Virus

Virus adalah mikroba yang sangat sederhana, terdiri dari asam nukleat, sedikit protein, dan
(dalam beberapa) selubung lipid. Mikroba ini sepenuhnya bergantung pada sel yang mereka
infeksi untuk kelangsungan hidup dan replikasi mereka. Virus yang penting secara medis
dibagi menjadi 20 keluarga yang ditentukan oleh sifat struktural anggota.
Ciri terpenting adalah asam nukleat. Virus mengandung DNA atau RNA tetapi tidak
keduanya. Keluarga virus DNA dan virus RNA selanjutnya dibagi lagi menjadi virus dengan
asam nukleat untai tunggal atau ganda. Terakhir, keluarga virus ini kemudian dibagi lagi
menjadi virus dengan selubung luar, atau virus telanjang tak bersampul.
Parasit Interselluler Obligat: mikroorganisme parasit yang tidak dapat bereproduksi di luar
sel inang, memaksa inang untuk membantu reproduksi.
Spike: Struktur protein atau glikoprotein yang sering menonjol dari permukaan partikel
virus, terlibat dalam kontak awal dengan reseptor pada sel inang.
Core: asosiasi asam nukleat virus dengan protein dasar yang dikodekan oleh virus untuk
membentuk CORE
Nucleid Acid: DNA/RNA
Matrix protein: berfungsi sebagai jembatan antara nukeokapsid dan bagian dalam
membrane virus
Membrane Envelope: Pembungkus virus yang biasanya diperoleh dari membrane sitoplasma
sel yang terinfeksi selama pelepasan sel
Nukleokapsid: Genom virus yang terbungkus membentuk kompleks protein dan struktur
Capsid:
- Melindungi genom asam nukleat dari kerusakan selama perjalanan ekstraseluler virus dari
satu sel ke sel lainnya
- Untuk membantu proses masuk kedalam sel
- Dalam beberaoa kasus untuk mengemas enzim esensial untuk Langkah awal proses infeksi

Cangkang protein yang membentuk kapsid atau nukleokapsid mengansumsikan salah satu
dari dua bentuk dasar; Silindris (Heliks) atau Bulat (Icosahedral)
Bakteri
Bakteri uniseluler yang tidak memiliki membran inti dan nukleus sejati. dan tidak memiliki mitokondria, retikulum
endoplasma (ER), atau badan Golgi. Tidak adanya struktur sel bakteri (prokariotik) bakteri juga berkembang biak
pembelahan aseksual.

bakteri bersifat gram positif (mempertahankan pewarna biru)

gram negatif (menghilangkan noda biru dan noda dengan pewarna merah).

Bakteri ini kemudian dibagi lagi menurut bentuknya (baik bulat [cocci] atau berbentuk batang), apakah mereka tumbuh
secara aerob atau anaerob (banyak bakteri tumbuh di kedua atmosfer dan disebut anaerob fakultatif), dan apakah mereka
membentuk spora yang tangguh atau tidak (hanya batang gram positif yang merupakan pembentuk spora). Pewarnaan
bakteri penting lainnya adalah pewarnaan tahan asam yang dipertahankan hanya oleh beberapa bakteri yang memiliki
karakteristik dinding sel kaya lipid.

Semua bakteri memiliki tiga kebutuhan nutrisi utama untuk pertumbuhan:

• Sumber karbon (untuk membuat konstituen seluler). Karbon mewakili 50% dari berat kering suatu bakteri.
• Sumber nitrogen (untuk membuat protein dan asam nukleat). Nitrogen membentuk 14% dari berat kering.
• Sumber energi (ATP), untuk menjalankan fungsi seluler.

Bakteri diklasifikasikan menjadi dua kelompok dasar menurut cara mereka memenuhi kebutuhan gizinya. Anggota satu
kelompok, autotrof (litotrof): dapat tumbuh secara sederhana, menggunakan karbon dioksida, air dan garam organik yang
diperlukan.

Kelompok bakteri kedua, heterotrof: membutuhkan zat yang lebih kompleks.membutuhkan

sumber karbon organik, seperti glukosa, dan memperoleh energi dengan mengoksidasi atau
memfermentasi zat organik. , (misalnya glukosa) digunakan sebagai sumber karbon dan
sumber energi.

Kapsul

Banyak sel bakteri mengelilingi dirinya dengan satu atau jenis gel hidrofilik lainnya. Lapisan ini
seringkali tebal; biasanya lebih tebal dari diameter sel.

Cell Wall

Dinding ini melindungi sel dari gangguan mekanis dan ledakan akibat tekanan turgor akibat
hipertonisitas interior sel relatif terhadap lingkungan. ( perlindungan )

Membran sel (plasma) bakteri mengandung fosfolipid dan protein.

Flagella adalah organel molekuler motilitas yang ditemukan pada banyak spesies bakteri, baik Gram
positif maupun Gram negatif.

