, jaringan, tinja, dan alternatif lain secara rutin
dikejar, serum atau plasma darah secara tradisional dan paling sering sumber biomarker terukur. Meskipun
menyelamatkan nyawa pada kasus-kasus tertentu, prosedur yang diperlukan untuk mengumpulkan dan
akhirnya menganalisis sampel darah seringkali mahal, bermasalah, dan secara fisik mengganggu.
Menggunakan cairan saliva sebagai media untuk pengembangan dan evaluasi biomarker meringankan
1

subjek/pasien ketidaknyamanan melalui penyediaan metode non-invasif deteksi penyakit.

Secara komparatif, air liur membawa banyak keuntungan dibandingkan darah, termasuk yang berikut: h

1. Koleksi tidak menuntut. Sementara pengambilan sampel darah membutuhkan personel yang sangat terlatih,
pengadaan air liur dapat dilakukan dengan: siapa saja, termasuk koleksi sendiri. A

2. Prosedurnya non-invasif. Pengadaan sampel tidak menimbulkan rasa sakit, mengurangi ketidaknyamanan
yang dialami sebagian besar individu dari
biopsi dan pengambilan darah berulang, sambil mendorong orang lain untuk berpartisipasi dalam evaluasi dan
t

pemeriksaan medis tepat waktu. e

3. Sampel lebih aman untuk ditangani. Sekresi saliva mengandung faktor-faktor yang menghambat infektivitas
HIV, mengakibatkan tingkat penularan oral yang sangat rendah atau dapat diabaikan (23). i

4. Sampel lebih mudah dikirim dan disimpan. Air liur tidak menggumpal dan membutuhkan lebih sedikit
manipulasi daripada darah.
i

5. Prosedurnya ekonomis. Air liur mudah dikumpulkan, dikirim, dan disimpan, sehingga mengurangi biaya
s

keseluruhan untuk pasien dan penyedia layanan kesehatan.

Terlepas dari atribut-atribut yang menguntungkan ini, penggunaan air liur sebagai cairan diagnostik
belum menjadi ide utama. Ini sebagian berasal dari pekerjaan yang mengungkapkan bahwa sementara
sebagian besar analit yang terdeteksi dalam serum darah juga ditemukan dalam air liur, kadarnya
berkurang secara substansial (24). Misalnya, pada orang dewasa yang sehat, kadar IgA biasanya

Gambar 2 Mekanisme transpor molekuler dari serum ke saluran kelenjar ludah. Gambar menunjukkan kedekatan kelenjar ludah
utama dengan sistem vaskular. Kelenjar ludah sangat vaskularisasi, memungkinkan untuk pertukaran konstituen berbasis darah. Sel-
sel asinus di dalam kelenjar ludah menyerap molekul dari darah dan mengeluarkan cairan ludah ke dalam rongga mulut. Perubahan
komposisi molekul darah selanjutnya dapat mengubah komposisi sekresi saliva. Biomarker berbasis darah spesifik penyakit cukup
dapat mengubah output kelenjar ludah, menghasilkan biomarker berbasis air liur dari gangguan sistemik. (Dicetak ulang dari referensi
119 dengan izin dari Mayo Foundation for Medical Education and Research. Diadaptasi dari referensi 120.)

2,5 hingga 5 mg/ml dalam serum dan 250 hingga 500 g/ml dalam air liur. Demikian pula, IgG (5 sampai 30 mg /
ml dibandingkan 5 sampai 30 g / ml) dan IgM (0,5 sampai 1 mg / ml dibandingkan 5 sampai 10 g / ml) kadar
dalam serum yang beberapa kali lipat lebih tinggi daripada yang ditemukan dalam air liur (25).Meski begitu,
korelasi antara air liur
bervariasi dan konstituen berbasis darah menyiratkan bahwa sementara kedua biofluida ini terpisah dan unik,
mereka mungkin terkait pada tingkat molekuler. Oleh karena itu, sangat penting bagi kami untuk
 mengeksplorasi air liur sebagai alternatif potensial untuk diagnostik berbasis darah dan jaringan.

TABEL 1 ludah umum perangkat pengumpulan

Perusahaan Perangkat
Salimetrics bantuan koleksiAir liur
Salimetricsmulutswab
Salimetricsanak-anak swab
Salimetrics bayi swab

Oasis Diagnostik DNA · SAL

UltraSal-2
Super · SAL

Malvern Perkembangan Medis Oracol

DNA Genotek ORAcollect · DNA

Oragene · DNA
Oragene · RNA

Immunalysis Quantisal
Norgen Air liur koleksi DNA dan perangkat pelestarian
Biomatrica DNAgard

ludah dIAGNOSTIK
pengumpulan sampel
agar prosedur diagnostik berbasis air liur untuk commence, salah satu harus terlebih dahulu
mengumpulkan sampel diperlukan. Meskipun sederhana dalam banyak hal, pengumpulan air liur dapat
memanifestasikan masalah unik dalam populasi tertentu. Ini mungkin termasuk laju aliran saliva, ritme
sirkadian, jenis kelenjar ludah, jenis stimulus saliva, diet, usia, status fisiologis, dan metode pengumpulan.
Cangkir Lashley, alat berukuran nikel noninvasif yang mampu mengumpulkan id flu melalui penyedotan,
kadang-kadang digunakan untuk mengumpulkan cairan oral dari kelenjar tertentu. Penyeka kapas juga
telah digunakan, tetapi penelitian terbaru menunjukkan bahwa mereka dapat menimbulkan bias yang tidak
diinginkan (26). Selain itu, sejumlah perusahaan telah memperkenalkan berbagai perangkat yang ditujukan
untuk mengumpulkan air liur, yang paling umum dirangkum dalam Tabel 1.
Meskipun menguras, meludah, dan menyedot tetap menjadi pendekatan yang paling umum (27), saat ini
tidak ada teknik yang diterima secara universal untuk pengumpulan sampel, fakta yang dapat menghambat
proses penelitian dengan menghambat reproduksi hasil yang dapat diandalkan. Setelah menetapkan
pedoman standarisasi prosedur dapat menyelesaikan masalah pembaur antara peneliti jauh dan
mengurangi beberapa variabilitas yang melekat antara individu dan populasi. Terlepas dari metode yang
digunakan, sangat penting bahwa subjek membersihkan rongga mulut dengan berkumur dengan air untuk
menghindari adanya kontaminan sebelum pengumpulan.

Biomarker dan Realitas Klinis

Menurut National Institutes of Health (NIH), biomarker adalah indikator yang diukur dan dievaluasi secara
objektif dari proses biologis normal, proses patogen, atau respons farmakologis terhadap intervensi
terapeutik (28). Ringkasnya, biomarker adalah entitas di dalam tubuh yang mampu memberikan informasi
yang tidak memihak mengenai keadaan fisiologis organisme hidup saat ini (29).
Biomarker ada dalam berbagai bentuk yang berbeda, termasuk antibodi, mikroba, DNA, RNA, lipid,
metabolit, dan protein. Perubahan konsentrasi, struktur, fungsi, atau aksinya dapat dikaitkan dengan
timbulnya, perkembangan, atau bahkan regresi gangguan tertentu atau hasil dari bagaimana tubuh
meresponsnya (30). Kumpulan biomarker yang andal dan dapat direproduksi yang unik untuk penyakit
tertentu sering disebut sebagai biomarker atau tanda tangan molekuler. Memahami dan mengevaluasi
signifikansi tanda biomarker individu dapat berguna dalam menentukan keberadaan, lokasi, dan bahkan
kemungkinan penyakit. Dengan demikian, biomarker berfungsi sebagai alat yang berharga dan menarik
dalam deteksi, risiko penilaian, diagnosis, prognosis, dan pemantauan penyakit (31). o

Realisasi klinis dari setiap biomarker atau panel biomarker digunakan untuk penilaian risiko kesehatan
atau prognosis adalah sulit jour ney ditandai dengan pengawasan yang luas. Biomarker potensial ditemukan di
o

salah satu perpustakaan "-omics" (proteome, transcriptome, miRNAome [pelengkap dari

microRNAs],metabolome, microbiome, atau epigenome) menjadi sasaran evaluasi komprehensif, termasuk
validasi praklinis dan akademik, sebelum Evaluasi FDA dan persetujuan.
 Untuk meminimalkan bias dan memperkuat signifikansi, PROBE (pengumpulan spesimen prospektif
dan blinded retrospektif evaluasi) studi yang dirancang biasanya digunakan. Protokol-protokol ini, yang
panggilan untuk koleksi sampel prospektif dan analisis retrospektif sebelum diagnosis, memerlukan populasi
pasien yang besar dan procurement dan kategorisasi sampel dan informasi klinis, masing-masing.

Setiap sampel dinilai melalui uji kuantitatif untuk menentukan spesifisitas, sensitivitas, dan reproduktifitas
biomarker sayan pertanyaan. Evaluasi lebih lanjut mengeksplorasi kemampuan mendeteksi dan mengukur
penanda secara akurat dalam konsentrasi yang relatif rendah. Akhirnya, agar biomarker dapat digunakan dalam
esai klinis, pencapaian berikut harus dicapai:

1. Selama pengujian praklinis, biomarker harus dikembangkan menggunakan sampel pasien dan dikonfirmasi
pada tingkat in vitro atauin vivo
.

