Lihat diskusi, statistik, dan profil penulis untuk publikasi ini di:https://www.researchgate.

net/publication/282464744

Sistem Mikroskop Fokus Otomatis menggunakan Pendekatan Pengukuran

Kontras

Artikeldi dalamJurnal Teknologi · May 2015

DOI: 10.11113/jt.v74.4665
Abdul Razakpada tanggal 09 Juni 2016.Pengguna telah meminta

penyempurnaan file yang diunduh.

KUTIPAN
BACA
3 2.437

4 penulis, termasuk:

Mohd Afzan Usman Nasrul Humaimi Mahmood

Universitas Teknologi Malaysia
Universitas Teknologi Malaysia
33PUBLIKASI142KUTIPAN
113PUBLIKASI1.075KUTIPANLIHAT PROFIL

LIHAT PROFIL

Mohd Azhar Abdul Razak

Universitas Teknologi Malaysia
28PUBLIKASI310KUTIPAN

LIHAT PROFIL

Semua konten setelah halaman ini diunggah olehMohd Azhar

Makalah penuh Jurnal Teknologi

Sistem Mikroskop Fokus Otomatis menggunakan Pendekatan
Pengukuran KontrasThang Ehang, Mohd Afzan Othman, Nasrul Humaimi Mahmood, Mohd Azhar Abdul Razak *

Fakultas Teknik Elektro, Universiti Teknologi Malaysia, 81310 UTM Johor Bahru, Johor, Malaysia

*Penulis koresponden: mohdazhar@utm.my

Sejarah artikel

Diterima : 25 Maret 2015 Diterima dalam bentuk revisi : 11 April 2015

Diterima : 13 April 2015Abstrak grafis

1.0 PENDAHULUAN

Abstrak

Penghitungan sel adalah metode yang digunakan untuk mengukur sel untuk diagnosis penyakit dan penelitian medis. Umumnya, hemositometer
digunakan untuk menghitung sel karena metode ini lebih murah dan sederhana. Spesimen berisi sel dimasukkan ke dalam hemositometer dan
ditempatkan pada mikroskop. Kenop pengatur mikroskop yang kasar diputar untuk memfokuskan sel. Bagi pengguna pemula, mendapatkan sel
yang terfokus membutuhkan waktu yang lama. Jika pengguna terlalu keras menggunakan kenop penyetel, roda gigi kenop dapat kendor. Selain
itu, jika sel terlalu fokus, dapat menyebabkan kerusakan pada lensa objektif dan hemositometer. Untuk mengatasi permasalahan tersebut,
dikembangkan sistem autofokus yang dapat mengontrol pergerakan tombol pengatur dalam mencapai fokus gambar secara otomatis. Kamera
CCD dipasang ke mikroskop untuk menangkap gambar sel melalui gigabit Ethernet. Gambar-gambar tersebut kemudian dianalisis menggunakan
metode pengukuran kontras. Untuk mengontrol pergerakan kenop, digunakan motor stepper yang dapat dipasang. Pergerakan dihentikan ketika
gambar fokus tercapai. Hasilnya, sistem fokus otomatis dapat membantu pengguna memfokuskan sel lebih cepat dan membuat mikroskop
menjadi lebih ramah pengguna.

