DIAGNOSTIK

INFEKSI
KELOMPOK 4

ULFI NOVIDA SARI

NURUL YANIFA
 Parameter yang Digunakan dalam
Proses Identifikasi Mikroorganisme
A. Karakteristik Kultur
 Secara klinis adalah bentuk, ukuran, warna, ketinggian
dan karakteristik lainnya dari koloni yang terbentuk
diatas culture plate
 Dalam taksonomi, meliputi nutrisi yang menjadi syarat
bagi petumbahan dari organisme dan faktor fisika
seperti temperatur, pH, dan periode inkubasi
 Faktor ini digunakan untuk identifikasi spesies
patogenik tetapi kurang umum digunakan pada
prosedur yang rutin
 Karakteristik kultur mikroorganisme biasanya
bervariasi tergantung pada media yang digunakan dan
banyak faktor lainnya
B. Morfologi dan pewarnaan
Meliputi penampilan mikroskopis dari persiapan
organisitas organisme
Informasi yang harus diperhitungkan adalah
ukuran, bentuk, susunan dan reaksi pewarnaan
jika prosedur pewarnaan diferensial digunakan
Contoh, film pewarnaan gram yang dipersiapkan
dari kultur murni mikroorganisme tertentu
menunjukkan beberapa sifat : sel bola kecil
“cocci”, susuna pada clusters, gram positif =
berwarna violet
C. Karakteristik biokimia

Identifikasi suatu spesies memerlukan

pengetahuan tentang aktifitas biokimianya,
karena karakteristik lainnya tidak cukup khas
atau differensial
Misalnya, bakteri E. coli secara normal menghuni
saluran usus, dapat dibedakan dengan salmonella
typhi jika dilihat dengan mikroskop. Namun, jika
kedua bekteri tersebut diperiksa karakter
metaboliknya mungkin dapat ditemukan bahwa
kedua jenis bakteri tersebut sangat berbeda
D. Karakteristik serologi

untuk identifikasi spesies seperti E. coli tidak

cukup, karena beberapa strain organisme
bersifat non-pathogenic dan yang lain sangat
berasosiasi dengan penyakit
Pengujian serologi dalam kasus ini akan
mengidentifikasi secara tepat berdasarkan
pengujian antiserum spesifik
Tes serologi in-vitro berharga dalam niagnosa
dari banyak bakteri, fungi, dan infeksi virus
 KULTUR URIN

Tujuan tes, sebuah diagosa etiologi dari bakteri yang

menginfeksi saluran kemih secara quantitatif dari urin
dengan identifikasi dan uji kerentanan dari bakteri
yang diisolasi
Tipe spesimen, urin (midstream urin), suprapublic
aspiration dan urin yang dikateterisasi
Karakter spesimen yang ditolak, spesimen yang tidak di
didinginkan lebih dari dua jam dapat mengalami
pertumbuhan berlebihan dan dapat menghasilkan hasil
yang tidak valid, spesimen yang tidak berlabel dan
salah label, spesimen dalam wadah yang kedaluarsa,
spesimen urin 24 jam
Koleksi spesimen

Pengumpulan urin tengah untuk investigasi

bakteri:
 Pasien tidak membutuhkan bantuan:
 Berikan wadah yang sesuai kepada pasien.
 Instruksikan pasien sebelum pengumpulan,
sebaiknya dengan ilustrasi.
Beri tahu pasien untuk tidak menyentuh
bagian dalam atau tepi wadah.
Pria:
1. Jika tidak disunat, tarik kembali kulupnya.
2. Mulailah buang air kecil, tetapi masukkan bagian
pertama ke toilet.
3. Kumpulkan bagian tengah urin ke dalam wadah,
dan masukkan kelebihannya ke dalam toilet.
Perempuan:
1. Jongkok di atas toilet dan pisahkan labia dengan
satu tangan.
2. Membatalkan bagian pertama dari urin ke toilet.
3. Kumpulkan bagian tengah urin ke dalam wadah
dan buang kelebihannya ke toilet.
Bayi
 Siapkan: wadah yang bersih
dan steril dengan ukuran yang
sesuai atau kantong plastik,
wol kapas atau kain kasa, air
sabun
 Besihakan genital bagian luar
 Berikan anak cairan sebanyak
mungkin sebelum pengumpulan
 Dudukkan aank dipangkuan
ibu, perawat, atau petugas
lingkungan
 Kumpulkan urin sebanyak
mungkin dalam wadah atau
kantong plastik
 Specimen processing

Media
 1. Blood Agar,
 2. MacConkey
Agar
 3. Nutrient Agar
Culturing procedure
 kocok sampel urin untuk menangguhkan kembali
mikroorganisme yang ada
 Celupkan loop terkalibrasi 1 µl pada posisi vertikal
dalam urin dan lepaskan loop lalau gunakan cairan
yang terkumpul untuk inokulasi pada nutrient agar
plate untuk dihitung
 Ambil loop yang lain untuk disebar pada MacConkey
agar plate
 Sebar ke NA untuk menutupi semua permukaan
 KULTUR DARAH

