BAKTERIOLOGI KEDOKTERAN

1. Definisi Bakteri
Bakteri adalah mikroorganisme prokariotik bersel satu yang memperbanyak diri dengan divisi
sel dan secara khas memiliki dinding sel.
1


2. Morfologi Bakteri
Kokus merupakan bekteri berbentuk bulat dapat tersusun sebagai berikut:
- mikrokokus adalah kokus tersendiri (single)
- diplokokus adalah kokus berpasangan dua-dua
- pneumokokus adalah diplokkus yang berbentuk lanset
- gonokokus adalah diplokokus yang berbentuk seperti biji kopi
- tetrade adalah kokus yang tersusun rapi dalam kelompok empat sel
- sarsina adalah kokus dalam kelompok delapan sel yang tersusun rapi dan berbentuk
seperti kubus
- streptokokus adalah kokus yang tersusun seperti rantai
- stafilokokus adalah kokus bergerombol tak teratur seperti untaian buah anggur
Basilus merupakan bakteri berbentuk batang dengan panjang variasi dua sampai sepuluh kali
diameter bakteri tersebut.
- kokobasilus adalah basil yang sangat pendek menyerupai kokus
- fusiformis adalah basil dengan kedua ujung batang meruncing
- streptobasilus adalah sel-sel bergandeng membentuk suatu filamen
Spiral:
- vibrio, berbentuk batang bengkok
- spirilum berbentuk spiral kasar dan kaku, tidak fleksibel dan dapat bergerak dengan flagel
- spirokhaeta berbentuk spiral halus, elastik dan fleksibel dapat bergerak dengan aksial filamen.
Contoh:
1. borrelia, berbentuk gelombang
2. treponema, berbentuk spiral halus dan teratur
3. leptospira, berbentuk spiral dengan kaitan satu atau kedua ujungnya
1

Gambar 1: morfologi bakteri
7



3. STRUKTUR DASAR SEL BAKTERI
Gambar 2: struktur sel
4






Kapsul.
o Kapsul adalah polimer yang membentuk selubung padat yang menyelimuti sel.
o Kapsul berperan dalam tingkat keinvasifan bakteri patogenik (sel yang berkapsul terlindung dari fagositosis kecuali
jika mereka diselubungi oleh antibodi antikapsular).
Dinding sel.
o Adalah lapisan selubung sel yang terletak di antara membran sitoplasma dan kapsul.
o bakteri gram positif, dinding sel tersusun atas peptidoglikan dan asam teikoat. Sedangkan pada bakteri gram negatif,
dinding sel tersusun atas peptidoglikan dan membran luar.
o Dinding sel berperan dalam proteksi terhadap osmotik & pembelahan sel.
o Komponen pada dinding sel:
a) Bakteri gram positif.
Peptidoglikan, terdapat 40 lembar lapisan peptidoglikan.
Asam teikoat & asam teikuronat, merupakan polimer yang larut dalam air. Asam teikoat membentuk antigen
permukaan utama karena terletak di permukaan luar dari lapisan peptidoglikan.
Polisakarida
b) Bakteri gram negatif.
Peptidoglikan, hanya terdapat satu atau dua lembar lapisan peptidoglikan.
Membran luar, merupakan struktur berlapis ganda.
Lipoprotein, berperan dalam menstabilkan membran luar dan merekatkannya ke lapisan peptidoglikan.
Membran Plasma/Sitoplasma.
Berperan dalam permeabilitas selektif & transport zat terlarut, transpor elektron & fosforilasi oksidatif pada spesies
aerobik.
50% membran plasma harus dalam keadaan semifluid (setengah cair) agar pertumbuhan sel dapat terus berjalan.
Nukleoid.
o Padanan nucleus pada eukariot, berupa rantai tunggal berbentuk melingkar.
o Beberapa bakteri memiliki tambahan DNA melingkar lain yang lebih kecil yang disebut plasmid.
Sitoplasma
o Adalah cairan sel.
Ribosom.
o Berperan dalam sintesis protein.
o Tersebar dalam sitoplasma.

Mesosom.
o Adalah invaginasi membran sitoplasma yang bergelung-gelung membentuk struktur khusus.
o Ada 2 tipe mesosom:
a) Mesosom septal, yang berfungsi membentuk dinding penyebrangan selama pembelahan sel.
b) Mesosom lateral
Flagella.
o Adalah alat tambahan seperti benang yang seluruhnya tersusun atas protein.
o Diameternya sekitar 12 30 nm.
o Flagella adalah organ pergerakan pada bakteri.
o Terbentuk dari ribuan molekul suatu subunit protein yang disebut flagellin.
o Ada 4 bentuk flagella:
a) Monotrik (flagella yang hanya terdapat pada satu ujung)
b) Lofotrik (flagel yang terdapat banyak pada satu ujung)
c) Amfitrik (flagel yang terdapat di kedua ujungnya)
d) Peritrik (flagel yang terdapat pada seluruh permukaan sel)
Gambar 3: bentuk flagel
4


Pili
o Pili (dari bahasa latin yang artinya rambut) atau fimbria (latin rumbai).
o Organ ini lebih pendek dan lebih halus daripada flagel.
o Tersusun atas subunit protein struktural yang disebut pilin.
o Protein minor, yang terletak pada ujung pili, menyebabkan bakteri dapat melekat pada sel lain.
o Pili dibagi dalam 2 kelas, yaitu:
a) Pili biasa, berperan dalam bakteri pathogen ke sel pejamu.
b) Pili seksual, berperan dalam perlekatan bakteri pada proses konjugasi.
Spora.
o Pada kondisi kekurangan nutria, tiap sel membentuk spora internal tunggal yang dilepaskan saat sel induk mengalami
otolisis.
o Spora adalah sel yang sedang beristirahat yang sangat resisten terhadap kekeringan, panas dan bahan-bahan kimia.
o Proses pembentukan spora dimulai ketika kondisi nutrisi kurang menguntungkan.
o Dinding spora relatif tidak permeabel, namun zat warna bias menembusnya dengan cara memanaskan preparat. Spora
diwarnai dengan malakit hijau atau karbolfuhsin.
o Sifat endospora :
a) Inti, merupakan potoplas suatu spora. Inti mengandung sebuah nukleus sempurna (kromosom).
b) Dinding spora, merupakan lapisan paling dalam yang mengelilingi membran dalam spora.
c) Korteks, merupakan lapisan paling tebal dari selubung spora. Peptidoglikan korteks sangat sensitif terhadap lisozim,
dan sifat autolisisnya berperan dalam pertumbuhan (germinasi) spora.
d) Selubung (coat), tersusun atas protein yang mirip keratin. Bersifat tidak permeable sehingga spora cenderung
resisten terhadap bahan kimia antibakteri.
e) Eksosporium, merupakan membran lipoprotein yang mengandung sejumlah karbohidrat.
2

Gambar 4: spora
4



















4. Klasifikasi Bakteri
Berdasarkan biokimia
setiap bakteri dapat dibedakan karakterisasi kimia dalam DNA bakteri menunjukkan kisaran
komposisi basa nukleotida yang luas sehingga terdapat kesamaan genetik meliputi tingkat
genetik berdasarkan
- komposisi basa DNA
- homologi sekuens DNA dan rRNA
- pola-pola metabolisme stabil yang dikontrol oleh gen
- polimer-polimer pada sel
- struktur organel dan pola regulasinya
Berdasarkan morfologi
Setiap bakteri dapat dibedakan menurut bentuknya dan ukuran. Dibedakan menjadi 3, yaitu:
- Cocus
- Bacillus (batang)
- Spiral
Berdasarkan sel
Dibedakan menjadi 2 yaitu, eubakteria terdiri dari berbagai bakteri yang lebih umum atau bakteri
sejati dan archaebakteria (bakteri purba) yang tidak menghasilkan peptidoglikan yang
membedakan dengan eubakteria. Terdapat empat utama dibedakan atas karakteristik dinding sel,
yaitu:
Eubakteria Gram Negatif yang mempunyai dinding sel
Bakteri ini merupakan kelompok bakteri heterogen yang mempunyai selubung sel kompleks
(jenis gram negatif) yang terdiri dari membran luar, lapisan peptidoglikan tipis di bagian dalam
dan membran sitoplasma. Sel berbentuk oval, batang lurus atau melengkung, heliks, beberapa
bentuk tersebut depan berselubung atau berkapsul. Anggota bakteri ini mungkin berupa bakteri
fototrofik atau nonfototrofik. Pergerakan jika ada, terjadi melalui flagel atau pergelinciran.
Eubakteria Gram positif berdinding sel
Kelompok bakteri ini mempunyai profil dinding sel jenis Gram positif. Sel-sel biasanya memberi
pewarnaan gram positif tetapi tidak selalu. Sel-sel dapat berbentuk sferis, batang atau filament.
Organisme tersebut secara umum bersifat heterotrof kemosintetikdan meliputi spesies aerob,
anaerob, dan fakultatif anaerob. Kelompok dalam kategori ini mencakup bakteri asporogenus
sederhana dan sporogenus.
Eubakteria yang tidak memiliki dinding sel
Bakteri ini adalah mikroorganisme yang tidak memiliki dinding sel (sering disebut sebagai
mikoplasma dan terdiri dari kelas mollicutes) dan tidak menyintesis prekursor peptidoglikan.
Bakteri tersebut diselubungi oleh suatu membran unit, yaitu membran plasma. Bakteri tersbut
menyerupai bentuk L. Mikoplasma adalah organisme yang sangat pleomorfik dan ukurannya
sangat kecil, bentuk dapat difiltrasi.
Arkhaebakteria
Organisme prokariot ini terutama ditemukan dalam lingkungan berair atau haitat terrestrial yang
ekstrem (tinggi garam, temperatur tinggi, anaerob) beberapa diantaranya adalah simbion dalam
saluran cerna hewan. Terdiri dari organisme fakultatif anaerob, anaob, dan aerob yang bersifat
kemolitotrof, heterototrof atau heterotrof fakultatif. Arkhaebakteria tidak memiliki dinding sel
peptidoglikan, memiliki isoprenoid diter atau lipid digliserol tetraeter. Sel-sel berbentuk sferis,
spiral, dan lempeng atau batang juga ada bentuk unisellular dan multisellular.
Berdasarkan genom
2


5. Taksonomi
Taksonomi bakteri
Untuk membatasi kelompok organisme dalam suatu bakteri yang dapat membagi kelompok
menjadi biotipe dan mengelompokkan spesies berdasarkan genus. Pengelompokkan yang lebih
luas seperti famili. Urutan formal dalam taksonomi bakteri diuraikan sebagai berikut:
Kerajaan, divisi, kelas, ordo, famili, genus, spesies. Untuk tujuan praktis, hanya susunan famili,
genus, dan spesies yang sering digunakan.