Kata kunci: Hemositometer; gambar terfokus; mikroskop; pengukuran kontras

Abstrak

Penghitungan sel adalah metode yang digunakan untuk menghitung sel, mendiagnosis jenis penyakit dan juga diterapkan dalam penelitian medis.
Pada umumnya “hemocytometer” digunakan untuk menghitung sel karena harganya yang murah dan cara penggunaannya yang sederhana.
Spesimen yang mengandung sel dimasukkan ke dalam "hemositometer" dan ditempatkan di bawah mikroskop. Rotator kasar pada mikroskop
disesuaikan untuk memfokuskan sel. Bagi pengguna baru, untuk mendapatkan gambar sel
sel bening membutuhkan waktu yang lama. Jika pengguna memutar rotor terlalu kasar, hal ini dapat melonggarkan roda gigi rotor. Selain itu, bila
sel terlalu fokus, hal ini dapat menyebabkan kerusakan pada lensa mikroskop dan "hemositometer". Untuk mengatasi permasalahan tersebut
maka dibangunlah sistem “autofokus” untuk mengontrol pergerakan rotor sehingga dapat diperoleh gambar terfokus secara otomatis. Kamera
CCD dipasang ke mikroskop untuk menangkap gambar sel melalui "gigabit Ethernet". Gambar-gambar ini kemudian dianalisis menggunakan
metode pengukuran kontras. Motor digunakan untuk mengendalikan rotor. Pergerakan motorik akan berhenti setelah diperoleh gambar fokus.
Terakhir, sistem "fokus otomatis" dapat membantu pengguna memfokuskan sel lebih cepat dan menjadikan mikroskop lebih ramah pengguna.

Kata kunci: Hemocytometer; imej fokus; mikroskop, ukuran kontras

© 2015 Penerbit UTM Press. Seluruh hak cipta.

sistem fokus otomatis, gambar terfokus dapat dicapai dengan menggabungkan

baik metode aktif dan pasif atau deteksi fase dan
Sistem optik autofokus menggunakan sistem kontrol yang terdiri
dari sensor dan motor untuk mendapatkan gambar terfokus
secara otomatis. Pada dasarnya sistem autofokus dikembangkan
berdasarkan tiga metode yaitu aktif, pasif atau hybrid. Sistem
autofokus aktif menggunakan komponen aktif, seperti
inframerah atau ultrasonik; untuk menentukan jarak ke subjek
[1]. Sistem autofokus pasif menentukan titik fokus yang benar
dengan menggunakan cahaya untuk melakukan analisis pada
gambar. Ada dua parameter yang dapat ditentukan dalam
autofokus pasif yaitu deteksi fase dan pengukuran kontras [2].
Untuk hibrida
pengukuran kontras.
Penelitian untuk menghasilkan sistem fokus otomatis pada
mikroskop digital biomedis ditunjukkan oleh [1]. Sistem ini
terdiri dari lensa, sensor CMOS dan bagian elektronik untuk
memfokuskan gambar pada sensor. Rumus lensa dan Discrete
Cosine Transform diterapkan dalam penelitian untuk
menghasilkan auto
 algoritma fokus. Transform (DWT) dan juga algoritma peningkatan tepi
Selain itu, sistem kontrol kamera fokus otomatis pasif morfologi. Kontrol
diperkenalkan oleh [2] menggunakan Discrete Wavelet

