BIOLOGY DEPARTMENT
1
-AKTIVITAS
O HORIZON
LAPISAN TIDAK TERDEKOMPOSISI MATERIAL TANAMAN
A HORIZON
PERMUKAAN TANAH (TINGGI BAHAN ORGANIK,
WARNA HITAM, COCOK UNTUK PERTANIAN; TANAMAN DAN
MIKROBA TUMBUH DISINI; AKTIVITAS MIKROBA TINGGI
B HORIZON
SUBSOIL (MINERAL, HUMUS DLL TERLEPAS DR PERMUKAAN
TANAH TERAKUMULASI DISINI; SEDIKIT BAHAN ORGANIK;
AKTIVITAS MIKROBA LEBIH RENDAH LAYER DIBANDINGKAN
HORIZON A
C HORIZON
DASAR TANAH (PERKEMBANGAN SECARA LANGSUNG
DARI BEDROCK; AKTIVITAS MIKROBA UMUMNYA SANGAT
RENDAH
BEDROCK
1. PADA AKAR
PD TANAMAN ------- AKAR TANAMAN KONSENTRASI NUTRIEN YG
TINGGI ----- AKTIVITAS MIKROBA UTAMA
AKAR TANAMAN ---- GULA, ASAM AMINO, HORMON & VITAMIN
------ STIMULASI PERTUMBUHAN BAKTERI & FUNGI
RHIZOSPHERE --- DAERAH SEKITAR AKAR DG ZONE AKTIVITAS
MIKROBA YG TINGGI.
TANAH MENEMPEL PD PERMUKAAN AKAR : RIZOPLAN
CONTOH :
-AZOSPIRILLUM & AZOTOBACTER : PENGIKATAN N DI RHIZOSPHER
9
10
11
12
FUNGSI MYCHORRHIZA:
1. MENINGKATKAN KECEPATAN PENYERAPAN NUTRIEN DR DLM
TANAH
2. MERANGSANG PERTUMBUHAN TANAMAN : AUXIN, GIBBERLIN,
VITAMIN, ASAM ELMAK & SITOKININ
3. MELINDUNGI AKAR DR PATOGEN
1.1.1 EKTOMIKORRHIZA
-DIJUMPAI PD POHON DI HUTAN
-KARAKTERISASI : AKAR PANJANG & PENDEK. PENDEK : CABANG
DIKOTOM
FUNGSI EKTOMIKORHIZA -- MELIND. AKAR DR PATOGEN :
-PRODUKSI ANTIBIOTIKA & ASAM ORGANIK
-PENGHALANG FISIK
-STIMULASI AKAR MENGELUARKAN SENY. KE RIZOSPHIR---
HAMBAT FUNGI LAIN
13
15
BINTIL AKAR
16
17
18
19
PROSES NODUL
SEL NORMAL TERINFEKSI : NEKROSIS DDAN
DEGENERASI
SEL TETRAPLOID : NODULE
SLL PD AKAR SEJUMLAH KECIL SEL
TETRAPLOID TJD SCR SPONTAN ALAMI DAN
PEMBELAHAN SEL MENGHASILKAN SPT
TUMOR : NODUL
PD KULTUR : RHIZOBIA MENGHASILKAN
SITOKININ : MENYEBABKAN PEMBEELAHAN
SEL TETRAPLOID
20
TERBENTUK BAKTEROID
MULTIPLIKASI BAKTERI DLM SEL TETRAPLOID
MEMBTK BAKTEROID
BAKTEROID DIKKL OLEH BAGIAN DR MEMBRAN SEL
TANAMAN DISEBUT MEMBRAN PERIBAKTEROID
STL MEMBTK BAKTEROID FIXASI NITROGEN
DIMULAI
DETERIORASI NODUL MELEPASKAN BAKTERI KE
TANAH
BENTUK BAKTEROID : MAMPU MEMBELAH,
SEJUMLAH KECIL BERBENTUK BATANG YG
DORMAN
21
22
23
REAKSINYA
ENZIM INI MENGKATALISIS PENAMBAHAN
AMONIA KE GLUTAMAT MENJADI GLUTAMIN
ENZIM GLUTAMAT SINTASE MENGKATALISIS
PEMINDAHAN KLP AMIDA DARI GLUTAMIN KE KETOGLUTARAT MEMBTK 2 MOLEKUL GLUTAMAT
KEDUA REAKSI DITAMBAHAKAN, REAKSI YG
TERJADI : KONVERSI 1 MOLEKUL KETOGLUTARAT DAN 1 MOLEKUL AMONIA
MENJADI GLUTAMAT DG MENGGUNAKAN 1
ENERGI TINGGI PHOSPHAT YG TERIKAT PD ATP
25
O
HO C
O
(CH2)2 CH COO-
+ ATP + NH3
H2N
NH2
GLUTAMATE
GLUTAMATE
-KETOGLUTARAT
GLUTAMINE
-KETOGLUTARAT
NH2
+ ATP
2 GLUTAMATE
GLUTAMATE + ADP + Pi
26
TANAMAN
PEMEBENTUKAN
NODUL OLEH
PERTUMBUHAN
1.
KACANG POLONG
CEPAT
2.
BUNCIS
RHIZOBIUM
LEGUMINOSARUM
R. PHASEOLI
3.
4.
5.