Tujuan tes, suatu diagnosa etiologi dari bakteremia

kultifasi aerobik dan anaerobik darah, dengan
identifikasi dan uji kerentanan dari organisme yang
diisolasi, kultur darah harus dilakukan untuk kasus
septiscemia, endokarditis, dan bakterimia kedua untuk
infeksi lokal. Pada kasus ini mungkin kultur darah dapat
memberiakan diagnosa etiologi dari infeksi lokal
Type spesimen, darah secara keseluruhan
Spesimen yang ditolak, darah dikoleksi pada botol atau
tabung selain botol kultur aerob dan anaerob, label
tidak sesuai dengan permintaan dan keterbalikan
dalam menggunakan botol atau tabung koleksi
Pre specimen processing
 Persiapan pasien, kesulitan utama darikultur darah adalah
potensi terkontaminasi oleh flora kulit, Kesulitan ini dapat
dikurangi secara nyata dengan memperhatikan perincian
persiapan kulit dan antisepsis sebelum pengumpulan spesimen.
 Persipan kulit: membersihakan sisi yang akan ditusuk dengan
isopropanol, Kemudian gunakan larutan yodium atau povidone
iodine untuk mendisinfeksi situs menggunakan lingkaran
konsentris yang semakin besar. Yodium harus kontakdengan
kulit sekitar 1 menit atau sampai kering untuk memastikan
desinfeksi. Tusukan vena tidak boleh diraba setelah persiapan.
Darah kemudian diambil kemudian bersihakan kembali bekas
tusukan dengan alkohol
 Koleksi spesimen

Kultur darah harus diambil sebelum memulai

terapi antimikroba
Jika lebih dari satu kultur yang akan diambil
maka kultur harus diambil secara terpisah tidak
kurang dari 30 menit terpisah untuk
mengesampingkan kemungkinan sementara
bekteremia oleh manipulasi diri oleh pasien dari
selaput lendir di mulut yang disebabkan oleh
gigi atau oleh iritasi lokal karena goresan pada
kulit
• Waktu pengumpulan harus ditunjukkan
• Teknik aseptik yang ketat sangat penting
• Jika ada lepaskan tutup plastikdari botol
kultur darah, usap sumbat dengan larutan
yidium atau pavodine iodin dan biarkan
mengering
• Kumpulkan 20 mL darah dalam jarum suntik
plastik steril dan inokulasi sedikitnya 10 mL
darah ke dalam masing masing botol atau
gunakan vacutainer can butterfly collection
 Penyimpanan, pre-inkubator atau penyimpanan
spesimen pada suhu kamar tidak dalam refrigator
 Wadah, kultur aerobik dan anaerob masing masing
satu botol, tidak terdapat celah udaraPenyimpanan,
pre-inkubator atau penyimpanan spesimen pada
suhu kamar tidak dalam refrigator
 Wadah, kultur aerobik dan anaerob masing masing
satu botol, tidak terdapat celah udara
Specimen processing
Media
Aerobic Blood culture MacConkey Agar
bottle Blood Agar
Anaerobic Blood culture
Chocolate Agar
bottle
Culturing procedure
Darah diinjeksi ke masing masing botol
dan diinkubasi selama dari 10 hari pada
suhu 37˚C
Membuang bagian negatif inkubasi setelah
10 hari kedaluarsa
Selama periode inkubasi, pewarnaan gram
dan subkultur harus digunakan secara
tepat
Pengolahan pasca proses
Faktor penggangu, pasien yang sedang
menjalani terapi antibiotik
Pelaporan hasil, organisme yang terisolasi akan
dilaporkan dan sensitivitas antibiotik juga akan
dilaporkan
Waktu penyelesaian, hasil kultur darah akan
segera dilaporkan setelah terjadinya
pertumbuhan, hasil akhir setelah 24-28 jam akan
dilaporkan, hasil yang negatif akan dilaporkan
setelah 10 hari kultur
 Interpretasi Kultur Darah Positif
 Hampir semua organisme, termasuk flora normal, dapat
menyebabkan bakteremia
 Hasil kultur negatif tidak selalu menyingkirkan
bakteriemia;
hasil false-negatif terjadi ketika patogen gagal tumbuh
 Hasil kultur positif tidak selalu menunjukkan bakteremia;
hasil positif palsu terjadi ketika kontaminan tumbuh.
 Basil Gram-negatif, anaerob, dan jamur harus
dipertimbangkan
patogen sampai terbukti sebaliknya.
 Masalah interpretasi yang paling sulit adalah untuk
menentukan apakah suatu organisme yang biasanya
dianggap flora kulit normal adalah patogen sejati.
 keterbatasan
 Tiga set kultur negatif darah dengan tidak adanya
terapi antimiktoba biasanya cukup untuk
mengecualikan keberadaan bekteremia
 Terapi antibiotik sebelumnya dapat menyebabkan
darah berkultur negatif
 Kultur darah dari pasien yang diduga mengandung
brucella atau leptospira harus diminta sebagai kultur
khusus
 Jika ragi atau jamur lain diduga khusus, biakan darah
jamur yang terpisah harus diambil dengan masing
masing spesimen kultur darah rutin
 Kompleks mycobacterium avium (MAC) sering pulih dari
darah pasien immunocompromised, khusus mereka
dengan sindrom imunodefisiensi yang didapat AIDS
CEREBROSPINAL
FLUID (CSF)

