LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

LEMBAR KERJA PESERTA DIDIK

(LKPD)

SINTESIS PROTEIN (EKSPRESI GEN)

Disusun Oleh:
Riki Khaerul Anwar, S.Pd.

Nama : SARAH AULIA IBRAHIM

Kelas : XII IPS 3

1
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

Sintesis Protein (Ekspresi Gen)

KOMPETENSI DASAR

3.3. Menganalisis hubungan struktur dan fungsi gen, DNA, kromosom dalam penyampaian
kode genetik (DNA-RNA-Protein).

4.3. Merumuskan urutan proses sintesis protein dalam kaitannya dengan penerapan prinsip
pewarisan sifat pada makhluk hidup.

TUJUAN

Peserta didik mampu menganalisis setiap tahapan dalam proses sintesis protein, meliputi
transkripsi dan translasi.

CARA KERJA

1. Lakukan literasi materi tentang bioproses yang terjadi di dalam sel, meliputi sintesis
protein melalui berbagai sumber!
2. Kerjakan LKPD pada bagian yang telah disediakan!
3. Jika ada hal yang kurang jelas, tanyakan pada guru!

TEORI SINGKAT

Ekspresi gen merupakan proses penterjemaahan informasi yang dikode di dalam gen
menjadi urutan asam amino selama sintesis protein. Apa itu sistesis protein? Sistesis protein
adalah prosedur biologis sebagai proses pembentukan partikel protein yang dilakukan oleh
sel-sel hidup untuk membuat protein dengan melibatkan sistesis RNA yang dipengaruhi oleh
DNA. Proses sintesis protein ini secara rinci memang sangat kompleks. Proses sintesis protein
ini dimulai dari produksi asam amino yang berbeda, dari yang beberapa berasal dari sumber

2
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

makanan. Dalam proses sintesa protein, molekul DNA adalah sumber pengkodean asam
nukleat untuk menjadi asam amino yang menyusun protein. Namun, DNA tidak terlibat secara
langsung dalam prosesnya tersebut. Molekul DNA pada suatu sel ditranskripsi menjadi
molekul RNA. RNA inilah yang kemudian ditranslasi menjadi asam amino sebagai penyusun
protein.
Sintesis protein berlangsung di dalam inti sel dan ribosom dengan bahan baku berupa
asam amino. Terdapat 20 jenis asam amino. Jenis asam amino dalam sintesis protein
ditentukan oleh DNA. Perbedaan jenis, jumlah, dan susunan asam amino menentukan jenis
protein yang disintesis, misalnya enzim, hormon, keratin, atau hemoglobin. Fenotipe suatu
organisme ditentukan oleh aktivitas protein fungsional dari suatu enzim. Jenis enzim yang
berbeda akan menimbulkan fenotipe yang berbeda pula. Jadi, sintesis protein merupakan
dasar untuk mempelajari bagaimana informasi genetik dalam DNA diekspresikan dalam suatu
mahkluk hidup serta menjelaskan bahwa protein sebagai jembatan yang menghubungkan
antara genotipe (faktor pembawa sifat) dengan fenotipe (sifat yang tampak). Hubungan
antara molekul DNA, RNA, dan asam amino dalam proses pembentukan protein dikenal pula
dengan istilah "Dogma sentral biologi”. Dogma sentral biologi ini merupakan rangkaian
proses DNA
membuat DNA dan RNA dan RNA membuat protein, yang dinyatakan dalam persamaan DNA
>> RNA >> Protein.
Sintesis protein adalah salah satu aktivitas mendasar suatu sel di dalam makhluk
hidup untuk mampu memproduksi atau mengolah protein. Sintesis protein merupakan proses
penyusunan asam-asam amino pada rantai polinukleotida. Kunci utama dalam proses sintesis
protein adalah DNA yang merupakan material genetika dari sel. Mengenai mekanisme
terjadinya proses sintesis protein maka kita akan dihadapkan pada dua tahapan utama.
Pembentukan protein atau sintesis protein mengalami dua tahap yakni transkripsi dan
translasi.

3
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

Setelah mempelajari materi tentang bioproses dalam sel berupa sintesis protein, jawablah
beberapa pertanyaan berikut ini!

1. Jelaskan perbedaan dari:

a. DNA template dan non template
DNA template adalah rantai DNA yang mengkode atau mencetak rantai mRNA
(kodon).Untaian ini TIDAK ditranskripsi atau dicetak menjadi mRNA sehingga disebut
anti-template.

b. DNA sense dan non sense

DNA SENSE adalah untaian DNA dengan arah 5′ → 3′ yang memiliki urutan / sekuens basa
nitrogen sama dengan mRNA (kecuali T diganti U).
DNA ANTISENSE adalah untaian DNA dengan arah 3′ → 5′ atau disebut untaian negatif (-).
Untaian ini berperan untuk melakukan transkripsi membentuk mRNA sehingga untaian ini disebut
Pencetak/Cetakan (Template).

c. Kodon dan Antikodon

Kodon adalah 3 pasang basa pada rantai mRNA yang menerjemahkan dan menjadi
kode 1 jenis asam amino. terdapat 64 macam kodon

antikodon adalah 3 pasang basa pada rantai tRNA yang mnjadi "pasangan" dari kodon.
tRNA membawa asam amino yang nantinya akan diproses dan disambung pada ribosom.

