JALUR MASUK DEUDROF

Jalur Entner-Douderoff digunakan oleh bakteri dari genus Pseudomonas dan genera
terkait serta organisme lain seperti beberapa enterik untuk metabolisme senyawa tertentu. Jalur
ini merupakan jalur utama untuk sekelompok bakteri yang penting, seperti spesies Pseudomonas
Pada jalur Entner-Douderoff, glukosa diubah menjadi 6-fosfoglukonat seperti pada jalur HMP.

Gambar 9-6 Jalur Entner-Douderoff (E-D) dan hubungannya dengan jalur EMP dan HMP. Tiga
jalur alternatif untuk konversi glukosa menjadi 6-fosfoglukonat tidak terdapat pada semua
organisme yang menggunakan jalur ini.
Pada reaksi pertama, yang dikatalisis oleh fosfoglukonat dehidratase, sebuah molekul air
dihilangkan dengan cara yang unik; dalam produk reaksi, dua atom hidrogen telah dihilangkan
dari satu karbon dan oksigen dari karbon lainnya (reaksi dehidrasi biasa melibatkan
penghilangan hidrogen dari satu karbon dan hidroksil dari karbon lainnya).

Produknya, 2-keto-3-deoksi-6-fosfoglukonat, ditindaklanjuti oleh aldolase dalam reaksi yang

identik dengan reaksi aldolase pada jalur EMP [bandingkan Persamaan. (9-34) dan (9-8)].
Produk yang dibentuk oleh 2-keto-3-deoksi-6-fosfoglukonat aldolase adalah gliseraldehida 3-
fosfat dan piruvat. Yang pertama merupakan perantara dalam jalur EMP dan HMP. Piruvat
dibentuk di jalur EMP dan didekarboksilasi secara oksidatif menjadi asetil-KoA, yang memasuki
siklus TCA. Jalur Entner-Douderoff berbagi zat antara dengan kedua jalur tersebut, dan dengan
memanfaatkan reaksi dari dua jalur lainnya, jalur ini dapat menyalurkan karbon ke dalam reaksi
biosintetik atau ke dalam karbon dioksida. Reaksi yang ditunjukkan pada Gambar 9-6
menyediakan oksidasi lengkap glukosa menjadi karbon dioksida dan air.

FIXASI KARBON DIOKSIDA SIKLUS CALVIN-AUTOTROPHIC

Jalur sintesis bahan organik dari karbon dioksida sama di hampir semua organisme
autotrofik, tumbuhan tingkat tinggi, eukariotik fotoautotrofik, dan mikroorganisme prokariotik,
serta bakteri kemoautotrofik. Jalur yang umum adalah jalur siklik atau disebut juga siklus
pentosa reduktif karena hubungannya yang erat dengan jalur HMP. siklus Calvin pada dasarnya
merupakan pembalikan bagian dari jalur HMP dan jalur EMP dan menggunakan banyak enzim
yang sama
Tabel 9-1 Reaksi yang terlibat dalam sintesis bersih satu molekul glukosa dari enam molekul
karbon dioksida melalui siklus Calvin pada organisme autotrofik.
difiksasi untuk menghasilkan glukosa. Enam putaran siklus HMP diperlukan untuk mencapai
oksidasi lengkap satu molekul glukosa menjadi enam molekul karbon dioksida. Demikian pula,
enam putaran siklus Calvin diperlukan untuk mencapai sintesis bersih satu molekul glukosa dari
enam molekul karbon dioksida.
Persamaan keseluruhan untuk fiksasi karbon dioksida autotrofik melalui siklus Calvin adalah
6CO2+18ATP + 12NADPH₂+12H2O→ glukosa + 18H3PO4 + 18ADP+12NADP (9-35)
Dua reaksi kunci dari siklus Calvin adalah reaksi yang memasukkan karbon dioksida
[Persamaan. (9-37)] dan reaksi yang membentuk molekul yang ditambahkan karbon dioksida
[Persamaan. (9-36)]. Substrat yang ditambahkan karbon dioksida adalah ribulosa 1,5-difosfat. Ini
terbentuk dari ribulosa 5-fosfat dapat dilihat sebagai perantara dalam jalur HMP. ATP diperlukan
untuk fosforilasi, yang dikatalisis oleh enzim fosforibulokinase dalam reaksi yang sangat mirip
dengan fosforilasi fruktosa 6-fosfat pada jalur EMP [Persamaan. (9-7)]
Enzim yang mengikat karbon dioksida adalah ribulosa-difosfat karboksilase. Penambahan
karbon dioksida diikuti dengan pembelahan molekul untuk menghasilkan dua molekul asam 3-
fosfogliserat, yang juga dikenal sebagai perantara dalam jalur EMP.

3-fosfogliserat kemudian diubah menjadi heksosa melalui pembalikan bagian atas jalur EMP,
dan ribulosa 5-fosfat yang diperlukan untuk pembentukan ribulosa 1,5-difosfat diregenerasi
melalui serangkaian reaksi yang juga ditemukan di HMP. Dalam tiga reaksi, gugus fosfat
dihilangkan melalui hidrolisis. Dalam reaksi yang sesuai dimana fosfat ditambahkan, ATP
diperlukan sebagai donor fosfat. Pembalikan reaksi tersebut tidak mungkin terjadi karena energi
ikatan fosfat tidak disimpan dalam fosforilasi oleh ATP; yaitu gugus fosfat dihilangkan dari
fruktosa 1,6-difosfat [Persamaan. (9-38)], glukosa 6-fosfat [Persamaan. (9-39)], dan
sedoheptulosa 1,7-difosfat [Persamaan. (9-40)] berikatan dengan gula melalui ikatan ester yang
stabil, bukan melalui ikatan berenergi tinggi yang mampu menyumbangkan fosfat ke ADP.
Enzim yang menghilangkan gugus fosfat melalui hidrolisis disebut fosfatase.