2. Selama analisis kelayakan, biomarker harus diuji menggunakan subpopulasi pasien kecil untuk menunjukkan
kemampuan untuk membedakan yang sakit dari subyek yang sehat. t

3. Selama proses validasi, biomarker harus diuji secara akurat.

4. Analisis statistik harus dilakukan untuk mengevaluasi akurasi diskriminatif biomarker pada populasi pasien
yang besar. t

5. Setelah pelaporan profil biomarker yang divalidasi, upaya harus dilakukan untuk menyelidiki fungsi biokimia
masing-masing. Memahami peran molekuler biomarker tidak hanya dapat memberikan informasi mengenai
patogenesis dan perkembangan penyakit tetapi juga mendukung posisinya sebagai evaluator kesehatan (32).

ORAL PENYAKIT DAN Saliva

Mikroba Biomarkers
Seperti yang diusulkan oleh Haffajee dan Socransky(33),ada 3 poin utama untuk memperhitungkan saat
s

menentukan kemanjuran mi diagnostik saliva crobial. Pertama, agar mikroba dianggap sebagai biomarker
spesifik penyakit, mereka harus dikaitkan langsung dengan, tetapi tidak harus penyebab, kondisi yang
bersangkutan. Selanjutnya, jika biomarker mikroba benar-benar mencerminkan status kesehatan, regresi atau
pemberantasannya harus bertepatan dengan hasil terapeutik yang positif. Dengan kata lain, saat kondisi pasien
membaik, konsentrasi atau kemampuan deteksi penanda bio yang sesuai harus berkurang.
Pertimbangan terakhir, dan mungkin yang paling berarti, adalah apakahmikrobapenandadapat digunakan
untuk menilai risiko penyakit. Jika demikian, dapatkah profil mikroba berbasis air liur berfungsi sebagai
indikator prediksi penyakit, dan apakah ada profil sehat yang harus diperjuangkan? Berkenaan dengan
masalah ini, apa yang paling menarik tentang diagnosa mikroba rongga mulut adalah kegunaan
potensialnya di luar evaluasi patologimulut rongga. Seperti yang dibahas di bawah, profil saliva mikroba dan
imunologis mungkin menunjukkan tidak hanya penyakit lokal tetapi juga penyakit sistemik dan gangguan
infeksi.

Mikrobioma Mulut
Rongga mulut manusia merupakan habitat yang beragam yang terdiri dari gigi, sulkus gingiva, lidah,
palatum keras dan lunak, mukosa bukal, dan tonsil. Setiap struktur dijajah oleh bakteri dan terus-menerus
bermandikan air liur. Menariknya, penelitian telah menunjukkan bahwa bakteri saliva, termasuk yang
berasal dari karies gigi, mungkin merupakan indikator pengganti penyakit yang berguna dalam diagnosis
pasien, pemantauan, dan evaluasi kesehatan secara keseluruhan (34, 35). Dengan pemikiran ini, banyak
pekerjaan telah dilakukan untuk mendefinisikan bioma mikro mulut manusia.
Didirikan oleh NIH, The Human Microbiome Project (36, 37) bertujuan untuk mengkarakterisasi flora
mikrobiologis dari beberapa wilayah atom pada subjek dewasa yang sehat, termasuk rongga mulut.
Meskipun penelitian tertentu melaporkan bahwa 700 hingga 1.200 spesies bakteri (38, 39, 40, 41, 42)
(www.homd.org) berada di mulut, para peneliti yang menggunakan sekuensing generasi berikutnya (NGS)
menunjukkan bahwa jumlah ini bisa sama setinggi 10.000 (43, 44, 45, 46). Meskipun ini menarik, penelitian
lebih lanjut diperlukan untuk mengklarifikasi
angka-angka ini, karena tidak jelas apakah sejumlah besar spesies benar-benar menjajah rongga mulut
atau hanya lingkungan sementara.
Meskipun sebagian besar individu hanya memiliki 75 hingga 100 spesies bakteri predominan yang
diketahui menghuni rongga mulut, 35% hingga 50% di antaranya belum dibudidayakan. Ironisnya, analisis
terbaru dari deposit plak sublingual menunjukkan bahwa banyak spesimen "tidak dapat dibudidayakan"
sebenarnya dapat dikaitkan dengan kesehatan atau penyakit mulut (47, 48, 49). Untungnya, ada sarana
tambahan untuk mendeteksi dan memantau spesies ini dan spesies lainnya, menggunakan analisis
genomik. Metodologi yang menjelaskan proses ini telah ditinjau dalam sejumlah artikel terbaru (49, 50) dan
oleh karena itu tidak dibahas di sini.
Saat ini, sebagian besar teknik laboratorium, termasuk NGS, microarrays bakteri, hibridisasi DNA, PCR,
dan PCR kuantitatif (qPCR), digunakan dalam mengejar pertanyaan spesifik yang bertentangan dengan
menjelaskan nilai diagnostik. Biasanya, pengembangan penanda penyakit yang dapat diandalkan mengikuti
pembentukan asosiasi antara spesies bakteri tertentu dan penyakit tertentu. Sejauh ini, sebagian besar
penelitian yang menggunakan metode yang disebutkan di atas berfokus pada situs mulut tertentu, termasuk
plak subgingiva, kerokan epitel lidah, dan mukosa bukal, untuk menentukan peran bakteri dalam kesehatan
dan penyakit mulut. Bagian berikut membahas metode berbasis kultur awal serta metode molekuler
kontemporer yang diterapkan pada diagnostik saliva dan pengembangan biomarker mikroba.
Diagnostik mikroba berbasis kultur awal. Diagnostik saliva mikroba bukanlah konsep baru. Lebih dari
20 tahun yang lalu, tes berbasis air liur dikembangkan untuk Streptococcus mutans dan Lactobacillus spp.,
dua agen penyebab karies gigi yang diketahui. Tes slideuntuk lactobacilli memulai debutnya pada tahun
1975 (51celup), diikuti oleh Cariescreen SM (52), analisis yang menggunakan slide berlapis agar untuk
mendeteksi dan mengukursaliva S. mutans. Tes serupa, yang disebut Dentocult SM Strip mutans, oleh
Orion Diagnostica, mengukur S. mutans dengan menginkubasi strip tes yang dicelupkan ke dalam media
kaldu selektif selama 48 jam (53). Sebuah program perangkat lunak yang disebut Cariogram mengevaluasi
hasilnya, bersama dengan kebiasaan diet inang, jumlah plak, dan penggunaan fluoride, untuk menghitung
risiko relatif berkembangnya karies gigi (54). Demikian juga, tes risiko karies (55), alat diagnostik yang
tersedia saat ini, secarabersamaan mendeteksi S. mutans dan lactobacilli dalam air liur. Tes ini, yang juga
telah digunakan untuk mengevaluasi risiko relatif karies, menggunakan salivarius mitis biru agar media
w

selektif dengan bacitracin dan ROGOSA agar untuk mendeteksi S. mutans dan lactobacilli, masing-
masing(56, 57, 58).Meskipun beberapa penelitian mempertanyakan validitasnya (59), tes ini memberikan
data objektif yang digunakan dalam praktik klinis dan penelitian untuk mendeteksi bakteri dan memantau
status kesehatan atau penyakit.
Diagnostik mikroba molekuler. Seperti yang telah dibahas sebelumnya, ada alasan yang jelas untuk
menggunakan metode berbasis budaya untukrisiko
penilaiankaries gigi. Namun, investigasi yang menggunakan teknik kultur-independen sekarang menghasilkan
bukti dalam menunjukkan pentingnya analisis mikroba molekuler dalam mengidentifikasi patologi oral (60).
Studi terbaru menggunakan kuantitatif 16S rRNA sequencing gen menemukan beberapa patogen diduga dalam
air liur pasien periodontitis dibandingkan dengan kontrol sehat(61, 62).Penyelidikan lain yang mengevaluasi
sinergi mikroba dan analisis molekuler menemukan bahwa biomarker saja tidak cukup analit diskriminatif (63),
dan hanya kombinasi dari nilai-nilai mikroba dan molekul cukup dapat membedakan sehat dari subyek yang
sakit. Studi lebih lanjut telah mengidentifikasi subjek yang berbau busuk dan aktif karies dengan menggunakan
analisis terminal restriksi fragmen panjang polimorfisme (T-RFLP), deep sequencing, atau human microbe
identification microarrays (HOMIM), yang merupakan microarray berbasis 16S rRNA yang mampu mendeteksi
300 spesies bakteri mulut. , termasuk yang belum dibudidayakan (64, 65, 66).

