pencegahan
Penulis:Kenneth McIntosh, MDSEditor Bagian:Martin S Hirsch, MDEditor Wakil:Allyson Bloom, MD Semua topik
diperbarui saat bukti baru tersedia dan proses peer review kami selesai. UPTODATE COM Tinjauan literatur saat ini
hingga: Jul 2021. | Topik ini terakhir diperbarui: 04 Agustus 2021.
PENDAHULUAN
Coronavirus adalah patogen manusia dan hewan yang penting. Di penghujung tahun
2019, sebuah novel virus corona diidentifikasi sebagai penyebab klaster kasus
pneumonia di Wuhan, a kota di Provinsi Hubei China. Ini menyebar dengan cepat,
mengakibatkan epidemi di seluruh China, diikuti oleh pandemi global. Pada Februari
2020, World Health Organisasi menetapkan penyakit COVID-19, yang merupakan
singkatan dari penyakit coronavirus 2019 [1]. Virus yang menyebabkan COVID-19
disebut pernapasan akut parah sindrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2); sebelumnya
disebut sebagai 2019-nCoV.
Topik ini akan membahas tentang virologi, epidemiologi, dan pencegahan COVID-
19. Itu fitur klinis dan diagnosis COVID-19 dibahas secara rinci di tempat lain.
(Melihat "COVID-19: Fitur klinis".)
Virologi Coronavirus — Coronavirus adalah virus RNA untai positif yang diselimuti.
Sekuensing genom penuh dan analisis filogenik menunjukkan bahwa virus corona
penyebab COVID-19 adalah betacoronavirus dalam subgenus yang sama dengan
penyakit akut yang parah virus sindrom pernafasan (SARS) (serta beberapa
coronavirus kelelawar), tetapi dalam beberapa klad yang berbeda. Kelompok Studi
Coronavirus dari Komite Internasional tentang Taksonomi Virus telah mengusulkan
agar virus ini disebut akut parah sindrom pernapasan coronavirus 2 (SARS-CoV-2) [4].
Pernafasan Timur Tengah Syndrome (MERS) virus, betacoronavirus lain, muncul lebih
jauh terkait [5,6]. Kesamaan urutan RNA terdekat adalah dengan dua coronavirus
kelelawar, dan tampaknya mungkin bahwa kelelawar adalah sumber utama; apakah
virus COVID-19 ditularkan langsung dari kelelawar atau melalui mekanisme lain
(misalnya, melalui inang perantara) tidak diketahui [7]. (Lihat "Virus Corona", bagian
tentang 'Virologi'.)
Reseptor inang untuk entri sel SARS-CoV-2 sama dengan untuk SARS-CoV, yaitu
enzim pengubah angiotensin 2 (ACE2) [8]. SARS-CoV-2 mengikat ACE2 melalui
domain pengikat reseptor dari protein lonjakannya (gambar 1). Protease seluler
TMPRSS2
juga tampak penting untuk entri sel SARS-CoV-2 [9].
Varian yang menjadi perhatian — Seperti virus lainnya, SARS-CoV-2 berkembang dari
waktu ke waktu. Paling mutasi pada genom SARS-CoV-2 tidak berdampak pada fungsi
virus. Yakin varian telah mengumpulkan perhatian luas karena kemunculannya yang
cepat di dalam populasi dan bukti untuk transmisi atau implikasi klinis; ini dianggap
varian perhatian (tabel 1). Setiap varian memiliki beberapa sebutan berdasarkan tata
nama yang digunakan oleh sistem klasifikasi filogenetik yang berbeda; Kesehatan Dunia
Organization (WHO) juga telah menetapkan label untuk varian terkenal berdasarkan
bahasa Yunani alfabet [10].
Di awal pandemi, sebuah penelitian yang memantau perubahan asam amino dalam
protein lonjakan dari SARS-CoV-2 yang termasuk dalam database urutan besar yang
mengidentifikasi D614G (glisin untuk substitusi asam aspartat) yang menjadi
polimorfisme dominan secara global dari waktu ke waktu
[11]. Dalam studi hewan dan in vitro, virus yang mengandung polimorfisme G614
menunjukkan tingkat yang lebih tinggi dari virus menular di saluran pernapasan,
meningkatkan pengikatan ke ACE-2, dan peningkatan replikasi dan transmisibilitas
dibandingkan dengan polimorfisme D614 [12,13]. Varian G614 tampaknya tidak terkait
dengan risiko yang lebih tinggi dari rawat inap [11] atau untuk mempengaruhi
pengikatan antibodi anti-spike [14]. Sekarang hadir di sebagian besar garis keturunan
SARS-CoV-2 yang beredar, termasuk varian yang menjadi perhatian tercantum di
bawah ini.
Di Amerika Serikat, proporsi virus yang beredar yang merupakan varian yang
mengkhawatirkan dirinci di situs web CDC.
Alpha (B.1.1.7 lineage) — Varian ini, juga dikenal sebagai 20I/501Y.V1, pertama kali
diidentifikasi di Inggris pada akhir 2020 dan secara temporal dikaitkan dengan
peningkatan infeksi regional (tabel 1) [15-17]. Varian ini mengandung lebih dari selusin
mutasi dibandingkan dengan strain sirkulasi lainnya, dengan beberapa dalam protein
spike. Memiliki selanjutnya telah diidentifikasi di negara lain, termasuk Amerika Serikat
[18].
Beberapa [27,28], tetapi tidak semua, penelitian [24] menunjukkan bahwa varian Alpha
mungkin juga berhubungan dengan keparahan penyakit yang lebih besar. Sejauh ini,
tidak ada bukti bahwa Alpha varian dikaitkan dengan pelarian kekebalan yang
signifikan secara klinis. Beberapa penelitian menunjukkan
bahwa serum dari penerima vaksin COVID-19 mempertahankan aktivitas penetralan
terhadap Varian alfa, dan beberapa vaksin mempertahankan kemanjuran terhadap
varian [29-32]. Ini data dibahas di tempat lain. (Lihat "COVID-19: Vaksin untuk
mencegah SARS-CoV-2 infeksi", bagian tentang 'Imunogenisitas, kemanjuran, dan
keamanan vaksin tertentu'.)