Tujuan test, diagnosa bateri atau fungi

menginitis melalui pengujian mikroskopik
dan kultur dengan identifikasi dan uji
kerawanan dari isolasi organisme
Tipe test, CSF
Kriteria spesimen yang ditolak, wdaah yang
tidak steril
Patogen dan commensals
 Pre spesimen processing
Pengumpulan spesimen, yang berhak
mengumpulkan spesimen adalah dokter
Jumlah spesimen, 3mL CSF cukup untuk
pembiakan
Waktu kambuh sebelum memproses sample, CSF
adalah spesimen darurat dan harus segera
diproses
Penyimpanan, pada suhu ruang
 Memprose spesimen
media proses
2 blood agar Sebagai aturan umum

Cocolate agar dan CSF dan spesimen

cairan tubuh untuk
MacConkey agar kultur sentrifugasi
Fluid thioglycollate spesimen dan plate
inokulasi dan lakukan
pewarnaan dari sedimen
Spesimen yang keruh
tidak boleh di
sentrifugasi
Pasca memproses spesimen
Faktor penghambat, pasien yang sedang
menjalani terapi antibiotik dan sampel koleksi
yang salah
Pelaporan, hasil mikroskopi dan semua kultur
posituf dilaporkan dengan segera ke dokter,
hasil negatif dikirim 72 jam setelah CSF diterima
Waktu penyelesaian, pewarnaan gram
dilaporka setelah 30 menit spesimen diterima,
hasil kultur positif 3-5 hari dan hasil kultur negatif
2-3 hari
 Kultur cairan tubuh, sterile
Persamaan, cairan tubuh, sterile,
Tujuan test, isolasi dan identifikasi organisme
patogen dari cairan tubuh yang steril dan
melakukan uji kepekaan
Tipe spesimen, cairan tubuh yang disedot secara
aseptik (misalnya: sinovial dan cairan peritoneum)
Kriteria spesimen yang ditolak, alat transportasi
spesimen yang tidak sesuai, spesimen salah label,
spesimen tidak berlabel. Contoh spesimen diterima
dalam penundaan yang lama (biasnya lebih dari 2
jam) dan spesimen yang diterima dalam media
transportasi yang kedaluarsa
Patogen adan commensals
 Pre spesimen processing
 Persiapan pasien, usap kulit diatas lokasi tusukan denga 2%
larutan yodium dalam kosentris (iodin harus kontak dengan
kulit selama 1 menit sebelum tusukan dan setelah ditusuk
bersihakn dengan alkohol 70% untuk menghilangkan iodium)
 Pengumpulan spesimen, kontaminasi dengan flora norma
kulit, rektum, saluran vagina, atau bagian permukaan
tubuhlainnya harud dihindari
 Yang mengumpulkan spesimen : dokter
 Jumlah spesimen, 1-5mL
 Waktu yang dibutuhkan, cairan tubuh yang diperlukan
sebagai spesimen CSF harus diproses segera
 Penyimpanan, disimpan dalam suhu ruang tidak dalam
refrigator
 Memproses spesimen

media Proses kultur

Blood agar ( 2
plates)
Chocholate agar
MacConkey agar
Thiologycollate
broth
Faktor pengganggu, pasien yang sedang
melakukan terapi antibiotik dan
pengumpulan sampel yang salah
Pelaporan hasil, melaporkan pewarnaan
gram diawal dan melaporkan isolasi patogen
sensitifitas pada pelaporan akhir
Waktu yang dibutuhkan, pewarnaan gram
dan hasil basah harus didapatkan 1 jam
setelah spesimen diterima, kultur negatif
dilaporkan 1-2 hari setelah spesimen diterima
 CONJUNCTIVAL
DISCHARGE
Tujuan test, diagnosa etiologi dari bakteri
conjunctiva melalaui kultivasi aeribik dengan
identifikasi dan uji kerawanan dari bakteri yang
diisolasi
Tipe spesimen, Discharge mata
Kriteria spesimen yang ditolak, alat transportasi
spesimen yang tidak sesuai, spesimen salah label
atau tidak berlabel dan spesimen yang diterima
di media transportasi yang kedaluarsa
Patogen dan commensals
 Sebelum memproses spesimen