PENYAKIT SISTEMIK DAN SALIVA

Penyakit Menular a

Diagnosis penyakit menular sistemik tetap sangat tergantung pada evaluasi sampel darah dan/atau
jaringan. Meskipun efektif, prosedur ini invasif dan mahal dan seringkali membutuhkan waktu yang lama untuk
mendapatkan hasil diagnostik yang berarti. Selain itu, tergantung pada pengaturan praktik, jenis tes ini mungkin
tidak dapat diakses oleh banyak pasien dan penyedia layanan kesehatan. Sementara air liur dapat membantu
meringankan beberapa tantangan yang terkait dengan metodologi diagnostik yang lebih tradisional, air liur juga
terbukti efektif dalam hal aksesibilitasnya. Misalnya, pasien dengan dugaan infeksi HIV sekarang dapat
diskrining untuk HIV-1 dan -2 melalui imunosorben terkait-enzim berbasis air liur. pengujian (ELISA) (67).
Meskipun hasil positif harus dikonfirmasi dengan tindak lanjut Western blot, ELISA ini biasanya menghasilkan
hasil yang akurat (sensitivitas 99,3%, spesifisitas 99,8%) dengan cepat (yaitu, 20 menit) dan menghilangkan
kebutuhan untuk pengambilan darah invasif (68, 69). Lebih penting lagi, sekarang telah dapat diakses secara
luas, karena FDA baru-baru ini menyetujui kit ELISA yang dijual bebas, membuat tes HIV tidak hanya mudah
dan semakin tersedia tetapi juga pribadi (70). Saat ini, hampir 25% dari semua orang HIV-positif tidak menyadari
infeksi mereka (71). Populasi spesifik ini menyumbang sebagian besar kejadian penularan HIV baru setiap tahun
(72). Menyediakan masyarakat dengan sarana untuk menilai status HIV mereka dapat menyebabkan
pengurangan proporsi subyek yang terinfeksi dengan mengurangi kemungkinan penularan virus. Lebih jauh lagi,
ini dapat meningkatkan tingkat kelangsungan hidup jangka panjang melalui memfasilitasi inisiasi awal terapi
antiretroviral.
 Meskipun cukup besar, kemajuan dalam diagnosis hidung berbasis air liur tidak hanya untuk infeksi
HIV. Kemajuan yang signifikan juga telah dicatat dalam identifikasi infeksi sistemik tambahan melalui cairan oral,
termasuk virus hepatitis, virus cytomegalo, malaria, dan demam berdarah. Faktanya, penelitian terbaru telah
mengungkapkan bahwa antigen dan/atau antibodi untuk virus hepatitis A, B, dan C telah terdeteksi secara rutin
dalam sampel saliva individu yang terinfeksi (6). Bersamaan dengan ini, penyelidikan telah menunjukkan
kemanjuran imunisasi virus hepatitis A (HAV) dengan menilai konsentrasi IgG saliva (73). Pekerjaan lebih lanjut
telah difokuskan pada analisis paparan akut terhadap HAV dengan menggunakan kombinasi tes IgM, IgA, IgG,
dan HAV RNA berbasis air liur (74). Pengukuran paparan akut, khususnya, bisa menjadi alat klinis yang
berharga untuk evaluasi cepat dari populasi besar yang berpotensi terpapar persediaan makanan yang
terkontaminasi. Memanfaatkan air liur sebagai media untuk pemeriksaan di tempat perawatan dan deteksi cepat
dapat meningkatkan triase dan strategi pengelolaan keadaan penyakit dini dengan mengidentifikasi sumber
infeksi, sehingga membatasi pajanan HAV lebih lanjut.
Tidak seperti HAV, baik virus hepatitis B (HBV) dan virus hepatitis C (HCV) umumnya terkait dengan
penyakit kronis dan pada akhirnya dapat mengakibatkan komplikasi terkait hati yang parah seperti sirosis
dan karsinoma hepatoseluler. Sementara setiap infeksi cukup umum, kebanyakan pasien tidak
menunjukkan gejala dan tetap tidak menyadari penyakit mereka dan potensi risiko perkembangan penyakit
dan penularan. Diagnosis tradisional dan pemantauan infeksi HBV dan HCV terutama terdiri dari tes
berbasis darah dan serologis yang mengevaluasi viral load serta antibodi dan antigen virus. Menariknya,
laporan telah menunjukkan bahwa DNA HBV dan HCV, antibodi, dan antigen virus tidak hanya ada dalam
air liur subjek yang terinfeksi tetapi juga berkorelasi baik dengan sampel darah (75, 76, 77). Temuan ini
menunjukkan peran potensial air liur sebagai mode noninvasif diagnosis HBV dan HCV dan pemantauan
keadaan penyakit.
Oleh karena itu, tes yang tersedia secara komersial yang dapat dengan cepat mengidentifikasi antibodi
HCV dalam air liur dengan menggunakan enzim immunoas say (EIA) baru-baru ini dikembangkan ( 78).
Although the results ob tained from this test draw parallels with those of serum immuno assays (97.5%), it
has yet to obtain FDA approval and is currently not available in the United States. Even so, it is widely
available in Europe and, if employed effectively, could possibly have a sub stantial impact on the early
detection and management of HCV infections (79).

Mempertimbangkan pertanyaan kesehatan global, diagnostik berbasis air liur telah menjadi fokus utama
penyelidikan untuk berbagai patogen menular lainnya. Di antaranya adalah beberapa mikroba endemik
dunia, antara lain organisme malaria (Plasmodium falciparum), virus dengue, virus Ebola, dan
Mycobacterium tuber culosis, serta sejumlah anggota famili virus herpes simpleks (HSV), virus Epstein-Barr
(EBV). , cytomegalovirus (CMV), dan human herpesvirus (HHV). Untuk malaria, antibodi IgG yang
diarahkan terhadapspesifik Plasmodium falciparum antigendapat dideteksi dalam air liur dan ditemukan
berkorelasi kuat dengan kadar dalam plasma (80). Demikian pula, dengan menggunakan metode
penangkapan antigen, antibodi IgA spesifik untuk virus dengue yang berkorelasi baik dengan infeksi
sekunder awal telah ditemukan dalam air liur (81). Sebaliknya, M.
TABEL 2 biomarker berbasis air liur diselidiki untuk patogen yang dipilih dan status IVD masing-masing a

Patogen Biomarker diselidiki IVD

status Referensi

HIV-1 dan -2 IgG Ya 67, 69, 70

Virus hepatitis A IgM, IgA, IgG,

dan RNA No 74

Virus Hepatitis B HbsAg, HbsAb,

HbcAb, dan DNA No 75
Virus Hepatitis C IgG, RNA Nob 77, 78 w

Plasmodium falciparum IgG No 80 n

Virus Dengue IgA No 81 o

Mycobacterium tuberculosis DNA No 82 d

virus Ebola IgG, RNA,

dan antigen Tidak 83 d

Virus herpes simpleks DNA No 84

virus Epstein-Barr DNA No 85 o

Human herpesvirus DNA Tidak 86 h

Sitomegalovirus DNA Ya 87 t

a
IVD, in vitro diagnostik.
b
Tes antibodi cepat Oraquick HCV tidak disetujui FDA tetapi tersedia secara komersial dan dapat digunakan untuk deteksi kualitatif antibodi IgG
terhadap virus hepatitis C dalam cairan oral. r

sebuah

tuberkulosis dan banyak virus, termasuk virus Ebola, HSV, EBV, HHV, dan CMV, paling andal terdeteksi
langsung menggunakan metodologi PCR(82, 83, 84, 85, 86, 87).Selain CMV, di mana deteksi dalam air liur bayi
dengan skrining PCR dapat mengidentifikasi bayi baru lahir dengan infeksi CMV kongenital, kegunaan klinis
pengujian berbasis air liur untuk sebagian besar patogen lainnya belum ditetapkan secara definitif (87).
Beban global penyakit menular akut dan kronis terus meningkat. Akses handal namun non-invasif dan
mudahsayametode diagnostik ble tidak tersedia untuk sebagian besar infeksi, dan sebagai hasilnya, banyak
pasien mengalami masalah kesehatan. Metode diagnostik berbasis air liur dapat mengatasi tantangan ini dan
telah ditetapkan untuk infeksi tertentu, tetapi pekerjaan terus berlanjut diperlukan. Upaya lebih lanjut di bidang
ini harus fokus pada hal-hal berikut: (i) mengoptimalkan pengujian berbasis air liur di tempat perawatan untuk
diagnosis infeksi, (ii) memastikan bahwa metode pengujian tetap non-invasif dan memberikan hasil yang andal
dengan cepat, dan (iii) meningkatkan aksesibilitas untuk pasien dan penyedia sementara membatasi biaya
perawatan kesehatan. Tabel 2 merangkum penyakit tersebut, biomarker masing-masing, dan penggunaannya
dalam in vitro tes diagnostik. e

Penyakit Sistemik Lainnya i

Penggunaan mikroarray NGS dan 16S rRNA dengan throughput tinggi yang cepat, termasuk Phylochip (88) dan
Bactochip (89), telah memungkinkan kami untuk lebih menentukan komposisi mikroflora mulut manusia.
Memanfaatkan ini dan teknologi lainnya telah memungkinkan kami untuk mengeksplorasi mikrobioma oral dan
untuk mengevaluasi potensinya sebagai indikator gangguan distal. Misalnya, penelitian terbaru menemukan
bahwa pasien Crohn pediatrik menunjukkan penurunan yang signifikan secara statistik dalam keragaman
mikrobiologi oral secara keseluruhan (90). Laporan lebih lanjut menyatakan bahwa individu dengan kondisi yang
ditentukan oleh pertumbuhan bakteri mulut yang menyimpang berada pada peningkatan risiko kanker pankreas
(91, 92, 93). Korelasi potensial antara mikroba mulut dan penyakit perifer mendorong kami untuk memeriksa
mikrobioma saliva dalam upaya mengidentifikasi penanda kanker pankreas. Menggunakan HOMIM, kami
mengevaluasi mikrobiota oral individu yang didiagnosis dengan kanker pankreas atau pankreatitis kronis

