PEMERINTAH PROVINSI JAWA TENGAH

DINAS KESEHATAN
Jl. Piere Tendean No. 24 Semarang Telepon 024-3517459
Faksimile 024-7517463 Laman http://www.jatengprov.go.id
Surat Elektronik dinaskesehatan@jatengprov.go.id

Semarang, 4 Februari 2022

Kepada
Yth. 1. Kepala Dinas Kesehatan Kabupaten/ Kota
2. Kepala Laboratorium Pemeriksa Covid-19
Se Jawa Tengah
di -
Tempat

SURAT EDARAN
NOMOR 965/243
TENTANG
Ketentuan Pengiriman specimen Whole Genom Sequencing (WGS)

Menindaklanjuti SE Kepala Badan Kebijakan Pembangunan Kesehatan Nomor

SR.01.06/I/592/2022 tanggal 28 Januari 2022 perihal Penguatan Deteksi Kasus Varian Virus
SARS-CoV-2 dari COVID-19, kami sampaikan Ketentuan Pengiriman Spesimen untuk
pemeriksaan WGS dan Pembagian zona rujukan WGS sebagai berikut :

A. Kriteria Kasus

1. Semua penderita konfirmasi di rawat di Rumah Sakit dengan gejala berat dan/atau
meninggal dunia;
2. Hasil tracing dari kasus positif (kontak);
a. Dirawat di Rumah Sakit dengan gejala klinis sakit berat atau meninggal dunia sesuai
ketentuan dalam Kepmenkes nomor HK.01.07/MENKES/4842/2021 tentang Jejaring
Laboratorium Surveilans GenomeVirus SARs-CoV-2;
b. Kasus kluster pada kondisi khusus yaitu kluster dengan jumlah > 25 orang kasus
maka jumlah sampel ditambah 3-5 sampel dari setiap kasus indeks.
3. Orang dengan Riwayat infeksi dan infeksi ulang;
4. Orang yang berpartisipasi dalam uji coba vaksin dan atau telah divaksinasi secara lengkap
(full dose):
5. Anak- anak dengan usia < 18 tahun pada daerah yang terjadi peningkatan kasus pada
anak; dan atau
6. Pelaku perjalanan internasional, pelintas batas negara dan pekerja migran yang tiba di
Indonesia.

B. Kriteria spesimen

1. Spesimen telah positif virus SARS-CoV-2 dengan nilai Ct (cycle threshold) gen target (RT-
PCR);
2. Spesimen dari kasus-kasus positif yang dikirim untuk WGS harus telah dilaporkan ke All
 Record-Tc-19;
3. Spesimen berupa sampel swab di dalam VTM (Viral Transport Medium) dengan volume >
600 μl.;
4. Spesimen yang tersisa untuk pemeriksaan WGS disimpan di lemari pendingin suhu 2-8
derajad Celcius selama maksimal 12 hari sejak hari pengambilan.;
5. Jika pengiriman akan dilakukan lebih dari 7 hari sejak pengambilan specimen harus
disimpan dilemari pendingin suhu - 80 derajat celcius. Hindari proses beku cair berulang
yang akan menimbulkan kerusakan pada sampel.;
6. Sampel dikemas dalam kotak pendingin dengan suhu 2-8 derajad celcius dan dikirim sesuai
zonasi rujukan ke:;
a. Laboratorium Biomolekuler, Balai Laboratorium dan PAK Provinsi Jawa Tengah, Jl.
Soekarno Hatta No. 185 Semarang, contac person dr. Yekti Hediningsih,Sp.PK, no
HP 0888 5407 738 atau;
b. Laboratorium COVID, Departemen Mikrobiologi FKKMK Universitas Gadjah Mada
(UGM) Yogyakarta, JL. Farmako, Senolowo, Sekip Utara, Kec. Depok, Sleman,
Yogyakarta 55281, contac Person Bp. Mulyono no HP 0813 2743 2188;

C. Pembagian Zona Rujukan WGS

NO KABUPATEN/KOTA LAB RUJUKAN WGS

1. Kab Brebes
2 Kab Tegal
3. Kota Tegal
4. Kab Pemalang
5. Kab Pekalongan
6. Kota Pekalongan
7. Kab Batang
8. Kab Kendal
9. Kota Semarang
10. Kab Semarang Balai Laboratorium Kesehatan
11. Kota Salatiga Provinsi Jawa Tengah
12. Kab Demak
13. Kab Grobogan
14. Kab Pati
15. Kab Jepara
16. Kab Rembang
17. Kab Blora
18. Kab Kudus
19. Kab Boyolali
20. Kab Temanggung
21. Kab Cilacap
22. Kab Banyumas
23. Kab Banjarnegara Laboratorium COVID FKKMK UGM
24. Kab Purbalingga
25. Kab Wonosobo
 26. Kab Magelang
27. Kota Magelang
28. Kab Purworejo
29. Kab Kebumen
30. Kab Wonogiri
31. Kab Sukoharjo
Laboratorium COVID FKKMK UGM
32. Kota Surakarta
33. Kab Sragen
34. Kab Karanganyar
35. Kab Klaten

D. Ketentuan Pengiriman Sampel

1. Pengiriman sampel wajib diketahui oleh Kepala Dinas Kesehatan Kab/Kota setempat.
2. Sebelum pengiriman sampel, fasyankes berkoordinasi dengan Dinas Kesehatan Kab/Kota
sesuai kriteria kasus.
3. Pengiriman sampel disertai dengan Surat Pengantar yang ditandatangani oleh pimpinan
fasyankes dengan tembusan Kepala Dinas Kesehatan Kab/Kota disertai data dukung
pasien (format terlampir).
4. Jam penerimaan sampel hari Senin sd Sabtu pukul 08.00 – 15.00 WIB.
5. Untuk pengiriman ke Laboratorium UGM, harus dikirim langsung dengan kurir, tidak melalui
jasa ekspedisi. Soft copy data pasien dikirim via email ke fkkmk@ugm.ac.id dengan subyek
Data WGS_Nama Faskes.
6. Pengiriman hasil pemeriksaan WGS/SGTV dari laboratorium wajib disampaikan kepada
Kepala Dinas Kesehatan Provinsi Jawa Tengah dengan alamat email
tricahyonoagus@yahoo.co.id dan khusus untuk laboratorium UGM memberikan tembusan
kepada Kepala Balabkes dan PAK Provinsi Jawa Tengah dengan email
wgslabkesjateng@gmail.com.

Demikian atas perhatian dan kerjasama yang baik selama ini, disampaikan terima kasih

Plt. KEPALA DINAS KESEHATAN

PROVINSI JAWA TENGAH
Sekretaris

Drs. AGUS TRI CAHYONO, Apt, M.Si

Pembina Tingkat I
NIP. 19670415 199303 1 010

Dokumen ini ditandatangani secara elektronik dengan menggunakan Sertifikat Elektronik yang diterbitkan
oleh Balai Sertifikasi Elektronik ( BSrE).