CLOVER
ALFALFA
KEDELAI
R. TRIFOLII
R. MELILOTI
BRADYRHIZOBIUM
JAPONICUM
CEPAT
CEPAT
LAMBAT
CEPAT
27
30
HEWAN GNOTOBIOTIK :
-HWN DIPELIHARA
-TIDAK ADA MIKROBA
-ABNORMAL THD PENYAKIT OLEH PATOGEN UMUM
-SENSITIF THD MIKROBA NONPATOGEN
CONTOH :
ORGANISME RETIKULOENDOTELIAL:
-SISTEM KEKEBALAN PD SEL TDK BERKEMBANG
-TDK DISTIMULASI OLEH ANTIGEN MIKROBA.
PD KELINCI GNOTOBIOTIK, TIKUS, MARMUT : CECUM MEMBESAR
VITAMIN K DITAMBAHKAN PD HEWAN GNOTOBIOTIK : TDK ADA
E.COLI
31
RUMINANSIA
INTESTINE RUMINANSIA :
-BANYAK MIKROBA--- MEMECAH SELLULOSA &
HEMISELLULOSA --- MATERI TANAMAN MJD ASAM
--DIABSORPSI
32
33
34
HEWAN DG BERAT 70 KG :
-120 GR FESES PERHARI
-+ 1011 BAKTERI/GR FESES
FERMENTASI PD USUS BESAR : ASAM ASETAT, PROPIONAT, ASAM
BUTYRAT, H2, CO2 & METANA
ASAM DIABSORPSI OLEH DARAH. ASAM YG TERTINGGAL DLM
FESES : MENGHAMBAT BAKTERI MENGUNTUNGKAN : INFEKSI USUS
-H2 & CH4 : DIABSORPSI OLEH DARAH---- PARU-PARU--DIKELUARKAN
-GAS : ANGIN
BAKTERI PD USUS BESAR :
-BACTEROIDES (45%)
-EUBACTERIUM (25%)
-PEPTOCOCCUS (15%)
-FUSOBACTERIUM (10%)
-ENTEROBACTERIACEAE (<0,5%)
-STREPTOCOCCUS : < 0,5% DR BAKTERI LAIN
35
ASETAT, FORMAT,
LAKTAT, H2, CO2
METHANOGENS:
METHANOBREVIBACTER RUMINANTIUM
METHANOMICROBIUM MOBILE
37
POLIMER KOMPLEKS
(SELLULOSA, POLISACCHARIDA LAIN, PROTEIN)
SELLULOLITIK & BAKTERI
HIDROLITIK LAIN
HIDROLISIS
MONOMER
GULA, ASAM AMINO
BAKTERI FERMENTATIF
ACETAT
H2 + CO2
ACETOGEN
FERMENTASI
ACETOGENESIS
ACETAT
PROPIONAT
BUTYRAT
PRODUKSI H2,
FERMENTA
ASAM LEMAK,
SI
OKSIDASI
BAKTERI
METHANOGEN
(SYNTROPS)
H2 + CO2
METHANOGEN
METHANOGENESIS
METHANOGEN
CH4
ACETAT
38
KARBOHIDRAT
ASAM SUKSINAT
ASAMPROPIONAT +
CO2
ASETILMETIL KARBINOL
GLUKOSA
ASAM LAKTAT
ASAM PIRUVAT
ASETALDEHIDE
2,3-BUTILEN GLIKOL
ASAM OKSALOASETAT +
ASETIL Ko-A + CO2
H2 + CO2
ETIL ALKOHOL
ASETIL Ko-A
ASAM ASETAT
ASAM ASETOASETAT
TCA CYCLE
ASETON
ASAM BUTIRAT
BUTIL ALKOHOL
ISOPROPIL ALKOHOL
ASAM HIDROKSIBUTIRAT
39
PENINGKATAN PROD.
PROPIONAT
GLUKOSA (HATI)
MENINGKATKAN PROT
,
MENURUNKAN LEMAK
SUSU
41
BIOTEKHNOLOGI
BIOLOGY DEPARTMENT
43
SINGKAT
AN
ATCC
NAMA
LOKASI
ROCKVILLE, MD USA
CCM
CZECHOSLOVAKIA COLLECTION OF
MIKROORGANISME
CDDA
CANADIAN DEPARTMENT OF
AGRICULTURE
COLLECTION OF INSTITUTE
PASTEUR
DEUTSCHE SAMMLUNG VON
MIKROORGANISMEN
J.E. PURKYNE
UNIVERSITY, BRNO,
CZECHOSLOVAKIA
OTTAWA,CANADA
CBS
CIP
DSM
FAT
BAARN, NETHERLANDS
PARIS, FRANCE
GTTINGEN, FEDERAL
REPUBLIC OF
GERMANY
TOKYO, JAPAN
46
SINGKAT
AN
IAM
NCIB
NCTC
NRRL
CMI
NAMA
LOKASI
INSTITUTE OF APPLIED
MICROBIOLOGY
NATIONAL COLLECTION OF
INDUSTRIAL BACTERIA
UNIVERSITY OF
TOKYO, JAPAN
ABERDEEN, SCOTLAND
LONDON,UK
PEORIA, IL USA
KEW, UK
47
JAMUR
MIKROALGE
RAGI
50
UTK INOKULASI :
-RHIZOBIUM ------PENINGKATAN PRODUKSI
------ PENYUBURAN TANAH
-------PENGONTROLAN PENCEMARAN
51
1. PENINGKATAN PRODUKSI
-PD
KACANG KEDELE PRODUKSI/Ha
NAMA
INOKULAN
KETERANGAN
1.
2.
NITRAGIN/AS
LEGIN/FAK.
PERTANIAN UGM
1,4 TON
JENIS-STANDAR
1,0 TON
DLM PENGEMBANGAN
3.