TABEL 3 Biomarker berbasis air liur dari penyakit mulut dan sistemik tertentu
Penyakit Biomarker mikroba oral
diselidiki Referensi(s)
Kanker mulut Capnocytophaga gingivalis, Prevotella
melaninogenica, Streptococcus mitis 7

Penyakit Crohn Fusobacteria, Firmicutes 90

Kanker pankreas Neisseria elongata, Streptococcus mitis 94
Pankreatitis kronis Granulicatella adiacens, Streptococcus 94
mitis
Penyakit periodontal Aggregatibacter 34, 49, 61,
62
actinomycetemcomitans,
Porphyromonas gingivalis,
Prevotella intermedia, Tannerella
forsythia, Campylobacter rectus,
Treponema denticola
Karies gigi Streptococcus mutans, Lactobacillus spp. 51, 52
Obesitas Selenomonas noxia 118

(94). Singkatnya, upaya kami mengungkapkan peningkatan 31 dan penurunan 25 spesies bakteri/cluster
dalam air liur pasien kanker pankreas dibandingkan kontrol yang sehat (n 10 masing-masing). Dua
kandidat bakteri mulut (Neisseria elongata dan Streptococcus mitis) divalidasi pada sampel populasi
independen dan menunjukkan penurunan yang signifikan (P 0,05; qPCR) pada subjek kanker pankreas
dibandingkan dengan kontrol (n total56). Secara sinergis, biomarker mikroba ini menghasilkan area di
bawah kurva waktu konsentrasi (AUC) 0,90 (interval kepercayaan 95% [95% CI], 0,78 hingga 0,96; P
0,0001) untuk plot karakteristik operasi penerima (ROC), dengan sensitivitas 96,4% dan 82,1% spesifisitas
dalam membedakan pasien kanker pankreas dari subyek sehat. Analisis tambahan menghasilkan
perbedaan yang signifikan (P 0,05; qPCR) dalam konsentrasi Granulicatella adiacens dan Streptococcus
mitis dalam rongga mulut antara pankreatitis kronis dan sampel kontrol (n total55).
Sepengetahuan kami, ini adalah studi pertama yang menggambarkan hubungan antara
mikrobioma saliva dan patologi pankreas. Namun, pertanyaan semacam ini tidak jarang. Seperti yang
dijelaskan pada Tabel 3, biomarker mikroba berbasis air liur juga telah dikaitkan dengan kanker mulut dan
bahkan obesitas.
Menyarankan bahwa mikroba mulut dapat berfungsi sebagai indikator penyakit sistemik, penyelidikan
tersebut menjelaskan penjelasan penanda mikrobiologis berbasis air liur untuk kanker pankreas. Meskipun
datanya substansial, apa yang harus ditetapkan sekarang adalah bagaimana indikator-indikator ini muncul
di rongga mulut dan apakah mikroflora mulut merupakan pengidentifikasi akurat dari kondisi sistemik
tambahan. Memahami bagaimana perubahan mikrobioma oral berhubungan dengan gangguan lokal dan
sistemik dapat memberikan masukan penting mengenai patogenesis penyakit, diagnosis, pemantauan, dan
prognosis. Menetapkan tanda tangan mikrobiologis spesifik penyakit dapat mengarah pada pengembangan
tes sederhana yang menargetkan mikroba diskriminatif yang mampu mengidentifikasi patologi tertentu.
Deteksi dini, terutama pada populasi berisiko tinggi, akan memungkinkan intervensi terapeutik yang lebih
cepat yang dapat menghambat perkembangan, atau bahkan timbulnya, kanker pankreas dan gangguan
lainnya, yang mengarah ke hasil yang lebih positif.

BIOMARKER LAIN DALAM SALIVA

Transkriptomik
 Sebagaimana dinyatakan di atas, penelitian telah menunjukkan bahwa sekresi saliva tidak hanya menampung
molekul RNA tetapi juga dapat menjadi sumber biomarker diskriminatif yang sangat menjanjikan. Untuk itu,
penyelidikan baru-baru ini telah mengidentifikasi lebih dari 3.000 spesies mRNA dan lebih dari 300 miRNA
dalam cairan saliva subjek sehat dan sakit, menunjukkan kemungkinan bahwa analisis transkriptomik dapat
menghasilkan informasi berharga mengenai kondisi tubuh (95).
Dengan pemikiran ini, sejumlah penyelidikan telah melaporkan identifikasi biomarker saliva untuk sindrom
Sjogren dan sejumlah kanker (95, 96, 97, 98). Sementara analisis lebih lanjut perlu dilakukan, hasil ini
menunjukkan peran penting untuk transkriptom saliva sebagai sumber biomarker spesifik penyakit yang layak
dan non-invasif.

Proteomik

Air liur manusia mengandung banyak koleksi protein yang beragam, masing-masing dengan fungsi biologis
yang berbeda. Sementara beberapa membantu pencernaan dan melumasi rongga mulut, yang lain membantu
menjaga homeostasis dan melawan bakteri patogen. Meskipun konten proteomik-nya diperkirakan hanya 30%
s

yang darah(99),air liur secara aktif sedang diselidiki sebagai sumber yang kaya biomarker protein(100)mampu
membedakan sehat dari mata pelajaran yang sakit(101).Untuk itu, banyak penelitian telah mengungkapkan
profil protein diskriminatif untuk kanker mulut, diabetes, penyakit periodontal, AIDS, dan karsinoma kelenjar
susu (102, 103, 104, 105, 106, 107). a

Metilomik 1

Diketahui mempengaruhi perkembangan mamalia, diferensiasi sel, dan karsinogenesis, metilasi DNA
menginduksi sel untuk mempertahankan atau mengubah karakteristik unik dengan mengontrol dan
memodulasi ekspresi gen (108, 109, 110). Anehnya, beberapa investigasi sekarang melaporkan analisis
metilasi genomik berbasis air liur yang membedakankarsinoma sel skuamosa oral (OSCC) (111pasien) dan
karsinoma sel skuamosa kepala dan leher (HNSCC) dari kontrol masing-masing (112, 113). Selain itu,
sejumlah studi telah meneliti perubahan epigenetik lokal dan global dengan umur(114, 115, 116),menunjukkan
kemungkinan air liur-dasard pemutaran prediktif untuk penyakit yang berkaitan dengan usia. a

Aspek lain yang menarik dari metilomik saliva adalah peran potensialnya dalam ilmu forensik dan
identifikasi cairan tubuh. Sebagaimana dibuktikan dalam penelitian baru-baru ini, 5 daerah termetilasi
diferensial spesifik jaringan (tDMRs) dibedakan melalui sekuensing bisulfit menggunakan DNA yang
dikumpulkan dari darah, air liur, air mani, darah menstruasi, dan cairan vagina (117). Meskipun awal, hasil ini
menjanjikan dan meletakkan dasar untuk analisis metilasi DNA genomewide di masa depan. Aplikasi masa
depan dapat mencakup penggunaan teknologi ini sebagai teknik forensik standar dalam penentuan cairan
tubuh inang yang tidak diketahui. r

KESIMPULAN
tahap awal deteksi penyakit yang akurat dan dapat diandalkan dikombinasikan dengan mode non-invasif
koleksi sampel adalah grail suci diagnosa ular molec. Saliva adalah biofluid yang berpotensi kaya akan
indikator diagnostik untuk gangguan oral dan sistemik. Dalam beberapa tahun terakhir, banyak
metodologi telah muncul untuk mengevaluasi konstituen mikrobial dan molekul air liur. Seperti yang
dijelaskan di atas, profil biomarker berbasis air liur yang unik dapat dikorelasikan dengan penyakit
tertentu dan dapat memberikan informasi penting mengenai keadaan fisiologis individu saat ini.
Menemukan, memvalidasi, dan memahami biomarker berbasis air liur dapat memiliki peran yang cukup
besar dalam menetapkan cairan mulut sebagai cairan bio diagnostik yang kredibel.
Bidang mani diagnostik saliva memang memiliki potensi translasi dan klinis yang besar. Kemajuan
berkelanjutan dalam teknologi throughput tinggi telah mendorong genre ini dengan mengungkapkan
wawasan yang belum pernah ada sebelumnya untuk memahami lingkungan saliva sebagai cerminan dari
kesehatan tubuh secara keseluruhan. Interpretasi yang benar dan pemanfaatan informasi ini mungkin
berguna tidak hanya untuk mengidentifikasi gangguan lokal dan sistemik tetapi juga untuk membantu dalam
desain dan modifikasi terapi.
Salah satu tujuan bersama di antara peneliti dan dokter adalah untuk menilai dan memantau status
fisiologis individu yang sehat dan yang sakit secara noninvasif. Eksplorasi dan penetapan saliva sebagai
alat diagnostik dapat memenuhi tujuan ini dengan menyediakan cara yang aman dan efektif untuk
mengevaluasi pasien dan mempersonalisasi pengobatan mereka.

