249

Agrivita VOLUME 36 No. 3 Oktober - 2014 ISSN: 0126-0537

KLASIFIKASI PENDUDUK STRUKTUR

UNTUK allelopati PROPERTIES DI ITCHGRASS ( Rottboellia cochinchinensis)

Apirat Bundit 1), Anyamanee Auvuchanon 2) dan Tosapon Pornprom 1 *)

1) Departemen Agronomi, Fakultas Pertanian di Kamphaeng Saen, Kasetsart University, Kamphaeng

Saen Campus, Nakhon Pathom 73.140, Thailand

2) Departemen Hortikultura, Fakultas Pertanian di Kamphaeng Saen, Kasetsart University,

Kamphaeng Saen Campus, Nakhon Pathom 73.140, Thailand

*)
Sesuai penulis E-mail: agrtpp@ku.ac.th

Diterima: September 23, 2014 / Diterima: 27 Oktober 2014

ABSTRAK PENGANTAR

Keanekaragaman hayati itchgrass dari daerah yang berbeda
dipelajari oleh morfologi ciri-ciri dan AFLP
analisis untuk mengklasifikasikan dari kemampuan alelopati. Korelasi
kesamaan / jarak antara
AFLP penanda (koefisien Jaccard) dan sifat-sifat morfologi
(Euclidean jarak) adalah signifikan dengan r = - 0,84 **. Itchgrass
dibagi menjadi dua kelompok dari kedua UPGMA dan STRUKTUR
menganalisa: kelompok A terdiri dari itchgrass dari
Chaehom-Lampang, Si Thep-Phetchabun, Phrom
Phiram-Phitsanulok, Amphur Muang-Nakhon Sawan,
Kamalasai-Kalasin, Amphur MuangChachoengsao dan Bang Yai-
Nonthaburi, sedangkan itchgrass dari Amphur Muang-Chiang Mai,
Pak Chong-Nakhon Ratchasima dan Kamphaeng Saen-Nakhon
Pathom merupakan kelompok sifat B. allelopati dari itchgrass
sebagai perwakilan dari kelompok yang berbeda ditentukan di uji
bioassay, ekstrak air dari itchgrass dari Chaehom- wilayah Lampang
memiliki kemampuan alelopati yang kuat pada pertumbuhan Echinochloa
crus-galli, ketul dan Lactuca sativa
Sebuah hubungan sinergis antara faktor potensial dan
genetik, bahan kimia, dan ekologi alelopati, tidak hanya
mempengaruhi baik potensi alelopati stabil dan tidak stabil, tetapi
kemampuan alelopati juga relatif kuat atau lemah (Zuo
et al., 2007). Kegiatan alelopati diidentifikasi dalam banyak jenis
tanaman. Seperti Avena sativa L. (Kato-Noguchi et al., 1994), Helianthus
annuus L. (Ohno et al., 2001), dan Rottboellia exaltata L. f.
(Kobayashi et al., 2008, Meksawat dan
Pornprom, 2010), telah ditemukan memiliki sifat alelopati. Namun,
usia dan genotipe, lokasi atau lingkungan, dan sistem tanam, yang
semuanya mempengaruhi produksi allelochemicals yang berdampak
pada pertumbuhan tanaman, di lapangan, laboratorium, atau rumah
kaca (Weston et al., 2013). Oleh karena itu, pemahaman yang lebih
baik dari potensi alelopati dari tingkat fisiologis, biokimia, dan
genetika akan memajukan pengetahuan kita tentang peran sifat
alelopati.

Itchgrass [ Rottboellia cochinchinensis

dibandingkan dengan kelompok lainnya. analisis molekuler sangat
didukung dalam pengelompokan morfologi dengan uji bioassay,
ciri-ciri morfologi tertentu yang trikoma lembut, ungu gelap batang
dan akar yang dapat digunakan untuk
pendahuluan
klasifikasi kemampuan alelopati. Hal ini menunjukkan bahwa
(Lour.) WD Clayton] merupakan gulma dataran tinggi tahunan,
menyerbuk sendiri, dan didistribusikan secara luas di daerah tropis
dan subtropis (Alloub et al.,
2005, Alves et al., 2003, Millhollon dan Burner,
1993). Ini adalah spesies yang dominan di beberapa daerah
termasuk Thailand di mana memiliki masalah gulma serius dari
itchgrass di beberapa tanaman.

klasifikasi itchgrass oleh sifat-sifat morfologi berkaitan dengan
analisis hubungan genetik itchgrass dengan analisis AFLP, yang
memungkinkan penilaian keanekaragaman hayati dari itchgrass dan
potensi alelopati mereka.
Sebaliknya, petani di daerah Chaehom-Lampang di Thailand utara
dibudidayakan itchgrass sebagai bahan mulsa untuk pengendalian
gulma di ladang sayur (Kobayashi et al., 2008, Meksawat dan
Pornprom, 2010). Itchgrass adalah keragaman dalam fitur morfologi,
biologi, dan fisiologis antara

Kata kunci: analisis AFLP, allelopathy, genetik populasi itchgrass di

perbedaan, itchgrass, morfologi Thailand. Faktor-faktor iklim, edafis, dan biotik dapat mempengaruhi
sifat morfologi dan fisiologis