Namun, analisis genomik yang sedang berlangsung dari varian Alpha yang beredar
di Amerika Serikat Kingdom telah mengidentifikasi mutasi lain pada protein lonjakan,
E484K, di beberapa urutan [22]. Mutasi ini terdapat pada Beta (B.1351) dan Gamma
(P.1) varian, dan beberapa penelitian telah menyarankan bahwa itu terkait dengan
pelarian kekebalan, seperti yang dibahas di bawah ini.
Mutasi lain dalam varian ini adalah penghapusan protein lonjakan pada asam amino
69-70 (del 69-70). Beberapa tes molekuler SARS-CoV-2 tidak dapat mendeteksi gen S
(yang mengkodekan protein lonjakan) target saat penghapusan ini ada. Tes ini akan
tetap dapat mendeteksi RNA virus karena mereka menggunakan lebih dari satu target
gen dan dengan demikian tidak akan menghasilkan hasil negatif palsu. Namun
demikian, kegagalan target gen S telah digunakan sebagai penanda untuk mendeteksi
varian Alpha, dengan peringatan bahwa del 69-70 juga telah dilaporkan dalam varian
lain [31].
Delta (B.1.617.2 garis keturunan) — Garis keturunan ini, juga dikenal sebagai
20A/S:478K, pertama kali diidentifikasi di India pada Desember 2020 dan telah
menjadi varian paling umum di sana dan di beberapa negara lain, termasuk Amerika
Serikat dan Inggris (tabel 1).
Data menunjukkan bahwa varian Delta sangat menular, lebih dari Alpha. Di dalam
laporan dari Inggris, proporsi infeksi SARS-CoV-2 yang disebabkan oleh Delta naik
karena yang disebabkan oleh Alpha menurun, dan infeksi rumah tangga sekunder
tingkat yang terkait dengan infeksi Delta adalah 13,6 persen dibandingkan dengan 9,0
persen untuk Alfa [33]. Dalam laporan lain tentang wabah kecil di Amerika Serikat,
rumah tangga tingkat serangan yang terkait dengan varian Delta adalah 53 persen [34].
Sebuah studi yang tidak dipublikasikan wabah di Cina menunjukkan bahwa tingkat
RNA virus saluran pernapasan awal adalah sekitar 1000 kali lebih tinggi dengan Delta
daripada yang diamati dengan virus leluhur yang beredar selama fase pertama
pandemi.
Laporan juga menunjukkan bahwa infeksi Delta dikaitkan dengan risiko yang lebih
tinggi rawat inap dari Alpha [33,35].
Yang lain
●Beta (garis keturunan B.1.351) – Varian ini, juga dikenal sebagai 20H/501Y.V2,
diidentifikasi di
Afrika Selatan pada akhir 2020 (tabel 1) [36]. Secara filogenetis berbeda dari B.1.1.7
tetapi berbagi beberapa mutasi, termasuk mutasi protein lonjakan N501Y. Data
pengawasan di Afrika Selatan menunjukkan bahwa varian ini dengan cepat menjadi
strain yang dominan, menunjukkan bahwa ia juga memiliki potensi untuk meningkatkan
transmisibilitas. Itu kemudian menjadi diidentifikasi di negara lain, termasuk Amerika
Serikat.
Garis keturunan ini mengandung mutasi lain pada protein lonjakan, E484K, yang
memiliki berpotensi mempengaruhi kekebalan dari infeksi atau vaksinasi sebelumnya.
Dalam sebuah studi yang menilai dampak mutasi protein lonjakan pada netralisasi oleh
antibodi dalam pemulihan plasma, E484K rata-rata mengurangi netralisasi ke tingkat
terbesar dibandingkan dengan mutasi lain (dengan beberapa sampel plasma,
pengurangannya >10 kali lipat), meskipun dampak bervariasi antara sampel individu
dan dari waktu ke waktu di antara sampel dari yang sama individu [37]. Dalam laporan
lain, pengenalan protein lonjakan garis keturunan B.1.351 ke dalam a konstruksi virus
melemahkan aktivitas penetralan plasma konvalesen, dengan 48 persen sampel
plasma yang kehilangan aktivitas penetralannya; sebagian besar spesimen plasma
masih mempertahankan ikatan antibodi non-penetralisir ke protein lonjakan Beta [38].
Plasma dari penerima vaksin mRNA COVID-19 tampaknya mempertahankan
netralisasi aktivitas melawan varian Beta, tetapi pada titer yang lebih rendah daripada
melawan virus tipe liar [30,39]. Implikasi klinis dari pengurangan aktivitas penetralan ini
tidak pasti bahwa korelasi imunologis yang tepat dari kekebalan belum dijelaskan,
tetapi sepertinya kekebalan yang diinduksi oleh vaksin mRNA COVID-19 masih akan
bersifat protektif terhadap varian Beta. Laporan awal uji coba yang mengevaluasi
vaksin lain kandidat menunjukkan bahwa mereka mempertahankan kemanjuran di
Afrika Selatan, meskipun besarnya perlindungan mungkin lebih rendah di sana
dibandingkan dengan lokasi di mana Beta tidak lazim [40,41]. Data ini dibahas di
tempat lain. (Lihat "COVID-19: Vaksin untuk mencegah Infeksi SARS-CoV-2", bagian
tentang 'Imunogenisitas, kemanjuran, dan keamanan pilihan vaksin'.)
●Gamma (garis keturunan P.1) – Varian ini, juga dikenal sebagai 20J/501Y.V3,
pertama kali diidentifikasi di Jepang pada empat pelancong dari Brasil dan kemudian
dilaporkan menyumbang 42 persen dari 31 spesimen sekuensing di negara bagian
Amazonas, Brasil pada Desember 2020 (tabel 1) [42]. Ini kemudian telah diidentifikasi
di negara lain, termasuk Amerika Serikat. Ini memiliki beberapa mutasi, termasuk tiga
di domain pengikat reseptor protein lonjakan, N501Y, E484K, dan K417T, yang
menimbulkan kekhawatiran tentang potensi peningkatan penularan dan dampak pada
kekebalan [43].
