CHAPTER ONE : EVOLUTION THEORY

EVOLUTION
The Miracle
Dahulu kita percaya bahwa Tuhanlah yang menciptakan dunia. Saat ini
kebanyakan orang di Inggris percaya bahwa evolusi membawa kita ke sini. Ilmu
pengetahuan telah mengambil alih, tapi kemana arahnya?
 FROM GOD TO SCIENCE
Our Deeper
Understanding to Evolution
Pada awal abad ke-19, keanekaragaman spesies dipercaya sebagai
ciptaan Tuhan yang tidak dapat dibantahkan dalam waktu. Hasil
gagasan ini disebut sebagai creationism (ciptaan Tuhan) dan fixism
(spesies tidak bervariasi). Ide kedua konsep ini muncul dari tafsiran
literal Kitab Suci dalam Kejadian Lama.

Penemuan fosil mendiskreditkan fixism, digantikan oleh Teori

Katastrofisme yang mengakui keberadaan fosil, tetapi membela
fixism. Teori ini menyimpulkan bahwa hilangnya makhluk hidup
adalah akibat dari suatu bencana alam, namun makhluk hidup yang
hidup di masa lalu diciptakan dan tetap tidak berubah. Penciptaan ini
berulang dari waktu ke waktu.

Hingga muncul Lamarckism Theory. Jean Baptiste de Lamarck berpendapat bahwa satu
spesies berubah menjadi spesies lain seiring waktu. Perubahan yang terjadi di lingkungan
dengan memodifikasi organ tertentu tergantung digunakan atau tidak digunakannya.
Akibatnya, karakter asli perlahan-lahan digantikan oleh serangkaian karakter yang diperoleh.
Karakter tersebut akhirnya diwariskan dan akan tetap ada dari generasi ke generasi. Organisme
berevolusi dari bentuk sederhana ke bentuk kompleks.

Salah satu komponen teorinya adalah “L’influence des circonstances”

(pengaruh keadaan). Jerapah awalnya berleher pendek tetapi setiap generasi
jerapah dewasa akan menjulurkan lehernya untuk mencapai dedaunan lebih
tinggi yang tertinggal.
Teori ini berkembang sampai Charles Darwin, Bapak Evolusi mengemukakan pendapatnya.
Darwinism Theory mengemukakan bahwa evolusi tidak bergantung pada perubahan
lingkungan, tetapi pada keacakan genetik. Mutasi memungkinkan terjadinya evolusi. Dalam
keanekaragaman genetik yang besar, lingkungan berperan penting sebagai seleksi alam.
Individu dengan variasi yang menguntungkan akan bertahan hidup lebih lama, bereproduksi
lebih banyak, dan menularkan perubahannya kepada keturunannya.

Pada akhirnya, hingga sekarang, peradaban manusia sampai ke Neo Darwinism Theory, sebuah
pemahaman evolusi yang menyatukan pengetahuan dari berbagai bidang seperti genetik,
paleontologi, biokimia, ekologi, dan populasi genetik. Fisher, Haldane, Wright, Dobzhansky, Mayr,
Huxley, Simpson, Stebbins, Richard Dawkins, Futuyma, Gould and Smocovitis memiliki kontribusi
besar terhadap teori ini.