Terakreditasi SK No .: 81 / DIKTI / Kep / 2011

http://dx.doi.org/10.17503/Agrivita-2014-36-3-249-259
250
Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................
karakteristik gulma dan menyebabkan evolusi biotipe gulma baru
(Zimdahl, 1993). Dengan demikian, penampilan dan penyebaran
itchgrass di daerah yang berbeda perlu dipertimbangkan untuk
mengklasifikasikan aksesi itchgrass ke dalam kelompok phenoltypic
tertentu yang relevan dengan itchgrass manajemen. Millhollon dan
Burner (1993) menganalisis itchgrass yang dikumpulkan dari 34
negara dan mengidentifikasi lima biotipe berdasarkan morfologi
umum dan pola pertumbuhan. Alves
et al. ( 2003) diklasifikasikan itchgrass dikumpulkan dari enam wilayah
Brasil menggunakan kedua penanda molekuler dan morfologi
sifat. Selanjutnya,
kelompok utama dilaporkan di Semenanjung Malaysia berdasarkan
variasi dalam perilaku pertumbuhan itchgrass (Alloub et al., 2005).
Teknik berdasarkan sequencing DNA memiliki akurasi yang besar
dalam studi taksonomi, dan diperkuat panjang fragmen
polymorphism (AFLP) penanda yang digunakan untuk menentukan
variasi genetik di populasi yang berbeda (Powell et al., 1996). Analisis
AFLP berhasil dimanfaatkan untuk mengungkapkan keragaman
genetik di antara Echinochloa spesies (Tabacchi et al., 2006). Untuk
menilai keragaman genetik, AFLPs yang diterapkan pada Glycine
max L. Merr. (Tara Satyawati et al., 2006) dan Triticum aestivum L.
(Eivazi et al., 2007). penanda molekuler dapat membangun hubungan
antara genotipe dan morfologi
sifat. Zhao et al. ( 2007)
melaporkan variasi genetik Brassica rapa
dengan AFLP dan data morfologi. Kantartzi dan Stewart (2008)
mengidentifikasi 58 plasma nutfah kapas untuk mengevaluasi serat
sifat dan keragaman mereka dengan cara penanda DNA. Skot et al. ( 2005)
mempelajari tanggal judul populasi alami dari ryegrass abadi dan
mengidentifikasi keragaman genetik dengan spidol AFLP. Dengan
demikian, pemahaman formal keragaman genetik dan sifat-sifat
morfologi disebut untuk tujuan klasifikasi potensi alelopati dari
itchgrass. Informasi yang terbatas tersedia pada keragaman
morfologi dan genetik itchgrass di Thailand tidak sepenuhnya
dipahami, di setiap morphotype mungkin memiliki kemampuan
alelopati yang berbeda. Oleh karena itu, tujuan dari penelitian ini
diambil dalam rangka untuk menentukan keragaman genetik, struktur
populasi, dan alelopati ampuh itchgrass menggunakan morfologi dan
AFLP spidol.
BAHAN DAN METODE
Bahan tanaman
benih Itchgrass dari sepuluh daerah di dalam wilayah
tanaman tumbuh utama diselidiki untuk
klasifikasi struktur populasi. Setiap lokasi yang mewakili wilayah
geografis yang berbeda di setiap bagian dari daerah yang berbeda.
Misalnya, Chaehom-Lampang (CH-LP) dan Amphur Muang-Chiang
Mai
(AM-CM) yang
terletak di wilayah utara. Daerah pengambilan sampel di wilayah
tengah yang Phrom Phiram-Phitsanulok (PR-PL), Si
Thep-Phetchabun (ST-PB), Amphur Muang-Nakhon Sawan
(AM-NS), Bang YaiNonthaburi (BY-NB), dan Kamphaeng
SaenNakhon Pathom (KPS-NP). Pak Chong-Nakhon Ratchasima
(PC-NR) dan Kamalasai-Kalasin (KLKS) itchgrass terletak di wilayah
tiga utara-timur sedangkan Amphur Muang-Chachoengsao (AMCS)
terletak di wilayah timur (Gambar 1). Benih disimpan di 7 ° C sampai
inisiasi percobaan.
The itchgrass-bubuk dibuat dari tanaman itchgrass dewasa,
yang tumbuh di bawah kondisi lingkungan dan agronomi seragam.
Mereka dipanen pada saat jatuh tempo dan kemudian dipisahkan
menjadi tunas dan akar. bagian tanaman ini secara individual
dipotong dan dikeringkan pada 40 ° C selama satu minggu, dan
digiling menjadi bubuk dengan penggiling listrik untuk lulus layar
mesh 0,5 mm dan disimpan dalam botol plastik di -20 ° C. Tiga
spesies tanaman uji seperti ketul L. var. radiata SCH. Biq., Echinochloa
crusgalli LP Beauv., Dan Lactuca sativa L. var. OP yang digunakan
dalam uji bioassay. benih uji tanaman berkecambah (radikula ~ 0,02
m) sebelum digunakan dalam percobaan.
Ciri morfologi
Sebuah bibit itchgrass tunggal di setiap lokasi itu
dipindahkan ke pot dan ditempatkan di rumah kaca dalam kondisi
mengendalikan. Data dikumpulkan pada tahap pertumbuhan yang
berbeda dari itchgrass yang
termasuk tahap 2-3 daun,
anakan, berbunga, dan pematangan dengan pengukuran panjang
perbungaan, panjang daun, tinggi tanaman, jumlah biji: perbungaan,
1000 biji berat, ukuran biji, trikoma, warna helai daun, warna daun
kelopak, batang warna dan warna root. Data karakteristik morfologi
yang standar dan koefisien jarak Euclidean dihitung untuk semua
pasangan sampel menggunakan kesamaan
data interval
(Simint) modul dari paket perangkat lunak. Analisis klaster dilakukan
menurut metode kelompok pasangan tertimbang dengan rata-rata
aritmatika (metode UPGMA) berdasarkan: trikoma, warna (ligule,
daun kelopak, dan batang), serta
 251

Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................

sebagai ukuran biji (lebar, panjang, dan 1.000 berat biji) dengan
algoritma sahn. Goodness of fit dari pengelompokan dibandingkan
dengan matriks data dasar diuji dengan perhitungan koefisien
korelasi kofenetik menggunakan normalisasi statistik Mantel uji Z
melalui algoritma Coph dan MxComp. Semua perintah diciptakan
dengan penerapan NTSYSpc versi paket software 2.01e (Mantel
1967, Rohlf, 1998).
daun beku digunakan untuk ekstraksi DNA dengan metode
modifikasi seperti yang dijelaskan oleh Doyle dan Doyle (1987), dan
Cullings (1992). Analisis DNA menggunakan AFLP penanda
dilakukan seperti yang dijelaskan oleh Vos et al. ( 1995). DNA genom
diisolasi dicerna dengan Eco RI dan
Mse Aku enzim restriksi, total lima AFLP kombinasi primer selektif
digunakan untuk amplifikasi selektif (E-ACA: M-CGA, E-ACA:
M-CGC, E-ACA: M-CGG, E-ACA: M-CGT, dan E-ACC: M-CGG) dan
produk amplication terdeteksi dengan denaturasi Polyacrylamide Gel
Elektroforesis dan perak tegang. band AFLP seluruh profil gel
dicetak secara visual sebagai hadiah (1) atau tidak (0) di sepuluh
lokasi. Jumlah fragmen mencetak gol, jumlah fragmen polimorfik,
dan persentase fragmen polimorfik ditentukan untuk setiap primer
yang digunakan. kesamaan genetik berdasarkan koefisien Jaccard
dihitung dan metode UPGMA digunakan. analisis cluster dengan
penerapan program NTSYSpc untuk Windows Versi 2.01e
dimanfaatkan untuk menghasilkan pohon filogenetik (Jaccard, 1908,
Rohlf, 1998).

Analisis Struktur Penduduk

Kelompok identifikasi struktur populasi itchgrass sampel di
sepuluh lokasi, mereka diperkirakan oleh Program stucture versi 2.1
menggunakan pendekatan Bayesian tersedia di
http://pritch.bsd.uchicago.edu (Pritchard et al.,