74:6 (2015) 35–39 | www.jurnalteknologi.utm.my | eISSN 2180–3722 |

36Mohd Azhar Abdul Razak dkk. / Jurnal Teknologi (Sains & Teknik) 74:6 (2015), 35–39
mengontrol pergerakan motor stepper dengan mudah. Untuk
lensa yang dapat disesuaikan dalam mencapai posisi fokus, mengoperasikan sistem, posisi panggung mikroskop diatur pada
pengontrol jaringan saraf Selforganizing Map (SOM) posisi paling bawah. Dua pengaturan eksperimental dilakukan
dikembangkan. Selanjutnya, fusi gambar multi-fokus untuk menguji pengoperasian sistem.
diperkenalkan oleh [3]. Dalam studi ini, metode baru yang Percobaan pertama dilakukan dengan meletakkan
menggabungkan Transformasi Contourlet dengan fusi hemositometer tanpa sel ragi di atas panggung mikroskop.
pemblokiran gambar diperkenalkan. [6] mengeksplorasi Voice Kamera CCD dipasang ke lensa mata mikroskop untuk
Coil Motor (VCM) on-Chip yang digunakan untuk fokus menangkap serangkaian gambar melalui gigabit Ethernet. Setiap
otomatis seluler. Pengoperasian driver VCM dan Pemrosesan gambar adalah
Sinyal Gambar (ISP) yang sistematis diperlukan untuk menjaga dianalisis menggunakan algoritma pengukuran kontras yang
fokus yang baik. Metode fokus otomatis baru berdasarkan ditulis dalam perangkat lunak MATLAB. Motor stepper dipasang
pendekatan pencarian dan pelacakan jendela fokus untuk kamera pada kenop fokus mikroskop untuk memutar kenop searah jarum
digital diperkenalkan oleh [7]. Algoritma ini dapat mencapai jam. Untuk setiap langkah putaran menggerakkan hemositometer
fokus otomatis kira-kira 0,0167
berfungsi dalam urutan gerak tinggi dan gerak rendah. Metode mm ke arah lensa objektif. Proses perolehan citra, analisis dan
pencarian fuzzy yang diperkenalkan oleh [8] digunakan dalam pergerakan mikroskop ke atas diulangi hingga diperoleh citra
sistem kontrol gerak mikroskop. Algoritma fokus otomatis baru terfokus. LED hijau akan menyala sebagai pemberitahuan
lainnya yang menggabungkan pencarian awal untuk arah, kepada pengguna bahwa proses telah selesai.
pencarian halus dan pencarian kasar diperkenalkan oleh [9]. Kemudian sistem diverifikasi dengan hemositometer yang
Jumlah besaran gradien diusulkan karena keunggulan respons diisi sel ragi. Proses perolehan citra, analisis citra dan tahapan
yang cepat dan komputasi yang lebih sedikit. [10] perpindahan dilanjutkan hingga diperoleh citra sel terfokus.
mengembangkan modul kamera saku yang memiliki aktuator
fokus otomatis dan sistem rana mekanis. Fungsi aktuator fokus
otomatis adalah untuk menggerakkan modul lensa. Sedangkan
shutter mekanis digunakan untuk mengatur intensitas cahaya dan
panjang fokus.
Fokus otomatis mengambil peran penting dalam aplikasi
penghitungan sel. Hal ini dikarenakan, citra sel yang terfokus
merupakan suatu kebutuhan sebelum aktivitas penghitungan sel
berlangsung [11-13]. Saat ini, banyak prosedur dalam bidang
kedokteran dan biologi memerlukan penghitungan sel sebagai
bagian dari alat diagnostik [11]. Alat yang digunakan untuk
menghitung sel disebut hemositometer. Hemositometer diisi
dengan sel dan ditempatkan di atas panggung mikroskop. Dalam
praktiknya, pengguna akan memutar kenop mikroskop secara
manual untuk memfokuskan gambar sel. Namun, masalah umum
telah ditemukan khususnya bagi pengguna pemula; mereka
cenderung membutuhkan waktu lebih lama dalam mengatur Kamera CCD
kenop mikroskop untuk mendapatkan gambar yang fokus. Oleh
Melalui Gigabit Ethernet
karena itu, hal ini menyebabkan buang-buang waktu hanya untuk
mendapatkan fokus
gambar. Selain itu, bagi pengguna pemula mikroskop kurang
nyaman digunakan. Hal ini karena mereka tidak memiliki cukup Tombol fokus
pengalaman untuk menangani dibandingkan dengan pengguna
berpengalaman tersebut.
India), kamera CCD (Basler Ace, Jerman), komputer dengan
platform MATLAB, motor stepper unipolar dan papan Arduino
Uno. Papan Arduino-Uno dipilih karena kemampuannya dalam Melekat

menjadi longgar. Waktu penting ketika tombol fokus

Terkadang ketika mikroskop terlalu terfokus; Melalui USB
melakukan penghitungan sel dan ini
itu akan merusak hemositometer dan pada
bergantung pada seberapa cepat gambar
saat yang sama dapat merusak lensa
fokus dapat ditangkap. Misalnya saja untuk
mikroskop. Selain itu, jika pengguna terlalu
mengetahui konsentrasi bakteri, virus atau
keras dalam menggunakan kenop penyetel,
patogen di dalamnya Papan Arduino Uno
hal ini dapat membuat roda gigi kenop
Oleh karena itu, pengembangan sistem mikroskop
autofokus dengan metode pengukuran kontras diperlukan untuk
darah dengan menggunakan penghitungan sel dapat memberi
mengatasi masalah fokus gambar dan menghindari human error.
kita beberapa informasi tentang perkembangan suatu penyakit
Selain itu, mikroskop dapat menjadi nyaman dan mudah
infeksi [13]. Jika waktu penggunaannya singkat, kemungkinan
digunakan
pasien untuk sembuh dari suatu penyakit akan meningkat.
ramah bagi peneliti karena proses pengambilan gambar sel
terfokus dapat dilakukan secara otomatis.
2.0 METODOLOGI
Gambar 1Ikhtisar sistem
+(��(��)��(��) − ��(�� + 1)��(��))]