Tidak menerima pewarisan karakter yang diperoleh (teori Lamarck) - Kontribusi genetika
Mendel.
Pada individu aseksual, satu-satunya sumber variabilitas genetik adalah mutasi. Pada
individu dengan reproduksi seksual, mutasi, rekombinasi genetik dan seleksi alam
bertanggung jawab atas variabilitas genetik – Kontribusi genetika Mendel.
Seleksi alam menyebabkan perubahan himpunan alel dalam suatu populasi. Akibatnya,
alel yang memberikan fenotipe yang menguntungkan bagi individu akan meningkatkan
frekuensi alelnya dalam populasi – Kontribusi genetika populasi.
Populasi berevolusi, bukan individu, karena hasil reproduksi lah yang mengarah pada
evolusi - Kontribusi genetika populasi.
Evolusi terjadi secara bertahap seperti argumen Darwin. Evolusi merupakan hasil dari
perubahan kecil pada frekuensi alel (frekuensi populasi), oleh karena itu memiliki spesies
baru memerlukan proses yang sangat panjang – Kontribusi genetika populasi.
Spesiasi terjadi ketika mekanisme isolasi reproduksi muncul di antara populasi suatu spesies
karena pertukaran gen di antara mereka terganggu – Kontribusi biogeografi.
Pemahaman ini dilengkapi dengan penemuan August Weismann yang mempelajari
bagaimana ciri-ciri organisme berkembang dan berevolusi pada berbagai organisme,
kebanyakan serangga dan hewan air, di Jerman pada akhir abad kesembilan belas dan awal
abad kedua puluh. Weismann mengajukan teori kesinambungan plasma nutfah, teori hereditas.
Weismann mengatakan bahwa plasma nutfah adalah materi herediter dalam sel, dan orang tua
mewariskan kepada keturunannya hanya plasma nutfah yang terdapat dalam sel germinal (sel
sperma dan sel telur), bukan sel somatik atau sel tubuh.

Weismann meramalkan bahwa dalam reproduksi seksual, suatu bentuk reproduksi yang
melibatkan dua orang tua, jumlah idant yang biasanya terdapat dalam sel harus berkurang
menjadi setengahnya, sehingga, dari idant yang ada di dalam sel suatu keturunan, separuhnya
berasal dari sel germinal ibu dan separuhnya lagi berasal dari sel germinal induk. berasal dari
sel germinal ayah. Teori tersebut menjelaskan mengapa keturunannya memiliki sifat-sifat
yang mirip dengan sifat ibu dan ayah.

Weismann berpendapat bahwa seleksi germinal menciptakan variasi yang adaptif dan
bukan sekadar variasi acak. Weismann menggunakan teorinya untuk menjelaskan hilangnya
organ-organ yang tidak berguna, seperti mata ikan gua yang buta, selama perkembangan,
dengan menyatakan bahwa seleksi germinal menghilangkan faktor-faktor penentu organ-
organ tersebut. Weismann mengakui bahwa faktor eksternal, seperti faktor lingkungan, dapat
berperan dalam perkembangan organisme. Namun teorinya tentang seleksi germinal
memungkinkannya menjelaskan bagaimana variasi sifat baru dalam organisme muncul
bahkan ketika perubahan determinan tidak diturunkan dari orang tua ke keturunannya. Hanya
variasi faktor penentu yang ada di sel benih, yang dipengaruhi oleh perubahan nutrisi, yang
dapat diwariskan ke generasi berikutnya.
 Bidang evolusi menimbulkan banyak
pertanyaan menarik, dan para ilmuwan terus
mengeksplorasi berbagai aspek dari proses
yang kompleks dan dinamis ini. Salah satu
pertanyaan paling penting dan menyeluruh
dalam biologi evolusi adalah:

Dari perkembangan pemahaman evolusi ini,

umat manusia dapat memahami kulit luar
dari: “Bagaimana evolusi membentuk
keanekaragaman?”. Tentang bagaimana
proses evolusi merupakan hasil dari ratusan
ribu tahun, bukan proses kemarin sore.
Namun, ada hal yang menjadi pertanyaan.

Kita telah mendapatkan sedikit perbekalan

dari pengungkapan misteri kehidupan kita,
tetapi ada satu bagian yang masih belum
terpecahkan.

WHAT IS THE ORIGIN OF LIFE?

HOW DID THE FIRST CELLS FORM?
DO WE NEED A LIVING BEING TO
CREATE A LIVING BEING?

Semua makhluk hidup yang masih ada

berasal dari satu nenek moyang yang sama,
yang disebut LUCA, Leluhur Universal Terakhir.
Sulit untuk memikirkan pandangan hidup
yang lebih menyatukan. Semua makhluk
hidup terikat pada satu makhluk bersel
tunggal, akar dari pohon kehidupan yang
bercabang-cabang rumit.

