GAUSSIAN 09W
B. DASAR TEORI
Kimia komputasi dapat dikatakakan juga sebagai ilmu yang menjembatani antara kimia teori
dengan kimia eksperimen karena kimia komputasi ini memiliki kelebihan tersendiri
dibandingkan dengan kimia eksperimen. Salah satu contohnya adalah penentuan struktur suatu
molekul yang dimodelkan sebagaimana struktur molekul tersebut terbentuk dialam melalui
perhitungan secara komputasi (Ramachandran et al., 2008 ). Perkembangan kimia komputasi
melahirkan beberapa aplikasi atau paket program kimia komputasi yang membentu melakukan
riset prapenelitian untuk membantu sebagai data pendukung dalam bentuk simulasi
menggunakan perhitungan secara komputerisasi (Ilbezim et al., 2017). Salah aplikasi yang paling
sering dipakai pada penelitian komputasi adalah program Gaussian 09W karena menawarkan
metode perhitungan yang bervariasi dalam melakukan simulasi molekuler (Itte et al., 2017).
Gaussian adalah salah satu dari sekian banyak Software yang digunakan untuk melakukkan
perhitungan kimi melalui simulasi komputer karena kemudahan yang ditawarkan pada aplikasi
ini (Rochiman, 2018). Secara perkembangannya, aplikasi Gaussian 09W memiliki kelebihan
yang lebihakurat dan baik dalam melakukan penentuan atau pemodelan struktur elektronim suatu
molekul. Dimana, pada penggunaannya Guasissan 09W sering digunakan bersamaan dengan
Gaussian View 5.0 untuk mempermudah visualisasi dan banyak pilihan menu dalam
mempermudah perhitungannya atau dengan kata lain aplikasi tersebut adalah aplikasi bantuan
yang wajib atau harus digunakan secara bersamaan dengan aplikasi Gaussian 09W. program
Gaussian 09W memiliki beberapa kelebihan dibandingkan dengan beberapa program komputasi
lainnya, yaitu mengghasilkan model yang akurat dan lengkap (Rochman, 2018). Salah satu
konsep dasar yang mendasari aplikasi ini adalah tentunya pendekatan kimia kuantum.
Ion [IrCl6]-3 sering digunakan sebagai ligan senyawa organik yang sering dipakai pada
aplikasi penelitian fotoelektron pada kristal halida (Gambar 1). Selain itu, senyawa kompleks
yang terbentuk dari ligan IrCL6-kompleks sering dipakai dalam studi penentuan mekanisme
primer dalam fotokimia transisi logam halide kompleks (Glebov et al., 2008). Logam berat yang
terdapat dalam IrCl6 adalah unsur Iridium yang terdapat pada logam transisi.
Hasil pemodelan digunakan untuk mempermudah visualisasi struktur suatu molekul ketika
ingin dijadikan sebagai suatu objek penelitian (Hadi, 2016). Ikatan yang terjadi antaratom klorida
dan iridium akan membentuk geometri molekul okltahedral yang berikatan secara koordinasi.
Atom-atom yang berikatan melalui elektron terluar akan membentuk konfirmasi struktur dengan
energi yang paling minimum. Simulasi komputasi menggunakan program Gausiaan 09W
mamapu menentukan energi SCF molekul test330 IrCl6 (Tabel 1).
Tabel 1. Hasil Perhitungan Energi SCF Menggunakan Program Gaussian 09W
No. Energi (a.u) Siklus
1. -19739.2810804 16
2. -19739.2991472 11
3. -19739.3023103 13
4. -19739.3063880 9
Pengunaan metode SCF sering dipakai untuk melakukan perhitungan energi pada suatu
molekul yang pada prinsipnya digunakan perhitungan secara terus menerus sampai medan
elektrostatik efektif. Dimana, pada perhitungan ini akan menghasilkan perubahan energi 4 kali
yang terukur pada 4 siklus yang berbeda pula dan diukur dalam satuan (a.u) pada setiap
perubahan energinya. Perubahan energi yang terjadi pada molekul test330 menglami perubahan
energi sebesar -19739.2810804 a.u. pada siklus ke 16, dimana hal ini menunjukan bahwa pada
energi tersebut merupakan energi minimum dan terdapat pembentukan yang disebabkan adanya
ikatan antaratom, yakni Iridium dan klorida. perubahan energi suatu molekul akan diiukuti oleh
perubahan muatan dan kerapatan elektron antara atom-atom yang berikatan dalam suatu molekul.
