A Rapid Method for Detection of Salmonella in

Milk Based on Extraction of mRNA Using

Magnetic Capture Probes and RT-qPCR
Yalong Bai, Yan Cui, Yujuan Suo, Chunlei Shi, Dapeng Wang, & Xianming Shi (2019)

Kelompok 6 :
Rahmat Bakti S 170219006
Kevin Laksmono 170219022
Tujuan Jurnal

 Deteksi Salmonella dalam produk susu secara cepat dan akurat.

Metode
 Pembuatan Probe Magnetik
 Nano Partikel magnetic (Fe3O4)
 Silika
 Asam Amino

 Kultivasi Salmonella strain sebagai sampel

 Salmonella enterica
 Luria-Bertani medium
 Sampel Susu
Analisis
 Sampel disentrifuge > ditambahkan reagent RNAprotect Bacteria Reagent
 Sentrifuge > ditambahkan enzim lysis
 Vortex > Sentrifuge
 Aqueous phase >> ditambahkan probe magnetic
 Dipisahkan m-RNA terikat dengan magnet
 m-RNA digunakan untuk RT-qPCR
One step RT-qPCR
Kelebihan
 Hybrid m-RNA:DNA lebih stabil disbanding DNA dupleks
 Menarget m-RNA yang hanya dapat dijumpai pada sel hidup
 Lebih singkat dan sensitive
 Variasi eksperimental yang lebih sedikit karena kedua reaksi berlangsung dalam tabung
yang sama , Lebih sedikit langkah pemipetan yang mengurangi risiko kontaminasi, Cocok
untuk amplifikasi
Kekurangan

 Perlu membuat magnetic probe berbeda untuk tiap primer spesifik

 Probe magnetic perlu dihilangkan sebelum di PCR
 Tidak dapat mengoptimalkan dua reaksi secara terpisah, Kurang sensitif dibandingkan dua
langkah karena merupakan dua reaksi gabungan, Deteksi target yang lebih sedikit per
sampel