●Epsilon (garis keturunan B.1.427 dan B.1.429) – Varian terkait ini juga secara
kolektif disebut sebagai 20C/S452R atau CAL.20C (tabel 1). Pada Oktober 2020,
hanya empat kasus global diidentifikasi, semuanya di California Selatan; pada Januari
2021, varian menyumbang 35 persen sampel virus yang diurutkan di California dan
telah diidentifikasi di negara lain
negara [44]. Varian mengandung beberapa mutasi protein lonjakan, termasuk L452R,
yang dikaitkan dengan peningkatan entri sel dan penurunan kerentanan terhadap
netralisasi oleh plasma penerima vaksin dan pemulihan in vitro [45]. Namun, beberapa
bukti menunjukkan bahwa kerentanan berkurang terhadap netralisasi B.1.429
sederhana dibandingkan dengan Beta [46]. Varian juga dikaitkan dengan RNA virus
dua kali lipat lebih tinggi tingkat pada usap hidung dibandingkan dengan virus tipe liar.
EPIDEMIOLOGI
Distribusi geografis dan jumlah kasus — Secara global, lebih dari 200 juta kasus
terkonfirmasi COVID-19 telah dilaporkan. Jumlah kasus yang diperbarui dalam
bahasa Inggris dapat ditemukan di Organisasi Kesehatan Dunia dan Pusat
Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa situs web. Peta interaktif yang
menyoroti kasus yang dikonfirmasi di seluruh dunia dapat ditemukan di sini.
Sejak laporan pertama kasus dari Wuhan, sebuah kota di Provinsi Hubei China, di akhir
2019, kasus telah dilaporkan di semua benua.
Orang ke orang
Rute penularan dari orang ke orang — Pernapasan langsung dari orang ke orang
penularan adalah cara utama penularan sindrom pernafasan akut yang parah
coronavirus 2 (SARS-CoV-2) [50]. Diperkirakan terjadi terutama melalui jarak dekat
kontak (yaitu, dalam jarak sekitar enam kaki atau dua meter) melalui partikel
pernapasan; virus dilepaskan dalam sekresi pernapasan ketika seseorang dengan
infeksi batuk, bersin, atau Pembicaraan dapat menginfeksi orang lain jika terhirup atau
melakukan kontak langsung dengan lendir membran. Infeksi juga dapat terjadi jika
tangan seseorang terkontaminasi oleh ini sekret atau dengan menyentuh permukaan
yang terkontaminasi dan kemudian mereka menyentuh mata, hidung, atau mulut,
meskipun permukaan yang terkontaminasi tidak dianggap sebagai rute utama
penularan.
SARS-CoV-2 juga dapat ditularkan jarak yang lebih jauh melalui jalur udara (melalui
inhalasi partikel yang tertinggal di udara dari waktu ke waktu dan jarak), tetapi sejauh
mana cara penularan ini berkontribusi terhadap pandemi tidak pasti [51-54]. Laporan
tersebar tentang wabah SARS-CoV-2 (misalnya, di restoran, di bus) telah menyoroti
potensi transmisi udara jarak jauh di tertutup, ruang berventilasi buruk [55-57]. Studi
eksperimental juga telah mendukung kelayakan transmisi udara. Sebagai contoh, studi
menggunakan pencitraan khusus untuk memvisualisasikan pernafasan pernafasan
telah menyarankan bahwa tetesan pernafasan mungkin aerosol atau dibawa dalam
awan gas dan memiliki lintasan horizontal lebih dari enam kaki (dua meter) dengan
berbicara, batuk, atau bersin [58-60]. Studi lain telah mengidentifikasi RNA virus dalam
sistem ventilasi dan sampel udara kamar rumah sakit pasien
COVID-19, termasuk pasien dengan infeksi ringan [61-65]; upaya untuk menemukan
virus yang layak di spesimen udara dan permukaan dalam pengaturan perawatan
kesehatan jarang berhasil [64- 68]. Namun demikian, transmisi keseluruhan dan tingkat
serangan sekunder SARS-CoV-2
menunjukkan bahwa transmisi udara jarak jauh bukanlah mode utama [53,54].
Selanjutnya, dalam beberapa laporan petugas kesehatan yang terpapar pasien dengan
infeksi yang tidak terdiagnosis saat hanya menggunakan tindakan pencegahan kontak
dan droplet, tanpa tindakan pencegahan sekunder infeksi diidentifikasi meskipun tidak
adanya tindakan pencegahan melalui udara [69,70]. Mencerminkan ketidakpastian saat
ini mengenai kontribusi relatif dari berbagai mekanisme transmisi, rekomendasi tentang
tindakan pencegahan di udara dalam perawatan kesehatan pengaturan bervariasi
menurut lokasi; tindakan pencegahan melalui udara secara universal direkomendasikan
ketika: prosedur yang menghasilkan aerosol dilakukan. Ini dibahas secara rinci di
tempat lain. (Lihat "COVID-19: Pengendalian infeksi untuk orang dengan infeksi SARS-
CoV-2", bagian di 'Prosedur/perawatan penghasil aerosol'.)
Deteksi RNA SARS-CoV-2 dalam darah juga telah dilaporkan di beberapa tetapi tidak
semua studi yang telah diuji untuk itu [71,72,75,83,84]. Namun, kemungkinan
ditularkan melalui darah penularan (misalnya, melalui produk darah atau jarum
suntik) tampak rendah; pernafasan virus umumnya tidak ditularkan melalui rute yang
ditularkan melalui darah, dan infeksi yang ditularkan melalui transfusi belum
dilaporkan untuk SARS-CoV-2 atau untuk Penyakit Tengah terkait. Sindrom
pernapasan timur coronavirus (MERS-CoV) atau SARS-CoV [85]. (Lihat "Darah
skrining donor: Pengujian laboratorium", bagian tentang 'Agen penyakit menular yang
muncul'.)
Juga tidak ada bukti bahwa SARS-CoV-2 dapat ditularkan melalui kontak dengan
situs membran non-mukosa (misalnya, kulit terkelupas).
Risiko penularan vertikal SARS-CoV-2 dibahas di tempat lain. (Lihat "COVID 19:
Masalah kehamilan dan perawatan antenatal", bagian 'Frekuensi bawaan infeksi'.)