LM005/ITB/LAB.MIKROB
1,1 TON
CONTOH UTK
DIKEMBANGKAN
4.
TANAH DR KEBUN
KEDELE
0,7 TON
52
2. PENYUBURAN TANAH
-SBG PUPUK HIJAU : MENGIKAT N UDARA +
MEMPERTAHANKAN/MENINGKATKAN SIFAT FISIK TANAH
3. PENGONTROLAN PENCEMARAN : MENDEGRADASI INSEKTISIDA
DLM TANAH
53
BIAKAN MURNI
PENGAKTIFAN PD MEDIA DEDAK UTK
PERBENIHAN SPORA
INKUBASI (20-450C, 1-7 HARI)
CARA EKSTRAKSI DG AIR/BUFFER
FILTRASI
RESIDU
EKSTRAK MENGANDUNG
ENZIM
PENGERINGAN
PENGGILINGAN
PENGAYAKAN
54
55
56
D. PENICILIN ASILASE.
-DIGUNAKAN DLM INDUSTRI PEMBUATAN PENISILIN SEMI-SINTETIK
-DIHASILKAN OLEH FUNGI : PENICILLIUM CRHRYSOGENUM
-PROPICILLIN, METHICILLIN, OXACILLIN, AMPICILLIN,
CARBENICILLIN
III. METABOLIT MIKROBA :
ETHANOL, ASAM ASETAT, ASAM LAKTAT, GROWTH FACTOR (ASAM
AMINO, VITAMIN), AGEN PHARMAKOLOGI/METABOLIT SEKUNDER
(FASE STASIONER)--- (ANTIBIOTIKA, STEROID).
57
SUBSTRAT
PERTUMBUHAN
SEL
METABOLIT
PRIMER
SUBSTRAT
PERTUMBUHAN
SEL
METABOLIT
PRIMER
METABOLIT SEKUNDER
METABOLIT
SEKUNDER
58
1. ETHANOL
C6H12O6 ---- 2C2H5OH + 2 CO2 + ENERGI
MIKROBA :
- FUNGI
BAHAN DR PATI : SACCHAROMYCES CEREVISIAE &
SACCHAROMYCES ELLIPSOIDEUS
BAHAN LAKTOSA DR WHEY : CANDIDA PSEUDOTROPICALIS
-BAKTERI : ACETOBACTER SUBOXIDANT, PSEUDOMONAS
LINDUERI
2. ASAM ASETAT
METODE :
1. PROSES LAMBAT : METODE PRANCIS & ORLEANS
2. PROSES CEPAT : GENERATOR
3. CARA ASETATOR (ASETIFIKASI KULTUR TERENDAM) : A. 59
ACETY
3. ASAM LAKTAT
BAHAN BAKU : LAKTOSA DARI WHEY
MIKROBA : LACTOBACILLUS SP
REAKSI :
LACTOBACILLUS DELBRUCKII
C6H12O6 --------------------------------------------------- 2CH3CHOHCOOH
60
61
GLUTAMAT (MSG)
MAKANAN
2.
ASPARTAT
&ALANINE
GLYCINE
CYSTEIN
JUS BUAH
3.
4.
PEMANIS MAKANAN
ROTI
JUS BUAH
5.
TRYPTOPHAN +
HISTIDIN
6.
ASPARTAM
MENINGKATKATKAN
RASA
RASA
MENINGKATKAN RASA
MENINGKATKAN
KUALITAS
ANTIOXIDAN
MAKANAN, SUSU
KERING
ANTIOXIDAN,
MENCEGAH
KETENGIKAN
MINUMAN RINGAN
PEMANIS RENDAH
KALORI
7.
LYSINE
ROTI (JEPANG)
TAMBAHAN MAKANAN
8.
METHIONIN
PRODUK KEDELE
TAMBAHAN MAKANAN
62
63
2.1. VITAMIN B 12
-DIBUAT OLEH MIKROORGANISME
-KEPERLUAN VIT PD HEWAN : DR MAKANAN/ ABSORPSI PRODUKSI
VIT. DLM USUS OLEH MIKROBA USUS
-MANUSIA---- VITAMIN : MAKANAN/SUPLEMENT
- DISINTESIS DLM USUS BESAR TDK MENCUKUPI UTK
DIEDARKAN DLM DARAH.
-MIKROBA PENGHASIL VITAMIN :
1. PROPIONIBACTERIUM : 19-23 MG/LT -- 2 X PROSES
2. PS. DENITRIFICANS : 60 MG/LT --- 1 X PROSES-- GULA BIT
MOLASE SBG SUMBER KARBON.
VITAMIN B12 -- MENGANDUNG CO (ESENSIAL DR STRUKTURNYA).
2.2 RIBOFLAVIN
-DISENTESIS OLEH :
1. FUNGI : ASHBYA GOSSYPII : JML SANGAT BESAR (> 7 GR/LT)
64
AGENT PHARMAKOLOGI
1. ANTIBIOTIKA
- SUBSTANSI KIMIA YG DIHASILKAN OLEH MIKROBA YAITU
DG MEMBUNUH/MENGHAMBAT PERTUMBUHAN MIKRORGANISME
LAIN.
