Diversitas Antibodi: Situs Variabel Bergabung dan Mutasi Somatik

Perbandingan keragaman urutan asam amino yang ada dalam molekul antibodi dengan
yang diprediksi dari segmen sekuens gen yang mengkodekan antibodi ini menunjukkan bahwa ada
lebih banyak variasi dalam urutan asam amino pada persimpangan V-J daripada yang diperkirakan
oleh urutan nukleotida. Studi selanjutnya menunjukkan bahwa keragaman tambahan ini dapat
dijelaskan dengan variasi di lokasi yang tepat selama gabungan V-J.
Selama bergabungnya gen segmen rekombinasi V41 dan J5 telah terbukti terjadi antara
empat posisi nukleotida yang berdekatan di lokasi persimpangan. Seperti ditunjukkan pada gambar
16.9d Kejadian rekombinasi ini menghasilkan empat urutan nukleotida yang berbeda yang
menyandikan tiga asam amino yang berbeda pada posisi 96 pada rantai cahaya kappa tikus. Karena
asam amino (96) terjadi di daerah rantai antibodi yang terlibat dalam pengikatan antigen, V-J yang
bergabung dengan kejadian jenis ini tidak diragukan lagi berkontribusi secara signifikan terhadap
spesifisitas antibodi yang diamati pada vertebrata.
Kejadian penggabungan alternatif yang serupa telah didokumentasikan untuk V-J, dan
reaksi gabungan VH-D-JH. Dengan demikian penggunaan situs alternatif rekombinasi selama
kejadian bergabung terlibat dalam perakitan gen antibodi dewasa memberikan mekanisme
tambahan untuk menghasilkan keragaman antibodi.
Terlepas dari keragaman antibodi yang luas yang dihasilkan oleh (1) bergabungnya segmen
gen V, D dan J dan (2) penggunaan posisi rekombinasi alternatif selama reaksi penggabungan,
data yang cukup menunjukkan bahwa masih ada mekanisme lain yang harus dilakukan dalam
generasi keragaman antibodi. Ini telah ditetapkan dengan membandingkan (1) urutan pasangan
nukleotida dari gen yang diekspresikan dengan urutan segmen gen kuman dan (2) rangkaian asam
amino yang sebenarnya dari rantai antibodi dengan urutan asam amino yang diprediksi dari urutan
nukleotida gen.
Sebagai contoh, ketika urutan asam amino yang sebenarnya dari tikus A yang berbeda,
rantai dibandingkan dengan urutan asam amino yang diprediksi (berdasarkan urutan nukleotida-
pasangan gen 1) dari rantai cahaya 1, perbedaan ditemukan di daerah variabel dari persimpangan
situs. Pengamatan serupa telah dilakukan pada studi wilayah variabel rantai berat. Pada dasarnya
semua kasus, perubahan tersebut diakibatkan oleh substitusi nukleotida pasangan tunggal.
Penggantian tersebut dapat mewakili 1-2 persen pasangan nukleotida dari segmen gen yang
mengkodekan daerah variabel antibodi. Substitusi nukleotida-pasangan ini diduga terjadi oleh
beberapa mekanisme mutasi somatik yang terbatas pada urutan DNA yang mengkodekan daerah
variabel rantai antibodi. Karena perubahan segmen gen antibodi ini terjadi pada frekuensi tinggi
seperti itu, proses yang terjadi sering disebut hipermutasi somatik.
Hypermutasi somatik daerah gen antibodi yang menyandikan situs pengikat antigen
mungkin sangat bernilai bagi organisme. Tanpa mekanisme ini untuk menghasilkan keragaman
antibodi, kisaran spesifisitas antibodi yang tersedia akan diperbaiki menurut urutan yang ada dalam
genom dan kombinasi yang bisa dihasilkan oleh berbagai tingkat segmen gen bergabung dengan
reaksi.
Virus dan patogen lainnya terus berkembang dan menghasilkan varian baru dengan faktor penentu
antigenik yang baru. Untuk memberikan pertahanan yang memadai terhadap perubahan komposisi
antigenik dari virus dan komponen lingkungan lainnya, sistem kekebalan juga harus mampu
merespon perubahan ini dengan cepat.
Berapa Banyak Kombinasi?