Pelepasan virus dan periode penularan — Interval yang tepat selama individu dengan
infeksi SARS-CoV-2 dapat menularkan infeksi ke orang lain tidak pasti. Itu potensi
untuk menularkan SARS-CoV-2 dimulai sebelum perkembangan gejala dan tertinggi
di awal perjalanan penyakit; risiko penularan berkurang setelahnya. Penularan
setelah 7 hingga 10 hari sakit tidak mungkin terjadi, terutama untuk sebaliknya pasien
imunokompeten dengan infeksi tidak berat.
●Periode penularan terbesar – Individu yang terinfeksi lebih mungkin menular pada
tahap awal penyakit ketika tingkat RNA virus dari saluran pernapasan atas spesimen
adalah yang tertinggi [86-91]. Satu studi pemodelan, di mana mean serial interval
antara timbulnya gejala di antara 77 pasangan penularan di Cina adalah 5,8 hari,
diperkirakan penularan memuncak antara dua hari sebelum dan satu hari sesudahnya
timbulnya gejala dan menurun dalam waktu tujuh hari [89]. Dalam studi lain yang
mengevaluasi lebih dari 2500 kontak dekat dari 100 pasien dengan COVID-19 di
Taiwan, semuanya 22 kasus sekunder memiliki paparan pertama mereka ke kasus
indeks dalam waktu enam hari dari gejala serangan; tidak ada infeksi yang
didokumentasikan dalam 850 kontak yang paparannya setelah interval ini [92].
Sebagai contoh, dalam sebuah penelitian terhadap sembilan pasien dengan COVID-19
ringan, virus menular tidak terdeteksi dari spesimen pernapasan ketika tingkat RNA
virus <106 salinan/mL [88]. Dalam penelitian lain, virus menular hanya terdeteksi pada
spesimen pernapasan dengan: konsentrasi tinggi RNA virus. Konsentrasi RNA virus
yang begitu tinggi dicerminkan oleh jumlah yang lebih rendah dari reverse transcriptase
polymerase chain reaction (RT-PCR) siklus amplifikasi yang diperlukan untuk deteksi.
Tergantung pada studinya, siklusnya ambang batas (Ct) untuk kepositifan kultur
spesimen dapat bervariasi dari <24 hingga 32 [100,101]. Menurut informasi dari Pusat
Pengendalian Penyakit Amerika Serikat dan Pencegahan (CDC), tiga hari setelah
pemulihan klinis, jika RNA virus masih dapat dideteksi di spesimen pernapasan atas,
konsentrasi RNA umumnya pada atau di bawah tingkat di mana virus kompeten-
replikasi dapat diisolasi dengan andal; selain itu, isolasi virus menular dari spesimen
saluran pernapasan atas lebih dari 10 hari setelah sakit onset jarang didokumentasikan
pada pasien yang memiliki infeksi tidak parah dan yang gejalanya telah sembuh
[88.100-105]. Kecuali untuk laporan sporadis reinfeksi, virus menular belum diisolasi
dari spesimen pernapasan imunokompeten pasien yang memiliki tes RNA positif
berulang setelah perbaikan klinis dan awal pembersihan RNA virus, dan dalam
penelitian yang mengevaluasi pasien tersebut, infeksi sekunder kontak dekat mereka
belum didokumentasikan meskipun ada peluang untuk transmisi [106.107]. (Lihat
'Risiko infeksi ulang' di bawah.)
Risiko penularan tergantung pada jenis paparan — Risiko penularan dari individu
dengan infeksi SARS-CoV-2 bervariasi menurut jenis dan durasi paparan,
penggunaan tindakan pencegahan, dan kemungkinan faktor individu (misalnya,
jumlah virus yang masuk) sekresi pernapasan) [113]. Banyak orang tidak menularkan
SARS-CoV-2 kepada siapa pun lain, dan data epidemiologi menunjukkan bahwa
minoritas kasus indeks mengakibatkan sebagian besar infeksi sekunder [114-116].
●Di antara kontak rumah tangga [117.118]. Satu tinjauan sistematis dari 54 studi yang
dievaluasi tingkat infeksi sekunder di antara kontak rumah tangga atau keluarga pasien
indeks dengan COVID-19 [118]. Di antara 77.758 kontak di Asia, Eropa, Amerika
Serikat, dan Australia, perkiraan tingkat infeksi sekunder rumah tangga yang
dikumpulkan adalah 17 persen, dengan variabilitas substansial di seluruh studi (kisaran
4 sampai 45 persen). Di dalam rumah tangga, pasangan atau orang penting lainnya
memiliki tingkat infeksi sekunder tertinggi [117]. Namun demikian, anak-anak dan
remaja juga dapat berfungsi sebagai kasus indeks untuk sekolah menengah infeksi
rumah tangga [119-121]. (Lihat "COVID-19: Manifestasi klinis dan diagnosis pada anak-
anak", bagian 'Apakah anak-anak menularkan SARS-CoV-2 ke orang lain?'.)
Sebuah survei seroprevalensi besar dari Spanyol juga menyoroti risiko infeksi yang
lebih besar dengan rumah tangga dibandingkan dengan paparan non-rumah tangga
[122]. Tingkat terdeteksi antibodi terhadap SARS-CoV-2 adalah 31 hingga 37 persen
(tergantung pada uji serologis) digunakan) di antara individu yang melaporkan
memiliki anggota rumah tangga dengan konfirmasi COVID-19, dibandingkan dengan
tingkat 10 hingga 14 persen di antara mereka yang melaporkan rekan kerja, anggota
keluarga non-rumah tangga, atau teman dengan COVID-19.
Studi-studi ini dilakukan sebelum prevalensi varian yang lebih menular, dengan mana
tingkat serangan sekunder yang lebih tinggi telah dilaporkan. (Lihat 'Varian yang
menjadi perhatian' di atas.)
●Dalam pengaturan perawatan kesehatan ketika alat pelindung diri tidak digunakan
(termasuk rumah sakit [123] dan fasilitas perawatan jangka panjang [124]).