All of use came from a mere single-celled

creature, a very dramatic story, lasting some 4
billion years.
CHAPTER TWO : THE NEWEST RESEARCH

THE o f L i f e
ORIGINS
Jika ada kehidupan lain di alam semesta. Jika ternyata kita tidak sendirian di
alam semesta ini. Seberapa mirip mereka dengan kita, manusia di Bumi? Apakah
mereka sama? Apakah mereka menggunakan DNA sebagai materi genetiknya?
Apakah mereka seperti Anda dan saya? Sama-sama terdiri dari sel?

Namun, sebelum memikirkan kemungkinan di luar, bagaimana cara kita

mempertimbangkan bagaimana kehidupan bisa muncul di planet kita sendiri?
Adaptasi dan seleksi alam. Bagaimana dengan selnya? Apakah kita semua
berasal dari satu induk sel nenek moyang yang sama?
Sebuah hipotesis yang terus berkembang, atau mungkin menunggu untuk
ditemukan.
 HOW MIGHT LIFE
Have Arisen?
Tahun 1920-an, Aleksandr Oparin dan J. B. S. Haldane secara terpisah mengusulkan Hipotesis
Oparin-Haldane: bahwa kehidupan di bumi muncul selangkah demi selangkah dari benda mati
melalui proses evolusi kimia bertahap.

Bumi purba memiliki atmosfer yang mengecil, miskin oksigen sehingga molekul cenderung
menyumbangkan elektron. Berdasarkan kondisi itu, molekul sederhana dapat bereaksi (dengan
energi dari petir/matahari) untuk membentuk bahan seperti asam amino dan nukleotida, yang
dapat terakumulasi di lautan, membentuk “sup primordial”.

Bahan-bahan tersebut dapat berkombinasi dalam reaksi lebih lanjut, membentuk molekul
(polimer) yang lebih besar dan lebih kompleks seperti protein dan asam nukleat. Polimer dapat
dirangkai menjadi unit/struktur yang mampu mempertahankan dan mereplikasi dirinya sendiri.
Oparin berpendapat bahwa ini mungkin merupakan “koloni” protein yang berkumpul bersama
untuk melakukan metabolisme, sementara Haldane berpendapat bahwa makromolekul
menjadi tertutup dalam membran untuk membuat struktur mirip sel.

Inilah yang menjadi awal dari Teori Abiogenesis.

 ABIOGENESIS THEORY
Teori abiogenesis adalah teori bahwa semua kehidupan dimulai dari molekul anorganik, yang
bergabung kembali dengan cara berbeda karena masukan energi. Bentuk-bentuk berbeda ini
akhirnya membentuk molekul yang dapat mereplikasi diri, yang mungkin menggunakan molekul
lain yang dihasilkan oleh abiogenesis untuk mulai menciptakan struktur dasar kehidupan, seperti
sel.

Sama seperti populasi yang berubah seiring waktu dalam evolusi organisme, evolusi molekul
melibatkan perubahan molekul seiring waktu. Para ilmuwan berspekulasi bahwa molekul
pertama yang mereplikasi diri mungkin adalah molekul RNA. Beberapa molekul RNA diketahui
memiliki kemampuan untuk mengkatalisis pembentukan molekul RNA baru, seperti yang terlihat
pada ribosom hampir semua makhluk di Bumi. Salah satu molekul RNA awal ini terbentuk tepat,
sehingga menghasilkan molekul RNA yang identik dengannya. Konsentrasi molekul ini dalam sup
prebiotik meningkat secara drastis, dan molekul tersebut selanjutnya berinteraksi dengan dirinya
sendiri dan beberapa protein terbentuk di sekitarnya, juga melalui abiogenesis.

