Waktu 60 menit
Pada kanker kolorektal (usus), enzim leukotriene A4 hidrolase (LTA4H) meningkatkan pertumbuhan
sel kanker usus besar HCT116, oleh karena itu, enzim ini menjadi target yang menarik untuk
pengembangan obat. Salah satu pendekatan yang dilakukan dalam pengembangan obat tersebut
adalah melalui molecular docking.
1. Lakukan validasi protein melalui redocking native ligand pada enzim leukotriene A4 hidrolase
(LTA4H) dengan PDB ID = 1HS6. Jawablah pertanyaan berikut :
a. Native ligand pada enzim tersebut : …………………………………………………………….
b. Berapa nilai RMSD hasil validasi : …………………………………………………………………
c. Berapa nilai moldockscore redocking : ………………………………………………………….
d. Skrinsut
Hasil molecular docking (yang memuat moldockscore dan RMSD)
2. Lakukan uji molecular docking senyawa obat yang sdh ada terhadap enzim/protein tersebut
Obat yang dilakukan molecular docking sama dengan pada saat tugas praktikum.
a. Obat apakah yang diujikan ? …………………………..
b. Gambar struktur 2D (chemdraw) dan 3D (chem3D)
Elektrostatik
Sterik
f. Skrinsut
Hasil molecular docking (yang memuat moldockscore)
3. Bandingkan dengan native ligand apakah berpotensi sebagai antikanker kolon atau tidak
senyawa yang diuji? Jelaskan!