-MERUPAKAN METABOLISME SEKUNDER
-
65
ANTIBIOTIKA
BACITRACIN
MIKROBA
BACILLUS SUBTILIS
TIPE MIKROBA
BAKTERI
PEMBTK SPORA
CEPHALOSPORIN
CEPHALOSPORIUM SP
CHLORAMPHENICO SINTESIS SCR KIMIA (DR
L
STREPTOMYCES VENEZUELAE)
FUNGI
CYCLOHEXYMIDA
STREPTOMYCES GRISEUS
ACTINOMYCETES
CYCLOSERIN
S. ORCHIDACEUS
ACTOMYCETES
ERYTHROMYCIN
S. ERYTHREUS
ACTINOMYCETES
GRISEOFULFIN
PENICILLIUM GRISEOFULVIN
FUNGI
KANAMYCIN
S. KANAMYCETICUS
ACTINOMYCETES
LINCOMYCIN
S. LINCOLNENSIS
IDEM
NEOMYCIN
S. FRADIAE
IDEM
66
ANTIBIOTIKA
MIKROBA
TIPE MIKROBA
NYSTATIN
S. NOURSEI
ACTINOMYCETES
PENICILLIN
PENICILLIUM CHRYSOGENUM
FUNGI
POLYMIXIN B
BACILLUS POLYMYXA
STREPTOMISIN
S. GRISEUS
BACTERI PEMBTK
SPORA
ACTINOMYCETES
TETRACYCLIN
S. RIMOSUS
IDEM
2. HORMON STEROID
MIKROBA PROSESNYA : RHIZOPUS NIGRICANS
67
FERMENTASI
-KOMPONEN ORGANIK + ASEPTOR ELEKTRON DG RX. OXIDASIREDUKSI--- MELEPASKAN ENERGI------- FERMENTASI
ALKOHOL
GLIKOLISIS ---- ASAM PIRUVAT -----ASETALDEHID
ELEKTRON
+ CO2
NADH
NAD+
ETHANOL
ASAM LAKTAT
NADH
NAD+
ASAM LAKTAT
69
KLASIFIKASI FERMENTASI
-MEMFERMENTASI SUBSTRAT ---- FERMENTASI BTK PRODUK
TIPE
REAKSI
ORGANISME
FERMENTASI
ALKOHOL
FERMENTASI
HOMOLAKTAT
FERMENTASI
HETEROLAKTAT
HEXOSE--ETHANOL +CO2
YEAST
ZYMOMONAS
STREPTOCOCCUS
BBRP
LAKTOBACILLUS
LEUCONOSTOC
BBRP
LAKTOBACILLUS
ASAM PROPIONAT
LAKTAT---PROPIONAT
ASETAT, CO2
PROPIONIBACTERIU
M, CLOSTRIDIUM
PROPIONICUM
70
TIPE
REAKSI
ASAM CAMPURAN
BAKTERI ENTERIK :
HEXOSA--ETHANOL
ESCHERICHIA,
2,3-BUTANOL, SUKSINAT,
LAKTAT,ASETAT, FORMAT, H2 + CO2 SALMONELLA,
SHIGELLA,
KLEBSIELA
ASAM BUTIRAT
HEXOSE --BUTYRAT
ACETAT, H2 + CO2
BUTANOL
ORGANISME
CLOSTRIDIUM
BUTYRICUM
CLOSTRIDIUM
BUTYRICUM
CL. KLUYVERI
KAPROAT
ETHANOL + ASETAT + CO2---
HOMOASETAT
KAPROAT + BUTYRAT + H2
CL. ACETICUM
ACETOBACTERIUM
METHANOGENIK
H2 + CO2 -- ASETAT
METHANOTRHRIX
METHANOSARCINA
71
TIPE
REAKSI
ORGANISME
SUKSINAT
PROPIONIGENIUM
OXALAT
OXALAT + H+ --- FORMAT + CO2
OXALOBACTER
+41,9 KJ/RX
72
METHANOGENESIS
4H + CO2 --- CH4 + 2H2O
-142,5 KJ/RX
REAKSI BERANGKAI
CH2CH2OH + CO2 ---- CH4 + 2CH3COO- + 2H
-100KJ/RX
UKURAN
FERMENTOR
(LITER)
PRODUKSI
1-20.000
40-80.000
100-150.000
-450.000
74
75
POLIMER KOMPLEKS
(SELLULOSA, POLISACCHARIDA LAIN, PROTEIN)
SELLULOLITIK & BAKTERI
HIDROLITIK LAIN
HIDROLISIS
MONOMER
GULA, ASAM AMINO
BAKTERI FERMENTATIF
ACETAT
H2 + CO2
ACETOGEN
FERMENTASI
ACETOGENESIS
ACETAT
PROPIONAT
BUTYRAT
PRODUKSI H2,
FERMENTA
ASAM LEMAK,
SI
OKSIDASI
BAKTERI
METHANOGEN
(SYNTROPS)
H2 + CO2
METHANOGEN
METHANOGENESIS
METHANOGEN
CH4
ACETAT
76
77
METHANOGENESIS DR ASETAT
ASETAT + H2O ----CH4 + HCO3- + H+
ACETOGENESIS DR H2 + CO2
4H2 + 2HCO3- + H+ --- CH3COO- + 2H2O
MIKROBA YANG MENGHASILKAN H2 : SYNTROPHOMONAS &
SYNTROPOBACTER-- TERGANTUNG PD HUBUNGAN SINTROTROPIK
DG BAKTERI LAIN.
SYNTROPHOMONAS : OKSIDASI C-4 MJD ASAM LEMAK C-7
MENGHASILKAN ASETAT, CO2 & H2
SYNTROPOBACTER DLM OXIDASI PROPIONAT MJD ASETAT, CO 2, H2
78
FERMENTASI MAKANAN
ADALAH :
MAKANAN DAPAT DIBUAT ASAM DG PENAMBAHAN CUKA ATAU
KEASAMAN KRN PERKEMBANGAN AKTIVITAS MIKROBA
MIKROBA YG BERPERAN DLM MAKANAN :
-BAKTERI ASAM
-BAKTERI ASAM LAKTAT
-BAKTERI ASAM ASETAT
-BAKTERI ASAM PROPIONAT.