HUBUNGAN JALUR PUSAT TERHADAP BIOSINTESIS

Aspek yang paling mencolok dari jalur ini adalah penghematan sintesis enzim dan
keserbagunaan yang diberikan oleh kemampuan sel hidup untuk menggunakan enzim yang sama
dalam beberapa jalur dan untuk lebih dari satu tujuan, dan untuk mengalihkan zat antara dari satu
jalur ke jalur lainnya. dan dapat ditarik dari jalur katabolik untuk berfungsi sebagai bahan
penyusun biosintesis bahan sel. Aliran karbon melalui jalur HMP dan EMP dapat divariasikan
untuk menghasilkan NADPH₂, ribosa 5-fosfat, dan eritrosa 4-fosfat sesuai kebutuhan untuk
reaksi biosintetik.
Tabel 9-2 Aliran zat antara dari jalur sentral ke dalam biosintesis konstituen seluler
 Siklus TCA menghadirkan masalah khusus karena sifat siklusnya. jalur ini hanya
digunakan untuk oksidasi terminal substrat yang terdegradasi menjadi asetil-KoA, jalur ini
beroperasi secara siklik. Oksalasetat diregenerasi dari suksinat melalui reaksi (9-21) menjadi (9-
23) dan tersedia untuk kondensasi dengan asetil-KoA untuk memulai putaran siklus lainnya
sejumlah komponen seluler yang dibutuhkan dalam jumlah cukup besar disintesis dari zat antara
dalam siklus TCA. Penarikan zat antara ini dari siklus mengganggu aliran siklik dan akan
mencegah oksidasi terminal sumber energi jika tidak ada reaksi alternatif dimana oksalasetat
dapat dimasukkan ke dalam siklus untuk mempertahankan operasinya. Kemoheterotrof harus
memanfaatkan zat antara siklus TCA untuk reaksi biosintetik harus mampu mensintesis zat
antara Ca untuk menggantikan zat antara yang disedot. Reaksi yang menggantikan zat antara
katabolik yang ditarik untuk digunakan dalam jalur biosintetik disebut reaksi anaflerotik.
Situasi berbeda terjadi pada autotrof. Saat mensintesis bahan organik dari karbon
dioksida dan memperoleh energi dari cahaya atau sumber energi anorganik, autotrof tidak akan
menguntungkan jika menggunakan jalur katabolik dengan cara yang sama seperti jalur yang
digunakan oleh sel.
Gambar 9-7 Reaksi mikroorganisme heterotrofik dapat memperbaiki karbon dioksida untuk
menggantikannya TCA asam oksalasetat dihilangkan untuk reaksi biosintetik.
Kemoheterotrof, autotrof harus mensintesis seluruh materi selnya dan harus menggunakan,
secara umum, jalur yang sama yang digunakan oleh heterotroph, hanya sebagian dari jalur yang
dapat digunakan, yaitu bagian yang mengarah ke prekursor yang diperlukan. Pada organisme ini,
reaksi yang mengarah dari asam sitrat menjadi a-ketoglutarat digunakan dalam arah maju,
sedangkan suksinat dibentuk oleh pembalikan reaksi yang biasanya mengarah dari suksinat
menjadi oksalasetat. Kedua bagian siklus beroperasi secara independen, dan keduanya
memerlukan masukan oksalasetat. Baik pada kemoheterotrof maupun autotrof, oksalasetat dapat
disintesis melalui satu atau lebih.
Gambar 9-8 Bypass glioksilat untuk sintesis senyawa Ca pada mikroorganisme yang digunakan
senyawa yang dimetabolisme menjadi asetil-KoA (asetat, asam lemak, hidrokarbon) sebagai
satu-satunya sumber karbon. Reaksi bypass adalah Persamaan. (9-42) dan (9-43). Jalan pintas
ditampilkan sehubungan dengan Siklus TCA.
Reaksi bypass yang pertama adalah pembelahan asam isositrat menjadi asam glioksilat dan asam
suksinat oleh enzim isositrat lyase.

Baik suksinat maupun glioksilat dapat diubah menjadi oksalasetat-suksinat melalui reaksi biasa
pada siklus TCA dan glioksilat melalui kondensasi dengan asetil-KoA yang dikatalisis oleh
malat sintase.

Reaksi-reaksi ini menggantikan zat antara siklus TCA yang ditarik untuk digunakan
dalam biosintesis. Namun, masih ada masalah dalam memasukkan sebagian karbon substrat ke
jalur EMP dan HMP untuk sintesis konstituen seluler lainnya. Reaksi bypass glioksilat telah
ditemukan pada berbagai bakteri dan jamur dan juga pada tumbuhan tingkat tinggi, tetapi tidak
terdapat pada hewan, reaksi ini memungkinkan sintesis bahan seluler dari asetil-KoA, yang
memungkinkan mikroorganisme tumbuh dengan mengorbankan asam lemak sebagai satu-
satunya sumber karbon dan energi. Operasi simultan dari bypass glioksilat dan siklus TCA
memungkinkan asetil-KoA proporsional antara bypass glioksilat, yang menyediakan penggunaan
asetil-KoA sebagai sumber karbon, dan siklus TCA, yang menyediakan oksidasi menjadi karbon
dioksida dan pembentukan ATP untuk kebutuhan energi sel.