2000, Falush et al., 2003). Analisis komponen utama dari data

Gambar 1. lokasi geografis dari 10 bidang
dimana sampel itchgrass dikumpulkan dari empat
wilayah Thailand, ChaehomLampang (CH-LP), Amphur
MuangChiang Mai (AM-CM), Si Thep-Phetchabun
(ST-PB), Phrom Phiram-
Phitsanulok (PR-PL), Amphur MuangNakhon Sawan
(AM-NS), Pak ChongNakhon Ratchasima (PC-NR),
Kamalasai-Kalasin (KL-KS), Amphur
MuangChachoengsao (AM-CS), Bang YaiNonthaburi
(BY-NB), dan Kampha-eng Saen-Nakhon Pathom
(KPS-NP)
Analisis AFLP
keragaman genetik dari itchgrass dari sepuluh lokasi
ditentukan. jaringan daun segar pada tahap 2-3 daun dipanen dari
setiap lokasi seperti yang disebutkan sebelumnya dan dibekukan
dalam nitrogen cair. Selanjutnya, 100 mg
morfologi berdasarkan matriks korelasi dan hubungan kemiripan
genetik / jarak antara AFLP dan morfologi
ciri-ciri sebagai korelasi sederhana ditentukan dengan
PAST.exe versi 2.10 (http://folk.uio.no/ohammer/past).
bioassay Uji
Fitotoksisitas dari ekstrak air dari itchgrass pada
pertumbuhan tanaman uji ditentukan untuk properti alelopati melalui
uji bioassay. ekstrak air disusun oleh menjenuhkan 500 mg
itchgrass-bubuk dalam 100 mL air suling selama 24 jam dan disaring
sebelum digunakan. Suling air digunakan untuk membangun
berbagai kuantitas dari ekstrak dari ekstrak setara asli untuk 0, 5, 10,
50, dan 100 mg / mL dengan tingkat pH di kisaran 6,4-6,6. Dua puluh
lima bibit spesies tanaman uji ditempatkan dalam cawan petri yang
dilapisi dengan kertas saring dan jenuh
252
Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................
dengan 4 mL ekstrak air di berbagai konsentrasi yang diperlukan.
Cawan petri disimpan dalam inkubator pada 25 ° C selama 24 jam.
Kedua tunas dan panjang akar tanaman uji diukur pada 5 hari
setelah transplantasi sesuai dengan metode yang digariskan oleh
Meksawat dan Pornprom (2010).
Persentase penghambatan dihitung dengan menggunakan
persamaan berikut: (%) penghambatan = [1 (panjang dengan ekstrak
air / panjang dengan kontrol)] × 100. Data dianalisis untuk analisis
varian (ANOVA) termasuk perhitungan sarana, standar error sarana
(SES) dan derajat kebebasan. Analisis statistik dilakukan dengan
menggunakan R-program yang.
HASIL DAN DISKUSI
Ciri morfologi
The morfologi itchgrass adalah
diselidiki untuk clustering, aksesi itchgrass ditandai dengan cara
pemeriksaan ciri-ciri morfologi utama untuk pengelompokan
spesimen. mengkoordinasikan analisis utama morfologi
ciri-ciri itchgrass dari sepuluh
lokasi dilaporkan. Berdasarkan ciri-ciri morfologi dan data dari
sepuluh lokasi, korelasi kofenetik antara cluster, dan ciri-ciri
morfologi Data kesamaan mengakibatkan cocok (r = 0,91936). Untuk
menilai keragaman genetik dari itchgrass, sepuluh aksesi benih
itchgrass dikumpulkan dari daerah tanaman tumbuh utama Thailand
diselidiki. analisis cluster dengan penerapan metode UPGMA
dipisahkan populasi itchgrass menjadi dua kelompok utama: Grup A
termasuk tujuh lokasi, dengan semua spesimen lebih dikategorikan
ke dalam Grup B, yang terdiri dari tiga lokasi (Gambar 2A). Grup A
terdiri dari itchgrass dari CH-LP, ST-PB, PR-PL, AM-NS, KL-KS,
AM-CS, dan BY-NB; sedangkan Grup B terdiri dari sampel dari
AM-CM, PC-NR, dan KPS-NP.
The morfologi ciri-ciri yang terkait dengan
potensi alelopati dari itchgrass dari CH-LP dengan trikoma lembut
dan batang ungu gelap dan akar memiliki potensi yang tinggi
untuk allelopathy
dibandingkan dengan kecil dengan trikoma lembut sedikit dan batang
hijau dan akar. Hal ini mirip dengan hasil analisis komponen utama
(PCA) yang menjelaskan data morfologi dengan 83,16% dari total
variabilitas di mana semua tujuh ciri morfologi yang disediakan data
yang sesuai untuk analisis morfologi. komponen utama 1 (PC1)
menjelaskan variabilitas 50,69% dari lebar biji, panjang benih, ligule
kontras dengan warna lembar daun, dan ribuan berat biji sedangkan
PC2 menjelaskan 32,47% variabilitas dengan warna batang dan
trikoma. The itchgrass populasi dari CH-LP dipisahkan dari orang
lain dengan sifat morfologi dan setuju untuk potensi alelopati dari
itchgrass mana CH-LP diklarifikasi untuk morfologi dan alelopati
potensial sifat dengan karakter trikoma dan batang warna. Populasi
lainnya dikelompokkan menjadi dua kelompok dengan PCA mana
AM-CM, KPS-NP, dan PC-NR dikelompokkan dengan warna lembar
daun hijau dan ligule sedikit hijau. Sebagai perbandingan, kelompok
kedua terdiri dari populasi itchgrass dari AM-NS, PR-PL, ST-PB,
KL-KS, AM-CS, dan BY-NB dengan warna lembar daun merah muda
merah dan ligule ungu (Gambar 2B).
Hubungan populasi itchgrass di masing-masing kelompok
dijelaskan oleh dendrogram UPGMA. Itchgrass di Grup A memiliki
beberapa ciri morfologi yang berbeda seperti, warna (selubung daun,
batang dan ligule), trikoma, ukuran benih (panjang dan lebar), dan
1.000 berat biji dibandingkan dengan sampel itchgrass tingginya
Grup B. Plant , jumlah daun, jumlah biji / tanaman, diameter batang
sekunder, dan bobot 100 biji utuh atau dehulled adalah karakteristik
yang paling signifikan yang memberikan bukti kuat bagi keberadaan
tiga kelompok itchgrass di Semenanjung Malaysia (Alloub et al., 2005).
Meskipun keterbatasan sifat morfologi untuk klasifikasi spesies
dipengaruhi oleh faktor genetik dan lingkungan dalam kondisi yang
sama, ciri-ciri morfologi tidak membedakan dari orang-orang dari
itchgrass di wilayah asli. Ini merupakan indikasi bahwa morfologi
itchgrass tergantung pada genotipe daripada lingkungan.
 253

Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................

(SEBUAH)

grup A

grup B

0.00 0.10 0,20 0,30 0.40 0,50 0.60 0.70 0.80 0,90 1.00

koefisien jarak

AM-CS

CH-LP
KL-KS (B)
ST-PB BY-NB
AM-NS
PC2 (32.481 %)

PR-PL

warna Stem
trikoma

PC-NR

KPS-NP

AM-CM

PC1 (50,686%)

Gambar 2. Analisis cluster berdasarkan ciri-ciri morfologi untuk itchgrass dari sepuluh lokasi; (A)
pengelompokan data morfologi dari metode UPGMA menggunakan NTSYS, dan (B) analisis komponen utama dari itchgrass dari
sepuluh lokasi berdasarkan koefisien korelasi dari tujuh ciri-ciri morfologi