PENAMBAHAN ASAM CUKA PD MAKANAN : PH RENDAH
CUKA : HASIL AKTIVITAS BAKTERI ASAM ASETAT
79
BIOTEKHNOLOGI
DETERIORASI, TOXIN UTK
VAKSIN
BIOLOGY DEPARTMENT
80
DETERIORASI
ORGANISME ORGANOTROPH/HETEROTROPH
-GLUKOSA & GULA HEXOSA SBG SUMBER ENERGI
-BIOMASSA --- MATERIAL ORGANIK PD TUMBUHAN & HEWAN
TK TINGGI
-KERUSAKAN BIOMASSA & MENGEMBALIKAN KE DLM BTK
KOMPONEN ORGANIK SEDERHANA---- OLEH MIKRORGANISME
MLL AKTIVITAS DSBT PROSES DEKOMPOSISI.
81
ATMOSPHRE
DARATAN
LAUTAN & LINGKUNGAN PERAIRAN
SEDIMEN & BEBATUAN
83
CO2 ATMOSFER
AKTIVITAS
MANUSIA
TUMBUHAN
BAHAN BAKAR
FOSSIL
HEWAN &
MIKROORGANISME
HUMUS
TUMBUHAN &
ALGAE PERAIRAN
CO2 TERLARUT
HEWAN PERAIRAN
RESPIRASI :
TUMBUHAN
HEWAN
MIKROORGANISME
OKSIDASI METANA
BAKTERI
AEROBIK
CH4
METANOGENIK
BAKTERI
(KOMPONEN
METHYL)
(CO2)
SEDIMENTASI
(CH2O)
KOMPONEN ORGANIK
ANAEROBIK
RESPIRASI ANAEROB
FERMENTASI
MIKROOGANISME ANAEROB
85
REAKSI TERANG
CO2 + H2O
(CH2) + O2
CO2 + H2O
86
REAKSI TERANG
KIMIA
INORGANIK
KIMIA
ORGANIK
INORGANIK (CO2,
HCO3-, CO32-)
EUKARIOTIK
PHOTOTROPIK;
CYANOBACTERIA
(PHOTOAUTOTROPH,
ELEKTRON DONOR : H2O)
LITHOTROPHS,
HIDROGEN,
SULFUR, BESI
DAN BAKTERI
PENGOKSIDASI
NITRIT
LITHOTROP
MENGGUNAKAN
SUMBER C
ORGANIK
(MIXOTROP)
ORGANOTROPH
87
SIKLUS NITROGEN
PERURAIAN OXIDASI MERUPAKAN KUNCI DARI PERSENYAWAAN
NITROGEN
PERSENYAWAAN
PERURAIAN OKSIDASI (JML e-)
N ORGANIK (R
NH2)
AMMONIA (NH3)
GAS NITROGEN (N2)
NITROUS OXIDA (N2O)
NITROGEN OXIDA (NO)
NITRIT (NO2)NITROGEN DIOKSIDA (NO2)
NITRAT (NO3-)
-3
-3
0
+1 (RATA-RATA PER N)
+2
+3
+4
+5
88
NITRIFIKASI
NO2NITROSOMONAS
NITROBACTER
N2
ASSIMILASI
CYANOBACTERIA
RHIZOBIUM
AZOTOBACTER
BEIJERINCKIA
KLP PROTEIN
ASSIMILASI
NO3-
DEAMINASI
AEROBIK
NH3
ASSIMILASI
DEAMINASI
ANEROBIK
FIXASI NITROGEN
KLP PROTEIN
NO2NO
N2O
N2
CLOSTRIDIUM
PASTEURIANUM,
BAKTERI
PHOTOTROPHIK
PSEUDOMONAS, &
BAKTERI FAKULTATIF
ANAEROB YG LAIN
DENITRIFIKASI
89
SIKLUS SULFUR
TRANSFORMASI SULFUR LEBIH KOMPLEKS DRPD NITROGEN.
-KOMPONEN SULFUR TEREDUKSI DPT DIGUNAKAN SBG DONOR ELEKTRON OLEH BAKTERI SULFUR TANPA MENGHASILKAN WARNA
(DIBEDAKAN DR BAKTERIOKLOROFIL & BAKTERI SULFUR UNGU).
-PERSENYAWAAN SULFUR --- SBG ENERGI DR H2S, ELEMEN SULFUR
(S0) & THIOSULFAT (S2O32-).
-PRODUK AKHIR OXIDASI SULFUR --- SULFAT (SO42-)
BEGGIATOA
THIOTHRIX
THIOBACILLUS
SULFOLOBUS
BEGGIATOA
THIOTHRIX
THIOBACILLUS
(ATAU SPONTANEUS)
S0
ASSIMILASI SULFAT
KLP PROTEIN
ANAEROBIK
DESULFURILASI
REDUKSI
AROBIK
DISIMILASI REDUKSI SULFAT
SO 4-
H 2S
DESULFURILASI
ASSIMILASI SULFAT
REDUKSI
KLP PROTEIN
DISIMILASI S0
BAKTERI PHOTOTROPIK
BAKTERI PHOTOTROPIK
S0
91
92
EKSOTOKSIN
ENDOTOKSIN
1.
2.
3.
4.
5.
KOMPLEKS LIPOPOLISACCHARIDA.