UCAPAN TERIMA KASIH

DTWW adalah salah satu pendiri RNAmeTRIX Inc., sebuah perusahaan diagnostik molekuler. Dia memegang ekuitas di
RNAmeTRIX, dan menjabat sebagai direktur perusahaan dan penasihat ilmiah. University of California juga memegang
ekuitas di RNAmeTRIX. Kekayaan intelektual yang ditemukan DTWW dan dipatenkan oleh University of California telah
dilisensikan ke RNAmeTRIX. Selain itu, ia adalah konsultan berbayar untuk PeriRx.
REFERENSI
1. Aas A, Jr, Paster BJ, Stokes LN, Olsen I, Dewhirst FE. 2005. Mendefinisikan flora bakteri normal rongga mulut. J.klin.
Mikrobiol. 43:5721– 5732.
2. Bonne N, Wong D. 2012. Pengembangan biomarker saliva menggunakan pendekatan genomik, proteomik, dan
metabolomik. Obat Genom. 4:82. 3. Park NJ, Li Y, Yu T, Brinkman BMN, Wong DT. 2006. Karakterisasi RNA pada saliva.
klinik Kimia 52:988 –994.
4. Hu S, Loo JA, Wong DT. 2007. Analisis proteom air liur manusia. Ann. NY Acad. Sci. 1098:323–329.
5. Burbelo PD, Bayat A, Lebovitz EE, Iadarola MJ. 2012. Teknologi baru untuk mempelajari kompleksitas penyakit mulut.
Dis. 18:121–126. 6. Amado LA, Villar LM, de Paula VS, de Almeida AJ, Gaspar AM. 2006. Deteksi antibodi spesifik virus
hepatitis A, B, dan C menggunakan cairan oral untuk studi epidemiologi. m. Inst. Oswaldo Cruz 101:149 – 155.
7. Mager D, Haffajee A, Devlin P, Norris C, Posner M, Goodson J. 2005. Mikrobiota saliva sebagai indikator diagnostik
kanker mulut: studi deskriptif non-acak dari subjek karsinoma sel skuamosa bebas kanker dan oral. J.Terjemahan. Med.
3:27.
8. Zhang L, Farrell JJ, Zhou H, Elashoff D, Akin D, Park NH, Chia D, Wong D. 2010. Biomarker transkriptomik saliva
untuk mendeteksi kanker pankreas yang dapat dioperasi. Gastroenterologi 138:949 –957.
9. Li Y, St John MAR, Zhou X, Kim Y, Sinha U, Jordan RCK, Eisele D, Abemayor E, Elashoff D, Park NH, Wong DT.
2004. Diagnostik transkriptom saliva untuk deteksi kanker mulut. klinik Kanker Res. 10: 8442–8450.
10. Hu S, Arellano M, Boontheung P, Wang J, Zhou H, Jiang J, Elashoff D, Wei R, Loo JA, Wong DT. 2008. Proteomik
saliva untuk penemuan biomarker kanker mulut. klinik Kanker Res. 14:6246 –6252.
11. Streckfus C, Bigler L, Dellinger T, Dai X, Kingman A, Thigpen JT. 2000. Kehadiran c-erbB-2 larut dalam air liur dan
serum di antara wanita dengan karsinoma payudara: studi pendahuluan. klinik Kanker Res. 6:2363–2370.
12. van Nieuw Amerongen A, Bolscher JGM, Veerman ECI. 2004. Protein saliva: nilai protektif dan diagnostik dalam
cariologi? Karies Res. 38: 247–253.
13. Zalewska A, Zwierz K, Zółkowski K, Gindzien´ ski A. 2000. Struktur dan biosintesis musin saliva manusia. Akta
Biochim. Pol. 47:1067– 1079.komposisi
14. Humphrey SP,Williamson RT, 200. Tinjauan saliva: posisi, aliran, dan fungsinormal. J. Prostet. Dent 85:162-169
15. Edgar W. 1990. Air liur dan kesehatan gigi. sdr. Lekuk. J. 169:96 –98.
16. Tiwari M. 2011. Ilmu di balik air liur manusia. J.Nat. Sci. Biol. Med. 2:53–58.
17. Holsinger F, Bui D. 2007. Gangguan kelenjar ludah. Springer, Berlin, Jerman.
18. Drobitch RK, Svensson CK. 1992. Pemantauan obat terapeutik dalam air liur: pembaruan. klinik Farmakokinet.
23:365–379.
19. Haeckel R, Hanecke P. 1993. Aplikasi air liur, keringat, danair mata D

cairanuntuk tujuan diagnostik. Ann. Biol. klinik (Paris) 51:903–910.

o

20. Jusko WJ, Milsap RL. 1993. Prinsip-prinsip

w

farmakokinetik dari Distri obat

n

bution dalam air liur. Ann. NY Acad. Sci. 694:36 –47. l

21. Zelles T, Purushotham KR, Macauley SP, Oxford GE,

Humphreys a

Beher MG. 1995. Tinjauan singkat. Air liur dan faktor pertumbuhan: sumber awet muda ada di dalam diri kita semua. J. Penyok.
Res. 74:1826 – 1832. d

22. Rehak NN, Cecco SA, Csako G. 2000. Komposisi biokimia dan keseimbangan elektrolit dari air liur manusia utuh yang "tidak
distimulasi". klinik Kimia Lab. Med. 38:335.
o

23. Campo J, Perea MA, Del Romero J, Cano J, Hernando V, Bascones A.

2006. Transmisi oral HIV, kenyataan atau fiksi? Sebuah pembaharuan. Dis.12:219 –228.
h

24. Miller S. 1994. Tes air liur—alat diagnostik nontradisional. Klinik.Lab. Sci. 7:39 –44. r

25. Challacombe SJ, Percival RS, Marsh PD. 1995. Perubahan terkait usia pada isotipe imunoglobulin dalam air liur dan serum
parotis secara keseluruhan dan pada individu yang sehat. Mikrobiol oral. kekebalan. 10:202–207. .

26. Kozaki T, Lee S, Nishimura T, Katsuura T, Yasukouchi A. 2011. Pengaruh pengumpulan air liur menggunakan kapas pada uji
imuno enzim melatonin. J. Circadian Rhythms 9:1.
27. Navazesh M. 1993. Metode pengumpulan air liur. Ann. NY Acad. Sci. 694:72–77.
28. Silberring J, Ciborowski P.biomarker 2010. Penemuandan proteomik klinis. Tren Anal. Kimia 29:128 -140.
29. Ilyin SE, Belkowski SM, Plata-Salaman CR. 2004. Penemuan biomarker dan validasi: teknologi dan pendekatan integratif.
1

Tren Bioteknologi. 22:411–416.

30. Wagner PD, Verma M, Srivastava S. 2004. Tantangan bagi biomarker dalam deteksi kanker. Ann. NY Acad. Sci. 1022:9 – 16.
31. Kurian S, Grigoryev Y, Kepala S, Campbell D, Mondala T, Salomon DR. 2007. Menerapkan genomik untuk kedokteran
y

transplantasi organ dalam penemuan dan validasi biomarker. Int. Imunofarmaka. 7:1948 – 1960. o

32. Bonassi S, Neri M, Puntoni R. 2001. Validasi biomarker sebagai prediktor awal penyakit. mutasi. Res. 480 – 481:349 –358.
33. Haffajee AD, Socransky SS. 1994. Agen etiologi mikroba penyakit periodontal destruktif. Periodontol. 2000 5:78 –111.
34. Paju S, Pussinen P, Suominen-Taipale L, Hyvönen M, Knuuttila M, Könönen E. 2009. Deteksi beberapa spesies patogen
dalam air liur dikaitkan dengan infeksi periodontal pada orang dewasa. J.klin. Mikrobiol. 47: 235–238.
35. Segata N, Haake S, Mannon P, Lemon K, Waldron L, Gevers D, Huttenhower C, Izard J. 2012. Komposisi saluran
pencernaan dewasa n

mikrobioma bakteri berdasarkan tujuh permukaan mulut, amandel, tenggorokan dan sampel tinja. Biola genom. 13:R42.
36. Turnbaugh PJ, Ley RE, Hamady M, Fraser-Liggett CM, Knight R, Gordon JI. 2007. Proyek Mikrobioma Manusia. Sifat
449:804 – 810. L

37. Kelompok Kerja NIH HMP, Peterson J, Garges S, Giovanni M, McInnes P, Wang L, Schloss JA, Bonazzi V, McEwen
b

JE Wetterstrand KA, Deal C, Baker CC, Di Francesco V, Howcroft TK, Karp RW, Lunsford RD, Wellington CR, Belachew T,
r