Taksonomi numerik
Menggambarkan persamaan, kemiripan dan perbedaan karakteristik bakteri. Jaccard similarity
coefficient (Sj) menyatakan sifat-sifat yang positif saja. Sedangkan simple matching
coefficient (Ssm) menyatakan sifat-sifat yang positif dan negatif. Koefisien-koefisien
menggambarkan sifat-sifat yang sama diantara organisme-organisme.
2


6. Fisiologi Bakteri
Faktor-faktor yang harus diatur selama pertumbuhan mikroorganisme adalah zat makanan, pH,
temperatur, konsentrasi garam, dan kekuatan ionik.
1. Temperatur (suhu)
Tiap-tiap bakteri mampunyai temperatur optimum, agar bakteri dapat tumbuh dengan baik.
Terutama untuk pembelahan sel, karena sangat peka pada pengaruh temperatur tinggi. Terdapat
batas-batas suhu pertumbuhan bakteri, yaitu:
a. Psikhrofilik: -5
o
C 30
o
C dengan optimum 10
o
20
o
C
b. Mesofilik: 10
o
45
o
C dengan suhu optimum 20
o
45
o
C
c. Termofilik: 25
o
80
o
C dengan suhu optimum 50
o
60
o
C
1

Sebagian besar organisme adalah mesofilik, dengan 30
o
C merupakan suhu optimal beberapa
mikroba yang hidup bebas, dan temperatur pejamu adalah suhu optimal untuk simbiosis hewan
berdarah panas.
Mikroorganisme memiliki respon syok panas dan dingin. Respon syok panas berupa sintesis
sesaat seperangkat protein syok panas, bila terkena suhu yang tiba-tiba meningkat di atas suhu
optimum pertumbuhan. Protein-protein tersebut sangat tahan terhadap panas dan dapat
menstabilkan protein sel yang sensitif panas. Sedangkan syok dingin ialah pembunuhan sel
akibat pendinginan yang cepat. Namun sejumlah senyawa dapat melindungi sel dari pembekuan
atau syok dingin, yaitu dengan gliserol dan dimetil sulfoksida paling sering digunakan.
2

2. pH
sebagian besar bakteri patogen memiliki pH optimum 7,2 7,6.
1

berbagai rentang pH pada organisme:
a. neutralofil tumbuh pada pH 6,0 8,0, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 7,5 pada
pH eksternal 5,5 8,5.
b. Asidofil memiliki pH optimum 3,0, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 6,5 pada pH
eksternal 1,0 5,0.
c. Alkalifil memiliki pH optimum 10,5, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 9,5 pada pH
eksternal 9,0 11,0.
pH internal diatur oleh sistem transport proton dalam membran sitoplasma, termasuk sistem
transport primer.
3. Nutrisi (zat makanan)
a. Karbon
Karbon organik diperlukan oleh bakteri heterotrof untuk pertmbuhan. Selain itu karbon dioksida
diperlukan untuk beberapa reaksi biosintetik.
b. Nitrogen
Nitrogen adalah komponen utama dari protein dan asam nukleat. Banyak mikroorganisme
memiliki kemampuan untuk mengasimilasi nitrogen menjadi bentuk paling tereduksi yaitu ion
amonium. Kemampuan mengasimilasi nitrogen secara reduktif melalui NH
3
disebut fiksasi
nitrogen, adalah suatu sifat unik pada prokariot, dan relatif sedikit bakteri yang memiliki
kapasitas metabolik ini.
c. Sulfur
Sulfur adalah komponen dari banyak substansi sel organik. Sulfur membentuk sebagian struktur
beberapa koenzim dan ditemukan pada rantai samping protein. Beberapa bakteri autotrofik dapat
mngoksidasinya menjadi sulfat, untuk digunakan sebagai sumber sulfur yang mereduksi sulfat
menjadi hidrogen sulfida yang bersifat toksik bagi organisme lain.
d. Fosfor
Fosfor diperlukan untuk komponen ATP, asam nukleat, dan koenzim seperti NAD, NADP, dan
flavin.
e. Mineral
Mineral diperlukan untuk fungsi enzim. Ion magnesium dan kalium penting untuk fungsi dan
integritas ribosom. Ca
2+
untuk komponen dinding sel gram positif.
4. kekuatan ionik dan tekanan osmotik
faktor-faktor seperti tekanan osmotik dan konsentrasi garam perlu diperhatikan. Terdapat bakteri
yang yang memrlukan kadar garam yang tinggi, disebut halofilik. Selain itu terdapat bakteri yang
memerlukan tekanan osmotik yang tinggi disebut osmofilik.
1

Sebagian besar bakteri mampu menoleransi tekanan osmotik dan kekuatan ionik eksternal yang
sangat bervariasi karena kemampuannya untuk mengatur osmolalitas dan konsentrasi ion
internal. Osmolaritas ionik diatur oleh transpor aktif ionik K
+
ke dalam sel, kekuatan ionik
internal dipertahnakn konsentan dengan kompensasi ekskresi puteresin (poliamin organik
bermuatan positif).
2


7. Pertumbuhan Bakteri
Definisi
Pertumbuhan adalah peningkatan jumlah semua komponen organisme secara teratur.
Syarat pertumbuhan
Syarat pertumbuhan adalah:
a. Adanya sel hidup
b. Ada sumber energi
c. Ada nutrisi dan faktor pertumbuhan
d. Tidak ada inhibitor
1

Perkembangbiakkan dapat berlangsung secara seksual dan aseksual
2

pertumbuhan secara aseksual, yaitu:
a. Pembelahan biner
umumnya bakteri berkembang biak secara amitosis dengan membelah menjadi 2 bagian (binary
division). Waktu diantara 2 pembelahan disebut generation time dan ini berlainan untuk setiap
jenis kuman, bervariasi antara 20 menit sampai 15 jam, contohnya Mycobacterium yang
mempunyai generation time 15 jam
b. Pembelahan tunas/cabang
pertumbuhan dengan cara ini akan didahului dengan pembentukkan tunas yang kemudian
menjadi cabang dan akhirnya cabang tersebut memisahkan diri dan membentuk bakteri yang
baru. Contoh bakteri yang memakai cara ini adalah bakteri dari famili Streptomycetacea.
c. Pembentukkan filamen
Pada pembentukkan filamen, sel akan mengeluarkan serabut panjang, filamen tidak bercabang.
Bahan kromosom kemudian masuk ke dalam filamen. Lalu filamen terputus-putus menjadi
beberapa bagian dan setiap bagian tersebut membentuk bakteri yang baru.

Perkembangbiakkan secara seksual
Pembelahan bakteri disini didahului oleh peleburan bahan kromosom dari 2 bakteri. Akibatnya
timbul sel-sel bakteri dengan sifat yang berasal dari kedua sel induknya. Pembelahan semacam
ini hanya terjadi pada famili Enterobacteriaceae, antara Escherichia coli, antara Salmonella
typhosa. Jika bakteri ditanam pada waktu-waktu tertentu dan ditinjau berdasarkan jumlah bakteri
yang hidup, maka dibagi menjadi 4 fase, yaitu:
1. fase penyesuaian (lag phase)
fase penyesuaian menggambarkan suatu periode dimana sel-sel yang kekurangan metabolit dan
enzim akibat adanya kondisi yang tak menguntungkan pada akhir riwayat biakan sebelumnya,
beradaptasi dengan lingkungan baru. Fase ini berlangsung selama 2 jam. Bakteri belum
berkembang biak tapi aktivitas metabolitnya tinggi.
2. Fase pembelahan (logarhytmik phase/exponential phase)
Bakteri mulai berkembang biak dengan berlipat 2, jumlah bakteri akan meningkat secara
eksponensial. Pada pertengahan fase ini, pertumbuhan bakteri sangat ideal, terjadi secara teratur,
dan semua bahan dalam sel berada dalam keadaan seimbang. Fase ini berlangsung selama 18 -
24 jam.
3. Fase stasioner
Dengan meningkatnya jumlah bakteri dari fase sebelumnya, meningkat pula jumlah hasil
metabolisme yang toksis. Akibatnya, mulai ada yang mati dan pembelahan terhambat. Pada
suatu saat, jumlah bakteri yang hidup sama dengan jumlah yang mati.
4. Fase kemunduran/penurunan (period of decline)
Pada fase ini, jumlah bakteri yang hidup berkurang. Beberapa jenis bakteri timbul bentuk-bentuk
abnormal (bentuk involusi).
Gambar 5: fase pada perkembangbiakkan seksual





5. Pengukuran pertumbuhan
1

1. Pengukuran diukur melalui biomassa sel
Pada prinsipnya, biomassa dapat diukur dengan
menentukan berat kering biakkan mikroba setelah
dicuci dengan air suling. Perhitungan konstanta kecepatan (k) pertumbuhan dapat menentukkan
jumlah pertumbuhan yang terjadi pada perode waktu tertentu maupun menentukkan waktu yang
diperlukan selama pertumbuhan.
Rumus :

log
10
B
1
= k(t
1
-t
0
)
B
0
2,3
k = ln 2
t
d

keterangan:
1. K=kecepatan pertumbuhan
2. B
1
=biomassa pada waktu 1(t1)
3. B
0
=biomassa pada waktu nol(t0)
4. t
1
-t
0
=perbedaan waktu
5. t
d
=waktu penggandaan (waktu generasi)


Tabel 1: data waktu generasi pada beberapa bakteri
3

Nama Bakteri Waktu generasi (menit)
Escherichia coli 17
Bacillus megaterium 25
Rhizobium japonicum 344 461
Mycobacterium tuberculosis 792 932
Treponema pallidum 1980

2. Pengukuran diukur melalui konsentrasi sel (jumlah sel yang dapat hidup per unit volume
biakan).
Jumlah sel yang hidup biasanya dianggap sebagai konsentrasi sel. Dalam menggunakan ukuran
rubidimetrik, terdapat korelasi antara tingkat kekeruhan dengan jumlah sel yang hidup. Di dalam
perhitungannya, pengukuran kecepatan sel diukur melalui konsentrasi sel hampir sama dengan
pengukuran kecepatan sel diukur melalui biomassa, dimana dengan mengganti B, konsentrasi
biomassa, dengan N, konsentrasi sel.

Rumus:

t
1
- t
o
= 2,3 log10 (N
1
/N
2
)
k
keterangan :
1. K = kecepatan pertumbuhan
2. N
1
= konsentrasisel pada waktu 1(t1)
3. N
0
= konsentrasi sel pada waktu nol(t0)
4. t
1
- t
0
= perbedaan waktu


8. Metabolisme Kuman
1

Metabolisme adalah seluruh proses pengolahan setelah bahan makanan masuk ke dalam
sel. Enzim-enzim yang berperan penting dalam metabolisme:
1. Dehidrogenase (melancarkan reaksi reduksi oksidasi metabolit)
2. Flavoprotein (transport zat H dalam proses respirasi)
3. Sitokrom (proses respirasi pada kuman aerob untuk transport H ke O
2
)
Metabolisme dibagi dua:
1. Anabolisme/asimilasi: meliputi proses sintesa (pembangunan)
2. Katabolisme/desimilasi: meliputi proses degradasi (perombakan)
a. Fermentasi
Fermentasi dengan pembentukan asam campuran khusus untuk famili Enterobacteriaceae.
Fermentasi dengan pembentukan asam butirat dilakukan oleh kebanyakan Clostridium.
b. Respirasi
Aerob: Glikolisis diteruskan hingga piruvat terpecah menjadi CO
2
dan H
2
O sehingga
menghasilkan ATP dan O
2
sebagai reseptor H. Urutan enzim yang dipakai dalam transport zat H
ke O
2
dalam rantai respirasi ini adalah flavoprotein, sitokrom b, sitokrom c, sitokrom a dan O
2

Anaerob: Zat organik seperti nitrat atau sulfat dan bukan O
2
yang berfungsi sebagai reseptor.


c. Metabolisme Karbohidrat
Karbohidrat dipecah menjadi triosa dalam bentuk fosfat dan piruvat. Enzim yang berperan dari
golongan glikosidase dan fosforilase. Dimana menghasilkan piruvat, 2 NADH dan ATP dengan
cara:
melalui pentose fosfat
cara ini dipakai untuk kuman yang tidak mempunyai enzim aldolase dan triosa PO
4
isomerase
yang diperlukan EMP.
menurut Entner Doudoroff
Melalui pembentukan deoksiglukonat. Cara ini dipakai pada beberapa Pseudomonas dan
Escherichia coli.
d. Metabolisme zat lemak
Permulaan reaksi diperlukan pengaktifan asam lemak dengan CoA dan sebagai hasil adalah
gliserol dan asetil CoA
e. Metabolisme protein
Sintesa protein memerlukan nitrosa yang biasanya diambil dari medium dalam bentuk NH
3
atau
NO
3 .
Sintesa protein mengikuti DNA gen memberikan pola yang menentukan pada sintesa DNA
sendiri dan RNA. RNA sebagai pembawa berita dari DNA yang menentukan sintesa protein.
Fermentasi asam amino dilakukan oleh beberapa Clostridium seperti:
Alanin + 2 glisin +2 H
2
O + 2H
2
O 3 as.asetat + 3 NH
3
+ CO
2