RELATIF STABIL, TAHAN PEMANASAN
DI ATAS SUHU 600C TANPA
KEHILANGAN TOKSISITASNYA
IMUNOGENIK LEMAH; ANTIBODI
BERSIFAT ANTITOKSIK & PROTEKTIF.
HUBUNGAN ANTARA TITER ANTIBODI
DAN PERLINDUNGAN THD PENYAKIT
93
EKSOTOKSIN
ENDOTOKSIN
KURANG JELAS DIBANDINGKAN
EKSOTOKSIN
EKSOTOKSIN
7. SERING DIKENDALIKAN OLEH GEN
EKSTRAKROMOSOM
ENDOTOKSIN
SINTESIS DIARAHKAN OLEH GEN
KROMOSOM
95
1. CL. TETANI
-PENYEBAB : TETANUS
-HABITAT : TANAH, FESES KUDA & HWN LAIN
-MEMPUNYAI ANTIGEN SOMATIK (O)
TOKSIN
-MENGHASILKAN NEUROTOKSIN (TETANOSPASMIN), DILEPASKAN
BILA BAKTERI MENGALAMI LISIS (INTRASELLULER)
-TOKSIN : DIKENDALIKAN OLEH GEN (PLASMID)
-TETANOSPASMIN BEKERJA THD SSP DG CARA:
-MENGHAMBAT PELEPASAN ASETILKOLIN (MENGGANGGU TRANSMISI NEUROMUSKULER
-PENGHAMBATAN NEURON SPINAL POSTSINAPS (MENGHAMBAT
PELEPASAN MEDIATOR PENGHAMBAT) : KEJANG OTOT, HIPEREFLESIA, KEJANG UMUM
96
PATOGENESIS
-BUKAN INVASIF
-LUAS JAR TERINFEKSI KECIL
-GERMINASI SPORA & PERTUMBUHAN ORGANISME VEGETATIF
PENGHASIL TOKSIN DIBANTU OLEH :
1. JAR. NEKROTIK
2. GARAM-GARAM KALSIUM
3. INFEKSI PIOGENIK
-TOKSIN DILEPASKAN DR SEL-SEL VEGETATIF DPT MENCAPAI SSP
MLL TRANSPOR AKSON MLL ALIRAN DARAH
-TOKSIN TERIKAT PD GANGLION DI MEDULA SPINALIS
97
98
2. CORYNEBACTERIUM DIPTHERIAE
MORFOLOGI
1. BTK SPT GADA (TDPT GRANULA ): DG PEWARNAAN ANILIN
2. BIAKAN : AGAR DARAH : KOLONI KECIL, BERGRANULA, KELABU,
BATAS KOLONI TDK TERATUS, HEMOLISIS KECIL
ADA 3 BIOVAR :
2.1. GRAVIS : BTK PEMUKUL DAN BTK HALTER, GRANULA
METAKROMATIK SEDIKIT, PD AREA SEL TERWARNAI
DLM PERBEDAAN CORAK BIRU. PENYAKIT : BERAT
- KARAKTERISTIK KOLONI PD McLEODS CHOCOLATE
TELLURITE AGAR : DAISY HEAD
- DLM KALDU : MEMBTK SELAPUT PD PERMUKAAN
99
100
101
102
STRUKTUR ANTIGEN
-PERBEDAAN TIPE : PERBEDAAN PD PERMUKAAN SEL KUMAN
-ANTIGEN K PD PERMUKAAN DINDING SEL KUMAN (IMUNITAS ANTI
BAKTERI)
-PENENTU UTAMA KEMAMPUAN INVASI & VIRULENSI : ANTIGEN K +
GLIKOLIPID
-UMUM : ANTIGEN O
103
104
105
PENGOBATAN
-PEMBERIAN ANTITOKSIN SPESIFIK SCR DINI--- MELAWAN TOKSIN
YG DIBENTUK.
-ANTITOKSIN DIBUAT OLEH BERBAGAI SEL HEWAN : KUDA, SAPI,
KAMBING, KELINCI
-PENGOBATAN -- BILA DUGAAN KUAT DIFTERI
DOSIS : 20.000-100.000 INTRAMUSKULER/INTRAVENA STL TES
PENGAMANAN (KULIT & KONJUNGTIVA).
-OBAT ANTIBIOTIKA (PENISILIN, ERITROMISIN) : MENGHAMBAT
PERTUMBUHAN BASIL DIFTERI.
PENCEGAHAN
-ISOLASI PENDERITA
-IMUNISASI AKTIF :
1. CAIRAN TOKSOID : FILTRAT BIAKAN KALDU STRAIN TOKSIGENIK
+ FORMALIN 0,3% & DIINKUBASI PD 370C.
106
107
CL. BOTULINUM
-HABITAT : ALAM, FESES HEWAN
-PENYEBAB : BOTULISME
-DIBEDAKAN MLL TIPE ANTIGENIK TOKSIN
-SPORA : RESISTEN THD PANAS
TOKSIN
-EKSOTOKSIN DG 7 VARIASI ANTIGENIK (A-G)
-PENYEBAB PENYAKIT PD MANUSIA : A,B,E (F).
-TOKSIN A & B : TOKSIN DR BERBAGAI MAKANAN
-TOKSIN TIPE E : HASIL IKAN
-TIPE C : LEMAS PD UNGGAS
-TIPE D : BOTULISME PD MAMALIA
-LABIL TOKSIN
-LETAL : 1-2 g.