1. Pengumpulan spesimen
 Tarik kelopak mata kebawah sehingga forniks
konjungtiva bawah terbuka
 Usap forniks tampa menyentuh tepi kelopak
mata dengan kaps steril
 Tempatkan swab di media transpor bakteri
atau jika spesiemen segera dibawa ke
laboratorium letakkan dlam tabung reaksi
steril dengan 0,5 mL buffer saline (pH 7)
2. Jumlah spesimen
Jumlah yang cukup untuk di swab
3. Waktu kambuh sebelum memproses sampel
 Spesimen mata harus diproses dengan segera
larena kontaminasi lysosom air mata mungkon
akan membunuh organisme
4. Penyimpanan
 Disimpan dalam refrigator (2-8˚C)
Memproses spesimen
media
Blood agar Proses kultur
Chocolate agar
MacConkey agar
Fluid
Thioglycollate
 Paska memproses spesimen
1. Pelaporan hasil
 Pelaporan temuan pewarnaan gram sebagai laporan awal
 Pelaporan patogen yang terisolasi dan pola sensitivitas
sebagai laporan akhir
 Waktu yang digunakan

2. Waktu yang digunakan

 Hasil pewarnaan gram harus didapatkan setelah 1 jam
penerimaan spesimen
 Isolasi dari kemungkinan patogen diharapkan setelah 2-3
hari
 Kultur negatif akan dilaporkan setelah 1-2 hari setelah
penerimaan spesimen
 Informasi tambahan
Semua bakteri diisolai dalam jumlah yang sama
dan tidak terkontaminasi dan diuji kerentanan
terhadap antibiotik termasuk uji terhadap
kerentanan terhadap klorofenikol
Jika dicurigai trakoma, pengikisan konjunctiva
harus di oleskan pada slide microskopik, udara-
kering dan difiksasi dalam mrtanol absolut
Deteksi sistem Antigen chlamydia tersedia untuk
tujuan ini
 KULTUR GENITAL
DAN SESNSITIVITAS
1. Tujuan tes
 Mengisolasi dan mengidentifikasi organisme patogen
yang berpotensi aerobik termasuk
 Gardnerella vaginalis dan kelompok
B Streptococcus ; menetapkan diagnosis
 gonore, kasus medis / hukum.

2. Jenis-jenis spesimen
 Upusan vagina, serviks, keputihan, endoserviks
aspirasi, endometrium, cairan prostatik, atau keluarnya
uretra
3. Kriteria penolakan spesimen
Alat transportasi spesimen yang tidak
sesuai; spesimen salah label; tidak berlabel
contoh; spesimen diterima setelah penundaan
yang lama (biasanya lebih dari 72 jam); spesimen
yang diterima dalam media atau wadah
pengangkut yang kedaluwarsa
 Koleksi spesimen
Wanita: Jangan gunakan pelumas pada spekulum. Lendir
serviks harus dikeluarkan terlebih dahulu sebelum
memasukkan swab ke dalam kanal endoserviks, pindahkan
swab dari sisi ke sisi yang memungkinkan beberapa detik
untuk penyerapan organisme oleh swab. Kembalikan swab
ke tabung pengangkut dan label.
Laki-laki: Menggunakan swab kawat kecil, dengan lembut
gesekkan mukosa uretra anterior atau, gunakan swab untuk
mengumpulkan spesimen pelepasan uretra.
Untuk mengatasi beberapa masalah yang terlibat dalam
memperoleh jumlah yang cukup untuk pemulihan organisme
dalam kasus yang diduga STD, kit yang berisi swab, slide
yang sesuai untuk mengumpulkan spesimen seperti sekarang
tersedia dan dapat digunakan di kantor dokter.
Jumlah spesimen
Jumlah yang cukup pada swab

Waktu kambuh sebelum memproses sampel

30 menit.

Penyimpanan Pelihara spesimen pada suhu

kamar. Jangan didinginkan.
 Specimen processing
Media Prosedur kultur
Agar Darah (2 piring) Goreskan ke dua piring
 Chocolate Agar, agar darah, satu
cokelat, piring
 MacConkey Agar
MacConkey dan Sab
 Sab. Agar agar.
Jangan lakukan
pemeriksaan kadar sel
Clue dan Trichomonas,
dan pewarnaan gram
periksa organisme
yang dominan.
 Pemrosesan pasca spesimen
1. Faktor yang mengganggu:
 Pasien yang sedang menjalani terapi antibiotik.
 Pengumpulan sampel yang tidak benar.
2. Pelaporan hasil:
 Laporkan temuan noda gram gunung basah sebagai laporan
awal.
 Laporkan patogen yang terisolasi dan pola sensitivitasnya
sebagai laporan akhir.
3. Waktu penyelesaian:
 Pewarnaan Gram dan hasil pemasangan basah harus tersedia 1
jam setelah spesimen diyterima.
 Isolasi patogen yang mungkin dapat diharapkan setelah 2-3 hari. 
 Negatif kultur akan dilaporkan 1-2 hari setelah diterimanya
spesimen.
 KULTUR DAN
SENSITIVITA DAHAK

1. Tujuan tes
Diagnosis etiologis infeksi saluran pernapasan
bagian bawah secara mikroskopis
pemeriksaan dan kultur dengan identifikasi dan
uji kerentanan organisme terisolasi.
2. Jenis-jenis spesimen
Dahak, aspirasi transtrakeal, aspirasi
translaryngeal, bronchoalveolarlavage.
3. Kriteria penolakan spesimen
Air liur
 Patogen dan commensals