●Di tempat berkumpul lainnya di mana individu tinggal atau bekerja dalam jarak dekat
(misalnya, kapal pesiar [125], tempat penampungan tunawisma [126.127], fasilitas
penahanan [128.129], asrama perguruan tinggi [130], dan fasilitas pengolahan
makanan [131.132]).
Jumlah virus yang bervariasi dalam sekresi pernapasan dapat berkontribusi pada risiko
variabel penularan dari individu yang berbeda. Dalam sebuah studi observasional yang
mencakup 282 individu dengan COVID-19 yang telah menjalani kuantifikasi RNA virus
saluran pernapasan sebagai bagian dari percobaan dan 753 kontak dekat mereka,
penularan diidentifikasi hanya dari 32 persen pasien indeks [139]. Tingkat RNA saluran
pernapasan yang lebih tinggi (diambil pada a median empat hari setelah timbulnya
gejala) secara independen terkait dengan tingkat serangan sekunder.
Bepergian dengan individu dengan COVID-19 juga merupakan paparan berisiko tinggi
[140-142], karena umumnya menghasilkan kontak dekat untuk waktu yang lama. Satu
studi melaporkan 62 persen tingkat serangan di antara penumpang yang berbagi kabin
kelas bisnis dengan kasus indeks selama penerbangan 10 jam; hampir semua individu
yang terinfeksi (11 dari 12) memiliki telah duduk dalam jarak enam kaki (dua meter)
dari kotak indeks [141]. Sebuah analisis dari Cina melihat risiko di antara individu yang
bepergian dengan kereta api dan terpapar di dalam tiga baris ke individu kemudian
dikonfirmasi memiliki COVID-19 [142]. Studi tersebut mengidentifikasi 2.334 kasus
primer dan 234 kasus sekunder untuk tingkat serangan keseluruhan 0,32 persen.
Risikonya infeksi sekunder tertinggi (3,5 persen) untuk individu di kursi yang
berdekatan dengan pasien indeks, dan lebih tinggi untuk mereka yang duduk di baris
yang sama daripada mereka yang di depan atau dibelakang. Risikonya juga meningkat
seiring waktu perjalanan. Studi ini tidak dapat menjelaskan kemungkinan bahwa
individu yang duduk bersebelahan bisa saja berasal dari orang yang sama rumah
tangga atau berbagi eksposur lainnya.
Risiko penularan dalam pengaturan luar ruangan tampaknya jauh lebih rendah
daripada di dalam ruangan, meskipun data terbatas [143]. Namun demikian, kontak
dekat dengan individu dengan COVID-19 tetap menjadi risiko di luar ruangan.
Risiko penularan dengan kontak yang lebih tidak langsung (misalnya, melewati
seseorang yang terinfeksi
di jalan, menangani barang-barang yang sebelumnya ditangani oleh seseorang yang
terinfeksi) adalah tidak mapan dan kemungkinan sangat rendah. Namun, banyak orang
dengan COVID-19 melakukannya tidak melaporkan memiliki kontak dekat tertentu
dengan COVID-19 pada minggu-minggu sebelumnya diagnosis [144].
Risiko penularan dari anak-anak dengan COVID-19 dibahas secara rinci di tempat
lain. (Lihat "COVID-19: Manifestasi klinis dan diagnosis pada anak-anak", bagian
'Melakukan' anak-anak menularkan SARS-CoV-2 ke orang lain?'.)
Dasar biologis untuk ini didukung oleh studi wabah SARS-CoV-2 di fasilitas perawatan
jangka panjang, di mana virus menular dibiakkan dari bagian atas RT-PCR-positif.
spesimen saluran pernapasan pada pasien presimptomatik dan asimtomatik sedini
mungkin enam hari sebelum perkembangan gejala khas [152]. Level dan durasi RNA
virus di saluran pernapasan bagian atas pasien tanpa gejala juga mirip dengan pasien
dengan gejala [153].
Risiko penularan dari individu yang tidak menunjukkan gejala tampak kurang dari itu
dari orang yang bergejala [118.120.154-157]. Sebagai contoh, dalam analisis 628
Kasus COVID-19 dan 3790 kontak dekat di Singapura, risiko infeksi sekunder adalah
3,85 kali lebih tinggi di antara kontak individu yang bergejala dibandingkan dengan
kontak individu tanpa gejala [158]. Demikian pula, dalam analisis American penumpang
di kapal pesiar yang mengalami wabah besar SARS-CoV-2, infeksi SARS CoV-2
didiagnosis pada 63 persen dari mereka yang berbagi kabin dengan penumpang
individu dengan infeksi tanpa gejala, dibandingkan dengan 81 persen dari mereka yang
berbagi kabin dengan individu bergejala dan 18 persen dari mereka tanpa teman kabin
[156].
Namun demikian, individu tanpa gejala atau presimptomatik lebih kecil kemungkinannya
untuk diisolasi diri dari orang lain, dan sejauh mana penularan dari individu
berkontribusi terhadap pandemi tidak pasti. Sebuah studi pemodelan CDC
memperkirakan bahwa 59 persen penularan dapat dikaitkan dengan individu tanpa
gejala: persen dari individu tanpa gejala, dan 24 persen dari mereka yang tetap tanpa
gejala [159]. Perkiraan ini didasarkan pada beberapa asumsi, termasuk bahwa 30
persen orang yang terinfeksi tidak pernah mengalami gejala dan 75 persen sebagai
menular seperti mereka yang melakukannya.
Kontaminasi RNA SARS-CoV-2 yang luas pada permukaan lingkungan di kamar rumah
sakit dan daerah perumahan pasien dengan COVID-19 telah dijelaskan [61.160.161].
Di sebuah studi dari Singapura, RNA virus terdeteksi pada hampir semua permukaan
yang diuji (pegangan, sakelar lampu, tempat tidur dan pegangan tangan, pintu dan
jendela interior, mangkuk toilet, wastafel) di ruang isolasi infeksi udara dari pasien
dengan gejala COVID-19 ringan sebelumnya untuk pembersihan rutin [61]. RNA virus
tidak terdeteksi pada permukaan serupa di ruangan-ruangan two other symptomatic
patients following routine cleaning (with sodium dichloroisocyanurate). Of note, viral
RNA detection does not necessarily indicate the presence of infectious virus [88].
