Mutasi pada Pasien

dengan Osteogenesis
Imperfecta dari Keluarga
Consanguin di India
Joshi Stephen, Katta Mohan Girisha, Ashwin Dalal, Anju
Shukla, Hitesh Shah, Priyanka Srivastava, Uwe Kornak,
Shubha R. Phadke.
(European Journal of Medical Genetics 58 (2015) 21-27)

Pembimbing:
Dr. Eriska Riyanti , drg., Sp. KGA (K)
Diterjemahkan Oleh:
Anggiani Dewi Rahmawati 160421140005

PENDAHULUAN

Osteogenesis
Massa
OI
Mutasi
14
memiliki
gen pada
tulang
telahbentuk
COL1A1
dilaporkan
sedikit
Imperfecta
autosomal
dan
dan
untuk
frekuensi
(OI)
COL1A2
OI.
dominan
adalah
12
fraktur
gen
gangguan
menjelaskan
seringgenetik
, dengan
OIyang
diwariskan
ataudiwariskan
tanpasecara
sklera
genauto
biru
tung

Klasifikasi OI

METODE

Pemetaan
Pasien
Exome
PCR
Analisis
dan
sequencing
bioinformatika
sekuensing
homozigositas

Pasien

Sequencing gen COL1A1 dan COL1A2 mengungkapkan mutasi patogen dalam d

Pemetaan homozigositas

Exome sequencing
Exome sequencing dilakukan untuk Pasien No 2,
6 dan 7 di mana tidak ada kandidat gen yang
diidentifikasi melalui SNP array.
Penyelarasan membaca referensi genom (hg19 /
GRCh37) dan pengambilan varian dilakukan
dengan perangkat lunak Next Gene
(Softgenetics, USA)
Varian yang dihasilkan dijelaskan dengan
software seperti Annovar dan GeneTalk dan
disaring menurut posisi genom mereka, efek, dan
frekuensi diprediksi di populasi umum dari server
exome varian, dbSNP dan 1000 Proyek genom

PCR dan sekuensing

Daerah ekson dan sisi intronik diamplifikasi
menggunakan primer masing-masing untuk setiap
gen (SERPINF1, PPIB, FKBP10, CRTAP, COL1A2
dan WNT1) yang dirancang dengan menggunakan
alat perancang primer dari NCBI.
NCBI urutan referensi NG_012979.1, NG_008122.1,
NG_015860.1, NG_028180.1, NG_007405.1 dan
NG_033141.1 digunakan sebagai template untuk
merancang primer untuk masing-masing gen PPIB,
CRTAP, FKBP10, SERPINF1, COL1A2 dan WNT1.
Genomic DNA diamplifikasi, produk PCR dimurnikan
dari gel agarosa (Gel Extraction Kit, Qiagen) dan
sequencing menggunakan ABI-310 DNA Analyzer
(Applied Biosystems, USA).

Analisis bioinformatika
Mencari gen kandidat dengan menyediakan gambaran klinis spesifik OI

HASIL

Semua
Pasien
SNP
Exome
microarray
2
sequencing
kasus
dan 4fenotipe
mempunyai
bisa
dilakukan
dilakukan
berjalan
harus
patah
dan
awalnya
konsisten
pada
wilayah
tulang
pasien
tapi
homozigot
dengan
pertama
sekarang
2, 6 dan
tipe
pada
diidentifikasi
7
III
tidak
disaat
atau
antaranya
dapat
bayi
tipe pada
IV
berjalan
dan
OI
ada
pasien
tujuh
dan
kand
me
tid
p

Informasi tentang
pasien
Usia dan jenis kelamin

Pasien 1

Pasien 2

Keluarga 3

6 bulan / perempuan

4 tahun / laki-laki

22 tahun / perempuan

Kekerabatan

Tingkat 5

Tingkat 3

Tingkat 3

Presentasi umur dari

gejala
Gigi

Kehidupan janin (32

minggu)
Normal

1 bulan

3 bulan

Normal

Fitur wajah

Dahi menonjol

Anterior fontanelle
Blue sclere
Fraktur
Anggota badan
membungkuk
Panjang / tinggi

Besar dengan sutura

terbuka
Mild
Multipel
Hadir dalam semua
anggota badan
61 cm (-6SD)

Wajah bulat dan dahi

menonjol
Tertutup

Dentinogenous
imperfecta
Wajah datar dan
mandibula menonjol
Tertutup

Perkembangan motorik

tertunda

Dimulai berjalan di 13
Tidak bisa duduk sampai
bulan. Sekarang tidak bisa 20 thn
berjalan tanpa dukungan usia / gabungan
kelemahan hadir

Kognitif

normal

Normal

Normal

Jenis OI

III

IV

III

Mulai dari bifosfonat

Satu bulan

3 tahun

19 tahun

Absen
Multipel
Hadir di tungkai bawah
79 cm (-3SD)

Mild
Multipel
Hadir dalam semua
anggota badan
87 cm (-14SD)

