Nama : Tantri Febriana Putri

NIM : S531808046
Peminatan : Human Nutrition

Sintesis ATP

A. Pendahuluan
Pada umumnya, sumber energi utama untuk metabolisme sel adalah glukosa,
yang mengalami katabolisme sebanyak 3 proses yaitu glikolisis, siklus krebs, dan
fosforilasi oksidatif.

B. Prinsip Dasar
1. Glikolisis
a. Glukosa terfosforilasi pada grup hidroksil 6 carbon yang dengan bantuan
enzim heksokinase menghasilkan glukosa 6 fosfat.
b. Glukosa 6 fosfat diubah menjadi fruktosa 6 fosfat oleh glukosa-6 fosfat
isomerase. C-1 terfosforilasi dengan bantuan isomerase, menghasilkan
fruktosa 1,6-bifosfat. Enzim aldolase dapat memecah fruktosa 1,6-bifosfat
menjadi dua molekul tiga karbon yaitu Dihidroksiaseton Fosfat (DHAP) dan
Gliseraldehida-3-Fosfat (GAP).
c. DHAP diisomerisasi oleh isomerase triosefosfat untuk membentuk molekul
kedua GAP. Semua rantai karbon yang berasal dari glukosa diubah menjadi
dua molekul GAP. Setiap molekul yang teroksidasi dan terfosforilasi oleh
fosfat anorganik membentuk 1,3-bifosfogliserat. Selama proses ini,
glyceraldehyde-3-fosfat dehidrogenase (GAPDH) menggunakan NAD+
sebagai kofaktor dan melepaskan NADH untuk setiap molekul dari GAP.
d. Sebagian energi dilepaskan melalui konversi 1,3 bifosfogliserat menjadi dua
molekul piruvat oleh phosphoglycerate kinase (PGK), phosphoglicerate
mutase, enolase, dan piruvat kinase. Konversi 1,3-bifosfogliserat menjadi 3-
fosfogliserat (oleh PGK) dan fosfoenolpiruvat menjadi piruvat (oleh piruvat
kinase) adalah langkah-langkah yang mendorong. Sintesis ATP dari ADP
dalam glikolisis. Piruvat kinase (PK) mengalami regulasi alosterik oleh
fruktosa 1,6-bifosfat yang mendorong aktivitas PK dan meningkatkan
tingkat glikolisis.
e. Jadi, 1 molekul glukosa menghasilkan 2 ATP, 2 NADH yang masuk ke
dalam sistem pernapasan, dan 2 Asam piruvat. Selanjutnya masuk ke siklus
krebs dan mengalami oksidasi dalam keadaan aerobik.