Pada akhirnya, molekul RNA mengalami mutasi yang memungkinkannya mensintesis protein
yang akan menghasilkan lebih banyak RNA. Mutasi lain menyebabkan terciptanya protein yang
mensintesis untaian DNA dari RNA. Maka, lahirlah genom organisme modern. Selama jutaan
tahun sejarah evolusi, perubahan perlahan terakumulasi dalam molekul-molekul ini, sehingga
menimbulkan kompleksitas kehidupan yang dapat dilihat saat ini.

Abiogenesis, menurut definisi, hanyalah penciptaan molekul organik dari sumber anorganik. Ini
tidak berarti dimana kehidupan dimulai. Detail model ini mungkin kurang tepat. Misalnya, para
ahli geologi sekarang berpendapat bahwa atmosfer awal tidak berkurang. Namun gagasan
dasarnya – pembentukan molekul atau kumpulan biologis yang sederhana, kemudian lebih
kompleks, dan kemudian mandiri secara bertahap dan spontan – masih menjadi inti dari
sebagian besar hipotesis asal usul kehidupan saat ini.

Source : Gramedia Aristoteles

 FROM INORGANIC COMPOUNDS
To Building Blocks
Pada tahun 1953, Stanley Miller dan Harold Urey melakukan eksperimen untuk menguji ide
Oparin dan Haldane. Mereka menemukan bahwa molekul organik dapat diproduksi secara
spontan dalam kondisi reduksi yang dianggap mirip dengan kondisi bumi awal.

ORIGINAL PROTOCOLS AND RESULTS!

Setelah air mendidih, campuran gas
disirkulasikan melalui sistem melewati
elektroda yang mengeluarkan percikan
api (yang menyimulasikan petir), dan
kondensor mengubah sebagian gas
menjadi cair sehingga dapat kembali
ke ruang bawah. Setelah periode ini, isi
peralatan tersebut tampak berubah
warna. Larutan berwarna merah dan
kuning mulai terkumpul di dalam
perangkap setelah menjalankan
percobaan selama beberapa hari dan
menjadi kaldu merah dan coklat pada
akhir percobaan.

Mereka menemukan beberapa jenis

molekul organik sederhana dalam
sampel, termasuk asam amino,
beberapa di antaranya relevan
sebagai bahan penyusun protein yang
ada di semua organisme hidup. Miller
mampu mengidentifikasi asam amino
glisin, alfa-alanin (α-alanin), dan beta-
alanin (β-alanin) dengan percaya diri.
Namun, dia kurang yakin tentang
keberadaan asam aspartat dan asam
α-amino-n-butirat, yang tanda-tanda
analisisnya lemah.

Dia mengulangi eksperimennya pada awal tahun 1970-an dengan menggunakan peralatan
analisis yang lebih baik dengan sumber energi yang berbeda serta meningkatkan sirkulasi gas
melalui penambahan tabung kaca, yang mengungkapkan keberadaan 33 asam amino
berbeda, termasuk lebih dari setengah dari 20 atau lebih asam amino yang terdapat dalam
protein yang ada pada makhluk hidup.
 NEO-ABIOGENESIS
Teori ini menyatakan bahwa: Terbentuknya kehidupan pertama di melalui tahap-tahap
tertentu, secara evolusi. Harold Urey dan muridnya, Stanley Miller, membuktikan hipotesis
dengan melakukan eksperimen yang mensimulasikan atmosfer Bumi Primitif.

Tahap - tahapnya :
1. Materi pembentuk makhluk hidup pertama diduga CH4, NH3, H2 dan H2O, sedangkan energi
yang memungkinkan terjadinya reaksi tersebut adalah sinar ultraviolet.
2. ⁠Pada tahap ini terjadi reaksi yang membentuk senyawa organik dari materi pembentuk
pertama. CH4 membentuk monosakarida, NH3 membentuk asam lemak dan gliserol, H2
asam amino, H20 membentuk pirimidin.
3. Monosakarida + monosarida menjadi polisakarida, asam lemak + gliserol menjadi lemak,
purin + pirimidin + asam fosfat menjadi nukleotida, dan nukleotida +nukleotida menjadi
asam nukleat.
4. Merupakan lanjutan dari tahap sebelumnya menjadi materi organik yang lebih kompleks,
asam nukleat + protein menghasilkan nukleoprotein. Nukleoprotein sudah mampu
mengadakan reproduksi, mutasi dan nutrisi.
5. Protein yang terjadi pada tahap sebelumnya menjadi protovirus atau sel awal.