Cara penularan bakteri
Berdasarkan habitat alam bakteri:
1. Tanah
Kebanyakan mikroorganisme di tanah bersifat patogen bagi manusia. Bakteri pathogen yang
terdapat di tanah antara lain:
- Clostridium tetani (agen penyebab penyakit tetanus)
- Bacillus anthracis
2. Air
Kebanyakan air tawar dan laut mengandung mikroorganisme. Namun, bakteri patogen
umumnnya tidak terdapat kecuali di air yang secara langsung tercemar oleh urin dan feses
manusia dan binatang. Mikroorganisme patogen di air misalnya: Vibrio cholerae (agen penyebab
penyakit kolera).
3. Udara
Walaupun bakteri sering ditemukan di udara, mereka sebenarnya tidak berkembang biak disana.
Udara luar jarang mengandung kuman patogen,karena efek pengeringan, ozon, dan
radiasi UV. Udara dalam ruangan mengandung bakteri patogen yang berasal dari
kulit, tangan, pakaian, dan terutama dari saluran pernapasan manusia.
1

contohnya: Mycobacterium tuberculosis (dapat menyebabkan penyakit TBC) melalui saluran
pernapasan.
4. Makanan
5

Terjadi melalui pangan atau makanan /minuman yang tercemar bakteri.
Contoh : - Shigella (penyebab disentri)
- Staphilococcus aures (paling banyak menyebabkan keracunanmakanan biasanya terdapat di
pangan yang mengandung protein misalnya daging ikan susu, serta produk yang dikonsumsi
dingin seperti salad dan pudding dengan gejala muntah)

9. Pewarnaan Kuman
1

Pewarnaan pada kuman dilakukan untuk mempelajari morfologi, struktur, sifat-sifat kuman.
Faktor-faktor untuk memperoleh pewarnaan yang baik adalah:
Gelas alas bersih dan bebas lemak.
Umur biakan: 18-24 jam, karena kuman yang umur biakannya lebih dari 24 jam akan mengalami
perubahan dalam morfologi dan strukturnya.
Kualitas zat warna.
Tebal tipisnya sediaan. Bila sediaan terlalu tebal atau tidak rata, maka penetrasi zat warna akan
berbeda-beda.
Jenis-jenis pewarnaan kuman:
Pewarnaan negatif
Pewarnaan sederhana
Pewarnaan khusus
Pewarnaan diferensial

1) Pewarnaan negatif:
Suspensi kuman dibuat dalam zat warna negrosin atau tinta bak disebar-ratakan dengan gelas
alas lain. Kuman tidak diwarnai dan tampak sebagai benda-benda terang dengan latar belakang
hitam. Pewarnaan ini dipakai untuk kuman yang sukar diwarnai,
misalnya:spirochaeta (Treponema, Leptospira, dan Borrelia)
Gambar 6: pewarnaan negatif
4


2) Pewarnaan sederhana:
Pewarnaan yang dilakukan hanya dengan 1 warna, misalnya biru metilen, air fukhsin, atau ungu
kristal selama 1-2 menit. Zat warna anilin mudah diserap oleh kuman.
3) Pewarnaan khusus:
Pewarnaan ini dilakukan untuk mewarnai bagian-bagian kuman yang sukar diwarnai dengan
warna biasa. Misalnya:
a) Flagel dengan pewarnaan gray
b) Simpai dengan Pewarnaan Muir, Hiss, Gins Burri
c) Spora dengan pewarnaan Klein
d) Inti dengan pewarnaan Feulgen
e) Difteri dengan pewarnaan Neiser untuk melihat granula Babes-Ernest
f) Spirokhaeta dengan pewarnaan Becker-Krantz dan pewarnaan Fontana Tribondeau.




4) Pewarnaan Diferensial
Pewarnaan diferensial adalah pewarnaan yang menggunakan lebih dari satu zat warna.
Pewarnaan ini dibagi menjadi 2:
1. Pewarnaan Gram adalah pewarnaan diferensial yang sangat penting yang membantu determinasi
suatu kuman. Pewarnaan ini ditemukan oleh Christian Gram pada tahun 1884. Dan dibutuhkan
untuk membedakan kuman yang Gram (+) atau Gram (-).
2. Pewarnaan tahan asam (acid fast staining). Misalkan pewarnaan Ziehl Neelsen
dan Kinyoun-Gabbet untuk membedakan kuman-kuman yang tahan asam dari yang tidak
tahan asam.
Pewarnaan Gram
Cara pewarnaan:
1. Sediaan yang sudah direkat diwarnai dengan karbol kristal ungu selama 5 menit.
2. Zat warna dibuang dan diganti dengan larutan lugol (larutan I
2
+ KI) dibiarkan
selama 45-60 detik.
3. Larutan lugol dibuang dan sediaan dicuci dengan alkohol 96% selama 30 detik.
4. Sediaan dicuci dengan air dan diwarnai dengan air fukhsin selama 1-2 menit.
Sediaan dicuci, dikeringkan, kemudian diamati di mikroskop.
Keterangan:
1. Setelah diberi karbol ungu kristal semua kuman akan berwarna ungu, zat warna
akan diserap dalam dinding sel dan protoplasma.
2. Pemberian lugol menyebabkan terbentuknya komplek ungu kristal-iodium yang
berwarna ungu tengguli kotor.
3. pencucian dengan alkohol akan menyebabkan terjadinya diferensiasi:
a. Kuman tetap berwarna ungu.
b. Kuman tidak berwarna, sebab zat warna akan dilarutkan oleh alkohol.
4. Fukhsin sebagai pewarna kontras (counterstain) mewarnai kuman yang tidak
berwarna menjadi merah.

Hasil yang dapat dibaca dari pewarnaan Gram adalah sebagai berikut:
- Kuman Gram positif akan berwarna ungu
- Kuman Gram negatif akan berwarna merah
Teori Permeabilitas dinding sel, teori ini berdasakan tebal tipisnya lapisan peptidoglikan dalam
dinding sel. Kuman Gram positif memiliki lapisan peptidoglikan yang tebal yaitu 30 lapisan serta
dinding sel yang kompak, sehingga permeabilitas dinding selnya kurang dan kompleks kristal
ungu-iodium tidak dapat keluar atau dipertahankan. Kuman Gram negatif mempunyai lapisan
peptidoglikan yang tipis, hanya 1-2 lapisan dan susunan dinding sel yang kurang kompak.
Sehingga permeabilitas dinding selnya kuat yang akan memungkinkan terlepasnya kristal ungu-
iodium keluar sel.
Pewarnaan tahan asam
- Pewarnaan Ziehl-Neelsen
Cara pewarnaan:
1. Sediaan kuman diwarnai dengan larutan fukhsin karbol dan dipanaskan dengan api kecil selama
5 menit.
2. Sediaan dicuci dengan air dan dimasukkan dalam larutan H
2
SO
4
5% selama 2 detik.
3. Kemudian dicuci dengan alkohol 60% sehingga tidak ada warna merah mengalir.
4. Sediaan dicuci dengan air kemudian diwarnai dengan pewarnaan biru metilen selama 1-2 menit,
dicuci dengan air, lalu keringkan.
Hasil yang dapat dibaca dari pewarnaan Ziehl-Neelsen adalah:
- Kuman tahan asam berwarna merah
- Kuman tak tahan asam berwarna biru
Sesudah diberi alkohol, kuman yang tahan asam akan berwarna merah danmempertahankannya
dikarenakan lapisan dinding sel kuman ini terdapat asam mikolat.Sedangkan kuman yang tidak
tahan asam akan melepaskan warna merahnya.
- Pewarnaan Kinyoun-Gabbet
Cara pewarnaan:
1. Sediaan kuman diwarnai dengan larutan kinyoun selama 3 menit dan dicuci dengan air.
2. Sediaan diwarnai dengan larutan Gabbet selama 1 menit, dicuci dengan air kemudian
dikeringkan.
Ditemukannya kuman tahan asam dalam sputum penderita seringkali dihubungkan dengan
penyakit tuberkulosis. Sebenernya hasil ini hanya menunjukkan adanya kuman tahan asam dan
kuman yang ditemukan mungkin juga bukan kuman tuberkulosis.
1

Gambar 7: pewarnaan Gram
4







Gambar 8: pewarnaan tahan asam
4




10. Flora Normal
Flora normal: sekumpulan mikroorganisme yang hidup pada kulit dan selaput lendir (mukosa)
pada manusia normal dan sehat.
2

Flora normal pada kulit manusia
2

- Flora tetap (resident flora): terdiri dari mikroorganisme tertentu pada bagian tubuh tertentu dan
jika berubah akan kembali seperti semula.
- Flora tidak tetap (transient flora): terdiri dari mikroorganisme nonpatogen atau potensial patogen
yang tinggal di kulit atau mukosa selama beberapa jam, hari, atau minggu yang berasal dari
lingkungan, tidak menimbulkan penyakit dan tidak hidup menetap. Jika flora tetap berubah,
maka flora sementara akan melakukan kolonisasi, berkembang biak, dan menyebabkan penyakit.
Flora normal pada mulut dan saluran pernapasan
1

Bagian yang mengandung mikroorganisme adalah mulut, nasofaring, orofaring, tonsil. Bagian
yang steril laring, trakea, bronkus, bronkiolus, alveolus. Mikroorganisme pada
mulut: Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Enterococcus. Mikroorganisme
pada faring: Neisseria. Infeksi pada mulut dan saluran nafas bagian atas meliputi bakteri
anaerob.
Flora normal pada saluran pencernaan
2

pH asam lambung melindungi lambung dari infeksi patogen usus seperti
cholerae.Mikroorganisme pada usus bagian atas adalah laktobasili dan enterokokki.
Mikroorganisme di kolon: Eubacteria, Clostridium, Streptococcus. Bakteri usus berperan dalam
sintesis vitamin K, penyerapan zat makanan, dan perlawanan terhadap mikroorganisme patogen.
Flora normal saluran urogenitalis
1

Mikroorganisme dapat ditemukan di genitalia eksterna, uretra anterior, dan vagina.Dalam flora
normal vagina ditemukan Streptokokus hemilitikus grub B,peptostreptokokus. Pada pubertas
terdapat flora yang menetap selama masa dewasa, yaitu: Lactobasillus, Micrococcus,
Staphylococcus epidermidis. Pada wanita hamil terdapat Streptococcus algalactica.



