LKPD DISKUSI KELOMPOK

Pohon Filogeni

NAMA KELOMPOK :
ANGGOTA KELOMPOK :
1.
2.
3.
4.
5.

Kelas :

PETUNJUK:
a. Diskusikanlah dengan anggota kelompokmu mengenai LKPD berikut ini.
(Wajib dikerjakan bersama, bagi anggota kelompok yang tidak
berpartisipasi secara aktif mohon untuk dilaporkan oleh kelompoknya
kepada guru secara pribadi).
b. Buatlah grup WA untuk masing2 grup dengan nama “nama group_kelas”
dengan mengundang Ibu guru ke masing-masing grup”
c. Dikumpulkan sesuai deadline pada moodle oleh perwakilan anggota
kelompok dalam bentuk word ke email elisabetsiahan4@gmail.com secara
formal dengan subjek “LKPD FILOGENI” dengan nama file “NAMA
KELOMPOK_KELAS_LKPD FILOGENI”.
d. Berusahalah menyelesaikan tugas berikut sebelum Post test dilakukan
agar kamu benar-benar memahami konsep KD berikut dengan baik.
e. Buatlah untuk masing-masing gambar pohon filogeni yang ada di word
dalam bentuk jpg. atau png. dan membuat file terpisah juga untuk
masing-masing pohon filogeni yang diminta berdasarkan soal sebagai
tugas keterampilan. Lampirkan data tambahan untuk masing-masing
pohon filogeni agar yang membaca gambar tersebut dapat
menginterpretasikan gambar yang Anda buat dengan baik. Gambar dapat
dibuat dengan gamabr tangan atau mengunakan amplikasi lainnya.
f. Sehingga ada dua penilaian dalam LKPD berikut ini, yaitu tugas dan nilai
keterampilan
g. Selamat bekerja, tetap semangat!
Pohon filogeni 1

1. Identifikasilah lima karakter yang dimiliki oleh burung:

a.
b.
c.
d.
e.

2. Identifikasilah dua karakter yang dimiliki oleh reptil / burung (kelompok

yang terdiri dari kura-kura, kadal, ular + buaya + dinosaurus + burung;
termasuk leluhur bersama mereka):
a.
b.

3. Identifikasilah empat karakter yang dimiliki oleh mamalia:

a.
b.
c.
d.

4. Clade adalah sekelompok spesies yang masing-masing termasuk spesies

leluhur dan semua turunannya. Ini juga dikenal sebagai kelompok
monofiletik.

Benar atau Salah:

1. Kura-kura, kadal, ular, buaya, dan dinosaurus membentuk suatu Klad.
2. Buaya, dinosaurus, dan burung membentuk klad.
5. Menurut kladogram, karakter mana yang pertama kali berevolusi: amnion
telur atau rambut?
Jawab :

6. Menurut kladogram, karakter mana yang pertama kali berevolusi: kulit

keratinisasi atau bipedalisme?
Jawab :

7. Pada cladogram, berilah lingkaran pada node (simpul) yang merupakan

nenek moyang (leluhur bersama) yang terbaru (terakhir) dari buaya,
dinosaurus dan burung.

Pohon filogeni 2
1.

Hewan apa yang tidak memiliki rahang?

Jawab :

2. Hewan apa yang memiliki paru-paru?

Jawab :

3. Manakah dari kelompok berikut ini yang TIDAK membentuk klad?

a. Pigeon, Mouse, and Chimp

Merpati, tikus, dan simpanse
Jawab :

b. Lizard, Pigeon, and Mouse

Kadal, merpati, dan tikus
Jawab :

c. Salamander, Lizard, Pigeon, Mouse, and Chimp

Salamander, kadal, merpati, tikus, dan simpanse
Jawab :

d. Hagfish, ikan kakap, Salamander, Lizard, Pigeon, Mouse, and Chimp

Hagfish, ikan kakap, salamander, kadal, merpati, tikus, dan simpanse
Jawab :

4. Pada kladogram,berilah lingkaran pada titik percabangan (node) yang

 merupakan leluhur bersama yang paling baru (terakhir) dari merpati,
tikus, dan simpanse.
Jawab :