Infeksi saluran
pernapasanbagian
bawah
Saluran pernapasan
bawah terdiri dari
bagian berikut: Kiri dan
kanan rongga pleura,
bronkiolus, ruang pleura,
diafragma, mediastinum
 Pre pemprosesan spesimen
1. Mempersiapkan pasien
Pasien diminta untuk mencuci rongga mulut dengan berkumur
dengan air 3-4 kali.
2. Koleksi spesimen
Batuk dalam dan kumpulkan dahak dalam wadah steril yang
lebar. 
Semua dahak ekspektoran terkontaminasi sampai tingkat tertentu
dengan sekresi Rongga Oropharyngeal, yang mengandung
berbagai macam bakteri komensal, beberapa di antaranya
adalah patogen potensial pada saluran pernapasan bagian
bawah ( S. pneumonia, Haemophilus influenzae ). 
Karena dahak mencerminkan infeksi pada bronkus dan paru-
paru. Kontaminasi Sekresi orofaringeal dijaga agar tetap
minimum. Sputa dini hari lebih disukai karena mengandung
semalam dikumpulkan sekresi di mana, bakteri patogen lebih
cenderung terkonsentrasi
3.Siapa yang akan mengumpulkan spesimen
Pasien
4. Jumlah spesimen
3 ml
5. Waktu kambuh sebelum memproses sampel
30 menit.
6. Penyimpanan
4 o C selama tidak lebih dari 2 jam
 Pemprosesan spesimen

media
 Darah Agar,
 Chocolate Agar,
 MacConkey Agar

Proses kultur
 Periksa sampel dan pilih
bagian bernanah berdarah dan
menyuntikkan darah ke agar,
agar coklat, dan agar
MacConkey dan lakukan
pewarnaan gram
spesimen. Inkubasi pelat seperti
yang ditunjukkan oleh bagan.
 Pemrosesn pasca spesimen
1. Faktor pengganggu
 Pasien yang sedang menjalani terapi antibiotik.
 Pengumpulan sampel yang tidak benar.
2. Pelaporan hasil:
Laporkan temuan pewarnaan Gram sebagai laporan awal.
Laporkan patogen yang terisolasi dan pola sensitivitasnya
sebagai laporan akhir.
3. Waktu penyelesaian:
Hasil pewarnaan Gram harus tersedia 1 jam setelah
penerimaan spesimen.
Isolasi patogen yang mungkin dapat diharapkan setelah 2-3
hari. 
Negatif kultur akan dilaporkan 1-2 hari setelah diterimanya
spesimen
 KULTUR TINJA, Salmonella & Shigella

1. Tujuan tes
Mendeteksi organisme patogen bakteri dalam
tinja; mendiagnosis demam tifoid, demam enterik, disentri
basiler, infeksi Salmonella
2. Jenis-jenis spesimen
Usap atau usap rektum atau feses (acak segar) dalam
sistem transportasi tinja
3. Kriteria penolakan spesimen
Kotoran yang terbentuk, spesimen yang terkontaminasi
dengan urin, sisa sabun, atau desinfektan. Spesimen
diterima dalam wadah pengangkutan yang sangat bocor;
popok; spesimen kering; spesimen yang dikirim dalam
fiksatif atau aditif;
 Pemrosesan pra spesimen
1. Mempersiapkan pasien
Instruksikan pasien tentang bagaimana spesimen harus
dikumpulkan dan dipindahkan ke wadah; beri dia
tongkat dan wadah.
2. Koleksi spesimen
Spesimen tinja tunggal tidak dapat digunakan untuk
menyingkirkan bakteri diare. 
Lebih dari dua spesimen hanya boleh diserahkan dari
pasien untuk siapa ada kecurigaan tingkat tinggi.
Kotoran harus dikumpulkan saat dikumpulkan di bedpan
steril. Spesimen harus berisi setidaknya 5 g tinja dan, jika
ada, bagian-bagian yang mengandung darah dan / atau
lendir harus dipilih. Spesimen tidak boleh
terkontaminasiair seni. 
3. Siapa yang akan mengumpulkan spesimen
Pasien. Jika tinja tidak dapat diperoleh, staf perawat atau
dokter akan mengumpulkan apusan tinja.
4. Jumlah spesimen
Spesimen harus mengandung setidaknya 5 g tinja
5. Waktu kambuh sebelum memproses sampel
Sampel tinja harus diperiksa dan dikultur sesegera mungkin
Saat spesimen tinja mendingin, penurunan pH akan
menghambat pertumbuhan sebagian
besar Shigella spp. dan beberapa Salmonella spp.
6. Penyimpanan
Didinginkan (2-8 ° C)
 Pemrosesan spesimen