11. Sistem Imun
A) Perlawanan imunologik terhadap mikroorganisme di luar sel
1) Fagositosis
Fagositosis adalah merupakan mekanisme tubuh untuk melawan benda asing yang masuk ke
dalam tubuh dan pelakunya adalah:
- monosit, yang di dalam jaringan menjadi makrofag
- leukosit polimorfonukleas (PMN)
Kedua jenis tersebut berasal dari sel primitif sumsum tulang di mana sel tersebut umumnya telah
dewasa. Lalu masuk ke sirkulasi darah yang pada PMN bertahan selama 6-7 jam dan kemudian
masuk ke dalam jaringan di mana sel tersebut bertahan 4-5 hari, sedangkan monosit bertahan
dalam sirkulasi selama 1-3 hari sebelum masuk ke dalam jaringan, baik monosit dan PMN
setelah dilepas dari sumsum tulang, umumnya tidak lagi mengalami mitosis (pembelahan diri).
Sehingga kebutuhan yang meningkat akan fagosit dalam perlawanan terhadap infeksi diperoleh
dari pelepasan yang lebih banyak fagosit dari persediaan yang ada dalam sumsum tulang. Kedua
sel tersebut diatur oleh mekanisme saraf dan faktor-faktor dalam serum, dan ini terjadi pada
infeksi kuman atau virus.
2) Kemotaksis
Peranan utama sistem kekebalan bagi fagositosis ialah menarik PMN dan monosit ke tempat
terjadinya interaksi antara antibodi atau limfosit kebal dengan mikroorganisme, faktor
kemotaksis yang dibebaskan limfosit-T yang mengalami mitosis setelah terikat dengan antigen
atau terbentuk akibat komplek antigen-antibodi.
3) Perlekatan
Langkah pertama dalam fagositosis, ialah melekatkan mikroorganisme pada fagosit. Banyak
kuman atau patogen yang mampu menghindar (resisten) pada perlekatan itu, sehingga resistensi
merupakan faktor yang memperbesar virulensinya. Dalam hal ini diperlukan opsonisasi (siap
dimakan), perlekatan ini terjadi melalui:


- ikatan Fe
Monosit dan leukosir polimorf mempunyai reseptor untuk fragmen Fe dari subklas IgG tertentu
yang terikat pada antigen, jenis IgG tersebut, yang spesifik terhadap antigen mikroorganisme
dapat mengikat mikroorganisme tersebut dengan fragmen Fe melekat pada fagosit. Dengan
demikian terjadi perlekatan pada fagosit.
- Ikatan C3
Monosit dan leukosit polimorf mempunyai reseptor untuk C3b yang aktif, sehingga adanya
komplemen, kompleks mikroorganisme dengan antibodi pengikat menimbulkan opsonisasi (siap
untuk dimakan). Biasanya ini terjadi pada tubuh yang belum memiliki kekebalan spesifik.
- Proses immune adherence
Opsonisasi melalui pengikatan C3 dapat dihalangi oleh inaktifator C3b yang didapat di dalam
serum. Kompleks mikroorganisme antibodi yang terikat dengan C3 yg aktif dapat juga melekat
pada eritrosit karena eritrosit terdapat dalam jumlah yang besar. Ternyata mekanisme ini penting
terhadap kuman Gram negatif dalam sirkulasi.
- Antibodi spesifik terhadap makrofag
Antibodi sitofilik yang tidak terikat dengan antigen dapat menempel pada monosit atau makrofag
(fagosit ini mempunyai reseptor atau Fe tertentu), bila antibodi bersangkutan homolog dengan
antigen mikroorganisme maka perlekatan mikroorganisme tersebut akan terjadi.
- Hambatan aktifitas blokade oleh produk kuman
Dengan adanya antibodi spesifik terhadap protein A stafilokokus, maka kuman bebas dari
hambatan opsonisasi, baik dengan IgG maupun oleh C3.
4) Pencaplokan dan penghancuran mikroorganisme (ingesti dan destruksi)
Setelah mikroorganisme melekat pada fagosit, maka pseudopodia direntangkan mengurung
mikroorganisme tersebut dengan membentuk suatu vesikel di dalam sel (fagosom), fagosom ini
kemudian bergabung dengan lisosom dalam sitoplasma menjadi fagolisosom, di dalam
fagolisosom mikroorganisme mati dan dihancurkan melalui mekanisme yang tergantung pada
oksigen dan mekanisme yang tidak tergantung pada oksigen.
- dalam mekanisme yang tidak tergantung pada oksigen, termasuk pH rendah dalam vakuola,
lisosim, protein kationik granuler, proteasa, lipasa dan glikolipasa. Lisosom sendiri bersifat
meosis berapa jenis mikroorganisme, tetapi juga dapat memperbesar efek pada mikrobasid
mekanisme lain.
- mekanisme yang tergantung oksigen terjadi oleh adanya peroksidase intra seluler. Peroksida
secara langsung mempunyai efek mikrobasid yang diperoleh melalui pembentukan gugus-gugus
yang reaktif, seperti hidroksil reaktif, dan oksigen tunggal reaktif, dan anion superoksida.
1


12. Bacillus anthracis
Definisi
Bakteri yang menyebabkan penyakit anthrax pada hewan herbivora, contoh kambing, domba,
lembu, kuda, sapi, dan lain-lain. Hewan lainnya (misalnya tikus) relatif resisten terhadap infeksi
bakteri ini. Terkadang manusia dapat terinfeksi jika kontak dengan hewan yang terinfeksi.
2

Morfologis:
Batang dengan ukuran 1 x 3-4 m, dapat tersusun seperti bambu. Spora sentral. Gerak negatif.
Gram positif, aerob, membentuk rantai.
Pada kultur tampak koloni putih abu-abu, tepi seperti rambut, tidak ada hemolisis pada agar
darah.
Termasuk organisme saprofit yang lazim terdapat dalam tanah, air, udara dan tumbuh-tumbuhan.
1




Gambar 9: struktur antrax
8


Gambar 10: B. anthracis pada agar darah
9


Taksonomi
7


- Kingdom: bacteria
- Phylum: firmicutes
- Class: bacilli
- Orde: bacillales
- Family: bacillaceae
- Genus: bacillus
- Species: B. anthracis
Fisiologis
a. pH: 6,5 di dalam tanah (dalam keadaan spora)
b. suhu: tinggi ataupun rendah (dalam keadaan spora) dalam waktu yang cukup lama dan dapat
bertahan selama bertahun-tahun pada tanah yang kering.
c. lingkungan: sporanya resisten terhadap perubahan lingkungan
d. nutrisi: basil saprofit menggunakan sumber nitrogen dan karbon sederhana untuk energi dan
pertumbuhannya.
2

Cara penularan
Pada manusia kuman anthrax dapat menyebabkan:
1. Infeksi kulit: penularan lewat kulit yang terluka. Kulit yang terinfeksi spora akan mengalami
iritasi dan kulitnya menjadi hitam
1

Gambar 11: infeksi kulit
10


2. Infeksi paru-paru: Wool sorters disease yang terjadi karena inhalasi spora dari bulu domba.
Biasanya penyakit ini fatal.





Gambar 12: infeksi paru-paru
11


3. Infeksi pada usus: menyebabkan infeksi pada usus halus yang disertai dengan gangren.
Penyebabnya adalah karena makan daging yang terinfeksi anthrax.
Proses masuknya B. anthracis ke dalam tubuh:
1. B. anthraticus masuk ke dalam tubuh dalam bentuk spora.
2. Spora kemudian diserang oleh sistem kekebalan tubuh.
3. Dalam sistem kekebalan tubuh, spora anthrax aktif dan mulai berkembang biak dan
mengeluarkan 2 racun, yaitu toksin edema dan toksin lethal. PA berikatan dengan EF
membentuk toksin edema. PA dan LF membentuk toksin lethal, yang merupakan faktor virulensi
utama dan menyebabkan kematian pada hewan yang terinfeksi.
4. Racun yang dikeluarkan B. anthracis terdiri dari 3 protein:
- PA (protective antigen)
- EF (edema factor)
- LF (lethal factor)
2






13. ANTIBIOTIK
Definisi
Zat yang dihasilkan oleh suatu mikroba. Terutama fungi, yang dapat menghambat/dapat
membasmi mikroba jenis lain
Obat yang digunakan untuk membasmi mikroba penyebab infeksi pada manusia

Penggolongan
Sifat toksisitas selektif
- Antimikroba yang bersifat menghambat pertumbuhan mikroba (bakteriostatik)
- Antimikroba yang bersifat membunuh (bakterisid)
Kadar minimal
- Kadar hambat minimal (KHM)
- Kadar bunuh minimal (KBM)
Jadi antimikroba tertentu aktivitasnya dapat meningkat dari bakteriostatik menjadi bakterisid bila
kadar antimikrobanya ditingkatkan melebihi (KHM).

Mekanisme Kerja
1. Antimikroba yang menghambat metabolisme sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: Sulfonamid,trimetoprim, asam p-aminosalisilat (PAS) dan Sulfon
Mekanisme:
Kuman pathogen mensintesis sendiri asam folat dari asam benzoate (PABA) untuk kebutuhan
hidupnya.
- Sulfonamid (sulfon)
Jika sulfonamide (sulfon) menang terhadap PABA, maka PABA akan bergabung dengan
sulfonamide (sulfon) untuk membentuk asam folat dan membentuk analog asam folat yang
nonfungsional akibatnya kehidupan mikroba terganggu.
- Trimetoprim
Efek sulfonamide dapat diatasi oleh mikroba dengan cara meningkatkan kadar PABA, tetapi
harus mengubah dihidrofolat menjadi asam tetra hidropolat. Enzim dihidrofolat reduktanse yang
berperan dihambat oleh trimetoprim sehingga asam dihidrofolat tidak dapat direduksi menjadi
asam tetrahidrofolat yang fungsional.
- PAS
Merupakan analog PABA dan bekerja dengan menghambat sintesis asam folat pada M.
tuberculosis. Karena sulfonamide tidak efektif terhadap M. Tuberculosis, sebaliknya PAS tidak
efektif terhadap bakteri yang sensitive terhadap sulfonamide.
2. Antimikroba yang menghambat sintesis dinding sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: penisilin, sefalosporin, basitrasin, vankomisin, dan sikloserin
Mekanisme:
Dinding sel bakteri terdiri dari polipeptidoglikan menjadi suatu polimer nukleopeptida
(glikopeptida). Sikloserin menghambat reaksi yang paling awal dalam proses sintesis dinding sel
diikuti berturut-turut oleh basitrasin, vankomisin dan diakhiri oleh penisilin dan sefalosporin.
Akibatnya tekanan osmotik didalam sel kuman lebih besar dari luar maka kerusakan dinding sel
kuman akan mengakibatkan terjadinya lisis, yang merupakan dasar efek bakterisidal pada kuman
yang peka.
3. Antimikroba yang mengganggu keutuhan membrane sel mikroba
Efek: bakterisid.
Kelompok antimikroba: polimiksin, golongan polien, berbagai antimikroba kemoterapeutik
(antiseptic surface active agent).
Mekanisme:
- Polimiksin
Polimiksin akan merusak membrane sel setelah bereaksi dengan fosfat pada fosdolipid
membrane sel mikroba.
- Golongan polien
Antibiotic polien bereaksi dengan sterol yang terdapat pada membrane sel fungus yang akan
mempengaruhi permeabilitas selektif membrane.
- Antimikroba kemoterapeutik
Antiseptic surface active agent akan merusak permeabilitas selektif membrane sel mikroba
menyebabkan komponen penting dalam sel mikroba yaitu protein, asam nukleat, nukleotida dll
akan keluar.



4. Antimikroba yang menghambat sintesis protein sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: golongan amino glikosid, makrolid, linkomisin, etrasiklin, dan
kloramfenikol.
Mekanisme:
Pada bakteri ribosom terdiri dari dua unit berdasarkan konstanta sedimentasinya dinyatakan
sebagai ribosom 30s dan 50s. kedua komponen ini akan bersatu pada pangkal rantai mRNA
menjadi ribosom 70s
- Golongan aminoglikosid (streptomisin)
Streptomisin akan berikatan dengan komponen ribosom 30s menyebabkan kode pada mRNA
salah dibaca oleh tRNA saat sintesis protein. Akibatnya terbentuk protein yang abnormal dan
nonfungsional bagi sel mikroba
- Golongan aminoglikosid (gentamisin, kanamisin, dan neomisin)
Memiliki mekanisme yang sama namun potensinya berbeda-beda
- Eritromisin
Eritromisin akan berikatan dengan ribosom 50s dan menghambat translokasi kompleks tRNA
peptide dari asam amino ke lokasi peptida menyebabkan rantai polipeptida tidak dapat
diperpanjang karena lokasi asam amino tidak dapat menerima kompleks tRNA asam amino yang
baru
- Linkomisin
Linkomisin berikatan dengan ribosom 50s dan akan menghambat sintesis protein
- Tetrasiklin
Tetrasiklin akan berikatan dengan ribosom 30s dan akan menhalangi masuknya kompleks tRNA-
asam amino pada lokasi asam amino
- Kloramfenikol
Kloramfenikol akan berikatan dengan ribosom 50s dan akan menghambat pengikatan asam
amino baru pada rantai polipeptida oleh enzim peptidil tranferase






5. Antimikroba yang menghambat sintesi asam nukleat sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok mikroba: rifampisin dan golongan kuinolon
Mekanisme:
- Riamfisin
Salah satu derivat riamfisin berikatan dengan enzim polimerase RNA sehingga menghambat
sintesis RNA dan DNA oleh enzim tersebut
- Golongan kuinolon
Golongan kuinolon menghambat enzim DNA girase pada kuman yang fungsinya menata
kromosom yang sangat panjang menjadi bentuk spiral hingga bisa muat dalam sel kuman yang
kecil
6