Pohon filogeni 3

1. Node (titik percabangan) manakah yang merupakan nenek moyang (leluhur)

terakhir dari taksa terminal B dan C?
Jawab :

2. Node mana yang merupakan nenek moyang (leluhur bersama) terkini

(terakhir) dari taksa terminal A dan B?
Jawab :

3. Pada takson terminal B, dengan takson terminal yang manakah yang lebih
dekat kekerabatannya, A atau C? Jelaskan bagaimana Anda tahu.
Jawab :

4. Dari cladograms yang ditunjukkan di bawah ini, mana yang menunjukkan

sejarah evolusi yang berbeda dari yang lain? (Pikirkan "rotasi simpul" atau
"swap")
5. Pada kelompok klad di bawah ini, tentukanlah jenis kelompok apa yang
mereka miliki berdasarkan system pengelompokkan klad berikut ini:
monofiletik, polifiletik, dan paraphyletic.
Jawab :
Grup 1:
Grup 2:
Grup 3:

Pohon filogeni 4

6. Kladogram sederhana dari hubungan kekerabatan kelompok vertebrata

ditunjukkan di bawah ini. Sebuah lingkaran telah digambar pada bagian
cladogram yang dikenal sebagai kelompok "ikan". Jenis kelompok apa itu
“ikan”? (monofiletik, polyphyletic, atau paraphyletic)
 Jawab : Parafiletik

7. Apa kelompok monophyletic terkecil pada cladogram yang mencakup

semua yang kita sebut ikan? Note: berilah tanda untuk klad tersebut.
Jawab : Tidak Ada

Cladogram vertebrata ditunjukkan di bawah ini dengan karakter

turunan bersama yang ditunjukkan.

8. Dari kelompok monofiletik apakah "choanae" merupakan karakter

turunan bersama?
Jawab : Kelompok Choanata, Lungfish, Tetrapoda, dan Amphibians dan
Land Vertebrata

9. Karakter turunan bersama apa yang diindikasikan untuk Tetrapoda?

Jawab : Amphibians dan Land Vertebrata

10. Sebutkan karakter apa pun yang ada pada kladogram yang
merupakan karakter leluhur bersama untuk Tetrapoda.
Jawab : Vertebrae, Jaws, Bony ribs and shoulder girdle, Choanae, dan
fingers and toes

11. Menurut prinsip parsimony maksimum, pertama-tama kita harus

menyelidiki penjelasan paling sederhana yang sesuai dengan fakta. Di
antara filogeni, pohon filogeni yang paling parsimonis adalah yang
 mengalami perubahan evolusioner paling sedikit. Manakah dari pohon
berikut yang paling parsimonis? Berikan alasanmu.

Jawab :

12. Jika Anda akan membangun pohon filogenetik untuk kelompok

kucing, manakah dari kelompok berikut yang terbaik sebagai kelompok
luar (out group? Jelaskan mengapa.
A) singa B) kucing domestik C) serigala D) macan tutul

Anda adalah spesialis taksonomi yang akan melakukan analisis

filogenetik pada sekelompok kumbang imajiner. Asumsikan bahwa
Anda memiliki pengetahuan sebelumnya bahwa takson A memiliki
hubungan yang lebih jauh dengan yang lainnya dari pada takson
lainnya satu sama lain. Ini berarti takson A akan menjadi pilihan
yang baik sebagai outgroup (kelompok luar).

13. Nilai matriks berikut. Berikan semua karakter keadaan "0" untuk
leluhur (sama dengan grup luar) dan "1" untuk turunan (berbeda dari
grup luar).

