LANGKAH – LANGKAH EDITING

HASIL SEKUENSING

DEPARTEMEN
MIKROBIOLOGI FK UNUD
 Hasil sekuensing berupa chromatogram dan chromatogram data

Chromatogram

Chromatogram data
Beberapa ketentuan yang harus diperhatikan
dalam melakukan editing

Download software yang akan digunakan

Umumnya menggunakan software MEGA

 Simpan sekuen dari genbank yang cocok dengan

primer (sekuen yang dipanggil saat melakukan Blast
primer yang akan digunakan

 Hasil sekuensing dengan primer R HARUS di

Reverse Complement terlebih dahulu.

 Cocokkan /bandingkan chromatogram data dari

primer F dan primer R yang ditampilkan di
sofware MEGA dengan hasil Chromatogram
Ujung Chromatogram yang tidak dapat dibaca, boleh dihapus. Gunakan gambar
yang bisa dianalisa

Sekuen F

Sekuen R
Perhatikan adanya Noise
 Kualitas gambar yang bagus

Kualitas gambar yang kurang bagus/kotor

 Buka software MEGA , ambil data yang akan dianalisa

Buka MEGA

Pilih Align

Edit Build Alignment

Creat New Alignment OK DNA

Tekan Edit Insert Sequen from file Open

Lakukan Reverse complement pada Reverse

sekuen dari primer R Data
complement

Lakukan editing Alignment-Clustal W Control A