2.2 Perangkat Lunak

2.1 Perangkat Keras
Pengukuran kontras adalah metode autofokus pasif yang
diterapkan dalam algoritma untuk mencari gambar fokus. Ini Gambar 1 menunjukkan alur kerja sistem mikroskop autofokus.
sederhana dan tidak memerlukan komponen aktif. Nilai kontras Sistem ini terdiri dari mikroskop tegak (Radikal,
(C) untuk setiap gambar dihitung menggunakan Persamaan (1). Di manaMDanNadalah jumlah piksel suatu gambar pada sumbu
vertikal dan horizontal. Nilai kontras suatu gambar diperoleh
�� = ∑ ∑[(��(��)��(��) − ��(��)��(�� + 1)) dengan menjumlahkan nilai penjumlahan perbedaan piksel
�� secara horizontal dan vertikal. Secara teoritis, suatu gambar yang
��=1(1)
�� mempunyai a
��=1
37Mohd Azhar Abdul Razak dkk. / Jurnal Teknologi (Sains & Teknik) 74:6 (2015), 35–39

nilai kontras (C) tertinggi ditentukan sebagai gambar terfokus.

Gambar 2 menunjukkan alur memperoleh gambar terfokus dengan
menerapkan metode pengukuran kontras.

Menangkap gambar awal (i) dan

Tentukan nilai kontras (C(i))
Ambil gambar (i+1) dan Tentukan nilai
kontras (C(i+1))

Putar motor stepper

searah jarum jam/menggerakkan
mikroskop
naik panggung

TIDAK
Setelah tombol ditekan, sistem memulai dengan akuisisi gambar,
penentuan nilai kontras,C(Saya) dan tahapan bergerak ke atas
hingga gambar fokus ditemukan.
C(saya)=C(saya+1)
C(i)>C(i+1)
Gambar 3 dan Gambar 4 masing-masing menunjukkan gambar
hemositometer tanpa dan dengan sel ragi. Gambar tanpa ragi
dilihat pada lensa objektif perbesaran 10x, sedangkan gambar
Ya dengan ragi dilihat pada perbesaran 20x. Pembesaran yang lebih
tinggi diperlukan untuk melihat gambar sel ragi karena diameter
Gambar terfokus diperoleh
selnya kecil (≈ 8µm) Namun, sel ragi pada gambar tidak dapat
teramati karena proses persiapan yang tidak tepat. Sel-sel
tersebut tidak melalui proses pencucian untuk menghilangkan
Gambar 2Diagram alir untuk menentukan gambar yang terfokus
sel-sel dan kotoran yang tidak dapat hidup.
ItuCnilai untuk gambar tersebut dihitung dan ditabulasikan
Mengacu pada Gambar 2, setelah hemositometer dengan atau pada Tabel 1. Seperti disebutkan sebelumnya, nilai tertinggi
tanpa sel ragi ditempatkan di bawah mikroskop, gambar awal menunjukkan gambar yang lebih jelas.
diambil dan nilai pengukuran kontrasC(Saya) dihitung
menggunakan Persamaan 1. Selanjutnya, motor stepper memutar
kenop fokus untuk menaikkan panggung mikroskop dan (A)
spesimen. Saat ini, gambar kedua diambil dan dianalisis untuk
menentukan nilai kontras baruC(saya+1). Nilai kontras baru
dibandingkan dengan nilai kontras sebelumnyaC(Saya).Proses
pergerakan ke atas, pengambilan dan analisis gambar spesimen
diulangi hinggaC(Saya) lebih besar dariC(saya+1) nilai. Gambar
terfokus dicapai dan ditampilkan satu kaliC(Saya) nilai tertinggi
di antara gambar yang diambil. Gambar terfokus yang diperoleh
dapat digunakan dalam analisis lebih lanjut seperti penghitungan
sel dan analisis morfologi untuk diagnosis penyakit.