-PEMBENTUKAN TOKSIN : KENDALI GEN VIRUS (BAKTERIOFAGE)
108
PATOGENESIS
-KRN EKSOTOKSIN PD MAKANAN KALENG
-MEKANISME KERJA TOKSIN : MENGHAMBAT PELEPASAN
ASETILKOLIN PD SINAPS & HUBUNGAN SARAF-OTOT :
PARALISA
GAMBARAN KLINIK
STL MAKAN---- GANGGUAN PENGLIHATAN----- TDK MAMPU
MENELAN --- KESULITAN BICARA --- TANDA- TANDA PARALISIS
-----KEMATIAN KRN PARALISA PERNAPASAN/HENTI JANTUNG
PD PENDERITA YG SEMBUH : TDK MEMBTK ANTITOKSIN
-KEMATIAN BAYI KRN BOTULINUM : TDK MAU MAKAN, LEMAH,
PARALISA. PD FESES : DIDETEKSI TOKSIN. PD SERUM : TIDAK
109
VAKSIN
111
RUTE
TEMPAT MASUK
RUBEOLA
IM
TRACT. RESP.
RUBELA
IM
INFLUENZA
IM
POLIO SALK
IM
POLIO SABIN
ORAL
G.E TRACT
RUTE
TEMPAT MASUK
CACAR
ID
TRACT. RESP.
RABIES
IM
KULIT
YELLOW FEVER
IM
JENIS VAKSIN
BAKTERI
DIFTERI
PERTUSIS
TETANUS
PNEUMOKOKUS
MENINGOKOKUS
H. INFLUENZAE
PREPARAT
PEMBERIAN
DIINAKTIFKAN
BAYI, ANAK-ANAK
POLISAKARIDA
VIRUS :
CACAR
POLIOMIELITIS
RUBEOLA
HIDUP
HIDUP
HIDUP
HEPATITIS B
RABIES
INAKTIF
INAKTIF
PD LINGKUNGAN TTT
PD LINGK KHUSUS
134
BIOTEKHNOLOGI
BIOLOGY DEPARTMENT
136
Dampak negatif
terhadap lingkungan
137
138
PESTISIDA BIOLOGIS
139
1. JAMUR
-SELAMA 30 TH, 5 FUNGI DEUTEROMYCETES UTK FORMULASI
MIKOPESTISIDA SBG KONTROL UTK HAMA.
FORMULASI JAMUR SBG INSEKTISIDA MIKROBA KOMERSIAL
SPESIES
NAMA PRODUK
DIPRODUKSI OLEH
Aschersonia aleyrodis
Beauvera bassiana
Aseronija
Biotrol FBB
Boverin
Hirsutella thompsonii
Metarhizium anisopliae
Verticillium lecanii
ABG-6178
Mycar
Biotrol FMA
Metaquino
Vertalec
Mycotol
140
JAMUR
-SELAMA 30 TH, 5 FUNGI DEUTEROMYCETES UTK FORMULASI
MIKOPESTISIDA SBG KONTROL UTK HAMA.
FORMULASI JAMUR SBG INSEKTISIDA MIKROBA KOMERSIAL
KONIDIA ZIGZAG
BEAUVERIA BASSIANA
Lecanicillium lecanii
METARHIZIUM ANISOPLIAE
Entomophthora spp
141
142
143
144
145
146
147
SPESIES
TOXIN YG DIHASILKAN
M. ANISOPLIAE (GREEN
MUSCARDINE)
CYTOKALASIN, CYCLOPEPTIDA,
DESTRUXINS A,B,C,D,E,
DESMETHYLDESTRUXIN B
VERTICILLIUM LECANII
(MISELIUM)
CYCLODEPSIPEPTIDA,BASSIANOLIDA
, ASAM DIPICOLINIC
BEAUVERIA BASSIANA
(WHITE MUSCARDINE)
BASSIANOLIDA,
BEAUVERICIN,CYCLODEPSIPEPTIDA
FORMULASI :
-109 CONIDIA/ML DLM AIR ATAU EMULSI MINYAK AIR 15%.
MINYAK -- MENINGKATKAN LAJU PENETRASI (MELEKATKAN,
MELARUTKAN, MERUSAK SUSUNAN PROTEIN KUTIKULA)
149
TRANSLOKASI
BAGIAN SASARAN
PENGIKATAN &
PENYIMPANAN
METABOLISME
PEMBUANGAN
150
PENETRASI/ABSORPSI
INTEGUMEN SRG :
1. EPIKUTIKULA : LAPISAN SEMEN, LAPISAN LILIN, KUTIKULIN
& EPIKUTIKULA DALAM
2. EKSOKUTIKULA
3. ENDOKUTIKULA
PROKUTIKULA
4. SELAPIS HIPODERMIS
5. MEMBRAN DASAR
PENETRASI ----- PROSES DIFUSI --- BBRP FAKTOR :
1. POLARITAS SENYAWA PESTISIDA
2. JENIS PELARUT
3. AFINITAS PESTISIDA
151
1. POLARITAS SENYAWA :
-MENENTUAKAN KELARUTAN SENYAWA
152
DIFUSI INSEKTISIDA :
1. SECARA VERTIKAL--- DR EPIKUTIKULA KE HEMOLIMPH
2. SECARA HORIZONTAL --- MLL TRAKHEA
153
TRANSLOKASI
INSEKTISIDA ---HEMOLIMPH---MENYEBAR KE SLRH TUBUH MLL
HEMOLIMPH
PENGIKATAN & PENYIMPANAN
-JENIS INSEKTISIDA --- AFINITAS YG KUAT THD JAR. TTT/THD
PROTEIN DLM HEMOLIMPH
METABOLISME & PEMBUANGAN
-PERTAHANAN TUBUH SRG BEKERJA
-METABOLISME --- MENGUBAH INSEKTISIDA POLAR---POLAR---
DIKELUARKAN DR TUBUH
-METABOLISME--- DETOKSIFIKASI INSEKTISIDA
154
155
156
157
2. BAKTERI
KEBANYAKAN BAKTERI SBG INSEKTA PATOGEN---FAMILI :
1.