media
SSA atau XLD
Selenite-F broth atau tetrathionate
Reagen
 API 20 E kit
Salmonella dan Shigella antiserum
(polivalen dan monovalen)
Proses kultur
1 gram tinja dimasukkan ke
tabung reaksi Selenite-F dan
goreskan pada XLD atau SSA.
 Inkubasi pada suhu 37 C. Setelah
inkubasi semalam lakukan
subkultur dari kaldu Selenite-F ke
piring XLD atau SSA yang baru.
Pemrosesan pasca spesimen
1. Faktor-faktor yang mengganggu
Pasien yang sedang menjalani terapi antibiotik.
Pengumpulan sampel yang tidak benar.
2. Pelaporan hasil
Laporan positif akan dikeluarkan hanya dalam kasus
salmonella atau shigella
terisolasi, jika tidak, laporan negatif akan
dikeluarkan .
3. Waktu penyelesaian
Hasil negatif dikirim 48 jam setelah menerima
spesimen.
Hasil kultur positif dapat diharapkan dalam 3-4 hari.
4. informasi tambahan
Indikasi untuk kultur tinja meliputi:
Diare berdarah
Demam
 Tenesmus ( adalah perasaan terus menerus akan
kebutuhan untuk mengosongkan usus, disertai
oleh rasa sakit, dan kram)
 Gejala parah atau persisten
Travel Perjalanan terakhir ke negara dunia ketiga
 Pajanan agen bakteri yang diketahui
Adanya leukosit tinja
 Isolasi dan Identifikasi Enterobacteriaceae
dan Pseudomonas
ENTEROBACTERIACEAE: FERMENTATIF, GRAM
NEGATIF, ENTERIC BACILLI
Bakteri Famili Enterobacteriaceae adalah organisme yang paling sering
ditemui yang diisolasi dari spesimen klinis. Enterobacteriaceae adalah
bakteri yang sangat beragam dan biasa disebut sebagai basil fermentasi,
gram negatif, enterik, menunjukkan bahwa mereka adalah batang gram
negatif yang dapat memfermentasi gula. Banyak yang merupakan flora
normal pada saluran usus manusia dan hewan. Beberapa menginfeksi
saluran usus. Anggota keluarga ini memiliki lima karakteristik yang
sama:
1. Mereka adalah batang gram negatif
2. Jika motil, mereka memiliki susunan flagela yang kaya
3. Mereka adalah anaerob fakultatif
4. Mereka adalah oksidase negatif
5. Semua spesies memfermentasi glukosa gula tetapi sebaliknya sangat
bervariasi dalam karakteristik biokimia mereka.
 Dua puluh enam genera dan lebih dari 100 spesies
Enterobacteriaceae telah dikenali. Beberapa genera esensial
klinis yang lebih umum dari keluarga Enterobacteriaceae
termasuk:

•Beberapa genera Enterobacteriaceae dikaitkan dengan

gastroenteritis dan penyakit bawaan makanan. Ini termasuk
Salmonella, Shigella, strain Escherichia coli tertentu, dan spesies
Yersinia tertentu. Semua infeksi saluran usus ditularkan melalui rute
fecal-oral.

•Setiap infeksi yang disebabkan oleh Salmonella disebut

salmonellosis. Mayoritas Salmonella menyebabkan diare, tetapi satu
spesies, S. typhi, dapat menyebar ke dalam darah dan menyebabkan
bentuk salmonelosis yang parah yang disebut demam tipus.
Infeksi Shigella disebut shigellosis. Shigella dapat menghasilkan
sitotoksin yang menyebabkan abses dan bisul muncul di usus besar
yang mengakibatkan disentri (diare dengan darah, lendir, dan sel
darah putih dalam tinja).
Escherichia coli adalah salah satu flora normal dominan di saluran usus
manusia dan hewan, beberapa strain dapat menyebabkan infeksi
pada usus. Enterotoxin E. coli (ETEC) menghasilkan enterotoksin yang
menyebabkan hilangnya ion natrium dan air dari usus yang
menyebabkan diare menjadi encer. Enteropatogenik E. coli (EPEC)
menyebabkan diare encer, karena Enteropatogenik E. coli (EPEC )dapat
menempel pada sel mukosa usus dan mengganggu fungsinya.
Enteroinvasive E. coli (EIEC) menyerang sel epitel usus yang
menyebabkan sindrom tipe disentri. Akhirnya, E. coli penghasil
Verotoxin (VTEC), seperti E. coli 0157: H7, menghasilkan verotoxin (juga
disebut racun Shiga) yang membunuh sel-sel epitel usus yang
menyebabkan diare berdarah. Dalam kasus yang jarang terjadi,
verotoksin memasuki darah dan dibawa ke ginjal di mana ia merusak
sel-sel pembuluh darah dan menyebabkan sindrom uremik hemolitik.
Beberapa spesies Yersinia, seperti Y. enterocolitica dan Y.
pseudotuberculosis juga menyebabkan penyakit diare.
 ISOLASI ENTEROBACTERIACEAE DAN PSEUDOMONAS