3.0 HASIL DAN PEMBAHASAN

Antarmuka Pengguna Grafis (GUI) sederhana dengan tombol

start diciptakan untuk mengoperasikan sistem fokus otomatis.
 (C)
Gambar 3Gambar hemositometer tanpa sel ragi dalam tiga kondisi;
(a) Kurang fokus, (b) Fokus, (c) Terlalu fokus

(B)

38Mohd Azhar Abdul Razak dkk. / Jurnal Teknologi (Sains & Teknik) 74:6 (2015), 35–39

Tabel 1Nilai kontras setiap gambar a, b dan c

Gambar SelNilai Kontras (C)

Tanpa sel ragi Dengan sel ragi
Dalam Fokus (a) 116 146
Terfokus (b) 244 158
Terlalu Fokus (c) 171 154

Berdasarkan Tabel 1, karena tidak ada sel ragi yang dimasukkan ke dalam
hemocytometer, nilai kontras untuk gambar terfokus yang direkam a
pembacaan 244 yang merupakan tertinggi dibandingkan dengan kurang fokus
dan
over focus dengan nilai kontras masing-masing 116 dan 171.
Sedangkan untuk hemositometer dengan sel ragi, fokusnya
gambar mencatat nilai kontras tertinggi (158) dibandingkan dengan
gambar di bawah fokus dan terlalu fokus yang merekam kontras
nilai masing-masing 146 dan 154. Akibatnya,
(A)