Karakter yang dimiliki A B C D

Rahang besar
Antena kecil
Memiliki Spots (bintik-bintik)
Green strips present
(Strip hijau)
14. Gambarlah kladogram yang menunjukkan hubungan kekerabatan
pada kumbang ini. Pastikan ini adalah pohon yang paling sederhana,
yang memiliki perubahan karakter sedikit mungkin (yang paling sedikit).
Jawab :

15. Dengan menggunakan kladogram di bawah ini.

Panjang relatif dari cabang katak dan tikus di pohon filogenetik

menunjukkan bahwa….
A. Katak berevolusi sebelum tikus.
B. Tikus berevolusi sebelum katak.
C. Gen katak dan tikus hanya memiliki homoplasi yang kebetulan saja.
D. Homolog telah berevolusi lebih lambat pada tikus.
Note: berikan alasan mu.
Jawab :

Urutan asam amino sitokrom c ditentukan untuk lima spesies

vertebrata yang berbeda. Tabel di bawah ini menunjukkan jumlah
perbedaan urutan antara setiap pasang spesies.

16. Dengan menggunakan data dalam tabel, buatlah pohon filogenetik

pada template yang disediakan untuk mencerminkan hubungan evolusi
suatu organisme. Berikan alasan untuk penempatan masing-masing
organisme pada pohon filogeni dari spesies yang memiliki hubungan
yang paling jauh ke yang paling memiliki hubungan yang paling dekat.
17. Identifikasi apakah data morfologi atau data urutan asam amino yang
lebih mungkin secara akurat mewakili hubungan evolusi yang
sebenarnya di antara masing-masing spesies, dan berikan alasan untuk
jawaban Anda.
Jawab :

Interpretasi Data dalam Pohon Filogenetik

Apa hubungan evolusioner di antara Beruang?

Para peneliti telah lama memperdebatkan berbagai hipotesis untuk
filogeni dan klasifikasi spesies dalam keluarga beruang, Ursidae. Dalam
latihan ini, Anda akan menginterpretasikan hasil dari satu penelitian
menggunakan data urutan DNA untuk menyimpulkan hubungan di
antara spesies beruang yang masih hidup.

Berdasarkan studi yang telah dilakukan pada tahun 2008, para

peneliti memperoleh urutan genom DNA mitokondria lengkap (mtDNA)
untuk delapan spesies beruang yang masih hidup. Sekuens mtDNA
diselaraskan dan dibandingkan menggunakan parsimoni maksimum
dan metode lainnya. Para peneliti kemudian membangun pohon
filogenetik yang ditunjukkan di bawah ini.

Interpretasi data
18. Pertama, praktikkan membaca hubungan filogenetik dari pohon. Angka
manakah yang mewakili leluhur bersama terkini dari (a) semua beruang, (b)
sloth bears dan spectacled bears, dan dan (c) beruang hitam Asia dan
beruang coklat?
Jawab :

19. Menurut data yang direpresentasikan di pohon ini, apakah beruang madu
lebih dekat hubungannya dengan sloth bears atau polar bear (beruang
kutub)? Jelaskan!
Jawab :

20. Spesies manakah yang merupakan kelompok luar (outgroup) dari antara
kelompok beruang tersebut, dan apakah maksud atau arti dari spesies
tersebut di pohon filogeni?
Jawab :

Dalam sebuah penelitian yang diterbitkan pada tahun 2000, para

peneliti mengurutkan bagian dari gen mitokondria sitokrom b dari
61 beruang coklat; 31 beruang ini berasal dari daratan utama pesisir
Alaska, sedangkan sisanya berasal dari kepulauan ABC di Alaska
tenggara. Beruang coklat daratan dan ABC berbeda dengan 11
substitusi nukleotida tetap dalam gen sitokrom b. Para peneliti
membandingkan urutan beruang coklat dengan 55 beruang kutub.
Mereka menemukan bahwa beruang kutub dan beruang coklat ABC
berbeda hanya pada tiga nukleotida dalam gen ini, sedangkan
beruang kutub dan beruang coklat daratan memiliki lebih banyak
perbedaan.

21. (a) Apakah hasil penelitian tahun 2000 menunjukkan bahwa beruang
coklat bersifat monofiletik, paraphyletik, atau polifiletik? Jelaskan!
Jawab :

(b) Gambar ulang pohon untuk mencerminkan hipotesis yang didukung

oleh penelitian tahun 2000, dan lingkari takson saudara pada beruang
 kutub.
Jawab :

22. Jelaskan dengan kata-kata bagaimana kedua pohon itu berbeda.

Jawab :