PiliPili (juga disebut fimbriae) adalah proyeksi seperti rambut yang ditemukan di permukaan sel
banyak spesies Gram-positif dan Gram-negatif. Mereka terdiri dari molekul protein yang disebut pilin
yang disusun membentuk tabung dengan inti berongga yang kecil
Core Berbeda dengan kekayaan struktural dari lapisan dan pelengkap dari selubung sel

Sitoplasma bakteri memiliki sitoskeleton yang melokalisasi protein, berpartisipasi dalam

pembelahan sel, dan bersama dengan peptidoglikan dinding sel, membentuk sel

Nukleoid adalah wilayah sitoplasma yang berisi genom dan kumpulan protein

Plasmid Banyak bakteri mengandung molekul DNA kecil, biasanya melingkar, tertutup kovalen,
beruntai ganda yang terpisah dari kromosom.

Spores Endospora adalah bentuk kecil, dehidrasi, dan tidak aktif secara metabolik yang diproduksi
oleh beberapa bakteri sebagai respons terhadap keterbatasan nutrisi atau tanda terkait bahwa
masa-masa sulit akan datang.

FUNGI
STRUKTUR
Sel jamur memiliki ciri khas eukariotik, termasuk nukleus dengan nukleolus, membran
nukleus, dan kromosom linier (Gambar 42-1). Sitoplasma mengandung sitoskeleton dengan
mikrofilamen aktin dan mikrotubulus yang mengandung tubulin. Ribosom dan organel,
seperti mitokondria, retikulum endoplasma, dan badan Golgi, juga ada. Sel jamur memiliki
dinding sel yang kaku di luar membran sitoplasma, yang berbeda dalam komposisi kimianya
dari bakteri dan tumbuhan. Perbedaan penting dari sel mamalia adalah susunan sterol dari
membran sitoplasma. Pada jamur, sterol dominan adalah ergosterol; dalam mammalian sel
itu adalah kolesterol. Jamur biasanya dalam keadaan haploid, meskipun inti diploid
terbentuk melalui fusi inti dalam proses reproduksi seksual.
Struktur kimiawi dinding sel pada jamur sangat berbeda dengan sel bakteri karena tidak
mengandung peptidoglikan, gliserol, asam teikoat, atau lipopolisakarida. Sebagai gantinya
adalah polisakarida mannan, glukan, dan kitin yang berhubungan erat satu sama lain dan
dengan protein struktural (Gambar 42-2). Mannoprotein adalah polimer berbasis manosa
(mannan) yang ditemukan di permukaan dan di matriks struktural dinding sel, di mana
mereka terkait dengan protein. Mereka adalah penentu utama dari spesifisitas serologi
karena variasi dalam komposisi dan keterkaitan rantai samping polimer. Glucans adalah
polimer glukosil, beberapa di antaranya membentuk fibril yang meningkatkan kekuatan
dinding sel jamur, ditemukan sering berhubungan erat dengan kitin. Kitin terdiri dari rantai
poly-N-acetylglucosamine yang panjang dan tidak bercabang. Ini inert, tidak larut, dan kaku
dan memberikan dukungan struktural dengan cara yang analog dengan kitin dalam
cangkang kepiting atau selulosa pada tumbuhan. Ini adalah komponen utama dari dinding
sel jamur berfilamen. Pada yeast, kitin tampaknya paling penting dalam membentuk septa
silang dan saluran yang dilalui inti sel dari ibu ke sel anak selama pembelahan sel.

KARAKTERISTIK

Jamur lebih kompleks dari pada bakteri dan virus. Ini adalah organisme eukariotik
yang mengandung nukleus, mitokondria, badan Golgi, dan retikulum endoplasma
yang jelas. Mereka dibedakan dari organisme eukariotik lainnya dengan dinding sel
yang kaku yang terdiri dari kitin dan glukan dan membran sel di mana ergosterol
menggantikan kolesterol sebagai komponen sterol utama. Sifat struktural yang unik
ini dimanfaatkan baik untuk diagnosis dan sebagai target pengobatan antijamur.