Analisis AFLP
Sebanyak lima kombinasi primer AFLP digunakan untuk
mengklasifikasikan sepuluh lokasi beragam itchgrass yang
menghasilkan band-band jelas berbeda pada clustering. Ada korelasi
kofenetik antara cluster dan data kesamaan genetik (r =
0,9997). Analisis klaster dilakukan pada semua data yang diperoleh
dari semua lima pasang primer dengan 206 alel polimorfik.
dendrogram tersebut diperoleh dengan menggunakan koefisien
Jaccard ini. koefisien kesamaan Jaccard berkisar antara
0,1991-0,9907. Kesamaan tertinggi (0,9907)
254
Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................
untuk perbandingan bijaksana pasangan di antara sepuluh aksesi
diamati antara aksesi AM-CM dan KPS-NP, dan kesamaan terendah
(0,1991) diperoleh antara KL-KS dibandingkan PCNR dan CH-LP
dibandingkan PCNR. Dua kelompok utama (A dan B) yang
diungkapkan oleh dendrogram. Grup A, yang terdiri tujuh lokasi
sampel itchgrass, memiliki kesamaan rata-rata
0.84. Grup B memiliki rata-rata kesamaan tertinggi (0,98) termasuk
itchgrass dari tiga lokasi. Persentase kesamaan jelas meningkat
antara sampel tersebut. Ada pemisahan itchgrass menjadi dua
kelompok: kelompok pertama terdiri dari itchgrass dari CH-LP,
ST-PB, PR-PL, AM-NS, KL-KS, AM-CS, dan BY-NB, sedangkan
itchgrass dari AM -CM, PC-NR, dan KPS-NP merupakan kelompok
kedua (Gambar 3A).
Analisis AFLP menunjukkan bahwa sampel dari ST-PB,
PR-PL, AM-NS, KL-KS, AM-CS, dan BYNB berhubungan erat
dengan CH-LP sehubungan dengan potensi alelopati di itchgrass,
sementara itchgrass dari AM-CM , PC-NR, dan KPS-NP adalah
kelompok properti weakallelopathic. Gatal-rumput dapat dijelaskan
oleh dua kelompok besar yang diduga untuk melepaskan
allelochemicals dan / atau merupakan gulma utama didistribusikan
secara luas di bidang tanaman. Percobaan kami adalah studi
pertama struktur populasi dan keragaman genetik untuk allelopathy
potensi gulma di Thailand dan analisis AFLP mengungkapkan
struktur populasi sepuluh aksesi dipisahkan menjadi tiga
sub-populasi setuju dengan daerah sampling dan distribusi. Dalam
studi lain yang serupa, et al., 2005). Temuan analisis struktur populasi
56
Gossypium arboreum aksesi plasma nutfah berdasarkan penanda
SSR mampu mengidentifikasi kapas sesuai dengan geografis
mereka wilayah
(Kantartzi dan Stewart, 2008).
Analisis Struktur Penduduk
Hubungan populasi itchgrass di masing-masing kelompok
tampaknya baik dijelaskan oleh dendrogram UPGMA. Namun,
program lain yang digunakan untuk mengevaluasi hubungan antara
populasi dan kelompok penduduk diklasifikasikan mereka untuk
mengkonfirmasi struktur populasi sepuluh sampel itchgrass. Struktur
populasi dianalisis dengan program yang stucture. Tiga subpopulasi
(K = 3) diidentifikasi dengan tertinggi kemungkinan nilai [Pn (D) =
-492,3] oleh K1 untuk K5 berjalan. Jarak rata-rata antara individu
dalam
subpopulasi kelompok 1-3 (K1-3) adalah 0,4047,
0,0871, dan 0,0093, masing-masing (Gambar 3B). Karena ada juga
tiga kelompok dari metode UPGMA,
tiga cluster UPGMA dibandingkan dengan analisis
program STRUKTUR untuk menentukan bagaimana program
diskriminasi di antara populasi. Hasil dari STRUKTUR mirip dengan
klaster
dari analisis UPGMA.
Subpopulasi 1 termasuk tiga itchgrass dari AMCS terkait dengan
BY-NB dan KL-KS untuk 79,2% dan
67,3%, masing-masing. Ketiga populasi dikumpulkan dari tengah
dan utara-timur dari Thailand. Subpopulasi kedua adalah kelompok
itchgrass dikumpulkan dari daerah tertutup yang terdiri dari itchgrass
dari AM-NS, ST-PB, CH-LP, dan PRPL, dan terkait erat sampel dari
pusat
melalui utara Thailand. Hubungan yang sangat tertutup
dari tiga populasi itchgrass yang ketiga subpopulasi includ-ing
itchgrass dikumpulkan dari AM-CM, PC-NR, dan KPS-NP, dan
adalah serupa pada karakter morfologi.
Korelasi kesamaan / jarak antara penanda AFLP (Jaccard
koefisien kemiripan) dan morfologi
ciri-ciri (Euclidean
jarak) adalah signifikan dengan r = -0,84 **. Oleh karena itu, semua
kesamaan dan jarak antara aksesi itchgrass terkait dan itchgrass dari
CH-LP memiliki efek alelopati pada spesies tanaman tes, Hich
berkerumun dalam kelompok yang berbeda oleh kedua morfologi
dan AFLP clustering. Kelompok lain berkerumun itchgrass dari
PC-NR dan KPS-NP dalam kelompok yang sama. Ketika morfologi
pengelompokan dibandingkan dengan AFLP pengelompokan untuk
Grup A dari morfologi
data, tujuh itchgrass
aksesi (KL-KS, BY-NB, AM-CS, PR-PL, AMNS, CH-LP, dan ST-PB)
dikelompokkan dalam yang sama seperti grup A berdasarkan data
AFLP. Grup B dari data morfologi berkerumun tiga aksesi itchgrass
(AM-CM, KPS-NP, dan PCNR) ke dalam kelompok itu adalah AFLP
pengelompokan yang sama.
 255

Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................