Dimana, pada kasus dalam penelitian ini kerapatan akan cenderung berupa jika golongan
halogen semakin kebawah dalam suatu tabel periodic unsur. Namun, pada kasus kali ini klorida
memeinkan peran penting karena berikatan sebanyak 6 atom dan akan mempengaruhi kerapatan
elektron disekitar atom iridium. Tentunya, melalui simulasu komputasi kita dapat memperdiksi
energi suatu moelkul dengan tingkat perhitungan yang akurat dalam kondisi kemurniaan suatu
sampel yang tinggi.
E. KESIMPULAN
Berdasarkan hasil penelitian menunjukan bahwa energi SCF oleh test330 menggunakan
program Gaussian 09W erdapat pada 4 siklus dan yang memiliki energi terkecil terdapat pada
siklus 16 sebesar -19739.2810804 a.u. Dimana, menunjukan bahwa pembentukan ikatan yang
terjadi pada atom klorida akan memepengaruhi kerapatan pada daerah sekitar aatom iridium dan
tetntunya akan berpengaruh pada perubahan energinya.
DAFTAR PUSTAKA
Hadi, A. A. 2016, Quantum-chemical study for some coumarin compounds by using semi-empirical
methods, J. ChemTech Research, vol. 9, no.10, hh. 139-148.
Ibezim E.C., Duchowicz P. R., Ibezim N. E., Mullen L. M. A., Onyishi I. V., Brown S. A. and
Castro E. A. 2009. Computer - Aided Linear Modeling Employing QSAR Fordrug
Discovery. Scientific Research and Essay Vol. 4 No. 13, University of Nigeria, Nigeria.
Itte,P.,Amshumali, M.K. and Mussavir, Pasha K.M. 2017. Molecular Modeling, Geometry
Optimization and Characterization of Bimetallic Complexes Derived from s-Indacene.
Universal Journal of Chemistry Vol. 5, No. 3. Jnanasagara Campus, India.
Ramachandran, K. I., Deepa, G. & Namboori, K. 2008, Computational Chemistry and Molecular
Modeling: Principles and Applications, Springer, German.
Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492
---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc. The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program. By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------
******************************************
Gaussian 09: IA32W-G09RevA.02 11-Jun-2009
19-Mar-2019
******************************************
%chk=test330
-----------------------------------------------------------
#p rohf/gen test units=au 6d 10f opt=z-matrix charge nosymm
-----------------------------------------------------------
1/10=7,18=40,20=1,28=-2,38=1,125=101/1,3;
2/12=2,15=1,17=6,18=5,29=3,40=1/2;
3/5=7,8=22,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,116=101/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7/16=-2,29=1,30=1/1,2,3,16;
1/10=7,18=40,28=-2/3(2);
2/15=1,29=3/2;
99//99;
2/15=1,29=3/2;
3/5=7,6=1,8=22,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,82=7,116=101/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,23=1,38=5/2;
7/16=-2,30=1/1,2,3,16;
1/18=40,28=-2/3(-5);
2/15=1,29=3/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
Leave Link 1 at Tue Mar 19 17:13:21 2019, MaxMem= 0 cpu: 0.0
(Enter C:\G09W\l101.exe)
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Search for a local minimum.
Step number 3 out of a maximum of 20
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
Update second derivatives using D2CorN and points 2 3
DE= -3.16D-03 DEPred=-1.06D-02 R= 2.98D-01
Trust test= 2.98D-01 RLast= 5.64D-01 DXMaxT set to 5.05D-01
The second derivative matrix:
V1 V2 V3
V1 0.44553
V2 0.01231 0.12154
V3 0.00546 0.00952 0.08235
Eigenvalues --- 0.08015 0.12319 0.44609
RFO step: Lambda=-1.13285355D-03 EMin= 8.01470926D-02
Quartic linear search produced a step of -0.38211.
Variable Old X -DE/DX Delta X Delta X Delta X New X
(Linear) (Quad) (Total)
V1 5.02686 0.00680 -0.03513 0.04139 0.00626 5.03312
V2 4.33802 0.03853 0.19945 0.03765 0.23710 4.57512
V3 4.78697 0.00634 0.07412 -0.05071 0.02341 4.81038
Item Value Threshold Converged?