2.
3.
4.
5.
BACILLACEAE
PSEUDOMONADACEAE
ENTEROBACTERIACEAE
STREPTOCOCCACEAE
MICROCOCCACEAE
158
GENUS BACILLUS
Bacillus
Bacillus dikenal
dikenal sebagai
sebagai bakteri
bakteri berspora
berspora dan
dan
agens
agens biocontrol
biocontrol penghasil
penghasil antibiotic.
antibiotic.
Juga
Juga menghasilkan
menghasilkan metabolit
metabolit sekunder
sekunderdan
dan atau
atau
enzym
enzym sekresi
sekresi
159
PENGHASIL ANTIBIOTIKA
Antibiotic
Source
Target pathogen
Disease
2, 4-diacetylphloroglucinol
Pseudomonas
fluorescens F113
Pythium spp.
Damping off
Agrocin 84
Agrobacterium
radiobacter
Agrobacterium
tumefaciens
Crown gall
Bacillomycin D
Bacillus subtilis
AU195
Aspergillus flavus
Aflatoxin
contamination
Bacillomycin,
fengycin
Bacillus
amyloliquefaciens
FZB42
Fusarium
oxysporum
Wilt
Xanthobaccin A
Lysobacter sp.
strain SB-K88
Aphanomyces
cochlioides
Damping off
Gliotoxin
Trichoderma
virens
Rhizoctonia solani
Root rots
Herbicolin
Pantoea
agglomerans C9-1
Erwinia amylovora
Fire blight
Iturin A
B. subtilis QST713
Botrytis cinerea
and R. solani
Damping off
Mycosubtilin
B. subtilis
BBG100
Pythium
aphanidermatum
Damping off
Phenazines
P. fluorescens
2-79 and 30-84
Gaeumannomyces
graminis var. tritici
Take-all
Pyoluteorin,
pyrrolnitrin
P. fluorescens Pf-5
Pythium ultimum
and R. solani
Damping off
Pyrrolnitrin,
pseudane
Burkholderia
cepacia
R. solani and
Pyricularia oryzae
Damping off
and rice blast
Zwittermicin A
Bacillus cereus
Phytophthora
Damping off
160
PRODUKSI ENZIM
enzim lysis yang dapat menghidrolisa beberapa jenis komponen
polymeric termasuk chitin, protein,`selulosa, hemiselulosa dan
DNA.
senyawa lain yang mampu menekan pertumbuhan patogen
seperti :
Hydrogen cyanide (HCN)
siderophores.
KOMPETISI
Pada lingkungannya (tanah), nutrisi yang tersedia terbatas sehingga
untuk dapat hidup mikroorganisme harus mampu berkompetisi
dengan mikroorganisme lainnya.
mengkolonisasi akar,
memanfaatkan mikroelemen di dalam tanah.
162
163
164
165
Spherical
Rhomboidal
Rhomboidal
Kuboid
Finitimus-like
Kuboid
Rhomboidal
166
SEROVAR
THURINGIENSIS
FINITIMUS
ALESTI
KURSTAKI
SUMIYOSHIENSIS
FUKUOKAENSIS
SOTTO
KENYAE
GALLERIAE
CANADENSIS
ENTOMOCIDUS
AIZAWAI
MORRISONI
TENEBRIONIS
OSTRINAE
NIGERIENSIS
H-ANTIGEN
9
10
11A,11B
11A,11C
12
13
14
15
16
17
18
19
20A,20B
20A,20C
21
22
SEROVAR
TOLWORTHI
DARMSTADTIENSIS
TUOMANOFFII
KYUSHUENSIS
THOMPSONI
PAKISTANI
ISRAELENSIS
INDIANA
DAKOTA
TOHUKUNENSIS
KUMAMOTOENSIS
TOCHIGIENSIS
YUNANENSIS
PONCICHERIENSIS
COLMERI
SHANDONGIENSIS
167
SEROVAR
JAPONENSIS
NEOLEONENSIS
COREANENSIS
SILO
MEXICANENSIS
MONTEREY
AMAGIENSIS
MEDELIIN
H-ANTIGEN
31
32
33
34
SEROVAR
TOGUCHINI
CAMEROUN
LEESIS
KONKUKIAN
168
3. DIPEL
6. Javalin , Thuricide
FORMULASI
powder product.
The non-spore-forming organisms lebih susah
memformulaisnya, karena tidak mempunyai spora yang
bersifat dorman. Untuk bakteri spt ini hanya bisa diformulasi
dalam bentuk cair.
170
Bacillus subtilis
GB03
Target
Pathogen/
Disease
Rhizoctonia
solani, Fusarium
spp., Alternaria
spp., and
Aspergillus spp.
that attack
roots
cotton, legumes
Crop
Formulatio
n
Application
dry powder;
usually applied
with chemical
fungicides
added to a
slurry mix for
seed treatment;
hopper box
treatment
HiStick N/T
Biocontrol
Organis
m
Bacillus subtilis
MBI600.
Target
Pathoge
n/
Disease
Fusarium,
Rhizoctonia,
Aspergillus
Crop
soybean, alfalfa,
dry/snap beans,
peanuts
Application
method