 Untuk mengisolasi Enterobacteriaceae dan Pseudomonas, spesimen dari situs

yang terinfeksi disingkirkan pada salah satu dari sejumlah besar media selektif
dan diferensial seperti agar EMB, agar Endo, agar Deoxycholate, agar
MacConkey, agar Hektoen Enteric, dan agar XLD.
 Agar XLD selektif untuk bakteri gram negatif. Selain itu, basil gram negatif
yang berbeda, karena reaksi biokimia mereka, menghasilkan koloni yang
berbeda. Reaksi khas untuk beberapa Enterobacteriaceae dan Pseudomonas
ditunjukkan di bawah ini:
1. Escherichia coli: koloni kuning datar; beberapa strain mungkin terhambat.
2. Enterobacter dan Klebsiella: koloni kuning berlendir.
3. Proteus: koloni merah sampai kuning; mungkin memiliki pusat hitam.
4. Salmonella: biasanya koloni merah dengan pusat hitam.
5. Shigella dan Pseudomonas: koloni merah tanpa pusat hitam.
 Agar Pseudosel selektif untuk Pseudomonas aeruginosa dan juga merangsang
P. aeruginosa untuk menghasilkan pigmen khasnya serta produk fluoresen.
Pseudomonas aeruginosa biasanya akan menghasilkan pigmen yang larut
dalam air berwarna hijau hingga biru pada agar-agar ini dan juga akan
berfluoresensi ketika pelat ditempatkan di bawah sinar ultraviolet dengan
panjang gelombang pendek
PERBEDAAN ANTARA ENTEROBACTERIACEAE DAN
PSEUDOMONAS

 Setelah batang gram negatif diisolasi, sejumlah tes dapat

dilakukan untuk menentukan apakah itu salah satu dari
Enterobacteriaceae atau apakah itu Pseudomonas

1. Produksi enzim oksidase. Tes oksidase didasarkan pada

produksi bakteri dari enzim oksidase. Sitokrom oksidase,
dengan adanya oksigen, mengoksidasi pereaksi uji
dimetheylanaline para oksidase para-amino dalam cakram
Taxo-N® untuk membentuk senyawa indophenol berwarna
merah.
Enterobacteriaceae bersifat oksidase-negatif; Pseudomonas
aeruginosa dan sebagian besar batang gram negatif
nonfermentatif adalah oksidase-positif.
2. Fermentasi glukosa. Semua Enterobacteriaceae memfermentasi
glukosa gula; Pseudomonas aeruginosa dan batang gram
negatif nonfermentatif lainnya tidak memfermentasinya.
3. Produksi pigmen. Tak satu pun dari Enterobacteriaceae yang
menghasilkan pigmen pada suhu 37OC; Pseudomonas aeruginosa
menghasilkan pigmen hijau hingga biru, larut dalam air yang
disebut pyocyanin dan menghasilkan produk yang disebut
fluorescein yang akan berfluoresensi di bawah sinar ultraviolet
gelombang pendek (254nm). Pseudosel agar dapat digunakan
untuk merangsang produksi pigmen dan produk neon.
4. Bau. Sebagian besar Enterobacteriaceae memiliki bau yang
agak busuk; Pseudomonas aeruginosa menghasilkan buah khas
atau aroma seperti jus anggur karena produksi senyawa
aromatik yang disebut aminoacetophenone.
 MENGIDENTIFIKASI ENTEROBACTERIACEAE DENGAN
MENGGUNAKAN ENTEROTUBE®II AN API 20E SYSTEMS

 Sejumlah teknik dapat digunakan untuk mengidentifikasi spesies

dan subspesies spesifik Enterobacteriaceae. Spesiasi penting karena
memberikan data mengenai pola kerentanan terhadap agen
antimikroba dan perubahan yang terjadi selama periode waktu
tertentu. Ini juga penting untuk studi epidemiologi seperti penentuan
infeksi nosokomial dan penyebarannya.

 Enterotube®II adalah tabung plastik terkompartemen mandiri berisi

12 agar berbeda (memungkinkan kinerja total 15 tes biokimia
standar) dan kawat inokulasi tertutup. Setelah inokulasi dan
inkubasi, kombinasi reaksi yang dihasilkan, bersama dengan Sistem
Pengodean dan Identifikasi Komputer (CCIS), memungkinkan
identifikasi yang mudah.
 API 20E adalah strip yang berisi 20 tes miniatur yang
digunakan dalam identifikasi Enterobacteriacae dan
gram negatif non-fermentor (pseudomonas dan
organisme serupa). Setelah inokulasi, strip diinkubasi
pada suhu 37 oC selama 18-24 jam. Hasilnya dibaca dan
dicatat dalam bentuk khusus yang disediakan dengan
strip. Angka 7 digit kemudian dihitung dari hasil dan
kemudian dimasukkan ke dalam perangkat lunak khusus
untuk identifikasi akhir.
PENGANTAR UNTUK PENGUJIAN SEROLOGIS