Maximum Force 0.038531 0.000450 NO
RMS Force 0.022884 0.000300 NO
Maximum Displacement 0.237101 0.001800 NO
RMS Displacement 0.137603 0.001200 NO
Predicted change in Energy=-5.807032D-03
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Leave Link 103 at Tue Mar 19 17:39:05 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 0.0
(Enter C:\G09W\l202.exe)
---------------------------------------------------------------------------------------------------
Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J
---------------------------------------------------------------------------------------------------
1 1 Ir 0 0.000000 0.000000 0.000000
2 2 Cl 0 2.663411 0.000000 0.000000
3 3 Cl 0 -2.663411 0.000000 0.000000
4 4 Cl 0 0.000000 2.663411 0.000000
5 5 Cl 0 0.000000 -2.663411 0.000000
6 6 Cl 0 0.000000 0.000000 2.421051
7 7 Cl 0 0.000000 0.000000 -2.545543
---------------------------------------------------------------------------------------------------
Z-Matrix orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 77 0 0.000000 0.000000 0.000000
2 17 0 2.663411 0.000000 0.000000
3 17 0 -2.663411 0.000000 0.000000
4 17 0 0.000000 2.663411 0.000000
5 17 0 0.000000 -2.663411 0.000000
6 17 0 0.000000 0.000000 2.421051
7 17 0 0.000000 0.000000 -2.545543
---------------------------------------------------------------------
Distance matrix (angstroms):
1 2 3 4 5
1 Ir 0.000000
2 Cl 2.663411 0.000000
3 Cl 2.663411 5.326822 0.000000
4 Cl 2.663411 3.766632 3.766632 0.000000
5 Cl 2.663411 3.766632 3.766632 5.326822 0.000000
6 Cl 2.421051 3.599340 3.599340 3.599340 3.599340
7 Cl 2.545543 3.684229 3.684229 3.684229 3.684229
6 7
6 Cl 0.000000
7 Cl 4.966594 0.000000
Symmetry turned off by external request.
Stoichiometry Cl6Ir(4-,2)
Framework group C4V[C4(ClIrCl),2SGV(Cl2)]
Deg. of freedom 4
Full point group C4V NOp 8
Rotational constants (GHZ): 0.5448041 0.5448041 0.5093303
Leave Link 202 at Tue Mar 19 17:39:05 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 0.0
(Enter C:\G09W\l301.exe)
Basis read from rwf: (6D, 10F)
No pseudopotential information found on rwf file.
Integral buffers will be 262144 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
167 basis functions, 352 primitive gaussians, 167 cartesian basis functions
92 alpha electrons 91 beta electrons
nuclear repulsion energy 2185.1569497902 Hartrees.
IExCor= 0 DFT=F Ex=HF Corr=None ExCW=0 ScaHFX= 1.000000
ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 ScalE2= 1.000000 1.000000
IRadAn= 0 IRanWt= -1 IRanGd= 0 ICorTp=0
NAtoms= 7 NActive= 7 NUniq= 7 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F
Background charge distribution read from rwf.
FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 0
NFxFlg= 0 DoJE=F BraDBF=T KetDBF=T FulRan=T
Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 1100 IOpCl= 0
NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
I1Cent= 10001006 NGrid= 1212.
Symmetry not used in FoFCou.
Self energy of the charges = -188.7129599999 a.u.
MM energy of the charges = 0.3575363685 a.u.
Nuclei-charges interaction = 129.3377998601 a.u.
Nuclear repulsion after external point charges = 2126.1393260188 Hartrees.
No density basis found on file 724.
Leave Link 301 at Tue Mar 19 17:39:06 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 1.0
(Enter C:\G09W\l302.exe)
NPDir=0 NMtPBC= 1 NCelOv= 1 NCel= 1 NClECP= 1 NCelD= 1
NCelK= 1 NCelE2= 1 NClLst= 1 CellRange= 0.0.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 167 RedAO= T NBF= 167
NBsUse= 167 1.00D-06 NBFU= 167
Leave Link 302 at Tue Mar 19 17:39:08 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 2.0
(Enter C:\G09W\l303.exe)
DipDrv: MaxL=1.
Leave Link 303 at Tue Mar 19 17:39:09 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 0.0
(Enter C:\G09W\l401.exe)
Initial guess read from the read-write file.
B after Tr= 0.000000 0.000000 0.000000
Rot= 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 Ang= 0.00 deg.
Guess basis will be translated and rotated to current coordinates.
Generating alternative initial guess.
Harris functional with IExCor= 205 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 3.33D-02 ExpMax= 9.10D+04 ExpMxC= 9.10D+04 IAcc=3 IRadAn= 0
AccDes= 0.00D+00
HarFok: IExCor= 205 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 0 IDoV= 1
ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000
Defaulting to unpruned grid for atomic number 77.
FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 0
NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0
NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
I1Cent= 4 NGrid= 0.
Symmetry not used in FoFCou.
Harris En= -19746.3424689230
Leave Link 401 at Tue Mar 19 17:39:14 2019, MaxMem= 33554432 cpu: 5.0
(Enter C:\G09W\l502.exe)
Restricted open shell SCF:
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Using DIIS extrapolation, IDIIS= 1040.
Two-electron integral symmetry not used.
IEnd= 103730 IEndB= 103730 NGot= 33554432 MDV= 33495399
LenX= 33495399 LenY= 33467069
Fock matrices will be formed incrementally for 20 cycles.