Wright M,
Giblin C, David H, Mills M, Salomon R, Mullins C, Akolkar B, Begg L, Davis C, Grandison L, Humble M, Khalsa J, Little AR,
s
 Peavy H,
Pontzer C, Portnoy M, Sayre MH, Starke-Reed P, Zakhari S, Read J, Watson B, Guyer M. 2009. The Proyek Mikrobioma Manusia
NIH.
Res. Genom 19:2317–2323.
38. Zaura E, Keijser B, Huse S, Crielaard W. 2009. Mendefinisikan "mikrobioma inti" yang sehat dari komunitas mikroba
oral. Mikrobiol BMC. 9:259. doi:10.1186/1471-2180-9-259.
39. Griffen AL, Beall CJ, Firestone ND, Gross EL, DiFranco JM, Hardman JH, Vriesendorp B, Faust RA, Janies DA,
Leys EJ.
2011. INTI:secara database 16S rDNA yang dikuratorifilogenetik dari bioma mikro oral inti. PLoS One 6:e19051.
doi:10.1371/journal.pone.0019051.
40. Nasidze I, Quinque D, Li J, Li M, Tang K, Stoneking M. 2009. Analisis komparatif keragaman mikrobioma air liur
manusia dengan pendekatan pyrosequencing dan kloning barcode. dubur. Biokimia. 391:64 –68.
41. Paster BJ, Boches SK, Galvin JL, Ericson RE, Lau CN, Levanos VA, Sahasrabudhe A, Dewhirst FE. 2001.
Keanekaragaman bakteri pada plak subgingiva manusia. J. Bakteri. 183:3770 –3783.
42. Sakamoto M, Umeda M, Benno Y. 2005. Analisis molekuler mikrobiota mulut manusia. J. Periodontal Res. 40:277–285.
43. Liu B, Faller LL, Klitgord N, Mazumdar V, Ghodsi M, Sommer DD, Gibbons TR, Treangen TJ, Chang YC, Li S, Stine
OC, Hasturk H, Kasif S, Segrè D, Pop M, Amar S. 2012. Sekuensing mendalam dari mikrobioma oral mengungkapkan
tanda-tanda penyakit periodontal. PLoS One 7:e37919. doi:10.1371/journal.pone.0037919.
44. Bik EM, CD Panjang, Armitage GC, Loomer P, Emerson J, Mongodin EF, Nelson KE, Gill SR, Fraser-Liggett CM,
Relman DA. 2010. Keanekaragaman bakteri dalam rongga mulut 10 individu sehat. ISME J. 4:962–974.
45. Mandel I. 1987. Fungsi air liur. J. Penyok. Res. 66:623–627. 46. Keijser BJF, Zaura E, Huse SM, van der Vossen JMBM,
Schuren FHJ, Montijn RC, sepuluh Cate JM, Crielaard W. 2008. Analisis pyrosequencing mikroflora oral orang dewasa yang
sehat. J. Penyok. Res. 87:1016 –1020. 47. Colombo APV, Boches SK, Cotton SL, Goodson JM, Kent R, Haffajee AD,
Socransky SS, Hasturk H, Van Dyke TE, Dewhirst F, Paster BJ. 2009. Perbandingan profil mikroba subgingiva dari
periodontitis refrakter, periodontitis parah, dan kesehatan periodontal menggunakan microarray identifikasi mikroba oral
manusia. J.Periodontol. 80:1421–1432. 48. Colombo APV, Bennet S, Cotton SL, Goodson JM, Kent R, Haffajee AD,
Socransky SS, Hasturk H, Van Dyke TE, Dewhirst FE, Paster BJ. 2012. Dampak terapi periodontal pada mikrobiota
subgingiva dari periodontitis berat: perbandingan antara responden yang baik dan individu dengan periodontitis refrakter
menggunakan microarray identifikasi mikroba oral manusia. J.Periodontol. 83:1279 –1287.
49. Paster BJ, Dewhirst FE. 2009. Diagnosis mikroba molekuler. Tol periodon. 2000 51:38 –44.
50. Pozhitkov AE, Beikler T, Flemmig T, Noble PA. 2011. Metode throughput tinggi untuk analisis mikrobioma oral manusia.
Periodontol. 2000 55:70 –86.
51. Larmas M. 1975. Sebuah teknik dipslide baru untuk menghitung lac tobacilli saliva. Prok. Finn. Lekuk. Soc. 71:31–35.
52. Jordan HV, Laraway R, Snirch R, Marmel M. 1987. Sistem diagnostik yang disederhanakan untuk deteksi budaya dan
penghitungan Streptokokus cus mutans. J. Penyok. Res. 66:57–61.
53. Jensen B, Bratthall D. 1989. Sebuah metode baru untuk estimasi streptokokus mutans dalam air liur manusia. J. Penyok.
Res. 68:468 –471.
54. Petersson GH, Bratthall D. 2000. Penilaian risiko karies: perbandingan antara program komputer 'Cariogram,' ahli
kesehatan gigi dan dokter gigi. Swedia. Lekuk. J.24 :129 –137.
55. Kneist S, Heinrich-Weltzien R, Fischer T, Klein C, Rupf S, Eschrich K. 1999. Handelsübliche Speicheltests zum Mutans-
¨
Nachweis-U bersicht und Effizienzbewertung. Quintessenz 50:33–43.
56. Glavina D, Gorseta K, Skrinjaric´ I, Vranic D, Mehulic´ K, Kozul K. 2012. Pengaruh yoghurt LGG pada Streptococcus
mutans dan Lactobacillus spp. jumlah saliva pada anak-anak. Kol. Antropol. 36:129 -132.
57. Näse L, Hatakka K, Savilahti E, Saxelin M, Ponka A, Poussa T, Korpela R, Meurman JH. 2001. Pengaruh konsumsi
jangka panjang dari bakteri probiotik, Lactobacillus rhamnosus GG, dalam susu pada karies gigi dan risiko karies pada
anak-anak. Karies Res. 35:412–420.
58. Solemdal K, Sandvik L, Willumsen T, Mowe M, Hummel T. 2012. Dampak kesehatan mulut pada kemampuan rasa pada
lansia yang dirawat di rumah sakit akut. PLoS One 7:e36557. doi:10.1371/journal.pone.0036557.
59. Bowden GH. 1997. Apakah penilaian komposisi mikroba plak/saliva memungkinkan diagnosis aktivitas penyakit individu?
Penyok komunitas. Epidemi Oral. 25:76 –81.
60. Lazarevic V, Whiteson K, Gaia N, Gizard Y, Hernandez D, Farinelli L, Osteras M, Francois P, Schrenzel J. 2012.
Analisis krobioma mi saliva menggunakan teknik kultur-independen. J.klin. Bioinformatika 2:4. doi:10.1186/2043-9113-2-4.
61. Sakamoto M, Umeda M, Ishikawa I, Benno Y. 2000. Perbandingan flora bakteri mulut dalam air liur dari subjek sehat dan
dua pasien periodontitis dengan analisis urutan perpustakaan 16S rDNA. Mikrobiol. tidak ada. 44:643–652.
62. Kumar PS, Griffen AL, Moeschberger ML, Leys EJ. 2005. Identifikasi kandidat patogen periodontal dan spesies yang
menguntungkan dengan analisis klon 16S kuantitatif. J.klin. Mikrobiol. 43:3944 –3955.
63. Gursoy UK, Könönen E, Pussinen PJ, Tervahartiala T, Hyvärinen K, Suominen AL, Uitto VJ, Paju S, Sorsa T. 2011.
Penggunaan penanda saliva yang diturunkan dari host dan bakteri dalam mendeteksi periodontitis: pendekatan kumulatif .
Dis. Penanda 30:299 –305.
64. Takeshita T, Suzuki N, Nakano Y, Shimazaki Y, Yoneda M, Hirofuji T, Yamashita Y. 2010. Hubungan antara bau
mulut dan komposisi global populasi bakteri asli dalam air liur. aplikasi lingkungan. Mikrobiol. 76:2806 –2814. D

65. Luo AH, Yang DQ, Xin SM, Paster BJ, Qin J. 2012. profil Mikroba di air liur dari anak-anak dengan dan tanpa karies pada
o

campuran gigi. Lisan w

Dis. 18:595–601.
66. Paster BJ, Olsen I, Aas JA, Dewhirst FE. 2006. Luasnya bakteri keanekaragamandalam saku periodontal manusia dan lainnya
suatu

lisan sites.Periodon tol. 2000 42:80 –87.

d

67. OraSure Technologies Inc. 2004. OraQuick memajukanHIV-1/2 sisipan paket tes antibodiyang cepat. OraSure Technologies
Inc., Bethlehem, PA.
68. Delaney KP, Branson BM, Uniyal A, Kerndt PR, Keenan PA, Jafa K, Gardner AD, Jamieson DJ, Bulterys M. 2006. Kinerja
tes HIV-1/2 cairan oral yang cepat: pengalaman dari empat penelitian CDC. AIDS 20: 1655-1660. :

69. OraSure Technologies Inc. 2013. Sisipan paket kit blot Barat OraSure HIV-1. OraSure Technologies Inc., Bethlehem, PA.
70. Badan Pengawas Obat dan Makanan AS. Juli 2012. Pertama, penggunaan cepat HIV di rumah yang disetujui untuk pengujian
mandiri. Informasi Kesehatan Konsumen FDA.http://www.fda.gov/downloads/ForConsumers/ConsumerUpdates/UCM311690.pdf.
Diakses 6 Mei 2013. .