1. Definisi Bakteri
Bakteri adalah mikroorganisme prokariotik bersel satu yang memperbanyak diri dengan divisi
sel dan secara khas memiliki dinding sel.
1


2. Morfologi Bakteri
Kokus merupakan bekteri berbentuk bulat dapat tersusun sebagai berikut:
- mikrokokus adalah kokus tersendiri (single)
- diplokokus adalah kokus berpasangan dua-dua
- pneumokokus adalah diplokkus yang berbentuk lanset
- gonokokus adalah diplokokus yang berbentuk seperti biji kopi
- tetrade adalah kokus yang tersusun rapi dalam kelompok empat sel
- sarsina adalah kokus dalam kelompok delapan sel yang tersusun rapi dan berbentuk
seperti kubus
- streptokokus adalah kokus yang tersusun seperti rantai
- stafilokokus adalah kokus bergerombol tak teratur seperti untaian buah anggur
Basilus merupakan bakteri berbentuk batang dengan panjang variasi dua sampai sepuluh kali
diameter bakteri tersebut.
- kokobasilus adalah basil yang sangat pendek menyerupai kokus
- fusiformis adalah basil dengan kedua ujung batang meruncing
- streptobasilus adalah sel-sel bergandeng membentuk suatu filamen
Spiral:
- vibrio, berbentuk batang bengkok
- spirilum berbentuk spiral kasar dan kaku, tidak fleksibel dan dapat bergerak dengan flagel
- spirokhaeta berbentuk spiral halus, elastik dan fleksibel dapat bergerak dengan aksial filamen.
Contoh:
1. borrelia, berbentuk gelombang
2. treponema, berbentuk spiral halus dan teratur
3. leptospira, berbentuk spiral dengan kaitan satu atau kedua ujungnya
1

Gambar 1: morfologi bakteri
7



3. STRUKTUR DASAR SEL BAKTERI
Gambar 2: struktur sel
4






Kapsul.
o Kapsul adalah polimer yang membentuk selubung padat yang menyelimuti sel.
o Kapsul berperan dalam tingkat keinvasifan bakteri patogenik (sel yang berkapsul terlindung dari fagositosis kecuali
jika mereka diselubungi oleh antibodi antikapsular).
Dinding sel.
o Adalah lapisan selubung sel yang terletak di antara membran sitoplasma dan kapsul.
o bakteri gram positif, dinding sel tersusun atas peptidoglikan dan asam teikoat. Sedangkan pada bakteri gram negatif,
dinding sel tersusun atas peptidoglikan dan membran luar.
o Dinding sel berperan dalam proteksi terhadap osmotik & pembelahan sel.
o Komponen pada dinding sel:
a) Bakteri gram positif.
Peptidoglikan, terdapat 40 lembar lapisan peptidoglikan.
Asam teikoat & asam teikuronat, merupakan polimer yang larut dalam air. Asam teikoat membentuk antigen
permukaan utama karena terletak di permukaan luar dari lapisan peptidoglikan.
Polisakarida
b) Bakteri gram negatif.
Peptidoglikan, hanya terdapat satu atau dua lembar lapisan peptidoglikan.
Membran luar, merupakan struktur berlapis ganda.
Lipoprotein, berperan dalam menstabilkan membran luar dan merekatkannya ke lapisan peptidoglikan.
Membran Plasma/Sitoplasma.
Berperan dalam permeabilitas selektif & transport zat terlarut, transpor elektron & fosforilasi oksidatif pada spesies
aerobik.
50% membran plasma harus dalam keadaan semifluid (setengah cair) agar pertumbuhan sel dapat terus berjalan.
Nukleoid.
o Padanan nucleus pada eukariot, berupa rantai tunggal berbentuk melingkar.
o Beberapa bakteri memiliki tambahan DNA melingkar lain yang lebih kecil yang disebut plasmid.
Sitoplasma
o Adalah cairan sel.
Ribosom.
o Berperan dalam sintesis protein.
o Tersebar dalam sitoplasma.

Mesosom.
o Adalah invaginasi membran sitoplasma yang bergelung-gelung membentuk struktur khusus.
o Ada 2 tipe mesosom:
a) Mesosom septal, yang berfungsi membentuk dinding penyebrangan selama pembelahan sel.
b) Mesosom lateral
Flagella.
o Adalah alat tambahan seperti benang yang seluruhnya tersusun atas protein.
o Diameternya sekitar 12 30 nm.
o Flagella adalah organ pergerakan pada bakteri.
o Terbentuk dari ribuan molekul suatu subunit protein yang disebut flagellin.
o Ada 4 bentuk flagella:
a) Monotrik (flagella yang hanya terdapat pada satu ujung)
b) Lofotrik (flagel yang terdapat banyak pada satu ujung)
c) Amfitrik (flagel yang terdapat di kedua ujungnya)
d) Peritrik (flagel yang terdapat pada seluruh permukaan sel)
Gambar 3: bentuk flagel
4


Pili
o Pili (dari bahasa latin yang artinya rambut) atau fimbria (latin rumbai).
o Organ ini lebih pendek dan lebih halus daripada flagel.
o Tersusun atas subunit protein struktural yang disebut pilin.
o Protein minor, yang terletak pada ujung pili, menyebabkan bakteri dapat melekat pada sel lain.
o Pili dibagi dalam 2 kelas, yaitu:
a) Pili biasa, berperan dalam bakteri pathogen ke sel pejamu.
b) Pili seksual, berperan dalam perlekatan bakteri pada proses konjugasi.
Spora.
o Pada kondisi kekurangan nutria, tiap sel membentuk spora internal tunggal yang dilepaskan saat sel induk mengalami
otolisis.
o Spora adalah sel yang sedang beristirahat yang sangat resisten terhadap kekeringan, panas dan bahan-bahan kimia.
o Proses pembentukan spora dimulai ketika kondisi nutrisi kurang menguntungkan.
o Dinding spora relatif tidak permeabel, namun zat warna bias menembusnya dengan cara memanaskan preparat. Spora
diwarnai dengan malakit hijau atau karbolfuhsin.
o Sifat endospora :
a) Inti, merupakan potoplas suatu spora. Inti mengandung sebuah nukleus sempurna (kromosom).
b) Dinding spora, merupakan lapisan paling dalam yang mengelilingi membran dalam spora.
c) Korteks, merupakan lapisan paling tebal dari selubung spora. Peptidoglikan korteks sangat sensitif terhadap lisozim,
dan sifat autolisisnya berperan dalam pertumbuhan (germinasi) spora.
d) Selubung (coat), tersusun atas protein yang mirip keratin. Bersifat tidak permeable sehingga spora cenderung
resisten terhadap bahan kimia antibakteri.
e) Eksosporium, merupakan membran lipoprotein yang mengandung sejumlah karbohidrat.
2

Gambar 4: spora
4



















4. Klasifikasi Bakteri
Berdasarkan biokimia
setiap bakteri dapat dibedakan karakterisasi kimia dalam DNA bakteri menunjukkan kisaran
komposisi basa nukleotida yang luas sehingga terdapat kesamaan genetik meliputi tingkat
genetik berdasarkan
- komposisi basa DNA
- homologi sekuens DNA dan rRNA
- pola-pola metabolisme stabil yang dikontrol oleh gen
- polimer-polimer pada sel
- struktur organel dan pola regulasinya
Berdasarkan morfologi
Setiap bakteri dapat dibedakan menurut bentuknya dan ukuran. Dibedakan menjadi 3, yaitu:
- Cocus
- Bacillus (batang)
- Spiral
Berdasarkan sel
Dibedakan menjadi 2 yaitu, eubakteria terdiri dari berbagai bakteri yang lebih umum atau bakteri
sejati dan archaebakteria (bakteri purba) yang tidak menghasilkan peptidoglikan yang
membedakan dengan eubakteria. Terdapat empat utama dibedakan atas karakteristik dinding sel,
yaitu:
Eubakteria Gram Negatif yang mempunyai dinding sel
Bakteri ini merupakan kelompok bakteri heterogen yang mempunyai selubung sel kompleks
(jenis gram negatif) yang terdiri dari membran luar, lapisan peptidoglikan tipis di bagian dalam
dan membran sitoplasma. Sel berbentuk oval, batang lurus atau melengkung, heliks, beberapa
bentuk tersebut depan berselubung atau berkapsul. Anggota bakteri ini mungkin berupa bakteri
fototrofik atau nonfototrofik. Pergerakan jika ada, terjadi melalui flagel atau pergelinciran.
Eubakteria Gram positif berdinding sel
Kelompok bakteri ini mempunyai profil dinding sel jenis Gram positif. Sel-sel biasanya memberi
pewarnaan gram positif tetapi tidak selalu. Sel-sel dapat berbentuk sferis, batang atau filament.
Organisme tersebut secara umum bersifat heterotrof kemosintetikdan meliputi spesies aerob,
anaerob, dan fakultatif anaerob. Kelompok dalam kategori ini mencakup bakteri asporogenus
sederhana dan sporogenus.
Eubakteria yang tidak memiliki dinding sel
Bakteri ini adalah mikroorganisme yang tidak memiliki dinding sel (sering disebut sebagai
mikoplasma dan terdiri dari kelas mollicutes) dan tidak menyintesis prekursor peptidoglikan.
Bakteri tersebut diselubungi oleh suatu membran unit, yaitu membran plasma. Bakteri tersbut
menyerupai bentuk L. Mikoplasma adalah organisme yang sangat pleomorfik dan ukurannya
sangat kecil, bentuk dapat difiltrasi.
Arkhaebakteria
Organisme prokariot ini terutama ditemukan dalam lingkungan berair atau haitat terrestrial yang
ekstrem (tinggi garam, temperatur tinggi, anaerob) beberapa diantaranya adalah simbion dalam
saluran cerna hewan. Terdiri dari organisme fakultatif anaerob, anaob, dan aerob yang bersifat
kemolitotrof, heterototrof atau heterotrof fakultatif. Arkhaebakteria tidak memiliki dinding sel
peptidoglikan, memiliki isoprenoid diter atau lipid digliserol tetraeter. Sel-sel berbentuk sferis,
spiral, dan lempeng atau batang juga ada bentuk unisellular dan multisellular.
Berdasarkan genom
2


5. Taksonomi
Taksonomi bakteri
Untuk membatasi kelompok organisme dalam suatu bakteri yang dapat membagi kelompok
menjadi biotipe dan mengelompokkan spesies berdasarkan genus. Pengelompokkan yang lebih
luas seperti famili. Urutan formal dalam taksonomi bakteri diuraikan sebagai berikut:
Kerajaan, divisi, kelas, ordo, famili, genus, spesies. Untuk tujuan praktis, hanya susunan famili,
genus, dan spesies yang sering digunakan.