Respon imun mengacu pada kemampuan tubuh

(diri) untuk mengenali faktor asing tertentu
(nonself) yang mengancamnya integritas
biologis. Ada dua cabang utama respon
kekebalan tubuh:
1. imunitas humoral (produksi molekul antibodi
di respons terhadap antigen; dimediasi oleh B-
limfosit); dan
2. imunitas yang diperantarai sel (produksi
limfosit T sitotoksik dan sitokin sebagai
respons terhadap antigen; dimediasi oleh T-
limfosit).
Untuk memahami respon imun kita harus terlebih
dahulu memahami apa yang dimaksud dengan istilah
antigen. Antigen, atau imunogen, adalah zat yang
dikenali tubuh sebagai nonself dan ke arah mana ia
meningkatkan respons imun. Secara kimia, antigen
adalah protein dengan berat molekul besar (termasuk
protein terkonjugasi seperti glikoprotein, lipoprotein,
dan nukleoprotein) dan polisakarida (termasuk
lipopolisakarida). Antigen protein dan polisakarida ini
ditemukan pada permukaan virus dan sel, termasuk
sel mikroba (bakteri, jamur, protozoa) dan sel
manusia.
Seperti disebutkan di atas, limfosit-B dan limfosit-T adalah sel-sel yang
melakukan respon imun. Tubuh mengenali antigen sebagai benda asing
ketika antigen itu berikatan dengan permukaan limfosit B dan limfosit T
melalui reseptor spesifik antigen yang memiliki bentuk yang sesuai
dengan antigen (mirip dengan potongan puzzle yang saling terkait).
Reseptor antigen pada permukaan limfosit B adalah molekul antibodi
yang disebut sIg; reseptor pada permukaan limfosit-T disebut reseptor
sel-T (TCR).

Bagian atau fragmen sebenarnya

dari antigen yang bereaksi dengan
reseptor pada limfosit B dan
limfosit T, serta dengan molekul
antibodi bebas, disebut epitop atau
penentu antigenik. Ukuran epitop
umumnya dianggap setara dengan
5-7 asam amino atau 3-4 residu
gula.
Dalam hal penyakit menular, berikut ini dapat bertindak sebagai
antigen:
struktur mikroba (dinding sel, kapsul, flagela, pili, kapsid virus,
glikoprotein terkait-amplop, dll.); dan
eksotoksin mikroba
Bahan-bahan tidak menular tertentu juga dapat bertindak sebagai
antigen jika mereka diakui sebagai "nonself" oleh tubuh. Ini
termasuk:
alergen (debu, serbuk sari, rambut, makanan, bulu, racun lebah,
obat-obatan, dan agen lain yang menyebabkan reaksi alergi);
jaringan dan sel asing (dari transplantasi dan transfusi); dan
sel-sel tubuh sendiri yang gagal dikenali oleh tubuh sebagai "diri
normal" (sel kanker, sel yang terinfeksi, sel yang terlibat dalam
penyakit autoimun).
Ada 5 kelas antibodi manusia: IgG, IgM, IgA, IgD, dan IgE. Antibodi yang
paling sederhana (monomer seperti IgG, IgD, dan IgE) adalah
makromolekul berbentuk "Y" yang terdiri dari empat rantai protein: dua
rantai berat identik dan dua rantai ringan identik. Keempat rantai
protein terhubung satu sama lain dengan ikatan disulfida (S-S) dan
ikatan nonkovalen. Dua ujung "Y" disebut sebagai bagian Fab dari
antibodi. Bagian Fab memberikan spesifisitas untuk mengikat epitop
pada antigen. Bagian bawah "Y" disebut bagian Fc dan bagian ini
bertanggung jawab untuk aktivitas biologis antibodi (lihat diagram IgG).
Tergantung pada kelas antibodi, aktivitas biologis dari bagian antibodi
Fc termasuk kemampuan untuk mengaktifkan jalur komplemen (IgG &
IgM), mengikat fagosit (IgG, IgA), atau mengikat sel mast dan basofil
(IgE). Dua kelas antibodi lebih kompleks. IgM adalah pentamer, yang
terdiri dari molekul seperti 5 "Y" yang terhubung pada bagian Fc mereka,
dan IgA sekretori adalah dimer yang terdiri dari 2 molekul seperti "Y".
 Serologi mengacu pada penggunaan Pengujian serologis langsung adalah
reaksi antigen-antibodi di
laboratorium untuk tujuan
diagnostik. Namanya berasal dari
fakta bahwa serum, bagian cair dari
darah di mana antibodi ditemukan
digunakan dalam pengujian.
Pengujian serologis dapat digunakan
di laboratorium klinis dengan dua
cara berbeda: untuk mengidentifikasi
antigen yang tidak diketahui (seperti
mikroorganisme) dan untuk
mendeteksi antibodi yang dibuat
terhadap antigen spesifik dalam
serum pasien.
penggunaan preparat antibodi yang
dikenal, yang disebut antiserum,
untuk mengidentifikasi antigen yang
tidak diketahui seperti
mikroorganisme. Ini adalah prinsip di
balik Lab 6. Pengujian serologis tidak
langsung adalah prosedur di mana
antibodi dalam serum seseorang
dibuat oleh individu tersebut
terhadap antigen yang terkait
dengan penyakit tertentu dideteksi
menggunakan antigen yang
diketahui