These data highlight the importance of environmental disinfection in the home and
health care setting. (See "COVID-19: Infection control for persons with SARS-CoV-2
infection", section on 'Environmental disinfection'.)
Given the uncertainty regarding the transmission risk and the apparent susceptibility of
some animals to SARS-CoV-2 infection, the United States CDC recommends that pets
be kept away from other animals or people outside of the household and that people
with confirmed or suspected COVID-19 try to avoid close contact with household pets,
as they should with human household members, for the duration of their self-isolation
Titik. There have been no reports of domesticated animals (other than mink)
transmitting SARS-CoV-2 infection to humans.
Neutralizing activity has been associated with protection from subsequent infection
[184]. Detectable binding antibodies, which generally correlate with neutralizing activity,
are also associated with a reduced risk of SARS-CoV-2 reinfection [185-188]. (See 'Risk
of reinfection' below.)
Risk of reinfection — The short-term risk of reinfection (eg, within the first several
months after initial infection) is low. Prior infection reduces the risk of infection in the
subsequent six to seven months by 80 to 85 percent [187,201].
These results are consistent with those from other observational studies that suggest a
lower rate of SARS-CoV-2 PCR positivity among individuals with detectable antibodies
against the virus [185-188]. In a study of health care workers in the United Kingdom
who underwent intermittent PCR and antibody testing, the 8278 participants with
evidence of prior infection had an 84 percent lower rate of subsequent infection (as
determined by PCR positivity) over seven months compared with the 17,383
participants who had no prior infection (8 versus 57 cases per 100,000 days; incidence
rate ratio 0.16) [187]. In another study, reinfection among individuals who were
seropositive at baseline was associated with lower titers of anti-spike IgG and lower
rates of detectable neutralizing activity [188]. (See 'Immune responses following
infection' above.)
Simply having a positive SARS-CoV-2 viral test after recovery does not necessarily
indicate reinfection; sequencing that demonstrates a different strain at the time of
presumptive reinfection is necessary to make the distinction between reinfection and
prolonged or intermittent viral RNA shedding following an initial infection. (See "COVID
19: Diagnosis", section on 'Diagnosis of reinfection'.)
Sporadic cases of confirmed reinfection using sequencing data have been described
throughout the world [204-212]. In some of these cases, the second infection was
asymptomatic or milder than the first, raising the possibility that immunity from an initial
infection might attenuate the severity of a reinfection even if it does not prevent it.
However, not all cases of purported reinfection have been less severe than the initial
infection, and at least one fatal reinfection has been reported in a patient undergoing B
cell-depleting therapy and chemotherapy [208].
These cases contrast with prior reports of positive PCR tests in patients with laboratory
confirmed COVID-19 following clinical improvement and negative results on two
consecutive tests [213-216]. In these earlier cases, positive tests usually occurred
shortly after the negative tests and were usually not associated with worsening gejala.
In a study of 108 patients with a repeat positive RNA test after previously testing
negative and being cleared from isolation, infectious virus could not be isolated in cell
culture and there were no newly confirmed cases among close contacts exposed
during the period of the repeat positive test [106]. Thus, many individuals who have
repeat positive PCR tests soon after infection have ongoing viral RNA shedding rather
than reinfection. (See 'Viral shedding and period of infectiousness' above.)
PENCEGAHAN
Infection control in the health care setting — In locations where community transmission
is widespread, preventive strategies for all individuals in a health care setting are
warranted to reduce potential exposures. Additional measures are warranted for
patients with suspected or confirmed COVID-19. Infection control in the health care
setting is discussed in detail elsewhere. (See "COVID-19: Infection control for persons
with SARS-CoV-2 infection", section on 'Infection control in the health care setting'.)
●Diligent hand washing, particularly after touching surfaces in public. Use of hand
sanitizer that contains at least 60% alcohol is a reasonable alternative if the hands are
not visibly dirty. The importance of hand hygiene was illustrated by a study in which
mucus specimens inoculated with cultured SARS-CoV-2 virus were applied to human
skin collected from autopsy [218]. SARS-CoV-2 remained viable on the skin for about
nine hours but was completely inactivated within 15 seconds of exposure to 80%
alkohol.
●Avoiding touching the face (in particular eyes, nose, and mouth). Orang Amerika
Academy of Ophthalmology suggests that people not wear contact lenses, because
they make people touch their eyes more frequently [219].
●Cleaning and disinfecting objects and surfaces that are frequently touched. Amerika
Serikat States Centers for Disease Control and Prevention (CDC) has issued guidance
on disinfection in the home setting; a list of Environmental Protection Agency-registered
products can be found here.
●Ensure adequate ventilation of indoor spaces. This includes opening windows and
doors, placing fans in front of windows to exhaust air to the outside, running heating/air
conditioning fans continuously, and using portable high-efficiency particulate air (HEPA)
filtration systems [220,221].
The CDC has included recommended measures to prevent spread in the community on
its website [217].
Individuals who are caring for individuals with suspected or documented COVID-19 at
home should also wear a mask when in the same room as that person. Precautions for
individuals with suspected or documented COVID-19 and their caretakers are discussed
in detail elsewhere. (See "COVID-19: Infection control for persons with SARS-CoV-2
infection", section on 'Isolation at home'.)
Type of masks — In the United States, cloth masks and disposable masks (eg,
commercially available surgical masks) are recommended for community use [224]. Itu
CDC specifies that the mask recommendation does not include N95 respirators, which
should be reserved for health care workers. Cloth masks should be made with several
layers of tightly woven fabric [225,226]. All masks should fit snugly over the face without
kesenjangan. Strategies to improve mask fit include using a mask with an adjustable
nose bridge, wearing a cloth mask over a disposable mask, knotting the ear loops of a
disposable mask to cinch the sides of the mask and secure it against the face, using
masks with ties rather than ear loops, and using a mask brace [227]. Masks should not
have exhalation valves. The CDC notes that the importance of fit and filtration likely
increases in situations where the risk of exposure is high (eg, prolonged close contact
indoors with people outside the household). Some individuals may opt to wear KN95
respirators, which are intended to have a very high filtration efficacy when fit tightly
against the face and are available commercially. However, people should be aware that
many marketed KN95 respirators do not meet the advertised filtration standards; jika
used, KN95 respirators that have been granted emergency use authorization by the US
Food and Drug Administration (FDA) should be chosen [228]. Detailed information on
the types of recommended masks can be found on the CDC website.