Taksonomi numerik
Menggambarkan persamaan, kemiripan dan perbedaan karakteristik bakteri. Jaccard similarity
coefficient (Sj) menyatakan sifat-sifat yang positif saja. Sedangkan simple matching
coefficient (Ssm) menyatakan sifat-sifat yang positif dan negatif. Koefisien-koefisien
menggambarkan sifat-sifat yang sama diantara organisme-organisme.
2


6. Fisiologi Bakteri
Faktor-faktor yang harus diatur selama pertumbuhan mikroorganisme adalah zat makanan, pH,
temperatur, konsentrasi garam, dan kekuatan ionik.
1. Temperatur (suhu)
Tiap-tiap bakteri mampunyai temperatur optimum, agar bakteri dapat tumbuh dengan baik.
Terutama untuk pembelahan sel, karena sangat peka pada pengaruh temperatur tinggi. Terdapat
batas-batas suhu pertumbuhan bakteri, yaitu:
a. Psikhrofilik: -5
o
C 30
o
C dengan optimum 10
o
20
o
C
b. Mesofilik: 10
o
45
o
C dengan suhu optimum 20
o
45
o
C
c. Termofilik: 25
o
80
o
C dengan suhu optimum 50
o
60
o
C
1

Sebagian besar organisme adalah mesofilik, dengan 30
o
C merupakan suhu optimal beberapa
mikroba yang hidup bebas, dan temperatur pejamu adalah suhu optimal untuk simbiosis hewan
berdarah panas.
Mikroorganisme memiliki respon syok panas dan dingin. Respon syok panas berupa sintesis
sesaat seperangkat protein syok panas, bila terkena suhu yang tiba-tiba meningkat di atas suhu
optimum pertumbuhan. Protein-protein tersebut sangat tahan terhadap panas dan dapat
menstabilkan protein sel yang sensitif panas. Sedangkan syok dingin ialah pembunuhan sel
akibat pendinginan yang cepat. Namun sejumlah senyawa dapat melindungi sel dari pembekuan
atau syok dingin, yaitu dengan gliserol dan dimetil sulfoksida paling sering digunakan.
2

2. pH
sebagian besar bakteri patogen memiliki pH optimum 7,2 7,6.
1

berbagai rentang pH pada organisme:
a. neutralofil tumbuh pada pH 6,0 8,0, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 7,5 pada
pH eksternal 5,5 8,5.
b. Asidofil memiliki pH optimum 3,0, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 6,5 pada pH
eksternal 1,0 5,0.
c. Alkalifil memiliki pH optimum 10,5, dan akan mempertahankan pH internal sekitar 9,5 pada pH
eksternal 9,0 11,0.
pH internal diatur oleh sistem transport proton dalam membran sitoplasma, termasuk sistem
transport primer.
3. Nutrisi (zat makanan)
a. Karbon
Karbon organik diperlukan oleh bakteri heterotrof untuk pertmbuhan. Selain itu karbon dioksida
diperlukan untuk beberapa reaksi biosintetik.
b. Nitrogen
Nitrogen adalah komponen utama dari protein dan asam nukleat. Banyak mikroorganisme
memiliki kemampuan untuk mengasimilasi nitrogen menjadi bentuk paling tereduksi yaitu ion
amonium. Kemampuan mengasimilasi nitrogen secara reduktif melalui NH
3
disebut fiksasi
nitrogen, adalah suatu sifat unik pada prokariot, dan relatif sedikit bakteri yang memiliki
kapasitas metabolik ini.
c. Sulfur
Sulfur adalah komponen dari banyak substansi sel organik. Sulfur membentuk sebagian struktur
beberapa koenzim dan ditemukan pada rantai samping protein. Beberapa bakteri autotrofik dapat
mngoksidasinya menjadi sulfat, untuk digunakan sebagai sumber sulfur yang mereduksi sulfat
menjadi hidrogen sulfida yang bersifat toksik bagi organisme lain.
d. Fosfor
Fosfor diperlukan untuk komponen ATP, asam nukleat, dan koenzim seperti NAD, NADP, dan
flavin.
e. Mineral
Mineral diperlukan untuk fungsi enzim. Ion magnesium dan kalium penting untuk fungsi dan
integritas ribosom. Ca
2+
untuk komponen dinding sel gram positif.
4. kekuatan ionik dan tekanan osmotik
faktor-faktor seperti tekanan osmotik dan konsentrasi garam perlu diperhatikan. Terdapat bakteri
yang yang memrlukan kadar garam yang tinggi, disebut halofilik. Selain itu terdapat bakteri yang
memerlukan tekanan osmotik yang tinggi disebut osmofilik.
1

Sebagian besar bakteri mampu menoleransi tekanan osmotik dan kekuatan ionik eksternal yang
sangat bervariasi karena kemampuannya untuk mengatur osmolalitas dan konsentrasi ion
internal. Osmolaritas ionik diatur oleh transpor aktif ionik K
+
ke dalam sel, kekuatan ionik
internal dipertahnakn konsentan dengan kompensasi ekskresi puteresin (poliamin organik
bermuatan positif).
2


7. Pertumbuhan Bakteri
Definisi
Pertumbuhan adalah peningkatan jumlah semua komponen organisme secara teratur.
Syarat pertumbuhan
Syarat pertumbuhan adalah:
a. Adanya sel hidup
b. Ada sumber energi
c. Ada nutrisi dan faktor pertumbuhan
d. Tidak ada inhibitor
1

Perkembangbiakkan dapat berlangsung secara seksual dan aseksual
2

pertumbuhan secara aseksual, yaitu:
a. Pembelahan biner
umumnya bakteri berkembang biak secara amitosis dengan membelah menjadi 2 bagian (binary
division). Waktu diantara 2 pembelahan disebut generation time dan ini berlainan untuk setiap
jenis kuman, bervariasi antara 20 menit sampai 15 jam, contohnya Mycobacterium yang
mempunyai generation time 15 jam
b. Pembelahan tunas/cabang
pertumbuhan dengan cara ini akan didahului dengan pembentukkan tunas yang kemudian
menjadi cabang dan akhirnya cabang tersebut memisahkan diri dan membentuk bakteri yang
baru. Contoh bakteri yang memakai cara ini adalah bakteri dari famili Streptomycetacea.
c. Pembentukkan filamen
Pada pembentukkan filamen, sel akan mengeluarkan serabut panjang, filamen tidak bercabang.
Bahan kromosom kemudian masuk ke dalam filamen. Lalu filamen terputus-putus menjadi
beberapa bagian dan setiap bagian tersebut membentuk bakteri yang baru.

Perkembangbiakkan secara seksual
Pembelahan bakteri disini didahului oleh peleburan bahan kromosom dari 2 bakteri. Akibatnya
timbul sel-sel bakteri dengan sifat yang berasal dari kedua sel induknya. Pembelahan semacam
ini hanya terjadi pada famili Enterobacteriaceae, antara Escherichia coli, antara Salmonella
typhosa. Jika bakteri ditanam pada waktu-waktu tertentu dan ditinjau berdasarkan jumlah bakteri
yang hidup, maka dibagi menjadi 4 fase, yaitu:
1. fase penyesuaian (lag phase)
fase penyesuaian menggambarkan suatu periode dimana sel-sel yang kekurangan metabolit dan
enzim akibat adanya kondisi yang tak menguntungkan pada akhir riwayat biakan sebelumnya,
beradaptasi dengan lingkungan baru. Fase ini berlangsung selama 2 jam. Bakteri belum
berkembang biak tapi aktivitas metabolitnya tinggi.
2. Fase pembelahan (logarhytmik phase/exponential phase)
Bakteri mulai berkembang biak dengan berlipat 2, jumlah bakteri akan meningkat secara
eksponensial. Pada pertengahan fase ini, pertumbuhan bakteri sangat ideal, terjadi secara teratur,
dan semua bahan dalam sel berada dalam keadaan seimbang. Fase ini berlangsung selama 18 -
24 jam.
3. Fase stasioner
Dengan meningkatnya jumlah bakteri dari fase sebelumnya, meningkat pula jumlah hasil
metabolisme yang toksis. Akibatnya, mulai ada yang mati dan pembelahan terhambat. Pada
suatu saat, jumlah bakteri yang hidup sama dengan jumlah yang mati.
4. Fase kemunduran/penurunan (period of decline)
Pada fase ini, jumlah bakteri yang hidup berkurang. Beberapa jenis bakteri timbul bentuk-bentuk
abnormal (bentuk involusi).
Gambar 5: fase pada perkembangbiakkan seksual





5. Pengukuran pertumbuhan
1

1. Pengukuran diukur melalui biomassa sel
Pada prinsipnya, biomassa dapat diukur dengan
menentukan berat kering biakkan mikroba setelah
dicuci dengan air suling. Perhitungan konstanta kecepatan (k) pertumbuhan dapat menentukkan
jumlah pertumbuhan yang terjadi pada perode waktu tertentu maupun menentukkan waktu yang
diperlukan selama pertumbuhan.
Rumus :

log
10
B
1
= k(t
1
-t
0
)
B
0
2,3
k = ln 2
t
d

keterangan:
1. K=kecepatan pertumbuhan
2. B
1
=biomassa pada waktu 1(t1)
3. B
0
=biomassa pada waktu nol(t0)
4. t
1
-t
0
=perbedaan waktu
5. t
d
=waktu penggandaan (waktu generasi)


Tabel 1: data waktu generasi pada beberapa bakteri
3

Nama Bakteri Waktu generasi (menit)
Escherichia coli 17
Bacillus megaterium 25
Rhizobium japonicum 344 461
Mycobacterium tuberculosis 792 932
Treponema pallidum 1980

2. Pengukuran diukur melalui konsentrasi sel (jumlah sel yang dapat hidup per unit volume
biakan).
Jumlah sel yang hidup biasanya dianggap sebagai konsentrasi sel. Dalam menggunakan ukuran
rubidimetrik, terdapat korelasi antara tingkat kekeruhan dengan jumlah sel yang hidup. Di dalam
perhitungannya, pengukuran kecepatan sel diukur melalui konsentrasi sel hampir sama dengan
pengukuran kecepatan sel diukur melalui biomassa, dimana dengan mengganti B, konsentrasi
biomassa, dengan N, konsentrasi sel.

Rumus:

t
1
- t
o
= 2,3 log10 (N
1
/N
2
)
k
keterangan :
1. K = kecepatan pertumbuhan
2. N
1
= konsentrasisel pada waktu 1(t1)
3. N
0
= konsentrasi sel pada waktu nol(t0)
4. t
1
- t
0
= perbedaan waktu


8. Metabolisme Kuman
1

Metabolisme adalah seluruh proses pengolahan setelah bahan makanan masuk ke dalam
sel. Enzim-enzim yang berperan penting dalam metabolisme:
1. Dehidrogenase (melancarkan reaksi reduksi oksidasi metabolit)
2. Flavoprotein (transport zat H dalam proses respirasi)
3. Sitokrom (proses respirasi pada kuman aerob untuk transport H ke O
2
)
Metabolisme dibagi dua:
1. Anabolisme/asimilasi: meliputi proses sintesa (pembangunan)
2. Katabolisme/desimilasi: meliputi proses degradasi (perombakan)
a. Fermentasi
Fermentasi dengan pembentukan asam campuran khusus untuk famili Enterobacteriaceae.
Fermentasi dengan pembentukan asam butirat dilakukan oleh kebanyakan Clostridium.
b. Respirasi
Aerob: Glikolisis diteruskan hingga piruvat terpecah menjadi CO
2
dan H
2
O sehingga
menghasilkan ATP dan O
2
sebagai reseptor H. Urutan enzim yang dipakai dalam transport zat H
ke O
2
dalam rantai respirasi ini adalah flavoprotein, sitokrom b, sitokrom c, sitokrom a dan O
2

Anaerob: Zat organik seperti nitrat atau sulfat dan bukan O
2
yang berfungsi sebagai reseptor.


c. Metabolisme Karbohidrat
Karbohidrat dipecah menjadi triosa dalam bentuk fosfat dan piruvat. Enzim yang berperan dari
golongan glikosidase dan fosforilase. Dimana menghasilkan piruvat, 2 NADH dan ATP dengan
cara:
melalui pentose fosfat
cara ini dipakai untuk kuman yang tidak mempunyai enzim aldolase dan triosa PO
4
isomerase
yang diperlukan EMP.
menurut Entner Doudoroff
Melalui pembentukan deoksiglukonat. Cara ini dipakai pada beberapa Pseudomonas dan
Escherichia coli.
d. Metabolisme zat lemak
Permulaan reaksi diperlukan pengaktifan asam lemak dengan CoA dan sebagai hasil adalah
gliserol dan asetil CoA
e. Metabolisme protein
Sintesa protein memerlukan nitrosa yang biasanya diambil dari medium dalam bentuk NH
3
atau
NO
3 .
Sintesa protein mengikuti DNA gen memberikan pola yang menentukan pada sintesa DNA
sendiri dan RNA. RNA sebagai pembawa berita dari DNA yang menentukan sintesa protein.
Fermentasi asam amino dilakukan oleh beberapa Clostridium seperti:
Alanin + 2 glisin +2 H
2
O + 2H
2
O 3 as.asetat + 3 NH
3
+ CO
2