2. Siklus Krebs
Pada sel prokariotik, siklus asam sitrat terjadi di sitoplasma; dalam sel
eukariotik, siklus asam sitrat berlangsung dalam mitokondria. Bahan awal yang
digunakan yaitu asam piruvat hasil dari proses glikolisis. Pada reaksi enzimatik,
terdapat tiga enzim dehidrogenase piruvat (E1), dihidrolipoil transasetilase (E2), dan
dihidrolipoil dehidrogenase (E3), mengoksidasi piruvat menjadi asetil-KoA dan
CO2 secara ireversibel di mana gugus karboksil dikeluarkan dari piruvat sebagai
molekul CO2. kelompok asetil memasukkan dua karbon di setiap putaran; ini
kemudian karbon akan meninggalkan siklus krebs sebagai CO2.
a. Pembentukan Sitrat
Reaksi pertama dari siklus krebs adalah kondensasi satu asetil-KoA dan
molekul molekul sitrat untuk menghasilkan oksaloasetat dikatalisasi oleh
sitrat sintase.
b. Pembentukan Isositrat
Sitrat berubah menjadi isositrat oleh enzim aconitase melalui pembentukan
cis-acinitate.
c. Oksidasi isositrat menjadi α ketoglutarat
Isositrat dehydrogenase mengkatalis dekarboksilasi oksidatif menghasilkan α
ketoglutarat dan CO2. α ketoglutarat yang baru dihasilkan selanjutnya
mengalami dekarboksilasi oleh α ketoglutarat dehidrogenase dalam reaksi
yang mirip dengan piruvat dehydrogenase. Energi yang dilepaskan dari kedua
oksidasi tersebut digunakan untuk menghasilkan NADH dari NAD.
d. Oksidasi α ketoglutarat menjadi suksinil –KoA
Alpha-ketoglutarat teroksidasi, karbon dioksida akan dihapus, dan koenzim A
ditambahkan untuk membentuk senyawa 4-karbon suksinil-KoA.
e. Mengubah suksinil KoA menjadi suksinat
Selanjutnya yaitu katalisasi oleh suksinil KoA sintase dan menggunakan
energi yang berasal dari pemindahan KoA ke fosforilasi GDP (ADP) menjadi
GTP (ATP). Suksinat yang dihasilkan adalah senyawa empat karbon yang
kemudian diubah oleh reaksi tiga sekuensial, oksaloasetat menuju mengakhiri
siklus.
f. Oksidasi suksinat menjadi fumarat
Oksidasi suksinat menjadi fumarat oleh suksinat dehidrogenase. Enzim ini,
terikat erat pada membran mitokondria bagian dalam (IMM), FAD direduksi
menjadi FADH2 yang menyediakan elektron untuk rantai pernafasan.
g. Hidrasi Fumarat menjadi malat
Fumarat kemudian terhidrasi oleh hidratase fumarat menjadi L-malate.
Suksinat dehydrogenase dan fumarat hidratase adalah gen oncosuppresor.
 Inaktivasi oncosuppressors menyebabkan akumulasi suksinat dan fumarat
yang menyebar di sitosol dan mendorong akumulasi faktor induksi hypoksia
1α (HIF1α) dengan menonaktifkan enzim prolyl hidroksilase (promotor dari
degradasi HIF1α); HIF1α pada gilirannya mengakibatkan kondisi pseudo-
hipoksia yang membantu perkembangan tumor..
h. Oksidasi Malat menjadi Oksaloasetat.
L-malat dioksidasi menghasilkan oksaloasetat. Reaksi ini dilakukan oleh L-
malate dehydrogenase menyebabkan NAD direduksi menjadi NADH.
Molekul yang dihasilkan dari oksaloasetat cocok untuk memulai siklus lain
melalui kondensasi dengan gugus acetyl. Selama proses ini menghasilkan 1
ATP, 2 FADH2 dan 3 NADH.

3. Rantai Respirasi dan Fosforilasi Oksidatif

Rantai pernapasan terdiri dari serangkaian komponen (kompleks) melakukan
transfer elektron melintasi membran dan terlibat dalam fosforilasi oksidatif
(OXPHOS), sebuah proses yang terjadi dalam kondisi aerobik.
a. 4 protein dan sintesis ATP melekat pada IMM. NADH / ubiquinone
oxidoreductase (kompleks I) melepaskan elektron dari NADH (diproduksi
dalam siklus asam sitrat) dan melewati ubiquinone, sebuah kofaktor
liposoluble yang terletak di dalam bilayer fosfolipid IMM.
b. Suksinat dehidrogenase (atau kompleks II) adalah tempat lain
untuk masuk elektron ke dalam rantai respirasi. Elektron yang berasal dari
oksidasi suksinat melewati FAD menuju ubiquinone.
c. Setelah ubiquinone direduksi menjadi ubiquinol, sehingga elektron dapat
masuk ke kompleks III, ubiquinone / cytochrome c oxidoreductase.
d. Elektron dipindahkan melalui beberapa kelompok heme dari liposoluble
shuttle ubiquinone menuju sitokrom c yang larut air. Sitokrom c biasanya
terikat pada permukaan eksternal IMM karena interaksi dengan cardiolipin.
Interaksi ini membantu shuttle untuk sampai ke penerima electron di
kompleks IV.
e. Cytochrome c oxidase adalah kompleks terakhir dari transpor elektron.
Elektron dari sitokrom c diakumulasi di pusat tembaga dan membawa
 oksigen menuju kelompok heme. Oksigen direduksi menjadi
air.
f. Transpor elektron melalui kompleks I, III, dan IV menginduksi pemompaan
proton dari matriks ke IMS. Khususnya, untuk setiap dua elektron yang
berasal dari 1 molekul NADH, 4 H+ digerakkan oleh kompleks I, 4 oleh
kompleks III, dan 2 oleh kompleks IV. Pernapasan kompleks kedua tidak
menghasilkan gerakan proton. rantai pernapasan di mitokondria yang aktif
menghasilkan perbedaan besar dalam [H+] di IMM, menghasilkan listrik
yang potensial (sekitar −180 hingga −200 mV) dan
variasi pH sekitar 0,75.