Informasi tentang
pasien

Pasien 1

Respon untuk
bifosfonat

Pasien 2

Keluarga 3

poor

Memuaskan

Miscellaneous

Pectus carinatum

Perkembangan karakter
seksual sekunder dan
mulai menstruasi
setelah satu tahun
pengobatan
bifosfonat

Anggota keluarga
yang terkena

Tidak ada

Dua sepupu kedua setelah

dihapus

Saudara kembar &

kakak perempuan

COL1A1 & COL1A2 Tidak ada mutasi Tidak ada mutasi

Tidak ada mutasi
skrining
Mutasi diidentifikasi p.M101K
c.525_536delCTTCGGCCG c.133G> T; p.E45 *
CCT;
p.Phe176_Leu179del
Gene

PPIB

WNT1

CRTAP

Status mutasi pada

orang tua

Hetero

Hetero

Hetero

Novel / Diketahui

Novel

Novel

Novel

Rincian pasien 1

Rincian keluarga 2

Rincian pasien 3

Informasi tentang pasien

Pasien 4

Pasien 5

Usia dan jenis kelamin

12 tahun / perempuan

12 tahun / perempuan

Kekerabatan

Tingkat 3

Tingkat 3

Presentasi umur dari

gejala
Gigi

6 bulan

9 bulan

Normal

Normal

Fitur wajah

Normal

Normal

Anterior fontanelle

Tertutup

Tertutup

Blue sclere

Absen

Absen

Fraktur

Multipel

Multipel

Anggota badan membungkuk Hadir

Hadir

Panjang / tinggi

Tidak bisa diukur karena cacat

Tidak diukur

Perkembangan motorik

Tidak bisa berjalan

Kognitif

Bisa berjalan awalnya tapi

tidak bisa berjalan sekarang
Normal

Jenis OI

IV

III

Mulai dari bifosfonat

2 tahun

2 tahun

Normal

Informasi tentang
pasien

Pasien 4

Pasien 5

Respon untuk
bifosfonat

Tidak memuaskan

tingkat Fraktur meningkat

tapi tidak bisa berjalan

Miscellaneous

Terdapat / mutiple
intervensi bedah pada
Tulang Wormian

Pop corn epiphysis

Anggota keluarga yang

terkena

Satu saudara perempuan

Tiga saudara laki-laki

COL1A1 & COL1A2

skrining

Tidak ada mutasi

Tidak ada mutasi

Mutasi diidentifikasi

c.532C> T; p.Q178 *

c.829_831delTCT;
p.F277del

Gene

SERPINF1

SERPINF1

Status mutasi pada

orang tua

Hetero

Hetero

Novel / Diketahui

Novel

Diketahui

Rincian pasien 4

Rincian pasien 5

Informasi tentang pasien

Pasien 6

Pasien 7

Usia dan jenis kelamin

14 tahun / laki-laki

13 tahun / perempuan

Kekerabatan

Tingkat 3

Tingkat 3

Presentasi umur dari gejala

6 bulan

1 bulan

Gigi

Normal

Normal

Fitur wajah

Brachycephaly

Anterior fontanelle

Tertutup

Mata tertanam dan dagu yang

runcing
Tertutup

Blue sclere

Absen

Hadir

Fraktur

Multipel

Multipel

Anggota badan membungkuk

Hadir

Absen

Panjang / tinggi

125 cm (-4SD)

Perkembangan motorik

Tidak bisa
diukur / terdapat scoliosis
Tertunda / No ambulation

Kognitif

Normal

Normal

Jenis OI

IV

IV

Mulai dari bifosfonat

2 tahun

Tidak ada

normal

Informasi tentang
pasien

Pasien 6

Pasien 7

Respon untuk
bifosfonat

Nomor patah tulang

berkurang tetapi tidak
berjalan

Tidak berlaku

Miscellaneous

Pop corn epiphysis

Anggota keluarga yang

terkena

Tidak ada

Tidak ada

COL1A1 & COL1A2

skrining

Tidak ada mutasi

Tidak diuji

Mutasi diidentifikasi

Tidak ada mutasi diidentifikasi

c.3034G> A;
p.G1012S

Gene

COL1A2

Status mutasi pada

orang tua

Orangtua
dianalisis

Novel / Diketahui

Diketahui

bisa

yang

tidak

DISKUSI

Gen AR-OI tampak dalam daerah homozigot diidentifikasi oleh microarray SNP d

Dari 19 pasien dengan mutasi CRTAP dijelaskan dalam literatur tiga didiagno

KESIMPULAN
Semakin banyaknya tersedia data tentang AR
OI, jelas bahwa diagnosis genetik tipe OI
berdasarkan pemeriksaan klinis dan fitur
radiologi tidak mungkin.
AR OI tampaknya berkontribusi dengan
proporsi yang signifikan pada kasus OI di
India.
Ukuran besar gen COL1A1 dan COL1A2 dan
banyak gen AR OI lainnya memanfaatkan
generasi sequencing berikutnya yang
berdasar diagnosis molekuler, penting untuk
kasus OI.