Cara penularan bakteri
Berdasarkan habitat alam bakteri:
1. Tanah
Kebanyakan mikroorganisme di tanah bersifat patogen bagi manusia. Bakteri pathogen yang
terdapat di tanah antara lain:
- Clostridium tetani (agen penyebab penyakit tetanus)
- Bacillus anthracis
2. Air
Kebanyakan air tawar dan laut mengandung mikroorganisme. Namun, bakteri patogen
umumnnya tidak terdapat kecuali di air yang secara langsung tercemar oleh urin dan feses
manusia dan binatang. Mikroorganisme patogen di air misalnya: Vibrio cholerae (agen penyebab
penyakit kolera).
3. Udara
Walaupun bakteri sering ditemukan di udara, mereka sebenarnya tidak berkembang biak disana.
Udara luar jarang mengandung kuman patogen,karena efek pengeringan, ozon, dan
radiasi UV. Udara dalam ruangan mengandung bakteri patogen yang berasal dari
kulit, tangan, pakaian, dan terutama dari saluran pernapasan manusia.
1

contohnya: Mycobacterium tuberculosis (dapat menyebabkan penyakit TBC) melalui saluran
pernapasan.
4. Makanan
5

Terjadi melalui pangan atau makanan /minuman yang tercemar bakteri.
Contoh : - Shigella (penyebab disentri)
- Staphilococcus aures (paling banyak menyebabkan keracunanmakanan biasanya terdapat di
pangan yang mengandung protein misalnya daging ikan susu, serta produk yang dikonsumsi
dingin seperti salad dan pudding dengan gejala muntah)

9. Pewarnaan Kuman
1

Pewarnaan pada kuman dilakukan untuk mempelajari morfologi, struktur, sifat-sifat kuman.
Faktor-faktor untuk memperoleh pewarnaan yang baik adalah:
Gelas alas bersih dan bebas lemak.
Umur biakan: 18-24 jam, karena kuman yang umur biakannya lebih dari 24 jam akan mengalami
perubahan dalam morfologi dan strukturnya.
Kualitas zat warna.
Tebal tipisnya sediaan. Bila sediaan terlalu tebal atau tidak rata, maka penetrasi zat warna akan
berbeda-beda.
Jenis-jenis pewarnaan kuman:
Pewarnaan negatif
Pewarnaan sederhana
Pewarnaan khusus
Pewarnaan diferensial

1) Pewarnaan negatif:
Suspensi kuman dibuat dalam zat warna negrosin atau tinta bak disebar-ratakan dengan gelas
alas lain. Kuman tidak diwarnai dan tampak sebagai benda-benda terang dengan latar belakang
hitam. Pewarnaan ini dipakai untuk kuman yang sukar diwarnai,
misalnya:spirochaeta (Treponema, Leptospira, dan Borrelia)
Gambar 6: pewarnaan negatif
4


2) Pewarnaan sederhana:
Pewarnaan yang dilakukan hanya dengan 1 warna, misalnya biru metilen, air fukhsin, atau ungu
kristal selama 1-2 menit. Zat warna anilin mudah diserap oleh kuman.
3) Pewarnaan khusus:
Pewarnaan ini dilakukan untuk mewarnai bagian-bagian kuman yang sukar diwarnai dengan
warna biasa. Misalnya:
a) Flagel dengan pewarnaan gray
b) Simpai dengan Pewarnaan Muir, Hiss, Gins Burri
c) Spora dengan pewarnaan Klein
d) Inti dengan pewarnaan Feulgen
e) Difteri dengan pewarnaan Neiser untuk melihat granula Babes-Ernest
f) Spirokhaeta dengan pewarnaan Becker-Krantz dan pewarnaan Fontana Tribondeau.




4) Pewarnaan Diferensial
Pewarnaan diferensial adalah pewarnaan yang menggunakan lebih dari satu zat warna.
Pewarnaan ini dibagi menjadi 2:
1. Pewarnaan Gram adalah pewarnaan diferensial yang sangat penting yang membantu determinasi
suatu kuman. Pewarnaan ini ditemukan oleh Christian Gram pada tahun 1884. Dan dibutuhkan
untuk membedakan kuman yang Gram (+) atau Gram (-).
2. Pewarnaan tahan asam (acid fast staining). Misalkan pewarnaan Ziehl Neelsen
dan Kinyoun-Gabbet untuk membedakan kuman-kuman yang tahan asam dari yang tidak
tahan asam.
Pewarnaan Gram
Cara pewarnaan:
1. Sediaan yang sudah direkat diwarnai dengan karbol kristal ungu selama 5 menit.
2. Zat warna dibuang dan diganti dengan larutan lugol (larutan I
2
+ KI) dibiarkan
selama 45-60 detik.
3. Larutan lugol dibuang dan sediaan dicuci dengan alkohol 96% selama 30 detik.
4. Sediaan dicuci dengan air dan diwarnai dengan air fukhsin selama 1-2 menit.
Sediaan dicuci, dikeringkan, kemudian diamati di mikroskop.
Keterangan:
1. Setelah diberi karbol ungu kristal semua kuman akan berwarna ungu, zat warna
akan diserap dalam dinding sel dan protoplasma.
2. Pemberian lugol menyebabkan terbentuknya komplek ungu kristal-iodium yang
berwarna ungu tengguli kotor.
3. pencucian dengan alkohol akan menyebabkan terjadinya diferensiasi:
a. Kuman tetap berwarna ungu.
b. Kuman tidak berwarna, sebab zat warna akan dilarutkan oleh alkohol.
4. Fukhsin sebagai pewarna kontras (counterstain) mewarnai kuman yang tidak
berwarna menjadi merah.
Hasil yang dapat dibaca dari pewarnaan Gram adalah sebagai berikut:
- Kuman Gram positif akan berwarna ungu
- Kuman Gram negatif akan berwarna merah
Teori Permeabilitas dinding sel, teori ini berdasakan tebal tipisnya lapisan peptidoglikan dalam
dinding sel. Kuman Gram positif memiliki lapisan peptidoglikan yang tebal yaitu 30 lapisan serta
dinding sel yang kompak, sehingga permeabilitas dinding selnya kurang dan kompleks kristal
ungu-iodium tidak dapat keluar atau dipertahankan. Kuman Gram negatif mempunyai lapisan
peptidoglikan yang tipis, hanya 1-2 lapisan dan susunan dinding sel yang kurang kompak.
Sehingga permeabilitas dinding selnya kuat yang akan memungkinkan terlepasnya kristal ungu-
iodium keluar sel.
Pewarnaan tahan asam
- Pewarnaan Ziehl-Neelsen
Cara pewarnaan:
1. Sediaan kuman diwarnai dengan larutan fukhsin karbol dan dipanaskan dengan api kecil selama
5 menit.
2. Sediaan dicuci dengan air dan dimasukkan dalam larutan H
2
SO
4
5% selama 2 detik.
3. Kemudian dicuci dengan alkohol 60% sehingga tidak ada warna merah mengalir.
4. Sediaan dicuci dengan air kemudian diwarnai dengan pewarnaan biru metilen selama 1-2 menit,
dicuci dengan air, lalu keringkan.
Hasil yang dapat dibaca dari pewarnaan Ziehl-Neelsen adalah:
- Kuman tahan asam berwarna merah
- Kuman tak tahan asam berwarna biru
Sesudah diberi alkohol, kuman yang tahan asam akan berwarna merah danmempertahankannya
dikarenakan lapisan dinding sel kuman ini terdapat asam mikolat.Sedangkan kuman yang tidak
tahan asam akan melepaskan warna merahnya.
- Pewarnaan Kinyoun-Gabbet
Cara pewarnaan:
1. Sediaan kuman diwarnai dengan larutan kinyoun selama 3 menit dan dicuci dengan air.
2. Sediaan diwarnai dengan larutan Gabbet selama 1 menit, dicuci dengan air kemudian
dikeringkan.
Ditemukannya kuman tahan asam dalam sputum penderita seringkali dihubungkan dengan
penyakit tuberkulosis. Sebenernya hasil ini hanya menunjukkan adanya kuman tahan asam dan
kuman yang ditemukan mungkin juga bukan kuman tuberkulosis.
1



10. Flora Normal

Flora normal: sekumpulan mikroorganisme yang hidup pada kulit dan selaput lendir (mukosa)
pada manusia normal dan sehat.
2

Flora normal pada kulit manusia
2

- Flora tetap (resident flora): terdiri dari mikroorganisme tertentu pada bagian tubuh tertentu dan
jika berubah akan kembali seperti semula.
- Flora tidak tetap (transient flora): terdiri dari mikroorganisme nonpatogen atau potensial patogen
yang tinggal di kulit atau mukosa selama beberapa jam, hari, atau minggu yang berasal dari
lingkungan, tidak menimbulkan penyakit dan tidak hidup menetap. Jika flora tetap berubah,
maka flora sementara akan melakukan kolonisasi, berkembang biak, dan menyebabkan penyakit.
Flora normal pada mulut dan saluran pernapasan
1

Bagian yang mengandung mikroorganisme adalah mulut, nasofaring, orofaring, tonsil. Bagian
yang steril laring, trakea, bronkus, bronkiolus, alveolus. Mikroorganisme pada
mulut: Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Enterococcus. Mikroorganisme
pada faring: Neisseria. Infeksi pada mulut dan saluran nafas bagian atas meliputi bakteri
anaerob.
Flora normal pada saluran pencernaan
2

pH asam lambung melindungi lambung dari infeksi patogen usus seperti
cholerae.Mikroorganisme pada usus bagian atas adalah laktobasili dan enterokokki.
Mikroorganisme di kolon: Eubacteria, Clostridium, Streptococcus. Bakteri usus berperan dalam
sintesis vitamin K, penyerapan zat makanan, dan perlawanan terhadap mikroorganisme patogen.
Flora normal saluran urogenitalis
1

Mikroorganisme dapat ditemukan di genitalia eksterna, uretra anterior, dan vagina.Dalam flora
normal vagina ditemukan Streptokokus hemilitikus grub B,peptostreptokokus. Pada pubertas
terdapat flora yang menetap selama masa dewasa, yaitu: Lactobasillus, Micrococcus,
Staphylococcus epidermidis. Pada wanita hamil terdapat Streptococcus algalactica.



