Mar

tupaSi
dabut
ar
180805046

Ri
ngkasanJur
nal
Prot
eomi
k:Dat
abasedanTeknol
ogi

Pr
oteomi
kmemegangper
ananbesardal
am memahamisi
stem dan
pr
osesbi
ologi
.Pr
oteomi
kmempel
ajar
itent
angst
ukt
ur,si
fatdanf
ungsi
pr
otei
n.Si
fatpr
otei
nyangmel
i
put
iekspr
esi
,pascat
ransl
asi
,i
nter
aksidan
sebagai
nya. Secar
a umum, pr
oteomi
k dapat mengkaj
i pr
oses
pembent
ukanpeny
aki
tsecar
aint
egr
ati
f,pr
osessel
uler
,danhubungan
ber
bagaimacam pr
otei
ndidal
am sel
.Dat
apr
oteomi
ksangatbany
akdan
l
uas,sehi
nggakemungki
nanbesardat
ati
dakl
engkap.Hali
nidi
sebabkan
kar
ena dat
a pel
engkap bany
ak y
ang t
erpi
sah,t
idak mudah di
akses,
ber
bagaimacam f
ormat
,dan t
idakt
erj
angkau ol
eh i
nter
net
.Pet
unj
uk
pengumpul
an dat
a pr
oteomi
k ol
eh The HUPO PSI t
elah di
buat
pedomanny
a.Dat
ayang y
ang har
usadaadal
ah dat
a"massspect
ra"
.
MzDat
ainidi
l
engkapidengananal
ysi
sXMLunt
ukmasukkedal
am mesi
n
pencar
i.Didal
am MzDat
ater
dapatnamai
nst
rumen,danpeny
edi
amesi
n
dandat
abasey
angt
erdapatpadaPRI TheEur
DE( opeanBi
oinf
ormat
ics
I
nst
it
ute’
sPr
oteomi
ksI
dent
if
icat
ionsDat
abase)
.
Kaj
i
anpr
oteomi
kdapatdi
manf
aat
kanunt
ukmempel
ajar
iber
bagai
di
sipl
i
n kei
l
muan bi
ologi
.Beber
apa y
ang t
elah di
tel
i
tiadal
ah pr
oduk
pangan seper
ti susu, si
tol
ogi
, hi
stol
ogi
, det
eksi peny
aki
t/
pat
ologi
,
per
tani
andanl
ainny
a.
Eksper
imen pr
oteomi
k, ber
tuj
uan unt
uk menent
ukan
i
dent
it
as,
kar
akt
eri
sti
kdani
nter
aksipr
otei
nyangdi
temukandal
am si
stem
sel
uleri
ndi
vi
du.Hali
nidapatmember
ikani
nfor
masit
ent
angpr
otei
nyang
ny
atadal
am j
uml
ahy
angj
auhl
ebi
hbesardar
ipendekeat
anl
abor
ator
ium
y
ang masi
htr
adi
sional
.Dengan per
kembangan PRI
DE skema XML
sebagaibent
ukbar
udar
iagr
egasidat
apr
oteomi
k.GPDEmenggunakan
kemungki
nan i
niunt
uk menggabungkan pr
oteomi
k per
cobaan y
ang
ber
bedaber
dasar
kanj
eni
sselsaj
adanber
gabungdal
am sat
usethasi
l
y
ang besar
.Dengan demi
ki
an,met
a-anal
i
sis dapat dengan mudah
di
hasi
l
kant
idakhany
adi"
per
bat
asan"per
cobaany
angber
bedat
etapij
uga
disel
uruht
emuant
im penel
i
tiber
beda.El
ekt
rof
oresi
sgel2di
mensii
alah
sal
ah sat
u pendahul
uteknol
ogiseder
hanadibi
dang i
niy
ang mampu
membedah kaj
i
an pr
otei
n. El
ekt
rof
oresi
s gel 2 di
mensi per
lu
di
kombi
naskan dengan t
ekni
k l
ain guna meni
ngkat
kan ef
ekt
if
it
as
penggunaanny
a.Pr
otei
ndi
kaj
ipadat
ahapper
ubahany
angt
erj
adidal
am
pembent
ukanpr
otei
nsaatset
elaht
ransl
asimenggunakanspekt
romet
ri
massa.Duat
ekni
kyangdi
gunakandal
am met
odespekt
romet
rimassa
y
aknit
ekni
kbot
tom-
updant
op-
up.Tekni
kper
tamaper
luenzi
m unt
uk
menj
adi
kan suat
u pr
otei
n menj
adif
ragmen sedangkan t
ekni
ktop-
up
secar
alangsung menganal
i
sist
arget
.Tekni
k bot
tom-
up l
ebi
h ser
ing
di
gunakan kar
ena keunggul
anny
a y
akni l
ebi
h sepsi
fi
k dan secar
a
meny
elur
uh dapatmenganal
i
sist
argetkar
ena t
elah menj
adif
ragmen-
f
ragmen