(SEBUAH)

grup A

grup B

0.00 0.10 0,20 0,30 0.40 0,50 0.60 0.70 0.80 0,90 1.00

koefisien kemiripan

(B)

(B)

Gambar 3. dendrogram yang diperoleh dengan analisis cluster data AFLP di setiap aksesi (A); Populasi
struktur itchgrass di Thailand yang K = 3 dan setiap warna satu cluster dianalisis dengan struktur dan diberikan 3 cluster (B)

Variasi genetik itchgrass adalah
diselidiki untuk mengklasifikasikan potensi alelopati dari morphotypes
itchgrass dari berbagai wilayah Thailand dengan memeriksa kedua
sifat morfologi utama dan analisis genetik menggunakan AFLP.
Analisis molekuler sangat didukung oleh dendrogram dalam studi
pendahuluan di morfologi pengelompokan analisis. Signifikansi
koefisien kemiripan / jarak dari
morfologi sifat dan spidol AFLP korelasi menunjukkan bahwa
karakteristik morfologi terkait dengan keragaman genetik itchgrass.
Hasil ini sejalan dengan orang-orang dari Na et al. ( 2010), yang
melaporkan korelasi positif antara jarak genetik dan jarak geografis
antara typha
spesies di Asia Timur. The morfologi sifat-sifat dan AFLP analisis
umumnya mengkonfirmasi
256
Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................
perbedaan dua kelompok terpisah yang diperoleh dari analisis
cluster. Hal ini menunjukkan bahwa klasifikasi itchgrass oleh
sifat-sifat morfologi berkaitan dengan analisis hubungan genetik
itchgrass dengan AFLP. Ini dapat digunakan untuk menilai
keragaman genetik itchgrass dengan potensi alelopati. Namun,
potensi alelopati dari itchgrass dari daerah yang berbeda harus
ditentukan untuk mengkonfirmasi awal mengklasifikasikan alelopati
ampuh spesies itchgrass menggunakan ciri-ciri morfologi utama dan
analisis AFLP.
Potensi alelopati dari encer Ekstrak dari Itchgrass
Ekstrak air diselidiki untuk mengkonfirmasi potensi alelopati
dari ichgrass di setiap daerah. Dari clustering menggunakan ciri-ciri
morfologi dan hasil analisis AFLP, ekstrak air dari itchgrass dari tiga
situs seperti itchgrass dari daerah CH-LP diwakili sebagai Grup A,
dan itchgrass dari KPS-NP dan daerah PC-NR yang
direpresentasikan sebagai kelompok B adalah menentukan
phytotoxic pada pertumbuhan jenis tumbuhan uji melalui uji
bioassay.
Secara umum, ekstrak air dari CHLP memiliki efek
penghambatan pada pertumbuhan bibit
ketul L., Echinochloa crus-galli L., dan
Lactuca sativa L., kecuali untuk pertumbuhan tunas
Echinochloa crus-galli L. tidak signifikan. Selain itu, peningkatan
konsentrasi ekstrak air menonjolkan penghambatan tunas dan akar
pertumbuhan. Di sebaliknya, kedua ekstrak air itchgrass dari
KPS-NP dan daerah PC-NR tidak signifikan menghambat untuk
menembak panjang dan panjang akar dari pertumbuhan bibit
tanaman uji (Gambar 4). Allelochemicals hadir dalam ekstrak gulma
berkurang menembak dan pertumbuhan akar rata-rata 50% dan
70%, masing-masing, pada konsentrasi tertinggi
ekstrak. Ini
Hasil penelitian menunjukkan bahwa itchgrass dari lapangan petani di
daerah CH-LP memiliki efek kuat alelopati pada pertumbuhan bibit
spesies tanaman uji dibandingkan dengan daerah lain.
Penyelidikan potensi alelopati dari itchgrass dari tiga situs
menyarankan bahwa fom daerah CH-LP itchgrass memiliki properti
alelopati. Demikian pula, Kobayashi et al. ( 2008) juga mengamati
aktivitas alelopati dari itchgrass dari bidang dataran tinggi di provinsi
Lampang di Thailand utara di bawah situasi lapangan. Potensi
phytotoxic tanaman itchgrass adalah karena pelepasan langsung
dari zat beracun yang mungkin
dari bagian tanaman dan / atau pelepasan langsung dari zat beracun
setelah degradasi tanaman (Meksawat dan Pornprom, 2010).
Dari fitotoksisitas dari ekstrak air dari itchgrass hasil
pertumbuhan tanaman tes, ekstrak air dari itchgrass dari lapangan
petani di CH-LP di utara Thailand memiliki efek penghambatan lebih
besar dari itchgrass dari KPS-NP dan daerah PC-NR. Ini merupakan
indikasi tdk dalam potensi alelopati dari itchgrass dari asal-usul
beragam. Seperti perbedaan dalam potensi alelopati
berpotensi terkait dengan
faktor genetik dan lingkungan. Hasil ini mirip dengan Zuo et al. ( 2007),
yang melaporkan hubungan sinergis antara potensi alelopati,
genetik, bahan kimia, dan faktor ekologi di T. aestivum L.
Keanekaragaman dari itchgrass diselidiki untuk memungkinkan
klasifikasi potensi itchgrass dengan karakteristik alelopati asal
beragam melalui analisis ciri-ciri morfologi utama dan analisis AFLP.
Utama ciri morfologi dan AFLP analisis menunjukkan bahwa sampel
itchgrass dari daerah CH-LP (potensi kuat-allelopathy) milik Grup A,
dan sampel itchgrass dari KPSNP dan PC-NR dengan potensi yang
lemah-allelopathy ditugaskan untuk Grup B. Penelitian ini telah
menunjukkan bahwa populasi itchgrass dari CH-LP yang terletak di
utara Thailand memiliki potensi kuat alelopati. keragaman genetik
berdasarkan pada kedua morfologi dan AFLP spidol terkait, dan
potensi tinggi untuk itchgrass alelopati yang berkerumun secara
terpisah dari potensi tinggi untuk itchgrass alelopati didukung oleh
kedua set data. Karena itu,
Pemanfaatan penelitian allelopathy sebagai alat pertanian
terhadap gulma mungkin karena bagasi sejarah. Pengembangan
manajemen gulma dengan ketergantungan kurang pada herbisida
sintetis adalah salah satu tantangan utama dalam penelitian
agrokimia. Dalam beberapa tahun terakhir, perkembangan herbisida
dari yang terjadi secara alamiah bahan kimia tanaman telah menjadi
isu penting. Informasi yang diperoleh dapat berpotensi dimanfaatkan
dalam pengembangan bio-herbisida untuk manajemen gulma di
masa depan. Oleh karena itu, penelitian lebih lanjut diperlukan untuk
mengidentifikasi allelochemicals dari itchgrass.
 257