71. Campsmith ML, Rhodes PH, Hall HI, Green TA. 2010. Prevalensi HIV yang tidak terdiagnosis di antara orang dewasa dan
remaja di Amerika Serikat pada
akhir tahun 2006. J. Acquir. Defisiensi imun. Sindr. 53:619 –624. n

72. Marks G, Crepaz N, Janssen RS. 2006. transmisi seksual Memperkirakan HIV dari orang sadar dan tidak menyadari bahwa
mereka terinfeksi dengan virus

di Amerika Serikat AIDS 20:1447-1450.

73. Ahmed M, Islam M, Munshi S, Andalib S, Tabassum S. 2011. Menguji antibodi virus hepatitis A dalam cairan mulut di antara
calon vaksin mendorong kebutuhan tes cepat HAV oral baru. India J Med. Mikrobiol. 29:72–73.
74. Oba IT, Spina AMM, Saraceni CP, Lemos MF, Senhoras R, Moreira RC, Granato CFH. 2000. Deteksi antibodi hepatitis A
dengan ELISA menggunakan saliva sebagai sampel klinis. Pdt. Med. Trop. Sao Paulo 42:197– 200.
75. Chen L, Liu F, Fan X, Gao J, Chen N, Wong T, Wu J, Wen SW. 2009. Deteksi antigen permukaan hepatitis B, antigen inti
hepatitis B, dan
DNA virus hepatitis B pada jaringan parotis. Int. J. Menginfeksi. Dis. 13:20 -23.

76. Goncalves PL, Cunha CB, Busek SCU, Oliveira GC, Ribeiro Rodrigues R, Pereira FE. 2005. Deteksi hepatitis C virus RNA di o

air liur sampel dari pasien dengan antibodi anti-HCV seric. braz. J. Menginfeksi. Dis. 9:28 –34.
77. Gonzalez V, Martro E, Folch C, Esteve A, Matas L, Montoliu A, Grifols JR, Bolao F, Tural C, Muga R, Parry JV, Ausina V,
Casabona J. 2008. Deteksi antibodi virus hepatitis C pada spesimen cairan oral untuk studi prevalensi. Eur. J.klin. Mikrobiol.
Menulari. Dis. 27:121–126.

78. OraSure Technologies Inc. 2010. Tes antibodi cepat HCV Oraquick sisipan paket. OraSure Technologies Inc., Bethlehem, PA.
dan

79. Drobnik A, Judd C, Banach D, Egger J, Konty K, Rude E. 2011. Publik implikasi kesehatan dari skrining hepatitis C cepat
dengan swab oral untuk
organisasi berbasis masyarakat yang melayani populasi berisiko tinggi. NS. J. Kesehatan Masyarakat 101:2151–2155.
80. Estevez P, Satoguina J, Nwakanma D, West S, Conway D, Drakeley C. 2011. Air liur manusia sebagai sumber antibodi anti-
malaria untuk memeriksa paparan populasi terhadap Plasmodium falciparum. Malar. J. 10:104. doi:10.1186/1475-2875-10-104.
81. Yap G, Sil BK, Ng LC. 2011. Penggunaan saliva untuk diagnosis dini dengue. PLoS Negl. Trop. Dis. 5:e1046.
doi:10.1371/journal.pntd.0001046.
82. Eguchi J, Ishihara K, Watanabe A, Fukumoto Y, Okuda K. 2003. Metode PCR sangat penting untuk mendeteksi
Mycobacterium tuberculosis dalam sampel rongga mulut. Mikrobiol oral. kekebalan. 18:156 –159.
83. Formenty P, Leroy EM, Epelboin A, Libama Fo Lenzi M, Sudeck H, Yaba P, Allarangar Y, Boumandouki P,
Nkounkou VB, Drosten C, Grolla A, Feldmann H, Roth C. 2006. Deteksi virus Ebola di spesimen cairan mulut selama
wabah demam berdarah virus Ebola di Republik Kongo. klinik Menulari. Dis. 42:1521–1526.
84. Furuta Y, Fukuda S, Chida E, Takasu T, Ohtani F, Inuyama Y, Nagashima K. 1998. Reaktivasi virus herpes simpleks
tipe 1 pada pasien dengan Bell's palsy. J. Med. Viral. 54:162–166.
85. DJ Blackbourn, Lennette ET, Ambroziak J, Mourich DV, Levy JA. 1998. Deteksi human herpesvirus 8 pada sekret
hidung dan air liur. J. Menginfeksi. Dis. 177:213–216.
86. Gautheret A, Aubin JT, Fauveau V, Rozenbaum W, Huraux JM, Agut H. 1995. Tingkat deteksi virus herpes manusia-6
pada berbagai tahap infeksi HIV. Eur. J.klin. Mikrobiol. Menulari. Dis. 14:820 –824.
87. Boppana SB, Ross SA, Shimamura M, Palmer AL, Ahmed A, Michaels MG, Sanchez PJ, Bernstein DI, Tolan RW,
Novak Z, Chowdhury N, Britt WJ, Fowler KB. 2011. Uji reaksi berantai polimerase air liur untuk skrining cytomegalovirus
pada bayi baru lahir. N. Inggris. J. Med. 364:2111–2118.
88. Brodie EL, DeSantis TZ, Joyner DC, Baek SM, Larsen JT, Andersen GL, Hazen TC, Richardson PM, Herman DJ,
Tokunaga TK, Wan JM, Firestone MK. 2006. Penerapan pendekatan mi croarray oligonukleotida densitas tinggi untuk
mempelajari dinamika populasi bakteri selama reduksi dan reoksidasi uranium. aplikasi Mengepung. Mikrobiol. 72:6288 –
6298.
89. Ballarini A, Segata N, Huttenhower C, Jousson O. 2013. Kuantifikasi simultan dari banyak bakteri oleh microarray
BactoChip yang ditandatangani untuk menargetkan gen penanda spesifik spesies. PLoS One 8:e55764. doi:
10.1371/journal.pone.0055764.
90. Docktor MJ, Paster BJ, Abramowicz S, Ingram J, Wang YE, Correll M, Jiang H, Cotton SL, Kokaras AS, Bousvaros
A. 2012. Perubahan keragaman mikrobioma oral pada penyakit radang usus pediatrik. radang. Dis. 18:935–942.
91. Michaud DS, Joshipura K, Giovannucci E, Fuchs CS. 2007. Sebuah studi prospektif penyakit periodontal dan kanker
pankreas pada profesional kesehatan pria AS. J.Natl. Kanker Inst. 99:171–175.
92. Hujoel PP, Drangsholt M, Spiekerman C, Weiss NS. 2003. Eksplorasi asosiasi periodontitis-kanker. Ann. Epidemiol.
13:312– 316.
93. Stolzenberg-Solomon RZ, Dodd KW, Blaser MJ, Virtamo J, Taylor PR, Albanes D. 2003. Kehilangan gigi, kanker
pankreas, dan Helicobacter pylori. NS. J.klin. nutrisi 78:176 -181.
94. Farrell JJ ZL, Zhou H, Chia D, Elashoff D, Akin D, Paster BJ, Joshipura K, Wong DT. 2012. Variasi mikrobiota rongga
mulut berhubungan dengan penyakit pankreas termasuk kanker pankreas. Gut 61:582– 588.
95. Park NJ, Zhou H, Elashoff D, Henson BS, Kastratovic DA, Abemayor E, Wong DT. 2009. Salivary microRNA:
discovery, characterization, and clinical utility for oral cancer detection. klinik Kanker Res. 15:5473–5477.
96. Hu S, Wang J, Meijer J, Ieong S, Xie Y, Yu T, Zhou H, Henry S, Vissink A, Pijpe J, Kallenberg C, Elashoff D, Loo JA,
Wong DT. 2007. Salivary proteomic and genomic biomarkers for primary Sjögren's syn drome. Rematik Arthritis. 56:3588
–3600.
97. Lee YH, Kim J, Zhou H, Kim B, Wong D. 2012. Salivary transcrip tomic biomarkers for detection of ovarian cancer: for
serous papillary adenocarcinoma. J. Mol. Med. 90:427–434.
98. Brinkmann O, Wong DT. 2011. Salivary transcriptome biomarkers in oral squamous cell cancer detection. Adv. klinik
Kimia 55:21–34. 99. Schulz BL, Cooper-White J, Punyadeera CK. 2012. Saliva proteome research: current status and future
outlook. Kritis. Rev. Biotechnol. 33: 246 –259.
100. Kawas SA, Rahim ZHA, Ferguson DB. 2012. Potential uses of human salivary protein and peptide analysis in the
diagnosis of disease. Lengkungan. Oral Biol. 57:1–9.
101. Spielmann N, Wong DT. 2011. Saliva: diagnostics and therapeutic per spectives. Dis. 17:345–354.
102. Streckfus C, Bigler L. 2005. The use of soluble, salivary c-erbB-2 for the detection and post-operative follow-up of breast
cancer in women: the results of a five-year translational research study. Adv. Dent. Res. 18:17–24.
103. Genco RJ, Grossi SG, Ho A, Nishimura F, Murayama Y. 2005. A proposed model linking inflammation to obesity,
diabetes, and peri odontal infections. J. Periodontol. 76:2075–2084.
104. Huang CM. 2004. Comparative proteomic analysis of human whole saliva. Lengkungan. Oral Biol. 49:951–962.
105. St John MA, Li Y, Zhou X, Denny P, Ho C, Montemagno C, Shi W, Qi F, Wu B, Sinha U, Jordan R, Wolinsky L, Park N, Liu
H, Abemayor E, Wong DT. 2004. Interleukin 6 and interleukin 8 as potential biomarkers for oral cavity and oropharyngeal squamous
cell carcinoma. Arch.Otolaryngol. Head Neck Surg. 130:929 –935. w
106. Rao PV, Reddy AP, Lu X, Dasari S, Krishnaprasad A, Biggs E, Roberts CT, Nagalla SR. 2009. Proteomic identification of
salivary biomarkers of type-2 diabetes. J. Proteome Res. 8:239 –245.
107. Landrum ML, Wilson CH, Perri LP, Hannibal SL, O'Connell RJ. 2005. Usefulness of a rapid human immunodeficiency virus-1
antibody test for the management of occupational exposure to blood and body fluid. In fect. Control Hosp. Epidemiol. 26:768 –774.
108. Russo V. 1996. Epigenetic mechanisms of gene regulation, vol 32. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor,
NY. t