CONCLUSION
Miller-Urey bukanlah jawaban akhir mengenai kemungkinan asal usul kehidupan di Bumi, namun
ini merupakan indikator yang baik bahwa kehidupan tidak memerlukan kehidupan untuk
diciptakan.

Singkatnya, percobaan Miller-Urey,

dengan menunjukkan sintesis abiotik
molekul organik, menjadi awal
pembentukan protocells. Protocells ini,
pada gilirannya, dapat terlibat dalam
hubungan simbiosis dengan bentuk
kehidupan lain, meletakkan dasar bagi
evolusi sel eukariotik yang lebih
kompleks, seperti teori endosimbiotik.
CHAPTER THREE : ENDOSYMBIONT

ALL OF US CAME FROM ONE ROOT OF LIFE

THE o f L i f e
ANSWER
 EUREKA!
into Living ‘Being’
Sel eukariotik berbeda dari sel prokariotik dengan adanya struktur seluler yang terikat membran
yang disebut organel. Dan berdasarkan teori ini, organel mitokondria dan kloroplas diduga
merupakan endosimbion prokariotik awal yang telah diambil. Mereka tinggal di dalam sel
inang begitu lama sehingga mereka bertransisi menjadi organel semi-otonom yang kita kenal
sekarang.

Ada anggapan bahwa endosimbiosis terjadi antara bentuk kehidupan awal. Bentuk simbiosis
ini melibatkan sel yang lebih besar yang berfungsi sebagai inang dan sel yang lebih kecil yang
disebut endosimbion.

Dalam teori endosimbiotik, dikemukakan bahwa sel yang lebih besar menelan atau mengambil
sel yang lebih kecil. Sel yang lebih besar mewakili sel eukariotik saat ini sedangkan sel yang lebih
kecil adalah sel prokariotik.

Dalam teori ini, sel eukariotik pertama mungkin adalah sel mirip amoeba yang memperoleh
nutrisi melalui fagositosis dan mengandung nukleus yang terbentuk ketika sepotong membran
sitoplasma terjepit di sekitar kromosom. Beberapa organisme mirip amoeba ini menelan sel
prokariotik yang kemudian bertahan di dalam organisme tersebut dan mengembangkan
hubungan simbiosis. Mitokondria terbentuk ketika bakteri yang mampu melakukan respirasi
aerobik tertelan; kloroplas terbentuk ketika bakteri fotosintetik tertelan. Mereka akhirnya
kehilangan dinding sel dan sebagian besar DNA mereka karena mereka tidak lagi berguna
dalam sel inang. Mitokondria dan kloroplas tidak dapat tumbuh di luar sel inangnya.
 FROM ONE
to Many
Pendukung teori ini mengemukakan bahwa sekitar 1,5 miliar tahun yang lalu sel yang lebih
besar menampung prokariota (bakteri) yang hidup bebas lebih kecil dan di dalam sel prokariota
hidup sebagai endosimbion.

Temuan penelitian yang tampaknya mendukung teori ini menunjukkan bahwa mitokondria
muncul dari proteobakteri (seperti SAR11 clade), sedangkan kloroplas muncul dari sianobakteri
(khususnya sianobakteri pengikat nitrogen).