Apirat Bundit et al .: Klasifikasi Struktur Populasi untuk allelopati Properti .............................................

(A) (A) (B) (B)

CH-LP KPS-NP
CH-LP
PC-NR
KPS-NP PC-NR a** a**
CH-LP KPS-NP
CH-LP
PC-NR
KPS-NP PC-NR

100 100 100 100

Bidens pilosa L.

Bidens pilosa L.
a** a**
Bidens pilosa L.

Bidens pilosa L.
80 80 80 80 b** b**

60 60 60 60
b** b**
b** b** b** c** c**
ns ns ns ns
ns ns 40 40 ns nsns ns nsns
ns ns
40 40 ns ns ns ns ns ns c** ns ns c** ns ns
c** c**
c** ns ns c** ns ns
ns ns ns ns
nsns ns ns
ns ns
0 20 0 20
20 20

- 20 - 20
- 20 0 - 20 0

a** a**
% Inhibition (shoot length)

% Inhibition (shoot length)

% Inhibition (root length)

% Inhibition (root length)

100 100
Echinochloa crus-galli L.

Echinochloa crus-galli L.
b** b**
Echinochloa crus-galli L.

Echinochloa crus-galli L.
100 100
80 80

80 80 60 60 ns ns ns ns
c** c**
c** c** ns ns
40 c** ns40 ns c** nsns nsns nsns ns nsns nsns ns
60 60
ns ns ns ns
ns ns ns
ns 0 20 0 20
ns ns ns ns ns ns
ns ns
40 40 ns
ns ns ns ns ns
ns ns ns ns ns ns - 20 - 20
ns ns
20 20 - 40 - 40

- 20 0 - 20 0

a** a**
a** a**
a** a**
Lactuca sativa L.

Lactuca sativa L.

100 100 100 100

Lactuca sativa L.

Lactuca sativa L.

b** b**
80 80 80 80

60 60 ns ns 60 60 b** b**
ns ns ns ns
ns ns ns ns
ns ns
ns c** ns ns c** ns ns nsns nsns ns ns ns
40
e** ns ns
40 d**
e** d** 40 40 c** c**
ns ns
ns ns c** ns ns c** ns nsns nsns ns
ns ns
20 20 0 20 0 20

- 20 0 - 20 0 - 20 - 20
0 50 105 50
10 50
100 mg/mL 100 mg/mL 0 05 510 1050 50100 mg/mL
100 mg/mL

Gambar 4. Penghambatan ekstrak air dari itchgrass; pada panjang tunas (A) dan panjang akar (B) dari tanaman uji
bibit. Data disajikan sebagai mean dan standar error, Least Significant Difference (LSD) menunjukkan perbedaan yang signifikan di ** P
< 0.01 (ns = tidak signifikan)

Penelitian tentang genetika allelopathy signifikan dan analysis clustering with bioassay test for allelopathic ability. The
dengan demikian harus terus untuk mencapai pemahaman lebih results demonstrate that the classification of itchgrass by
lanjut dari fungsi gen yang bertanggung jawab untuk kehadiran morphological traits is related to the analysis of the genetic
allelochemicals di pabrik. relationship of itchgrass with AFLP. This can be used to assess the
genetic diversity of itchgrass with a potential for allelopathy in the
future.
KESIMPULAN DAN SARAN