109. Ohgane J, Yagi S, Shiota K. 2008. Epigenetics: the DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated
:

regions in cells.
/

Placenta 29(Suppl):29 –35.

110. Herman JG, Baylin SB. 2003. Gene silencing in cancer in association with promoter hypermethylation. N. Inggris. J. Med.
349:2042–2054. s

111. Viet CT, Schmidt BL. 2008. Methylation array analysis of preoperative and postoperative saliva DNA in oral cancer patients.
Epidemi Kanker.
Biomarker Sebelumnya 17:3603–3611. r

112. Carvalho AL, Henrique R, Jeronimo C, Nayak CS, Reddy AN, Hoque MO, Chang S, Brait M, Jiang WW, Kim MM,
Claybourne Q, Gold
enberg D, Khan Z, Khan T, Westra WH, Sidransky D, Koch W, Califano JA. 2011. Detection of promoter hypermethylation in
salivary rinses as a biomarker for head and neck squamous cell carcinoma surveillance. klinik Kanker Res. 17:4782–4789.
a

113. Righini CA, de Fraipont F, Timsit J-Fo Faure C, Brambilla E, Reyt E, Favrot MC. 2007. Tumor-specific methylation in saliva:
a promising
biomarker for early detection of head and neck cancer recurrence. klinik Kanker Res. 13:1179 –1185. 4

114. Boks MP, Derks EM, Weisenberger DJ, Strengman E, Janson E, Sommer IE, Kahn RS, Ophoff RA. 2009. The relationship
of DNA
methylation with age, gender and genotype in twins and healthy Controls. PLoS One 4:e6767. doi:10.1371/journal.pone.0006767.
115. Fraga MF, Ballestar E, Paz MF, Ropero S, Setien F, Ballestar ML, Heine-Suñer D, Cigudosa JC, Urioste M, Benitez J,
Boix-Chornet M,
Sanchez-Aguilera A, Ling C, Carlsson E, Poulsen P, Vaag A, Stephan Z, Spector TD, Wu YZ, Plass C, Esteller M. 2005.
Epigenetic differences arise during the lifetime of monozygotic twins. Prok. Natal akad. Sci. USA 102:10604 –10609.
116. Bocklandt S, Lin W, Sehl ME, Sánchez F, Sinsheimer JS, Horvath S, Vilain E. 2011. Epigenetic predictor of age. PLoS One
6:e14821. doi:10 .1371/journal.pone.0014821.
117. Lee H, Park M, Choi A, An J, Yang W, Shin KJ. 2012. Potential forensic application of DNA methylation profiling to body fluid
identification. Int. J. Legal Med. 126:55–62. i

118. Goodson JM, Groppo D, Halem S, Carpino E. 2009. Is obesity an oral bacterial disease? J. Dent. Res. 88:519 –523. s

119. Forde MD, Koka S, Eckert SE, Carr AB, Wong DT. 2006. Systemic assessments utilizing saliva. Part I. General considerations
y

and current L

assessments. Int. J. Prosthodont. 19:43–52.

120. Haeckel R, Hänecke P. 1996. Application of saliva for drug monitoring:an in vivo model for transmembrane transport. Eur. J.klin.
Kimia klinik i

Biochem. 34:171–191. s
 790 cmr.asm.org Clinical Microbiology Reviews

Janice M. Yoshizawa received her Ph.D. in bi
ological sciences from the University of Califor
nia, Irvine, with an emphasis in biochemistry,
molecular biology, and microbiology. She spent
over 2 years as a postdoc in the laboratory of Dr.
David TW Wong at the UCLA School of Den
tistry, conducting clinical research based on
ology at The Forsyth Institute in Cambridge,
MA. He is also Professor of the Department of
Oral Medicine, Infection and Immunity at the
Harvard School of Dental Medicine, Harvard
Medical School, Boston, MA. He is an Adjunct
Professor at the Institute of Oral Biology at the
University of Oslo and at the Bouvé College of D

identifying salivary biomarkers for the early de Health Sciences, Northeastern University, Bos
tection of various oral and systemic diseases. o

She is currently working at the UCLA Clinical ton, MA. He is also an Affiliate Member of the w

Microarray Core, with a focus on next-genera n

tion sequencing. Faculty of Arts and Sciences at Harvard University. Dr. Paster
received his l

Christopher A. Schafer, MBA, Ph.D., com

pleted hisinBS and undergraduate clinical trainfellow with Dr. Carl Woese
d

Massachusetts Amherst. He was a postdoctoral e

ing in dietetics at the University of Pittsburgh. at the University of Illinois in Urbana and with Dr. Ron Gibbons at
He then obtained his Ph.D. in genetic, molecu The
lar, and cellular biology from the University of
d

Southern California (USC), under the mentor

ship of Dr. Robert Maxson, while simultane
Forsyth Institute before becoming a member of staff at The Forsyth
ously completing his MBA at Pepperdine Uni
Institute
versity. Currently, he is a postdoctoral scholar r
f

and project manager in the laboratory of David o

TWWong, DMD, DMSc., at the University in 1986. m

of California Los Angeles Dental Research Institute,

pursuing a career in molecular diagnostics research and
product development. t
h

David TW Wong, DMD, DMSc. is the Fe p

Jason J. Schafer, Pharm.D., MPH, BCPS, :

AAHIVP, is a Clinical Pharmacy Specialist in

/

lix & Mildred Yip Endowed Professor and As

Infectious Diseases and Assistant Professor of c
/

Pharmacy Practice at the Jefferson School of sociate Dean of Research and Director of the
Pharmacy in Philadelphia. He received his
m

Pharm.D. from Duquesne University and com Oral/Head and Neck Oncology Research Cen
r

pleted 2 years of residency—the first at the .

Mercy Hospital of Pittsburgh and the second ter at UCLA. Dr. Wong is an active scientist in
specializing in Infectious Diseases at the Ohio
s

State University Medical Center. He also re oral cancer and saliva diagnostics research. dia
cently received his MPH from the Jefferson
.

has authored over 230 peer-reviewed scientific

School of Population Health. Jason's clinical practice site is o

an HIV specialty care clinic, where he provides medication

r

publications. He is a fellow of the American As

therapy management services. g

James J. Farrell is Director of the Yale Center sociation for the Advancement of Sciences o

for Pancreatic Disease and Endoscopic Oncol n

ogy at the Yale University School of Medicine in (AAAS), a past member of the ADA Council of
New Haven, CT, and an Associate Professor of
Medicine. In addition to being a practicing clin M

ical gastroenterologist, Dr. Farrell is a board Scientific Affairs, and the past president of the a

certified clinical pharmacologist, interventional American Association of Dental Research (AADR).

endoscopist, and clinical and translational re
kamu

searcher focused on pancreatic cancer. He is a

member of the 2012 American Association for 2

Cancer Research (AACR) Scientific Program

1

Committee, the PANCAN Medical Advisory Board, and the

NIH/NCI Na tional Pancreas Cancer Task Force. Dr. Farrell 2

has authored dozens of arti cles and scientific abstracts in 0

the field of pancreatic cancer early diagnosis and 1

treatment, pancreatic cysts, and treatment-predictive 4

biomarkers. He speaks on clinical topics at local, national,

and international meetings to both professional and lay b

audiences. y

Molecular Analysis of Saliva and the Oral Microbiome

N

Bruce J. Paster is presently Senior Member of

r

Staff and Chair of the Department of Microbi

h
 U

C
i

a
e

r
r

o
s

l
i

i
t

n
y

S
i

r
a

e r

October 2013 Volume 26 Number 4 cmr.asm.org 791