- Kapsul terbuat dari karbohidrat, nitrogen, atau fosfor.

Kapsul dan lapisan lendir berfungsi untuk pelindung sel

terhadap dehidrasi, cadangan makanan, perlindungan terhadap
fagositosis dan pertahanan diri. Pada umumnya kapsul dimiliki
oleh bakteri virulen. Pada bakteri parasite, kapsul dilengkapi
pelindung terhadap system pertahanan sel inang.

- Flagela dimiliki oleh beberapa prokariota sebagai alat

bergerak.

- Phili atau fimbriae merupakan rambut halus yang muncul dari dinding sel berfungsi
untuk melekatkan diri ke suatu permukaan benda dan sebagai saluran untuk
menyalurkan materi genetika dalam peristiwa konjugasi.

- Dinding sel tersusun dari peptidoglikan berfungsi untuk memberi bentuk, sebagai bahan
pelindung, mengatur keluar masuknya zat, dan perperan dalam pembelahan sel.

- Membran sel (membrane plasma) bakteri tersusun dari protein dan lemak berfungsi
untuk mengatur transportasi zat dari luar ke dalam sel. Membrane sel pada sianobakteri
berperan dalam fotosintesis. Didalamnya terdapat tilakoid (kromatofor) yang
mengandung pigmen fotosintesis.

- Mesosom untuk pabrik energi .

- Lembar fotosintetik untuk berfotosintesis.

- Sitoplasma tempat berlangsungnya reaksi metabolik.

- DNA untuk mengontrol sintetis protein dan pembawa sifat.

- Plasmid pembawa gen tertentu dapat ditransformasikan ke sel lain.

- Ribosom untuk tempat sintesis protein.

- Endospora untuk mempertahankan diri dari kondisi buruk pada salah satu ujung sel.