11. Sistem Imun
A) Perlawanan imunologik terhadap mikroorganisme di luar sel
1) Fagositosis
Fagositosis adalah merupakan mekanisme tubuh untuk melawan benda asing yang masuk ke
dalam tubuh dan pelakunya adalah:
- monosit, yang di dalam jaringan menjadi makrofag
- leukosit polimorfonukleas (PMN)
Kedua jenis tersebut berasal dari sel primitif sumsum tulang di mana sel tersebut umumnya telah
dewasa. Lalu masuk ke sirkulasi darah yang pada PMN bertahan selama 6-7 jam dan kemudian
masuk ke dalam jaringan di mana sel tersebut bertahan 4-5 hari, sedangkan monosit bertahan
dalam sirkulasi selama 1-3 hari sebelum masuk ke dalam jaringan, baik monosit dan PMN
setelah dilepas dari sumsum tulang, umumnya tidak lagi mengalami mitosis (pembelahan diri).
Sehingga kebutuhan yang meningkat akan fagosit dalam perlawanan terhadap infeksi diperoleh
dari pelepasan yang lebih banyak fagosit dari persediaan yang ada dalam sumsum tulang. Kedua
sel tersebut diatur oleh mekanisme saraf dan faktor-faktor dalam serum, dan ini terjadi pada
infeksi kuman atau virus.
2) Kemotaksis
Peranan utama sistem kekebalan bagi fagositosis ialah menarik PMN dan monosit ke tempat
terjadinya interaksi antara antibodi atau limfosit kebal dengan mikroorganisme, faktor
kemotaksis yang dibebaskan limfosit-T yang mengalami mitosis setelah terikat dengan antigen
atau terbentuk akibat komplek antigen-antibodi.
3) Perlekatan
Langkah pertama dalam fagositosis, ialah melekatkan mikroorganisme pada fagosit. Banyak
kuman atau patogen yang mampu menghindar (resisten) pada perlekatan itu, sehingga resistensi
merupakan faktor yang memperbesar virulensinya. Dalam hal ini diperlukan opsonisasi (siap
dimakan), perlekatan ini terjadi melalui:


- ikatan Fe
Monosit dan leukosir polimorf mempunyai reseptor untuk fragmen Fe dari subklas IgG tertentu
yang terikat pada antigen, jenis IgG tersebut, yang spesifik terhadap antigen mikroorganisme
dapat mengikat mikroorganisme tersebut dengan fragmen Fe melekat pada fagosit. Dengan
demikian terjadi perlekatan pada fagosit.
- Ikatan C3
Monosit dan leukosit polimorf mempunyai reseptor untuk C3b yang aktif, sehingga adanya
komplemen, kompleks mikroorganisme dengan antibodi pengikat menimbulkan opsonisasi (siap
untuk dimakan). Biasanya ini terjadi pada tubuh yang belum memiliki kekebalan spesifik.
- Proses immune adherence
Opsonisasi melalui pengikatan C3 dapat dihalangi oleh inaktifator C3b yang didapat di dalam
serum. Kompleks mikroorganisme antibodi yang terikat dengan C3 yg aktif dapat juga melekat
pada eritrosit karena eritrosit terdapat dalam jumlah yang besar. Ternyata mekanisme ini penting
terhadap kuman Gram negatif dalam sirkulasi.
- Antibodi spesifik terhadap makrofag
Antibodi sitofilik yang tidak terikat dengan antigen dapat menempel pada monosit atau makrofag
(fagosit ini mempunyai reseptor atau Fe tertentu), bila antibodi bersangkutan homolog dengan
antigen mikroorganisme maka perlekatan mikroorganisme tersebut akan terjadi.
- Hambatan aktifitas blokade oleh produk kuman
Dengan adanya antibodi spesifik terhadap protein A stafilokokus, maka kuman bebas dari
hambatan opsonisasi, baik dengan IgG maupun oleh C3.
4) Pencaplokan dan penghancuran mikroorganisme (ingesti dan destruksi)
Setelah mikroorganisme melekat pada fagosit, maka pseudopodia direntangkan mengurung
mikroorganisme tersebut dengan membentuk suatu vesikel di dalam sel (fagosom), fagosom ini
kemudian bergabung dengan lisosom dalam sitoplasma menjadi fagolisosom, di dalam
fagolisosom mikroorganisme mati dan dihancurkan melalui mekanisme yang tergantung pada
oksigen dan mekanisme yang tidak tergantung pada oksigen.
- dalam mekanisme yang tidak tergantung pada oksigen, termasuk pH rendah dalam vakuola,
lisosim, protein kationik granuler, proteasa, lipasa dan glikolipasa. Lisosom sendiri bersifat
meosis berapa jenis mikroorganisme, tetapi juga dapat memperbesar efek pada mikrobasid
mekanisme lain.
- mekanisme yang tergantung oksigen terjadi oleh adanya peroksidase intra seluler. Peroksida
secara langsung mempunyai efek mikrobasid yang diperoleh melalui pembentukan gugus-gugus
yang reaktif, seperti hidroksil reaktif, dan oksigen tunggal reaktif, dan anion superoksida.
1


12. Bacillus anthracis
Definisi
Bakteri yang menyebabkan penyakit anthrax pada hewan herbivora, contoh kambing, domba,
lembu, kuda, sapi, dan lain-lain. Hewan lainnya (misalnya tikus) relatif resisten terhadap infeksi
bakteri ini. Terkadang manusia dapat terinfeksi jika kontak dengan hewan yang terinfeksi.
2

Morfologis:
Batang dengan ukuran 1 x 3-4 m, dapat tersusun seperti bambu. Spora sentral. Gerak negatif.
Gram positif, aerob, membentuk rantai.
Pada kultur tampak koloni putih abu-abu, tepi seperti rambut, tidak ada hemolisis pada agar
darah.
Termasuk organisme saprofit yang lazim terdapat dalam tanah, air, udara dan tumbuh-tumbuhan.
1



Taksonomi
7


- Kingdom: bacteria
- Phylum: firmicutes
- Class: bacilli
- Orde: bacillales
- Family: bacillaceae
- Genus: bacillus
- Species: B. anthracis

Fisiologis
a. pH: 6,5 di dalam tanah (dalam keadaan spora)
b. suhu: tinggi ataupun rendah (dalam keadaan spora) dalam waktu yang cukup lama dan dapat
bertahan selama bertahun-tahun pada tanah yang kering.
c. lingkungan: sporanya resisten terhadap perubahan lingkungan
d. nutrisi: basil saprofit menggunakan sumber nitrogen dan karbon sederhana untuk energi dan
pertumbuhannya.
2

Cara penularan
Pada manusia kuman anthrax dapat menyebabkan:
1. Infeksi kulit: penularan lewat kulit yang terluka. Kulit yang terinfeksi spora akan mengalami
iritasi dan kulitnya menjadi hitam
1


2. Infeksi paru-paru: Wool sorters disease yang terjadi karena inhalasi spora dari bulu domba.
Biasanya penyakit ini fatal.

3. Infeksi pada usus: menyebabkan infeksi pada usus halus yang disertai dengan gangren.
Penyebabnya adalah karena makan daging yang terinfeksi anthrax.
Proses masuknya B. anthracis ke dalam tubuh:
1. B. anthraticus masuk ke dalam tubuh dalam bentuk spora.
2. Spora kemudian diserang oleh sistem kekebalan tubuh.
3. Dalam sistem kekebalan tubuh, spora anthrax aktif dan mulai berkembang biak dan
mengeluarkan 2 racun, yaitu toksin edema dan toksin lethal. PA berikatan dengan EF
membentuk toksin edema. PA dan LF membentuk toksin lethal, yang merupakan faktor virulensi
utama dan menyebabkan kematian pada hewan yang terinfeksi.
4. Racun yang dikeluarkan B. anthracis terdiri dari 3 protein:
- PA (protective antigen)
- EF (edema factor)
- LF (lethal factor)
2


13. ANTIBIOTIK
Definisi
Zat yang dihasilkan oleh suatu mikroba. Terutama fungi, yang dapat menghambat/dapat
membasmi mikroba jenis lain
Obat yang digunakan untuk membasmi mikroba penyebab infeksi pada manusia

Penggolongan
Sifat toksisitas selektif
- Antimikroba yang bersifat menghambat pertumbuhan mikroba (bakteriostatik)
- Antimikroba yang bersifat membunuh (bakterisid)
Kadar minimal
- Kadar hambat minimal (KHM)
- Kadar bunuh minimal (KBM)
Jadi antimikroba tertentu aktivitasnya dapat meningkat dari bakteriostatik menjadi bakterisid bila
kadar antimikrobanya ditingkatkan melebihi (KHM).

Mekanisme Kerja
1. Antimikroba yang menghambat metabolisme sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: Sulfonamid,trimetoprim, asam p-aminosalisilat (PAS) dan Sulfon
Mekanisme:
Kuman pathogen mensintesis sendiri asam folat dari asam benzoate (PABA) untuk kebutuhan
hidupnya.
- Sulfonamid (sulfon)
Jika sulfonamide (sulfon) menang terhadap PABA, maka PABA akan bergabung dengan
sulfonamide (sulfon) untuk membentuk asam folat dan membentuk analog asam folat yang
nonfungsional akibatnya kehidupan mikroba terganggu.
- Trimetoprim
Efek sulfonamide dapat diatasi oleh mikroba dengan cara meningkatkan kadar PABA, tetapi
harus mengubah dihidrofolat menjadi asam tetra hidropolat. Enzim dihidrofolat reduktanse yang
berperan dihambat oleh trimetoprim sehingga asam dihidrofolat tidak dapat direduksi menjadi
asam tetrahidrofolat yang fungsional.
- PAS
Merupakan analog PABA dan bekerja dengan menghambat sintesis asam folat pada M.
tuberculosis. Karena sulfonamide tidak efektif terhadap M. Tuberculosis, sebaliknya PAS tidak
efektif terhadap bakteri yang sensitive terhadap sulfonamide.
2. Antimikroba yang menghambat sintesis dinding sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: penisilin, sefalosporin, basitrasin, vankomisin, dan sikloserin
Mekanisme:
Dinding sel bakteri terdiri dari polipeptidoglikan menjadi suatu polimer nukleopeptida
(glikopeptida). Sikloserin menghambat reaksi yang paling awal dalam proses sintesis dinding sel
diikuti berturut-turut oleh basitrasin, vankomisin dan diakhiri oleh penisilin dan sefalosporin.
Akibatnya tekanan osmotik didalam sel kuman lebih besar dari luar maka kerusakan dinding sel
kuman akan mengakibatkan terjadinya lisis, yang merupakan dasar efek bakterisidal pada kuman
yang peka.
3. Antimikroba yang mengganggu keutuhan membrane sel mikroba
Efek: bakterisid.
Kelompok antimikroba: polimiksin, golongan polien, berbagai antimikroba kemoterapeutik
(antiseptic surface active agent).
Mekanisme:
- Polimiksin
Polimiksin akan merusak membrane sel setelah bereaksi dengan fosfat pada fosdolipid
membrane sel mikroba.
- Golongan polien
Antibiotic polien bereaksi dengan sterol yang terdapat pada membrane sel fungus yang akan
mempengaruhi permeabilitas selektif membrane.
- Antimikroba kemoterapeutik
Antiseptic surface active agent akan merusak permeabilitas selektif membrane sel mikroba
menyebabkan komponen penting dalam sel mikroba yaitu protein, asam nukleat, nukleotida dll
akan keluar.



4. Antimikroba yang menghambat sintesis protein sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok antimikroba: golongan amino glikosid, makrolid, linkomisin, etrasiklin, dan
kloramfenikol.
Mekanisme:
Pada bakteri ribosom terdiri dari dua unit berdasarkan konstanta sedimentasinya dinyatakan
sebagai ribosom 30s dan 50s. kedua komponen ini akan bersatu pada pangkal rantai mRNA
menjadi ribosom 70s
- Golongan aminoglikosid (streptomisin)
Streptomisin akan berikatan dengan komponen ribosom 30s menyebabkan kode pada mRNA
salah dibaca oleh tRNA saat sintesis protein. Akibatnya terbentuk protein yang abnormal dan
nonfungsional bagi sel mikroba
- Golongan aminoglikosid (gentamisin, kanamisin, dan neomisin)
Memiliki mekanisme yang sama namun potensinya berbeda-beda
- Eritromisin
Eritromisin akan berikatan dengan ribosom 50s dan menghambat translokasi kompleks tRNA
peptide dari asam amino ke lokasi peptida menyebabkan rantai polipeptida tidak dapat
diperpanjang karena lokasi asam amino tidak dapat menerima kompleks tRNA asam amino yang
baru
- Linkomisin
Linkomisin berikatan dengan ribosom 50s dan akan menghambat sintesis protein
- Tetrasiklin
Tetrasiklin akan berikatan dengan ribosom 30s dan akan menhalangi masuknya kompleks tRNA-
asam amino pada lokasi asam amino
- Kloramfenikol
Kloramfenikol akan berikatan dengan ribosom 50s dan akan menghambat pengikatan asam
amino baru pada rantai polipeptida oleh enzim peptidil tranferase

5. Antimikroba yang menghambat sintesi asam nukleat sel mikroba
Efek: bakteriostatik
Kelompok mikroba: rifampisin dan golongan kuinolon
Mekanisme:
- Riamfisin
Salah satu derivat riamfisin berikatan dengan enzim polimerase RNA sehingga menghambat
sintesis RNA dan DNA oleh enzim tersebut
- Golongan kuinolon
Golongan kuinolon menghambat enzim DNA girase pada kuman yang fungsinya menata
kromosom yang sangat panjang menjadi bentuk spiral hingga bisa muat dalam sel kuman yang
kecil
6