Itchgrass adalah gulma luas di jagung dan tebu bidang dan ACKNOWLEDGMENTS
diduga untuk melepaskan allelochemicals. Ciri-ciri spesifik trikoma
lembut, warna ungu gelap dari batang, dan akar dapat digunakan This research was partly supported by the Thailand
untuk mengklasifikasikan awal kemampuan alelopati di itchgrass. Analisis Research Fund (RSA 5280004), the Royal Golden Jubilee Ph.D.
molekuler sangat didukung di morfologi Program (PHD /0023/2552) and the Kasetsart University Research
and Development Institute.
258
Apirat Bundit et al.: Classification of Population Structure for Allelopathic Properties………………………………………
REFERENCES
Alloub, H., A.S. Juraimi, A. Rajan, J. Kadir, M.S.
Saad and S. Sastroutomo. 2005. Growth behavior of
itchgrass ( Rottboellia cochinchinensis) in Peninsular
Malaysia. Weed Biology and Management 5:8-13. Alves,
P.L.C.A., M.F. Bachega, J.R. Moro, M.V.F.
Lemos, E.C.C. Alves, M.A.S. Silva and
F.V. Moro. 2003. Identification and
characterization of different accessions of itchgrass ( Rottboellia
cochinchinensis).
Weed Science 51:177-180.
Cullings, K.W. 1992. Design and testing of a
plant-specific PCR primer for ecological and evolutionary
studies. Molecular Ecology 1:233-240.
Doyle, J.J. and J.L. Doyle. 1987. A rapid DNA
isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue.
Phytochem Bull 19:11-
15.
Eivazi, A.R., M.R. Naghavi, M. Hajheidari, S.M.
Pirseyedi, M.R. Ghaffari, S.A.
Mohammadi, I. Majidi, G.H. Salekdeh and M. Mardi. 2007.
Assessing wheat ( Triticum aestivum L.) genetic diversity
using quality traits, amplified fragment length
polymorphisms, simple sequence repeats and proteome
analysis. Annals of Applied Biology 152:81-91.
Falush, D., M. Stephens and J.K. Pritchard. 2003.
Inference of population structure using multilocus
genotype data: linked loci and correlated allele
frequencies. Genetics 164:1567-1587.
Jaccard, P. 1908. Nouvelles recherches sur la
distribution florale. Bulletin de la Societe Vaudoise des
Sciences Naturelles 44:223-270.
Kantartzi, S.K. and J.M. Stewart. 2008.
Association analysis of fibre traits in
Gossypium arboreum accessions. Plant Breeding
127:173-179.
Kato-Noguchi, H., S. Kosemura, S. Yamamura, J.
Mizutani and K. Hasegawa. 1994. Allelopathy of oats: I.
Assessment of allelopathic potential of extract of oat
shoots and identification of an allelochemical. Journal of
Chemical Ecology 20:309-314.
Kobayashi, K., D. Itaya, P. Mahatamnuchoke and
T. Pornprom. 2008. Allelopathic potential of itchgrass ( Rottboellia
exaltata L. f.)
powder incorporated into soil. Weed Biology and
Management 8:64-68. Maccaferri, M., S. Corinna, E. Noli and
R.
Tuberosa. 2005. Population structure and long-range
linkage disequilibrium in a durum wheat elite collection.
Molecular Breeding 15:271-289. Mantel, N.A. 1967. The
detection of disease
clustering and a generalized regression approach. Cancer
Research 27:209-220. Meksawat, S.
and T. Pornprom. 2010.
Allelopathic effect of itchgrass ( Rottboellia
cochinchinensis ( Lour.) W.D. Clayton)
on seed germination and plant growth. Weed Biology and
Management 10:16-
24.
Millhollon, R.W. and D.M. Burner. 1993. Itchgrass
( Rottboellia exaltata) biotypes in world populations. Weed
Science 41:379-387. Na, H.R., C. Kim and H.K. Choi. 2010.
Genetic
relationship and genetic diversity among
Typha taxa from East Asia based on AFLP markers.
Aquatic Botany 92:207-
213.
Ohno, S., K. Tomita-Yokotani, S. Kosemura, M.
Node, T. Suzuki, M. Amano, K. Yasui, T. Goto, S.
Yamamura and K. Hasegawa.
2001. A species selective allelopathic substance from
germinating sunflower ( Helianthus annuus L.) seeds.
Phytochemistry 56:577-581. Powell, W., M. Morgante and C.
Andre. 1996.
The comparison of RFLP, RADP, AFLP, and SSR
(microsatellite) markers for germoplasm
analysis. Molecular
Breeding 2:225-238. Pritchard, J.K., M. Stephens and P.
Donnelly.
2000. Inference of population structure using multilocus
genotype data. Genetics 155:945-959.
Rohlf, F.J. 1998. NTSYS-pc: numerical taxonomy
and multivariate analysis system. Version
2.0, user’s guide, New York, USA.
Skot, L., M.O. Humphreys, I. Armstead, S.
Heywood, K.P. Skot, R. Sanderson, I.D. Thomas, K.H.
Chorlton and N.R.S. Hamilton. 2005. An association
mapping approach to identify flowering time genes in
natural populations of Lolium perenne
(L.). Molecular Breeding 15:233-245. Tabacchi, M., R.
Mantegazza, A. Spada and A.
Ferrero. 2006. Morphological traits and molecular markers
for classification of

Apirat Bundit et al.: Classification of Population Structure for Allelopathic Properties………………………………………
Echinochloa species from Italian rice fields. Weed Science
54:1086-1093. Tara Satyavathi, C., K.V. Bhat, C. Bharadwaj,
S.P. Tiwari and V.K. Chaudhury. 2006. AFLP analysis of
genetic diversity in Indian soybean [ Glycine max ( L.)
Merr.] varieties. Genetic Resources and Crop Evolution
53:1069-1079.
Vos, P., R. Hogers and M. Bleeker. 1995. AFLP a
new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids
Research 23:4407-4414. Weston, L.A., I.S. Alsaadawi and S.R.
Baerson.
2013. Sorghum Allelopathy - From Ecosystem to
Molecule. Journal of Chemical Ecology 39:142-153.
259
Zhao, J., M.J. Paulo, D. Jamar, P. Lou, F.
Eeuwijk, G. Bonnema, D. Vreugdenhil and M. Koornneef.
2007. Association mapping of leaf traits, flowering time,
and phytate content
in Brassica rapa.
Genome 50:963-973. Zimdahl, R.L. 1993. Weed ecology,
in funda-
mentals of weed science. Academic Press, New York,
USA. Zuo, S.P., Y.Q. Ma and S. Inanaga. 2007.
Allelopathy variation in dryland winter wheat ( Triticum
aestivum L.) accessions grown on the Loess Plateau of
China for about fifty years. Genetic Resources and Crop
Evolution 54:1381-1393.