Indikasi bahwa teori ini masuk akal didasarkan pada ciri-ciri yang sama yang dimiliki oleh
organel-organel ini dan nenek moyang prokariotiknya. Beberapa ciri yang umum dimilikinya
adalah sebagai berikut:
Baik mitokondria maupun plastida mampu bereproduksi sendiri melalui proses yang mirip
dengan pembelahan biner prokariotik.
Baik mitokondria maupun plastida memiliki DNA sirkular tunggal yang serupa dengan bakteri
dalam hal ukuran dan struktur, namun berbeda dengan inti sel.
Porin pada membran luar mitokondria dan kloroplas mirip dengan membran sel bakteri.
Cardiolipin, lipid membran, hanya ditemukan di membran sel bakteri dan membran
mitokondria bagian dalam.

HELOGENOME(!)
Bahwa kita, sejatinya tidak berevolusi sebagai spesies yang terpisah, tetapi bersama dengan
seluruh makhluk hidup lainnya, selalu hidup bersimbiosis dengan jumlah mikroba besar, di
dalam maupun di luar tubuh kita, holobiont.

Bukan persaingan yang ketat, bukan seleksi alam, tetapi kolaborasi antara mikroba dan diri kita
sendiri, semua berkaitan. Sel yang memiliki tujuan dan bersama merekayasa organisme jenis
apa diri kita.
OUR PATHWAY
to Freedom of Thought
"Organic life beneath the shoreless waves
Was born and nurs'd in Ocean's pearly caves;
First forms minute, unseen by spheric glass,
Move on the mud, or pierce the watery mass;
These, as successive generations bloom,
New powers acquire, and larger limbs assume;
Whence countless groups of vegetation spring,
And breathing realms of fin and feet and wing."

- famous poem 'The Temple of Nature' (1803)

Memahami evolusi membantu kita memecahkan masalah

biologis yang berdampak pada kehidupan kita. Ada contoh
bagus mengenai hal ini di bidang kedokteran. Untuk tetap
selangkah lebih maju dari penyakit patogen, peneliti harus
memahami pola evolusi organisme penyebab penyakit. Untuk
mengendalikan penyakit keturunan pada manusia, para
peneliti mempelajari sejarah evolusi gen penyebab penyakit.
Dengan cara ini, pengetahuan tentang evolusi dapat
meningkatkan kualitas hidup manusia.
 SUMBER
The Miller-Urey Experiment - Chemical Evolution | BioTechSquad, 31
Agustus 2017, https://nature.berkeley.edu/garbelottoat/?p=582. Diakses
pada 1 Februari 2024.

ASAL MULA KEHIDUPAN DI BUMI,

https://staffnew.uny.ac.id/upload/197905222008122003/pendidikan/Ilmu
+Alamiah_Asal+Mula+Kehidupan.pdf. Diakses pada 2 Februari 2024.

BD Editors. “Abiogenesis - Definition and Theory.” Biology Dictionary, 28

April 2017, https://biologydictionary.net/abiogenesis/. Diakses pada 2
Februari 2024.

“A Brief Explanation Of Miller Urey Experiment - Biology.” BYJU'S,

https://byjus.com/biology/miller-urey-experiment/. Diakses pada 2
Februari 2024.

Fiska. “Pengertian Teori Biogenesis: Pendukung dan Semboyannya.”

Gramedia, https://www.gramedia.com/literasi/teori-biogenesis/. Diakses
pada 3 Februari 2024.

Reza, Muhammad. “Teori Evolusi : Teori Biokimia, Urey, Miller, dan Teori
Biologi.” Mandandi.com, 9 September 2021,
https://www.mandandi.com/2021/09/teori-evolusi-teori-biokimia-
urey.html. Diakses pada 2 Februari 2024.

Rogers, Kara. “Miller-Urey experiment | Description, Purpose, Results, &

Facts.” Britannica, 19 Desember 2023,
https://www.britannica.com/science/Miller-Urey-experiment. Diakses
pada 1 Februari 2024.

Rosa, Endah. “Teori Endosimbion dan Sejarah Kehidupan di Bumi.”

Warung Sains Teknologi, https://warstek.com/endosimbion/. Diakses
pada 4 Februari 2024.