The WHO also recommends non-medical masks for most individuals and has issued
standards for the ideal composition of a cloth mask to optimize fluid resistance and
filtration efficiency [229]. However, it recommends that medical masks be used by
individuals at risk for severe COVID-19 (eg, individuals >60 years old or with high-risk
underlying conditions) when in public settings where distancing is not feasible and by
any household members of individuals with suspected or confirmed COVID-19 when in
the same room [222]. In certain European countries, medical masks (including
respirators, such as N95 masks) are recommended in certain indoor public settings,
including on public transportation and in stores [230].
When advising patients on the use of masks, clinicians should counsel them to avoid
touching the eyes, nose, and mouth when putting on or removing the mask, to practice
hand hygiene before and after handling the mask, and to launder cloth masks routinely.
Clinicians should also emphasize that the mask does not diminish the importance of
other preventive measures, such as social distancing and hand hygiene. Patients can
also be counseled that masks have not been associated with impairment in gas
exchange, including among patients with underlying lung disease [231,232].
Rationale — The rationale for wearing masks in the community is primarily to contain
secretions of and prevent transmission from individuals with infection, including those
who have asymptomatic or presymptomatic infection. Masks can also reduce exposure
to SARS-CoV-2 for the wearer.
●Source control – Several studies support the use of masks to provide source control
and reduce transmission in the community [225,233-240]. In a retrospective study of
124 patients with confirmed COVID-19 and their families in Beijing, China, secondary
transmission occurred in 41 families; use of masks by family members (including the
index patient) prior to illness onset in the index patient was independently associated
with a reduced risk of infection [233]. The type of mask used (medical or cloth) was not
ditentukan. In a case report of two hair stylists with COVID-19 who worked while
symptomatic prior to the diagnosis but wore face coverings, there were no subsequent
COVID-19 diagnoses among 139 clients with close contact, all of whom were also
wearing face coverings; both medical masks and cloth face coverings were used [241].
In epidemiologic studies, government-issued mask mandates and high rates of self
reported mask wearing have each been associated with decreased community
incidence rates and, in some cases, decreased COVID-19 hospitalization rates
[240,242-244]. Although limited by assumptions and estimates, modeling studies have
also suggested that high adoption of mask-wearing by the general public can reduce
transmission, even if masks are only moderately effective in containing infectious
respiratory secretions [245,246].
Mask-wearing has also been hypothesized to reduce the viral inoculum, even if it
doesn't eliminate exposure, and thereby reduce the risk of severe illness
[251,252].
●Filtration efficacy – Filtering facepiece respirators (FFR) have the highest filtration
efficacy. In the United States, the prototypical FFR is the N95 respirator, which filters at
least 95 percent of 0.3 micrometer particles. Medical masks have lower filtration
efficacy, which depends on how closely the mask lies against the face. Dalam satu
studi, medical masks with ties versus ear loops filtered 72 and 38 percent of particles,
respectively (approximately 0.02 to 3.00 micrometers) [253]. Other strategies to improve
the fit of a medical mask, such as using a cloth mask over it or knotting the ear loops to
eliminate gaps, also appear to increase filtration efficacy [254]. Studies on the filtration
efficacy of fabrics suggest that certain fabrics (eg, tea towel fabric [termed dish towel
fabric in the United States], cotton-polypropylene blends), particularly when double
layered, can approach the filtration efficacy of medical masks [225,255-257]. dalam
sebuah experimental model, universal masking with a three-ply cotton mask was shown
to substantially reduce aerosol exposure [221]. Tight-weave fabric, two or more layers,
and a tight fit are essential for adequate filtration.
Despite the variability in filtration efficacy of different masks (respirators, medical masks,
cloth masks) in experimental settings, data on clinical efficacy differences in preventing
transmission of SARS-CoV-2 are lacking.
Screening in high-risk settings — Screening for SARS-CoV-2 infection with serial viral
testing is recommended in long-term care facilities to quickly identify cases so that
infected individuals can be isolated, contacts can be quarantined, and outbreaks can be
prevented [264,265] (see "COVID-19: Management in nursing homes", section on
'Screening and testing'). Similar strategies have been employed in other congregate
environments, such as college campuses [266]. Some have proposed more widespread
use of serial testing as a measure to slow community transmission [267,268].
Both nucleic acid amplification tests (NAATs) and antigen tests have been used for
serial screening. Although antigen tests are generally less sensitive than NAAT,
modelling studies have suggested that if the frequency of testing is high enough, tests
with lower sensitivity can be successfully used to reduce cumulative infection rates
[269,270]. Accessibility and fast turnaround time are also important features of a useful
screening test. (See "COVID-19: Diagnosis", section on 'Specific diagnostic
techniques'.)
Other public health measures — On January 30, 2020, the WHO declared the COVID
19 outbreak a public health emergency of international concern and, in March 2020,
began to characterize it as a pandemic in order to emphasize the gravity of the situation
and urge all countries to take action in detecting infection and preventing spread.
Throughout the world, countries have employed various nonpharmaceutical
interventions to reduce transmission. In addition to personal preventive measures (eg,
masks, hand hygiene, respiratory etiquette, and environmental disinfection),
transmission reduction strategies include:
●Stay-at-home orders
●Aggressive case identification and isolation (separating individuals with infection from
others)
●Contact tracing and quarantine (separating individuals who have been exposed from
others)
These measures have been associated with reductions in the incidence of SARS-CoV-2
infection over time, with epidemiologic studies showing reductions in cases, and in
some situations, COVID-19-related deaths following implementation of these mitigation
measures [273-281].
For countries where incidence has declined and relaxation of transmission reduction
measures is being considered, the WHO has issued interim guidance on
implementation, which includes a step-wise approach that is adjusted according to local
circumstances and prioritizes protecting vulnerable populations; it recommends that
personal preventive measures be maintained and that public health efforts to detect
cases for isolation and to identify contacts for quarantine be strengthened [282,283].