Seseorang dapat dengan mudah melihat bahwa sejumlah besar keragaman dapat dihasilkan
oleh penggabungan segmen gen antibodi seperti yang baru saja dijelaskan. Contoh : jumlah rantai
cahaya kappa yang berbeda yang mungkin terjadi pada manusia: segmen gen 300 Vk x 5 Jk segmen
Jk = 1500 segmen gen Vk Jk yang menyatu. Wilayah variabel rantai berat memberikan keragaman
yang lebih besar lagi karena segmen gen D ganda. Jika ada segmen gen 300 VH, segmen gen 25 D
dan 6 segmen gen JH pada sel induk kuman manusia 45.000 daerah variabel rantai berat yang
berbeda dapat dirakit. Dengan menggunakan perkiraan ini, 67.500.000 situs pengikatan antigen
yang berbeda dapat diproduksi dengan menggunakan rantai cahaya kappa saja. Cahaya lambda
rantai menghasilkan tingkat keanekaragaman yang lain.
Jelas, fusi gen antibodi ini memberikan keragaman antibodi dalam jumlah besar. Kita
sekarang tahu, bagaimanapun, keragaman lebih lanjut dihasilkan dalam dua cara tambahan: (1)
mutasi somatik (2) variabilitas di tempat di mana V-J, V-D, dan D-J peristiwa bergabung terjadi.
Secara keseluruhan, kemungkinan keragaman antibodi tampaknya tidak terbatas.
Peraturan Transkripsi Tingkat-Khusus Enhancer
Gen antibodi kuman tidak ditranskrip atau ditranskripsi pada tingkat yang sangat rendah.
Namun, pada antibodi yang memproduksi limphosit B 10 sampai 20 persen molekul mRNA adalah
transkrip gen antibodi. Proses penataan kembali membawa promotor yang berada di hulu segmen
gen LH-VH ke dalam kisaran pengaruh unsur peningkat kuat yang terletak di intron antara segmen
gen JH dan CH. segmen gen. Setiap segmen gen LH-VH mengandung promoter hulu. Namun,
sebelum peristiwa penataan genom yang mengarah pada sintesis rantai berat, penambah ini lebih
dari 100.000 pasangan nukleotida dari promotor LH-VH terdekat.
Agaknya enhancer ini tidak bisa melakukan transkripsi aktif dari promotor yang berada di
tempat yang jauh. Akan tetapi, kejadian-kejadian di atas ulang yang terjadi selama diferensiasi sel
B memindahkan promotor segmen gen LH-VH terdekat ke dalam kurang dari 2000 pasangan
nukleotida dari penambah. Penambah yang terlibat dalam aktivasi sintesa rantai berat adalah
jaringan yang spesifik yang hanya mengaktivasi transkripsi dalam limphocyes dan tidak
berpengaruh pada sel yang berasal dari jaringan lain.
Agaknya, proses aktivasi memerlukan adanya faktor pengubah transkripsi yang disintesis
dalam limfosit, namun tidak pada jenis sel lainnya. Unsur penambah serupa telah ditemukan di
intron antara cluster segmen Jk gen rantai ringan dan urutan pengkodean Ck. Dengan demikian,
nampaknya gerakan promoter gen antibodi ke dalam kisaran pengaruh enhancer spesifik jaringan
mungkin merupakan mekanisme umum pengaktifan gen antibodi selama diferensiasi limfosit B
SELEKSI CLONAL
Organisme memulai sintesis antibodi yang spesifik untuk antigen yang sebelumnya tidak
pernah ditemui. Hal ini dijelaskan dengan baik oleh teori seleksi klonal. Semua antibodi yang
dihasilkan oleh limfosit B tunggal memiliki spesifisitas ikatan antigen yang sama. Tetapi sel yang
berbeda dalam populasi limfosit B akan mengalami penataan ulang genom yang berbeda yang
mengarah pada produksi antibodi dengan spesifitas yang berbeda.
Dengan demikian, populasi limfosit B pada manusia atau tikus akan menghasilkan
berbagai macam antibodi yang sangat besar. Teori seleksi klonal menyatakan bahwa pengikatan
antigen asing tertentu terhadap antibodi permukaan limfosit B merangsang sel untuk membelah,
menghasilkan sejumlah besar limfosit B ini ("tiruan" sel yang identik) dan dengan demikian
jumlah besar antibodi merangsang tertentu yang mengenali antigen asing