4
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

2. Jelaskan fungsi dari:

a. DNA template
Fungsi DNA templat di dalam proses PCR adalah sebagai cetakan untuk
pembentukan molekul DNA baru yang sama.
b. m RNA (RNA duta)
RNA duta berisi sumber informasi genetik dari DNA templat yang mengarahkan
pembentukan asam amino.Ini juga berisi beberapa wilayah peraturan yang menentukan
kecepatan dan aliran terjemahan.

c. t RNA (RNA transfer)

Transfer RNA (transfer-Ribonucleic acid) atau asam ribonukleat transfer adalah
molekul yang menginterpretasikan pesan genetik berupa serangkaian kodon di sepanjang
molekul mRNA dengan cara mentransfer asam-asam amino ke ribosom dalam proses
translasi.
d. r RNA (RNA ribosom)
Fungsinya yaitu bersama-sama dengan protein, RNA ini akan membentuk struktur
ribosom yang mengatur proses translasi.
3. Jelaskan tahapan-tahapan pada proses transkripsi berikut ini:
a. Inisiasi (permulaan) transkripsi
Inisiasi adalah terikatnya RNA polimerase pada rantai DNA (promoter), lalu RNA
polimerase akan memisahkan rantai ganda DNA dan menyiapkan template atau cetakan
untaian tunggal untuk ditranskripsi.

b. Elongasi (pemanjangan) transkripsi

Tahap Elongasi terjadi setelah ikatan antara anticodon tRNA inisiator dengan kodon
pertama mRNA selesai. Kemudian tRNA kedua akan berikatan dengan mRNA di kodon
kedua.Kemudian, ribosom bergeser pada molekul mRNA sepanjang satu kodon.
Pergerakan ini membuat tRNAprolinl bergerak ke tempat yang ditinggalkan tRNAmet

5
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

c. Terminasi (pengakhiran) transkripsi

Suatu proses diterminasi ketika proses tersebut telah selesai mengeksekusi
perintah terakhir atau diterminasi dengan sengaja oleh proses lain, biasanya proses induk
yang melakukan hal ini.

4. Jelaskan tahapan-tahapan pada proses translasi berikut ini:

a. Inisiasi (permulaan) translasi
Tahap inisiasi dari translasi terjadi dengan adanya mRNA, sebuah tRNA yang
memuat asam amino pertama dari polipeptida, dan dua sub unit ribosom. Pertama, sub unit
ribosom kecil mengikatkan diri pada mRNA dan tRNA inisiator khusus (lihat gambar). Sub
unit ribosom kecil melekat pada tempat tertentu di ujung 5` dari mRNA.

b. Elongasi (pemanjangan) translasi

- Pengenalan kodon = Antikodon yang membawa asam amino melekat pada sisi A
pada ribosom dan berikatan kovalen dengan mRNA
- Pembentukan polipeptida = Polipeptida yang berada di sisi P kemudian ditransfer
ke sisi A dengan inisiator yaitu rRNA. Polipeptida kemudian melekat di belakang peptida
yang dibawa RNAt tadi yang ada di sisi A.
- Translokasi = mRNA kemudian bergeser sehingga mRNA yang berada di sisi A
akan bergeser ke sisi P. Dikarenakan polipeptida masih berikatan dengan RNAt maka
polipeptida ikut juga bergeser. Sedangkan RNAt yang ada di sisi P akan pindah ke sisi E
dan pergi dari ribosom.

c. Terminasi (pengakhiran) translasi

yang merupakan akhir dari proses translasi. Dimana pada tahap ini mRNA telah
mencapai kodon stop atau akhir kodon, yang mana kodon ini akan mengaktifkan faktor

6
LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

pelepas yang menyebabkan ditambahkannya molekul air pada rantai asam amino yang
telah terbentuk.

5. Berikut ini adalah tabel kode genetik:

7
 LKPD Mata Pelajaran Biologi Kelas XIII (SINTESIS PROTEIN)

Jika rantai template (cetakan) DNA adalah 3’ TAC – ACG – ATA – TGG – ATT 5’, maka tentukan:
a. DNA sense (DNA coding/nontemplate)
TAC ACG ATA TGG ATT
b. m RNA (RNA duta/kodon)
AUG UGC UAU ACC UAA

c. t RNA (RNA transfer/antikodon)

UAC ACG AUA UGG AUU

d. Jumlah dan jenis asam amino penyusun polipeptida yang terbentuk

Ada 5 bisa dilihat dari tabel asam amino yang jelas AUG itu mentonin