KLASIFIKASI
Jamur diklasifikasikan dalam kerajaannya sendiri yang terpisah, Kingdom Fungi, dan ada
sebagai organisme uniseluler (ragi) yang dapat bereplikasi secara aseksual, atau sebagai
organisme berfilamen multiseluler (kapang) yang bereplikasi secara seksual dan aseksual.
Meskipun sebagian besar jamur hanya ada dalam satu dari dua bentuk, beberapa jamur
penting secara klinis dapat mengasumsikan morfologi (jamur dimorfik). Beberapa ciri
morfologi lainnya penting untuk dipahami siswa. Pada dasarnya,
jamur terdiri dari filamen yang disebut hifa dengan bentuk tunas atau spora. Jamur telah
diidentifikasi secara historis oleh morfologi struktur ini. Hifa dapat dibagi lagi menjadi
serangkaian kompartemen individu atau sel yang dipisahkan oleh septum atau dinding, dan
berpigmen (jamur dematiaceous) atau nonpigmentasi (jamur hialin). Dengan demikian,
kapang dapat dibagi lagi menjadi tiga kelompok: kapang nonseptate (umumnya
nonpigmented); jamur septate, dematiaceous; dan septate, jamur hialin. Meskipun ini
mungkin agak membingungkan, ini memiliki aplikasi praktis dalam mengklasifikasikan
beberapa penyakit jamur, seperti yang akan terlihat pada bab-bab selanjutnya.
Taksonomi jamur itu rumit dan, sejujurnya, di luar minat sebagian besar pelajar dan dokter.
Cukuplah untuk mengatakan bahwa bentuk aseksual dari kapang (anamorf) dan bentuk
seksual dari kapang (teleomorph) memiliki morfologi yang berbeda dan secara historis
memiliki nama yang berbeda. Untuk tujuan buku teks ini, hanya nama yang umum dikenal
(terutama nama anamorph) yang akan digunakan.
Berbeda dengan bab-bab tentang bakteri dan bab-bab selanjutnya tentang parasit, bagian
dari buku teks ini telah disusun berdasarkan presentasi klinis penyakit: jamur kulit dan
subkutan, jamur dimorfik sistemik, dan jamur oportunistik. Tabel berikut adalah daftar
penyakit yang paling umum dan genera jamur terkait di setiap kelompok. Harus diakui
bahwa ini bukanlah daftar yang lengkap; sebaliknya, ini adalah jamur yang kemungkinan
besar akan dilihat oleh dokter.

Meskipun konidia lebih mudah diamati, klasifikasi resmi jamur terutama bergantung pada
sifat spora teleomorf dan pemisahan hifa sebagai karakteristik diferensial. Atas dasar ini,
jamur telah disusun menjadi lima filum: Chlytridiomycota, Zygomycota, Glomeromycota,
Ascomycota, dan Basidiomycota. Ciri yang membingungkan dalam klasifikasi jamur yang
penting secara medis adalah bahwa untuk sebagian besar spesies pengelompokan dan
nama ditetapkan sebelum bentuk teleomorf ditemukan. Salah satu pendekatannya adalah
dengan memarkir jamur ini di kelas buatan mereka sendiri (Deuteromycetes, atau fungi
imperfecti) menunggu penemuan teleomorf mereka. Bagi banyak orang, hal ini sekarang
telah tercapai tetapi penerapan metode molekuler seperti analisis gen RNA ribosom telah
membuatnya hampir tidak relevan. Spesies ini sekarang dapat diklasifikasikan berdasarkan
genom tanpa mengetahui bentuk reproduksinya. Genera yang penting secara medis
sebagian besar termasuk dalam Ascomycota, dengan beberapa di Basidiomycota, dan
Zygomycota, seperti yang ditunjukkan pada Tabel 42-1. Penemuan teleomorf mungkin tidak
memberikan kejelasan langsung dari sudut pandang siswa; misalnya, ketika tahap seksual
Trichophyton mentagrophytes, penyebab kurap, didemonstrasikan, ternyata identik dengan
yang sudah disebut ascomycete (Arthroderma benhamiae).
Pengelompokan jamur penting secara medis yang digunakan dalam bab-bab berikut ini
didasarkan pada jenis jaringan yang diparasitinya dan penyakit yang dihasilkannya, bukan
pada prinsip taksonomi mikologis dasar. Jamur superfisial, seperti dermatofita,
menyebabkan lesi lamban pada kulit dan pelengkap, umumnya dikenal sebagai kurap dan
kaki atlet. Patogen subkutan secara khas menyebabkan infeksi melalui kulit, diikuti oleh
penyebaran subkutan, penyebaran limfatik, atau keduanya. Jamur oportunistik adalah jamur
yang ditemukan di lingkungan atau flora menetap yang menghasilkan penyakit dalam
keadaan tertentu dan inang yang dikompromikan. Patogen sistemik adalah jamur yang
paling mematikan dan dapat menyebabkan penyakit sistemik progresif yang serius pada
orang yang sebelumnya sehat. Mereka tidak ditemukan di mikrobiota manusia. Meskipun
potensi utama mereka adalah untuk menghasilkan infeksi viseral dan penyebaran sistemik
(mikosis sistemik), mereka juga dapat menghasilkan infeksi superfisial sebagai bagian dari
spektrum penyakit mereka atau sebagai kejadian awal. Mikosis superfisial tidak menyebar
ke jaringan yang lebih dalam. Seperti semua klasifikasi klinis, tumpang tindih dan
pengecualian terjadi. Pada akhirnya, organisme menentukan penyakitnya, dan penyakit itu
harus diisolasi atau didemonstrasikan.
Taksonomi didasarkan pada spora seksual dan pemisahan hifa
Bentuk aseksual tidak diketahui oleh kebanyakan patogen
gen rRNA digunakan untuk klasifikasi
Pengelompokan medis diatur berdasarkan perilaku biologis pada manusia
Jamur sistemik menginfeksi orang yang sebelumnya sehat