Recommendations on international and domestic travel in the United States are found
on the CDC website [284,285]. Because the risk of travel changes rapidly and
recommendations on restricting activity and testing after travel vary by state, individuals
should consult country- and state-specific guidance prior to travel.
Testing and quarantine — Testing and quarantine are strategies to quickly identify
secondary infections in an exposed individual and reduce the risk of that individual
exposing others before an infection is recognized. In the United States, CDC
suggestions on testing and quarantine following an exposure in the community depend
on the vaccination status and history of infection. The following measures are
recommended for those who have had close contact with a person with suspected or
confirmed SARS-CoV-2 infection in the community (including during the 48 hours prior
to that patient developing symptoms and regardless of whether the individuals involved
were wearing masks) [286]:
•Daily monitoring for fever, cough, or dyspnea for 14 days. Individuals who develop
such signs or symptoms should stay home and maintain distance from other individuals,
including those in their household, if they are not doing so already (as below), and
contact their medical providers. (See "COVID-19: Outpatient evaluation and
management of acute illness in adults", section on 'Management and counseling for all
outpatients'.)
•Self-quarantine at home, with maintenance of at least six feet (two meters) from others
selalu. In particular, they should avoid contact with individuals at high risk for severe
illness. (See "COVID-19: Clinical features", section on 'Risk factors for severe illness'.)
The preferred quarantine period is 14 days following the date of the last exposure (so
long as the individual remains asymptomatic) and is based on the incubation period for
SARS-CoV-2 infection. (See "COVID-19: Clinical features", section on 'Incubation
period'.)
However, the CDC acknowledges that shorter durations of quarantine may ameliorate
the associated community burdens and adherence challenges in exchange for a slightly
increased risk of post-quarantine transmission [287]. Thus, it notes that acceptable
alternatives are:
These intervals were based on modeling performed by the CDC that suggested median
post-quarantine transmission rates of 4 percent (range 2.3 to 8.6) for the 7-day
quarantine with negative NAAT and 1.4 percent (range 0.1 to 10.6) for the 10-day
quarantine, compared with 0.1 percent (range 0 to 3.0) for the 14-day quarantine. Di
dalam another study of individuals who had household exposure to SARS-CoV-2 and
underwent daily symptom monitoring and polymerase chain reaction (PCR) testing,
there was an 81 percent probability that those who were asymptomatic with negative
testing through day 7 would remain so through day 14 [288].
If quarantine periods shorter than 14 days are used, individuals should be counseled to
continue symptom monitoring and maintain strict adherence to other prevention efforts
within and outside of the household (eg, mask wearing, physical distancing) for a full 14
hari.
For household members of an individual with COVID-19 who cannot physically separate
themselves (eg, maintain physical distance, sleep in a separate room, use a separate
bathroom) from that person, the quarantine period begins once the isolation period of
the individual with COVID-19 is complete.
•Testing (ideally five to seven days following exposure) is also recommended following
close contact to promptly identify new infections [289]. However, a negative test
performed earlier after exposure should not be used to reduce the quarantine period to
shorter than seven days. (See "COVID-19: Diagnosis", section on 'Select asymptomatic
individuals'.)
●For vaccinated individuals: Fully vaccinated individuals are exempted from the self
quarantine suggestions above but should get tested 3 to 5 days following exposure and
wear a mask in public for 14 days or until the test is negative [290]. They should also
continue to self-monitor for fever and symptoms for 14 days following exposure and
undergo evaluation if features of COVID-19 develop.
●For individuals with a recent history of infection: Individuals who had documented
SARS-CoV-2 infection within the three months prior to the exposure are exempted from
these self-quarantine and testing recommendations [291]. (See "COVID-19: Diagnosis",
section on 'Symptomatic patients'.)
Management of health care workers with a documented exposure is discussed in detail
di tempat lain. (See "COVID-19: Infection control for persons with SARS-CoV-2
infection".)
Post-exposure prophylaxis for select individuals — In the United States, the FDA has
issued an emergency use authorization (EUA) to use the monoclonal antibody
casirivimab-imdevimab to prevent SARS-CoV-2 infection in select individuals over 12
years of age who have had close contact with an individual with infection or who are at
high risk of exposure to individuals with infection in an institutional setting [292]. Jika
casirivimab-imdevimab is available, we suggest this approach to post-exposure
prophylaxis for the following individuals, who meet the criteria for use according to the
EUA:
●Those who are at high risk for progression to severe COVID-19 based on age or
underlying conditions, as outlined in the table (table 2)
dan
We recommend against using other agents for prophylaxis outside a clinical trial.
●Variants of concern – Several variants of SARS-CoV-2 have emerged that are notable
because of the potential for increased transmissibility (table 1). Possible immune
escape is another concern for some recently isolated variants.
SARS-CoV-2 has been detected in non-respiratory specimens, including stool, but the
role of these sites in transmission is uncertain.
●Period of infectiousness – Individuals with SARS-CoV-2 infection are most infectious
in the earlier stages of infection (starting a few days prior to the development of
symptoms). Transmission after 7 to 10 days of illness is unlikely, particularly for
otherwise immunocompetent patients with nonsevere infection. Prolonged viral RNA
shedding after symptom resolution is not clearly associated with prolonged
infectiousness.
●Quarantine – Unvaccinated individuals who have close contact with someone with
known or suspected COVID-19 should monitor for symptoms and self-quarantine (ie,
stay at home, physically distanced from others). The preferred quarantine period is 14
days; shorter quarantine periods of 7 days (following a negative viral test within 48
hours) or 10 days are acceptable alternatives, although they are associated with a
higher risk of post-quarantine transmission.
•They had close contact with an individual with infection or have a high risk of exposure
to individuals with infection in an institutional setting.
•They are at high risk for progression to severe COVID-19 based on age or underlying
conditions (table 2).
●Public health guidance - Guidance has been issued by the WHO and the United
States Centers for Disease Control and Prevention (CDC), as well as other expert
organisasi. These are updated on an ongoing basis.
--