(B)
(C)
Gambar 4Gambar hemositometer dengan sel ragi dalam tiga kondisi;
(a) Kurang fokus, (b) Fokus, (c) Terlalu fokus
sistem yang dikembangkan menampilkan gambar dengan nilai
kontras tertinggi pada GUI picture box, yaitu dalam hal ini
gambar fokus dipilih dan ditampilkan pada GUI seperti terlihat
pada Gambar 5.
Sistem dimulai
39Mohd Azhar Abdul Razak dkk. / Jurnal Teknologi (Sains & Teknik) 74:6 (2015), 35–39
Pengakuan
Penulis ingin mengucapkan terima kasih yang tulus kepada
Universiti Teknologi Malaysia yang telah mendukung dan
mendanai penelitian ini berdasarkan proyek pemungutan suara
nomor Q.J130000.2523.08H78. Berbagai bantuan dari anggota
kelompok penelitian sangat kami hargai.
Referensi
[1] C. Chen-Song, C. Yu-Jen, Y. Ming-Shing, H. Ming-Han, H. Yun-Zhe, H.
Ke-Nung. 2009. Kajian Sistem Fokus Otomatis pada Mikroskop Digital
Biomedis.3rdKonferensi Internasional tentang Bioinformatika dan
Teknik Biomedis. 1–4.
[2] C. Chih-Yung, H. Rey-Chue dan C. Yu-Ju. 2010. Sistem Kontrol Kamera
Fokus Otomatis Pasif.Komputasi Lunak Terapan. 10: 296–303. [3] W. Xin
dan L. Yingfang. 2011. Metode Baru Penggabungan Gambar Multi-Fokus
tombol
Gambar 5Gambar terfokus ditampilkan pada GUI
Gambar yang difokuskan memerlukan waktu kurang dari
10 detik untuk ditampilkan pada GUI setelah tombol mulai
ditekan. Dengan sistem autofokus ini, pengguna dapat
menghemat waktu dalam mendapatkan gambar paling jernih.
Setelah gambar diperoleh, gambar tersebut dapat digunakan
untuk analisis lebih lanjut, misalnya. penghitungan sel, analisis
morfologi dalam diagnosis penyakit dini.
4.0 KESIMPULAN
Kesimpulannya, mikroskop autofokus yang memenuhi tujuan
yang dinyatakan dalam penelitian telah berhasil dikembangkan.
Caranya dengan menuliskan algoritma pengukuran kontras
seperti terlihat pada Gambar 2 di MATLAB, dimana algoritma
ini digunakan untuk menentukan putaran kenop pengatur yang
kemudian akan menangkap gambar yang terfokus dan
menampilkan gambar tersebut pada GUI picture box (seperti
pada Gambar 5) secara otomatis. Dengan mengembangkan
sistem ini, mikroskop menjadi lebih mudah digunakan karena
setiap pengguna (dengan atau tanpa pengetahuan menggunakan
mikroskop) dapat menggunakannya tanpa repot. Selain itu,
sistem ini juga dapat menghindari kerusakan pada lensa
mikroskop dan hemositometer/kaca slide spesimen. Pada saat
yang sama, dapat melindungi gigi kenop mikroskop dari
kerusakan akibat pengguna yang kasar dalam menyesuaikan
kenop.
menggunakan Transformasi Countourlet. Konferensi Internasional tentang
Transportasi, Teknik Mesin, dan Listrik (TMEE). 2319–2322.
[4] RM Bahy, GI. Salama, T.A. Mahmoud. 2012. Registrasi Gambar Multi
Fokus Menggunakan Hough Transform. 29thKonferensi Sains Radio
Nasional (NRSC). 279–284.
[5] TK Kim, JS Sohn, SHLee, SG Kwon, DG Kim. 2006. Algoritma Kontrol
Fast Auto-Focus menggunakan VCM Hysteresis Compensation pada
Kamera Ponsel. Konferensi Internasional tentang Proses Akustik,
Pidato dan Pemrosesan Sinyal.3: AKU AKU AKU.
Lihat statistik publikasi
[6] SH Yang, SM Sohn, KT Hong, HS Lee, BI Sohn. 2005. Driver Motor
Kumparan Suara Pada Chip untuk Aplikasi Kamera Fokus Otomatis Seluler.
Konferensi Sirkuit Solid-State Asia.101–104.
[7] TH Tsai dan C.Y. Lin. 2008. Metode Fokus Otomatis Baru Berdasarkan
Pendekatan Pencarian dan Pelacakan Jendela Fokus untuk Kamera
Digital.3rdSimposium Internasional tentang Komunikasi, Kontrol dan
Pemrosesan Sinyal (ISCCSP 2008). 650–653.
[8] S.Li, L.Hao, Z.Sun, X.Liu. 2011. Kontrol Gerakan Fokus Otomatis
Sistem Robot Mikro untuk Penyuntikkan Sel. Konferensi Kontrol dan
Keputusan Tiongkok (CCDC). 2436–2440.
[9] L.Pan, T.Zhou, B.Zheng, L.Yu. 2010. Penerapan Deteksi Keyakinan Tepi
pada Fokus Otomatis di Bawah Kamera Fundus. Kongres Global WRI
Kedua tentang Sistem Cerdas (GCIS). 2: 399–402.
[10] MJ Chung, YH Yee, WH Ann. 2007. Pengembangan Modul Kamera
Ringkas yang Memiliki Aktuator Fokus Otomatis dan Sistem Rana
Mekanis untuk Ponsel. Konferensi Internasional tentang Kontrol,
Otomasi dan Sistem. 2319–2322.
[11] S.M. Mazalan, N.H. Mahmood, F.K.C. Harun, R.M. Zulkifli, M.A.A.
Razak. 2013. Penghitung Trombosit Otomatis Berdasarkan Modifikasi
Hough Transform. Jurnal Informasi Kesehatan Pencitraan Medis. 3:
543–546.
[12] SM Mazalan, N.H. Mahmood, MA Razak. 2013. Penghitungan Sel
Darah Merah Otomatis pada Citra Apusan Darah Tepi Menggunakan
Circular Hough Transform. Konferensi internasional tentang
Kecerdasan Buatan, Pemodelan dan Simulasi. 320–324.
[13] FKS Mauricio, R.M. Claudio, L.C. Dos-Santos. 2010. Penghitungan Sel
Darah Merah Berbasis Gambar untuk Darah Hewan Liar. Konferensi
Internasional Tahunan IEEE Engineering in Medicine and Biology
Society (EMBC). 438–441.